2W1XA

The interdependence of wavelength, redundancy and dose in sulfur sad experiments: 1.284 a wavelength 360 images data
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title The Interdependence of Wavelength, Redundancy and Dose in Sulfur Sad Experiments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME C
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2w1xA00
1IWUA 1LMOA 1LJFA 133LA 2BQIA 4LT2A 1HMKA 3AZ7A 4H9AA 4ETAA 2C8PA 3TMWA 1HFYA 2BQDA 2ZYPA 1NQIA 5D5CA 1JKBA 5L3IA 1DKJA 1LZ9A 2VB1A 5KXKA 1BB7A 3QNGA 5A3EA 1BHZA 3AGGG 4KXIA 1OUHA 1UC0A 3WXTA 2Z39A 1IC7Y 2DQCY 2MEAA 2CJLA 5B06A 2Z18A 4IASA 1QUSA 1JTOL 1LZGA 3A3QA 3CT0A 4DC4A 3RNXA 1LOZA 1XGPC 3TXEA 1LSPA 5I4WA 4NWHA 1GB6A 3LZ2A 3LN2A 3EMSA 1D0LA 1G7IC 4N1CC 3ULRA 3AJNA 4YEMA 4ETCA 2A7DA 1I56A 1GF4A 1LZBA 1GBSA 1GXV2 4QDNA 1GE1A 1BB4A 2ZIJA 4H8XA 1RFPA 4I8SA 4ML7A 5KXZA 4TUNA 5F9UA 4W96A 5K7OA 1AKIA 3G3BB 1LJHA 4R6CA 4U3XB 1DZBX 1B7LA 2DQJY 154LA 1J1OY 1REXA 1WQOA 1LZ5A 4WMGA 5IDDA 4H93A 4DD9A 1LSCA 4YM8A 6LYZA 1LSBA 1YKZX 1HHLA 2DKVA 1UIFA 4B1AA 2RSCA 3WPLA 5KXRA 4NHIA 3EO5A 5DN5A 3W6CA 1LYSA 153LA 1QQYA 2HTXA 3A92A 3W6DA 1RJCB 1QTEA 2Z37A 4NGOA 4NGZA 4NHSA 5ILFA 3A91A 5LVGA 1IWWA 1HSWA 1H6MA 1QSWA 2MEGA 1IP6A 2YBIA 4NGYA 4RW2A 1GHLA 1GWDA 2F2NA 2MEDA 4N0JA 1EQ4A 1GF8A 1WVUA 1IP1A 1HFXA 4H8YA 1LZRA 1LZ6A 2X0AA 2Z12A 3M3UA 4PRUA 1NDMC 1GFEA 4NSJA 1YANA 1E8LA 5KKJA 2H9JA 4NY5A 1YL0X 1DI4A 2BQBA 3A94A 1GB8A 1FN5A 2DQHY 1BGIA 4WLXA 1HEWA 2ZYCA 4ANRA 2ZIKA 1H87A 1JITA 1AT5A 3AYQA 5EBHA 4ET8A 2LYOA 4DD1A 1UACY 1IEEA 1NMMA 1JIYA 5DL9A 4PPOA 5LIOA 1RCMA 4OOTA 2YBMA 2YDGA 5F9XA 4TSCA 4N9RA 4B4IA 2YBNA 2BQHA 4OWEA 3TXJA 2BLYA 2Z2FA 1YL1X 2Z38A 4NGWA 2F4AA 1QUTA 1IOQA 4C5FA 4TWSA 3AB6A 1LJ4A 1HC0A 3CQLA 1UIBA 1LSYA 1INUA 4BADA 5E4PA 3BKVA 1LZTA 4HJVA 2XBSA 1B5ZA 1LJGA 2A7FA 