The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
65
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sequence length |
164
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structure length |
160
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Chain Sequence |
QQKRAFEYEIRFYTGNDPLDVWDRYISWTEQNYPQSNMSTLLERAVEALQGEKRYYSDPRFLNLWLKLGRLCNEPLDMYSYLHNQGIGVSLAQFYISWAEEYEARENFRKADAIFQEGIQQKAEPLERLQSQHRQFQARVSRQTLLALEKEEEEEVFESS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Defining the Molecular Basis of Bubr1 Kinetochore Interactions and Anaphase-Promoting Complex/Cyclosome (Apc/C)-Cdc20 Inhibition
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
MITOTIC CHECKPOINT SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE BUB1 BETA
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| total genus |
65
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| structure length |
160
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| sequence length |
164
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| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2009-10-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF08311 | Mad3_BUB1_I | Mad3/BUB1 homology region 1 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Alpha Horseshoe | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LAH A; 3SI5 A; 2WVI A; 4AEZ C; 4A1G A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2R05 A; 2AVP A; 4UQX A; 4JEU A; 3QAQ A; 3GZ2 A; 5J90 A; 5D0Q D; 3IKO B; 4YVO A; 2WXL A; 3CVW A; 3S7J A; 4J8E A; 4F1P A; 3V2O A; 2WXI A; 3ASD A; 4GTR A; 3NF1 A; 4U0Z A; 3CGH A; 4AXH A; 3Q4A B; 2BUG A; 2V5Q C; 2AXZ A; 5AAO A; 3IHY A; 2HE0 A; 1SZ9 A; 3ABM E; 5AQ9 A; 1Y8M A; 2FO1 E; 4UI9 J; 5G04 C; 4G8K A; 2DIW A; 3FUH A; 1SZA A; 4F3V A; 4TUU A; 5FQ8 A; 5G05 J; 2CFZ A; 1FVH A; 5ARG A; 3ZYM A; 4GPM A; 1TJF A; 4B0Z A; 4GMJ A; 1H2V C; 1DC2 A; 4BES A; 2V0P A; 3ENE A; 4NIK A; 2V5F A; 1FT2 A; 3FEY A; 5D2M C; 2YQ8 A; 1Z6T A; 4I17 A; 4AVX A; 2DYR E; 3FTZ A; 3NBN B; 1ELW A; 3TXN A; 2BED A; 3ZUV B; 1H2T C; 3TAX A; 1MZC A; 4B8C B; 2P9I G; 2IFU A; 3HXF A; 2Q7F A; 2X6H