2XC2A

Crystal structure of oxidized schistosoma mansoni thioredoxin pre- protein at 1.6 angstrom
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
QLVIMSELIELKQDGDLESLLEQHKNKLVVVDFFATWCGPCKTIAPLFKELSEKYDAIFVKVDVDKLEETARKYNISAMPTFIAIKNGEKVGDVVGASIAKVEDMIKKFI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and Functional Characterization of Schistosoma Mansoni Thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXINN
source organism Schistosoma mansoni
molecule tags Oxidoreductase
total genus 33
structure length 110
sequence length 110
ec nomenclature ec 1.8.1.8: Protein-disulfide reductase.
pdb deposition date 2010-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2xc2A00
4HS1A 2CAQA 2FA4A 3KGKA 5F06A 4ZL8A 4L5LA 1ILOA 4KDYA 3L0HA 1MDIA 2PMTA 4BA7A 1GUKA 5CNWA 1GRXA 1QK8A 2KP1A 1WOUA 1EOGA 4GF0A 1B4QA 5B8AA 5J9BA 2HE3A 4L5OA 4EVMA 3PINA 1GSDA 2JACA 3DVXA 3QFAC 4TR4A 4DSSA 2C3NA 6GSVA 1MEKA 2A4VA 3TDGA 2VCWA 5DCGA 2PERA 3BBYA 1T4YA 4BVYA 1A24A 3KJYA 1BAYA 1OKTA 1TKDB 4L0UA 1VRSD 1TRVA 3W6GA 3UARA 3O3TA 4LL4B 4YH2A 2IFQB 1TK0B 2HZEA 4ISDA 2OE1A 1TK5B 3VWUA 2JADA 2H1GA 1AC1A 3DVWA 3S9FA 1ERUA 2PU9C 3EVIA 4WEYA 5IMAA 1GNWA 1YY7A 2LSTA 1XXUA 1W89A 1S3DA 1EGOA 4ZL9A 5D96A 4G2EA 2K8SA 2PUKC 2VLUA 5F8BA 1X9MB 2F51A 3G7IA 4N10A 17GSA 2YN1A 4K0GA 2N5BA 2KHPA 2C3TA 1RK4A 2Z9SA 3GYKA 5D9VA 1CQGA 2L57A 4ECBA 1SYRA 2LV3A 2MZCA 1GTIA 1O6JA 3A5WA 3SWLA 2GSTA 2B5YA 2GZPA 3LYPA 2I4AA 4K7NA 4HQSA 1RQMA 2P0GA 3NOFA 5G30A 1Z7PA 16GSA 2D2ZA 2L59A 3RPNA 5GSTA 3LXZA 5J9CA 1XW9A 4HQZA 1BX9A 1QQ2A 4JE1A 2QSIA 3A2XA 1YQ1A 4YQMA 1OC8A 2VOCA 5DQYA 2VL3A 4MF7A 1V9WA 4KDUA 3EU4A 4L8EA 1GWCA 1WRYA 1O8WA 1XWBA 3PGTA 1XW5A 1YF0A 4XS1A 3TKQA 5ID2A 1XPVA 1ZCPA 4K9ZA 3TJBA 2AHEA 4P3YB 5H5QA 1BQ7A 2YNXA 2LQOA 1ZMAA 4I8BA 3WYWA 2XPEA 2PVOC 3RHCA 5JCGA 4V2MA 2HNLA 4V2NA 3A3TA 3O6TA 5ECQB 1F37A 5F07A 1KBNA 2MMAA 3FZ9A 1GSSA 4AJ8A 2LQQA 2PBJA 3CSJA 5DQSA 1DUGA 2DBCA 14GSA 4F9ZA 4WR5A 3DD3A 4ZBBA 2LRTA 5LD0A 2KP2A 3IA1A 4I2UA 5IMDA 1U3IA 3H79A 3GA4A 