2W4XA

Btgh84 in complex with stz
Total Genus 229
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
229
sequence length
586
structure length
579
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVEGRNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
publication title Structural Insight Into the Mechanism of Streptozotocin Inhibition of O-Glcnacase.
pubmed doi rcsb
source organism Bacteroides thetaiotaomicron
total genus 229
structure length 579
sequence length 586
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2008-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2w4xA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2w4xA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2w4xA01
3L2MA 1J18A 4JFWA 1C3FA 2GJXA 2YDSA 2YLAA 1JD9A 4UQAA 2ZXDA 3IJ7A 2CKSA 3WEZA 4FK9A 4IPNB 1V3JA 4MTVA 4W84A 3VIHA 4QCEA 1C91A 4BA0A 1H09A 1IZKA 3CUFA 3AHYA 3QHMA 3PBGA 1HVQA 3OLGA 5BXTA 4DWSD 1VAHA 3AI0A 1C7TA 1LWHA 1LLOA 1QI2A 3EDDA 2J7BA 3AHXA 4UOQA 1KR1A 1K9EA 1E4LA 1QNPA 2J8GA 5KEZA 1LF1A 2D0GA 2WZIA 1UA7A 1WCGA 4TOQA 2J74A 1BLIA 1J11A 3N17A 1GVIA 2E4TA 2XSBA 1WP6A 1P6WA 1G01A 2VTFA 2VX6A 2E9BA 3WQ5A 4P7LA 2J77A 3L4WA 5IFPA 1NP0A 1DTUA 1C8YA 4D6GA 5A6BA 5A6AA 1CBGA 2RGMA 4OUEA 4A3YA 3M7SA 3WKZA 1MYRA 2BVTA 3AISA 2PBOA 2O9TA 3VNZA 4EE9A 1E4IA 5BROA 4HMDA 1V6XA 3CBWA 2ZXQA 5FIPA 1GHRA 2WWDA 1I75A 4WJXA 3VVGA 4UQCA 3RPMA 1N82A 2VMFA 4TVUA 5D9PA 4AD0A 1HXJA 1R87A 2AOSA 3SUSA 3F5JA 1CXEA 4JAWA 4W88A 1US2A 1DWAM 3GYCA 1VRXA 2GDVA 2IXUA 4CGTA 3PZUA 3TTYA 1E43A 1NOUA 4ACZB 2X0YA 1VJZA 2VO5A 5JUVA 3CHCA 2V5CA 4FLRA 4J3XA 5JIPA 2Y2WA 1PEZA 1GJWA 2DT2A 2XVPA 1E1FA 1J0JA 1HF6A 4MJ2A 4B16A 1BVZA 2DT3A 1WZKA 2VOTA 4UFJA 1E40A 3AIRA 4U5IA 4L4PA 3OGSA 4AD5A 1HJXA 1UH3A 3VGBA 3BAIA 3WF2A 2DSZA 1UYQA 3QOKA 2A3HA 3VMPA 4BQ2A 3VMOA 3F5KA 1JZ7A 3VGFA 3I3BA 4F9JA 4OBSA 3EDFA 4AZCB 4W87A 3EMQA 5FD0A 3W28A 5GNXA 1E0WA 4P7OA 4C91A 1JF6A 3NSXA 3CO4A 1QW9A 2EO7A 1JAKA 4GKLA 5CG0A 1MW0A 1ISWA 1VENA 1MW3A 1AMYA 2WC3A 1WKYA 5IHSA 2WLYA 