2X9MA

Hendra virus attachment glycoprotein
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
419
structure length
419
Chain Sequence
PNQICLQKTTSTILKPRLISYTLPINTREGVCITDPLLAVDNGFFAYSHLEKIGSCTRGIAKQRIIGVGEVLDRGDKVPSMFMTNVWTPPNPSTIHHCSSTYHEDFYYTLCAVSHVGDPILNSTSWTESLSLIRLAVRPKSDSGDYNQKYIAITKVERGKYDKVMPYGPSGIKQGDTLYFPAVGFLPRTEFQYNDSNCPIIHCKYSKAENCRLSMGVNSKSHYILRSGLLKYNLSLGGDIILQFIEIADNRLTIGSPSKIYNSLGQPVFYQASYSWDTMIKLGDVDTVDPLRVQWRNNSVISRPGQSQCPRFNVCPEVCWEGTYNDAFLIDRLNWVSAGVYLNSNQTAENPVFAVFKDNEILYQVPLAEDDTNAQKTITDCFLLENVIWCISLVEIYDTGDSVIRPKLFAVKIPAQCSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Viral protein
molecule keywords GLYCOPROTEIN G
publication title Dimeric Architecture of the Hendra Virus Attachment Glycoprotein: Evidence for a Conserved Mode of Assembly.
pubmed doi rcsb
source organism Hendra virus
total genus 103
structure length 419
sequence length 419
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2x9mA00
5F9TA 4K3YA 4NC5A 1MS9A 1Z4YA 2VK6A 1INGA 4GB1A 2HU0A 1NSDA 2HTVA 4GZQA 4XJAA 3H71A 3JU4A 1MS1A 2HTYA 2SLIA 1BJIA 4MJUA 4K1JA 4GZWA 4FPLA 1SO7A 4MX0A 4HIZA 4FOYA 2A75A 1B9TA 1NSBA 3O9JA 3D11A 1V3EA 1S0JA 3B7EA 2XZIA 4YZ4A 1F8EA 4MJVA 2QWAA 3ALXA 4FP2A 4FPHA 3INBA 4J9TA 2W38A 4GZXA 4FOVA 1DILA 1L7FA 4FPJA 2QWBA 3NN9A 1WCQA 2HT8A 4MWQA 1IVDA 1B9VA 2HTQA 1EURA 5HUKA 1IVFA 4M4VA 1MS4A 4X49A 1N1YA 1NCAN 5HX0A 4WA3A 2QWHA 1V0EA 4CPOA 3B69A 4FQ4A 4XJRA 1MS8A 1EUUA 1Z50A 3A72A 2VW2A 2FHRA 1WCSA 1F8DA 4CPNA 2ZB5A 4MWVA 3SALA 4KS5A 4GZSA 2VSKA 2C4AA 1Z4VA 5B2DA 6NN9A 4X6KA 1SNTA 5JYYA 1INHA 4NN9A 4XOGA 2SIMA 1L7HA 5HUNA 5NN9A 4B7JA 1W21A 1Z4WA 1L7GA 2F0ZA 3TIBA 4K1KA 3H72A 4YZ5A 1EUTA 4K1IA 1SLIA 1N1TA 4FPFA 4XYXA 3W09A 1NSCA 4MWLA 3O9KA 4B7RA 3CKZA 