1GB5A 1BB5A 2IHLA 4PRQA 4ET9A 3ZVQB 1YROA 1XGTC 1AT6A 3WVXA 1GDXA 2ZNWY 1UBZA 4OWAA 2DQDY 4MR1A 3T6UA 4R0FA 1B5YA 1OUFA 1WQQA 3TMUA 1ZVYB 2XBRA 5B1FA 1LZCA 1LSFA 1LHHA 4FDYA 1AZFA 1IWVA 2W1YA 5KXTA 1GBXA 1O23A 2WARA 1LZAA 1CJ7A 4UWUA 3IJUA 1OUGA 1UIHA 4YENA 1LJNA 2LHMA 4DDBA 5L3HA 5KKIA 2MECA 4OOOA 3WMKA 1OUCA 4D9ZA 1LCNA 1FKVA 1GEVA 4NHQA 1UICA 1D6PA 1IWZA 2YSSC 1CKDA 5I5QA 2XJWA 1KIRC 4NGVA 1IY4A 1B5XA 4LYOA 5C6IA 4WM4A 4DD3A 1UIDA 3EXDA 3M18B 2PC2A 3CT5A 1OUBA 4DWXA 3TXKA 4LYMA 1T6VL 1LYOA 3HBEX 5J7CA 2HUBA 1HERA 3EBAB 1IX0A 4XJFA 2DQAA 1GBYA 2Z2EA 4QEQA 1FKQA 1PS5A 1GF7A 4ETDA 1XEJA 3CSQA 5FDJA 4FJRA 5LYZA 3WXUA 2HECA 1REYA 1BB6A 1KIQC 1TCYA 2BQNA 1F6RA 1LZ4A 4XADA 1IP2A 4HTNA 3WU8A 1HEOA 2LZTA 3BKHA 1B5WA 4CHXA 1IP7A 1YKXX 4ETBA 5JENB 3W3EA 4IATA 4MSTA 1LTMA 1SQ2L 2XTHA 5L9JA 3LYTA 1MELL 1JJ3A 4LT0A 4XJIA 1VATA 5HNCA 1B7NA 2HEBA 1GFHA 4B0DA 1YKYX 1ZVHL 5AMYA 4LYCA 1HEPA 2EPEA 2D4KA 4WO9A 3WPJA 1GF5A 2FBDA 1BWHA 4II8A 3GXRA 1GFRA 4QGZA 4ZIXA 1BVKC 1GE2A 3B72A 1GXXA 3A34A 1IOSA 1G7HC 3OK0A 5APFA 1TAYA 4YEOA 4WOAA 1F6SA 4NG1A 3CB7A 1GB3A 3RW8A 4GCBA 2EKSC 2BQFA 3LYMA 4NHTA 1LJKA 1LHJA 1B0DA 2YVBA 2H5ZA 3P65A 4B4JA 4LYZA 1LZ1A 4RLNA 2HEEA 1IR7A 4HSFA 5FELA 4DD2A 3MGWA 1EQEA 4LGKA 1IP4A 1V7TA 3IWRA 1W6ZA 2EIZC 4NSGA 1J1XY 1GD6A 2Y8PA 3A96A 1Z55A 1IP5A 1MLCE 1JISA 4HJZA 4TSBA 5B59A 1LJEA 5FEKA 1RI8B 1GAZA 1UIAA 2D4IA 2NWDX 4XJHA 1GF3A 2Q0MX 2BQKA 193LA 1JKCA 5E9RA 1JHLA 4GN4A 1JEFA 1WTMA 1AM7A 1GE0A 1DKKA 1P2CC 2IFFY 4G4CA 4NWEA 1DPXA 1WQNA 1LSMA 4PHIA 4EMNA 1GDWA 1GB0A 1LHIA 2BQJA 5APEA 1VDPA 1QTKA 5KXOA 1DXJA 1LMQA 1XGRC 2MEBA 3A6CY 2DQFC 2DBTA 4H1PA 3ZVQA 1HNLA 2BQMA 2HEDA 4Z98A 6LYTA 2I26L 2ZWBA 3WH1A 8LYZA 4OW1A 1JTTL 4WO6A 3SP3A 3W6BA 4H9BA 1GB2A 1GF6A 5I4YA 4GLVA 1REZA 4NGJA 1OQMA 1D9UA 4H8ZA 1GBWA 4WL7A 3B6LA 5HNLA 4DD0A 1XEKA 4Z3MA 