2WKYA

Crystal structure of the ligand-binding core of glur5 in complex with the agonist 4-ahcp
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Glutamate Receptor Glur5 Agonist (S)-2-Amino-3-(3-Hydroxy-7,8-Dihydro-6H-Cyclohepta[D]Isoxazol-4-Yl)Propionic Acid and the 8-Methyl Analogue: Synthesis, Molecular Pharmacology, and Biostructural Characterization
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
total genus 82
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-06-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2wkyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2wkyA02
3RTFB 4YKIA 1ZIUA 2G93A 5KDTA 1UIVA 5ICTA 3MUQA 5AA4A 1MQHA 3IL1B 1PB7A 4U4SA 3ILUB 3ECRA 1B7UA 3VDFA 4WKMA 3H3GA 2ZNUA 3EHSA 4OFLA 1YCJA 4GOTA 4Z0IA 4E0XA 2O68A 5I2NB 1LCFA 1POTA 3FVKA 2UVGA 3PU5A 2RCBA 3CSGA 2ESNA 4LQ5A 4IY6A 3PD9A 3O6GA 2H9BA 3O28A 4UACA 1OIBA 3G3KA 1GGGA 4TLLB 2ZYNA 1OVTA 3Q29A 2WKYA 3DP8A 3K02A 5L9OA 1MQDA 1OQHA 4E0WA 4GWOA 4LA9A 2O1LA 5DYHA 3C34A 4EXLA 4R2FA 3E9XA 2DQVA 1SI1A 3K6WA 5EHMA 3RPWA 4EQ7A 1B40A 3TQLA 1XVYA 1P1NA 2I49A 3G3IA 1FTOA 5EYFA 2A5TB 3HHFA 4X1BA 1QUIA 1EZOA 5KCJB 3RT6B 3CFZA 1TXFA 2P0SA 2FYIA 4H5GA 4YU0A 4R6YA 3I5OA 1B7ZA 2DVZA 2HXWA 2XXYA 2R9JA 4KHZE 5B70A 1LBBA 1USYE 3EHTA 1B6HA 3KFMA 1O63A 4NMYA 1NNPA 1Y9UA 3HPIA 4ECFA 4OETA 4KQPA 1S50A 3A3UA 3SEXA 3MZBA 3OO9A 3LSWA 3HN0A 1QJMA 4G2ZA 2ZMBA 2F6PA 4C1TA 1MXVA 4Q0CA 2V3QA 2QSXA 3TELA 1MH3A 4IO6A 4XKQA 1LFGA 1AL3A 3O9PA 1ELJA 1JW4A 2ZYOA 2PX1A 1FTLA 2GFEA 4WEDA 3LSFB 3M3FA 3O2AA 4IGTA 4FAJA 3TMGA 5I58A 1N3XA 4F1UA 5I57A 3K01A 4X9TA 3DELB 5I56B 1LAGE 4EF1A 1M5CA 2UYFA 3HHGA 3MP6A 3E3KA 1SDXA 3TCHA 5HPQA 2O1MA 1XVXA 4ND9A 1XS5A 3VVEA 1EZ9A 2Q2CA 4GL0A 3TODA 2H98A 2DE2A 