1NMBN 4MWWA 4H53A 2F12A 5HUGA 4QN7A 4MWYA 1A4QA 4BBWA 2SILA 2BERA 2F25A 4MZAA 1E8VA 1DIMA 4XE9A 1F8CA 4XMIA 2YA7A 1Z4ZA 2F24A 2BATA 1N1SA 4MWUA 4M4UA 2RKCA 2AH2A 2F13A 1N1VA 4B7MA 1INYA 3K36A 4FVKA 2YA4A 4FPYA 4MWJA 2HTWA 1EUSA 1B9SA 4X4AA 3TI8A 4XJQA 2QWCA 5M1ZA 3CL0A 4D8SA 2YA5A 4XILA 4YW4A 1INVA 2VW0A 3GVLA 4FOWA 4XJUA 4XJ8A 4M4NA 2YA6A 4GZOA 1E8TA 4B7QA 4KS4A 1NMAN 2X9MA 1F8BA 2VW1A 4CPLA 1MS0A 4XJZA 1IVEA 4WA4A 3TI6A 1INWA 4YW1A 2QWIA 2AGSA 3TI5A 4Q6KA 1XOEA 4FPCA 4KS2A 2QWEA 4HZWA 1USXA 1MWEA 1A14N 7NN9A 4HZVA 4M3MA 4XHBA 4WA5A 1INXA 3D12A 4CPZA 3PJQA 1USRA 4HZXA 1VCUA 1W8NA 2QWGA 4XHXA 1IVGA 2F10A 4I00A 2XZKA 1XOGA 4YW5A 1VCJA 4GZTA 1V0FA 3A71A 4B7NA 1NNAA 1KITA 1NNBA 2F28A 2AEPA 1A4GA 2QWKA 2W20A 1MZ6A 4DGRA 1W1XA 2JKBA 4X47A 2F29A 3CL2A 3K38A 2BF6A 4FPKA 5B2CA 3K39A 1W8OA 4HZZA 4XIOA 4WEGA 3K3AA 4XJ9A 2C4LA 4YZ3A 4FPOB 2HT5A 3H73A 4GDIA 2HTRA 4XMAA 4GJTA 1INFA 4CPMA 2W5OA 3SANA 4MZEA 2BZDA 1MS3A 2YDPA 4HZYA 4MWXA 4QNPA 2QWJA 1NNCA 4FZHA 1SLLA 3TIAA 4YZ2A 2QWDA 3SILA 2ZB6A 4YZ1A 2HU4A 4SLIA 2AEQA 3GVKA 4QN3A 4H52A 1MS5A 4KS3A 3NSSA 4FJ6A 3GVJA 3SLIA 1MR5A 1Z4XA 2VK7A 1V3BA 1E8UA 2F27A 4XIKA 2VK5A 3TICA 1W0OA 2W5NA 4FP3A 4FPGA 2XCYA 4QN6A 4K1HA 1V3DA 1NCDN 4CPYA 4FOQA 3K37A 2B8HA 2F11A 4UF7A 5HUMA 2YDTA 4XJWA 1NMCA 1W0PA 3TI4A 1IVCA 2VWDA 2F26A 1NCCN 2CMLA 4MC7A 3OPZA 2VVZA 4GEZA 3T1EA 2VSMA 3ALWA 1NN2A 4FPEA 3BEQA 4QN5A 4GDJA 3H6JA 3TI3A 4JF7A 1IVBA 2HT7A 2YA8A 4KS1A 4YW3A 4YW2A 1V2IA 4WEFA 4NCSA 2QWFA 1S0IA 1V0ZA 4QN4A 1NCBN 4MWRA 3CYEA 1V3CA 1MZ5A 2HTUA 2XZJA 4GZPA 1W20A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5F9TA 4K3YA 4NC5A 3WWAA 5D9BA 1MS9A 4XMBA 1Z4YA 2VK6A 1INGA 4GB1A 2HU0A 1NSDA 3DR2A 2HTVA 4GZQA 4XJAA 3H71A 3JU4A 1MS1A 2HTYA 2SLIA 1BJIA 4MJUA 