2XD2A

The crystal structure of malx from streptococcus pneumoniae
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
KELTVYVDEGYKSYIEEVAKAYEKEAGVKVTLKTGDALGGLDKLSLDNQNGNVPDVMMAPYDRVGSLGSDGQLSEVKLSDGAKTDDTTKSLVTAANGKVYGAPAVIESLVMYYNKDLVKDAPKTFADLENLAKDSKYAFAGEDGKTTAFLADWTNFYYTYGLLAGNGAYVFGQNGKDAKDIGLANDGSIVGINYAKSWYEKWPKGMQDTEGAGNLIQTQFQEGKTAAIIDGPWKAQAFKDAKVNYGVATIPTLPNGKEYAAFGGGKAWVIPQAVKNLEASQKFVDFLVATEQQKVLYDKTNEIPANTEARSYAEGKNDELTTAVIKQFKNTQPLPNISQMSAVWDPAKNMLFDAVSGQKDAKTAANDAVTLIKETLKQK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Molecular Basis of Glycogen Breakdown and Transport in Streptococcus Pneumoniae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTOSE/MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
molecule tags Sugar binding protein
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 118
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xd2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xd2A02
3KJTA 5CC2A 4R9GA 4XIGQ 3K6VA 2OBGA 3U92A 5IAIA 1JW1A 2HAUA 3IOVA 4POXA 4G4PA 4UACA 4XKRA 4YB6A 2HEUA 4YB5A 4KI0E 3K6UA 3K1MA 2RCAA 4KYSA 1B4HA 5DEXB 1NH7A 5AA4A 1NNKA 1TT1A 4RK2A 4YKJA 3DM0A 3O6HA 3IO6A 5H8HB 4BDQA 4UA8A 2B3FA 4WXJA 5DT6A 3PMXA 2HCAA 4OFJA 1B5IA 1S9TA 3SERA 4XXUA 3TTNA 1LCTA 2H5YA 3DP6A 3P7IA 3V89B 4DCXA 4ZEKA 3G3FA 1R6ZA 3PGFA 2V3TA 5H8FB 4ELQA 1VE4A 5I57B 3E9XA 3N5LA 4F39A 4EXKA 3PUZE 3H06B 1DTGA 3IB2A 1A8EA 5DYHA 5I2KB 1ZJLA 2XXYA 1SD3A 3ILTB 2Z23A 1JVYA 3FVOA 1GTKA 2DQVA 1BTJA 2F7BA 3FVNA 5I59A 4I1DA 4F1UA 2F36A 4JDFA 2GFEA 4LP2B 1I6BA 1N0TA 3PU5A 3E4RA 3K01A 4ELPA 1VFDA 2Y7IA 3SEWA 3OSRA 4XKNA 1B46A 1MM6A 1MY4A 2IA4A 3G7WA 1B5JA 3QAXA 1JEUA 4OMBA 1VFEA 3USDA 4HW8A 1O63A 3EHTA 2UVGA 1OVTA 4EXLA 1OQHA 2XD2A 4YKIA 4PFWA 4IGRA 4YMBA 3UP9A 4DXCA 2ZNTA 2F5XA 1A99A 1R1NA 