2QMXA 3TAJA 5CBSA 4U1OA 2E1SA 1NNTA 3T9VA 5L9MA 1UTHA 1ZKBA 3CR9A 1UTBA 4PFUA 3TPAA 1Y3NA 4QFOA 4QFKA 2Z8EA 1NNKA 1H43A 5CI5A 2I3VA 3V83A 1URSA 4FEDA 1GTKA 3WAFA 1PBQA 3OENA 3ZS6A 1N04A 3RN8A 3H6VA 4NF4A 2DVCA 4YMAA 2Q8JA 2F8DA 5KZTA 4WXJA 2DWJA 1B2HA 3IOTA 2PVUA 2OWTA 4KPTA 1IITA 3UA8A 3SKPA 3TCFA 5L8DA 5K2YA 2O7IA 3FASA 1B52A 2HAVA 1O7TA 1M5FA 3CVGA 4R74A 1LB9A 3U72A 1O64A 4P11A 3QXMA 3S4UA 1B3FA 3IOWA 2DXYA 1PC3A 3K00A 2ZNTA 2Y7IA 4MFIA 1LLSA 2ONSA 3QAXA 2F97A 4YKJA 5H8SA 3OO6A 4RYAA 1POY1 2HAUA 1US4A 3CSBA 4LUBA 5LOMA 4IB2A 4R75A 3RQTA 5H8HB 4YB6A 4NF6B 4R9FA 1R1NA 1NFTA 2QL3A 2UVJA 3N6UA 3R26A 4OZ9A 5CM6A 3W15C 3QSLA 2ABHA 2H5YA 3UIFA 1MDQA 1MY4A 3MC2A 1IIWA 4RY1A 3SEYA 1H3DA 2VGQA 1A55A 3E13X 1MS7A 4JDFA 2GHAA 3O29A 1LAXA 3SEWA 1N0TA 2D21A 3KSJA 4BDOA 4R72A 3VVDA 4XKNA 3GXAA 4YAHX 3BFTA 4RA1A 3G3JA 3VFJA 1B3GA 4NF5B 4F22A 3DP4A 4PFYA 1A7LA 2H4IA 4O3AA 2Z22A 1RYXA 4G4PA 1JEVA 4JSOA 2A5TA 2DWHA 3K6UA 4OHNA 1EH3A 3IO6A 1YTVA 2Y7WA 5M2VA 3KEIA 3LUYA 2I48A 3O6HA 3V89B 3T9HB 3FZVA 3QYTA 3PPQA 2PT2A 4BDQA 4JWXA 5DVFA 2UVHA 3CIJA 3PUYE 4ISUA 1IXCA 1HSLA 2HEUA 2X7QA 1JETA 3IJOB 3K1NA 3KZGA 4FEBA 2H25A 4Q8RA 1A8EA 3GZGA 3S9LC 1UIUA 1B0LA 2XD2A 5I59A 3KOSA 4OERA 3MPKA 3KG2A 1VSOA 3CG1A 2QJEA 4GVOA 3HCQA 1QKBA 2ZNSA 5ICQA 3MPLA 2RCAA 3K4UA 4IO5A 3QK6A 4PETA 2FA7A 1AIVA 4GXAA 1BP5A 3VE1B 3V5AA 5FHNA 1MY0A 4OQOA 4GFRA 1UTHB 1IEJA 2AL4A 3SESA 5I56A 3I3VA 3LC8A 1EU8A 5AE4A 4RPNA 1NL5A 4LVQA 4P0GA 4H5FA 1PDAA 2F35A 3EHUA 4THIA 4MF3A 4JWYA 4HTGA 5FHMA 3T66A 5H8FB 3EQ1A 1B05A 5BWJA 3TTLA 1SW2A 1Y4CA 1IXGA 3VXCA 3JZJA 3TKDA 3MVYA 5DEXB 4YKKA 2V3UA 1Y1ZA 1XHYA 2F36A 4OXVA 4YKPA 1Y1MA 5ISUA 2R6GE 4YB5A 1NH7A 1A8FA 1N76A 2RC9A 3ZSFA 1A40A 3MZ9A 1DTZA 2ALUA 5H8QB 4GRKA 