4CH9A 4O5TA 4K1JA 4GZWA 4UOUA 3E5ZA 4DG6A 4FPLA 1SO7A 4MX0A 4A0PA 1QLGA 4HIZA 4PWZA 4FOYA 2A75A 1B9TA 1NSBA 3O9JA 3D11A 1V04A 1V3EA 2ZWAA 1S0JA 3B7EA 4N1BA 2XZIA 4YZ4A 1F8EA 4MJVA 3TC9A 2QWAA 3ALXA 4FP2A 1ZGKA 4ZY3A 4FPHA 3INBA 4J9TA 2W38A 4GZXA 4FOVA 1DILA 1L7FA 4L7BA 4FPJA 2QWBA 3NN9A 1WCQA 2HT8A 4MWQA 1IVDA 1B9VA 2HTQA 1EURA 5HUKA 4ZGCA 1IVFA 3WDZA 4M4VA 1MS4A 1RWLA 1E1AA 1N1YA 1NCAN 4X49A 3WN7A 5HX0A 4WA3A 2IAXA 2QWHA 1V0EA 2GVUA 4CPOA 3B69A 4FQ4A 4XJRA 1MS8A 2H2UA 2ZW9A 1EUUA 1Z50A 4D4UA 3A72A 5GX3A 2VW2A 3UC1A 3LI3A 2FHRA 2GHSA 1WCSA 4IFNX 1F8DA 4CPNA 3LI5A 2ZB5A 4MWVA 3SALA 4KS5A 4ASCA 4GZSA 2VSKA 3II7A 2C4AA 1Z4VA 3DASA 5B2DA 4GN9A 6NN9A 3U0SA 4Q1UA 4X6KA 3P5BL 5H47A 5D9CA 1SNTA 5JYYA 1INHA 5GX1A 4NN9A 4XOGA 2SIMA 1L7HA 5HUNA 2FP9A 2WOZA 4GNAA 1X2JA 5NN9A 4B7JA 1W21A 1Z4WA 1L7GA 4IQKA 2F0ZA 4R40A 3TIBA 2IAPA 4K1KA 3H72A 1PJXA 4YZ5A 1SUUA 1EUTA 2FPBA 2DG0A 1SLIA 4K1IA 1N1TA 4FPFA 4XYXA 3W09A 1NSCA 3NO0A 3KGGA 4MWLA 3O9KA 4B7RA 3CKZA 2IATA 1NMBN 4MWWA 4H53A 2F12A 5HUGA 3FW0A 4QN7A 4MWYA 1A4QA 4BBWA 2GVVA 2SILA 2BERA 5FNSA 3V1SA 3VNHA 1Q7FA 2F25A 4MZAA 1IUCA 1E8VA 1DIMA 2FLUX 1C9UA 4XE9A 1H6LA 3SOVA 3A9HA 1F8CA 3SOBB 4C1YA 4XMIA 2YA7A 2IVZA 1Z4ZA 2F24A 2BATA 1N1SA 3AMSA 4MWUA 4M4UA 2RKCA 2AH2A 1CQ1A 2F13A 1N1VA 4B7MA 1INYA 3K36A 3WW9A 4FVKA 2YA4A 4FPYA 4IFJA 2IAVA 1OFZA 1QBIA 4MWJA 2HTWA 1EUSA 1B9SA 1ZI0A 4GNBA 3HRPA 4CSDA 4AH4A 5EO8A 1IJQA 4X4AA 3V64C 3L6VA 3TI8A 4XJQA 2H2NA 4CHBA 2QWCA 1U6DX 4GN7A 3ZGDA 4JMLA 5M1ZA 3CL0A 3FVZA 5EO7A 4D8SA 2YA5A 1IUBA 4XILA 4YW4A 1INVA 2VW0A 3GVLA 4FOWA 4XJUA 4XJ8A 4M4NA 2YA6A 4GZOA 1E8TA 4AHAA 4B7QA 4KS4A 1NMAN 1K32A 2X9MA 1F8BA 3HLHA 5FZJA 3KYAA 2VW1A 4CPLA 1MS0A 2DSOA 1CRUA 1C5KA 3IAXA 4XJZA 1IVEA 4WA4A 2DYHA 3TI6A 1INWA 4YW1A 