2WZ9A

Crystal structure of the thioredoxin domain of human txnl2
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
120
structure length
120
Chain Sequence
AAVEEVGSAGQFEELLRLKAKSLLVVHFWAPWAPQCAQMNEVMAELAKELPQVSFVKLEAEGVPEVSEKYEISSVPTFLFFKNSQKIDRLDGAHAPELTKKVQRHASSGSFLPSAKVKVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Protein binding
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of the Thioredoxin Domain of Human Txnl2
rcsb
molecule keywords GLUTAREDOXIN-3
total genus 34
structure length 120
sequence length 120
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2wz9A00
1QFNA 3FK8A 2HZEB 4KSOA 4X0XA 2FA4A 3I69A 1Z7PA 4KW6A 2YN1A 3M9KA 4TXVA 3UJ1A 2VL3A 1G6YA 4N10A 1S3CA 2CX4A 4WETA 4POKA 5KN0A 12GSA 1JHBA 1YF1A 2CAIA 1C72A 2GT5A 4KSMA 4ZBBA 2GQKA 4OO5A 3ME8A 3U5RE 4TKYA 1BQ7A 1VGLA 5CRWA 1GUHA 1Z5YE 1HNCA 4V2LA 2AYTA 1LBKA 4OFMA 2TRXA 3FR6A 3WT2A 3H4KA 1G7OA 2O8VB 1MD4A 3GL5A 2G0FA 3LXTA 1A8YA 2YV7A 1O85A 5AIVA 2DMLA 3KXOA 2R4VA 1DSBA 2LEGA 3A2WA 1A2LA 2JADA 4IBPA 1QQ2A 3CYNA 1B9YC 2C8UA 3GKXA 3C73A 3GIXA 3EU3A 2MMNA 1SJIA 4K0GA 5ELAA 1TDIA 1XW9A 5A4WA 2V1MA 3HVVA 2OADA 5DVBA 2HSHA 5GSTA 5A4VA 3IAM2 6GSVA 1O7UA 1PMTA 5AGYA 3UEMA 3LJRA 3A5WA 3TKSE 3EINA 4EF0A 2DSAA 4AJ6A 1F6MC 4KUNA 2ES7A 4OWYA 1Z6NA 4QL7A 2I1UA 3JCML 4HOJA 1EV9A 2N5FA 1EZKA 3GHAA 1JZDA 5D9XA 3M0FA 4X1UA 1BJXA 4ECBA 3VPTA 1ZMAA 4ZBAA 5G5EA 3LQ7A 1A0RP 3G7YA 1GSUA 5CREA 2WCIA 2A2SA 4TR1A 1OYJA 1XPVA 3TKQA 1T4YA 2KP2A 3QAVA 1ON4A 1K0NA 4IHUA 3I43A 2WDUA 10GSA 5DDLA 2OACA 4CHSA 4N11A 2GZZA 5HR0A 4K6XA 1F3AA 2MBTA 1NHOA 3BCIA 5C04A 5ECKB 2DIZA 1K0BA 5IPHA 1KEBA 3A3TA 3GTUB 3LYKA 2EIOA 4ULXA 1RK4A 2NBSA 1U6TA 4O32A 5B7CA 3RDWA 2IMKA 1XXUA 2LNSA 1J0FA 3M1GA 1U88A 1ERVA 2RM6A 3F4TA 3CMIA 1GSEA 5CNWA 1W89A 1Z7RA 3PINA 3F6DA 5ECMB 3RBTA 3P2AA 3L9SA 4OMVA 4K7OA 2XPEA 1AQVA 2FWFA 4RQRA 3FYGA 3GX0A 3H93A 2C3QA 2VOCA 3IV4A 3H1NA 3ZIVA 4MJCA 1EOGA 4TW5A 4HJ2A 2JL4A 4Q5NA 2A4VA 2YWOA 1X0RA 1XVQA 1ZZYA 2JSYA 3IK9A 2N5BA 4JRRA 4IN0A 