2WUSA

Bacterial actin mreb assembles in complex with cell shape protein rodz
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
LRKDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Bacterial Actin Mreb Assembles in Complex with Cell Shape Protein Rodz.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
molecule tags Structural protein
source organism Thermotoga maritima
total genus 96
structure length 335
sequence length 335
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2wusA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2wusA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2wusA03
1BA1A 2Q0UA 2NRHA 2A41A 4CZJA 1IG8A 4EFHA 4LC9B 4PKGA 1JCEA 1DGKN 1Z6RA 1ZC6A 2IIRA 3MN7A 4IXCA 4O5FA 3AARA 3H1VX 3DXMB 1BA0A 1S3XA 2GWJA 2GEMA 1HKGA 2D0OA 3DXKB 1U2VA 5JICA 1GLBG 1BO5O 1RGIA 4JN4A 3O1BA 4CJ7A 3F9MA 4FWLA 1BDGA 3D7EO 2P9SA 4XEIA 4BC4A 1HJOA 4BGBA 3SLCA 5FPMA 1BG3A 4K43A 4H5TA 4AM6A 4JHDA 2P9NA 2ZWHA 5AQSA 2W41A 3VETA 4BVOA 2WUSA 2IVPA 3U8XA 4BR4A 2DPNA 1MA9B 1C0GA 3LDNA 4WQ5A 4CZFA 3C7NA 4FSVA 3LDOA 5E84A 3WQTA 3A5LC 2ZGYA 4BRLA 2BTFA 3KVGA 4KBOA 1MDUB 3G25A 2GWKA 4CBWA 4EIAA 2YHXA 5EXWA 5F0XA 2CGJA 4O8KA 4FOEA 5EX5A 3VEZA 1D4XA 2ZGZA 5AQPA 5FPNA 3W3DA 3IUCA 3FLCO 4BQZA 3HBTA 4BR5A 3ENHA 4ISFA 5LJWA 1YXQA 3HM8A 2CGKA 2QWQA 4FWPA 5ADXA 2CH6A 4A62A 3VEOA 3FZMA 1BWFO 4BRNA 4PKIA 1X3MA 4IZ9A 4B1UB 4MLEA 4BC5A 1C0FA 3UKRB 3GDQA 1NBWA 4BC3A 1DKGD 3O08A 3DJCA 3UE5A 4CZHA 5AQOA 3HZ6A 4BC2A 1H1VA 5F1XA 4BG9A 4FOIA 3FZKA 4H0TB 2Q1NA 1HKCA 1YAGA 3ATUA 5KQDA 1U6ZA 1QQMA 1T6DA 4B9QA 2QM1A 3VGMA 2D4WA 4A2AA 3O80A 4FWKA 3IMXA 1TUUA 4E1JA 1RFQA 2FSKA 1WUAA 4B1XB 4K41A 5BR9A 1NMDA 5AQJA 4QS8A 3WXJA 1OKJA 4DB3A 4H03B 5AQIA 3LL3A 2QWRA 3AY9A 3CJ7A 1BOTO 5AZIA 3WEEB 4NO7A 3DWLA 3O5BA 1G99A 2FLOA 1HKBA 2E20A 3CI5A 2YHWA 5AQKA 1MWMA 3CJBA 3D2FA 3J8AA 