2W66A

Btgh84 in complex with hq602
Total Genus 244
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
244
sequence length
712
structure length
647
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGKQSSKKGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVEGRNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTDYMPHKMLPLQVKANRVLISPVEIELDAIYPGENIQINFRLSAGLQKAPVKFVRFFVLTIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
publication title Molecular Basis for Inhibition of Gh84 Glycoside Hydrolases by Substituted Azepanes: Conformational Flexibility Enables Probing of Substrate Distortion.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
total genus 244
structure length 647
sequence length 712
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2008-12-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2w66A03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2w66A02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2w66A01
1R8LA 3UR8A 4QFUA 4M56A 4AIOA 2WC4A 1WAWA 3ARWA 4MNLA 3RMEA 2FGZA 1B3WA 2WMFA 4JKMA 1OB0A 4QAWA 3AMKA 1E0XA 3MMUA 3QHNA 3WH9A 1HIZA 4PSPA 5M03A 4ZFMA 3MUIA 3WH8A 3SUTA 4H8VA 4EE9A 4UOJA 1CENA 8CGTA 1P6WA 2J7EA 1GOKA 3BMVA 3GXMA 1S46A 2VX4A 1W32A 5JBDA 3WF0A 2G3IA 1BSIA 3PZTA 4TVCA 1WDSA 3MUY1 4BA0A 1E71M 1KB3A 2PI6A 1NOUA 1JD9A 5I78A 4N0RA 4MB3A 3VGDA 2XM2A 1BVZA 1GVIA 2HISA 1V0MA 3RM8A 2D22A 1E3ZA 1M53A 5IXEA 4PUDA 3GZAA 3RCNA 4MJ2A 1FHLA 5AYIA 4XUYA 3O9NA 1GJUA 3PZVA 4W8AA 4IM4A 1JFXA 1FFQA 2J7FA 3WMCA 4W93A 1BPLB 4BF7A 3M6DA 2CBVA 1E3XA 1ZBKA 2OYLA 1E43A 2WHJA 3PZGA 2QV4A 2WVVB 4E2OA 2PC8A 3WY1A 2ZUTA 1JZ4A 3L4UA 4CVUA 3GM8A 4WKFA 1GQJA 4GPNA 2XVNA 3SCNA 4AZCA 1CEOA 4BQ4A 5HOSA 1IZKA 3WQ8A 4XB3A 2WWCA 5FKYA 4AZBA 5IFTA 5D9PA 4DM1A 3K8MA 3UR7A 4P8VA 2BS9A 1JD7A 1C7SA 3QOKA 4M29A 5HXMA 2WNWA 4AD0A 2D0GA 3ARSA 3WIJA 1NH6A 2D0FA 1H41A 3SCRA 1R7AA 3CBWA 5KZ6A 3OGVA 4CU6A 4HOXA 5E6YA 1EQCA 1FH8A 2EXOA 4C7FA 1Q6EA 1CXHA 1RP8A 2XFRA 3L4WA 4CU8A 2UWFA 3AS3A 1QHZA 1DWHM 1EDTA 1W9BM 2UY2A 2WW5A 4MNMA 1J0IA 2CESA 2YDQA 1CLXA 2QPUA 1VEPA 4W87A 