1LU4A 3TRPA 2IWTA 5J9CA 1EGOA 3IPZA 4HEA2 3N5OA 5ECHB 2V41A 5D9VA 1V57A 4MZWA 4E8HA 5IQYA 2CAQA 2HE3A 2KUCA 3QDNA 5CO3A 3ZVJD 1TW9A 2LRTA 2H73A 5CYYA 5IM9A 2H74A 3DXBA 1GNEA 5DQYA 3Q74A 2IFQB 4OCFA 4NV2A 1XZOA 3ZRDA 5IO0A 2H30A 3N9JA 1UN2A 4Q5QA 1ZCPA 1DE2A 2CZ3A 3GKMA 1M2BA 3HA9A 4GSTA 3FW2A 1YEPA 2IMIA 4PUFC 1R5PA 3H8QA 5DCHA 8GSSA 1FHEA 1A23A 4KCEA 2E2GA 4MZCA 5HFGA 2IMFA 4LLRA 4LMVA 4NXIA 1QUWA 2XHFA 4DSRA 2B6MA 3TJFA 2D2ZA 2HZFA 2IMEA 2C3NA 4PUAA 3IDVA 3HXSA 1XWAA 4K9ZA 1FO5A 3EURA 1MEKA 1YKCA 3K8NA 2HXKA 4EDYA 6GSYA 1ABAA 2GVPA 1PD21 1O8XA 3CBUA 1M9AA 3H79A 3F63A 3E9JB 1E2YA 4AGSA 1XWBA 3FZ5A 2YWIA 2WJUA 4XTSA 4QL9A 1GTAA 3GV1A 4YH2A 4O92A 4BL7A 4L5LA 1YY7A 3VPQA 3QR6A 3UBKA 2PN8A 1GSYA 4JU5A 2V6KA 2AHEA 4BPYA 4EC0A 1XIYA 3TDGA 5EL8A 1K0CA 3QD9A 1JLVA 3W8SA 4IP1A 2XPDA 4D73A 1K0AA 2M46A 3TJBA 3L9VA 1G7EA 2GTUA 3F3RA 1WPIA 2JZSA 2B7JA 3KH9A 3ZVJA 5DJMA 1XFLA 3M8NA 4F0CA 4J56E 4V2MA 2H76A 3BJ5A 1ZOFA 2GGTA 1QXHA 1H4OA 2VCTA 3CTFA 4L0WA 5HR1A 3LEFA 5D96A 4V1Ap 3EVIA 1KTEA 4MPFA 1OAZA 4GTUA 2QC7A 4ZIJA 3KH7A 5AIXA 2H6YA 3ZYWA 4HS1A 4MJEA 1F9MA 1SL1B 4GRFA 1X5EA 1SKWB 2H75A 3DMLA 4Q5FA 3ZITA 1X9MB 2HRFA 2BJXA 3M9JA 4HZ2A 1TKDB 1SJ6A 3KEBA 4GXZA 2HFDA 2MMZA 5ID2A 1Z3EA 4DVCA 4DSQA 5KEJA 1AW9A 2H19A 1TRSA 4AJ7A 5EY6A 1OKTA 2L6CA 5DALA 5GAPD 3C8EA 3Q19A 2REMA 4NV5A 2VM2A 4PNFA 2DC5A 4WR4A 1BYEA 2RM5A 2FUG2 1NM3A 2DBCA 3FZ9A 2H66A 11GSA 3CRTA 1NHYA 2RUEA 3CSJA 1XVWA 2B5EA 1MDJA 1V58A 4JZQA 1YF0A 4PQIA 1WP0A 5HR2A 3KD0A 3GRXA 4AF2A 1PRXA 4WF5A 3TKSC 2YJ7A 3ZREA 2HNLA 3GKKA 1MD3A 1FVJA 4F82A 4GSNA 5D8IA 4FIWA 5IMVA 5LCZA 3QAGA 3D4MA 1TU8A 2DJ2A 5CRGA 4XCSA 2PBJA 3DIEA 2LTKA 1X5DA 4V2NA 1X5CA 1T1VA 2GDRA 4ML1A 4XRDA 4DSSA 5G1KA 4IJIA 2K8SA 4XHMA 1X9SB 5DAKB 4RUVA 2GSTA 5IMCA 1Z9HA 2H6XA 1TJDA 3IXRA 5FHIA 5H5SA 2XBIA 2ZUPA 3RHCA 1PL1A 2H0GA 5J41A 2CA8A 2RIIA 2NPBA 5JWQB 4WKWA 2H6ZA 2O85A 4K1FA 4IVFA 1GSFA 4EXJA 1Z6MA 1V9WA 1DBYA 2VUPA 3GFKA 3CSIA 5C00A 4D73B 3LFLA 2DLXA 4MLYA 2V6OA 1QK8A 3C1RA 3ZL5A 1T00A 