1GLDG 5AQMA 3WXIA 3CJ9A 5BRHA 2P9IB 4EHTA 1YUWA 5BRFA 2P9UA 3CETA 3CJAA 1LOTB 2Q31A 4ISEA 3H3OB 5JLFA 3VEVA 3EO3A 4H5VA 3KHYA 4XH4A 4MO4A 1EQYA 4FL9A 3RSEA 2QWMA 3GL1A 2P9KA 5AQRA 1TYQA 4BRKA 2W40A 1GLJO 3JXUA 3UKUB 1NGIA 3GBTA 4DQ8A 1ATSA 2P9LB 2VCPA 4FPBA 1KAZA 3HTVA 4JAXA 4I6MA 4PKHA 3ZEUA 1KAXA 2A3ZA 2YHYA 5AR0A 3HSCA 3L0QA 4CZMA 1GLEG 3QDKA 3UB5A 4HWIA 2I7PA 3VF6A 3ULEA 1JCFA 4ISGA 4CZLA 1DEJA 3LDLA 4BRQA 4A61A 1LCUA 4BRAA 3VERA 4BRPA 3BP8A 2V51B 2J4RA 5TKYA 2D0PA 3R9PA 3ZETA 4BR7A 1NLVA 4BG8A 3H45C 4IJAA 3ATVA 2QWPA 2P9PA 3TU5A 3C0BA 4WYBA 4BR9A 3EL2A 3VF4A 1NGJA 5BPMA 3ZX2A 4FO0A 3MMVA 3I33A 3EKUA 5AQXA 3KZBA 2FSNA 3LM9A 1GLCG 1GLLO 5AQLA 1J6ZA 5AQTA 3O4WA 2ZF5O 4WQ5C 3CERA 3ID8A 3VGLA 1HLUA 5JMVA 4FWQA 2V7YA 1HPMA 5KQ8A 1ZBSA 3GOIA 4RCHA 3DXMA 3A0IX 3U9ZA 2PBDA 1ESVA 1K8KB 1IJJA 2NZTA 3WT0A 4B1VA 3DXKA 3WXKA 3AAQA 3H6EA 1X9JA 1TUYA 3WXLA 1S22A 5AFUH 5BN8A 3BF3A 2E2NA 3GG4A 3CQYA 1P8ZA 2ITMA 3U9DA 2Q36A 5EOYA 1HX1A 5EVZA 3LM2A 5AZJB 3VESA 4Y0WA 5ADXH 5CE3A 4CBUA 2YJEA 3VPZA 3U4LA 4BRHA 3FE1A 4H0VB 3D2EB 3O8MA 4YDUA 1ATRA 4B1WB 3FZLA 2YI1A 1E4GT 4FWMA 5BPNA 3A5OC 4M7YA 2VYPA 5EY4A 4JD2B 4EHUA 3ZX3A 3QMLA 4B1YB 2QWLA 4GY2B 4FWRA 1SQKA 2HF3A 4YDUC 4J8FA 2E1ZA 3SJHA 2PAVA 3W0LA 4MO5A 5AQGA 3MDQA 1NGFA 4CZGA 2QWNA 4CI6A 2IVOA 3EN9A 2GTDA 2D1KA 2YJFA 4BRFA 3AAPA 3MN5A 2FF3B 3HI0A 3BUZB 4BVPA 4BREA 5AQNA 1R59O 1U2VB 5ELZA 3BF1A 4PL7A 2F9WA 1QHAA 2OANA 4CD1A 5BPLA 1V4SA 2CGLA 5AQHA 2QXLA 2P9SB 3UKRA 3MK6A 3P4IA 5AQFA 3SK3A 4RTFD 3FZFA 1JCGA 2E1YA 1GLAG 2EWSA 1ZXOA 3BEXA 3A5NC 4K42A 5BRDA 2E2OA 3QBXA 1NGCA 4JHDB 4PL8A 2P9NB 1X3NA 2FF6A 3FFKB 2HF4A 2HMPA 2A42A 1YVNA 4H0OA 5LJVA 2E8AA 4QS9A 4XH1A 2ASMA 2UYTA 4BRIA 3C7NB 5E26A 5AQWA 4BRCA 1QQNA 3FGUA 1T6CA 5AQVA 3M6GA 2ASPA 5BREA 1NWKA 2Q97A 5KPRA 4BRGA 2NLXA 3H1QA 2BUPA 3VEWA 2VWBA 1GLFO 5AQYA 1Z05A 