5I53A 4XJBA 4N5RA 4HP0A 1FDLY 1OUEA 1B2KA 1B7PA 1ZV5L 1C43A 1IP3A 1LZYA 1LSDA 1IIZA 4LYBA 5A3ZA 1GFKA 3HBHA 1IOCA 4LYTA 2HEAA 2W1LA 1SLYA 4LT3A 1BWJA 1LSAA 4J1BA 208LA 4B4EA 2ZNXY 1IOTA 4XJDA 4H9IA 3ATOA 1GFAA 2B5ZA 2BAAA 3RT5X 3J4GA 4AGAA 1IVMA 4DDAA 1B7OA 1GB9A 3WW6A 1B7QA 1VDTA 3K3TA 3P68A 3TXGA 2CDSA 5KXYA 4DDCA 1D0MA 1YIKA 3ATNA 1DI3A 1FLUA 3LYOA 4J1AA 4IJ4A 2BLXA 1BQLY 1J1PY 3A3RX 2I25L 1BB3A 4KT3A 5DN4A 2D4JA 4LT1A 2H9KA 1VFBC 1XGQC 1ZMYL 1FBIX 4GCEA 4M4OA 4NEBA 1LZSA 3A95A 5DLAA 4E3UA 1QSAA 1LMCA 2AUBA 1KXYA 1HSXA 2DQEY 3A6BY 3QY4A 4UWNA 4WG7A 1LMPA 4J0LA 1NHEA 3CT1A 4TX7A 1LJ3A 1LJIA 1NBYC 4G4HA 5HMVA 2F4GA 4HTKA 2HU3A 3AZ4A 3OJPA 1IC5Y 132LA 1FLQA 1KIPC 1GF0A 1OP9B 2W1XA 3WVYA 5LA5A 1GAYA 4H91A 5KXWA 1OUDA 5F16A 1TBYA 3N9AA 3CSRA 5LYMA 2HU1A 1CJ9A 3WPKA 4H9CA 5LVIA 1I1ZA 4CGEA 4NIJA 4YOPA 1FLYA 1GBZA 1GFTA 4HV2A 4M6DA 3TXFA 4PGJB 1HELA 4RW1A 1GF9A 1C46A 5B05A 5LAFA 5KXNA 2N5ZA 3LZTA 4KL7A 1YAQA 1LMNA 4GN3A 1LKSA 5KXPA 4G9SA 4X3BA 1LZ8A 3FI7A 5LVKA 1EL1A 5I54A 4DT3A 1A4VA 1CKFA 3LHMA 3WULA 1LAAA 1YILA 1WQPA 3E3DA 5HLLA 2CWIA 1TEWA 1YQVY 2YBLA 4XENA 1G7JC 4NG8A 3WU7A 2DQIY 3WYHA 2D91A 1JJ0A 3VWOA 5LXWA 4H9EA 3CSZA 1CJ8A 2FYDA 4DD7A 4ZFPA 1CKHA 3FE0A 1C45A 1G7MC 1YAOA 2W1MA 4NHPA 1LHMA 4NSIA 5I4XA 5ILCA 1QDTA 1RE2A 5KXMA 2FBBA 1V7SA 5LA8A 3AW6A 3F6ZA 5II3A 2CGIA 1TDYA 3AGIA 4LFXA 4WM3A 4EOFA 1I20A 4WG1A 1VDQA 4O34A 1F0WA 4G49A 1IY3A 1OUAA 4Z46A 3RZ4A 3QE8A 134LA 1GFUA 1IR8A 5LAGA 1LSNA 1UIGA 1XGUC 1QIOA 2G4PA 3N9CA 135LA 1IWXA 1GFVA 2HEFA 3AW7A 1NWGA 5KXLA 3J6KA 1JKDA 3HFMY 4H9HA 5B07A 4ZEEA 4Z41A 3P66A 1NF5A 2GV0A 4HJYA 1EQ5A 1JTPL 3B0KA 4H94A 4NGLA 5C6LA 1N4FA 1IO5A 1YAPA 4WM1A 4BS7A 1CKCA 3N9EA 4HTQA 3A93A 2LYMA 1JKAA 3WUNA 1HEQA 5APDA 5F14A 5HQ1A 1IR9A 5KXXA 1C10A 1KXWA 1GBOA 1B9OA 1HFZA 1UA6Y 5B1GA 5T3FA 2ZQ3A 1YAMA 2LZ2A 3IJVA 1GFGA 