2X7PA

The conserved candida albicans ca3427 gene product defines a new family of proteins exhibiting the generic periplasmic binding protein structural fold
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
306
structure length
306
Chain Sequence
LPTLKVAYIPEHFSTPLFFAQQQGYYKAHDLSIEFVKVPEGSGRLINLLNSNEVDIAIGLTEAFIADIAKGNENIHVLDTYVKSPLLWAVSTGSNRDDVTDAKQLKRIGVSRIGSGSYVMSFVLAHQLGVPSFDQFQVLSNFKNLRDSVNLKDGVEGSDAFMWEYFTSKKYYDNHEIKQIDQIYTPWSSWVVATSSDSLQAKSDVIKNFIDAVNQGIQYYNEHVDEAIEYISSNLDYSAEDAKEWTKTVEFNSRIGKTPLDWDTIVVKTKDTLKLAGVLAESDDVILKRLNSNVKKTNLQLDGDLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Conserved Candida Albicans Ca3427 Gene Product Defines a New Family of Proteins Exhibiting the Generic Periplasmic Binding Protein Structural Fold
pubmed doi rcsb
molecule keywords POSSIBLE THIAMINE BIOSYNTHESIS ENZYME
molecule tags Unknown function
source organism Candida albicans
total genus 107
structure length 306
sequence length 306
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF09084 NMT1 NMT1/THI5 like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2x7pA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2x7pA01
4F31B 3QSLA 3CFZA 2A5TA 1P1OA 2QSXA 4UACA 1SI1A 2IEEA 1B1HA 2RC7A 4YB7A 2XXWA 1JVYA 1FCKA 1HSJA 1EZOA 3C32A 3BBRA 3D4CA 4JDFA 2Z8EA 2ZMBA 4AB5A 5L9SA 2V93A 4YKIA 3HHFA 3FXUA 1QUKA 3JV9A 4G68C 5FHNA 3CFXA 4H5FA 1HSEA 1NNTA 4G8MA 2I4BA 3EHTA 3DP8A 2I6EA 1N04A 4XKNA 3ILUB 1PC3A 5B7DA 3LSWA 1FQBA 2D21A 4FE8A 3QIMA 3CI8A 4U1OA 5HM4B 5DVFA 4H67A 4P0IA 2XXYA 4G4PA 1Y3QA 3QAXA 5EYFA 2AIXA 3IOTA 2B3FA 1YCJA 2RKMA 3IR1A 1AMFA 5J1DA 3E13X 3M3FA 1B58A 3IJXB 2ZNSA 1B5IA 3W9WA 1MQJA 3TTNA 1M5BA 1MXZA 3K6WA 5ITOA 2V25A 3PPRA 3FGSA 1B32A 4QSEA 2AL4A 2OBGA 3RUMA 1USYE 1H76A 2ALUA 2QRYA 3G3GA 4RK2A 4QFLA 3R26A 2B3BA 1VR5A 1PDAA 1JW5A 1US4A 3TDJA 4LATA 4YB6A 2ZYNA 4GXAA 2DP8A 3U8QA 3PUYE 4ZEIA 4LZ5A 3SETA 4FAJA 3LC8A 4AB6A 4PE5B 4JWXA 1MY0A 3N6TA 3MPLA 1JETA 1Z7NE 3LR1A 1N3XA 1LB9A 3JYRA 1CE2A 1VE4A 1GGGA 1IXCA 3PUZE 4ONYA 5CC2A 4I62A 3GBBA 5AA2B 