4AM7A 4BGAA 3TPQA 2KHOA 4BRDA 2HOEA 4CZKA 4C23A 1SAZA 1Q18A 4BR0A 4DHYA 2CH5A 1E4FT 4FWSA 3WEEA 3ENOA 4K25A 3IDHA 2Q2RA 3H46O 4H0YB 4Z94A 4RWTA 1QZ6A 4BROA 3MCPA 2Q0RA 5JLHA 4FWOA 3LDQA 3M1FA 2P9IA 2A5XA 1Y64A 5B8HA 4FWNA 1QQOA 1SZ2A 3VGKA 2A40A 3I8BA 2V52B 3VENA 4CZEA 2I7NA 4B1ZA 3IFRA 5AQQA 1ATNA 4F9OA 4BQLA 2ASOA 4IJNA 3M3ZA 3O6WA 3OHRA 3CJCA 3VEXA 3JS6A 3UKUA 4GNIA 2E88A 1T44A 5FPDA 4MLHA 4XH5A 2GELA 4QS7A 2P9LA 1XC3A 4H0PA 3SMSA 3WUHA 3QB0A 1WOQA 5KPTA 3VEYA 2H3GX 4H0XB 3WQUA 1KAYA 4A2BA 2F9TA 4JNEA 3A8YA 4NB4A 4CBXA 5AZIB 2E2QA 3SMPA 5AFUA 1XUPO 3QFPA 4IO8A 4WQ4A 1NGBA 1RDWX 1CZAN 3CQXA 5F2RA 1NGGA 3L4IA 5KPZA 1KXPA 3D2FB 4CD3A 3A5MC 3CJ1A 1NGHA 3MN9A 1NGAA 1BUPA 1XQSC 4DCHA 3EZWA 4WQ4C 2P9UB 5LY3A 4M63C 5FPEA 5I9EB 2YCHA 3QFUA 4HTLA 4FPAA 3CHWA 3CIPA 3EKSA 3RSEB 4L3QA 2E2PA 2P9KB 3LDPA 1TYQB 3FZHA 4CZIA 1QZ5A 1MWKA 4EAHD 3VOVA 3H3NO 3QICA 3QBWA 4H5WA 4BRMA 2IVNA 2AP1A 4M7XA 2V7ZA 3ZX0A 2FSJA 3S41A 3MN6A 4I6MB 3R8EA 3GE1A 1K8KA 4IWVA 3ZEUB 1NGEA 1BU6O 3ULEB 1NGDA 4H5NA 4BR2A 2QWOA 3B8AX 3DAWA 5AZJA 1HUXA 3R6MA 3ZETB 2AA4A 5AQUA 3L6QA 2GUPA 3D2EA 3O1WA 2P9PB 3FR0A 2A6AA 1NM1A 2QW9A 5AQZA 4JD2A 1V4TA 2FXUA 4H5RA 5BN9A 3VF2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Q0UA 2NRHA 2A41A 1YT3A 2PY5A 2IIRA 3MN7A 4MFBA 4DSKA 4IXCA 1WBDA 1ASVA 3WNEA 3DXMB 1LV5A 3UIQA 3MECA 4FVMA 1HKGA 4AHUA 3DXKB 4DFKA 1I39A 1RGIA 3THWB 4LF8K 4CJ7A 4FWLA 3CFPA 3HRGA 5SZTA 1C1AA 3C6TA 1X1PA 3S3OA 5FPMA 4FM1A 1EXQA 1BG3A 3SAFA 1FW6A 4AM6A 3TAGA 5AQSA 1LW2A 2WUSA 2DPNA 1MA9B 1TKTA 2FC0A 2ZJRL 1QVGM 3CCJN 4KH4A 5E84A 3ZT1A 2D0AA 3O3GA 4CK2A 2GWKA 4CBWA 1VQ4N 1S6QA 2YHXA 1EKEA 1TV6A 4O8KA 2YX6A 1S9EA 3U6FA 1HYSA 1KLMA 2VQFK 4LSNA 2OPQA 4F3OA 2HBMA 1KFDA 5DM7L 1YXQA 4FWPA 3AO4A 2QKBA 2JWLA 3VEOA 2NRZA 2ZE2A 3THXA 1YJ9N 4JI7K 4B1UB 1QVFM 4MLEA 4BC5A 3K2PA 1C0FA 2ZJPL 