2QWIA 2AGSA 3TI5A 4HW6A 4Q6KA 1XOEA 2G8SA 4AGTA 4C1YB 4FPCA 4KS2A 2QWEA 4HZWA 5EX7A 5FNQA 1USXA 2W8BA 1MWEA 4GNCA 5D9DA 3SRGA 3AMRA 1A14N 3ZGCA 1N6DA 7NN9A 2IAWA 4HZVA 5FZNA 5FWWA 2OJHA 4M3MA 5GX5A 4XHBA 4WA5A 1INXA 3D12A 4CPZA 3PJQA 2P4OA 1USRA 4HZXA 4IN4A 1VCUA 1W8NA 2HQSA 2QWGA 2FP8A 3Q6TA 4XHXA 4HHQA 4YY8A 1IVGA 2F10A 4I00A 2ISMA 1CVMA 2IASA 2XZKA 3S94A 3LI4A 1S18A 3HLIA 1XOGA 4O5SA 4YW5A 2POOA 1VCJA 3A71A 1V0FA 4GZTA 4B7NA 1NNAA 1KITA 2XN4A 1NNBA 2F28A 2AEPA 3Q6PA 4IMBA 4IYGA 1WP5A 1A4GA 2QWKA 2W20A 3G4EA 2VPJA 2QE8A 2IARA 5GX4A 1MZ6A 1N6EA 1W1XA 2JKBA 4DGRA 4X47A 4AGIA 2F29A 1N6FA 3CL2A 3K38A 2BF6A 2GVWA 4FPKA 2IAQA 4L7DA 1POOA 3V65B 5B2CA 3K39A 1W8OA 1X2RA 4HZZA 4D52C 4GN8A 4XIOA 4WEGA 3K3AA 4XJ9A 2C4LA 4YZ3A 3I1CA 4FPOB 2HT5A 3H73A 4HHOA 4GDIA 2HTRA 4XMAA 5GX2A 4GJTA 1INFA 4CPMA 2W5OA 3O4PA 3SOQA 3ADEA 3SANA 4D52A 3Q6KA 3S8ZA 4MZEA 2BZDA 1MS3A 1N7DA 2YDPA 4HZYA 4MWXA 4QNPA 2QWJA 2V91A 1NNCA 4FZHA 5FNRA 1SLLA 3TIAA 4YZ2A 2QWDA 4IFLX 2ZB6A 3SILA 5FNUA 4YZ1A 3VNGA 2HU4A 3A9GA 4SLIA 2AEQA 3GVKA 4QN3A 4H52A 1MS5A 4ZLRA 4KS3A 3NSSA 4FJ6A 1S1DA 3GVJA 3SLIA 3G4HA 1MR5A 1CRZA 1Z4XA 2VAQA 2VK7A 1V3BA 3SREA 1E8UA 2F27A 4XIKA 2VK5A 3TICA 1W0OA 2W5NA 4FP3A 2IAUA 4G3NA 4FPGA 2XCYA 4QN6A 4K1HA 1V3DA 1NCDN 2FPCA 2IAOA 5CGJA 4CPYA 4D52B 4FOQA 3K37A 2B8HA 2F11A 3BYCA 4UF7A 5HUMA 5F72C 2YDTA 4XJWA 1NMCA 3S2KA 1W0PA 3TI4A 1NPEA 1RWIA 1IVCA 2VWDA 2F26A 1NCCN 2CMLA 4MC7A 2GVXA 3OPZA 2VVZA 4GEZA 5GTQA 3T1EA 2VSMA 3ALWA 1NN2A 4FPEA 3BEQA 4QN5A 4GDJA 2DG1A 2ZZKA 3H6JA 3TI3A 4JF7A 2Z32A 1IVBA 2HT7A 2YA8A 4KS1A 4YW3A 4YW2A 1V2IA 4WEFA 4NCSA 2QWFA 1S0IA 1V0ZA 3S8VA 5FNTA 4QN4A 1NCBN 4MWRA 4L7CA 3CYEA 1V3CA 1MZ5A 2HTUA 2XZJA 2W8BB 4GZPA 1W20A
chains in the Genus database with same CATH topology