2O7IA 3OSQA 4NMYA 4ONYA 2X26A 4GIZA 4P0IA 4P0GA 4U21A 1A8FA 3UN6A 2R6GE 3MP1A 4U1ZA 3EHUA 4G8NA 4IY5A 3MZBA 4ND9A 3MVWA 4LQ2A 4MH5A 4NF4A 1MQHA 5FHNA 4PP0A 1IXCA 3OEKA 3Q26A 2X7PA 1UTHB 3CFXA 3IR1A 4RPOA 3PUXE 4WEPA 3PPPA 2I6EA 2HZKA 3B6QA 3S2VA 2XX8A 2D5WA 4F3PA 3I6VA 1B0LA 2NVUB 4EF1A 4FAJA 1QULA 4IO6A 3RGYA 1KWHA 4OFLA 3PMVA 3LSLA 3K00A 2HQ0A 1NL5A 4MLVA 3VLUA 4IO5A 4TLLB 1LAXA 3HV1A 2Y7KA 3PUYE 4ZEFA 5H8SA 4AQ4A 4HS7A 3H03A 4NWDA 1Y20A 5HM4B 2XX7A 3K02A 2OWTA 3KGCA 1EH3A 2F7AA 4YB7A 3V83A 3KZGA 4PE5B 3S9LC 2H4IA 1BKAA 3OO6A 2ZYKA 3MVXA 3W9VA 1MY3A 3JYRA 4NF6A 3FJMA 1J1NA 1NNFA 4DZ1A 3Q25A 1R9QA 3MPLA 3PUWE 3FXQA 4WEDA 1NNTA 5A5XA 3M3FA 1P1WA 3IL1B 1MPCA 2GHAA 2ZYMA 1SW2A 3U72A 2F35A 3OOAA 4U1OA 1LBCA 2QS3A 3T22A 5BWJA 3U1OA 5BUUA 5L9OA 3U94A 4P11A 1TXFA 5AA2D 3ZKKA 3V5AA 3FXRA 3LUYA 1H76A 5ITOA 1MXWA 2OWSA 4YZZA 3D4GA 5K2XA 4MLQA 4M1VA 1MG1A 1PB8A 1XHYA 2E0SA 2VP1A 1N84A 5KDTA 3T9UA 1JNFA 1D3KA 2O51A 2QMWA 1B7UA 3IJXB 2QPQA 2R9JA 2X7QA 3FD3A 3QYTA 1BP5A 1Y3QA 2Y7WA 4PFUA 2V84A 4O3BA 3QUFA 3TDJA 3LSXA 3CFZA 3RTFB 1CE2A 1MY0A 1Y3PA 3H6TA 3Q28A 2CZLA 1N04A 3C4MA 4BDLA 1H44A 1XVYA 4NF6B 4R2FA 1M5EA 2CMOA 3KN3A 5L9MA 1GGGA 4PFTA 4GL0A 4RJZA 3OMBA 3OO7A 1PB9A 5A5XB 3BBRA 4G68A 2H9BA 3MUQA 3UA8A 3TKDA 1YCJA 1N3XA 4I62A 3C9HA 1NKXA 5DVJA 3C34A 2I0BA 3PPOA 2DOJA 4WKMA 5TP9B 4QF9A 5EYFA 4H5GA 1MXYA 3PUVE 4NF8A 1B1HA 2W7YA 2I4CA 1NMUA 1US5A 3LBSA 4U4SA 4THIA 2G93A 4LONB 2PVUA 3K4UA 2THIA 1MQDA 2OJTA 3KFMA 2RC7A 2ONKE 5FTIA 1TFAA 3PD8A 5H8QA 4BDRA 5KDTB 3EHSA 5FHMA 3I3VA 1IIWA 3ZSFA 1ANFA 2LAOA 3FV1A 5CMMA 2Q2CA 3R26A 4N6PA 1YPNA 5TPAA 1M5CA 3DP4A 2F97A 4FEDA 4F29A 3B7DA 4LA9A 3RT8A 4FIMA 5LOMA 3JZJA 1QJMA 2FYIA 1AIVA 3W15C 2RC8A 1B6HA 3FV2A 3ZKLA 1AMFA 4PFYA 3TMGA 2PYYA 3U8QA 3H7MA 2DWIA 3KN8A 1MXVA 2H25A 2Q88A 4QRZA 2A5TA 