2WKYA

Crystal structure of the ligand-binding core of glur5 in complex with the agonist 4-ahcp
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title The Glutamate Receptor Glur5 Agonist (S)-2-Amino-3-(3-Hydroxy-7,8-Dihydro-6H-Cyclohepta[D]Isoxazol-4-Yl)Propionic Acid and the 8-Methyl Analogue: Synthesis, Molecular Pharmacology, and Biostructural Characterization
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
total genus 82
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-06-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2wkyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2wkyA02
2NUVA 1T0KA 5KDTB 2F8DA 4ZE9A 3FXRA 1OQGA 3G3HA 4O3BA 5TPAB 1NH8A 2H98A 1Y9UA 4YKPA 1Q1KA 3MPLA 3K1NA 5KDTA 1JEUA 1Y4CA 4EQ9A 2DVZA 3GBAA 3V83A 1MXUA 3V5AA 1JQFA 3KJTA 5TPAA 4FE8A 2R71A 3FD3A 3I3VA 5L9OA 3IOUA 2OWTA 4JXIA 3VVFA 1GV8A 4BDQA 2XXIA 3OO9A 2UYEA 4H67A 4WXJA 3UN6A 4TQUQ 3S9NC 4XXUA 3GBBA 3W9WA 3V89B 4MLQA 3KG2A 2AL5A 5CMCA 2HFBA 1NNKA 3HPIA 2XX9A 1A54A 4HW8A 5H8HB 4FECA 1JETA 4YICA 5I84A 4ZE8A 5DEXA 2REGA 5H8HA 3KSXA 3MZBA 1SVXB 3HV1A 4Q5TA 4OHNA 4LQ2A 3IX1A 2V84A 3MBPA 2I58A 3TUSA 1AH5A 4G68A 3TODA 1DPEA 2V25A 4E0WA 2GHBA 2RC9A 1XS5A 3OO6A 1B5HA 3UORA 5CBRA 5I2KB 4THIA 2F34A 3M3FA 3RNNA 4QSCA 3K6UA 5ITOA 5EYFA 4C1TA 4BDNA 2ZYKA 3U72A 2A5TB 2QMWA 2DE4A 2ALUA 3AXFA 3EPEA 4NF8B 1Y3NA 1FTOA 3PV0E 4LA9A 1MM7A 3OOAA 3T9XB 3G3KA 2DVCA 5DVIA 3O66A 3FUZA 1US4A 1B05A 1MY4A 2OWSA 3IK6B 2A5TA 1ATGA 1RKMA 5ISUA 1N3WA 4U4XA 1NFTA 4F19A 3TQLA 1XT8A 2DWAA 1DSNA 3S9MC 3H6UA 3KN7A 1PBPA 1SBPA 3OMBA 4I1DA 2Y7WA 4ONYA 2A5SA 4G77A 1TFAA 3MPKA 4F18A 4OXVA 2PX1A 5L9SA 3QYTA 3DLNA 3S2VA 3RGYA 1Y20A 4GVOA 5JEIA 3UIFA 2R6GE 1I69A 3OO7A 2X7QA 1XC1A 1B2HA 3O2AA 1Q35A 