2X0OA

Apo structure of the alcaligin biosynthesis protein c (alcc) from bordetella bronchiseptica
Total Genus 194
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
194
sequence length
595
structure length
578
Chain Sequence
PHPAEIVAHLQPEIWNKVNRLLVRKAISEYAHEWLLEPQRLGPGETPGFERFRLTLADGAQYDFDAQVMAMRHWRIPPESIVKTVAGVPAPLDALQFVIEIRDKLGLPVDRLPIYMDEITSTLHGSAYKHGRTTLGAAALARADYQTIETSMIEGHPSFVANNGRLGFDAEDYHGYAPEAATPVRLMWLAVHKDNAHFSCLSDMDYDSLMSEELGESAVTDFAARLREQGLHPADYYFMPAHPWQWFNKLSLAFAPYVAQRKIVCLGYGEEQYLAQQSIRTFFNISRPGKRYVKTSLSILNMGFMRGLSPYYMAGTPAINEYIHDLISADPWLRANGFRILREVASMGFRNYYYEAAIDTDTPYKKMFSALWRENPLTLIAPGQNLMTMAALLHVDPQGRALLPELIQASGLDAGTWLERYVDAYLTPLIHCFYAHDLVFMPHGENVILVIQDGVPVRAFMKDIAEESSILNPQVRLPQAAQRLAADVPEAYKLLTIFVDVFEGYFRHLTQILVETELMPEHDFWRLVAGRIAAYQQAHPQRLDKYRRYDLFAPDMIHSCLNRLQLAAPNLPNPIACF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The Scottish Structural Proteomics Facility: Targets, Methods and Outputs.
pubmed doi rcsb
source organism Bordetella bronchiseptica
molecule tags Biosynthetic protein
molecule keywords ALCALIGIN BIOSYNTHESIS PROTEIN
total genus 194
structure length 578
sequence length 595
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04183 IucA_IucC IucA / IucC family
A PF06276 FhuF Ferric iron reductase FhuF-like transporter
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.274.90 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Enzyme I; Chain A, domain 2 Enzyme I; Chain A, domain 2 2x0oA01
1.10.510.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 2x0oA04
