2X0QA

Co-complex structure of alcaligin biosynthesis protein c (alcc) with atp from bordetella bronchiseptica
Total Genus 209
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
209
sequence length
599
structure length
582
Chain Sequence
HPAEIVAHLQPEIWNKVNRLLVRKAISEYAHEWLLEPQRLGPGETPGFERFRLTLADGAQYDFDAQVMAMRHWRIPPESIVKTVAGVPAPLDALQFVIEIRDKLGLPVDRLPIYMDEITSTLHGSAYKHGRTTLGAAALARADYQTIETSMIEGHPSFVANNGRLGFDAEDYHGYAPEAATPVRLMWLAVHKDNAHFSCLSDMDYDSLMSEELGESAVTDFAARLREQGLHPADYYFMPAHPWQWFNKLSLAFAPYVAQRKIVCLGYGEEQYLAQQSIRTFFNISRPGKRYVKTSLSILNMGFMRGLSPYYMAGTPAINEYIHDLISADPWLRANGFRILREVASMGFRNYYYEAAIDTDTPYKKMFSALWRENPLTLIAPGQNLMTMAALLHVDPQGRALLPELIQASGLDAGTWLERYVDAYLTPLIHCFYAHDLVFMPHGENVILVIQDGVPVRAFMKDIAEESSILNPQVRLPQAAQRLAADVPEAYKLLTIFVDVFEGYFRHLTQILVETELMPEHDFWRLVAGRIAAYQQAHPQRLDKYRRYDLFAPDMIHSCLNRLQLANPNLPNPIACFRPSWL
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Co-Complex Structure of Alcaligin Biosynthesis Protein C (Alcc) with ATP from Bordetella Bronchiseptica
rcsb
molecule tags Biosynthetic protein
source organism Bordetella bronchiseptica
molecule keywords ALCALIGIN BIOSYNTHESIS PROTEIN
total genus 209
structure length 582
sequence length 599
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04183 IucA_IucC IucA / IucC family
A PF06276 FhuF Ferric iron reductase FhuF-like transporter
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.274.90 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Enzyme I; Chain A, domain 2 Enzyme I; Chain A, domain 2 2x0qA01
1.10.510.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 2x0qA04