3OZPA 4OIFA 1TFVA 3FHQA 3QR3A 3ZJ6A 5FKYA 5BCAA 5EB8A 3WD2A 1V02E 1LG2A 4OZOA 2Z1KA 3EMCA 3KZSA 3N11A 4HTYA 3ARPA 3CHDA 3WMBA 4JCLA 4DWSC 1YQ2A 3PZVA 4XX6A 4S3KA 1TE1A 4V2XA 4X9YA 4KGJA 3EBVA 2J7CA 3BMWA 2VZTA 1V08A 1E6RA 1KXTA 1SFSA 1W9UA 4M81A 4URIA 1V0MA 4W8BA 1QHZA 2WC4A 1X6LA 1JYWA 1E6ZA 2WKLA 3WNKA 2D20A 1KBBA 1FP9A 1ISXA 1HJVA 2PC8A 2VRJA 4ATWA 4PBGA 2ZXBA 2PB1A 3VIIA 4F66A 1HKJA 5M03A 3PZQA 5D9MA 4AIOA 2JALA 1MFUA 3MMUA 4P7RA 1FA2A 3CH9A 1BYDA 1A3HA 1GHSA 4D6JA 4MNKA 3CUIA 1GQLA 3CUHA 5LA1A 4MAZA 8A3HA 1EOMA 3GXDA 5A2CA 3A3HA 4YPJA 1YHTA 5BWFA 1BYAA 3A4AA 4DUVA 3GNOA 2YBTA 3FNDA 3ZJ7A 1B3ZA 4AISA 3VD4A 2EXOA 1K9DA 3WY1A 4AEFA 2WBGA 4PMXA 1LG1A 4P8VA 1VBRA 1J12A 1EA9C 1TA3A 1B90A 1E6PA 2JEPA 2PWFA 1C8QA 4PMVA 3ZMRA 3VM5A 1QHPA 2OYKA 4MAVA 2CESA 4B15A 3T2OA 4PMUA 3MKKA 2XVNA 3RO8A 1MVYA 1DEDA 5FL1A 4EANA 3HN3A 3PZTA 2WMFA 4GO8A 4QAWA 5A8OA 3GNPA 2D3NA 3K8MA 4W8LA 2WVTA 1Y7VA 1MW2A 1DWFM 1E5NA 3B8SA 2VJXA 3WH6A 2WCGA 4U33A 1V0LA 1JYNA 4J3VA 3VIOA 4JFSA 2BNJA 1W1PA 1C93A 1GONA 4GZEA 1G94A 4BCEA 1HIZA 2V3EA 4BS0A 2WYSA 2G41A 1W3LA 3AMKA 3VD9A 2BV9A 2AMGA 4CD4A 4WKAA 5E0FA 4J3UA 3L4ZA 2XVKA 1BTCA 4J3TA 5CLTA 4LX4A 1KCKA 2CBUA 1CXIA 4HPHA 1WDPA 1HJUA 1U33A 4NRRA 3WN6A 4AZHA 3AMLA 3RM9A 2WW5A 1WB0A 4J28A 1JD7A 4AD4A 4CCDA 5E6ZA 1XHGA 4YN5A 2G3NA 1ZU8A 1CGWA 1JFXA 3K8LA 2W62A 1UD8A 2AAAA 1PIFA 1QNSA 4M24A 1HP5A 2DDXA 1HKMA 4C7GA 2WLZA 1GQKA 3SCVA 3U5UA 2GJPA 4J7RA 1V3HA 3CUJA 3AYSA 8CGTA 4UQBA 1K9FA 4L4OA 4F79A 1TUXA 5CZKA 2XTKA 5EMYA 1H11A 3ZR5A 1UD4A 1V3KA 2PWGA 2DSKA 1MQQA 1JIBA 3CZLA 1CGTA 1JDCA 2VZVA 1HJQA 4AYSA 2VX5A 1NM9A 4Z2LA 2CCRA 3DYMA 3MSGA 1CGVA 1TG7A 2BXYA 2MANA 1CLXA 1NWRA 1V03A 4GI8A 3M6DA 3BXWA 1VFOA 3WNLA 1VEPA 2J75A 1XCWA 4E2OA 2XG9A 4BQ4A 1QI4A 1UH4A 1B3YA 3W38A 2YA1A 2ZUUA 4W7VA 4BQ3A 1B0IA 1E0VA 5D8ZA 5BXSA 3BLKA 1SMDA 4NZCA 2PI6A 2CPUA 3CZEA 2EPKX 3VINA 3WDPP 1H41A 3QHNA 4W5ZA 1UKSA 1E4MM 1KWKA 4TUFA 1ZBVA 5JBFA 4NI3A 4KRUA 3K46A 3DHUA 1ESWA 1FFQA 1GJUA 1EQPA 2F2HA 3VOCA 4CD5A 4D1IA 5AYBA 5F7UA 