2X0QA 2X0OA 2X0PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2CLXA 3CD8A 3SQQA 5HE1A 3QZIA 4O0SA 4UZDA 1MQ4A 1UNLA 4QYFA 5HU3A 4WBBB 4RBLA 5HVYA 2X8IA 4QMTA 2B54A 4FTLA 4I23A 3MFRA 1FGIA 4FV1A 3T3UA 4ANSA 4RJ6A 1CKIA 4BCHA 3W2RA 2R0UA 3HMOA 2O3PA 1FVTA 2ZV8A 2JAVA 4FKSA 2OBJA 4XEYA 3RINA 4HW7A 4OT5A 3C4EA 3O0GA 4L6QA 1H8FA 1A06A 4EH9A 4FSUA 2YCFA 3ZYAA 4O0YA 5GNKA 3RJCA 5JFXA 3ZLYA 4MEDA 3A99A 4CEJA 3IKAA 3BU5A 5IKWA 2AYPA 3WF9A 5KHWA 1MRYA 5K0KA 5ANDA 4KIKB 3ZRLA 3BGZA 4I1ZA 3RI1A 5BVFA 5L2WA 1WFCA 3FZTA 3LFQA 3R8MA 3OTVA 1UWHA 1YVJA 1K3AA 1I44A 2QURA 4HOKA 4BHNA 5J95A 4C2MA 3A7GA 3EL8A 4QPAA 3JVSA 1PMUA 2EU9A 2OICA 5CQUA 3R7VA 3ETAA 2J9MA 3SRVA 4BTMA 4EOQA 4FTIA 3P08A 3TNIA 5DH3A 3W55A 4AZVA 3TTIA 1PXOA 3TUDA 2X1NA 3BE2A 3EN9A 4WSYA 1H0WA 4O27B 5AMNA 3DZOA 4OUCA 4Q9SA 4BDIA 3LXPA 1BYGA 3VN9A 4LMUA 4C34A 2HAKA 2R3GA 2WMXA 2CPKE 4YTHA 5JFVA 3ZH8A 4ZEGA 2E9NA 3E3PA 2C5OA 3D7ZA 2QHMA 5HLPA 4ZSAA 5BQ0A 3EQHA 2DS1A 2X7OA 4EK3A 3NUXA 3PXZA 2JA6A 4FTRA 3ZHPC 4FI1A 1V1KA 3QRIA 4RQKA 2IEWA 5CI7A 1AD5A 5E91A 4EOSA 5JQ5A 3A62A 5HQ0A 3F5UA 3LCOA 4DGGA 2NP8A 3OG7A 1DM2A 2YISA 4BCNA 4RJ4A 4ITIA 3WZDA 4FT3A 2UZVA 4KIQA 5JT2A 5M44A 2IN6A 3JVRA 4M7IA 1Y91A 5FD2A 3TZ7A 4FYNA 4NW5A 3F61A 3UC3A 5HIEA 5K5XA 2R3FA 4U40A 3L8XA 1QPJA 3MB6A 3PSBA 4WSQA 2IW8A 2N1DB 2JBPA 3PVGA 4ZIMA 3GCSA 3F6XA 5IDPA 1OUYA 2YLFA 5C8KA 3QUPA 3OCGA 2G9XA 4OBPA 4YR8A 3SXFA 3REPA 2V55A 1YHSA 3KMUA 3VUHA 1JVPP 3EQBA 5CU0A 2WTWA 1WCMA 3BPRA 2Z7RA 1IASA 4EUUA 2X2KA 1P2AA 5IUGA 4UY9A 3P7BA 3VBQA 3DV3A 3MFSA 5BMSA 2BFYA 2R7IA 3BGPA 2VTAA 1OUKA 4XLIA 5AX3A 3FKOA 5HICA 3R0TA 4KS8A 2FSTX 4RGJA 3PTGA 4Z16A 4D2RA 4GEOA 4BTFA 5HBEA 5EI6A 3AD4A 5AP7A 5J9YA 3RNIA 4IX5A 2ZDTA 4FIGA 4X3JA 4TYJA 3WF6A 3V51A 4GT4A 4EKLA 4CSVA 3FI2A 3MWUA 2XMYA 1JKLA 4NM0A 4BCOA 2LGCA 3W1FA 4N6YA 3MTLA 4U9AA 3RPYA 2WIHA 3HECA 2GNIA 2HZIA 3KXNA 2P3GX 4QYYA 3DK3A 3RCJA 4TL0A 3V8WA 2WTCA 4ZJIA 3ZC6A 3C13A 2ZM4A 2CLQA 4UWBA 4P5ZA 1XWSA 3KMMA 4YO6A 3UQFA 1DS5A 