2XD2A

The crystal structure of malx from streptococcus pneumoniae
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
KELTVYVDEGYKSYIEEVAKAYEKEAGVKVTLKTGDALGGLDKLSLDNQNGNVPDVMMAPYDRVGSLGSDGQLSEVKLSDGAKTDDTTKSLVTAANGKVYGAPAVIESLVMYYNKDLVKDAPKTFADLENLAKDSKYAFAGEDGKTTAFLADWTNFYYTYGLLAGNGAYVFGQNGKDAKDIGLANDGSIVGINYAKSWYEKWPKGMQDTEGAGNLIQTQFQEGKTAAIIDGPWKAQAFKDAKVNYGVATIPTLPNGKEYAAFGGGKAWVIPQAVKNLEASQKFVDFLVATEQQKVLYDKTNEIPANTEARSYAEGKNDELTTAVIKQFKNTQPLPNISQMSAVWDPAKNMLFDAVSGQKDAKTAANDAVTLIKETLKQK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Molecular Basis of Glycogen Breakdown and Transport in Streptococcus Pneumoniae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTOSE/MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
molecule tags Sugar binding protein
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 118
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xd2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xd2A02
2DOJA 4E0WA 3S9MC 3OSRA 3VLUA 2ONRA 2QPQA 5CBSA 5AA2D 1SBPA 4KYSA 4X1DA 4PFWA 1QJMA 4LA9A 3THIA 5ISUA 1RYXA 4I62A 2I4CA 1UIUA 1YTVA 4WKMA 1B58A 4NF5A 3C32A 3C31A 4N07A 2RF1A 3KBRA 5HM4B 5ITPA 4DCYA 1LBBA 3F11A 1TXFA 1FTMA 3BFUA 1B46A 3M3LA 3R26A 2PYYA 2H9BA 2XXHA 3PUWE 4DLDA 4ZEKA 5BWJA 2PT1A 3DM0A 4JWXA 4M4GA 3C4MA 3BFTA 1B7UA 4OETA 2OCUA 2H4IA 3S9EA 2B3FA 2Y7KA 3OO7A 1MQIA 2F7AA 2ZNTA 4GXSB 4AQ4A 1ZKBA 4I8CA 1Y3PA 3KGCA 4GQOA 2Q2CA 1B6HA 4G68C 2VHAA 1MDQA 1II5A 2P1SA 2F34A 3TTMA 4G68A 3VV5A 2A5SA 5DVJA 2QS2A 2IA4A 5AA2A 4DXUA 2F6PA 5I2KA 1VR5A 2QMWA 1LBCA 2QS3A 2HAUA 3R7XA 4R6KA 3SEWA 5H8FA 2B3BA 5IAIA 4TOZA 3FXUA 1M5BA 4AB5A 3IL1B 3U93A 3CI8A 2DWJA 3IOUA 2OWTA 4FATA 5IKBA 2ANJA 3K1MA 1OIBA 3V5AA 3UN6A 1MY0A 1TFDA 2I0BA 4ELQA 3UA8A 2ABHA 4H67A 3K00A 4G8MA 3JZJA 5I2NB 4GIZA 4F29A 3MW0A 1B32A 1FQAA 4F3PA 4KYEA 2DS9A 1A54A 3H6VA 1MS7A 2XHDA 3C34A 3RUMA 1SVXB 4ONYA 2Z8DA 3K6UA 3N6TA 1IUDA 5DYHA 1EU8A 2O69A 1QW0A 1FQFA 2F7BA 3CG3A 4LQ2A 5AE4A 1M5FA 4F3GA 3Q27A 1LLSA 1VFEA 2IEEA 3UP9A 4YKIA 4NWDA 2OK2A 4IO5A 4ELPA 5EYFA 3WAEA 4FEBA 4L17A 4F22A 1NMUA 5I84A 2REGA 3TCGA 4YB7A 1ZU0A 2XXTA 1CE2A 2DP8A 4BDMA 2XX7A 2VD2A 4IB2A 1MM7A 1NKXA 3K02A 4BLAA 3VXBA 4FJPA 3FIRA 4H6DA 4PETA 1DTZA 5J1DA 2G29A 2DE4A 3PPQA 2KLFA 1B4ZA 2ZXTA 3EHUA 