2WARA

Hen egg white lysozyme e35q chitopentaose complex
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFQSNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Gallus gallus
publication title The Chitopentaose Complex of a Mutant Hen Egg-White Lysozyme Displays No Distortion of the -1 Sugar Away from a 4C1 Chair Conformation
doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME C
total genus 52
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2warA00
4ETBA 2Z37A 4DWXA 2BQIA 2MEEA 5KXSA 1B7OA 1C43A 4YOPA 1NHEA 1GDXA 1LZTA 4OWEA 1D6QA 5F16A 1IWWA 1D6PA 1GBSA 4B49A 3AW6A 3M18B 3A92A 5A3EA 4Z3MA 4OWAA 4P2EA 1IOTA 1LSDA 1IR9A 1LSZA 4MR1A 1KIQC 2BQOA 2B5ZA 4HTQA 1FKQA 1XGPC 3WW6A 4DT3A 194LA 1GFEA 1LTMA 1RCMA 4GCEA 4H1PA 1A4VA 5LVHA 7LYZA 1J1OY 1RE2A 2FYCA 1HERA 4H9IA 4TX7A 4ZFPA 5I4WA 1GF3A 1F6SA 1OUEA 1BWIA 1GF8A 1GEVA 1G7JC 1JSEA 4OOOA 1GFGA 4HTNA 1EL1A 1GBYA 5KXWA 1C46A 2D4IA 2I26L 2LYZA 3LZTA 1GB7A 4NGIA 3AZ4A 5FHWA 1PZYA 1LKSA 1OUFA 1T3PA 2DBTA 2IFFY 3CB7A 3P65A 3TXBA 3TXDA 3M3UA 4Z41A 5KJ9A 1LHKA 3GXKA 2Z39A 5LVJA 1IIZA 1B7RA 4NFVA 3TXJA 4GCFA 3TXFA 2Z19A 3WMKA 2GV0A 1LMQA 3A90A 2DQHY 4KL7A 1SLYA 1JEFA 2RSCA 4U3XB 1UIAA 1OUDA 4NGKA 1CKFA 1LSGA 3WVXA 5LVKA 4B4JA 1UIDA 1GXXA 1JWRA 1EQ5A 4NHSA 3W6DA 3EBAB 1QUTA 1CJ7A 3KAMA 1REYA 2W1MA 3WVYA 1LHJA 2HU3A 2BPUA 1UIGA 2XBRA 5KXPA 1XGQC 4WOAA 2H9KA 1IR8A 2XBSA 5DN4A 3P64A 4DD7A 5ILFA 208LA 4M4OA 5B07A 1IOQA 2YBNA 4NWEA 1LSBA 3RNXA 3ATNA 1YIKA 3N9CA 4TTDA 2LZTA 2MECA 2NWDX 4XJFA 4H9FA 3ATOA 1D0MA 5FCPA 1LZDA 4HV1A 4PGJB 1BVXA 5D5FA 1JPOA 1UACY 3D3DA 1GWDA 3D9AC 4H90A 1DQJC 4NG8A 4WG1A 1XEIA 1IC5Y 4YM8A 1IP1A 1FN5A 1HEPA 1IWZA 3IJUA 4GCBA 1B5YA 1WQMA 1GE0A 1LMAA 1B5ZA 3CT5A 5K7OA 1GB9A 4ZEEA 3QNGA 1GF5A 2F30A 4KT3A 1IP4A 2BQDA 1CKCA 3A8ZA 2I25L 5C6LA 2F4AA 2F4GA 5LIOA 1DKKA 1QTKA 5M1YA 3AZ6A 4WL6A 3A3RX 1DPWA 1XGUC 1GB8A 2C8OA 4J7VA 1B5UA 1UC0A 3HBDA 1LZSA 1YAMA 4LYMA 5J7CA 4LT2A 1QUSA 4TUNA 4HJYA 5DM9A 1AKIA 4CFPA 1QIOA 3ULRA 9LYZA 1VDSA 3TMWA 3BKVA 1GFVA 4ZIXA 1MLCE 1UIFA 1YROA 1IP5A 1LZ1A 1JJ3A 2I6ZA 3A94A 