4PMMA 3FZOA 5EKOA 4F70A 5DFPA 4BCJA 4EJNA 3FQEA 3R21A 1PKGA 5L8LA 3IPHA 3S0OA 2XB7A 3D2KA 4QMQA 2R7BA 4YJPA 1DI8A 4L53A 5AX9A 4DH5A 4FKUA 5IZ2A 3WF8A 2VWZA 3C4ZA 2WQMA 3I1AA 3FY0A 2VWXA 3MS9A 4YLKA 4LG4A 4A4OA 2QOKA 2VTMA 3DJ6A 4IXPA 3C4FA 4PF4A 3TN8A 3H9OA 1KE8A 4MVFA 2FB8A 2XKEA 4I93A 4O21A 3MH3A 3FLSA 4ASZA 4P4CA 4QTBA 3HLLA 5HOAA 4FV7A 4MK0A 3LFFA 4AN2A 3C4CA 2WMAA 3LAUA 2XKFA 4Z9LA 4DFNA 5I9ZA 4OTPA 2XM8A 3S1HA 3FAAA 3MSSA 3O8TA 1FPUA 3ANQA 3MVLA 4CEIA 5CX9A 2BRMA 3BIZA 4RIYA 3CIKA 4RX7A 5IEXA 5CNNA 3MI9A 3VW8A 5FXQA 3QTUA 3F5PA 4MF0A 4XNEA 4AE6A 4AUAA 2EZCA 3OY3A 1WBOA 1BI8A 2P55A 3A61A 4D1ZA 4F9WA 2W1DA 3C0GA 3QFVA 2YDIA 4JT3A 4P2KA 4FVQA 4D2VA 4WHZA 5CAPA 4CLIA 3BU6A 3V5PA 5AR3A 4M15A 3QKKA 4NKAA 1UU8A 4YZNA 4JIAA 3VS2A 3JYAA 4N4SA 3NYXA 5HU9A 4D2TA 3W2CA 2QOOA 3QD3A 2G2HA 3JY0A 4IX4A 4DFLA 4PNIA 1NVQA 3UVPA 4FIFA 3GTOA 5K3YA 3R8ZA 2AUHA 4RIXB 3ROCA 4F9AA 2VRXA 3WF7A 3ZRKA 4E6DA 3UIUA 4USFA 2JIUA 2PVNA 1G3NA 3GCQA 2HOGA 5KMMA 1UNHA 5IA0A 5HTBA 3MVHA 4M97A 1VJYA 4V05A 2WD1A 5AP5A 2PL0A 5IH5A 2QCSA 3SC1A 4NCTA 3SOCA 1MP8A 4PDOA 2HIWA 2ACXA 4YBJA 2OZOA 3ORZA 5AP3A 3UC4A 5T68A 4C57A 4HCUA 2N3EA 3C51A 3II5A 3PA5A 4RMZA 1ZMUA 3G51A 4HPUE 5ETFA 5AR2A 2Y8OA 2ZB0A 3F3UA 4R3RA 1UNGA 3HDMA 4AP7A 5HCZA 4MCVA 2HWGA 5E8YA 1UU7A 4CFUA 1JKTA 3MBLA 4EOLA 3BU3A 4CEHA 3OS3A 1OPJA 3PY1A 2RG6A 5L2IA 1NVRA 5KBRA 3RK7A 4FSYA 3WZEA 5FTQA 5ANKA 4ANQA 2C5XA 3MY0A 4FT0A 4G3CA 2HZNA 4BF2A 3QTZA 4GVJA 3ZDUA 4D4VA 1M7QA 3VUGA 2C6MA 2UV2A 2VTNA 3PZHA 4NU1A 3WZKA 2EB2A 4QP3A 1OL2A 4XX9A 4FSZA 5IISA 4I0SA 1PYEA 4NTTA 1T6JA 3FZ1A 1IEPA 1YOLA 4J52A 3RAIA 4ANNA 4ANOA 4U80A 3VNTA 3DT1A 2ITZA 1K2PA 1J3HA 3KN5A 3PG3A 2P2IA 2P33A 3DTCA 3HV5A 4AOJA 3P86A 3TL8A 4DGNA 4GG7A 4DG2E 2I1MA 1P4FA 1BLXA 4F65A 1KV1A 1OZ1A 4G3EA 3LVPA 4F99A 