2GT6A 1FVJA 3GKKA 1URMA 4OCFA 2ON7A 1YKCA 2DC5A 2HSHA 3LG6A 2L6DA 2FWHA 3HYPA 3IK7A 1F3BA 1U6TA 2LTKA 2X8GA 3LWAA 2DJJA 3HJOA 3D22A 1XOBA 1J9BA 2YZHA 3QMXA 5D73A 4PNFA 4PQIA 4KDXA 4TR0A 4OWYA 2RUEA 4O32A 3QCPA 2YWNA 5AISA 4OFMA 1GUHA 1BYEA 2E2MA 4EE0A 3ME7A 5DBQA 5IOWA 1FB6A 2WZ9A 2J9HA 4ECIA 1Z5YE 4WR4A 5IMZA 4F0CA 1KNGA 1X5EA 2FWGA 5ECIB 2H71A 2YANA 4MF6A 1GTBA 1M2BA 2WDUA 3Q18A 3N9JA 3TKRA 3LSZA 1TU8A 5JWQB 2HXKA 2O8VB 3ZFLA 2HI7A 3VI7A 3EMXA 2H30A 2N5FA 4HZ2A 5H5SA 3FZ4A 3GIXA 3DMLA 2C1YA 2H1AA 4JR4A 4N0VA 2AB6A 2LNSA 2RIIA 2K8VA 2VM1A 3IRAA 3FRCA 2YV7A 1TXXA 2H1DA 2H0GA 1YZXA 4HU7A 3DGQA 1PA3A 4ID0A 1SL0B 2OA7A 1GTAA 2L5LA 5FHIA 3NIVA 4TW5A 4I2TA 1NHOA 2XPDA 2B1LA 3IR4A 1TOFA 1YKAA 3F0IA 3VI5A 3W8SA 3M9JA 1PL1A 3G9BA 5B8BA 3HKRA 3C71A 4MLYA 4K6XA 3KMNA 1IYIA 2OJLA 4KW6A 1E6BA 4KCEA 3P2AA 2OACA 2XC2A 3IDVA 2PGTA 4OMVA 3H8QA 3EWLA 1K3LA 2B3SA 3QFBC 1G6WA 3J7Yb 3GSSA 4GCIA 4X0XA 5H5RA 3Q6OA 2DLXA 2PVQA 3TRPA 1XFLA 3H4KA 2H6ZA 4EDZA 1ZL9A 2ALBA 2YPMA 3ERWA 4BWSA 3O76A 1OE8A 3QD9A 3VWVA 1BEDA 1SYXA 2R6KA 4IS0A 1GSUA 2VL2C 4PURA 3GRXA 4RUVA 3GL3A 1JZOA 1R5PA 1SK0A 3EYTA 2AJQB 3GH9A 4OFTA 1Z9HA 4CDOA 2FD3A 1NSWA 4HI7A 3M9KA 2VD1A 4LMVA 2R37A 3GL5A 3KM6A 5KEJA 4OO5A 3TJJA 2QKEA 1Y25A 4MF5A 4O7HA 3GTUA 3QOUA 2JSZA 4J2FA 3FR6A 4IKHA 2GDRA 2V1MA 5G5EA 3QR6A 12GSA 2E0QA 3HHVA 5LNKe 1A0RP 1YEXA 1DSBA 2X8CA 1MD4A 5ECMB 1SJIA 1S3AA 3F4SA 3KH7A 2RM6A 2FWEA 3UOMA 2XBIA 5COHA 3CMIA 1PMTA 1ZOFA 5IPHA 4CHSA 4MMMA 4AJ6A 5D8IA 1K0CA 4NV5A 2K18A 4NHZA 3TB2A 4AF2A 4RQRA 2HZFA 13GSA 2HRNA 3PH9A 1YEPA 1K3YA 5GZZB 5EY6A 1UVZA 4POKA 4QL7A 4MA9A 1QMVA 5J5NA 3DXBA 2ES7A 3EMPA 1PGTA 1VF4A 3D5JA 4DEJA 5INYA 4D73A 3UEMA 3UIWA 3M8NA 1J08A 3F3RA 3JCML 1YJ6A 4KNDA 2B1KA 4FYUA 5G31A 1FOVA 1SD9A 3ZZXA 2JU5A 5A4VA 5ECPB 2H8LA 3BD2A 3DIEA 3APQA 1FHEA 4MZCA 2H66A 1F3AA 2EC4A 2PPTA 3ISOA 2IWTA 5DAKA 4BPYA 4IW9A 2G2QA 2DJ1A 3CSHA 4KSMA 5G5FA 1XOAA 5FT3A 2VD0A 5CYYA 1TRSA 3QAWA 1JFUA 2VUPA 4N30A 4TR1B 2HSYA 2K6VA 1JLVA 4FIWA 5IO0A 3RAZA 3KP8A 4LLRA 4IQ1A 