2WCAA

Btgh84 in complex with n-butyl pugnac
Total Genus 225
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
225
sequence length
585
structure length
578
Chain Sequence
LQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVEGRNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
publication title Insight Into a Strategy for Attenuating Ampc- Mediated Beta-Lactam Resistance: Structural Basis for Selective Inhibition of the Glycoside Hydrolase Nagz.
pubmed doi rcsb
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
total genus 225
structure length 578
sequence length 585
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2009-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2wcaA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2wcaA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2wcaA01
1W3JA 4QFUA 4UTFA 3MMDA 4WF7A 4AD4A 4H7VA 2DH3A 3G6LA 3BAJA 3OLGA 1VBUA 5ABGA 2J8GA 1FFQA 4PTXA 1JNEA 2DH2A 3AROA 2NW0A 1ISWA 4PMOA 1DEDA 3VNZA 1KXVA 3MUY1 1UKPA 1ZB5A 1CGWA 4OZOA 4J7RA 4BCEA 1XCXA 4FLQA 5LA0A 2FGZA 3UR8A 3ZSSA 3M07A 1CGUA 3VIKA 1E4LA 3ZR6A 4F79A 4AZ7A 1IZKA 2WANA 3SEPA 1AQ0A 4AD0A 2WYSA 4AC1X 2VCBA 4JKKA 5HDRA 4LYQA 3BH4A 1B1YA 4EKJA 4HZ8A 2W91A 1KB3A 5A3HA 4PTWA 2CBJA 1NQ6A 3GXFA 3WSUA 3HU7A 4U31A 2YOCA 1NH6A 2YA1A 1GOIA 4AD3A 3GM8A 1BAGA 3AZRA 2X09A 1K6AA 4KMQA 2AOSA 4A3YA 2VURA 3N13A 1B2YA 1BSIA 1OGSA 1KBKA 1UYQA 2WVVA 1QI4A 2V38A 5FL0A 1HKKA 1W9PA 2EPOA 2XFYA 3AMDA 1WZAA 1NWTA 1XD1A 1CLXA 2OWWA 3ARYA 4C7FA 1H5VA 3CIVA 4EE9A 1QBAA 1XHGA 3TA9A 1XD0A 5DF0A 1EGZA 2WVUA 4AIOA 1E56A 5A8QA 4AZIA 3MANA 3NDZA 3A4AA 4NI3A 3CHEA 4B3LA 1VFUA 1UA7A 2DT0A 3W37A 4ATDA 3GXIA 1UD2A 3IJ8A 3FHAA 2QHAA 2FH6A 2F2HA 3NUKA 2QPUA 3IAQA 3WF3A 1Z32X 4RE4A 1EDQA 2X0HA 4JHOA 2YLLA 3CUHA 4AZGA 5AY7A 1V6UA 2E9LA 3U5YA 3ARZA 2W92A 3PZQA 5FD0A 1I1XA 1OD8A 4HMEA 1BQCA 1I75A 4CN6A 4RE2A 3ARPA 3CTTA 4PMVA 1E6PA 1W9XA 1G01A 2Y2WA 2W61A 2PWGA 5CSYA 4AZCB 1KWGA 2CBVA 5ABFA 2CYGA 2VO5A 3VIPA 5JBFA 2WSKA 3VIFA 2ZE0A 2VCCA 4OBSA 4WKHA 3D5HA 1AMYA 2D0HA 