2B55A 4I6QA 4JBVA 2PZ5A 5LARA 3P1AA 3ERKA 4C5UA 2X6EA 3IDBA 4FX3A 3WOWA 2DWBA 4NM3A 5AA9A 3G6GA 2WTVA 4BKYA 4NEUA 5HO6A 2ESMA 4MX9A 3ORMA 4JR3A 1OL1A 1YXXA 4ZTLA 2YM3A 3HP5A 4QPMA 4L52A 4GFMA 5TR6A 4C58A 5EYKA 2MP0A 3UO4A 1KV2A 4AZWA 5BUEA 5L8JA 4Y95A 5IEVA 3UO6A 4A7CA 4J8NA 5JH6A 4GU6A 5CT0A 2JIIA 3IDCA 4QNAA 4TW9A 2QLUA 2YWPA 2EXEA 3CKWA 2BRGA 2X0PA 2HWOA 1WMKA 3CKXA 3V6SA 5AV3A 3HMIA 3EQCA 4RWLA 4WNOA 2PVHA 3Q2MA 2GMXA 3DB6A 1O9UA 2YHVA 4IFCA 5EI8A 3BQCA 1XH6A 2QR8A 3AT3A 1JLUE 3LXNA 3QAME 4GSBA 1FOTA 2B4SB 4MF1A 3F7ZA 4EKKA 2A27A 4YC8A 3VRZA 2J0MB 4YHJA 2ITQA 4UXLA 4E1ZA 2RKUA 3EB0A 4D2WA 3EZAA 4I22A 2A69D 1YI3A 4W9WA 3F7WA 4AZSA 3PVBA 3DXNA 3NPCA 3KXZA 4KAOA 4BIDA 4FSNA 4GK4A 2PHKA 4V2RA 2WMBA 2XJ0A 3ZUTA 5CALA 2OSCA 3BHHA 3GCPA 4AGCA 5AP0A 5CF8A 2XJ1A 2R92A 3R6XA 5LWNA 1U5RA 4RIWB 1B6CB 3QUDA 3SAYA 4R3CA 3AQVA 1FMKA 2WEIA 4CT1A 2JKKA 4ZY4A 1SYKA 1I6VD 2ETRA 4OTGA 4A07A 3TNHA 1M7NA 4E4LA 3CGFA 3DDQA 4XP2A 2BE5D 1K9AA 2Y6OA 3LCSA 4F7JA 4RX5A 4RZWA 3PIYA 5A4CA 3DZQA 1PXIA 1F3MC 3FMMA 3UNZA 2QC6A 5F20A 4BCQA 2VZ6A 3ENHA 5AP1A 2WMUA 4D2PA 2W1FA 4EOJA 2QOQA 4YTCA 3BYOA 5GZ8A 2E9UA 1NY3A 1W2DA 3VAPA 2ERKA 3HRCA 1EZBA 2JDTA 3FI4A 2WMRA 4LRMA 4MAOA 5LJJA 5C8NA 5IEYA 2X81A 5FBOA 5DR9A 4X6QC 2W9ZB 2C6EA 1IR3A 3FJQE 3WIGA 4EZ5A 2GSFA 3LRDA 4IDTA 4L01A 5H3QA 5K4JA 2NRYA 1JOWB 3L9MA 3O50A 3QD4A 4YZCA 3C4WA 2W1CA 2NPQA 5D12A 1MQBA 3KRLA 2YABA 2NVXA 2FO0A 1STCE 4KWPA 1WZYA 2BDJA 4K11A 4WNMA 4IVDA 2PMNX 4FTNA 2G01A 3JUHA 4PTCA 5AV0A 4AX8A 4QQTA 2O2UA 2PVRA 5HTIA 5J7HA 2WXVA 2VN9A 3TKIA 3P4KA 2WMSA 3HV6A 4RA4A 2WB8A 3OMVA 3PSDA 4PWNA 2HK5A 5EW8A 3ACKA 1ZOHA 5CZHA 2VK9A 2O5KA 2A1AB 4PPAA 3AT4A 1JBPE 5FLFA 3D4QA 3PRIA 4G34A 3KY2A 2WHBA 3NIZA 4L7FA 5CF4A 2R4BA 2IO6A 4XJ0A 3P78A 4Z55A 3C5UA 2X8DA 4FV5A 3DKGA 