2X0OA 2X0QA 2X0PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CEGA 5AP6A 2QKRA 3JVRA 3R1SA 4M12A 3TTJA 3DFCB 4B8MA 4D2VA 2PVMA 2QURA 3E88A 5EW8A 4YZNA 2X7GA 1V1KA 5LMAA 3ET7A 4DTKA 5BX0A 3O51A 1Z5MA 2OI4X 1LEZA 4F1MA 5AUXA 4JNWA 3POZA 4CFUA 2JA7A 3H9RA 4QP3A 1TQIA 3Q4ZA 3BGQA 2W17A 4J71A 4X2NA 3VNTA 3GBZA 5JZNA 3EKKA 4YO4A 2EB2A 3AGMA 3ZO3A 4BDIA 4EL9A 4V04A 2HZNA 4KIQA 4DN5A 3OY3A 4L7FA 3I60A 4AOIA 3BBWA 4CZUA 4PNKA 4GW8A 3VRZA 3DLSA 5AEPA 4LM5A 4R5SA 3OXZA 4IH8A 1H24A 4A9RA 3C4FA 4V0GB 3OEFX 2IW8A 2JDOA 5HCXA 4A4OA 2EU9A 4AA5A 1CKIA 1ZLTA 4EHGA 4ZY5A 4IB0A 3W8QA 4BGHA 4EH9A 3IDBA 4ITJA 3RPYA 2V22A 1XH5A 4QQCA 2ONLA 4TWOA 2C0OA 3TNHA 4EC9A 3II5A 1Q3DA 4DH7A 4ACGA 4FTKA 4APCA 2GS2A 2X8DA 4QP9A 5IMXA 4GFMA 2DUVA 3IW4A 4YSMA 4M97A 1H4LA 3QA0A 2BZIB 5KE0A 2C1BA 3B2WA 5EDQA 3R1NA 4L67A 3QGYA 4ENXA 3EQHA 5LJJA 2XM8A 4BCIA 4EHEA 3E5AA 3Q4UA 2YAAA 4FIFA 2OH4A 4GVAA 1J91A 2J0LA 4UYAA 4NW6A 5CSVA 2IN6A 4YHJA 2WZJA 3V5JA 1W27A 3FQHA 3HV4A 3EKNA 2GTMA 3E92A 5KMJA 1RDQE 3BRBA 3O8TA 4QQ5A 4FV6A 3UO5A 5C8MA 4ZSAA 3A4OX 4QTCA 3OCBA 4E4LA 5IH6A 4I6HA 1T46A 2V7OA 1JBPE 3CLYA 3JVSA 5GJDA 4RVTA 4FV3A 3I1AA 4IX3A 4AN3A 4ITIA 4AS0A 3AMBA 1MRYA 3VHEA 5FEDA 4EOIA 5AMNA 4DG3E 1OIUA 4FNZA 4WBOA 3DKCA 4M84A 1MQ4A 4KINA 4U43A 3C50A 3BV3A 3H4JA 4QMUA 4G9CA 5IZFA 3BEGA 3EWHA 5M57A 1OL7A 4RIXB 4D9TA 4L42A 4D0WA 4ZIMA 2VTMA 1YW2A 4U97A 3R8UA 5IMEA 2BRHA 4AXAA 2UUEA 3FZTA 2PWLA 2FO0A 1ZYRD 4Y72A 2RG6A 3HUBA 4O2PA 3FLZA 3UG2A 2H9VA 5A54A 2YM8A 4YTHA 3VWAA 4XH6A 1A9UA 3DTCA 3P08A 3W16A 3QAME 2PVLA 3GCVA 4L46A 4LL5A 4MNEB 3UNZA 3MV5A 4FT5A 3L9PA 4WNKA 2JGZA 4D0XA 2GS7A 4LGHA 3TKHA 3VUTA 3Q9YA 2GQGA 4GH2A 3ZRMA 4TL0A 2RG5A 4N70A 3WZDA 4ZS0A 3SC1A 5DBXA 3WF7A 5CF5A 2BAKA 2X1NA 3FSKA 3Q5IA 4O0SA 5EKOA 3W18A 2WEVA 1OECA 3AC8A 4RIWA 4YTIA 4EH6A 5C1QB 4BKJA 3FLNC 4FZ6A 3UMXA 4DGMA 5EYCA 2YDJA 4J96A 3A7HA 1BL6A 5L2QA 4M69A 5K3YA 5EYDA 3BEAA 5JMSA 4D55A 3P78A 4MWHA 3O71A 1ZXEA 1JKLA 4XV3A 4GIIA 4ZK5A 