2O68A 3GBAA 1JW1A 5K2XA 2PX1A 5AA2A 2ESNA 2VGQA 2X7PA 2THIA 2QS4A 1MY4A 1B52A 4FECA 2F6PA 3O97A 2VD2A 5F7VA 5TP9B 3F11A 4DE8A 4JB7A 4R2BA 3H4ZA 1GV8A 5TP9A 4NF5A 2H99A 2PBWA 2FNCA 3FVKA 1YPNA 4YKPA 2XXIA 2XXUA 1PB7A 1IZ1A 3O9PA 3T9VA 2UYFA 3OO8A 3CFLA 3SERA 3K02A 3TZAA 1DTGA 3FZVA 1FQFA 4LZ7A 1BP5A 4LA9A 2Q8JA 3TCGA 3K4UA 4LP2B 2DOJA 4U4XA 3IK6B 5CMCA 5IKBA 5H8QB 4FEDA 1OMPA 2O69A 2QL3A 5K2YA 4ND9A 4F2OA 1ZTYA 1XVXA 1TT1A 4QFKA 5H8QA 2HXWA 4F3GA 1ELJA 4F18A 3TTLA 1EZ9A 1GVCA 3VLWA 4KFQA 1ZJLA 2XXQA 4E0WA 2LAOA 4WEPA 2I4CA 2ONRA 3K6VA 3OOAA 2QS2A 1LB8A 3T93B 1GTKA 2HEUA 2GRVA 4QHQA 1IXIA 4H6DA 3U94A 2XXTA 1MG1A 5ITPA 4OFJA 2V84A 3KSJA 2QPQA 2XD2A 4FEBA 1MQDA 1MQIA 1AOVA 1MXXA 1IQ7A 1T0KA 1B40A 1D9YA 3OELA 3QUFA 1B3HA 5CBSA 1NNKA 2O1LA 5CMBA 4G8NA 1B7HA 1LLSA 4U23A 4I8CA 5I56B 5AA3A 3QK6A 2OLBA 4R75A 3K01A 2RC8A 4ZEBA 4KYSA 4X48A 4RJZA 3EF7A 5BWJA 1YAEA 3I3VA 2VOZA 1LCTA 2H25A 1EU8A 4OENA 5FHOA 1ANFA 3USDA 2F7BA 4JBZA 5TPAB 1DSNA 4LQ2A 3RTWB 1B3EA 1PBPA 3H06B 4GIZA 1B7UA 3OSQA 1S50A 4F1VA 4ELRA 4XKRA 2Z22A 4IB2A 1M5EA 4GVOA 2HQ0A 2D5WA 3HN0A 3PMWA 2F7CA 3OO9A 4GFRA 3N5LA 1XC1A 3GLBA 4FATA 3MVYA 1MY3A 3Q26A 3KOSA 3G3JA 3R7XA 3QXMA 1LFHA 3N94A 3O29A 4C0RA 1DOTA 4OMBA 3K2DA 1QULA 2Q9TA 1B3GA 3KN3A 3H6TA 3OEKA 2H98A 3OENA 4GOTA 3IOVA 3FVNA 5F1QA 3PMVA 3K6XA 4U2RA 2DXYA 4OEVA 1B0LA 1URSA 1N7XA 2HFBA 1MY2A 4IO6A 3MWBA 1N3WA 3IO4A 3IB0A 4PFUA 1LAHE 1I6BA 4ZZAA 2F8DA 4MFIA 4GF8A 4TOZA 4QFOA 3HV1A 1Q35A 1LAGE 4TLMB 3ZKLA 4RNSA 2QS1A 4OESA 1FTKA 1F9BA 2ZYMA 3JZJA 4NTLA 1BKAA 1UIVA 3HHGA 3SEYA 1OIBA 1P1WA 1R9LA 2WKYA 5JTYB 3MC2A 2I58A 3EHSA 5FTHA 3BFTA 2RF1A 1KWHA 5JTYA 4N6PA 1PB8A 1SW1A 3QUJA 4KD5A 2ABHA 1VSOA 1IITA 2UVGA 3TKDA 3TFLA 1P99A 5ELVA 2D3IA 2VHAA 3VLUA 3ODBA 4KYDA 4DCXA 4LZ8A 3O66A 4NWDA 3HPIA 3ZSFA 4OXVA 3IORA 3IX1A 3FVOA 3C31A 3K1PA 1SBPA 1Y3PA 2V3TA 2F5XA 4X1DA 2DVCA 4EDPA 4ESWA 3VVFA 2H4IA 3O6GA 2REJA 3KJTA 2X7QA 2DQVA 5I2KB 1RYXA 4F22A 1B3FA 5CMKA 3S9NC 3R6UA 1D4NA 4K3FA 2YPNA 4R9FA 1BIYA 2Y7IA 1B6HA 1H3DA 3C35A 3M8UA 3IO6A 2NWJA 3CVGA 3A3CA 4YMBA 3OSRA 