2ZE0A 1ZJAA 1WO2A 4AD5A 4HA1A 1PAMA 1MW1A 4CN4A 4PMNA 2E0PA 4PMUA 2A3EA 4ZE5A 2G4FA 2DIEA 1B9ZA 5EB8A 2G3MA 4AD1A 1RH9A 2YBTA 2DSZA 3NDZA 3W37A 3D5HA 3VX0A 4AZ7A 4CCEA 4Z2JA 5IDIA 4CKQA 1JZ7A 3N1AA 2B31A 2GDVA 3TOPA 3GNPA 4AD4A 2ZX5A 1XD1A 4W8LA 3SUSA 3WD3A 1F4HA 2F8QA 2DSUA 2WC3A 1V3HA 3MMWA 1TA3A 2W5FA 3VNYA 2ZUNA 1H1NA 1LG1A 3CUFA 1E6NA 5BRPA 4QLLA 1EXPA 2XVPA 4MTVA 1GOQA 1OGBA 1CIUA 3WH6A 1QBBA 1QI0A 1LL4A 3DECA 3CZJA 1XV8A 4J3SA 3WFLA 5M17A 1GCYA 2WXDM 1N82A 3NSNA 6A3HA 3W24A 2EPNA 5EMYA 2EPLX 1ZBWA 1Q6GA 2A3CA 4TOQA 1HJSA 1J10A 4UNIA 3UERA 1JF6A 3WBAA 4WSJA 1W1PA 1MFVA 1VIWA 5AYBA 1JZ6A 2ZX8A 1TMQA 2C0HA 3CPUA 2W4XA 2XFYA 3SCSA 2XGBA 2PWFA 4AMCA 1J9YA 3ZT6A 4WIWA 2GFTA 1JYXA 3OLEA 2WHMA 1XD0A 4B3LA 2JIEA 3L2LA 2VJXA 2DPEA 3CLWA 1GW1A 4QP0A 2W92A 4M8UA 1UKOA 3PZ9A 2RGLA 4AYSA 4D6IA 1J01A 2CEQA 3OLDA 3PZUA 2BY3A 2DH3A 4PMRA 3WNNA 3L4ZA 5A6JA 3MO4A 3EDFA 3A4XA 5JIWA 4D6GA 3N04A 4D1IA 1BTCA 1V03A 1D3CA 1GJWA 3RJYA 2X0HA 1FP9A 3EMZA 2W62A 4P8UA 3OGSA 1G94A 1EA9C 1V0LA 1CXKA 3B9AA 3N17A 1E6XM 2E4TA 3W82A 2ZUVA 4PBGA 5BXPA 1CWYA 1ODZA 4OBSA 2D1ZA 1PBGA 2WMGA 2NT1A 4JIEA 2EJ1A 4YHGA 5C71A 5DMYA 3VGBA 5JIPA 4CVWA 1LJYA 1ISWA 1TE1A 4GQQA 1CXLA 4AD3A 3W25A 2Z1KA 2ZUUA 3WQ6A 4HU8A 3WDIA 5M5DA 1QI2A 4AIEA 3WN6A 3QR3A 1CGTA 3WD4A 1KGXA 3AIBA 2E9LA 4RE4A 1HN1A 1KR0A 2ZWZA 5BXRA 1MQQA 4Z2IA 2EQDA 1CXFA 1W3KA 3GTNA 3ARQA 3N18A 3W27A 1BQCA 3VGGA 1OWQA 1BGAA 1BLIA 3SIMA 2WSKA 4TVDA 3UG3A 3QHOA 4CD8A 2VX7A 2GUYA 3MV01 4DUWA 2XYLA 1E72M 3VNZA 5D9NA 4PUEA 1WPCA 2EO7A 4C7DA 4F79A 4M82A 1MQRA 4P7QA 2CNCA 5I3DA 4NRSA 2V5DA 1KWGA 1E73M 5E9AA 3S2CA 1JL8A 4NF7A 1OBAA 1HVQA 3G6LA 1C93A 2ZWYA 1VB9A 1E0WA 3AS0A 1UUQA 3BXWA 4RE3A 1UH4A 3VIPA 2WAGA 2XJ7A 1KFWA 4DWSB 1V02E 1NQ6A 2YIHA 1QHOA 1W2PA 3VDHA 4PMOA 3M7SA 2HVMA 2FDMA 2FH8A 5FOOA 3SCWA 1E6RA 2WCSA 3QHMA 1WZMA 5CLWA 4V27A 1VBUA 2UY5A 1EO7A 1UZ1A 3FXYA 3AZRA 1VFMA 3RM4A 3AXIA 3U7BA 2BY1A 5CSUA 2J8FA 1C90A 5A2AA 3RILA 1B2YA 4N42A 1DWFM 4MDPA 1ODUA 1QI3A 7CGTA 4H41A 1V6WA 4JFVA 3TTSA 2VUYA 3OLIA 1HJVA 3EMQA 4HZ8A 3FHQA 3AQUA 1UKQA 3L4VA 4M24A 1VFUA 