3MS8A 3ZSTA 1A47A 3NYDA 3NDYA 3G6LA 3UR7A 5A6LA 3EYPA 2GK1B 2CKRA 2J78A 4V28A 1XH2A 2VR4A 1NWTA 3VX0A 1M04A 4TTGA 2WMIB 2XVGA 4PTWA 3ALFA 3IANA 3K4AA 3AXHA 1HL8A 1OT1A 4CD6A 1BSIA 2J47A 2W63A 1W3JA 1V3LA 4Y7EA 3ARUA 2WBKA 5A2BA 1FFRA 2XSAA 2A3BA 2XWEA 4W89A 1ZB5A 2JIEA 2GFTA 2BHYA 3ARTA 4MJ4A 1E55A 2FHFA 3OGRA 1EO5A 3MV01 3SEPA 2YL6A 1BYBA 1FP8A 4D6DA 3WUBA 1WZMA 2XFYA 3W26A 3ARQA 3SCTA 2BS9A 5E09A 4H04A 4CVUA 1G0CA 1X1NA 4D6IA 5I0DA 9CGTA 3W29A 2XIIA 1FH7A 4UNIA 1SR0A 3ZR6A 1NP2A 3T0AA 4XV0A 3AJ7A 1KQZA 2A3CA 2BY0A 3WD4A 1W32A 2J25A 5LA0A 4K68A 3A4XA 4PMNA 3WBEA 1W1TA 2WHKA 5DFAA 4B3KA 4PCSA 1Q4NX 2GJXB 3OBAA 3AZRA 4TVDA 2D1ZA 3NIYA 4QLJA 1J0IA 1QBBA 4RE3A 3WDJA 2W66A 2EQDA 1BGGA 5BXRA 1US3A 2BVDA 4NF7A 2YA0A 2BXZA 5ABFA 2WK2A 2V3GA 1UG6A 2OWXA 1GQJA 1UWIA 3OZOA 1GOQA 1EIBA 1OD8A 2W92A 3GNRA 1QBAA 2JE8A 4FLQA 3UG4A 1W9XA 3ARSA 3SUWA 2DT0A 2XGIA 4AZBA 2XJ7A 1BYCA 2BY2A 5ABGA 4B3LA 1WPCA 3A47A 1PX4A 2CNCA 1NH6A 3D5HA 4M56A 1GW1A 3TTOA 3WD1A 2QPSA 3WMSA 5LYRA 5DEZA 1VB9A 1CDGA 1FHLA 3MSDA 4S3JA 2UY5A 2VCCA 2DT1A 4LXFA 3NSMA 4AC1X 3FAXA 1D3CA 5CPQA 3ARRA 4J3SA 2YLLA 3WDIA 3BSGA 7TAAA 3L4XA 1UD6A 3TONA 4P8WA 2DIJA 1JYXA 4A4AA 4QLKA 3DHPA 4CKQA 1UKPA 4D1JA 5BYWA 2J4GA 1UD5A 1OD0A 3VDCA 3WNOA 1OGBA 4B9ZA 3VIPA 1RD6A 3KL5A 2Y8KA 4H8VA 4E8DA 3K8KA 1JNEA 3BCDA 1QI5A 4JFVA 4CUCA 3SUUA 1LL7A 3CHEA 3HMCA 2OSWA 1KR0A 1Z32X 3RM8A 3T0DA 2XFRA 1TVPA 4WK9A 2ZX7A 4JCMA 3WQ6A 3HU7A 3PTMA 2XPKA 1H2JA 4V27A 2PWDA 1WZLA 1JFHA 4MB5A 2QLYA 3TTSA 3WBAA 4M29A 5FOOA 1I1XA 1W3KA 1QVBA 3RJYA 1E9LA 1UH2A 3L4YA 1OIMA 2VURA 3AS0A 3VIFA 4CU8A 2FHCA 3MUIA 1JXJA 2FHBA 1UA3A 4X0VA 4TX8A 4OJYA 3OLIA 2F8QA 1ODUA 4UCFA 1HKKA 2Y24A 1V3MA 4C7DA 3KE0A 1AVAA 3ARZA 2OWWA 1FH9A 2DSVA 1J0HA 4F9DA 4BZYA 5A94A 4PTXA 1V02A 1E6SM 4ZFMA 4MNLA 3UR8A 4PUDA 4DUWA 1MXGA 4YHGA 4GQRA 2WSPA 1CXHA 2C8NA 3WL0A 4Z2IA 4D72A 5DF0A 3T0BA 4PMRA 1F4AA 3JUGA 4IUGA 5BRPA 3F5LA 1HX0A 1WE5A 7A3HA 5I6SA 1MW1A 2ZUNA 4BF7A 4LPCA 1H3GA 2W4XA 3MV11 3CZ8A 3L4VA 4H2CA 3THDA 1B3WA 3ZIZA 3GBEA 