3TTRA 4X9TA 5KDTB 4G68B 1S7YA 3I6VA 4MBPA 3TMGA 3MPKA 5KDTA 1LAFE 3C4MA 4G68A 4IY6A 3PPNA 4LUBA 3C34A 3T9HB 2ONKE 5I2NB 4ELOA 3S9LC 5I2NA 1CB6A 4DZ1A 2DWJA 4IGRA 2E0SA 4EF2A 1A8FA 3VE1B 3TELA 2NXOA 4QFNA 3TQWA 3KSXA 3SEWA 1DMBA 4YKKA 4H1XA 3W15C 4XTCQ 2BJJX 4R2FA 1OVBA 3MBPA 1MY1A 2O1MA 3H7MA 3L6HA 4ZEDA 4R6YA 5HBCA 2FA7A 2HZLA 4M1VA 4RA1A 2NVUB 1ZBMA 3K1MA 1B5HA 4EQ9A 4HS7A 4GXSB 1MPCA 1N0TA 2F35A 3O28A 4R74A 3TCFA 5HPQA 2RCAA 4LONB 3I5OA 2UVHA 4OETA 3W9VA 4EUOA 1SDXA 4R73A 4IO4A 3B6TA 3KG2A 3MJNA 5FHMA 3T66A 1MXUA 3RY3A 4POXA 3OMBA 3S9MC 2UVIA 4BDOA 1MPDA 3O2AA 2GHAA 3KFMA 4QRZA 3UK4A 1UTHB 4FORA 4NWCA 5L8DA 3TODA 1YTVA 2QMWA 1II5A 2P1SA 1LSTA 1UTHA 5H8HB 4KHZE 1O7TA 4OVJA 2UVJA 4BDNA 4QSCA 3DP4A 2DVZA 3OXNA 4IO5A 3AXFA 1Z7ME 4NEDA 3CG3A 1MXYA 5M2VA 4YICA 3TYHA 3THIA 1B4HA 1H43A 2I49A 1M5DA 4WXJA 1VFDA 1TXFA 5ICTA 3PPQA 1NMUA 4Z7EA 3LUYA 4WKMA 3EN3A 2DWAA 2R9JA 5I57B 2O51A 4C1TA 2B65A 3V89B 3SDFA 3VLVA 1Y1ZA 1AIVA 3TQLA 1LFGA 4YZZA 4ELQA 1MXWA 2Z8DA 2DWHA 2V3QA 1B3LA 1FQCA 4RXLA 5DTBA 3ECRA 1XVYA 3M3LA 3IOWA 4KR5A 1MXVA 1O63A 3A09A 3VVEA 1BLFA 3LSLA 4JSDA 2I3VA 3S2VA 3PMXA 3TUSA 4YU0A 3KEIA 1FTMA 2RCBA 3H3GA 4OHNA 3H6VA 1SI0A 4KI0E 5CI5A 1Y9UA 2XXRA 3C33A 1LFIA 2O6AA 1URGA 4U1ZA 4TQUQ 1LAXA 1OVTA 5EHSA 2Q89A 2F7AA 4EXKA 4H5GA 1HSLA 2UYEA 3VDFA 4PP0A 4F3SA 3D4GA 1MM6A 5L9MA 1FTJA 3RQTA 1D3KA 3GXAA 3FIRA 2OK2A 2F6GA 2O84X 4H8IA 5I56A 4ELPA 4RK9A 4YKJA 4GQOA 4OWDA 5H8NB 1SW5A 1AH5A 1USYH 4KCDA 1MM7A 1A40A 4RPNA 4P0GA 3IJOB 4QSDA 2I0CA 4UA8A 1M5CA 1FQEA 4RPOA 2Y7PA 4IO3A 2W7YA 1OLAA 1Y3NA 2CZLA 3FJGA 2QS3A 2M8CA 3UORA 4X1BA 1N84A 5CRYA 5TPAA 2ANJA 3MP6A 1H45A 1MQGA 1B1XA 1A55A 4KYEA 4H0WA 1L5TA 4DXCA 4BDLA 3RPWA 3TEPA 2ONSA 1FTOA 1NKXA 3U92A 1D9VA 2Y7WA 4RYAA 1BTJA 1LBBA 2A5SA 5ICQA 3MVXA 1MRPA 2PT2A 3MVZA 4LVQA 3WAFA 3CG1A 1B4ZA 3KN7A 4XKQA 3DELB 3FASA 4ZEKA 2DWIA 4DXBA 3KOTA 3TTKA 4DDDA 4DCYA 1IXGA 1NNFA 4GD5A 1ZU0A 3QYTA 3KJ7A 2IA4A 2X26A 1PEBA 3K1NA 2ZYOA 1ATGA 2HAUA 2XD3A 3FUZA 4Q5TA 2CMOA 2DSFA 1JQFA 3UIFA 3WAEA 4IO2A 2F34A 1I6QA 1Y20A 4GLIA 5B70A 2I3WA 