4TXOA 1R4WA 1WMJA 1Y6EA 1S3CA 1PQNA 2GGTA 2GSRA 4KH7A 3EE2A 1UC7A 1OE7A 3HD5A 2C0EA 2P5QA 4TKYA 2C8UA 1OC9A 10GSA 2PN8A 5DALA 2YP6A 3LEFA 2RUFA 1ACVA 5D9WA 3N5OA 2DJ2A 3I43A 4XS4B 4KE3A 1JZRA 3DRNA 2A2RA 4K1FA 1QXHA 3CXGA 1SJ6A 4IBPA 2IN3A 4GSNA 1VGLA 3ERGA 4TN8A 5D93A 3GKNA 3U5RE 2CX4A 5KN2A 1OYJA 4KUNA 4PUFC 2G0FA 1LJRA 5D9TA 1NHYA 2I3YA 1R5AA 2VL2A 2E2GA 4NMUA 2AUVA 5EPFA 1VF1A 2VAFA 3NZNA 3ERFA 2QC7A 1C72A 2B6MA 2L4QA 6GSWA 1U3AA 1OC3A 5KN1A 1ZYQB 2FNOA 2X64A 2M46A 1GSYA 1SKSB 4J57E 1XWCA 4QL9A 3WGDA 4DVCA 1PKWA 3L9UA 4MJBA 1SU9A 3ZFBA 4N11A 1TDIA 2B7KA 1DBYA 3VWWA 1MD3A 3ZITA 1X9WB 5HFIA 4MPGA 5ELAA 1M2DA 5CP1A 5ECOB 1MDKA 4V2LA 4EO3A 1PKZA 2QGVA 3TKPA 2WCIA 3P8WA 4YQVA 5HR2A 4MJEA 2LRNA 4IP6A 2B5XA 3AY8A 1HYUA 1VF3A 1A23A 2L5OA 3TCOA 6GSUA 3HVXA 2I9HA 3GN3A 2GSSA 3E9JB 1O85A 1JZWA 5J41A 3HXSA 2GS3A 2IMKA 2RLIA 2NVLA 1DE2A 1MDJA 3CRUA 2LRCA 4JZQA 3IK9A 3QAVA 3L9VA 2WS2A 1SENA 1V57A 5GSSA 1G0TA 2AAWA 5HFGA 1O73A 2YWOA 4POLA 1K0OA 3D21A 3UVHA 2NDOA 3IPZA 3KH9A 3IV4A 4AGSA 2GQMA 1Q4JA 1T1VA 2OE3A 1V98A 1JHBA 1B48A 3Q74A 2XBQA 3LQ7A 5CREA 2HRFA 2PWJA 2HT9A 4MH2A 3HCZA 3TOUA 4WKWA 4PUAA 2YWIA 5CAXA 3C1RA 1H75A 3L4NA 4EKZA 2IFQA 1IYHA 4IQAA 2VLTA 2H75A 4F82A 2F3MA 1MTCA 5B7CA 4KAEA 2H0IA 4PX1A 3LYKA 4TVEA 2A2SA 4XIHA 3I9V2 2GVPA 3CYNA 2ON5A 3APOA 2IJYA 2VM2A 1GTUA 5CO3A 4LL1B 3BOAA 4KB3A 5HQPA 1AAZA 3FEUA 2C80A 3L78A 1PL2A 4HJ2A 2RM5A 2IMIA 3WT2A 2OADA 1K0AA 2LJRA 1THXA 4N0ZA 2VO4A 5ECKB 3KTLA 2H01A 5D9XA 3FY7A 5EVOA 3GNJA 5G1KA 2C4JA 3GH6A 1GLPA 3TGZA 3ZVJD 1A2MA 4EXJA 3DKSA 4I97A 1V58A 1ZGNA 2HYXA 2FA8A 2VCTA 3CBUA 3ZIVA 2P5RA 4GWRA 1AQVA 3PR8A 4ECCA 1GULA 4V1Ag 3ZMKA 3EU3A 4F0BA 4GQFA 5ECLB 3WT1A 1USBA 1T7PB 1F6MC 4HOJA 3H1NA 1B8XA 1TU7A 5GAPD 1TK8B 1Z3EA 4X43A 4LA1A 2JSYA 5ECHB 1AQXA 4ZB9A 2WRTA 3L9SA 5DDLA 4FH8A 1QUWA 3ED3A 1SL2B 2IIYA 19GSA 4IJ3A 3HJMA 4MP4A 5E59A 3FW2A 1ERWA 2WJUA 6GSSA 3GMFA 4IGJA 1XVQA 3GUSA 4JU5A 4NAXA 5IMVA 4ZILA 3SBCA 1WIKA 2GTUA 4YAPA 2YJHA 1M9AA 1YF1A 1I5GA 2CVDA 4DSSB 4FO5A 2AV4A 2IMEA 1FO5A 