2WEJA

Thermodynamic optimisation of carbonic anhydrase fragment inhibitors
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
publication title Thermodynamic Optimisation in Drug Discovery: A Case Study Using Carbonic Anhydrase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2wejA00
3V2JA 4Q6EA 3BL0A 4YGKA 3M5SA 2Q1QA 2ZNCA 3U47A 2NWOA 1DCBA 1CNGA 2FOSA 4QJPA 4CNXA 1UGCA 4MDMA 1CRMA 4Q49A 4QJMA 3PO6A 4FPTA 4KP8A 2NNOA 5DSRA 2CABA 3F7UA 4KUVA 4Z1JA 3N2PA 3V3IB 4MLXA 4K1QA 1RJ6A 1I9NA 1CANA 3CYUA 1Z9YA 2WEJA 3OKVA 3T83A 2HD6A 4WW8A 1CA3A 2NN7A 1CNIA 3KOKA 3FW3A 1FLJA 3DCWA 3TMJA 3V3GB 1IF7A 5FDCA 1CAKA 2CBAA 4UOVA 5EH5A 3T84A 1UGFA 4Q0LA 5HPJA 1MUAA 3M1QA 1TEUX 1G52A 4E49A 4M2RA 1BNVA 1UGBA 1CNYA 1HEBA 4E3DA 3OIMA 4R5BA 3RZ1B 1YDDA 1BICA 1G54A 1IF6A 2OSMA 3CZVA 3M2YA 1AM6A 1RZEA 5LMDA 3RZ8A 2EZ7A 3MDZA 1F2WA 1KOPA 3RYJB 1H9QA 5FL6A 3MWOA 4CA2A 1I8ZA 1HCBA 1CCSA 4Q7WA 4Q06A 4WUQA 3MNHA 2X7UA 1XQ0A 4BCWA 4DZ9A 1CCTA 2FOUA 5EH7A 3HKQA 1JD0A 3P3JA 1ZFQA 3M1WA 4Z1EA 4MTYA 4RIVA 5EKMA 4K13A 1LUGA 5DOHA 4Q90A 1FQLA 3DVCA 3M2ZA 4COQA 4QIZA 3KONA 3OYSA 3IBUA 5CA2A 1CRAA 3OILA 5E2KA 4E3GA 4XE1A 3OY0A 3DD8A 5FLRA 1RAZA 4RN4A 1BV3A 5JESB 4ZWIA 3CAJA 4QSBA 4WW6A 3ML5A 3B4FA 2POVA 5BRVA 5CLUA 5SZ1A 1AVNA 3MHLA 1BCDA 4CACA 4L5WA 3M40A 4Q7VA 3P44A 1G4JA 3RJ7A 2NNSA 1ZSAA 1CAZA 1DMXA 3IEOA 5E5RA 4QK3A 3RGEA 3M1JA 3M67A 1CVHA 1KWRA 2NWYA 4KNJA 1LZVA 7CA2A 3R17B 5EHVA 1IF9A 5E5UA 3SBIA 4QY3A 3TVNX 2NMXA 3S74B 1XEVA 4CNVA 5CJFA 2Q1BA 3PYKA 5DSMA 1J9WA 4FU5A 5C8IA 4RH2A 3LXEA 3W6IA 1URTA 1G0EA 4ZX1A 2ILIA 4ITOA 3MHIA 1YO2A 3MHOA 1FSQA 2Q38A 5DSIA 3F4XA 4YXUA 2AX2A 4PZHA 4QSJA 4WUPA 1KOQA 5JGSB 2HL4A 2X7TA 4QTLA 1CNKA 3V2MA 3T85A 4MLTA 1KEQA 4ZWZA 1CNBA 2HKKA 1BN3A 5EKJA 2ABEA 1Z97A 5DSKA 1CVFA 1LG6A 4JS6A 2NNGA 3S76A 3FFPX 1G0FA 4R5AA 3SBHA 3EFIA 5FLPA 4ITPA 1CNXA 3CA2A 2WEOA 4GL1X 5JQTA 2CBCA 2HFWA 1BNWA 5FNGA 5JGTB 3OYQA 3U45X 4KUYA 3V3FA 1I9LA 3V7XA 4QEFA 4RFDA 1CIMA 3OIKA 1HEAA 4JSWA 3T5UA 3M1KA 5JG5B 2FMZA 3BL1A 5SZ4A 1RAYA 1CZMA 