2ZXQA 1UHVA 4LQ1A 3OZOA 1OM0A 1WDSA 4LYRA 1CXLA 3W6MA 4W86A 1F4HA 2Y8VA 1HJUA 1E4NA 2XHYA 4GKLA 3II1A 3W25A 3EYPA 3AHXA 4HPGA 3ZT5A 4D6HA 3VDAA 3FXYA 5BXRA 1P6WA 1R87A 2WK2A 3VM7A 5GPRA 1J18A 1H49A 3SUVA 3VIIA 1ISXA 2ZWYA 1PJ9A 3SCNA 5DEZA 2VZUA 4XX6A 4M8UA 2VX4A 1W9VA 2PBGA 1L8NA 5A6BA 4UQAA 3PTQA 3PZ9A 3GDBA 1VEPA 3W38A 1JYWA 1JF6A 1BYAA 1C7TA 4W88A 3AIUA 2QMKA 4CU7A 4W93A 3ZQ9A 2AAAA 4HOZA 4XB3A 4BQ5A 4BA0A 1OGBA 5A8NA 3UCQA 1KQZA 3QOKA 2XVKA 4PMUA 4LYPA 1CXFA 2X0YA 1SMAA 1FHLA 2OSYA 4XV0A 4F66A 1RPKA 1C92A 1OINA 1X6NA 4BS0A 2WVTA 2EPLX 3WH7A 3IANA 5HNNA 5FL1A 1TR1A 1UOKA 5A69A 1E0VA 5EBAA 5C71A 3RM4A 2D3NA 4P8WA 2ZXBA 3SCUA 1KWKA 2YBUA 1XYZA 1MVYA 5BRPA 4F9JA 1H11A 3T2PA 4B9YA 3AIWA 1NOFA 2CHNA 4PMNA 7A3HA 3CHFA 1UH4A 5CPTA 4ML4A 2VQTA 1A3HA 1W9DM 2NSXA 2VR5A 3ZMRA 1QNQA 1KR1A 1VF8A 1W1PA 2VRKA 3DYPA 4LPCA 4DWSB 3MMUA 2D0GA 3ECQA 3ARWA 1E9LA 4MDOA 2QV4A 5BCAA 4UZUA 3T2OA 2ZX7A 3WDIA 1HKIA 1JXJA 3UG5A 1JYNA 2JFEX 5D9MA 3UESA 5DMYA 1OBAA 3ARVA 2HISA 3L4ZA 1UKSA 5I0DA 1K9FA 1PBGA 2JE8A 3B9DA 1H4PA 1VRXA 5FIPA 3ZJ7A 2VMFA 3A4XA 1Q6FA 4JFTA 5IHRA 1BFNA 3GH5A 2WXDM 1JZ7A 1KXHA 1HN1A 2WLZA 4UZSA 3WBEA 4JFWA 1H1NA 4TTUA 3OGSA 2JF6A 3ZJ8A 1QI5A 4PUEA 4AWEA 4IISA 3UG3A 1UQZA 1QVBA 3AIRA 1CDGA 1GHRA 3EDJA 2YA0A 1QHOA 4B9ZA 5I77A 4DUVA 3S6TA 7CGTA 4J3TA 4CCEA 3THCA 3RDKA 1E4IA 4OOUA 2V5CA 4HP5A 1HJVA 4UQBA 2WMIA 3WF2A 1GW1A 2BY3A 1V0LA 1HVXA 3TTQA 2IXUA 1HVQA 1E55A 4LGXA 4JFSA 3RCNA 5C70A 2NT1A 3RIKA 3WDPP 2YDQA 1DTUA 3GXDA 5I6SA 1ITXA 3EDFA 1QI2A 3K4AA 1ZJBA 4PMDA 4Q7NA 2DDXA 3VMOA 4UOQA 2J62A 1IT0A 2YBTA 1PAMA 2WKLA 4U3AA 4FLRA 4E4PA 1NWSA 1FH8A 1GORA 2J4GA 2BHZA 4QAWA 2J7BA 4GI9A 1CXIA 1R85A 2CEQA 2XGIA 1GQLA 1JZ4A 3JUGA 4N0RA 1GOWA 3ZT7A 1GNXA 4PYSA 3AIBA 5I5RA 2X1IA 1M03A 3IAPA 3VD5A 1CLVA 2X2YA 2PI6A 4CCCA 2VJXA 1DHKA 4PMZA 4AIEA 2GFTA 5HOSA 1UD6A 3SCWA 5E6YA 3SUUA 1JDAA 3IJ9A 1W3HA 2WPGA 3ARQA 3A47A 1PIFA 4H41A 1KCLA 1LL6A 2D3LA 1TA3A 3WNNA 2Y8KA 1V6YA 4D72A 4M29A 2D2OA 1GOKA 4J27A 4HU8A 1MW0A 5BXPA 4YPJA 3WL0A 4CN1A 2XWDA 3MU7A 1KGXA 3VPLA 