1ELJA 4ZDMA 1ZLQA 3N26A 4BDOA 5IKBA 3MZ1A 4RNSA 4ESXA 1SYIA 1DSNA 3OELA 1B3EA 2F7CA 1D9VA 1B1XA 1MXXA 1Y1ZA 2VOZA 5ITPA 3CG3A 5JTYA 4RPNA 4EQ7A 4L17A 5AA2A 1USYH 2QRYA 1B58A 1B32A 4OEVA 2ZNSA 1EZOA 5K2YA 4F31B 4FATA 4LZ8A 2XXVA 5I2NA 5CMBA 4Z7EA 1MQIA 4GRKA 4NF5B 1SBPA 2FA7A 3LC8A 1QW0A 3MW0A 4H1XA 3UK4A 4U23A 1LLSA 1ZKBA 3MZ9A 4F1VA 2Y7RA 2DE3A 1MM7A 3C33A 4HCWA 2XXWA 5I58A 4ZECA 2ANJA 1H45A 1UQWA 4FORA 4R6HA 1PBQA 1S7YA 3FUZA 4FECA 3T9VA 1RYOA 1MH4A 1Z7NE 2HZLA 3G3HA 4OFOA 4GXSB 1SVXB 3IJOB 2XXPA 4FE8A 2PBWA 2QMXA 4MF3A 4DE8A 4QSEA 2I48A 4POWA 2Z8FA 1B7ZA 3PMWA 3FVKA 4DXBA 3SEYA 4AB6A 4YU0A 1D9YA 2UYFA 3T9XB 5B7DA 2NXOA 2I4BA 2PT1A 4OETA 4RYAA 3LR1A 1D4NA 2XXTA 1PEBA 4QFKA 5I2NB 2G29A 4IB2A 3F11A 1Q1KA 3SETA 1ZTYA 1I6AA 5ICQA 3DP8A 4O3AA 1MDQA 5AA4B 2XXUA 2Z8EA 3TODA 4G68C 4N13A 2Q2AA 5FTHA 3RLFE 5F1QA 3O66A 4X48A 3G3GA 4KR5A 2VGQA 3TZAA 5I58B 1HSEA 4OWDA 4R2BA 1M5FA 3KOSA 3TTKA 4X1DA 2DXYA 2GH9A 4LVQA 1TFDA 1N7XA 4GOTA 3RY3A 1CB6A 2F78A 2DVCA 2P0SA 3MAMA 4DCYA 1MH3A 3QXMA 3K1PA 3H6UA 3UIFA 3RT6B 3UGWA 4OQOA 2P1SA 3O29A 4GLIA 3E3KA 1FQCA 4F19A 3MJNA 1B7HA 3R6UA 2ONSA 4YMAA 4F2OA 4ISUA 4GFRA 1M5DA 2UVJA 3VE1B 2PT2A 1A54A 3K6XA 3T96B 3PPNA 4OXVA 5I59B 1FQAA 4ZEBA 4KCCA 4XKPA 1SW4A 2XXRA 4I8CA 1B05A 4OESA 1NFTA 1P1OA 2I0CA 3SEVA 4H67A 4R6YA 3ZS6A 3FGSA 2DWAA 1MPBA 5ELVA 3DLNA 3FATA 1LB9A 2RC9A 3SEUA 3S9MC 2H98A 1JW4A 3TTLA 2REGA 1UIUA 4H8JA 3WAEA 1N7WA 3H3GA 3MP6A 4GVOA 4JSDA 4M4GA 1PB7A 1B0HA 3CI8A 4TLMB 4C1TA 3FVGA 3G3IA 5H8NA 2OLBA 2D3IA 4F22A 4JSOA 3JV9A 1SW1A 3TTRA 4NF4B 5ISUA 2UXAA 3MPKA 4U2RA 1EZ9A 3GLBA 2AYSA 1SI1A 2HFBA 4C1UA 1LFIA 4H5FA 2IEEA 1MPDA 4Q0CA 1OIBA 1IXIA 1EZPA 3K2DA 4JWOA 3BKIB 2Q8JA 4OTEA 1B52A 2DS9A 2D21A 3DELB 5AE4A 5DVIA 1URGA 4F18A 4QSDA 3IOTA 4TOZA 3KJ7A 3ONMA 1SI0A 3EF7A 3KBRA 1BIYA 4C0RA 4ZEIA 