4J0LA 1GAYA 1MELL 4ETDA 3CT0A 4H9HA 4RW2A 1D0LA 4OWBA 1DI4A 2YSSC 1I56A 1C08C 3W6AA 4WLYA 1V7SA 1BB4A 4PPOA 1HEQA 4WM3A 1IOSA 1JISA 5LVGA 2FBDA 2N5ZA 3FE0A 3HBEX 1PS5A 1LHIA 3GXRA 3LYTA 2EPEA 2LYOA 1JUGA 1V7TA 2W1XA 5KXTA 1G7IC 2DQIY 1GB0A 1GF6A 4LT3A 193LA 1W08A 3G3AB 1B5XA 2BQKA 4ETAA 1VEDA 2A7FA 4RW1A 1LJGA 1IEEA 1ZVHL 1XSFA 1WTMA 4ET9A 4GCDA 1IC4Y 4NGLA 4M6DA 1BWHA 1BB5A 1C7PA 4QDNA 1J1PY 4N1EI 1UBZA 5B06A 1TEWA 1WQNA 132LA 1RI8B 1ZV5L 1JKAA 1XFPL 1JHLA 1LSCA 3A67Y 3TMXA 1QSAA 4PHIA 4RDSA 1HEMA 1LSFA 2IHLA 5APFA 3AGGG 3HFMY 1HFXA 3WPJA 1LAAA 1ALCA 1LPIA 1LHLA 2CJLA 2CWIA 1GFJA 2YBHA 1CKDA 2YBJA 4GLVA 4IJ4A 1QTEA 4XADA 1B5VA 1LZNA 1LKRA 1CJ9A 1LZ5A 4R0FA 1D9UA 1B7NA 4H9CA 1IY4A 4UWUA 4N9RA 4H9BA 1J1XY 1IWVA 2BQCA 4UWVA 3RT5X 3ZVQB 2CDSA 5KXLA 1GFAA 1RFPA 2DQDY 4N0JA 4BS7A 1JTOL 2HECA 4QY9A 4B0DA 4G4HA 1LOZA 1LYYA 1GF7A 1YANA 3TMUA 3QE8A 4II8A 4NWHA 3J4GA 1OUAA 2EIZC 1YL1X 3E3DA 4WMGA 3WH1A 134LA 1G7HC 1QSWA 3MGWA 4LYTA 5HLLA 4BADA 5II3A 3EMSA 5KXRA 1FKVA 4NGWA 3TXEA 5AMYA 5DN5A 1JSFA 5KXOA 4R6CA 5HMJA 4Z98A 1B7PA 3TXHA 4ANRA 1BVKC 1JITA 4DC4A 3LYZA 4H8XA 5LINA 5KKIA 1KXWA 4GN4A 4XJHA 1VAUA 1GB6A 5B1FA 1GBZA 1HENA 1LJFA 1LSPA 2HEEA 4NGOA 1GAZA 1LMPA 1OQMA 5KXKA 1FBIX 5IDDA 1LHHA 2LYMA 1BB3A 3AZ7A 4NIJA 2ZYPA 1VATA 5LVIA 2BQEA 3J6KA 1LJEA 1YQVY 2YBMA 1CJ6A 4N5RA 4DD3A 3LZ2A 1W6ZA 4GN3A 4OOTA 1LZEA 2C8PA 4A7DA 3A95A 4WL7A 1GFKA 4NGYA 3G3BB 1YAQA 2ZQ4A 4LYZA 1GBOA 3W6CA 5JENB 5KXMA 5F9XA 1B7QA 5I4YA 4CGEA 2ZILA 4LT0A 1LSNA 1YAPA 1GF4A 1YKZX 2Z2EA 4H9AA 5D5CA 4DYGA 4WLTA 4DD0A 2BQBA 5DLAA 3AW7A 3LYMA 1UIHA 2H5ZA 3T36A 1GEZA 2HUBA 5F81A 1KIPC 5C6IA 4NSIA 1GHLA 2HEFA 1LCNA 4LYCA 4IATA 1KXYA 5KXNA 1LJKA 1HF4A 2BLYA 5HNLA 1FLWA 2Z38A 5ILCA 1LJIA 1IP3A 1TCYA 1KIRC 4XJBA 3WW5A 3A6BY 1QDTA 3WUAA 1WQOA 2ZNXY 3OJPA 2DQCY 4ET8A 4CJ2A 1IP6A 1NBZC 4TSBA 4DD9A 5LAGA 3WL2A 1TAYA 2MEGA 3EO5A 1GXV2 1LSYA 1LZ4A 1LMCA 4NGVA 1GE3A 1IC7Y 1HFYA 3CT1A 4OWCA 4Z46A 1E8LA 4NSGA 1LZAA 2D4JA 1LZ6A 4E3UA 4PRQA 3B0IA 4H9EA 153LA 4NHIA 4ETEA 4WLDA 1GE2A 4WG7A 3VWOA 1BQLY 1HMKA 2BQFA 1RJCB 4I8SA 