4NXIA 2O87A 3CSIA 2ZNMA 1B9XC 1ZZYA 3R2QA 3GX8A 4XRDA 1NM3A 1YDKA 1WWJA 3MWHA 4OCEA 2CQ9A 2DJKA 4H86A 2FLSA 3FZAA 5HFKA 1VF2A 4K8MA 4GSSA 3GSTA 4ML1A 4EL1A 2LJKA 4I5QA 2I81A 4HDEA 4GRFA 4XS6A 1HNAA 4KCAA 1NW2A 4J56E 3F3QA 4ZBAA 3ZYWA 2L4CA 2YOIA 2HZEB 3UBKA 1A2JA 1QFNA 3P90A 3IC4A 3EC3A 2IPAA 6GSTA 3I69A 1U88A 2L6CA 4E8HA 3I6AA 3UJ1A 4TR3A 5HR3A 3KXOA 2B7JA 4Z7XA 4MZBA 4ULXA 2DJ0A 3C73A 2FGXA 2GLRA 1N2AA 4F2IA 1GSEA 4MH3A 3GV1A 3MNGA 4IVFA 3A2VA 2R5GA 9GSSA 1R26A 5B6MA 2N5AA 1F2EA 1G6YA 1X0RA 3IBHA 4IJIA 8GSSA 3ZMLA 5DJMA 3TKSE 4TOPA 3C7MA 2H6XA 4GTUA 4Q5QA 3D4TA 3KZQA 4ZBDA 4G9HA 1KEBA 2R3XA 3DYRA 2GSQA 1U87A 3G7JA 3GFKA 1EOHA 3WGXA 3LORA 3UL3A 2NBSA 4BVXA 3APSA 4JRRA 1EV4A 1WE0A 3DEXA 1O8XA 5ID2B 1OKDA 3VWXA 2V6KA 3VK9A 18GSA 5CRDA 2FCHA 3GKMA 1EV9A 2MMNA 4HEA2 5IPGA 1XWGA 4IELA 2HLSA 2VLVA 1N8JA 2CAIA 4O92A 1EEJA 2CT6A 3LFLA 4LMWA 5ENUA 2LS5A 4K7IA 5JWOB 3QAGA 2MMOA 5AIXA 2YV9A 2X8HA 4NV2A 3CTGA 2DJ3A 3TKSC 4HZ4A 2OBKA 1Z7RA 5F0GA 3UMAA 4PXOA 2NPBA 5ECRB 3HVVA 4F03A 4PGTA 5GAND 1ERTA 4X1UA 2MBTA 1BG5A 4L0WA 3E3EA 2DIYA 2H76A 3UBLA 2GZYA 3HZ4A 3KCMA 5DCHA 4POBA 4Q5RA 4BL7A 1H4OA 1O7UA 3MAKA 1A8YA 1EZKA 1GSFA 2H1BA 5ELGA 3TJGA 4NWYA 1EEMA 4KSOA 3TUEA 2YWMA 2REMA 5AIVA 2YZUA 4PQHA 1V2AA 4ZB8A 5IOXA 1PX7A 4OD7A 1R7HA 2H74A 4OFNA 1M99A 3W8JA 2DIZA 1T4ZA 2H72A 3MDKA 6GSXA 5J3RA 2CA8A 5IMCA 3TOTA 4GSTA 1HQOA 5ECNB 1EGRA 2FHEA 2B5EA 3RHBA 1B4PA 2V6OA 1E2YA 2JL4A 4V1Ap 4MK3A 3TJKA 2JZRA 1UN2A 2F8AA 2VCZA 4KX4A 3UAPA 2R2JA 1QGVA 3WGEA 1CQHA 3E0UA 4RQXA 3KTBA 2IL3A 5IMFA 2V32A 4MABA 1Z6NA 3FYGA 2CV4A 4KGIA 1FAAA 3TRXA 5L71A 3CTFA 4DSRA 2YJ7A 3ME8A 2OE0A 4XCSA 3M0FA 4HU9A 1T3BA 1OVNA 2WFCA 1GUMA 2O89A 3HDCA 4PQ1A 5KN0A 1XWAA 2CZ3A 4WXTA 4EDYA 2FUG2 5HR0A 5EL8A 1GNEA 1XVWA 3F4TA 3ZVJA 3BCIA 5C04A 3OR5A 1T8EB 5E4WA 2H6YA 1SD8A 4ACSA 4ECJA 5ECSA 1HNCA 1K0MA 2VCQA 4FYCA 3BJ5A 3KD0A 3G7YA 4BWQA 4ILFA 2TRXA 5CRWA 3V1WA 5IO2A 1XW6A 3U6VA 4TR1A 1GL8A 1M9BA 3F6FA 3H93A 1TTZA 3F9UA 1SKWB 1XCCA 1ZYEA 4GXZA 1GH2A 1PRXA 5A5KA 4MJAA 4RI7A 