2WKYA

Crystal structure of the ligand-binding core of glur5 in complex with the agonist 4-ahcp
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
b'RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Glutamate Receptor Glur5 Agonist (S)-2-Amino-3-(3-Hydroxy-7,8-Dihydro-6H-Cyclohepta[D]Isoxazol-4-Yl)Propionic Acid and the 8-Methyl Analogue: Synthesis, Molecular Pharmacology, and Biostructural Characterization
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-06-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2wkyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2wkyA02
2GH9A 4GLIA 2F34A 1H45A 4HW8A 4G2ZA 4ISUA 1QUIA 2E0SA 2I0BA 4YAHX 3HCQA 1SD3A 1FCKA 1MXUA 5B70A 4F1UA 3CFLA 4UA8A 3GXAA 4F3BA 4OERA 2O1MA 1MPDA 2XXTA 3EHSA 2F6PA 1Q35A 1N0TA 4NEDA 4POWA 3PMWA 4JDFA 3KOTA 1M5CA 3IL1B 3OENA 3M8UA 3T96B 3HPIA 2X26A 3IOVA 2F36A 3K0VA 3QYTA 4EXKA 1RYOA 4WXJA 3D4GA 5BWJA 2HZLA 2DSFA 4Q8RA 2HZKA 1JEVA 4O3BA 1A8FA 4R2BA 1SDXA 1NH8A 3VDFA 4OESA 3FVGA 3A3CA 1DPPA 4OMBA 3KFMA 1BTJA 4ONYA 3K1NA 4AB6A 1P1WA 3ODBA 3IR1A 1SI0A 4EQBA 3T9XB 1AMFA 4C1UA 1I69A 3VXCA 1MXXA 1AOVA 1XT8A 4TQUQ 4F39A 3PUWE 1UQWA 3C31A 2R71A 2PMSA 4YB5A 3VE1B 4F2OA 1BIYA 4QFOA 4UACA 1A99A 3RT8A 4U1OA 2AL4A 4H5GA 3TZAA 1B1HA 2O7IA 3SEVA 4KI0E 1TXFA 3IB0A 4RYAA 4YICA 4OTEA 1QW0A 3FD3A 5KDTA 4QFLA 4FEBA 5H8HA 1MQDA 3EN3A 1TT1A 5H8FB 3OELA 4FJPA 4JSOA 4KYEA 3MAMA 5TPAA 4NF4B 3DP6A 5AA3A 3UGWA 4OFLA 3FATA 3B7DA 1Y1ZA 1Y4TA 1D3KA 2D3IA 4PFWA 2F7AA 2RC8A 5KCJB 3TELA 1DOTA 3C4MA 2UYEA 5ICQA 3UA8A 1URSA 4OEUA 2VHAA 4F2QA 4THIA 1MY1A 4XKNA 2VGQA 3KGCA 3IB2A 4NF6B 3RGYA 2Z8EA 3V83A 1P99A 4HS7A 3KEIA 4F1YA 3PMXA 4OEVA 2F5XA 4RK9A 3VVDA 2I49A 4O3CA 4X9TA 2Y7IA 1SW2A 3N6TA 2B3BA 2R9JA 3KSJA 2I4BA 2RINA 2VD3A 3V5AA 3I5OA 3FXUA 5EHSA 4KD5A 3QXMA 4IO7A 1UIUA 1ZTYA 1B1XA 3RT6B 3U94A 2F7CA 4RJZA 2IEEA 1B3GA 4TOZA 3TUSA 2DE2A 3G3GA 3VLWA 1IXGA 4XKQA 3ZKLA 1HSLA 3IOWA 4FE8A 4R74A 2OK2A 1B4HA 4ECFA 5BUUA 