1C91A 3KL5A 3IJ7A 3PHAA 1A47A 3VNYA 5A2BA 4MNLA 5HBFA 5GQBA 2B31A 3VD4A 1UZ4A 3SCOA 4B3KA 2ZWZA 4U5KA 1LQ0A 2BHYA 1QI0A 5D8WA 4MNKA 5JIPA 1B3VA 4J3VA 5CLTA 3W81A 3K46A 3KZSA 1J10A 4WKAA 2BVYA 1JD7A 1V3JA 1W1TA 4GO9A 1V3MA 1UWRA 1EHAA 4S3KA 4JHZA 1B31A 1CEOA 1H2JA 1UWQA 3MUZ1 4GI6A 2WWDA 1JIBA 4DWSD 2JF7A 1GOMA 3BMWA 4EANA 2J8FA 3O9NA 2WHLA 3KL3A 2YL6A 4MB3A 1LG2A 2DSWA 5A8PA 2FDMA 2DGAA 2W67A 3PTMA 4D6DA 4URIA 3WDHA 4AXNA 2QF8A 2GK1B 4PTVA 1J12A 3WDJA 1WNOA 3PZGA 3FAXA 3E1F1 3QHOA 2FHFA 1GZJA 2V3EA 3NJ3A 1EA9C 2DIEA 1JFHA 1GPFA 3EDDA 1E70M 1GONA 1WZKA 2WCGA 3VU2A 5A8MA 2WHJA 2C8NA 1WZLA 3VGBA 1E71M 5CGTA 4W7UA 3FY1A 2XJ7A 4D6GA 3FN9A 3DHPA 4UNIA 4TX8A 1XYFA 1M53A 3CHCA 4AW7A 1C8XA 3MV01 4MDPA 2VT0A 5IHSA 5ABHA 4UQ9A 4ZENA 4Q22A 3SIMA 2YKKA 1H41A 3WMSA 3F5JA 3PZMA 3PZOA 1D7FA 3N17A 1Q6DA 1VB9A 4MNJA 1JF5A 1UR1A 2FHBA 2XVLA 3DYMA 5LYRA 1GQIA 4W8LA 1G9HA 1IV8A 3WY1A 1ZU8A 4E8DA 3DC0A 3ZJKA 5CSUA 4KGJA 2EPKX 2JIEA 2XVGA 1K9TA 4S3JA 1SR0A 2O9OA 1JZ6A 3PZUA 1QNRA 1H0IA 2GDUA 4CU8A 1R7AA 4HOXA 4MPKA 2FHCA 1ZBVA 2ZICA 1OT2A 1J0JA 1MXGA 2WHKA 5E0CA 3WL1A 2F8QA 1XH0A 3U5UA 4AYSA 5E6ZA 4HMCA 3CZKA 1LL7A 3AXXA 2IXVA 3AS0A 1JYXA 1TMQA 1WE5A 4J3SA 4C7GA 1CGVA 4UR9A 2EBNA 4AEFA 7TAAA 4QCFA 1Q6GA 1B3WA 4L4OA 4MADA 1HP5A 1UWUA 5A6JA 5IFTA 3TTSA 5IFPA 4Z2IA 1E0WA 4DM2A 3SCTA 2E4TA 1ODUA 2OWXA 1DWIM 5TD4A 1KBBA 2CKSA 4KRUA 3RM9A 4CU6A 1JD9A 4W7WA 2WMHA 2C0HA 3LMYA 2D22A 3WQ5A 1ISYA 1ZBWA 1BYDA 3ZIZA 2CBUA 3A6OA 3MUAA 3N9KA 4RE3A 1V3KA 4LX4A 5E70A 1J0YA 1RP8A 4P7OA 4GQQA 2DSVA 3KEHA 1JFXA 1K9EA 2YDSA 2XVNA 1JDCA 3AOFA 3WELA 2BXYA 5A6AA 3AQUA 2WKGA 4QLLA 3CZJA 4AMCA 1V03A 3O6AA 5IDIA 4UFLA 3FNDA 3CO4A 4F9DA 3VIHA 1UKTA 1KCKA 3L4UA 4X0VA 4MTVA 4H2CA 5EFFA 2Y5EA 3AHYA 3MO4A 1R8LA 3GNPA 5FKYA 4YHGA 3MSGA 3TTOA 3WFLA 3WH9A 1E5NA 4FF5A 2YIHA 2G4FA 1US3A 2J74A 4WSJA 2QLYA 4X0NA 1BVNP 6CGTA 1OD0A 1V02E 4IUGA 2VZVA 3VKKA 2ZXDA 5F7UA 4ZE4A 4P7NA 3GNOA 3WQ6A 4Y7EA 1MQPA 4PSPA 3VVGA 2WLYA 5A94A 1EOKA 3VD9A 1UWTA 3SCQA 1M04A 2UWFA 5D8ZA 1E4MM 3RM8A 1Q4NX 4OKDA 1NWUA 3WH5A 