2Y84A 4KYEA 5CM6A 4YKKA 1QVSA 3W9WA 3SEXA 1POTA 4G8MA 3K0VA 5DVFA 2P2AA 3QK6A 1ZBMA 1N3WA 1UIVA 3HO7A 3C35A 2O68A 1FTMA 1AL3A 1R9LA 1WODA 4OYVA 3O6GA 2ONRA 1O64A 1OQGA 1RKMA 4IO2A 3KG2A 4QFPA 4ZZEA 5FHOA 4QHQA 3LSFB 3C32A 4DXUA 1ZMGA 1MY2A 1URDA 1TWYA 5L8DA 4GQOA 2VD2A 1IXGA 1O7TA 3RQTA 4G77A 3N6UA 1MXZA 1B5HA 2QS1A 4ZZAA 5KZTA 1FQEA 3HPIA 1NNPA 1VR5A 1SQYA 1XS5A 2Z22A 2BJJX 1I69A 2VHAA 2Q9TA 2V93A 2DYXA 3K1NA 2O1MA 3VVDA 3TCGA 3TAJA 1MQGA 3TCHA 1DPEA 1QUKA 2QS4A 3CIJA 2UYEA 3VVEA 1DTZA 2PMSA 3TFLA 3N6TA 4JXIA 3HHFA 4IGTA 1QKAA 3PPQA 4MFIA 1IEJA 4ZE9A 3GZGA 3MP8A 5DEXA 3TUSA 3O2AA 2B3BA 2DE2A 1B3LA 5I56A 4RY1A 3GBAA 2DWJA 3OO8A 4OZ9A 4Q30B 3BFTA 2XD3A 2F34A 2PX1A 4ZE8A 1USYE 1US4A 2XX9A 4I9DA 3V8XB 4R75A 1FQFA 4G2ZA 1II5A 3C36A 3R7XA 4E0XA 1HSLA 1FTLA 1L5TA 4G68B 3M8UA 4JBZA 1Z7ME 2I49A 4EQBA 1LFGA 3SKPA 4PETA 3THIA 5I57A 3GXAA 1FCKA 2I3VA 3FASA 4Q5TA 4RK9A 2ESNA 4ELRA 1IXHA 4GD5A 2ABHA 3SESA 2YPNA 1F9BA 2RF1A 3HN0A 1XVXA 3KEIA 4NF8B 3OENA 4E0WA 2NOOA 2O7UA 1DOTA 4YKPA 4R6KA 3VXBA 4ELOA 4PQJA 5JEIA 5H8QB 3I5OA 4ZEDA 4FEBA 1MY1A 4GF8A 5HBCA 5TPAB 1Y1MA 2WKYA 4IY6A 4O3CA 1SYHA 3TCFA 1XC1A 2YLNA 3IAZA 3C31A 1P1QA 4NTLA 1DMBA 3KN7A 5I56B 4OVJA 4LQ5A 3B6WA 2QS2A 4YICA 3TEPA 3IOWA 4IO4A 1B3FA 2A5TB 1MDP1 2RCBA 1GVCA 3IORA 3OO9A 1LCFA 1Y4TA 4H6DA 5KCJA 4MBPA 4NE4A 2DVZA 4BLAA 4JWXA 3MVYA 5CI5A 4RXLA 3HHGA 1A55A 1B2HA 4DLDA 1UTHA 5JTYB 1Y3NA 5AA2B 2O1LA 1UTBA 1P1UA 2RINA 2O6AA 4NEDA 4G8HA 1PC3A 1QUIA 5M2VA 3KOTA 1XOCA 2DWHA 1B3HA 3O28A 3IOUA 3OXNA 3IO4A 4LATA 4U4XA 4BDMA 5ICTA 3VXCA 2GRVA 1B3GA 4ESWA 4F3SA 5J1DA 2DXRA 1MRPA 1B40A 1QUJA 2XXIA 2HAVA 2F6GA 4EUOA 4R73A 3SDFA 3ODBA 4QFLA 1ZU0A 4R9FA 3MWBA 3ILUB 1AOVA 2DE4A 3EQ1A 3FJGA 3IB0A 3QUJA 5EHMA 1LB8A 1XT8A 2H99A 3CG1A 3A09A 3H6VA 4QFOA 1M5BA 5CRYA 2Y7PA 3OEMA 3CVGA 4IO7A 3T93B 