4ZECA 3VLVA 1Y3PA 3KN7A 4IGRA 2PT1A 1P1WA 3N6TA 1UQWA 1B5IA 2VD2A 2XXRA 3PPPA 4JWOA 4H8IA 1H44A 4N13A 2LAOA 3I6VA 3OEKA 3RGYA 1OVBA 3K6XA 2D5WA 1DTGA 1ATGA 1LSTA 3K6VA 4QSEA 2AIXA 5FTHA 2RKMA 2UXAA 4IY5A 2NVUB 5H8HA 1SW4A 4NF6A 1N3WA 4KYEA 2OCUA 1OMPA 1MY2A 3P7IA 4BDNA 4N6PA 4IO4A 4M4GA 1NMUA 1TFDA 3VLUA 1DPEA 1MQIA 5DVJA 1VE4A 3L6GA 3OO7A 1SW5A 4LZ5A 1Z7NE 3B6TA 2O84X 2QS3A 2XHDA 1JW5A 2YLNA 4KCCA 4ELQA 2Z8DA 1PBPA 4EXKA 1IZ1A 3RY3A 1I6BA 1CE2A 1QULA 2GHBA 4GXSB 3S2VA 1MM7A 3LSLA 4NWCA 3TTNA 4NF5A 3SEUA 3JYRA 3M3KA 1MRPA 2XXWA 3R6UA 4AB5A 3IR1A 4DE8A 2REGA 5I59B 1SBPA 2ONKE 5CMMA 2BJJX 5A5XB 3FGSA 3ZKLA 3C31A 1OLAA 1OQGA 2PMSA 2PBWA 3FXQA 1N7XA 3IB1A 2I6EA 3Q26A 4U2RA 3IB0A 2REJA 3C36A 1MQGA 3OSQA 3C35A 3PMXA 4GD5A 2OBGA 1LBCA 1R9QA 4PFWA 1D9VA 1D9YA 1CB6A 2QS2A 3W9WA 3MP8A 1S9TA 2Q9TA 3H6WA 3K1PA 4KR5A 5CBRA 4G68A 1XOCA 2D3IA 1MH4A 3TTMA 2XX9A 1DPPA 1SI0A 4R9GA 4RK9A 3PPRA 1FCKA 1I6QA 3A09A 1ZMGA 4ZZAA 3U92A 2VD3A 4GQOA 4GLIA 4LZ7A 3MZ1A 3O6IA 2IEEA 3OMBA 3H4ZA 3CFLA 3S9MC 3MBPA 4R73A 3FUZA 3GLBA 3PD8A 1NNFA 4AB6A 5I84A 4F19A 1B9JA 3HSTA 3FV1A 2P1SA 1B1HA 4I1DA 5CC2A 3GBAA 2XXVA 3ONMA 1M5BA 2R71A 1FW0A 1NKXA 2ANJA 1R9LA 2Y7RA 5H8FA 3PUZE 4LQ2A 4DLDA 5JK4A 4MBPA 1SW1A 2M8CA 3SEVA 4POWA 1I69A 5TP9A 5DEXA 5I2KB 3H7MA 2DP8A 3VLWA 4P0IA 1MDP1 4NF8A 3KOTA 4F29A 1B3EA 5CMKA 2GH9A 3EN3A 2B3FA 3W9VA 4EF2A 2P2AA 3IK6B 3OEMA 3L6HA 1Q35A 1MY3A 5H8QA 4FE8A 3PUXE 3BBRA 4F1YA 3OSRA 1B58A 1IQ7A 1BIYA 1MG1A 5B7DA 1URDA 4H0WA 2Y84A 4KI0E 1H45A 5IKBA 3N94A 1LFIA 1MM6A 1BTJA 1OLCA 1I6AA 2DOJA 4F3PA 3IJXB 1LB8A 1PB8A 2DYXA 4KYSA 3TQWA 2XXIA 3MQ9A 4HCWA 4ZEBA 1ZBMA 5JEIA 4FORA 4X1DA 3THIA 5CMCA 4R6KA 1DOTA 2B3BA 3FATA 3G3FA 4OESA 1BLFA 1MXXA 4FJPA 3TTKA 1WVJA 1SYIA 3TTRA 