5LXWA 1LJ4A 1KXXA 1YILA 3A6CY 1LMOA 2HEAA 1NBYC 2DQJY 1GFHA 4LT1A 4NGZA 3RW8A 5I54A 1GBWA 2W1YA 3QY4A 2WARA 4AXTA 1N4FA 2A7DA 2VB1A 4G4CA 2EKSC 2HEDA 1VDQA 1NDGC 4UWNA 2BQNA 4XYYA 4LYOA 3ZEKA 3K3TA 2ZNWY 1LMNA 3IJVA 1EQEA 4HP0A 4N1CC 2MEIA 5IHGA 1LJJA 1CKGA 4H8ZA 1AT5A 2DQAA 4TWSA 4I0CA 5LAFA 1H6MA 3TXGA 1T6VL 3W6BA 4NHTA 4WM6A 4WLXA 4G49A 5IELA 5KY1A 4HJZA 2Z2FA 3T6UA 4XJGA 4LGKA 4XN6A 1LZCA 1GPQC 2PC2A 3A93A 4HTKA 3WYHA 4H8YA 2ZIJA 1BB6A 1EQ4A 5KXXA 1YAOA 1NDMC 2DKVA 2AUBA 1WQQA 1JIYA 5FELA 2MEFA 3AZ5A 1H87A 1IR7A 1LZBA 2BLXA 2LHMA 4LYBA 1INUA 2YVBA 4X3BA 1LZYA 1QQYA 6LYZA 1HHLA 4C3WA 1UIEA 4GLAA 1JTTL 4YEMA 1JJ0A 1GB5A 1LJ3A 4MSTA 1HSWA 3F6ZA 1FLQA 4LZTA 5LA5A 4EMNA 1IWXA 4RLMA 2XTHA 5APDA 4YEOA 1A2YC 3FI7A 1GE1A 4TSCA 4J1BA 4H94A 4B4EA 5I53A 3WU8A 1FLYA 3A91A 2Y8PA 4NSJA 1TDYA 2G4PA 3TXIA 5B05A 4CHXA 1IVMA 4XJDA 4ML7A 1UUZC 2CGIA 1HMLA 4MCKA 1VDTA 1IOCA 4IASA 5HMVA 1IY3A 4HPEA 5HNCA 2XJWA 3WPLA 4NG1A 3WU9A 5B1GA 1G7MC 5T3FA 4EOFA 2F2NA 3CSQA 4D9ZA 2G4QA 1F0WA 1JKBA 3ZVQA 4OWHA 1NF5A 2DQEY 2BQJA 1B2KA 1NWGA 1GE4A 1P2CC 1UCOA 4O34A 1WVVA 1HNLA 1WVUA 2YBIA 4XJIA 3WPKA 1GF0A 1C45A 2G4NA 3RZ4A 1GFUA 2ZQ3A 4KXIA 1BWJA 5APCA 2H9JA 5I4XA 1LYOA 1OUGA 1REZA 1JTPL 1IORA 3B72A 4PJ2C 5E4PA 1LHMA 6LYTA 1HC0A 3P66A 4QGZA 2FBBA 3P4ZA 4FJRA 1B7LA 3WXTA 4N8ZA 5LYTA 1UA6Y 1IWUA 1GFTA 1LJHA 4HSFA 5LA8A 1LJNA 1HELA 5DL9A 1GDWA 3N9AA 2X0AA 4YF2A 1SQ2L 4NHPA 4H91A 2MEHA 5KKJA 3W3EA 3P68A 1O23A 4WO9A 4OW1A 2BQHA 5LYMA 1BHZA 2DQFC 4LFPA 5L9JA 4W96A 1B7SA 5KXYA 2Q0MX 1BB7A 1WQPA 3SP3A 1DI5A 1DPXA 5EBHA 3WUMA 207LA 2BQMA 3OK0A 5I5QA 1HEWA 1BGIA 1ZVYB 3A34A 1LZ9A 4YENA 5L3IA 1XEJA 1F10A 2ZIKA 4WM5A 3WUNA 5A3ZA 4DD2A 3CQLA 5F14A 1IWYA 1B9OA 1F6RA 1OUCA 1XGRC 1FDLY 1ZMYL 2HU1A 1CKHA 1OUIA 3N9EA 5B59A 1DI3A 4G4BA 1XEKA 3AYQA 5E9RA 4WO6A 2HEBA 4PRUA 4DD1A 4W94A 1AZFA 2FYDA 1YL0X 1GF9A 3EXDA 2Z12A 4KPMA 4B4IA 1IX0A 1IP7A 4GN5C 1DZBX 1GB2A 4BAPA 3W6EA 4L41A 1YKYX 5HQ1A 1GBXA 1JJ1A 3B0OA 5C6JA 2D91A 3AGHA 3IWRA 3CSZA 1GB3A 2ZWBA 1B0DA 1TBYA 3TXKA 3WU7A 3HBHA 4G9SA 2ZYCA 3AJNA 1OUBA 3LYOA 4NGJA 4WM4A 