3OD7A 3IK6B 1IQ7A 3RPWA 2ZMBA 5AA1A 3VFJA 3O6IA 1FTKA 5KCJB 5F7VA 3CR9A 2RKMA 4KPTA 1JW5A 3VLVA 4N07A 3KSXA 3T9HB 1UTBB 1B51A 4GWOA 3TQLA 1LAGE 2Z8DA 5CMCA 3K6WA 3L6HA 3RN8A 2YJPA 4F3GA 2AL4A 3FJ7A 3B6TA 3RNNA 4AB5A 1MS7A 2XHDA 4EDPA 1OMPA 3HCQA 2OZZA 4KHZE 1IITA 3VLWA 4H0WA 1DPPA 2NWJA 2UVIA 2A5SA 1LSTA 5I84A 5DTBA 3CRBA 3RUMA 4X9TA 4U22A 3D4CA 4JWYA 3RTWB 2B65A 3S4UA 1JETA 4KYDA 3QSLA 1NH8A 1Q35A 2AL5A 1B9JA 4H65A 1POY1 4X1BA 3EPEA 2Q89A 3TTMA 1Y9UA 1FTJA 4LZ7A 4XTCQ 4EF2A 2QJEA 1ATGA 3CSBA 1GV8A 4OERA 4OHNA 1IZ1A 2M8CA 2XXHA 4EQ9A 1B4ZA 3TYHA 4QSCA 1P1NA 2UVHA 3M3KA 3N94A 4XKQA 4OEUA 4F1YA 5EHSA 4GL8A 3A3CA 3T66A 3KSJA 3G3KA 2OK2A 2I58A 4NWCA 3GBBA 1P99A 3PV0E 2ZNUA 1JQFA 1S50A 4OENA 3FIRA 1FQDA 5TP9A 1VSOA 2ZYNA 1IUDA 3EN3A 1MQJA 2ZXTA 3ECRA 2NUVA 3CFLA 2ALUA 5TU0A 2F6PA 2AIXA 2ZYOA 1LGBC 3MVZA 5AA3A 1SDXA 4JB7A 2VD3A 1A7LA 2OCUA 5CBRA 2DP8A 1WVJA 2QL3A 5B70A 2DSFA 1N76A 3LSWA 4YAHX 2XXQA 3FXUA 4BDNA 1SW5A 3TQWA 3E13X 4DDDA 4H8IA 3U93A 1I6QA 2HXWA 4Q8RA 2QSXA 2XXXA 1LAFE 5H8NB 1T0KA 3Q29A 1FW0A 3QIMA 1H43A 3VV5A 1A40A 1OVBA 3MC2A 1HSJA 3H4ZA 2V25A 3IB1A 4QFNA 4IO3A 1FQBA 1GR2A 2I3WA 2GHBA 2KLFA 4KQPA 3AXFA 3S9NC 1YTVA 2O84X 4LUBA 3PPRA 2REJA 5CBSA 4Z0IA 1AH5A 1OLAA 1FTOA 4KFQA 3MBPA 1Y4CA 1LBBA 3VVFA 3Q27A 3HSTA 4K3FA 3G3JA 1ZIUA 3FZVA 4GXAA 4ZS9A 5JK4A 1WDNA 3UORA 2R71A 1JEVA 4LZ5A 4TQUQ 2F8DA 1EU8A 3S9EA 1QKBA 3L6GA 4HTGA 4NF5A 4HCYA 3M3LA 3O9PA 1PDAA 3VDFA 1BLFA 1JVXA 1PBPA 3H6WA 3BFUA 4ECFA 4F2QA 5H8HA 1LAHE 4RA1A 3MQ9A 5CMKA 4DIGA 3A3UA 4FJPA 4R72A 1YAEA 1MXUA 1RYXA 3TELA 1H3DA 5L9SA 4F3BA 4KCDA 1OLCA 2E1SA 3IX1A 4KD5A 5H8FA 2FNCA 3O97A 2V3QA 4R74A 3TPAA 3CSGA 3PD9A 1LFHA 2O69A 5I2KA 2V3UA 3WAFA 1URSA 5HPQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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