4DLGA 3UKRB 4JI4K 1IBLK 5J2QA 1HNIA 1A5XA 5AQOA 1XHXA 1H1VA 4FOIA 3FZKA 4FVUA 2O8CB 4H0TB 1ASUA 3OYEA 1BL3A 4W5RA 3OYDA 3NBPA 1FXXA 4C8KA 1U6ZA 1QQMA 1T6DA 4NLCA 3TTFA 2QM1A 4GVEA 2D4WA 4O55A 3NGIA 4FWKA 4CJTA 1BISA 4N56A 4YOXA 1Q86O 4K41A 4KAZA 1S1WA 4DU1A 3M8PA 1OKJA 3TR8A 1J9AA 1VSJA 5C15A 3AY9A 3CJ7A 1REVA 4ILJA 4TSXA 3RMDA 1BOTO 5AZIA 1JLEA 4CEDA 3KLIA 1HNXK 1G99A 1HKBA 2RPIA 5AQKA 4Q5VA 4YFUA 1MWMA 4FXDA 4H4OA 2Y1IA 5AQMA 3VQ4A 3CF5L 4NCAA 1YUWA 3V9SA 1JLFA 3CETA 3E1YA 3O9UA 4KKOA 3H3OB 4AHTA 3P39A 2G8VA 4CF0A 4FL9A 1YI2N 3S3NA 1ZBFA 5C42A 2P9KA 3VQPA 1NKEA 3MEGA 3UKUB 2WC9A 4AHVA 4DQ8A 1W2BM 3M8SA 1ATSA 1UAXA 2RN2A 3QEIA 3SNNA 2DFFA 1NJWA 1U47A 3F9KA 4OPAA 3KJVA 4KTWA 2PZSA 5JS2A 3VQEA 4CZLA 1J5OA 4X62K 4FK4A 4A61A 4C8OA 4JKGB 4RG8A 3C95A 5TKYA 3L2UA 4BE0A 4X66K 2PYLA 2DY4A 4DQIA 3ZT4A 2Z1JA 1I94K 2P9PA 1QTMA 4DV1K 3C0BA 3SQ4A 3LAKA 1EO1A 4CEQA 3VF4A 3CMEN 4FM0A 4FO0A 5CYMA 4BY9C 3EKUA 5AQXA 3RTVA 1T3VA 3KZBA 2FSNA 2YNIA 1BIZA 3WNGA 2ZF5O 5J1EA 3WNHA 5HRSA 3HJFA 2VG7A 1D5AA 3VGLA 4JKBA 4FJ8A 5FROA 1B9FA 1NK8A 5KQ8A 1RTJA 3GOIA 4KV8A 3J80O 1RBRA 2VGMA 5I42A 1RDCA 1ESVA 4HUEA 2NZTA 3C65A 3WXKA 3SJJA 1X9JA 2P51A 3SUQA 4DV0K 3GG4A 2ITMA 5EOYA 1OH6A 1HX1A 1OVYA 5EVZA 3K9JA 3VESA 2RE2A 1HR0K 3LDSA 5CE3A 4FJXA 2UU9K 4H0VB 3O8MA 4CEOA 4FWMA 3OTOK 1HNWK 4FJMA 4B1YB 3QMLA 1VSEA 3TAPA 2OZSA 1SKRA 1QSSA 3LP0A 4HUFA 2X74A 3W0LA 3PLAA 4GVMA 4DR2K 5HRRA 1XNQK 4MO5A 2OYQA 2UXDK 3KKSA 5HLFA 3DLRA 2NRVA 2GTDA 1FKPA 4CJFA 2D1KA 2KQ2A 3PIOL 1U04A 4YNQA 3CC2N 4F4KA 3AGRA 4B9LA 3MN5A 4YOUA 3BF1A 2OANA 1SL1A 1L3UA 2CGLA 5KGXA 2P5GA 2B6AA 3SUNA 2X78A 4ICLA 3HXMA 3R1XA 4RTFD 3FZFA 4R79A 1RDDA 4FZZA 1GLAG 3BEXA 2E2OA 4PL8A 1X3NA 3NH1A 3AV9A 4DQPA 5KTQA 5LJVA 3L2WA 4QS9A 2ASMA 3MWTA 4JKDA 1VQPN 3CYGA 5E26A 3K5LA 4FZXC 3M6GA 5BREA 4BRGA 2NLXA 1JXEA 3QNNA 1VHXA 1NK6A 2JGUA 