3O66A 1QUKA 2ABHA 5AA2A 4RPNA 5CRYA 1N04A 3FJGA 1WODA 4YU0A 3IX1A 1UTHB 3R7XA 4ZZAA 1B58A 3CI8A 3L6GA 1IXIA 2Z23A 4R2FA 2NOOA 3O97A 4QFNA 4ESWA 4FAJA 2Y7KA 1OVBA 5KZTA 1LAHE 5JTYA 2X7QA 3O6GA 3Q25A 3TQWA 4F3GA 1PB7A 2B3FA 1MXZA 4MBPA 5FTHA 4ZEIA 4POXA 3T9UA 5ITPA 1Z7ME 1ATGA 2KLFA 2XXRA 1N76A 2ESNA 2DE4A 3VVFA 1JVXA 1N3XA 2A5TB 4OFJA 1OVTA 1B4ZA 2DP8A 2XXIA 1D4NA 3E9XA 3VLUA 2CMOA 2FYIA 5CMBA 5DTBA 3PPQA 2F6GA 3MWBA 4HCYA 4BDOA 5L9SA 3SESA 3DP4A 1WDNA 2Q89A 4P0GA 5EYFA 4F3SA 4GL0A 1DTGA 3PU5A 1B40A 3FV2A 1JVYA 2XXPA 3TTRA 4QHQA 4GOTA 5J1DA 4H6DA 4O3AA 2ZMBA 5CBRA 3TCGA 1B32A 4KPTA 2HEUA 4DCXA 3IB1A 1I6QA 3G7WA 2NWJA 3OO6A 5JEIA 3VXBA 2X7PA 4ELRA 1R6ZA 2YPNA 1LAXA 5CM6A 4OHNA 5DT6A 2F8DA 5DYHA 2W7YA 4RXLA 1B7HA 5I59B 3K6WA 2O51A 2OBGA 3R26A 2XX8A 3TFLA 4P0IA 3MBPA 2ZYMA 3RQTA 4FEDA 4OXVA 4F19A 2P2AA 3Q27A 3G3IA 4G68A 1MXWA 2D5WA 2ZYKA 3S2VA 4G8NA 4QSDA 2O1LA 2IA4A 2QS4A 4C1TA 5I2NB 1AL3A 1D9VA 4HCWA 3ILUB 4ELPA 2UYFA 2HAUA 3CSGA 3UK4A 3QUJA 3PPOA 2OLBA 4LONB 4U4SA 5CC2A 5L8DA 3DM0A 4LP2B 3RN8A 3IJOB 1B5JA 1MM7A 1B3EA 2ZNTA 4BDLA 4KCDA 3PUYE 2H5YA 4YKJA 4I1DA 1J1NA 4RNSA 2Y7RA 2XXUA 3M3FA 1PB9A 2XD2A 1MY0A 5HM4B 3EQ1A 4GXAA 3GBAA 1UTBB 2Z8DA 2HAVA 3G3FA 3FXRA 4N13A 5H8QB 2I4CA 2DWIA 3VFJA 4XKPA 4OQOA 3OD7A 3K6VA 1NFTA 1ZJLA 4YMAA 1GR2A 2V3UA 1NH7A 4X48A 1ZU0A 5H8NA 3TEPA 1B46A 1UIVA 1II5A 1NMUA 4QF9A 3FVOA 1MM6A 1PBQA 1IXCA 5I57A 3S4UA 3KN7A 1URDA 1B3HA 2GRVA 3HN0A 3FVNA 5I58B 3F11A 2R6GE 4H8JA 1IITA 1DMBA 5I84A 3MPLA 1PDAA 1AH5A 4KFQA 2I48A 4IY5A 3S9MC 4TLLB 3K1MA 5DEXA 5DVJA 1B05A 1B3FA 4YB7A 4NTLA 1SW4A 4ZS9A 5B7DA 4YB6A 2UVGA 4EQ9A 2O68A 2QPQA 3S9NC 4PFUA 4PE5B 4YKPA 3N6UA 1H44A 1CB6A 5I56A 1B52A 4U23A 3V89B 4NF5B 2Z8FA 3ILTB 2DVZA 5A5XA 4ZECA 3RUMA 2G93A 2OWSA 1B5IA 1EH3A 1LCTA 1Y20A 4ND9A 2O6AA 2P0SA 4R6KA 1XVYA 1USYE 4RA1A 3OEKA 4Q30B 3CSBA 3IAZA 4BDQA 4X1DA 1WVJA 5CMMA 1QUJA 1SQYA 2ANJA 2ZYOA 4YZZA 2H9BA 4E0XA 4RY1A 4WEPA 4GRKA 1XVXA 4JSDA 4MFIA 