2GSJA 4LYRA 4JFTA 1E3XA 3DYPA 4ATLA 1JGIA 2ZUMA 3MANA 5JIWA 4CU6A 3VD5A 3SCRA 3GH4A 5I77A 1ODZA 2YBUA 3WELA 2CERA 5CGTA 3WEMA 5CPSA 3EDEA 3OGVA 1NQ6A 3ZOAA 1KXQA 5DO8A 5AYIA 5A8NA 1CYGA 2QV4A 4MDOA 5GPRA 1RP8A 3SCPA 3BMVA 2Y8VA 3QGVA 2ZOXA 3T2QA 1ITXA 1UD2A 3UESA 1E72M 3WUFA 4HOZA 2VRKA 2VQTA 1JDDA 4LYQA 3ZSSA 3GH5A 3KL3A 3HJEA 3SCUA 4H7VA 2BFGA 5HNNA 2ZE0A 4UZUA 1JI1A 3AS2A 3VMNA 2G3IA 3VO0A 5A8QA 2X05A 1OSEA 2D0FA 1PX3A 1LJYA 4HZ7A 2WCAA 2A3EA 5IDIA 3SCOA 3WQ8A 5DT5A 3AHZA 4CN4A 2ZX5A 4Q7NA 3WUEA 1J0KA 4AIUA 2DQXA 4E8CA 2CIPA 1C8XA 5M5DA 4GZJA 1OB0A 1EHAA 1DWGM 4GXPA 1UQYA 2E8YA 4AY1A 1E6QM 3OA5A 4LGXA 1CECA 4HA3A 2VCAA 1WDSA 3ECQA 1UZ4A 3UETA 1UOKA 2YIHA 3MMWA 4HA1A 4PSRA 4PTVA 2EJ1A 5A8PA 2V38A 3T08A 4P7QA 4GI6A 1M53A 4UOJA 1V0NA 3PZOA 1FH8A 3GDBA 5C70A 2XM2A 1TA3B 1OM0A 4W8AA 4H8HA 4XZBA 1WAWA 2E40A 1R7AA 1VEOA 4GPNA 5CPTA 5EFDA 2Y5EA 4AD3A 1MWOA 1PX8A 1DP0A 4KGLA 5A8MA 2WKGA 3RIKA 3AICA 1XCXA 3TA9A 1UWTA 4MB4A 1AQMA 3UEQA 4GZIA 1BF2A 2BHZA 3SUVA 2J8FA 3WH8A 2WWCA 3W24A 3MU7A 1JNDA 3WH5A 2QPUA 4CN1A 2C0HA 2V5DA 1QI0A 1R8LA 3WNNA 3WIJA 4NSBA 3VIJA 1V6WA 2J7HA 4ACYA 2ZWZA 3S6TA 3RDKA 2D2OA 2PWEA 1TMQA 2W61A 4RL3A 4XUYA 4RE4A 1X6NA 3RMEA 1H4PA 5C71A 2G3MA 1XV8A 4R27A 5A6KA 1E71M 3PZGA 3WD0A 4ZE4A 2F61A 3ALGA 3OG2A 2W5FA 3AMGA 4EK7A 5A1AA 2WNWA 1UWQA 5IHRA 2ZUVA 2WHJA 1EHNA 1O6IA 1UZ1A 3SURA 1UKTA 3W53A 2UY2A 3W6MA 1UUQA 4PMOA 3WF3A 1W9DM 3W27A 2PBGA 4DWSA 4U3CA 4N42A 2QMKA 1WZAA 3DC0A 4HMEA 4M80A 1PAMA 4ZXOA 2WAGA 4AWEA 4HZ6A 2NW0A 6TAAA 2GVYA 5A2AA 4UTFA 3B9AA 3MUAA 4N0RA 5FL0A 1TCMA 1Q6EA 2JFEX 1XD0A 1XC6A 1HJWA 1HNYA 3AZSA 2FGLA 1V6YA 1E5JA 1HVXA 2WHLA 1D2KA 4JKMA 2JF6A 3AXIA 2YL8A 4UQDA 4MADA 1UR1A 2VX7A 1UHVA 1ISZA 3F4VA 1ECEA 1Q6FA 1MQPA 4HA4A 5CSUA 5I23A 1QW8A 1UKOA 2ZX8A 2DGAA 4XZWA 3VUPA 2E8ZA 4W86A 2WC7A 3BGAA 5I79A 5HOSA 1BVNP 3PTKA 1HP4A 3CMGA 2W91A 1ISVA 1UKQA 3VIGA 1R86A 4QFUA 2ZUWA 3SIMA 2XIBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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