3IOUA 4RPOA 3IB2A 3KBRA 2E0SA 3N5LA 3KJ7A 3K1MA 4JB7A 1JVYA 1LGBC 4ESWA 3DLNA 3RTWB 2DWIA 4GIZA 2ZXTA 3KN8A 1Y3QA 4DXBA 4DCYA 4ELPA 1EZPA 3AXFA 4AQ4A 4DXCA 1ZLQA 2DWAA 5HM4B 3KJTA 4C1UA 2XD3A 2HFBA 4G68B 3MAMA 5A5XA 1WDNA 4EDPA 3EPEA 4ZEDA 1P1QA 3C32A 1QUKA 3H6TA 4YB7A 3K2DA 2Q2AA 4OMBA 3TYHA 3T9XB 3CI8A 4MLQA 1XT8A 4DIGA 2HZKA 1JNFA 2I4BA 3B6QA 3FVOA 2O6AA 1T0KA 2Q88A 3TEPA 1BKAA 3H03A 2I0BA 5CRYA 2AL5A 1YAEA 1FQFA 4IO3A 4F39A 3Q28A 4G8HA 2B65A 2Z23A 3H6UA 2Y7PA 4IO2A 3G3GA 5TPAB 3ILTB 4ZEKA 5JTYA 1TT1A 2XXHA 5EHSA 3R7XA 5BUUA 3UP9A 5DVIA 3Q25A 4LZ8A 4OVJA 4TOZA 1B1XA 5TP9B 4LONB 1US5A 4G8MA 5H8NB 1M5DA 1FTJA 4ZZEA 3PUWE 4XKRA 4NF8B 3KN3A 1JW1A 2OWSA 3PMWA 5L9SA 4OYVA 2H99A 4BDRA 5F7VA 3ZKKA 2ZYKA 3OELA 1B3HA 2F7AA 3Q27A 1DSNA 4ELOA 3H06B 1TFAA 2V84A 1MY1A 1F9BA 2RC8A 4U21A 2W7YA 3FJGA 4XIGQ 3FXUA 3A3CA 3OOAA 3TFLA 1B5HA 5I2KA 3UK4A 5ELVA 2OLBA 3C9HA 2X7PA 5ITOA 4C0RA 3PPOA 3RUMA 3KGCA 1H76A 1A99A 3FIRA 4BLAA 3PMVA 2FNCA 2XX8A 3PUVE 3TCGA 1RKMA 4H6DA 3QUFA 5HBCA 2NXOA 1USYH 4X48A 4DZ1A 1VFEA 3RT8A 4F18A 2VHAA 4POXA 1MPBA 4L17A 3IORA 3TZAA 2RINA 4PE5B 4XKPA 1AH5A 2XX7A 1FQAA 4GF8A 1N84A 3B7DA 4ZEFA 4RNSA 1YPNA 3FVNA 3C4MA 4R2BA 4F3SA 3OD7A 4ELRA 1B46A 1B51A 4ZE9A 4QFLA 4QHQA 1GV8A 3LSXA 2AYSA 3S9NC 2F6GA 1LFHA 2I58A 4U23A 2NUVA 4EUOA 1SVXB 4BDMA 4IO7A 2XXQA 4G68C 1GR2A 2KLFA 1QKAA 1SD3A 1MQJA 4NTLA 4OEUA 1XC1A 4ESXA 4FATA 3GBBA 1VFDA 3BKIB 4TLMB 2XXPA 3M8UA 3U93A 3WAEA 1LAFE 3JV9A 3T9UA 3S9EA 2DSFA 1ZU0A 3LBSA 4I62A 3M3LA 1FTKA 3LR1A 4G77A 4XXUA 1IXHA 2F78A 1AOVA 4TQUQ 4HCYA 4RK2A 2F5XA 4QF9A 4Q30B 5DT6A 1L5TA 3FJ7A 1B3LA 3E4RA 4QFNA 2XXTA 1JVXA 5J1DA 1Y4TA 1S7YA 4PP0A 2VOZA 3TDJA 3MVZA 3K0VA 2I3WA 5JTYB 4G8NA 1JEUA 3MVXA 4OWDA 4OFOA 2GRVA 2HCAA 2UVIA 