4MCUA 1MTCA 1M9BA 2OA7A 3P8WA 1A0FA 1SD8A 2A2RA 2B5YA 3D0ZA 3UBLA 1M99A 4GQFA 5ECLB 5IO2A 5DBQA 4GWRA 1AIUA 1PL2A 3FR3A 2KOKA 5HFIA 4EVMA 1B4QA 1XOBA 2VCXA 1TK0B 2PPTA 3GUSA 4K0NA 2B7KA 1B48A 3L78A 4BWQA 4PGTA 2Z9SA 2WULA 2N5AA 1H75A 3HHVA 1K0DA 2WZ9A 3WGXA 4MF5A 2YV9A 3LWAA 1GTBA 2I4AA 1U3IA 2IMDA 3KCMA 4EO3A 2BMXA 1ZGNA 3OR5A 5ABRA 2R37A 1R7HA 5D9WA 2IJYA 3DD3A 2AB6A 1GSDA 3J7Yb 1GULA 1AAZA 5GSSA 1ACVA 4NPBA 3KP8A 4NAXA 13GSA 4Z7XA 2CQ9A 5JCGA 1A24A 5DALB 1IYHA 4WBJA 5B8AA 1JFUA 4IQ1A 3BOAA 2CVKA 2M72A 4E8EA 4IGJA 4J57E 2AV4A 2YZHA 4WBRD 2C3TA 4O7HA 4BVYA 4MPGA 6GSTA 5GZZB 1OC9A 3GNJA 4ZL8A 1O73A 2ZNMA 4IP6A 1NW2A 4MABA 3QAWA 1GRXA 1QMVA 1T3BA 5LD0A 1SK1A 2DMMA 4V1Ag 2DJ1A 4XS4A 1JZWA 2LS5A 1MDIA 1O6JA 4EUYA 2LQOA 4MJAA 3TOUA 1ERTA 4I5QA 3TRQA 2L59A 3O76A 1GSSA 1AQWA 2MMOA 2JZTA 3IC4A 4LA1A 4OD7A 3D22A 4DSSB 2FCHA 2F51A 1ZL9A 4PXOA 1XOAA 3VLNA 2K18A 2NTOA 18GSA 2YNXA 1G6WA 1ST9A 1OE8A 4IELA 2K6VA 2F8FA 3EU4A 2PMTA 2X64A 3GYKA 1XCCA 4KNDA 4HI7A 2L4CA 1TRWA 4MK3A 2B1LA 3EE2A 1R5AA 4I2TA 1WMJA 4JBBA 1PQNA 2C0FA 3LSZA 2OJLA 4OO4A 4HJMA 4ID0A 3HJMA 1BEDA 3GH6A 5HFKA 3NZNA 3DRNA 3F9UA 1O8WA 4MF6A 2I9HA 3C1SA 5H5RA 4YAPA 4ML6A 3FKFA 5HQPA 2P5QA 17GSA 1TI3A 2AUVA 2RLIA 3WT1A 2AJQB 3F3QA 4PX1A 2C0GA 2VL2C 2F9SA 1VF4A 4AJ8A 1TRUA 2KHPA 5D9TA 1FB6A 3UARA 1FG4A 2HYXA 2CVBA 2YJHA 2C4JA 3BD2A 1URMA 1VF1A 3V1WA 3PR8A 3F8UA 4NHWA 1HNBA 3L4NA 6GSXA 4PURA 1VRSD 3EMPA 1EEJA 1HNAA 4KB3A 3A2XA 1CQHA 4POLA 1SJZA 3Q6OA 1MDKA 2LV3A 3IE3A 1A2MA 3ZZXA 1CQGA 2QSIA 1SKSB 4P3YB 4K7IA 4TR1B 2WRTA 3O3TA 4K2DA 5IMZA 1K0MA 3WGDA 3DWVA 3LG6A 2C80A 2LNTA 4G10A 3TJKA 2IN3A 4TRXA 3EC3A 4YQMA 1OC9B 3MNGA 3UMAA 2CVDA 1AQXA 4RQXA 3P7XA 4IS0A 3GL3A 2HZEA 4N30A 2VLUA 1PA3A 3CSHA 4XS4B 5COHA 3HD5A 1VF2A 1SL2B 1HD2A 1R4WA 2YZUA 3PH9A 2VL9A 4RI7A 1GUKA 5F05A 2HRNA 3D6IA 2C0DA 1BG5A 2FLSA 1A8LA 4XS1A 3VK9A 3RAZA 4KDXA 2H72A 2P31A 1GH2A 5JCWA 3CTGA 1PGTA 2X8CA 2QGVA 2DJJA 1M2AA 4TR4A 2H71A 1TXXA 3P90A 1ML6A 4HU7A 4IJ3A 2E2MA 2L5LA 3GA4A 4I97A 