1ZNCA 2CBDA 3MZCA 3W6HA 4YXIA 3M14A 1G4OA 1G3ZA 5L6KA 1RZDA 1KWQA 3KS3A 4QJOA 1TH9A 4QSIA 1ZE8A 3IBIA 1HEDA 1HECA 1T9NA 3M5TA 4JSAA 2O4ZA 4XZ5A 4KUWA 2QO8A 3KLDB 4XIWA 1THKA 3C7PA 4K0TA 5FLQA 1OKMA 1I91A 4ZAOA 4BF6A 2POWA 2H15A 2WEGA 2NXTA 4C3TA 4PYXA 1FQRA 2WD2A 3R16A 4WL4A 1CNJA 4YWPA 3SAPA 5FLTA 2WEHA 2FOQA 1UGDA 1YDBA 3KKXA 5JEPB 4N0XB 4PXXA 3IAIA 12CAA 3F7BA 3K7KA 4MDGA 5FNIA 2W2JA 2NWZA 3BETA 3DC9A 3DVDA 1G6VA 4M2UA 2FOYA 1EOUA 1RZAA 1DMYA 3M2XA 5L3OA 4Y0JA 3B1BA 5SZ6A 5IPZA 3D8WA 1I9MA 3FE4A 4Q8ZA 3RYYA 4Q09A 5DSNA 1CNHA 1CAOA 6CA2A 5AMDA 5JG3B 2F14A 1CNWA 3RZ5A 4DZ7A 1A42A 1UGGA 1I90A 4RIUA 5FL4A 3M5EA 5DSLA 1YDAA 3RYVB 1CALA 3T82A 4Z1KA 3DAZA 3MYQA 3M98A 4QIYA 5E2RA 1UGAA 5EHWA 5EZTX 3DC3A 1IF5A 5FDIA 4LU3A 3HLJA 1V9IC 5SZ3A 1BNNA 3T5ZA 5A6HA 2FW4A 5BNLA 3JXFA 4N16A 3RZ7A 5JDVB 4KP5A 5SZ0A 1CVDA 3N3JA 1V9EA 3S77B 8CA2A 1FSRA 5DSPA 4FL7A 4Q7SA 4E5QA 4R59A 3P3HA 1TE3X 1TG9A 4QJ0A 5DSJA 5AMLA 3ZNCA 1I9OA 4Q8XA 4Z1NA 4Q7PA 4PYYA 4LHIA 4QJXA 3UYQA 1CAHA 4YXOA 4G0CA 4ZX0A 1CAIA 1AZMA 3OKUA 3IBLA 1FQNA 5E2NA 5BRWA 1FSNA 3L14A 4IWZA 2FNKA 1CA2A 1TBTX 3K34A 3NJ9A 4JSSA 2NWPA 4LP6A 1H9NA 1OKLA 1YDCA 2FOVA 5FLSA 4QSAA 2NXRA 3F8EA 4E3HA 1BZMA 1YO0A 1G48A 5EOIA 3VBDA 4G7AA 1ZSBA 4KNIA 3S9TA 3ML2A 4HF3A 5G03A 1FR7A 4RUZA 4BF1A 4ILXA 5DRSA 2CA2A 1ZSCA 5E2MA 3DD0A 5FL5A 2EU2A 4Q81A 5G0BA 3MMFA 1DCAA 4YX4A 3KNEA 5EH8A 1CVCA 3MHMA 4HT2A 1G45A 3HKTA 4Q9YA 3IGPA 1JV0A 4HT0A 4L5VA 4M2VA 4TWMA 3M04A 3MNIA 5BRUA 4KNMA 3P5LA 4KNNA 3HKNA 2AW1A 3MHCA 4E3FA 1FQMA 3KIGA 5FNHA 4YGNA 3KOIA 5JQ0A 3P4VA 3MNUA 4Q87A 1CAJA 3N0NA 3V3JA 3IBNA 1G46A 2NN1A 1TEQX 3P58A 5A25A 5FNJA 1BNUA 4Q78A 1HCAA 4E9OX 4MO8A 3K2FA 2FMGA 4HEWA 1G1DA 3NI5A 4QK1A 4QK2A 1BN1A 3HFPA 1MOOA 1I9QA 4HU1A 1CVEA 1CCUA 1TTMA 1Y7WA 4IDRX 3HKUA 2POUA 5EKHA 3U7CA 4CQ0A 3V3HB 3S8XA 2FNMA 4M2WA 4JSZA 3DVBA 4XIXA 2HNCA 1TG3A 1H4NA 4HEZA 4TWLA 3P5AA 3JXHC 3RG3A 5JEGB 2CBEA 3TVOX 4HBAA 4QJWA 1BNQA 4Q08A 5JEHB 2GEHA 5SZ7A 1TB0X 1CNCA 4KV0A 4FVOA 1ZGEA 5FLOA 3DV7A 3S71B 4YGFA 4YHAA 5E2SA 