4FG8A 2XM9A 5BUJA 2CMWA 5DN3A 2YIIA 1I44A 4FRFA 4HVIA 2Z8CA 3BE2A 4R3RA 4J95A 3DAEA 3CGOA 4C58A 4DGLC 4OAVB 2VWIA 4AZTA 3W32A 4OW8A 3GU5A 4PTGA 4QMXA 3EYHA 2YCQA 2OIBA 5HVKA 1YVJA 2XIRA 4GVJA 2JIIA 4G6OA 4X2GA 2WQBA 4FKIA 1XH4A 4OTIA 4WT6A 2CGWA 4L45A 3LZBA 2W4OA 3B2TA 3CIKA 3C13A 4U3ZA 5CVGA 1UV5A 3FKIA 4FTUA 4ID7A 3RWQA 3GU6A 4QQJA 2A98A 4H1MA 4ZY6A 4BBEA 3COHA 4UEUA 3A4PA 5DRBA 4ERKA 4D1XA 4FYOA 4BI0A 3ORIA 3EN5A 4JIAA 3JYAA 1M2RA 3FC2A 2W1ZA 3I81A 3FLYA 3OT8A 3ZS5A 4ACCA 5EDRA 3ANRA 3FQEA 5M56A 4QMTA 2W7XA 3PP0A 1JOWB 2IEWA 3M1SA 3DU8A 5CTPA 2YJRA 1VR2A 2CGUA 3ULZA 3DBDA 3PA3A 4WNMA 3D9VA 4ANQA 1P5EA 1MUOA 5TE0A 2FB8A 4ZLYA 4FSRA 2RFEA 2W1EA 2OZAB 5IG1A 4IDVA 2YM3A 4O21A 3WYXA 2R0IA 3ROYA 1VYZA 4DFZE 4BWKA 1J1BA 5K9IA 5FG8A 2N1DB 4XHKB 4AOTA 4CZTA 3O2MA 4DH5A 2ZV7A 2ZB0A 4BGQA 4XLVA 1OKWA 3AQVA 4K8AA 1UWHA 2B4SB 4B6LA 3BGZA 5JEBA 5FP6A 4F6UA 4C7TA 4MBIA 4ANBA 2BIKB 4HYUA 5CENA 4CFFA 4H39A 5ANKA 1GAGA 3ENMA 3UYTA 3EN9A 1JNKA 2UW7A 4QPSA 4C3FA 5CXHA 2AC5A 3F82A 2C6MA 3EZBA 4Q5HA 5FTQA 3R9OA 3QHWA 2A6HD 1F5QA 3VUIA 4BKYA 3IW7A 1KE6A 3HDMA 3FUPA 5EM6A 3ZFYA 4F6WA 3KB7A 2VTRA 3FMNA 4GRBA 3QC4A 3CPBA 4IW0A 1TQMA 4FK3A 3P5KA 5AR7A 3CQEA 5CQWA 4N6YA 5CWZA 3LR8A 3UPZA 5DT0A 2E2IA 2WD1A 3PY1A 5LVMA 1DAWA 3HV6A 3D5WA 3F3TA 3KXZA 3ZTXA 3ITZA 3H0GA 3ZXZA 2X8IA 1Q5KA 3QXOA 2EVAA 1Q4LA 2XKFA 3D5VA 3IGOA 2ITQA 3MH1A 3NW6A 4FVPA 5JGDA 2OW3A 2IVTA 4PNIA 4KKGA 3LFAA 2A68D 2PHKA 1H01A 2FSMX 2ITPA 4HGSA 4KIPA 4M14A 4NFMA 5CU3A 4EOJA 3CGFA 2FSTX 3PVUA 4M0YA 4TYHB 2F9GA 2W96B 3OCTA 3QWJA 4TYIA 3NW5A 4HYHA 2RFSA 1H08A 2K3OA 3D83A 4KKEA 5D1JA 4CTBA 4ZJVA 4FZAB 1NXKA 2BAJA 4BFMA 5AP0A 2YIQA 2PVNA 3TNQB 3O8UA 3QTZA 3A99A 3GTMA 3ZO2A 2BR1A 2UV2A 4CMUA 2A27A 2PMIA 3PJ1A 4MQ2A 5EDPA 4QYYA 2J51A 2GHMA 2A19B 2UZLA 3NRMA 4YJNA 5ACKA 