1HEMA 2MEHA 4GCCA 3W6AA 1IC4Y 1D6QA 4HPIA 7LYZA 2C8OA 1NDGC 4WM2A 4C3WA 1GE3A 1JSEA 2ZILA 4WLDA 1ALCA 1G7LC 5D5FA 1C7PA 4N1EI 4RDSA 4QY9A 4W94A 1LSEA 3RU5A 2BQOA 2FYCA 2G4NA 3WUAA 4RLMA 5HMJA 1LZNA 4H92A 4OWBA 4P2EA 4CFOA 2DQGY 5FHWA 3GXKA 2BQLA 4OWCA 4XYYA 1BWIA 2D6BA 2ZQ4A 3AZ6A 3B0OA 4TTDA 4MCKA 3TMXA 4ETEA 1JWRA 1GPQC 2YBJA 4WL6A 1WQMA 207LA 5KXSA 1NKHA 1IWTA 3G3AB 4LZTA 1DI5A 1C08C 4B49A 1LSGA 4WM6A 1T3PA 1LYZA 3WUMA 1KXXA 1CNSA 1CJ6A 4DYGA 3W6EA 1LPIA 1HENA 1UUZC 4L41A 1XEIA 4HPEA 4HV1A 3A67Y 4PJ2C 5DM9A 3WL2A 2Z19A 1LJJA 1LYYA 5LVJA 2G4QA 1GEZA 3AZ5A 1GE4A 4GCDA 1HMLA 3W6FA 1XFPL 3TXDA 194LA 4H9FA 1DQJC 1XSFA 4WLYA 4GLAA 2EQLA 1PZYA 3D3DA 5C6JA 4NFVA 3ZEKA 4CJ2A 1GB7A 4A7DA 3A90A 1B7SA 2BQGA 1OUJA 2BQAA 4NGKA 4BAFA 3A8ZA 2MEFA 4LFPA 1VEDA 1LZDA 1WTNA 3HBDA 3WU9A 1IWYA 4WLTA 1BVXA 2F30A 2YBHA 1B7RA 1FLWA 1VAUA 2I6ZA 3P4ZA 3TXIA 5LVHA 1D0KA 5LINA 3B0IA 3P64A 5IELA 4GN5C 3KAMA 1CKGA 1JJ1A 1HF4A 1QDRA 4N8ZA 4NSHA 1OUIA 4KPMA 1LSZA 1LMAA 4NGIA 4YF2A 1B5UA 3D9AC 1A2YC 1UIEA 5APCA 2MEIA 3TXBA 1B7MA 1LHKA 3TMVA 4J7VA 4H90A 1JPOA 3WW5A 1GFJA 1JUGA 1REMA 4CFPA 5IHGA 5KJ9A 5LYTA 1DPWA 4UWVA 1LKRA 1IORA 1B5VA 1WVVA 2LYZA 1W08A 1VDSA 4BAPA 4G4BA 5M1YA 4OWHA 5F81A 4GCFA 2BPUA 1LZEA 1LMTA 2BQEA 9LYZA 1NBZC 4AXTA 3TXHA 1LHLA 1F10A 1JSFA 1UCOA 5KY1A 2MEEA 3T36A 4WM5A 5FSTA 4XJGA 5FCPA 3AGHA 3LYZA 4I0CA 1WQRA 4XN6A 2BQCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IWUA 3HT8A 1LJFA 133LA 2BQIA 3HTGA 1HMKA 4H9AA 2C8PA 3TMWA 2BQDA 2ZYPA 150LA 2VB1A 3AGGG 4KXIA 3HU8A 2DQCY 1L64A 2O7AA 1XGPC 1LSPA 248LA 4N1CC 4YEMA 6LZMA 1LYGA 1GBSA 1GE1A 2ZIJA 4R6CA 1B7LA 1WQOA 4WMGA 4H93A 196LA 1L27A 1LSBA 1UIFA 4B1AA 2RSCA 232LA 3WPLA 4NHIA 5DN5A 151LA 4NGZA 1QTEA 5ILFA 2OU9A 1C61A 4NGYA 3C8SA 1GWDA 1IP1A 1HFXA 2X0AA 2RBSA 1YANA 137LA 1E8LA 4I7SA 4NY5A 3LZMA 