2X8HA 1OVNA 1PKZA 1GTIA 3IAS2 5A4UA 1JZRA 1X9WB 4MDCA 4KDUA 2B1KA 3TUEA 2VAFA 3MWHA 4NHZA 2B5XA 4I8BA 1PKWA 2VD0A 3KTLA 3S9FA 1F3BA 1Y6EA 2OE3A 1FAAA 2GSSA 3VURA 1EOHA 1SENA 5ECOB 2OE1A 3FHKA 4WXTA 3ERWA 2BTOT 2O89A 2JU5A 1DE1A 3GKNA 3UVHA 5AN1A 2F8AA 4BWSA 4MZBA 2EIRA 3GX8A 16GSA 3KJYA 1KBNA 1UVZA 3RPNA 4GSSA 2VCZA 3APQA 3US3A 4BVXA 2KLXA 1SD9A 4EL1A 4KX4A 5GAND 3TKSA 1YKAA 2GSQA 1SU9A 1EP8A 2CV4A 3D5JA 4JEDA 4ECJA 4KE3A 4IW9A 3VWUA 2WS2A 2WGRA 1IYIA 5D73A 4GCIA 2TRCP 5L71A 3QPMA 3ZFLA 1YEXA 1PN9A 3QMXA 4EDZA 1EWXA 3ERFA 2FWGA 5JCUA 1T8EB 2DIYA 6GSSA 5J3RA 2MMAA 2H1DA 5ECRB 4POBA 4MA9A 1FVKA 1SK2A 2HI7A 3U6VA 4N0VA 4MJBA 3GTUA 3SBCA 2J23A 4NMUA 2CT6A 3VFIA 3F4SA 1WRYA 3FY7A 3F0IA 4G19A 3HJPA 1OKDA 2EC4A 2ON7A 3L0HA 2J9HA 3UOMA 1G0TA 4YQUA 3RPPA 22GSA 2R5GA 1GWCA 3GMFA 4MH3A 4FYBA 3DGQA 2R6KA 4TXOA 2NVLA 3CRUA 4GQCA 3I6AA 2FGXA 4NWYA 5B6MA 3IBHA 1K0OA 2F3MA 3GH9A 5JWRB 3D4TA 1U3AA 3WYWA 1Q98A 4HQSA 1TRVA 3L9UA 3UIWA 1WWJA 3GSTA 3NIVA 2LRCA 2JACA 3UVTA 1PX7A 1B8XA 2H0IA 5ECQB 1XBSA 4LL1B 1YJ6A 5AISA 1SYRA 6GSUA 3APSA 3UL3A 3ZIJA 1ZYEA 4ZILA 4HZ4A 4HU9A 4HQZA 3C7MA 4KCAA 1FOVA 2H8LA 3KIJA 3HDCA 3IA1A 2HT9A 2WFCA 5LNKe 3IHQA 5G2ZA 3W8JA 2VM1A 2IFQA 2LJRA 3VWWA 2PERA 3FRCA 2FWEA 1WJKA 3QOUA 5KN1A 3SWLA 2GZPA 1V40A 2K9FA 3VWXA 1RQMA 2MZCA 1UC7A 1FW1A 5DCGA 4ZL9A 4ZB8A 1TOFA 1U87A 3HJOA 1DUGA 1Q4JA 1HYUA 14GSA 3AY8A 1YZXA 5ID2B 1GSQA 1V98A 3HCZA 4L5OA 2R2JA 3DYRA 3EMXA 3LGCA 4ILFA 1RW1A 5ENUA 2VLVA 2R3XA 2VD1A 4ZXGA 2V2GA 1AC1A 4FYCA 1TTZA 4ECCA 1SK0A 3APOA 4K8MA 3ME7A 2E0QA 2YWMA 1M7TA 1GLQA 2PGTA 3FEUA 3EWLA 1TP9A 2IIYA 3J7Yk 4G9HA 4J2FA 3ISOA 4EKZA 4X43A 2PVQA 3QFAC 1AUCA 6GSWA 7GSSA 3DVXA 2ON5A 4RI6A 3W6GA 2OBIA 5HR3A 1T7PB 3HVSA 4PNGA 4JR4A 2LSTA 1ZYQB 1AXDA 3UAPA 2X8GA 4EE0A 2K8VA 2LRNA 4KDYA 4ZBDA 3ZLPA 2LJAA 1BX9A 4H86A 4TR0A 2H01A 2JSZA 2G2QA 1EEMA 3HYPA 2M80A 3HY2A 2GZYA 4N0ZA 5IMAA 2RUFA 2CZ2A 1JLWA 4FO5A 1S3DA 4KGIA 2PUKC 1NSWA 5E4WA 5J4UA 5EPFA 3QCPA 3TB2A 3IOSA 1WE0A 3EYTA 2I81A 3G7JA 3GURA 