4A4XA 4BDKA 3D0EA 3WIKA 5HIBA 1JWHA 3FI3A 2C3LA 4HOKA 3CS9A 2YU9A 3MDYA 4Y83A 3VVHA 4G17A 5HESA 3THBA 3BGPA 3BCEA 3NWWA 3OS3A 2EZBA 3KN5A 1YI4A 4G3CA 3BU6A 3FZSA 2B1PA 1I50A 2YIRA 3OG7A 4Q9SA 3L8PA 1XBCA 2WMQA 3V8TA 1DI8A 3ZOSA 1WCCA 3NNWA 4Y46A 1M2PA 4EK5A 5CSPA 2VAGA 5EK7A 3GTOA 2VWVA 5DT4A 3FWQA 4GCJA 4LOOA 4DFXE 2E2HA 3TNIA 1NA7A 4AAAA 1PF8A 4Z55A 4AOJA 3SX9A 2UZUE 3RAHA 2OIDA 1W0XC 5IUHA 2W1CA 3IPHA 2OJFE 2VGPA 3KXMA 3W2RA 4QIWA 4E5BA 3KEXA 2GCDA 1KSWA 3BHVA 4NW5A 2WMAA 1PXLA 3QQJA 4FV4A 5E91A 4FSZA 1NVQA 4QMQA 3E87A 3RHXA 2QODA 5CT7A 3V3VA 1GJOA 2Y8OA 2VZ6A 3QL8A 3R6XA 5M4FA 1UNHA 4HYIA 2RSVA 2WQOA 3OMVA 3QA8A 4GU9A 4NWMA 3U4UA 3UIBA 4BI1A 2ITXA 4YJRA 3MI9A 2QR8A 2X4ZA 4MVFA 4BCPA 1F0QA 3VUMA 2IZTA 3QKMA 4P7EA 5CSXA 4CFMA 4UV0A 2NP8A 3TIYA 3ZFXA 5BMMA 2UW3A 4XCUA 3FI2A 4M3QA 1U54B 2C69A 2BFYA 3KKVA 5A4QA 2PZRA 3FBVA 3LM5A 5EG3A 5HOAA 3TN8A 4BTJA 4CRLA 3EQFA 4QRCA 2PMLX 5J87A 3E64A 4O0RA 4S2ZA 5CSWA 3WI6A 4DC2A 4JQEA 5J9ZA 2GU8A 3FZ1A 4UWBA 5E7RA 5I9ZA 2I0YA 3DBEA 4M8TA 1H07A 4G3DA 3R04A 1FMOE 1H0VA 3VUHA 2R7BA 2WQMA 3GQIA 3OBGA 3ZRKA 5EHOA 3NPCA 4A7CA 3EN7A 3LAUA 2CLQA 3F5UA 4Y5HA 4CT2A 3BYUA 3U4WA 1AD5A 1S9JA 5AUUA 2J0KA 1K2PA 2XKCA 4Y8DA 2X7OA 3ZUUA 5AUYA 2VTJA 5JKGA 2QU6A 2HY81 2CKEA 5EI2A 4ZJJA 4FI1A 4BYIA 4EZ3A 4YR8A 2O63A 3Q32A 5HZNA 4ZAUA 3LFSA 1BL7A 2P3GX 1VJYA 4G6LA 3DY7A 4QT1A 5AP7A 4BWXA 2B54A 4M67A 4PMMA 3QQFA 4BCNA 3AOXA 4PPCA 1REJA 2RGPA 4FZFB 5AUTA 3BKBA 5CVHA 3FV8A 3TG1A 3UP7A 4F9AA 5AR4A 2R64A 4FIHA 3NCZA 2QD9A 5AP4A 1XH6A 4RSSA 3GC8A 3UG1A 4CXAA 4WHZA 5TT7A 4OT5A 5FGKA 2MX9A 3GCUA 3Q4TA 4J97A 3HP2A 3ZHPC 2C4GA 1Q8ZA 2O64A 5CAPA 2Q0BA 3PVGA 4CQ5A 3IW5A 5AX3A 2J7TA 3QD3A 1KV1A 2UZBA 4F1OA 1PHKA 2HENA 1XH9A 2VTOA 3R1QA 4FEQA 4J53A 4K9YA 1ZOEA 5AP5A 2JEDA 2O65A 4QMLA 4X6RA 5FD2A 