A; 1KZO A; 3KSQ A; 5M72 A; 4GZ6 A; 4L23 A; 4RG9 A; 2VGX A; 5CCL A; 1JUQ A; 4NUR A; 3FDH A; 1KZP A; 2X6J A; 3D9O A; 1PAQ A; 1H6P A; 2KM4 A; 4EQF A; 1V54 E; 3QNK A; 5HQ8 A; 3UTM A; 3Q78 A; 2DWZ A; 2GGF A; 5BXO A; 5CRV A; 3MJW A; 3EHQ A; 3CHP A; 5LFA A; 5AQ7 A; 2EIM E; 2M63 A; 2OVB A; 4L2Y A; 4GYW A; 5KNH D; 3DWL G; 3HVE A; 1EYH A; 5FIN A; 5ENT D; 4U96 D; 3GZ1 A; 4WUY A; 4ANU A; 3J5Q B; 3TWS A; 4GTQ A; 3TWX A; 3KD7 A; 4Y6W A; 2XZT G; 4ANW A; 4WNF A; 3MKQ B; 2VSO E; 4N3B A; 2LXM A; 1E8W A; 3TGO A; 4U63 A; 3RKV A; 3UM2 A; 2XHE A; 4GZC A; 1SVX A; 4XKC A; 2AXV A; 4TRQ A; 4CDR A; 2P9L G; 1IXV A; 2I1K A; 4UWL A; 2J07 A; 4AM9 A; 4A63 B; 3FU5 A; 3MV2 B; 2WXO A; 2PL2 A; 3PZD A; 1IKN D; 4ILG A; 4XEI G; 3B95 A; 5ENN A; 1K1A A; 2EIK E; 3AG1 E; 4DI4 A; 4ATG A; 4F7A A; 4EBA G; 2X38 A; 2XPI A; 3MA5 A; 5T8I A; 3WXX A; 2XEE A; 3UM3 A; 4WAF A; 3CHM A; 3G2S A; 5KJM A; 4UWF A; 1O5M A; 4WWN A; 1E8Z A; 3ASH A; 3JXI A; 3RRM B; 4N2S A; 3E33 A; 1SA4 A; 4Q69 A; 3L13 A; 3SY2 A; 3FH5 A; 3IBE A; 3EHM A; 4MBG A; 3FUD A; 4YDO A; 1V55 E; 3UIP C; 1QQE A; 4G8L A; 3FUI A; 3RRU A; 4GTO A; 1YCS B; 5FZS A; 3TXM A; 3SGH A; 2WXN A; 4GTT A; 4ANV A; 4BT9 A; 2WM9 A; 5LCW J; 4XI9 A; 2XGO A; 3BG1 B; 3UM1 A; 2ZGD A; 3TG4 A; 2ZIS A; 1OWP A; 5HI7 A; 2KBX A; 5EX0 A; 1Z3X A; 3SFX A; 5KJK A; 4XKB A; 3NOG D; 3G2U A; 5FJY A; 3EHN A; 4HRN A; 3ZW3 A; 4TV3 A; 2P9U G; 4FJZ A; 2L9B A; 4LRZ A; 1BI8 B; 1MQS A; 3VLD A; 3EJN A; 2WVI A; 2AXU A; 5DIZ A; 3UT8 A; 4OVV A; 4DI3 A; 3AS4 A; 3FTS A; 3AS8 A; 4UQY A; 5EYP F; 1WM5 A; 3KEZ A; 4UUC A; 2VGE A; 4DX6 D; 4TUM A; 4EEC A; 3FTU A; 3JUE A; 3U3W A; 5G04 J; 2L0T B; 4GAA A; 4JD2 G; 4HOS A; 5HKP A; 3MKQ A; 4WWP A; 3TWW A; 3U64 A; 1HZ4 A; 1H6O A; 2FI7 A; 2LO6 A; 3RU0 A; 1K8K G; 1TR4 A; 3RO3 A; 2JEK A; 1BD8 A; 1OCR E; 1QBQ A; 1E90 A; 2P9N G; 2AWI A; 3GYZ A; 3RAU A; 1TEZ A; 2F37 A; 4C0E A; 1NP7 A; 2JLB A; 3DEP A; 3ASG A; 2H6I A; 2GRR B; 3PZ3 A; 3HDX A; 4N3A A; 2QFC A; 1H6K A; 4KZC A; 4L9P A; 3HXD A; 1IHG A; 4CZ2 D; 5G05 C; 3TWU A; 4EPZ A; 4EZL A; 3NZU A; 4ILH B; 2DYS E; 3SBT B; 3K9I A; 4CRW A; 4JEH A; 2C2L A; 3DXM G; 1Y6I A; 2J9Q A; 5LOZ A; 1HG5 A; 3G2T A; 4URK A; 2HR2 A; 