1B0HA 5LOMA 1ZBMA 3R6UA 2QRYA 1LFIA 2Y7KA 1D4NA 4OETA 1ZMGA 3H03A 1MXYA 2QMXA 2Z8FA 3Q27A 3S9LC 1LB9A 4OYVA 3EQ1A 4P0IA 1M5CA 3KZGA 2QSXA 2H99A 2RINA 2PVUA 4IY6A 3E9XA 4OTEA 1OLCA 1N04A 3KN8A 4LZ7A 1LSTA 5FTHA 4RK2A 2DWJA 1A99A 3QUJA 4C0RA 1R6ZA 2V3TA 4IO5A 3ZS6A 3Q25A 2QS1A 3ILTB 4QF9A 2O1MA 4F2QA 3EN3A 1M5FA 1P1NA 1ZIUA 1FW0A 1OMPA 3T96B 1YCJA 1KWHA 3M3LA 4OQOA 3O6IA 3TELA 4YB7A 3FJ7A 2LAOA 5CRYA 2XX7A 4O3CA 2DS9A 2DP8A 2M8CA 4DDDA 4ELQA 4FEDA 3PGFA 3ZSFA 2VGQA 1B3GA 3SEWA 2D3IA 3MAMA 3C31A 1GTKA 1QW0A 1P1WA 1POY1 4H8IA 3B6TA 3TQWA 1BTJA 2OJTA 3RUMA 1MY3A 3IJXB 3KEIA 1I6AA 4R2BA 3V8XB 1RYOA 3VXCA 2W7YA 1FTKA 3O28A 3U8QA 4KCDA 5L8DA 4H65A 1B52A 4F31B 4NF6B 3CG1A 4QFPA 3OO8A 1B7ZA 3K6XA 1OVTA 4OFOA 4DZ1A 1SI1A 4KYEA 4FORA 3OSRA 3TAJA 4POXA 1TWYA 3PD9A 1US5A 1B0LA 2O7UA 3FZVA 4ND9A 4OFJA 5F7VA 4NF6A 4JWOA 2IEEA 1QKAA 4R2FA 2GHAA 4WEPA 1B1HA 4IGTA 2I3VA 3N6TA 4LATA 1A8EA 4EQ7A 4H1XA 4U1OA 3VLWA 3GZGA 3O6GA 3CIJA 2DXYA 2XD2A 2F35A 4DIGA 1MS7A 3PUXE 3SEUA 2X7PA 2QS4A 1L5TA 3PPOA 1TXFA 4U21A 3L6GA 3F11A 4MLVA 1IZ1A 1Z7NE 4OWDA 4LUBA 1EZ9A 1POTA 4YKIA 5AA2A 1MPDA 2UXAA 3U93A 4Q0CA 5H8SA 5AA2D 2ZYNA 4X9TA 3PUYE 2DYXA 2I3WA 4F3PA 3WAFA 1PEBA 4EDPA 3IR1A 5HBCA 3EHUA 2AL4A 4OMBA 1VFEA 3KFMA 1ZTYA 4NF4B 3RTFB 1ANFA 5FHMA 1SW4A 3FXUA 4JWXA 3CFXA 1ZU0A 3IO6A 2QS2A 4YB5A 4NF4A 5ICQA 2ESNA 3C4MA 2HEUA 5B7DA 3QK6A 2XXWA 4UA8A 5CBSA 3B6QA 5EHMA 2YPNA 3E3KA 2ZNTA 3HO7A 1PB9A 3OENA 1LCTA 2WKYA 4OEVA 4PETA 1JVXA 4HTGA 5CM6A 4NE4A 2QS3A 1H44A 3K2DA 3ECRA 4PE5B 4JSOA 4G68C 3MZ1A 1MQJA 1LCFA 2O1LA 1B1XA 4XTCQ 1P1UA 4RY1A 3K6WA 2Z8EA 3QXMA 4F1YA 1LB8A 5B70A 3IAZA 1IIWA 4F3BA 2AIXA 5DVJA 1LLSA 1P1QA 2HZKA 3UK4A 1QUKA 3MQ9A 4F29A 2V3QA 1N3XA 1JW4A 2IA4A 3FXQA 1PBQA 3TZAA 3PUVE 