2LAOA 2I6EA 3C9HA 4LUBA 1H43A 1XC1A 4EXLA 4NF8A 5DVIA 2XXXA 3C35A 3MJNA 3H6UA 3ZS6A 1MY4A 2Q2AA 1M5FA 4WKMA 3OMBA 5CBSA 4AB5A 3PV0E 5TP9A 2Y7PA 3MVXA 2Y7WA 4JB7A 2BJJX 4QFKA 1S7YA 4F22A 1MXVA 4KCCA 3FGSA 1B6HA 2E1SA 3WAFA 3SKPA 3B6WA 3L6HA 1M5BA 1B51A 1ZLQA 1MQIA 2ZYNA 4XKRA 2XX9A 2DWJA 3PGFA 3IORA 3S9EA 2RCAA 4PFTA 1IIWA 4LATA 1JW5A 2AIXA 5I2KB 3IK6B 4QSCA 5FHNA 3A09A 2F7BA 1MXYA 4EF2A 1H3DA 3FZVA 4AQ4A 4JWYA 1UTBA 4U2RA 3KJTA 1EZPA 3H6WA 3IOUA 1LB9A 1P1QA 4WEDA 3SDFA 2ZNSA 3G3KA 1MH3A 1B5HA 1S50A 2B65A 1LFGA 3EHUA 4IO6A 1LB8A 1NNTA 1IXHA 2PBWA 2HXWA 4H1XA 2QMXA 3ZSFA 5LOMA 4H8IA 4XXUA 2REJA 4DLDA 1QJMA 1MDQA 2NUVA 4DXUA 1Y3NA 1FQFA 3MZBA 3UORA 3LSLA 1P1NA 4GVOA 3OO9A 1VSOA 4FORA 3W15C 4P11A 2QJEA 2OJTA 3PMVA 3MZ1A 4H67A 3R6UA 3O6IA 1B0LA 2ZXTA 1OQGA 1R9LA 3SEUA 3QAXA 1H76A 2RF1A 2VD2A 4IO5A 1RYXA 1PEBA 2REGA 3CR9A 5HPQA 5CMCA 3BFUA 4F1VA 3T93B 1B2HA 1RKMA 1OQHA 1CE2A 1HSEA 1LCFA 3JZJA 4GXSB 4Z0IA 1HSJA 4DIGA 3OOAA 3W9VA 4ZEDA 3C34A 3HHFA 3OEMA 3IO4A 4QFPA 5DVFA 3VLVA 2XXHA 4PQJA 2XX7A 3JV9A 2O7UA 3H03A 1R9QA 3EHTA 3H7MA 1LFIA 4LQ5A 3FJ7A 4XIGQ 2XHDA 3O6HA 4YKKA 1Y9UA 1O7TA 1US5A 1I6BA 5HBCA 5L9OA 1T0KA 2Y84A 3D4CA 4DE8A 1BKAA 4BLAA 1ZKBA 2HQ0A 3V8XB 3K00A 5JK4A 2P1SA 2PT1A 5IAIA 3LSFB 4R73A 4DXCA 1MG1A 5ELVA 1A8EA 1NKXA 4G8HA 4OWDA 3TPAA 4DZ1A 3PD8A 2QSXA 3FASA 5H8FA 1YPNA 1L5TA 1Y3PA 4IO3A 2THIA 3KN8A 1I6AA 1O64A 4H0WA 4NF4A 3MP8A 3BFTA 3FIRA 2RC7A 3MUQA 5KCJA 3MW0A 1Z7NE 3VV5A 4FIMA 3K6UA 1FQAA 1QVSA 4Z7EA 3K4UA 1FQDA 3PPNA 1POY1 1FW0A 1YTVA 2DQVA 3MP1A 1XOCA 3UIFA 5KDTB 1LFHA 3TCFA 3N5LA 4NF6A 2UVHA 2I0CA 1JW4A 1LBBA 3RLFE 3GZGA 4QRZA 1ZIUA 2RKMA 4JXIA 1LLSA 5FHMA 1TFDA 2V93A 3C36A 3FUZA 1ELJA 2YJPA 5ITOA 1QULA 4OETA 3O9PA 3TTNA 1MPBA 3O29A 4JWOA 3MZ9A 4QSEA 3H3GA 4GFRA 1YCJA 4IB2A 3I3VA 2DOJA 1PC3A 1VR5A 4LZ5A 1S9TA 2H4IA 2V84A 4MLQA 4GWOA 5AA4B 2UVJA 2QS1A 5L9MA 4E0WA 2NXOA 4KYSA 4H5FA 1IUDA 3C33A 3LUYA 4XTCQ 1GTKA 1F9BA 3IJXB 3UP9A 4DXBA 3RNNA 3SETA 