4OERA 2HAVA 3ZKKA 3IAZA 2OWTA 3BFUA 2YLNA 4R6KA 5CMMA 3OD7A 3MUQA 5DVJA 3H6WA 5KZTA 4THIA 1IEJA 1MH4A 2ZNUA 1MDP1 3B6WA 3U72A 3Q29A 1QUIA 1SVXB 4R72A 3V8XB 3CRBA 4ZEFA 4Q30B 5KCJB 2Q2AA 4F1YA 3EPEA 3E9XA 2QJEA 4R9GA 3PV0E 2XXPA 4PETA 4F2QA 3KGCA 5KCJA 1FQAA 2I48A 2GHBA 1NFTA 3U1OA 1WVJA 3CIJA 4WEDA 4OFLA 3PD9A 2GH9A 3DP6A 5I84A 4GRKA 4DIGA 3IOUA 1LBCA 1IUDA 4N07A 1LGBC 2GFEA 1N7WA 4NMYA 3RT8A 2UXAA 4Q0CA 2PT1A 1FTLA 4ZE9A 3RN8A 1MDQA 3MP1A 5I2KA 1B05A 3E4RA 1TFDA 2XHDA 1MS7A 3FXQA 3SKPA 3EQ1A 2DE2A 3V83A 1A99A 2Y84A 4NF6B 3MZ9A 4M4GA 4L17A 1SYIA 1URDA 3RNNA 3O6HA 2YJPA 5DVIA 1NNPA 4NF6A 2H9BA 3G3KA 2E1SA 4ZECA 1OLCA 1MH3A 3RLFE 4Q8RA 2OWSA 2G93A 1LCFA 5BUUA 1EZPA 4MF3A 2FYIA 2AYSA 1QKAA 1I6AA 3VXCA 2AL5A 3MQ9A 3L6GA 1WODA 4FIMA 2Z8FA 3Q28A 5L9OA 1QW0A 4PFYA 4PFTA 3SEUA 1US5A 2HCAA 4ZS9A 4QFPA 4ZE8A 2XX8A 3EHUA 3FV2A 2XXVA 1FW0A 1JW4A 3HCQA 4U21A 1OQHA 2NUVA 1QUJA 5IAIA 3C9HA 4O3BA 1JVXA 1B7ZA 3K0VA 4E0XA 5H8FB 2VP1A 4ESXA 1GR2A 1B2HA 4F3BA 1O64A 2ZXTA 1P1QA 5H8FA 1I69A 5EHMA 4F1UA 2O7UA 2F78A 4LQ5A 2RC9A 2I0BA 1EH3A 3HO7A 4HCYA 3FATA 1R1NA 1RYOA 1JEUA 1SQYA 4JWOA 5H8HA 3FV1A 4RY1A 4JSOA 2HZKA 4GWOA 4C1UA 2REGA 1NL5A 4HCWA 4H8JA 3P7IA 2VD3A 5AA4B 3LSXA 4XXUA 2O7IA 4NF5B 3S4UA 5AA1A 4DLDA 3K00A 5AA4A 3T9UA 4O3CA 1ZLQA 3BKIB 1PBQA 2DE4A 1AL3A 1R9QA 4KQPA 1IIWA 5I57A 4NF8B 2Y7KA 3PUXE 1OQGA 3CR9A 3IB1A 3B7DA 3G3IA 4MLQA 4F29A 4EQBA 3Q25A 4NF8A 3FJ7A 2H5YA 4P11A 3TAJA 4NF4B 1A54A 2NOOA 2P2AA 3C36A 2PYYA 1RKMA 4XKPA 2Q88A 3MZ1A 4NF4A 3VVDA 4MLVA 3CSGA 1DPEA 3PGFA 3V5AA 3LSFB 3G3HA 4G8HA 3DLNA 1WDNA 2OJTA 3MAMA 4ISUA 1Y4CA 3M3KA 4MH5A 2XXHA 1B51A 4ZZEA 1SD3A 1XOCA 4NE4A 2OZZA 3HSTA 3MVWA 2XXXA 3G7WA 4ZDMA 1S9TA 3H03A 2ZNTA 2V3UA 1B5JA 3KBRA 2DYXA 4OEUA 1B46A 1QJMA 3UN6A 2XX7A 5TU0A 4IY5A 1JNFA 3LBSA 3DM0A 3RGYA 4PFWA 4BDRA 1P1NA 1Q1KA 2Q2CA 5CBRA 1P1UA 3PPOA 3MW0A 5ISUA 3TCHA 4R6HA 5H8NA 3ILTB 3FJMA 3PPPA 3KZGA 5JK4A 2PMSA 4U4SA 5CM6A 1QVSA 3CSBA 2KLFA 4YB5A 3Q27A 4TLLB 4BDQA 4OFOA 5DYHA 1A7LA 3PUWE 1DTZA 1NH8A 1J1NA 1TFAA 1B9JA 1MQHA 1JEVA 5I58B 3OO6A 1UIUA 