2YL9A 3WEMA 3W38A 4GINA 4JFSA 4X0NA 4C90A 1VENA 4JL1A 1V3JA 3CZ8A 4CD4A 1KWKA 3AZSA 1WNOA 3AIUA 3O2LA 3IANA 4J7RA 3MSDA 1IV8A 2OSWA 1QOXA 4S3KA 1AMYA 3CGTA 1NOWA 4DUXA 3WD0A 1FH7A 4AZCB 3PTKA 3UETA 1NWRA 4OZOA 1ITCA 1I75A 5CPSA 3VDCA 4ATDA 4UQ9A 4J28A 1DWGM 2NW0A 4AZ5A 1JI1A 3ARPA 4J27A 3BAJA 3VGHA 5JBFA 3WUBA 1KBKA 4GI6A 4KRTA 3E1F1 5AC5A 2CIPA 2OWWA 3BLKA 1V6XA 2VMFA 4J3WA 2Y24A 3WUEA 4IUGA 2BVDA 2E40A 2VR5A 3U57A 4TXEA 1US3A 3ARYA 3ZSTA 2A3AA 5A94A 1UD4A 4Z2LA 1XGZA 1WDQA 1PIFA 4BQ3A 3VMOA 1HKKA 4P7RA 4PTVA 4A4AA 4OBRA 4CU7A 4NRRA 3PZIA 2YDRA 2NT0A 1BHGA 1UQZA 2XTKA 4ZENA 2WMJA 5D8ZA 4JCMA 1CGXA 1BG9A 1HNYA 3VD3A 2V3GA 2YJQA 1XRVA 1ZS2A 3IK2A 1I1WA 4AC1X 3VPLA 3CHFA 2J75A 5CGTA 4CGTA 3LPPA 3W81A 3AZTA 4UCFA 3OLGA 5GNZA 3AISA 4KH2A 2VVNA 3N13A 6TAAA 3GNOA 2WWDA 3M07A 2W61A 4C91A 3PZMA 1HKJA 2YL8A 4HMDA 4UQAA 3AIEA 4OOZA 3THCA 3VTRA 3NIYA 4BQ5A 1WDRA 4PTXA 1B1YA 3GNRA 2E3ZA 4LQ1A 4ZE4A 3K46A 4XZBA 3RPMA 1OGGA 2ZXQA 2V3DA 1BYCA 2FH6A 1C8XA 4D6CA 3DHPA 3WH7A 4LYPA 2A3BA 1E6ZA 4ZXLA 3HMCA 5M3WA 3DYMA 3CZEA 1W3HA 2OWXA 3T0DA 1K9TA 4D6EA 4S3JA 2JF7A 3F5KA 3BSHA 2VRQA 3OG2A 4Z2HA 2VI0A 1WKYA 1TCMA 2YBUA 1XSKA 1W3JA 1Q6FA 1PX3A 1JF5A 4EANA 3ZOAA 5BCAA 3EDEA 2O92A 2X0YA 1WZKA 4AEEA 5CQ1A 2FHFA 1XSJA 3N9KA 1J0KA 2WB5A 4FLQA 1U2YA 5CGMA 1G5AA 2PF0A 4A3HA 1LQ0A 1X6NA 3WL0A 3ZJ8A 1V6VA 1ZBVA 2VZSA 5JUVA 3OBAA 1K9FA 2GJXB 1QI5A 3VM5A 3UEQA 1BF2A 4FLRA 2WC7A 1DHKA 5I6SA 3BAXA 1NM9A 3CZKA 1AQMA 2YLAA 2WANA 3POCA 1R87A 4MNJA 4WLCA 3WELA 2DT3A 1FHDA 1DTUA 2XWDA 1MXDA 4J3TA 3VX1A 4HTYA 5D8WA 3CHEA 1UWRA 3VGEA 1FFRA 1HXJA 1CGWA 1JFHA 1X1NA 1E6PA 5LYRA 5A6KA 1M7XA 3WNMA 2WCGA 2PWGA 1UD6A 4ML4A 1ISYA 1DEDA 3SCUA 1E4IA 2VQUA 2YL6A 4YPJA 1FP8A 1W2VA 4Q22A 5IHSA 3POHA 4JCLA 5ABHA 3WD2A 2W66A 3BC9A 5D9OA 1GNXA 6CGTA 1U30A 3GXFA 3WEOA 4BZYA 2CITA 2VOTA 3VIHA 4W84A 2G3JA 5FD0A 3ALGA 1GUVA 1CXEA 3ZJ7A 1GQLA 2VCAA 4AIUA 1ISVA 3CO4A 1OIMA 1I1XA 2XG9A 2JE8A 4E8DA 4HPHA 2VZTA 2JEPA 1HT6A 4UOZA 3MKKA 4ATLA 2V5CA 2GK1A 3AFBA 1M03A 3PZNA 3TTQA 4M1RA 3L4YA 2XIBA 1B3VA 1GOIA 3WF4A 3MS8A 3ZIZA 2VTFA 3SUWA 