5IKBA 4LA9A 3TMGA 1UTHA 3FV1A 3MVWA 3SERA 2XD3A 3KBRA 3TTKA 3TAJA 3LSWA 1Y4CA 3QK6A 3MVZA 2HCAA 3U92A 4TLMB 1P1UA 2VOZA 2GFEA 1BLFA 5AA2B 4N07A 4U21A 2Z22A 2Q8JA 2DS9A 3PPRA 5CMKA 2A5TA 1SW1A 3PD9A 4R6YA 3P7IA 1LSTA 1IQ7A 1URGA 3CG3A 1Y1MA 4RK2A 2GHAA 1FTOA 3O2AA 1LBCA 3H6VA 3M3KA 2O84X 5JTYB 2Q2CA 4NMYA 1NNFA 2I3WA 1OMPA 1USYH 4ZE8A 2G29A 3PUVE 2WKYA 1DSNA 4F31B 3DELB 4EF1A 1M5EA 4EQ7A 3LR1A 1OIBA 3H06B 1VFEA 3KN3A 1OLAA 1A7LA 1MY2A 3SEWA 5K2YA 1JW1A 3LC8A 3HO7A 3KZGA 3ZKKA 3FXQA 3G3JA 4R72A 4FECA 1FTLA 1B0HA 1MQJA 2YLNA 1LGBC 3AXFA 1ANFA 3OO8A 3U8QA 2XXVA 5I59A 2F35A 3HV1A 4ZZEA 1TFAA 4R6HA 3S9LC 1US4A 3A3UA 2PVUA 4NE4A 3U72A 4FATA 3SEYA 3DLNA 3OO7A 3T66A 3PPPA 3KSXA 4YMBA 4F29A 3K02A 4KQPA 4G77A 5I2NA 4IY6A 1MQGA 3MC2A 3TQLA 4ZEKA 3PUXE 2D21A 3KG2A 3G3HA 1MPCA 4PFYA 4KHZE 4LZ8A 4N6PA 2QMWA 1FQCA 1Y3QA 2QRYA 2DWAA 4G68C 3IO6A 2F97A 2V3QA 1QKBA 3TYHA 4MH5A 5H8SA 1NL5A 3E4RA 2AYSA 3RY3A 4MLVA 2NVUB 1DPEA 3QIMA 4G68B 4BDNA 4JBZA 5AE4A 3K1PA 2ONKE 3K2DA 4G8MA 1XHYA 3CIJA 3UN6A 1B9JA 4GF8A 3FVKA 1SVXB 5AA4A 5TU0A 2OWTA 2PT2A 1GVCA 2H98A 3OSRA 4K3FA 2CZLA 1N84A 2I58A 5M2VA 1D9YA 1JETA 4U4XA 3FJMA 3RPWA 5H8QA 4ZEFA 4LVQA 1MS7A 4IO2A 4OVJA 4HTGA 3EF7A 3KJ7A 4EDPA 5F1QA 5F7VA 4Q0CA 1FQBA 4G4PA 2UVIA 5I58A 1Q1KA 1FTJA 1N7WA 3BBRA 2OCUA 3B6TA 4KYDA 4M1VA 3K6XA 2XXWA 4KR5A 3VVEA 2ONSA 3B6QA 3TTMA 4IGTA 3ECRA 2ALUA 3PUZE 1MH4A 1YAEA 4X1BA 5H8NB 2F78A 3BKIB 3RTFB 1OLCA 3M3LA 5FHOA 1A54A 3Q28A 5I57B 1R1NA 1XS5A 4GD5A 4NF5A 1P1OA 2Q88A 2VP1A 3E3KA 4ZE9A 3CVGA 3MP6A 3Q29A 3CFZA 3MVYA 3QUFA 1A40A 2DE3A 3IOTA 2A5SA 1FQEA 3O28A 3JYRA 3MQ9A 5DEXB 3Q26A 3T9VA 5K2XA 3OSQA 4ZDMA 3WAEA 3T9HB 4BDMA 1IZ1A 1GGGA 1MRPA 4OENA 1PB8A 2RC9A 2DWHA 1EZOA 3U93A 5I56B 4Q5TA 2M8CA 3CG1A 5EHMA 2HFBA 2H99A 3KOSA 4U1ZA 2DVCA 5A5XB 4PETA 2RCBA 2QL3A 2Q9TA 4ELQA 1SBPA 1FTKA 3I6VA 1QKAA 4IO4A 3HHGA 1N7XA 3H6TA 1KWHA 2QS2A 1M5DA 4H65A 2PX1A 1B7ZA 4GQOA 2V3TA 4U22A 1ZMGA 1O63A 2GHBA 3DP8A 4JWXA 2FNCA 