3SETA 1PB7A 4R74A 1NNTA 2F36A 3LSXA 3OSQA 3G3GA 4IB2A 5I58B 4ESWA 2Y84A 3FV1A 2AYSA 4AQ4A 3CI8A 3FATA 2GFEA 1B9JA 1FQFA 4X48A 5ITPA 5I58A 2DWHA 3VVDA 4R6HA 1O7TA 4OERA 3E4RA 3BFTA 4GWOA 3TFLA 1EU8A 4IO7A 1MY1A 2Q2CA 1H76A 4I8CA 2XD3A 3FV2A 2XXRA 1LBCA 4P11A 1OQHA 3DP4A 4HS7A 2XXPA 1N7XA 3PPNA 4ECFA 5KCJB 1VSOA 3C35A 4GLIA 3TTMA 4IY5A 4ZEBA 3DELB 1LAHE 1M5DA 3MW0A 4F39A 4RPNA 1JEVA 3FJMA 2D5WA 5JTYB 2Q88A 1M5BA 3G3FA 3H06B 3K1PA 5KCJA 3EHSA 3TPAA 3N5LA 2Q2AA 3QUFA 4ZEIA 1B6HA 1N7WA 3MVZA 3KSJA 4XKPA 3KBRA 3MZ9A 1Z7ME 4WEDA 3GXAA 1MQHA 5FHNA 5JTYA 4F3SA 3IOWA 1P1OA 5I2KA 1SW2A 1UTBB 3KJ7A 1LAGE 1Y3PA 4ISUA 4POWA 3FASA 2Z22A 2XXUA 3LC8A 1YTVA 4R6YA 1PC3A 4R75A 4OVJA 1UTBA 4NF8A 4E0XA 1BKAA 2P0SA 3H3GA 1IXHA 2CZLA 1URDA 3QAXA 1VR5A 2GRVA 1FTLA 2F7BA 3SEXA 3U92A 1UIUA 4N07A 3LUYA 1B46A 4KYDA 4GOTA 1TT1A 1FTJA 5AA1A 1CB6A 4MH5A 4NF5B 3T93B 1N84A 1MH3A 3MP8A 5L9MA 4FAJA 2HQ0A 3K6VA 4YB6A 4FATA 4G8NA 1UQWA 3CR9A 2RC7A 3C32A 2DOJA 4PFUA 1RYXA 2Q9TA 4PFTA 1AOVA 3SDFA 3G7WA 4Q8RA 5BWJA 4GRKA 4YZZA 1LAFE 4NWDA 4N6PA 2I49A 3C34A 4YKKA 1II5A 4TOZA 2UVJA 3M8UA 2HZLA 2D21A 3O97A 2I4CA 3E13X 4EF2A 1SW5A 5IAIA 4UACA 3FVKA 3ZKLA 1MPBA 2GH9A 3ONMA 3N26A 2UVIA 1SI0A 1QUJA 4IO2A 4KYSA 3OEMA 2O51A 3RT8A 1B51A 4R9GA 1IITA 5M2VA 1QUIA 1JVYA 3JZJA 1XVXA 1D9VA 2F97A 4MBPA 3CG3A 4ZECA 1B7HA 5I2NB 2YLNA 4H8JA 2ANJA 3TCFA 2VD3A 4GXAA 1TFDA 3MVYA 1OVBA 5ICTA 4DXCA 3W9VA 3CVGA 3TCGA 2XXVA 3KOSA 5I2NA 4U4SA 1SW1A 2QL3A 3S9EA 3VLVA 2YJPA 1B7UA 1B5JA 5JK4A 4OESA 1A8FA 2H9BA 3MP6A 4RYAA 1USYH 3LBSA 1DMBA 4KHZE 1NKXA 3U1OA 5F1QA 1SQYA 2PT2A 2I0BA 3HSTA 3SESA 1SDXA 5I57B 3MC2A 2VD2A 4QHQA 5H8FB 2VOZA 4KPTA 5I56B 3UA8A 2KLFA 5DT6A 3THIA 4DXBA 3MVXA 1O64A 4IO6A 3PPRA 3D4GA 5I57A 1A55A 3H4ZA 3DP8A 