2ZYMA 3D4GA 5AA2A 4ZE8A 1QW0A 2CZLA 4YZZA 3CG3A 4H67A 5KDTB 1LAHE 2NWJA 3CRBA 4ZDMA 2PYYA 2Z8FA 2O7UA 5AA4B 3MP1A 4JXIA 2QRYA 3UORA 2THIA 2A5SA 3CFXA 4U4XA 1WODA 2OJTA 3TUSA 3OO8A 1MXUA 1KWHA 4HW8A 3IX1A 3UGWA 3EF7A 4YICA 5K2XA 2ONRA 5TPAA 4F1VA 3O66A 3RNNA 1B32A 3G3HA 1A54A 3B6WA 4F3BA 3SERA 3F11A 1SQYA 4H65A 4Q5TA 2V25A 1VR5A 2Q89A 3QUJA 2Y7KA 5H8NA 4NE4A 4DXUA 2QMWA 1B4ZA 5FTIA 3MVWA 4I8CA 3FVGA 2X26A 3SETA 1P1OA 4OEVA 1PB9A 1MXWA 1Z7ME 1IXIA 1R6ZA 1II5A 1ZJLA 1JQFA 4EQ9A 3G7WA 5AA2D 2DXRA 1ANFA 4HS7A 1MXYA 2DE3A 4JSDA 1FTMA 5I2NA 4O3CA 1GVCA 1D3KA 1FQEA 2YJPA 4PFTA 5TU0A 2CMOA 4N07A 3IO4A 3T93B 5AA1A 4F31B 2UYEA 3USDA 5AA3A 2HZLA 2V3TA 3UN6A 2IA4A 2DS9A 3IAZA 3U94A 3BFUA 4QSCA 1B4HA 4M1VA 1ZTYA 3PV0E 3IOVA 1URGA 4QFPA 1MPCA 4BDLA 1RYOA 2I0CA 1IUDA 4F2QA 2XXXA 4FECA 4LP2B 3FD3A 3N26A 1B7HA 2QS4A 4ONYA 4GL8A 4WEPA 4EQBA 1SYHA 1DMBA 3U8QA 2F34A 4FIMA 2YPNA 4F2OA 4Z7EA 1M5EA 3ODBA 3MJNA 5FHOA 3U1OA 5CMBA 3FJMA 1N7WA 3T22A 3SDFA 3KSXA 1MXZA 5IAIA 2OK2A 1HSJA 4H1XA 3MWBA 5KCJA 4KYDA 3PPNA 4LATA 3QIMA 1LCTA 4OTEA 4DDDA 2HQ0A 1D4NA 4XTCQ 1PEBA 1FQBA 2VP1A 4U1ZA 1FQCA 2DE4A 2G29A 1TWYA 1Y20A 1AMFA 4OENA 4U22A 2F7BA 4ZEIA 1J1NA 5I58B 2I4CA 3RLFE 5I57B 2QPQA 4KD5A 4JBZA 1P1UA 2QS1A 3D4CA 4KFQA 4ZS9A 3VVFA 4PQJA 2NOOA 3MW0A 2XXUA 4QSDA 3FXRA 1B0HA 2RF1A 3C33A 4QRZA 5ITPA 5AA2B 2OZZA 3T96B 1Q1KA 1QVSA 3FV2A 4R6HA 4YMBA 1P99A 3DP6A 4O3BA 4RJZA 3V8XB 4K3FA 3O97A 4RXLA 4MH5A 4NEDA 4DCXA 2O69A 4I9DA 1UTBB 1NH8A 3HO7A 1FQDA 1HSEA 4UA8A 5F1QA 5DTBA 1B5JA 4KCDA 1MPDA 4NWDA 1QUJA 2F7CA 2O51A 3OXNA 3VV5A 3HV1A 4OFJA 3VXBA 2V93A 3PGFA 4H8JA 4NF4B 2RC7A 4MLVA 3DM0A 4F3GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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