3E13X 2I3VA 2O69A 3MPKA 5ISUA 1JEUA 1NNPA 4EUOA 1MDP1 4I8CA 4ESXA 4DCYA 3W9WA 1IEJA 3OXNA 5CI5A 1VE4A 3C32A 2DYXA 1SYHA 1GV8A 4I9DA 3USDA 4R75A 4NF8B 4OYVA 2DXRA 3ONMA 1BP5A 3LSXA 3SEXA 4PP0A 1B7UA 1AIVA 1NNKA 5H8HB 1LAFE 4NWDA 2OZZA 5TP9B 4L17A 2XXYA 5TPAB 3K01A 5I2KA 4OZ9A 5AA2D 3U1OA 3H4ZA 4R9FA 1SI1A 1A55A 1B3LA 3HSTA 4ZEBA 5AA1A 1POTA 4C0RA 2ONRA 2FA7A 4GIZA 2PYYA 3LBSA 5FTIA 3TKDA 3RTWB 3N94A 2H25A 3T22A 3QSLA 4NWCA 2UXAA 4MF3A 4ELOA 3TODA 2QS3A 3TTLA 1EZ9A 1MY3A 3GLBA 1LAGE 4IGRA 1JNFA 4BDRA 1N3WA 3THIA 3N26A 4M4GA 4YKIA 5ICTA 3EPEA 2V25A 1VFDA 2AL5A 4F18A 1SW5A 4F3PA 2ZNUA 4GL8A 4R9GA 3CRBA 4LQ2A 3TDJA 4LZ7A 1ZBMA 4DDDA 1DTZA 1PBPA 1EU8A 1SYIA 1JQFA 3GBBA 1TWYA 4RPOA 2DXYA 1MQHA 4I62A 4OFOA 3CFXA 1FTMA 2XXQA 3TCHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2GH9A 4GLIA 2F34A 1H45A 4HW8A 3T1BA 4G2ZA 4ISUA 4OA4A 4XF5A 1QUIA 2E0SA 4P47A 2I0BA 4YAHX 3HCQA 1SD3A 1FCKA 1MXUA 5ET6A 5B70A 1DBZA 1NV6A 4HE1A 4F1UA 3CFLA 3B50A 2MKZA 4UA8A 3GXAA 4F3BA 4OERA 2O1MA 1MPDA 1D9QA 2XXTA 3EHSA 2F6PA 1Q35A 1N0TA 4NEDA 4POWA 4N17A 3PMWA 4JDFA 1LBYA 3KOTA 1M5CA 3IL1B 3OENA 3M8UA 2WX9A 3T96B 3HPIA 2X26A 3IOVA 1IMFA 2F36A 3K0VA 2CEYA 3QYTA 4EXKA 1IMAA 4GWSA 1RYOA 4WXJA 3D4GA 5BWJA 2B4LA 2HZLA 2DSFA 1FBDA 4Q8RA 2HZKA 4MNPA 1JEVA 4O3BA 1A8FA 4R2BA 3GYYA 1SDXA 2ZZWA 1NH8A 3VDFA 4OESA 3FVGA 3A3CA 1DPPA 4OMBA 3KFMA 1BTJA 4ONYA 4O7MA 3K1NA 4AB6A 1P1WA 3ODBA 3IR1A 1SI0A 4EQBA 3T9XB 1AMFA 4C1UA 1I69A 3VXCA 1MXXA 1AOVA 1XT8A 4TQUQ 4F39A 3PUWE 1UQWA 3C31A 2R71A 2PMSA 4YB5A 4NX1A 3VE1B 4F2OA 3ISPA 1BIYA 4QFOA 4UACA 1A99A 2CZIA 3RT8A 5EQ8A 1NV5A 4U1OA 2AL4A 4H5GA 3TZAA 1B1HA 2O7IA 3SEVA 4KI0E 1TXFA 3IB0A 4RYAA 4YICA 4OTEA 1JP4A 1QW0A 3FD3A 4QXDA 5KDTA 2XWVA 1NV3A 4QFLA 4FEBA 5H8HA 1MQDA 3EN3A 2DDKA 1TT1A 5H8FB 3OELA 4FJPA 4JSOA 4KYEA 3MAMA 4N6DA 4NAPA 5TPAA 4PDDA 4NF4B 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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