5F9TA 4K3YA 4NC5A 1MS9A 1Z4YA 2VK6A 1INGA 4GB1A 2HU0A 1NSDA 2HTVA 4GZQA 4XJAA 3H71A 3JU4A 1MS1A 2HTYA 2SLIA 1BJIA 4MJUA 4K1JA 4GZWA 4FPLA 1SO7A 4MX0A 4HIZA 4FOYA 2A75A 1B9TA 1NSBA 3O9JA 3D11A 1V3EA 1S0JA 3B7EA 2XZIA 4YZ4A 1F8EA 4MJVA 2QWAA 3ALXA 4FP2A 4FPHA 3INBA 4J9TA 2W38A 4GZXA 4FOVA 1DILA 1L7FA 4FPJA 2QWBA 3NN9A 1WCQA 2HT8A 4MWQA 1IVDA 1B9VA 2HTQA 1EURA 5HUKA 1IVFA 4M4VA 1MS4A 4X49A 1N1YA 1NCAN 5HX0A 4WA3A 2QWHA 1V0EA 4CPOA 3B69A 4FQ4A 4XJRA 1MS8A 2H2UA 1EUUA 1Z50A 3A72A 2VW2A 2FHRA 1WCSA 1F8DA 4CPNA 2ZB5A 4MWVA 3SALA 4KS5A 4GZSA 2VSKA 2C4AA 1Z4VA 5B2DA 6NN9A 4X6KA 1SNTA 5JYYA 1INHA 4NN9A 4XOGA 2SIMA 1L7HA 5HUNA 5NN9A 4B7JA 1W21A 1Z4WA 1L7GA 2F0ZA 3TIBA 4K1KA 3H72A 4YZ5A 1EUTA 4K1IA 1SLIA 1N1TA 4FPFA 4XYXA 3W09A 1NSCA 4MWLA 3O9KA 4B7RA 3CKZA 1NMBN 4MWWA 4H53A 2F12A 5HUGA 4QN7A 4MWYA 1A4QA 4BBWA 2SILA 2BERA 2F25A 4MZAA 1E8VA 1DIMA 4XE9A 1F8CA 4XMIA 2YA7A 1Z4ZA 2F24A 2BATA 1N1SA 4MWUA 4M4UA 2RKCA 2AH2A 2F13A 1N1VA 4B7MA 1INYA 3K36A 4FVKA 2YA4A 4FPYA 4MWJA 2HTWA 1EUSA 1B9SA 4X4AA 3TI8A 4XJQA 2H2NA 2QWCA 5M1ZA 3CL0A 4D8SA 2YA5A 4XILA 4YW4A 1INVA 2VW0A 3GVLA 4FOWA 4XJUA 4XJ8A 4M4NA 2YA6A 4GZOA 1E8TA 4B7QA 4KS4A 1NMAN 2X9MA 1F8BA 2VW1A 4CPLA 1MS0A 4XJZA 1IVEA 4WA4A 3TI6A 1INWA 4YW1A 2QWIA 2AGSA 3TI5A 4Q6KA 1XOEA 4FPCA 4KS2A 2QWEA 4HZWA 1USXA 1MWEA 1A14N 7NN9A 4HZVA 4M3MA 4XHBA 4WA5A 1INXA 3D12A 4CPZA 3PJQA 1USRA 4HZXA 1VCUA 1W8NA 2QWGA 4XHXA 1IVGA 2F10A 4I00A 2XZKA 1S18A 1XOGA 4YW5A 1VCJA 4GZTA 1V0FA 3A71A 4B7NA 1NNAA 1KITA 1NNBA 2F28A 2AEPA 1A4GA 2QWKA 2W20A 1MZ6A 4DGRA 1W1XA 2JKBA 4X47A 2F29A 3CL2A 3K38A 2BF6A 4FPKA 5B2CA 3K39A 1W8OA 4HZZA 4XIOA 4WEGA 3K3AA 4XJ9A 2C4LA 4YZ3A 4FPOB 2HT5A 3H73A 4GDIA 2HTRA 4XMAA 4GJTA 1INFA 4CPMA 2W5OA 3SANA 4MZEA 2BZDA 1MS3A 2YDPA 