1YL0X 4I7JA 2DQHY 2ZYCA 1CV3A 4PJZA 3G3XA 1JITA 5LIOA 4PPOA 2YBMA 4TSCA 4N9RA 4B4IA 2BLYA 2Z2FA 4I7KA 2F4AA 4TWSA 3AB6A 3CQLA 1LSYA 234LA 1BB5A 3ZVQB 210LA 3WVXA 3SB5A 3C8RA 4MR1A 1B5YA 195LA 1ZVYB 3HDEA 223LA 1IWVA 1GBXA 1O23A 1D3JA 164LA 235LA 1LZAA 3IJUA 4I7NA 206LA 4YENA 1LJNA 4DDBA 5L3HA 200LA 4NHQA 1LLHA 2YSSC 3NY8A 1KIRC 2PC2A 1KY1A 3HUAA 186LA 1L09A 3HBEX 3EBAB 2Z2EA 3HU9A 1GF7A 5FDJA 4FJRA 5LYZA 237LA 155LA 218LA 2QARC 1F6RA 1SWZA 1C6AA 1KY0A 3RZEA 3SBAA 4CHXA 1L31A 1CU6A 129LA 5L9JA 190LA 171LA 4XJIA 1YKYX 3GUKA 2D4KA 3WPJA 1BWHA 1C6TA 1GFRA 4ZIXA 1L42A 1C6HA 4WOAA 3CB7A 4YX7C 1L21A 1L74A 1LHJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1IWU A;  1LMO A;  1LJF A;  133L A;  2BQI A;  4LT2 A;  1HMK A;  3AZ7 A;  4H9A A;  4ETA A;  2C8P A;  3TMW A;  1HFY A;  2BQD A;  2ZYP A;  1NQI A;  5D5C A;  1JKB A;  5L3I A;  1DKJ A;  1LZ9 A;  2VB1 A;  5KXK A;  1BB7 A;  3QNG A;  5A3E A;  1BHZ A;  3AGG G;  4KXI A;  1OUH A;  1UC0 A;  3WXT A;  2Z39 A;  1IC7 Y;  2DQC Y;  2MEA A;  2CJL A;  5B06 A;  2Z18 A;  4IAS A;  1QUS A;  1JTO L;  1LZG A;  3A3Q A;  3CT0 A;  4DC4 A;  3RNX A;  1LOZ A;  1XGP C;  3TXE A;  1LSP A;  5I4W A;  4NWH A;  1GB6 A;  3LZ2 A;  3LN2 A;  3EMS A;  1D0L A;  1G7I C;  4N1C C;  3ULR A;  3AJN A;  4YEM A;  4ETC A;  2A7D A;  1I56 A;  1GF4 A;  1LZB A;  1GBS A;  1GXV 2;  4QDN A;  1GE1 A;  1BB4 A;  2ZIJ A;  4H8X A;  1RFP A;  4I8S A;  4ML7 A;  5KXZ A;  4TUN A;  5F9U A;  4W96 A;  5K7O A;  1AKI A;  3G3B B;  1LJH A;  4R6C A;  4U3X B;  1DZB X;  1B7L A;  2DQJ Y;  154L A;  1J1O Y;  1REX A;  1WQO A;  1LZ5 A;  4WMG A;  5IDD A;  4H93 A;  4DD9 A;  1LSC A;  4YM8 A;  6LYZ A;  1LSB A;  1YKZ X;  1HHL A;  2DKV A;  1UIF A;  4B1A A;  2RSC A;  3WPL A;  5KXR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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