4FA2A 4AT3A 1PKDA 4WD5A 4TT7A 3MPAA 4NK9A 3OBJA 3FDNA 3HGKA 3GC9A 3VQUA 5AUZA 5HX8A 3MH2A 1E1XA 3LPBA 1W82A 3VS5A 4OAUC 4A9UA 4F7LA 4X3FC 3CKWA 1OKVA 2WQEA 3B8QA 4RQVA 5BVEA 5JRQA 2YEXA 5ETCA 4PTCA 3E8EA 1W7HA 2OU7A 3C1XA 4X3JA 4DGGA 5I9VA 3UOJA 5HNIX 5G1XA 4UXLA 2IZUA 2A6ED 2R3HA 3CY2A 3L8SA 3UO6A 3AMYA 3DJ5A 1UNLA 4BCFA 3BYVA 3O96A 4E1ZA 2WXVA 4IXPA 5E8VA 5HLPA 4GT3A 4JDHA 4E6DA 4CV8A 4QP6A 2ITNA 2JKKA 3TZMA 3NS9A 3OP5A 3R8PA 4Z7HA 2G01A 5DWRA 3MY5A 4D4SA 2C6KA 4MF0A 1YOJA 3VULA 1LUFA 4F4PA 1M2QA 4YSJA 1JLUE 1OITA 2X2LA 4I21A 3LVPA 3UQGA 5LCKA 2AYPA 3VF9A 5AR5A 3Q9WA 4EOSA 3KXXA 5BVWA 1J3HA 3WILA 4D5KA 2BRGA 4R7IA 4U7ZA 1PXNA 2PVKA 3FLQA 2YLFA 3F88A 3BHUA 2G9XA 4OBOA 2B7AA 3GTQA 2E9NA 2PVRA 4RC4A 3I7BA 4E6AA 4X3FA 4DG2E 2Z60A 1A06A 4FBXA 4O6LA 2R2PA 4C38A 4YLKA 3GEQA 4BIBA 3R63A 4BZOA 3TV4A 1SNXA 1PMVA 3IDCA 3BQCA 3EHAA 4UWYA 3MFTA 3MVLA 1QCFA 2PE2A 3EFWA 4FZDB 2KULA 4I94A 1YNJD 5DR6A 3H9FA 4O27B 3HV7A 4IAZA 1H1PA 3ALOA 3C0HA 4TNDA 4NSTA 3Q60A 5E8SA 4C4GA 5DA3A 4DFYA 2QLUA 4FSWA 2A0CX 4G34A 3ZSIA 4CYIA 4CKRA 5JFWA 3UZTA 1ZZLA 2X6DA 2A4LA 4ANSA 3LJ1A 3HA6A 3OOGA 3V6SA 4AF3A 3T8OA 4H3PA 5LMBA 1ZMUA 2IVVA 3QTIA 4EORA 3FI4A 3HL7A 4RZVA 4RC2A 3W55A 5LVNA 4CEIA 4IAKA 4J52A 4WUNA 2JC6A 2G2IA 4RJ3A 4RJ6A 5AP2A 3OVVA 5C9CA 5K5NA 1XR1A 2GNHA 3KRXA 1P4OA 3OW4A 4FODA 3IO7A 5EYKA 3NIEA 3O8PA 3BLRA 2ITWA 4O0UA 4WNPA 5HI2A 3LCOA 1IG1A 3WIGA 3R7VA 4CMOA 1YI3A 3NZ0A 3K3IA 2O5JD 1YOLA 3GGFA 4FYNA 5B7VA 3LE6A 2QOCA 1WVXA 2W1DA 1Y6AA 4E4NA 5H2UA 3FC1X 5AJQA 4RJ8A 4DGOA 4UN0C 5AR8A 4M68A 4G5JA 4YBJA 1Z9XA 4ACHA 2OF2A 4K18A 3PIYA 4DG0E 3GTLA 5IEYA 4EOKA 2RFNA 4ZSGA 2VTTA 2XNGA 3DQWA 3MJ2A 4E93A 2XK7A 3U44A 1Q41A 3QD4A 4RWKA 4RJ4A 4LG4A 3WE4A 2B9FA 3V5LA 4XNEA 2XH5A 2UZDA 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