2F97A 3SESA 1N76A 4GL0A 2ZYKA 5DT6A 5I58A 3ZS6A 4KCCA 4EQ7A 5H8SA 1XS5A 4DXUA 3ONMA 4YAHX 1XT8A 4N13A 3UGWA 1SW4A 3MP8A 4XIGQ 4JWYA 1Y1MA 2Z23A 4OYVA 3H6UA 4QF9A 3VV5A 1UQWA 4HTGA 2P0SA 4EXLA 3A3UA 2QMXA 1UTBB 3SEVA 3PU5A 4IO7A 1R6ZA 1UTBA 4FJPA 1ZMGA 4BLAA 1H44A 3TTMA 5A5XB 1Y4TA 3UA8A 4O3AA 3FD3A 5AE4A 1MPBA 1VFEA 3PUVE 4OZ9A 1DPPA 1SW2A 1ZKBA 4EF1A 5A5XA 4PQJA 3T9XB 1B0HA 4AQ4A 5DEXB 3OO7A 2F36A 2PVUA 4I9DA 2G29A 3U93A 1NH7A 3N26A 3IL1B 5DEXA 1PB9A 1A8EA 1TWYA 3IB2A 3T96B 4H65A 4JXIA 1XHYA 3S9EA 3SEXA 3RTFB 2DE3A 4HW8A 3PD8A 2RINA 5AA2D 3KN8A 3VFJA 1IXHA 1QKBA 4I1DA 2DS9A 3N6UA 4ECFA 1FQDA 4GL8A 3VXBA 3E3KA 3K6UA 1SYHA 3B6QA 2R71A 1M5FA 5FTIA 3FXRA 4Z0IA 3TPAA 1POY1 4KPTA 5JEIA 3MZBA 4BDMA 2XX9A 3G3FA 3T22A 1ZIUA 3RT6B 3UP9A 4U22A 2DXRA 4G2ZA 4YMAA 4F39A 4F3PA 3FVGA 3O6IA 1POTA 3GZGA 5I59B 2R6GE 2OCUA 5LOMA 5I59A 4POWA 2Y7RA 2A5TB 4IGTA 4G77A 4F19A 4OQOA 3OEMA 4OTEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4F31 B;  3QSL A;  3CFZ A;  2A5T A;  1P1O A;  2QSX A;  4UAC A;  1SI1 A;  2IEE A;  3QMF A;  1B1H A;  2RC7 A;  4YB7 A;  2XXW A;  1JVY A;  1FCK A;  1HSJ A;  1EZO A;  3C32 A;  3BBR A;  3D4C A;  4JDF A;  2Z8E A;  2ZMB A;  4AB5 A;  5L9S A;  2V93 A;  4YKI A;  3HHF A;  3FXU A;  1QUK A;  3JV9 A;  4G68 C;  5FHN A;  3CFX A;  4H5F A;  1HSE A;  1NNT A;  4G8M A;  2I4B A;  4HXV A;  3EHT A;  2Q8M A;  2WBD A;  3DP8 A;  2I6E A;  1N04 A;  4XKN A;  3ILU B;  1PC3 A;  5B7D A;  1FRP A;  3LSW A;  1FQB A;  2D21 A;  4FE8 A;  3QIM A;  3CI8 A;  4U1O A;  5HM4 B;  5DVF A;  4H67 A;  4P0I A;  4MX6 A;  2BJI A;  2XXY A;  4G4P A;  1Y3Q A;  3QAX A;  5EYF A;  2AIX A;  3IOT A;  4QBA A;  2B3F A;  1YCJ A;  2RKM A;  3IR1 A;  4JVD A;  1AMF A;  4NF0 A;  5J1D A;  3E13 X;  3M3F A;  1B58 A;  3IJX B;  3B50 A;  2ZNS A;  1B5I A;  3W9W A;  1MQJ A;  1IMF A;  3TTN A;  1M5B A;  1MXZ A;  4MJO A;  3K6W A;  5ITO A;  2V25 A;  4PTK A;  3PPR A;  3FGS A;  1B32 A;  4QSE A;  2AL4 A;  5IGA A;  2R8T A;  4OVT A;  1FPF A;  2OBG A;  3RUM A;  1USY E;  1H76 A; 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