3SQV A; 4FLB A; 2NSZ A; 3CKC A; 2XCB A; 3VLF A; 3FUF A; 4FHJ A; 2E2E A; 3B7R L; 4XI0 A; 1OCZ E; 2PZI A; 3JCK C; 4U0U A; 3C3Q A; 2FF4 A; 4FJY A; 2P9K G; 2Y0B G; 3AG2 E; 3NB2 A; 1JCR A; 1U2V G; 3CV0 A; 3O4Z A; 2FEZ A; 1OY3 D; 2PNN A; 2GRM A; 3TWR A; 1HF8 A; 5JJ6 A; 3FUJ A; 1WAO 1; 1HE8 A; 3FY4 A; 5CHE E; 5ENS D; 1HU3 A; 5FWQ A; 2IJG X; 1OT8 A; 1OWM A; 5E76 A; 1FT1 A; 4GA0 A; 4Z68 A; 3CK7 A; 4G26 A; 2R5S A; 4BX8 A; 2CHZ A; 4DK5 A; 1FVF A; 3LJN A; 2MHK A; 5KJN A; 1TNO A; 4K03 A; 3UKU G; 3D3M A; 4BT8 A; 1N4R A; 3I3N A; 1TYQ G; 2J4D A; 4K0R A; 2Y4T A; 2EQX A; 1O1R A; 4XZ4 A; 3AU5 A; 2OEV A; 4XX5 A; 3C3R A; 2WXK A; 3LXU X; 4A1S A; 4LNU D; 4LSZ E; 2L6B A; 3D9L A; 5ARF A; 2Y3A A; 4LUN U; 3QC1 A; 2VSY A; 4KVO A; 5KBA A; 2CHX A; 4HVB A; 1MX4 A; 5EID A; 3JUI A; 1BI7 B; 5AJD A; 1NA3 A; 3W9F A; 2VGY A; 3CK9 A; 2HO1 A; 3FU6 A; 2P58 C; 1EF1 C; 5FZR A; 3NAW A; 4LER A; 1NI1 A; 3VTY A; 5BUZ A; 3SNX A; 3AAA C; 2XS8 A; 2YHC A; 5BXU A; 3CVU A; 2XZD G; 1H2U A; 2BF0 X; 4DX1 A; 2WPV A; 3ZN3 A; 1UN8 A; 2LSU A; 2F8Y A; 4C9B B; 1UOH A; 4LCT A; 4U8H A; 3FEX A; 3AU4 A; 3DST A; 2EIJ E; 3APC A; 4JL0 A; 4AY6 A; 3Q47 B; 4FAD A; 3ZIM A; 4HLE A; 1OCC E; 4H7Y A; 1O1S A; 1D8D A; 1NA0 A; 2GRL A; 3L08 A; 3DSS A; 1IQR A; 1IYG A; 5JA4 D; 4OVU A; 4BET A; 3PZ1 A; 3JQ0 A; 3HXE A; 1U3D A; 4XE0 A; 4BY6 A; 1N54 A; 2CG3 A; 2YIN A; 5C2Y A; 3EU5 A; 3UUX A; 2UY1 B; 3Q7A A; 2A4Z A; 3FTY A; 4HQD A; 1LD7 A; 5CMY A; 2RFA A; 4PDX A; 4FC8 A; 2KXP C; 1FCH A; 4AY5 A; 1E96 B; 1BPO A; 3V31 A; 5D0O D; 3T8K A; 1NFI E; 2IEJ A; 3ZNG A; 4GA2 A; 3R9A B; 3ZEF A; 1UJK A; 3G2V A; 2OCC E; 3DEO A; 1S63 A; 4RVB A; 4N5C A; 5ENO D; 2XEV A; 2DZO A; 4O6F A; 3D9J A; 2IOL A; 1E8X A; 4HOU A; 4LEU A; 5G2N A; 2ZGG A; 3L16 A; 4J8D A; 2KAT A; 4ME2 A; 3UIN C; 4M3O A; 2PQN A; 3FUN A; 3R7R A; 4IN3 B; 3UKR G; 4CDN A; 3TG5 A; 1FPP A; 3EDT B; 4HRL A; 3UT7 A; 4AOF A; 2IO2 C; 3CST A; 3ABK E; 4G11 A; 3O48 A; 3SBS A; 1LTX A; 3EIQ C; 3OAW A; 1NZN A; 3FTX A; 2AJA A; 4AIF A; 2DBA A; 1MX2 A; 3PH0 C; 2ZXW E; 5FT9 A; 5IY5 E; 3JQ1 A; 2C0L A; 5JJT A; 2P2C P; 4I9E A; 1TNU A; 5JHA A; 3PZ2 A; 3Q79 A; 5A7D B; 1WDY A; 4IRU A; 4X8Q A; 3CHS A; 3UXG A; 