4OFNA 4FYUA 4YAVA 1M0UA 3RHBA 5G31A 4TXOB 5EVOA 4CW9A 2H1BA 1N8JA 1S3AA 2E7PA 4F2IA 2NDOA 3Q18A 3MDKA 1OE7A 3I9V2 2LKUA 1K3LA 1OC3A 4GF0A 2LJKA 3GN3A 2VL2A 4JR6A 3ZTLA 3KGKA 2MYGA 1I5GA 4ACSA 3KMOA 2LUSA 3ZFBA 3TJJA 1F2EA 1TU7A 5G5FA 3TCOA 1T4ZA 3MSZA 1W4VA 4QQ7A 5G30A 1SL0B 3LYPA 3FZAA 5B6NA 1WOUA 2VO4A 2GSRA 4CDOA 2HLSA 4PQ1A 5IOWA 1EP7A 3ED3A 1J9BA 2MBSA 1M2DA 5ECSA 4WEYA 1KNGA 1PSQA 1GL8A 19GSA 1EV4A 2YP6A 4KH7A 9GSSA 5DJLA 3DKSA 2B3SA 4IKHA 3D21A 3HZ4A 3G7IA 4ISDA 3TKPA 2AAWA 4O5RA 3A2VA 3O6TA 4BA7A 3WGEA 2P5RA 3TKRA 2FNOA 4LL4B 3TGZA 3C71A 4WF4A 1GP1A 4FH8A 1TK5B 3R2QA 4PQHA 4F9ZA 2YOIA 3E0UA 5DQSA 5IPGA 1GLPA 1WIKA 1N2AA 1YQ1A 3NOFA 1XWKA 1O81A 1SYXA 4MP4A 1QGVA 1XW6A 4ECIA 1I9DA 1XWGA 3HZ8A 5ELGA 1EGRA 5FWGA 1TI1A 1Y25A 3KP9A 2L4QA 4HUAA 3IK7A 4ZB6A 4ZB9A 2H1GA 3BCKA 2PWJA 4OFTA 4WR5A 3MAKA 5A5KA 4JE1A 4GLTA 3LXZA 1J08A 3ERGA 4L8EA 5FT3A 2YCDA 2VIMA 2FHEA 2FD3A 4LMWA 5CP1A 3KM6A 4ZL7A 3VWVA 2EIQA 2VCQA 5DAKA 3KMNA 2PVOC 4I2UA 1B4PA 3DEXA 5ECPB 5CRDA 2OKAA 4F03A 3KZQA 1GUMA 3VI7A 2WB9A 3KTBA 2YPMA 2JZRA 2PU9C 2IPAA 3DVWA 5ECIB 2GQMA 1R26A 2H70A 4KAEA 5B8BA 3PGTA 4TR3A 5F06A 5G1LA 5KN2A 2GS3A 1E6BA 1OC8A 20GSA 5IMDA 2XBQA 1USBA 2OBKA 4MH2A 3LORA 4IQAA 5IOXA 4MF7A 2GLRA 4G2EA 2HSYA 3ZMLA 1SKRB 2DJ3A 5IMFA 5JWOB 3TOTA 1LJRA 2TIRA 5F07A 2VCWA 4HDEA 3HVXA 4TN8A 2QKEA 1GTUA 3HKRA 1YDKA 5ECNB 1JZOA 1XW5A 2VCVA 2ZCTA 2YANA 4KA0A 2DJ0A 1K3OA 2OE0A 4K7NA 4DEJA 3F4RA 4XRAA 5H5QA 3TJGA 3M3MA 5CAXA 3CXGA 2O87A 5E59A 1A2JA 4XIHA 1B9XC 1K3YA 2V32A 2X99A 4TVEA 2LQQA 2L5OA 4Q5RA 3VI5A 2H1AA 5J9BA 2FY6A 3IRAA 5CRHA 5F8BA 1BAYA 4TOPA 1PX6A 3F6FA 5KN3A 3G9BA 1F37A 2L57A 4F0BA 2GT6A 4XS6A 3FR9A 2H0HA 5J5NA 4I6XA 3GSSA 1ERUA 3FZ4A 4L0UA 1FB0A 2DJKA 3WD6A 3ZMKA 2VLTA 2KP1A 1ILOA 2FWHA 2GQLA 3E3EA 5IIZA 1VF3A 3QFBC 1THXA 1GNWA 1UA5A 4YQVA 3TRXA 3BBYA 2ALBA 1V2AA 2IL3A 5D93A 2P0GA 4MMMA 1THOA 2O7KA 2C0EA 2CX3A 5F0GA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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