4GXPA 2OYMA 3AHVA 1F4AA 5E0CA 5EFDA 5F7UA 4WF7A 5EBAA 5HPCA 2CKRA 4D1JA 3RDKA 1V0NA 4W85A 2WVUA 1BFNA 4J3UA 5LA2A 1U33A 3PHAA 2O9PA 2W91A 3BH4A 4HZ6A 3QOMA 5A1AA 5JBEA 3AMGA 1NWTA 4W7WA 3MV11 1D7FA 3CUIA 3D3AA 4UZUA 3TONA 2J62A 3GDBA 2Y2WA 2GSJA 1Y7VA 2BHYA 3FN9A 3IJ7A 2AAAA 4PEEA 5FL1A 3WD1A 2WYSA 1ECEA 5A6MA 1HL8A 4ZEPA 2DDXA 5BXSA 1QW9A 1BYAA 1GPFA 1QPKA 3BAKA 3T0BA 4GQRA 3WDHA 5AY7A 4PYSA 4JKKA 4TTGA 1PPIA 3NJ3A 2VX5A 3LMYA 4X0VA 2NSXA 1V3LA 4KGJA 1ZJBA 3KL3A 2BV9A 5LA1A 4ACZA 4GKLA 1EOKA 4IPNB 1JYNA 3AHYA 3CH9A 3U5YA 2D3NA 2G8ZA 4FLSA 1OT1A 1J18A 3MSGA 1JDAA 1ESWA 4PMYA 4X9YA 2GDUA 3BCDA 1V6YA 3G6MA 3PZQA 3GH5A 2DEPA 2BNJA 3A6OA 1RD6A 1Q6DA 3OA5A 2BXYA 3K4AA 5A2CA 2DQXA 1JYWA 3BAYA 4PMXA 5AC4A 3W0KA 3AS2A 3BSGA 2WLYA 4LPCA 3VIJA 1WDPA 4D6DA 3UG4A 2X8RA 1XC6A 1VRXA 1MWOA 1OINA 5ABFB 1DWIM 3MMDA 1UWUA 3ARRA 2DT1A 1XSIA 4EAMA 2ZX7A 2QF8A 1VBRA 1ZB5A 4UFHA 4B15A 1CGVA 3AMLA 1LWHA 1GOWA 1UH2A 1FH9A 2C7FA 4W5UA 4D71A 3UESA 2CERA 4H8HA 4WK9A 3A4WA 3SCVA 3GH7A 1WP6A 2X09A 1C92A 3VD5A 3OZOA 1OM0A 2CHNA 5A8QA 1VAHA 1V02A 4PTWA 4B3KA 2CKSA 4P7LA 4F66A 5A6LA 2WZEA 1J11A 5A8PA 2BY2A 5CLTA 5DT5A 1UWTA 3K8LA 2J4GA 1VJSA 4H2CA 1HP5A 3KE0A 1W1TA 3DC0A 5A6BD 3APGA 1G0CA 3LPFA 4E4PA 3TTOA 1KXTA 4GIAA 2PB1A 3GH4A 1UKSA 2DIJA 1CYGA 1PX4A 3VOCA 3LPOA 3MUAA 2W63A 2CETA 3OB8A 3VIGA 3HU7A 4LYQA 1M01A 1UD8A 3BGAA 4LXFA 1OSEA 2WSPA 4UFMA 2CHOA 3W28A 1MW0A 4RE2A 3UG5A 1EH9A 4H04A 3AIQA 3RO8A 4HOZA 4M80A 1YHTA 2V38A 1NP0A 3HJEA 4JAWA 3BMWA 1NWUA 1UHVA 4R5EA 1VFFA 3GBDA 4J3VA 2DH2A 5ECUA 3F4VA 1TR1A 4PSRA 2D20A 4AZHA 2Y4SA 1H0GA 4KRUA 1J0JA 3CMJA 5HDRA 1BAGA 3II1A 5EFFA 3EDKA 2O9OA 1XYFA 1LL6A 3ALFA 3LPGA 4PTMA 1US2A 1GONA 4MADA 1EHAA 5LA0A 2JF6A 2G3NA 3AYSA 1MFUA 1JDCA 2BVYA 3VUPA 4AZIA 3AHXA 3U7VA 4AD2A 3K1DA 1H0IA 3AMDA 3W29A 3QGVA 2WBGA 1XYZA 3VINA 1O6IA 2VCBA 1UQYA 1SR0A 4MPKA 3I3BA 1W9XA 5E0FA 1UD2A 4HU0A 3SUUA 3VU2A 1TG7A 4RL3A 3ZQ9A 4R27A 1H5VA 1PZ3A 3FHAA 3I3DA 1LWJA 3S6TA 2J77A 3PZOA 1JZ2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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