4DUI A; 3B13 A; 5C1D A; 4YND A; 3CHQ A; 3ABL E; 2V4H C; 2YHE A; 1YMP A; 3L17 A; 3UT4 A; 3JXJ A; 4O1P A; 3LY9 A; 2KZT B; 3CR3 A; 4JA7 A; 1JWF A; 4UQZ A; 3FTV A; 1XNF A; 1A17 A; 3L6A A; 3HXB A; 3CHO A; 5BPP A; 2FO7 A; 3BQO A; 4DPR A; 1QYM A; 1ELK A; 1G3N B; 1RZ4 A; 4N5Q A; 3T5V A; 2UY1 A; 3FUK A; 3NOC D; 1N11 A; 1IHB A; 3GW4 A; 5EIB E; 2ZU6 B; 4DJA A; 5EN5 D; 3KEA A; 3PZ4 A; 3LPZ A; 3FTW A; 2XGS A; 3FU3 A; 5ANR A; 5AQA A; 1U3C A; 3CVY A; 5ENQ D; 3ZRH A; 1TJC A; 3U66 A; 4HOQ A; 2VSN A; 3LS8 A; 4AP2 A; 3ZYQ A; 4R7L A; 4ATZ D; 5B1A E; 2WQ7 A; 3PUJ A; 3B7S A; 1JCS A; 3I4R B; 5FIO A; 3DBS A; 4UI9 K; 3V79 K; 3PRE A; 1OCO E; 4FHK A; 1Z5S C; 4LNG A; 4I6E A; 4CT0 A; 1HH8 A; 3ZYK A; 3TWT A; 4HXI A; 4F6R D; 1TN7 A; 1KT1 A; 4BWR A; 3MYV A; 3UQ3 A; 4KXK B; 2KCL A; 3OXG A; 3DSX A; 4V3I A; 2WXJ A; 3S7D A; 3OTN A; 1HS6 A; 2L0I A; 2NC9 A; 4G23 A; 3Q73 A; 3ZVV A; 1HX8 A; 1ZB1 A; 4BSX A; 3LVQ E; 2LXL A; 1KT0 A; 2R2L A; 3R9M A; 1AP7 A; 2WXM A; 3LY8 A; 3FHE A; 1N94 A; 3ULQ A; 4UWG A; 2IY0 C; 2QZA A; 3UPV A; 2I9C A; 4HBD A; 3SI5 A; 3SF4 A; 2BKK B; 2VJ8 A; 4K5C A; 2OND A; 2NXP A; 2OEW A; 3ML9 A; 4I2Z A; 2KZT A; 1Q2Z A; 4G25 A; 5G55 A; 3F6Q A; 4U95 D; 3SO8 A; 3RSE G; 2HYZ A; 4O60 A; 1UN9 A; 4AJW A; 4RSY A; 4PS3 A; 3BG0 B; 1N0Q A; 3RO2 A; 5AN8 A; 3HXC A; 1L5J A; 3ULY A; 2WXP A; 1P5Q A; 4PUC A; 2X6K A; 5FQ4 A; 2OOE A; 5KWD A; 4JPS A; 4Y6C A; 3IHV A; 4ACK A; 4HI8 A; 2WXF A; 5BT1 A; 5CEA A; 3RRN B; 3PE3 A; 1TN8 A; 3FUE A; 1X81 A; 2GW1 A; 1GW6 A; 2J09 A; 3C98 A; 4RG6 A; 3EU9 A; 5A23 A; 5BV0 A; 4KZ0 A; 3HG0 D; 3L22 A; 3QKY A; 3QWV A; 4GTP A; 4GU5 A; 2XPY A; 4W9R A; 2XRY A; 2IO3 C; 2WB2 A; 3ZFW A; 3MKR A; 4DX5 D; 4GZ3 A; 5T4Y A; 1QZ2 A; 3ML8 A; 3DSU A; 1YYH A; 3PS6 A; 2R02 A; 2P9S G; 4GYO A; 2OVF A; 4XIF A; 1HXI A; 4MRU A; 3ZU7 B; 2PM7 A; 2F8X K; 1ZBP A; 4IYP A; 4N2Q A; 5CER B; 2IOS A; 2Y4U A; 3Q5M A; 2ZIR A; 2VYI A; 3PVL A; 3Q15 A; 4NAC A; 3SFZ A; 3QWW A; 4CYM D; 2EIL E; 4APO A; 1HG2 A; 3AG4 E; 3PNL B; 1TNY A; 4BTB A; 3DPY A; 3ASF A; 3MZL B; 3B7T A; 3Q7F A; 3LKU A; 5CRU A; 2AW6 A; 2F0Y A; 5LP0 A; 4OYS A; 3QAR A; 5KCM A; 3J5P A; 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