6GSYA 2MYGA 3IAS2 2LNTA 3TRQA 1AQWA 3C8EA 1DE1A 3KIJA 1JZDA 3F4RA 3RPPA 2DMLA 20GSA 1G7EA 5A4UA 4IP1A 1W4VA 1JLWA 4ZL7A 2K9FA 3EINA 2FWFA 2VIMA 2X99A 2IMFA 2WGRA 4XS4A 4K2DA 4HJMA 1G7OA 1GSQA 2BJXA 1WPIA 3D6IA 3IAM2 4CW9A 2H70A 3GX0A 3GHAA 1RW1A 3QPMA 4MPFA 3VPQA 3Q19A 5CRHA 1EWXA 2NTOA 4MZWA 1T00A 5AGYA 2CZ2A 2ZUPA 5LCZA 2C0FA 3HZ8A 3MSZA 3TKSA 1J0FA 3WD6A 1WP0A 2P31A 3GTUB 1AUCA 1M2AA 1FB0A 5F05A 3HVSA 4I6XA 3F6DA 2GQLA 1LU4A 4YAVA 2OBIA 2C0DA 2OKAA 3P7XA 4NPBA 2TIRA 1TI3A 2V41A 3M3MA 4WBRD 3D0ZA 1TJDA 2H0HA 2FY6A 1A8LA 5DVBA 3UVTA 3DWVA 1ON4A 1PX6A 4IHUA 1TI1A 3HY2A 4E8EA 5B6NA 3ZLPA 5A4WA 1F9MA 4WF4A 4MDCA 4ML6A 1GP1A 3ZRDA 1FG4A 2ZCTA 1X9SB 1X5CA 2LUSA 2F8FA 1Q98A 1AXDA 3FR9A 2LEGA 3FHKA 3J7Yk 1ST9A 5CRGA 4XHMA 5HR1A 4TXVA 5JWRB 2O85A 1X5DA 5KN3A 1Z6MA 4FYBA 4D73B 2H73A 1PN9A 3TJFA 3FKFA 1FW1A 1GLQA 1KTEA 1ML6A 2LKUA 5AN1A 1FVKA 1EP8A 5G1LA 4HUAA 4MCUA 3FR3A 2EIQA 1WJKA 3US3A 4K7OA 3C1SA 2GT5A 3GKXA 1UA5A 2GZZA 2MBSA 3HJPA 3LGCA 3A2WA 7GSSA 5DAKB 4EF0A 3KMOA 2KOKA 2M72A 3IE3A 5J4UA 3HA9A 4Q5NA 1K0BA 1M0UA 1TRWA 4ZIJA 4NHWA 1SJZA 1XIYA 1SL1B 3ZTLA 2R4VA 1SK2A 1O81A 3FZ5A 1TP9A 3M1GA 5C00A 4TXOB 5IIZA 2BMXA 1LBKA 2WULA 2WB9A 1TRUA 2XHFA 2BTOT 1K0NA 1PD21 4GLTA 1HNBA 1XWKA 3KP9A 2VCVA 4G10A 2CVBA 1HD2A 2CVKA 4TRXA 2J23A 5IQYA 1V40A 1OC9B 4WBJA 1ABAA 2C3QA 5DALB 4EC0A 1SKRB 1A0FA 4Q5FA 1SK1A 4JEDA 4YQUA 1AW9A 4WETA 4O5RA 3RDWA 4DSQA 1PSQA 4GQCA 3VPTA 4OO4A 3FK8A 2YCDA 2IMDA 2C0GA 4WF5A 2GQKA 3VFIA 3EURA 3VLNA 2V2GA 3ZL5A 4KA0A 3VURA 3QDNA 2I1UA 3IOSA 11GSA 2EIRA 4ZXGA 4PNGA 3KEBA 4AJ7A 1OAZA 1XBSA 5JCUA 3LJRA 4IN0A 1TW9A 1ERVA 2F9SA 2VCXA 4MJCA 4POMA 5DJLA 4JBBA 2KLXA 3F63A 3ZREA 1B9YC 2EIOA 2MMZA 1A2LA 1K3OA 1I9DA 3ZIJA 2VL9A 2HFDA 3RBTA 4G19A 4ZB6A 5ABRA 4EUYA 3LXTA 1AIUA 2KUCA 2AYTA 3IHQA 5JCWA 4XRAA 2JZTA 1EP7A 2LJAA 3GURA 2TRCP 22GSA 2E7PA 3D4MA 4XTSA 1K0DA 3BCKA 1BJXA 1THOA 4RI6A 3CRTA 2JZSA 4QQ7A 3K8NA 1XZOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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