1LGDA 2WD3A 5J8ZA 3RYZA 1YO1A 4ZWYA 3DCCA 1CAMA 2FNNA 4CNWA 3S72B 4Q07A 5DOGA 5DSOA 4FIKA 4K0SA 4FVNA 1RZBA 1UGEA 5FNLA 3UYNA 1ZFKA 4L5UA 4Z0QA 3EFTA 3SAXA 4YVYA 5G01A 1I9PA 1CVBA 4RUXA 1FR4A 1BN4A 3N4BA 1RJ5A 3S97A 5BYIA 3S78B 4XFWA 2IT4A 1CINA 4YGJA 5G0CA 1LG5A 1CILA 3MNKA 1RZCA 4ZWXA 4ETQC 1HUHA 3M2NA 3M96A 3V5GA 1IF4A 4KAPA 3HS4A 3D93A 2HOCA 4Q99A 5DVXA 3RYXB 3PJJA 3M3XA 2H4NA 9CA2A 1ZH9A 3RZ0B 1G53A 2NNVA 3S73B 3DCSA 4K0ZA 3D92A 3RG4A 3MNJA 5FNKA 3P55A 4CNRA 1OQ5A 3GZ0A 4Q8YA 5FNMA 3S75B 1BNMA 5AMGA 1JCZA 2VVBX 2GD8A 2X7SA 1XPZA 3MNAA 4MDLA 1ZGFA 3U3AX 3DA2A 2QOAA 4PQ7A 2OSFA 2CBBA 1HVAA 1Z93A 1XEGA 4Q6DA 1CVAA 2NXSA 3QYKA 3D0NA 1HUGA 2VVAX 3ZP9A 3Q31A 4X5SA 4HEYA 3D9ZA 1OKNA 1BNTA 5DSQA 4FRCA 5EIJA 4RUYA 4Q83A 3DBUA 1IF8A 5CACA 3KWAA 4E4AA 3JXGA 4WR7A 3NB5A 5SZ2A 4YGLA 4YYTA 2EU3A 4RFCA 2QP6A 3RLDA 5E28A 1CAYA 5SZ5A 5EHEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3V2J A;  4Q6E A;  3BL0 A;  4YGK A;  3M5S A;  2Q1Q A;  2ZNC A;  3U47 A;  2NWO A;  1DCB A;  1CNG A;  2FOS A;  4QJP A;  4CNX A;  1UGC A;  4MDM A;  1CRM A;  4Q49 A;  4QJM A;  3PO6 A;  4FPT A;  4KP8 A;  2NNO A;  5DSR A;  2CAB A;  3F7U A;  4KUV A;  4Z1J A;  3N2P A;  3V3I B;  4MLX A;  4K1Q A;  1RJ6 A;  1I9N A;  1CAN A;  3CYU A;  1Z9Y A;  2WEJ A;  3OKV A;  3T83 A;  2HD6 A;  4WW8 A;  1CA3 A;  2NN7 A;  1CNI A;  3KOK A;  3FW3 A;  1FLJ A;  3DCW A;  3TMJ A;  3V3G B;  1IF7 A;  5FDC A;  1CAK A;  2CBA A;  4UOV A;  5EH5 A;  3T84 A;  1UGF A;  4Q0L A;  5HPJ A;  1MUA A;  3M1Q A;  1TEU X;  1G52 A;  4E49 A;  4M2R A;  1BNV A;  1UGB A;  1CNY A;  1HEB A;  4E3D A;  3OIM A;  4R5B A;  3RZ1 B;  1YDD A;  1BIC A;  1G54 A;  1IF6 A;  2OSM A;  3CZV A;  3M2Y A;  1AM6 A;  1RZE A;  5LMD A;  3RZ8 A;  2EZ7 A;  3MDZ A;  1F2W A;  1KOP A;  3RYJ B;  1H9Q A;  5FL6 A;  3MWO A;  4CA2 A;  1I8Z A;  1HCB A;  1CCS A;  4Q7W A;  4Q06 A;  4WUQ A;  3MNH A;  2X7U A;  1XQ0 A;  4BCW A;  4DZ9 A;  1CCT A;  2FOU A;  5EH7 A;  3HKQ A;  1JD0 A;  3P3J A; 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