4HZYA 4MWXA 4QNPA 2QWJA 1NNCA 4FZHA 1SLLA 3TIAA 4YZ2A 2QWDA 3SILA 2ZB6A 4YZ1A 2HU4A 4SLIA 2AEQA 3GVKA 4QN3A 4H52A 1MS5A 4KS3A 3NSSA 4FJ6A 1S1DA 3GVJA 3SLIA 1MR5A 1Z4XA 2VK7A 1V3BA 1E8UA 2F27A 4XIKA 2VK5A 3TICA 1W0OA 2W5NA 4FP3A 4FPGA 2XCYA 4QN6A 4K1HA 1V3DA 1NCDN 4CPYA 4FOQA 3K37A 2B8HA 2F11A 4UF7A 5HUMA 2YDTA 4XJWA 1NMCA 1W0PA 3TI4A 1IVCA 2VWDA 2F26A 1NCCN 2CMLA 4MC7A 3OPZA 2VVZA 4GEZA 3T1EA 2VSMA 3ALWA 1NN2A 4FPEA 3BEQA 4QN5A 4GDJA 3H6JA 3TI3A 4JF7A 1IVBA 2HT7A 2YA8A 4KS1A 4YW3A 4YW2A 1V2IA 4WEFA 4NCSA 2QWFA 1S0IA 1V0ZA 4QN4A 1NCBN 4MWRA 3CYEA 1V3CA 1MZ5A 2HTUA 2XZJA 4GZPA 1W20A
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5F9T A;  4K3Y A;  4NC5 A;  3WWA A;  5D9B A;  1MS9 A;  4XMB A;  1Z4Y A;  2VK6 A;  1ING A;  4GB1 A;  2HU0 A;  1NSD A;  3DR2 A;  2HTV A;  4GZQ A;  4XJA A;  3H71 A;  3JU4 A;  1MS1 A;  2HTY A;  2SLI A;  1BJI A;  4MJU A;  4CH9 A;  4O5T A;  4K1J A;  4GZW A;  4UOU A;  3E5Z A;  4DG6 A;  4FPL A;  1SO7 A;  4MX0 A;  4A0P A;  1QLG A;  4HIZ A;  4PWZ A;  4FOY A;  2A75 A;  1B9T A;  1NSB A;  3O9J A;  3D11 A;  1V04 A;  1V3E A;  2ZWA A;  1S0J A;  3B7E A;  4N1B A;  2XZI A;  4YZ4 A;  1F8E A;  4MJV A;  3TC9 A;  2QWA A;  3ALX A;  4FP2 A;  1ZGK A;  4ZY3 A;  4FPH A;  3INB A;  4J9T A;  2W38 A;  4GZX A;  4FOV A;  1DIL A;  1L7F A;  4L7B A;  4FPJ A;  2QWB A;  3NN9 A;  1WCQ A;  2HT8 A;  4MWQ A;  1IVD A;  1B9V A;  2HTQ A;  1EUR A;  5HUK A;  4ZGC A;  1IVF A;  3WDZ A;  4M4V A;  1MS4 A;  1RWL A;  1E1A A;  1N1Y A;  1NCA N;  4X49 A;  3WN7 A;  5HX0 A;  4WA3 A;  2IAX A;  2QWH A;  1V0E A;  2GVU A;  4CPO A;  3B69 A;  4FQ4 A;  4XJR A;  1MS8 A;  2H2U A;  2ZW9 A;  1EUU A;  1Z50 A;  4D4U A;  3A72 A;  5GX3 A;  2VW2 A;  3UC1 A;  3LI3 A; 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