4F2OA 3SEVA 4GL0A 4LVQA 4ZEDA 1QULA 4RK9A 2F78A 3TCHA 4GIZA 4Q30B 4GFRA 1Y1ZA 1MDQA 2NXOA 3BKIB 3HN0A 1R1NA 3P7IA 2V3UA 2PBWA 1GR2A 2FNCA 1D9YA 4QFNA 4R6KA 1GVCA 3QIMA 4EXLA 3T22A 4DCXA 2ZXTA 3CSGA 3K01A 2Y7IA 3UP9A 1S7YA 2OLBA 2XXHA 1MG1A 4YMBA 4OZ9A 1LFGA 3BBRA 4QFOA 1B58A 3S4UA 5TU0A 3IB1A 1I6BA 1N0TA 2Z23A 2X26A 1Y4TA 1B40A 3VVEA 2QPQA 4LZ5A 4R73A 3R7XA 3FIRA 3TTNA 1ELJA 5AE4A 1ZKBA 2NVUB 4ELPA 4PP0A 1WVJA 1EZOA 4F3GA 1USYE 3ZKKA 1IUDA 1QJMA 2I6EA 5CMMA 3VFJA 4ZDMA 1AL3A 4JSDA 1B3EA 2PMSA 1N76A 1NH7A 4PFWA 4QRZA 1J1NA 4M4GA 5H8QB 4ZEKA 4XKNA 3C33A 2DE3A 3C9HA 4ESXA 2O84X 1B32A 5DVFA 1H45A 1URSA 3B6WA 3RT6B 1MRPA 4U1ZA 1NMUA 4R72A 5H8QA 2ZNUA 3T9HB 4I9DA 4L17A 2FA7A 5J1DA 3T66A 4OFLA 3OD7A 2RCBA 4XKQA 3HCQA 2XHDA 4BDOA 2RF1A 1S9TA 1AMFA 1MY0A 3VV5A 4AB6A 1YAEA 2I0CA 1R9LA 1BIYA 1H3DA 2HXWA 5CC2A 4OEUA 4G8MA 4AB5A 4TLLB 3LSLA 3IO4A 4DCYA 1LBBA 3SEYA 3IOVA 3ODBA 3A3CA 1MPCA 4KR5A 3A09A 3PMWA 2QJEA 4RA1A 2OZZA 4WKMA 4ZS9A 5A5XB 4GL8A 5DTBA 2PYYA 4GXSB 1VFDA 4N13A 5ELVA 5KZTA 4RNSA 3OELA 3Q28A 1CE2A 3K02A 2H5YA 4YAHX 3FVOA 3RN8A 2F6PA 2H4IA 5A5XA 1MH4A 1ZLQA 3IB2A 3N6UA 1EZPA 5K2YA 1UIVA 2BJJX 4KQPA 1OIBA 1B4ZA 3RTWB 2Y7RA 3MVWA 4K3FA 3PUWE 4MF3A 3K4UA 2HAUA 4XKRA 1ZJLA 5HM4B 2ABHA 4DXUA 4YKJA 4BDMA 3IOTA 3VLUA 3FJGA 2RKMA 1I6QA 2Q8JA 1EH3A 4GF8A 3H6TA 2ONSA 2O6AA 4I62A 2REJA 4PQJA 1O63A 4P0GA 3IL1B 3I5OA 1R9QA 1B5IA 4ZZEA 5DEXB 4H6DA 2ONKE 3CRBA 4LP2B 2F6GA 2DXRA 4Z0IA 3JYRA 3IB0A 3HHFA 4G68B 3MP1A 4NMYA 2ZNSA 3OEKA 2PT1A 2O69A 2Z8DA 3RLFE 3LSWA 4GD5A 4HCYA 1HSLA 2Q89A 3PMXA 5CMBA 2DWIA 1IXGA 4U22A 2NWJA 5H8NB 5DYHA 2F7CA 2FYIA 3Q26A 3OXNA 1S50A 1IXCA 2DE2A 1B3HA 3HHGA 2VP1A 3H7MA 1B4HA 2ZYMA 1BLFA 2O7IA 4PFYA 5H8NA 2DSFA 4KD5A 2F5XA 2UVHA 2XXYA 3W15C 