4XENA 2HTXA 1C10A 135LA 1QDRA 5F9UA 1G7LC 1NKHA 3CSRA 4HV2A 4ETCA 1FLUA 4HJVA 1AT6A 5APEA 3WXUA 2DQGY 4DDAA 1OUJA 4GCCA 3TMVA 2YBLA 3LHMA 1LYSA 3B6LA 4NSHA 4RLNA 2BQLA 1GD6A 1IO5A 1LSAA 3AB6A 5FSTA 4C5FA 3B0KA 1I20A 1REMA 5LYZA 2MEDA 1CJ8A 1I1ZA 1XGTC 2YDGA 2D6BA 1Z55A 3W6FA 4AGAA 1DXJA 1YKXX 4NEBA 5FEKA 1JKDA 1LZ8A 1GFRA 1B7MA 5FDJA 5KXZA 1WQRA 4WM1A 1NQIA 1LSMA 3A3QA 4DDCA 1D0KA 1WTNA 5L3HA 4NHQA 154LA 3BKHA 1IWTA 1JKCA 1OUHA 2BAAA 4BAFA 133LA 2D4KA 4H92A 1HEOA 1LMTA 2EQLA 3LN2A 1REXA 3AGIA 2MEAA 1UICA 2W1LA 1OP9B 4DDBA 3A96A 2BQGA 1B5WA 2Z18A 4CFOA 4LFXA 4FDYA 1VFBC 1AM7A 2MEBA 1DKJA 4HPIA 4WM2A 1IP2A 1UIBA 2BQAA 1VDPA 1LSEA 4J1AA 3RU5A 2LZ2A 1HFZA 1HSXA 4NY5A 4QEQA 1LZGA 4B1AA 8LYZA 3WULA 1LYZA 1LZRA 4H93A 1CNSA 1NMMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L90A 2F32A 4DWXA 4YOPA 1D6QA 1L54A 1L25A 4GRVA 4OWAA 1LSDA 216LA 1L98A 1OV7A 4W57A 1XGPC 194LA 4GCEA 4H9IA 5FHWA 1BWIA 1JSEA 1GBYA 1C46A 1GB7A 3AZ4A 4W53A 2IFFY 1LKSA 4Z41A 4NFVA 3TXFA 3WMKA 1T8AA 1L99A 1CKFA 4EKPA 209LA 4B4JA 1UIDA 1EQ5A 1L28A 2W1MA 1L19A 3WVYA 2HU3A 1UIGA 1L18A 1C60A 1LSBA 3ATNA 1YIKA 4TTDA 2NTHA 184LA 2RB1X 4HV1A 3FI5A 1BVXA 1GWDA 3D9AC 4WG1A 1XEIA 1IP1A 1B5YA 1WQMA 3QNGA 2F30A 2OU9A 1LW9A 1IP4A 1CKCA 3HUQA 2I25L 5C6LA 2F4GA 5LIOA 1L53A 3AZ6A 201LA 1DPWA 2C8OA 4J7VA 1LZSA 4LYMA 4LT2A 1QUSA 4CFPA 4HJYA 1QIOA 1VDSA 3BKVA 1GFVA 1UIFA 1GAYA 3CT0A 4RW2A 4OWBA 1DI4A 1V7SA 4PPOA 3GXRA 2LYOA 1JUGA 5KXTA 1L21A 2DQIY 2OU0X 1L79A 2BQKA 1L27A 4GCDA 1IC4Y 5B06A 132LA 1JKAA 1JHLA 1LSCA 1QSAA 3GUMA 189LA 1HEMA 144LA 5APFA 3HFMY 3DMXA 1CU2A 223LA 4IJ4A 2CJLA 2YBJA 1LZ5A 1D9UA 4AQNA 2BQCA 1RFPA 1JTOL 186LA 1PQKA 4B0DA 1L55A 1QTHA 1LYIA 196LA 1OUAA 1P46A 255LA 4WMGA 1L13A 134LA 4LYTA 5II3A 1CU0A 4ANRA 175LA 4EKRA 5KKIA 1VAUA 3VW7A 1LSPA 1L73A 1FBIX 1P6YA 1BB3A 3AZ7A 102LA 3RUNA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4ETB A;  2Z37 A;  4DWX A;  2BQI A;  2MEE A;  5KXS A;  1B7O A;  1C43 A;  4YOP A;  1NHE A;  1GDX A;  1LZT A;  4OWE A;  1D6Q A;  5F16 A;  1IWW A;  1D6P A;  1GBS A;  4B49 A;  