3WEEA 4K25A 4NYFA 4EP4A 1ITGA 4V19S 3THXB 2Q3SA 1RNHA 4WFBL 4KH5A 1IO2A 1NK7A 2Q0RA 2JLEA 4CJQA 3AVLA 3EY1A 2P9IA 1FKOA 3K58A 1K73O 1SZ2A 3VENA 2V52B 5CR4A 4CZEA 1JXBA 4B1ZA 3SYZA 5AQQA 3VQ5A 2HHXA 4KO0A 4CECA 4BQLA 4IJNA 5D3GA 4OPKA 3IKMA 4F8RA 5FPDA 2QKKA 4XH5A 1IH7A 4KPYA 4F2RA 4DR6K 4CIGA 3K9KA 1L3VA 1XC3A 4LF9K 3AA4A 2E4LA 4OKJA 5CZ1A 2FBVA 4H0XB 3WQUA 3NH2A 1P90A 3A8YA 4CBXA 4IEIA 5AZIB 1XUPO 1OH7A 2B5JA 1NGBA 3A2FA 3L4IA 1YIJN 1XQSC 4A5BA 4C8NA 4FK2A 4DR4K 2E6MA 4WQ4C 3BY5A 4OPJA 2UUCK 5LY3A 1C1CA 4MDAA 3V1QA 4FJNA 4JI0K 3V1RA 1D8YA 4KB1A 3ZSZA 3OS2A 3KD1E 4CJPA 4KRFA 3Q7CA 3OYLA 1D9FA 1WAFA 2P9KB 4CZIA 4FCYA 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3QERA 3ZCMA 3ZT0A 4LY7A 1KC8O 1YAGA 4C1NK 3ATUA 4DTRA 2GUIA 4GV9A 5DM6L 4A2AA 3NMUA 4ID5A 3IMXA 2ZQBA 1J54A 4DV3K 1VQ9N 1TUUA 4E1JA 1N36K 5BR9A 1TK5A 1YJWN 4QS8A 2BE2A 4ZHRA 4DB3A 4DWIA 5AQIA 3LL3A 2QWRA 3AA2A 4BWMA 3WEEB 1J5EK 4E72A 3QIOA 3O5BA 4QAGA 2YHWA 5GAGP 4ILHA 3IAYA 3D2FA 3J8AA 2UXBK 2G8IA 3OYMA 2P9IB 5C25A 2P9UA 3AVMA 3CJAA 2Q31A 4ISEA 3PX6A 1M90O 3O9RA 3EO3A 4YOWA 4XIUA 4H5VA 2R7YA 4JKHA 3T3FA 3VTHA 4R5PA 1C0TA 3E9OA 3GL1A 5AQRA 2W40A 3JXUA 5KGWA 1NGIA 4DTMA 3DMJA 3AVBA 1WSJA 2VCPA 1Q7YO 1KAZA 3TTCA 5GINA 1K9MO 4JAXA 2VG6A 4JKEA 4E1NA 4CEAA 3L0QA 1T05A 4NXNK 4CZMA 3UB5A 1SKSA 3ITHA 4ISGA 2NRXA 1RCHA 1LCUA 4PA1A 3VERA 1NMNA 4Z0UA 4E19A 4O0IA 2V51B 2J4RA 4UQGA 4W5TA 3ZETA 4BR7A 3VQ6A 3L4QA 2OTJN 4IJAA 4OPHA 3ATVA 2QWPA 4OGEA 4BR9A 3ZX2A 3J7YP 3I33A 4AHCA 4I7FA 2KZMA 1QSLA 3LM9A 3QINA 1GLCG 1GLLO 3CCEN 5CHIA 4FLUA 4JI6K 4O44A 1JKHA 3T7ZA 1HLUA 1BQNA 4LF4K 3PO5A 2V7YA 1HPMA 4ZTJA 1S6PA 3T1HK 3E01A 1CZ9A 2HVIA 3SAGA 2PBDA 2HB5A 1IJJA 4B1VA 3LPTA 3DLKA 2IAJA 4CGIA 5C10A 1RBTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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