5I59B 1Y1MA 1FCKA 2VHAA 1PB8A 5CMKA 4F1VA 1MXWA 2CMOA 1IXIA 3CFZA 2G93A 3T9UA 1JW1A 2B3BA 2RCAA 1MQGA 5I59A 2HCAA 1MM6A 3GLBA 3FVGA 1LAXA 4BDRA 1IQ7A 4IGRA 1SD3A 1B3FA 1IEJA 3TEPA 2G29A 4YMAA 4R9FA 4NF5A 1WDNA 3PPQA 1M5EA 2B65A 3FVNA 5FHOA 4EQBA 4U2RA 1URGA 3MJNA 4F1UA 4TLMB 3G3JA 4O3AA 2O68A 2THIA 1P99A 3VE1B 3K0VA 3C36A 4JDFA 4G8HA 3IORA 3H6VA 1JW5A 4EXKA 1H43A 3VXBA 4QFLA 2ZYOA 3FGSA 4QFKA 1FQBA 2RC8A 1MQIA 4F22A 3PD8A 3M3KA 1XVYA 1D3KA 2UYFA 3TDJA 4C1UA 1FQCA 2UVGA 2I48A 4X1DA 5AA4B 3Q29A 4FEBA 4FIMA 4H0WA 1GGGA 3USDA 4X1BA 1NNFA 1FQDA 4RPOA 2OBGA 3VDFA 1DPPA 3K1MA 4EUOA 2R9JA 2XXQA 5AA4A 2XX8A 3PMVA 2V93A 3T9VA 3KN3A 3I6VA 4RXLA 4LONB 5FTIA 5EHSA 1NL5A 4DLDA 4LQ5A 4NTLA 3MWBA 4FJPA 3KOTA 4HCWA 3EHTA 3N94A 2XXXA 5H8FA 3A3UA 3EF7A 5I56A 2OCUA 3MUQA 2XXTA 3RPWA 1B3LA 4G4PA 2ZMBA 3LR1A 3PPPA 3D4CA 4IO4A 1MDP1 1WODA 1MQDA 2Y7PA 2ONRA 5BUUA 3G3IA 3LSFB 1QVSA 1JNFA 3BFUA 4U23A 4YU0A 3RY3A 3JV9A 4DE8A 1FQEA 2OK2A 4IO3A 4OENA 3K00A 3B7DA 1BP5A 3KGCA 1Y3QA 2HAVA 1YPNA 1NNPA 4Z7EA 4KI0E 1HSJA 2F7AA 3U94A 3UGWA 4GQOA 4QSDA 1MXVA 2E0SA 3CSBA 3WAEA 1FTMA 1UTHB 1XHYA 4XIGQ 2P1SA 4MFIA 4JWYA 4NEDA 4ZEFA 4H5FA 4KCCA 3TYHA 3DP6A 3IJOB 4G2ZA 4QSEA 1A7LA 1DTGA 3TKDA 5AA2B 2B3FA 4JBZA 3PU5A 3TMGA 3H6WA 1UTHA 4H5GA 1LGBC 3ILUB 1HSEA 3O6HA 3QSLA 3SKPA 1F9BA 1FQAA 3O29A 3CFLA 1DTZA 1A40A 4RJZA 1AIVA 1LFHA 1MY2A 4JB7A 4EF1A 3TTLA 3TTKA 1SYHA 5AA3A 1OLAA 3SERA 1SYIA 2P2AA 3RQTA 1QKBA 1DOTA 1VE4A 5TP9B 3O9PA 3TTRA 4KFQA 2H25A 5IKBA 2I4BA 3L6HA 2NOOA 4NWCA 4LZ8A 4M1VA 5CI5A 5K2XA 3R26A 4BLAA 4ELRA 1MXZA 2DQVA 3PUZE 5HPQA 5TP9A 1PDAA 3DM0A 1XOCA 4ELOA 4ZZAA 1MXXA 4BDLA 2E1SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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