1C8YA 5CZKA 1EIBA 4IPLA 4CN4A 5AYIA 2YL5A 2CESA 1R7OA 4HOWA 3TTYA 5BRQA 1SMDA 2ZX8A 1ZBCA 3VM5A 4TOQA 2E8YA 2VRQA 5E9AA 3WEZA 1VAHA 2XYLA 2GJXA 1B9ZA 3L4YA 4J3XA 4PEEA 3TOPA 4OOZA 1U33A 4UFHA 2E40A 1B90A 4IPNB 4CD4A 4V27A 4AZ6A 3HN3A 4U3CA 3J7HA 1WKYA 4JKMA 2XSBA 1Q6EA 3AHZA 2DIJA 3BCDA 3QHNA 4B16A 3EMQA 3RMEA 4N42A 1PX4A 1UH2A 4HZ6A 4PRWA 1UKQA 4MB1A 4HPHA 1GHSA 1HF6A 2DEPA 2Y24A 3EDKA 1LWHA 3SUTA 2DT2A 1S46A 3WQVA 4UOZA 1BF2A 1PZ3A 5EB8A 3ZT6A 2W66A 3UEQA 3ZM8A 1HJWA 3PZVA 1VBRA 2WNWA 1LF1A 1JZ5A 2A3BA 1R86A 5KEZA 3NCOA 2A3CA 2E9MA 4BQ2A 4HA1A 2J78A 4JL1A 2XG9A 4UFJA 4H8VA 1BLIA 3L4XA 1HIZA 3EMZA 5GNXA 2PWFA 1WO2A 3AHVA 3BMVA 2XWEA 4M56A 1W3LA 3BGAA 2ZIDA 4NRRA 2GSJA 2XSAA 2VTFA 3LPGA 1G5AA 3MSDA 2VNCA 4FLSA 5HXMA 5BYWA 1LLOA 3CLWA 4J3WA 2WC7A 1W1YA 3WD0A 4A3HA 3WMCA 2GUYA 3N1AA 3MKKA 5D9PA 1GUVA 4PMRA 2CETA 1N82A 2F61A 3GBDA 3TONA 2XPKA 2OYMA 3VILA 3UERA 3VGDA 4CD5A 3TP4A 1JAKA 2C7FA 3WQ8A 1V6WA 1QNOA 5D9NA 1E6XM 3VINA 1CXKA 3UETA 4ZXLA 4JZ5A 3RPMA 3MMWA 3VX0A 3WMBA 2WVVB 3HMCA 4QP0A 1E3XA 1W9BM 3ARXA 4OBRA 2VOTA 3CBWA 4QLJA 4H8HA 1M01A 1U2YA 3BAXA 2ESCA 3U7VA 3AMKA 2OWCA 3OIHA 1HKMA 1NP0A 3NYDA 1J0KA 1MQQA 3AYRA 4UCFA 1JZ8A 1OIMA 4AD1A 1BG4A 3NDYA 3OB8A 3AZTA 4MJ4A 4DWSC 2GK1A 1C7SA 4OIFA 1TZ7A 4ATWA 1V0NA 2V3GA 2VX5A 8A3HA 1QHPA 1CNVA 3ALFA 4GQRA 2ZUVA 1E40A 5CGMA 4UFMA 3ZSTA 3WNLA 4L4PA 2X8RA 1BPLB 5ABEA 1HJXA 1MQRA 4D1IA 3T09A 5A2AA 2O92A 4ZXOA 4ZFMA 3VDBA 3CZ8A 1VENA 2BVTA 1EH9A 2E8ZA 1VFOA 2WWCA 2QMJA 3QR3A 4HTYA 2CERA 1W2VA 3OG2A 4U5IA 1UR9A 3VOCA 2NT0A 5FOOA 1JDDA 4HZ7A 2BHUA 2ZUTA 1E6ZA 1B3ZA 3OGRA 4P7QA 4Z2GA 1Y7VA 2W62A 3CMGA 4HA4A 3W53A 1XSIA 2JIWA 1D3CA 1F4AA 3I3BA 1OB0A 2YL9A 3GXMA 4Z2JA 1E72M 2Q8XA 3GNRA 4U2ZA 1C90A 1O6IA 4D1JA 4E8CA 5CQ1A 1CYGA 2WZHA 1JZ3A 5LA1A 2ZX6A 1V3HA 2CBIA 4F8XA 4M82A 3N15A 1UD3A 1V0KA 3L2MA 2YDRA 3S2CA 1C3FA 4M80A 4YHEA 4GPNA 2DQXA 1EHNA 3OLIA 1JG9A 4ATLA 2BS9A 3SCPA 3AFBA 1KXQA 1WB0A 4W89A 2YJQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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