2HY0A 4C36A 3FDNA 2ITOA 2YM8A 2C0IA 3EN4A 3GU4A 4L3PA 2UW5A 4UZHA 5HNGA 1H0VA 2HYYA 3TKUA 3BYVA 3GC8A 3ZEPA 3CEKA 3I7BA 2JDRA 5CVFA 4BDEA 3QHRA 5A4LA 1HCLA 4X3FC 4YLLA 3RAKA 4QMLA 4HVSA 5CEMA 3QTXA 2Z8CA 3VS7A 4BKJA 4EOOA 5JKGA 4V0GA 5J1WA 3VS5A 4QO9A 4YJUA 4I0RA 4EHVA 4QMNA 2OH0E 4K0YA 1PKDA 1GNGA 5HTCA 4JXFA 4FKPA 3BCEA 5E8TA 4ALWA 4IE9A 2A6HD 3TNWA 4D9UA 4PL4A 3SX9A 1BKXA 4YBKA 4FV6A 5FXRA 5KMJA 1Y8YA 3CCNA 4YURA 3C7QA 3VS4A 3DFAA 3EZRA 3OFMA 4PMSA 2AC3A 3UNJA 2YM5A 4NJDA 2UW0A 3Q9YA 3R02A 4F9YA 2OZAB 3NW7A 2UVYA 4PRJA 3OWLA 3GGFA 4X2GA 3L1SA 2JIVA 3OXTA 1UWJA 5EM6A 4EHEA 2OF4A 2FSOX 4MNFA 3EL7A 4BHZA 4CQGA 2GHMA 5BNJA 2W06A 4EBWA 5JGBA 3EYGA 3PG1A 5AV1A 4AZTA 3DQXA 5J5SA 4I5MA 3EMGA 1BL6A 3RTPA 4WRGA 3QRTA 3H30A 3QTRA 5FXSA 3HVCA 3R8LA 4AT4A 3ZFYA 1ZOEA 3ORKA 4E5BA 2BROA 4LOQA 3NUNA 2C6DA 4BCPA 4D0WA 3DA6A 4X21A 2OXXA 3E8EA 3BE9A 3LXLA 2O0UA 4PPCA 1QMZA 3G33A 5CWZA 4OTIA 4UMRA 1TWAA 3GNIB 4C3RA 3IECA 3SW7A 2FH9A 4QYEA 3AMAA 4X7QA 5HLNA 3PSCA 4HVGA 4D4SA 3KRJA 2X0GA 3ULZA 3CGOA 4OBOA 5AAFA 3HUCA 2JKOA 4XCUA 2GNLA 5M4UA 1SVGA 3IS5A 3PJCA 3MFTA 4LMNA 3PYYA 4UN0C 1R39A 3LQ8A 2O65A 3AC3A 4JBOA 2YIIA 2I0YA 3P0MA 3VO3A 4IAZA 4O0TA 3DTWA 4XUFA 5AAGA 2BZKB 4GG5A 3ZFXA 4J53A 3QLFA 3RWQA 4MXOA 4UMPA 4PP9A 1OKZA 4KKHA 3DNEA 3QCYA 3NX8A 3R1YA 1QPEA 4QMUA 3P23A 3RCDA 4JX3A 4GS6A 3ZLWA 4BC6A 4ASXA 3FHIA 1YOMA 2J0KA 4FUYA 3EN6A 2HXLA 3EN5A 3HA6A 3VQUA 4TWOA 3F69A 3WYXA 5FP6A 2XK8A 4DCEA 5CAOA 5TOZA 3L8SA 4HGTA 3ODYX 2Y9QA 1X8BA 1ZYRD 4AN9A 2K3OA 4QQCA 4IB0A 4MXCA 4NJ3A 3HA8A 4IIRA 4X6RA 5DT3A 5DOSA 5A46A 2F2UA 4PDSA 2A6ED 2R3JA 4IB5A 4TWNA 3I6UA 4G1WA 5DGZA 3UJGA 4R1YA 1XH8A 2BHEA 2C4GA 3HYHA 4XHKB 1Q97A 5TE0A 5AUUA 4O4EA 4TY1A 3Q4TA 1W27A 3ENMA 2XK3A 5CAVA 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