3AW6 A;  3M18 B;  3A92 A;  5A3E A;  4Z3M A;  4OWA A;  4P2E A;  1IOT A;  1LSD A;  1IR9 A;  1LSZ A;  4MR1 A;  1KIQ C;  2BQO A;  2B5Z A;  4HTQ A;  1FKQ A;  1XGP C;  3WW6 A;  4DT3 A;  194L A;  1GFE A;  1LTM A;  1RCM A;  4GCE A;  4H1P A;  1A4V A;  5LVH A;  7LYZ A;  1J1O Y;  1RE2 A;  2FYC A;  1HER A;  4H9I A;  4TX7 A;  4ZFP A;  5I4W A;  1GF3 A;  1F6S A;  1OUE A;  1BWI A;  1GF8 A;  1GEV A;  1G7J C;  1JSE A;  4OOO A;  1GFG A;  4HTN A;  1EL1 A;  1GBY A;  5KXW A;  1C46 A;  2D4I A;  2I26 L;  2LYZ A;  3LZT A;  1GB7 A;  4NGI A;  3AZ4 A;  5FHW A;  1PZY A;  1LKS A;  1OUF A;  1T3P A;  2DBT A;  2IFF Y;  3CB7 A;  3P65 A;  3TXB A;  3TXD A;  3M3U A;  4Z41 A;  5KJ9 A;  1LHK A;  3GXK A;  2Z39 A;  5LVJ A;  1IIZ A;  1B7R A;  4NFV A;  3TXJ A;  4GCF A;  3TXF A;  2Z19 A;  3WMK A;  2GV0 A;  1LMQ A;  3A90 A;  2DQH Y;  4KL7 A;  1SLY A;  1JEF A;  2RSC A; 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 1IOR A;  3B72 A;  4PJ2 C;  5E4P A;  1LHM A;  6LYT A;  1HC0 A;  3P66 A;  4QGZ A;  2FBB A;  3P4Z A;  4FJR A;  1B7L A;  3WXT A;  4N8Z A;  5LYT A;  1UA6 Y;  1IWU A;  1GFT A;  1LJH A;  4HSF A;  5LA8 A;  1LJN A;  1HEL A;  5DL9 A;  1GDW A;  3N9A A;  2X0A A;  4YF2 A;  1SQ2 L;  4NHP A;  4H91 A;  2MEH A;  5KKJ A;  3W3E A;  3P68 A;  1O23 A;  4WO9 A;  4OW1 A;  2BQH A;  5LYM A;  1BHZ A;  2DQF C;  4LFP A;  5L9J A;  4W96 A;  1B7S A;  5KXY A;  2Q0M X;  1BB7 A;  1WQP A;  3SP3 A;  1DI5 A;  1DPX A;  5EBH A;  3WUM A;  207L A;  2BQM A;  3OK0 A;  5I5Q A;  1HEW A;  1BGI A;  1ZVY B;  3A34 A;  1LZ9 A;  4YEN A;  5L3I A;  1XEJ A;  1F10 A;  2ZIK A;  4WM5 A;  3WUN A;  5A3Z A;  4DD2 A;  3CQL A;  5F14 A;  1IWY A;  1B9O A;  1F6R A;  1OUC A;  1XGR C;  1FDL Y;  1ZMY L;  2HU1 A;  1CKH A;  1OUI A;  3N9E A;  5B59 A;  1DI3 A;  4G4B A;  1XEK A;  3AYQ A;  5E9R A;  4WO6 A;  2HEB A;  4PRU A;  4DD1 A;  4W94 A;  1AZF A;  2FYD A;  1YL0 X;  1GF9 A;  3EXD A;  2Z12 A;  4KPM A;  4B4I A;  1IX0 A;  1IP7 A;  4GN5 C;  1DZB X;  1GB2 A;  4BAP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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