3TAJA 3U94A 3EPEA 3PUXE 3U1OA 1ATGA 2Q88A 3MJNA 1OQHA 1P1UA 1OLAA 2ONKE 4KYDA 4HW8A 2H25A 3ILUB 1T0KA 4HS7A 1S9TA 1B40A 2XXIA 1B3EA 2XXQA 3OO6A 3IX1A 1JEVA 3DP8A 3QXMA 4NF8B 3RTWB 1MY1A 1JVXA 3CFZA 1FQBA 2YLNA 4TLLB 1MY3A 1PB8A 4RK2A 5FHOA 4YU0A 2QRYA 5CMMA 4LZ7A 4O3AA 4KCCA 1OMPA 2Y7IA 5L9MA 1PEBA 4G8NA 4EDPA 1YAEA 3N94A 3LSFB 1XHYA 2XD3A 1B3HA 3RGYA 3QUJA 1N7WA 1D9VA 3T9HB 3Q25A 3CSBA 3OELA 4YKJA 3VE1B 1MXYA 4DZ1A 2O84X 5CBRA 3KJ7A 3CFLA 2GRVA 3DLNA 4POWA 3CIJA 3PPOA 4EXLA 3FXQA 1ZJLA 4C0RA 2V93A 1UTHB 1A55A 4MLQA 2HQ0A 3KJTA 4N6PA 3OSQA 5CMBA 5K2YA 3K0VA 2CMOA 1LAGE 4P0IA 4QFNA 4ELRA 4F1UA 2ZNUA 1B5HA 3HHGA 2PVUA 3TTLA 5DVIA 3B6QA 2RC7A 4IO4A 4RPNA 1Y4TA 3SKPA 3QIMA 3IJOB 4LVQA 4OFJA 3FV1A 5A5XB 1B1XA 4QSDA 1N7XA 4IO3A 5TP9A 4EXKA 3RTFB 2V84A 2AL4A 2PT2A 1Z7NE 3S9NC 1DTGA 1JW5A 2I4BA 1FQCA 3MZ1A 2HFBA 5EHSA 2I48A 3PV0E 4XKNA 4RNSA 1NNFA 1SW2A 2DVCA 1RKMA 1QKBA 4ZZAA 2DQVA 4GL0A 3FXRA 3T9VA 3K6WA 2H5YA 1B52A 4RK9A 3K6XA 3SETA 4OTEA 4TLMB 1PBPA 1IZ1A 1FW0A 1JVYA 2V25A 2OBGA 3R6UA 2I3VA 4G4PA 1HSEA 4P11A 1DOTA 4YB6A 3FVKA 2F35A 1M5EA 1QVSA 5CI5A 3A09A 4NF4A 4OFLA 3IB2A 3KSJA 2F97A 4OQOA 4C1UA 3V8XB 2Y7WA 4FORA 3HPIA 2ONSA 2RC8A 3H7MA 1XOCA 3ZSFA 5KCJB 2ZMBA 4JBZA 3AXFA 1US5A 1FTLA 4GLIA 3FJ7A 1MPCA 3T9XB 1UIVA 2XXWA 3QAXA 1D3KA 1RYOA 3TPAA 3ILTB 2E0SA 2XXVA 3DELB 3FZVA 1SYIA 3GZGA 2X7QA 3UIFA 3K2DA 2XX8A 3RNNA 1SYHA 2DVZA 1B7ZA 1P1NA 2YJPA 3N26A 1UTHA 3S2VA 3KN3A 1UTBA 4XIGQ 1MY2A 1B3FA 2O1LA 3PD8A 5I57B 2DXRA 3OO9A 5CRYA 2RCBA 1O64A 3KG2A 4R75A 1DSNA 4YB5A 3O6IA 2UVIA 1HSJA 4RPOA 5DEXB 3RT6B 5DTBA 1B1HA 4U2RA 4GVOA 1B05A 1MPDA 3TCHA 2FYIA 2P0SA 5A5XA 4WEDA 1LB9A 1BKAA 4LZ5A 5TU0A 1URDA 1P99A 5ICTA 5L8DA 1D9YA 4LQ5A 3S9LC 1JETA 2ZNSA 3N5LA 4OVJA 4IY6A 3H6UA 3FVNA 1I6BA 3UORA 3T22A 1JQFA 1PC3A 1Y9UA 1MQJA 1I69A 4GFRA 3FASA 1FTKA 3O28A 1ZTYA 4HCYA 4IY5A 2PBWA 4LATA 5FTIA 4UACA 3MP8A 1UQWA 5DT6A 3CR9A 4R9FA 4NMYA 4GWOA 3GLBA 4OYVA 1GGGA 2QS1A 1NL5A 3CRBA 4DCXA 2QS4A 1B5IA 1A99A 4R73A 5I56B 3Q26A 1MXWA 5JEIA 3E9XA 3VDFA 3B7DA 5ICQA 1BP5A 3L6GA 4ZDMA 1KWHA 4WXJA 1R9LA 4YMAA 4HCWA 1CB6A 5TPAB 1EZ9A 1N3XA 1WVJA 1EZPA 5KZTA 2V3UA 1IXCA 3EHTA 3SDFA 4LP2B 1QUKA 2DWHA 2YPNA 3TYHA 2B65A 1B9JA 3O97A 5HBCA 3L6HA 3FVGA 3MQ9A 2Z22A 1TFAA 4QRZA 3VFJA 1M5CA 1DMBA 5KCJA 2Z23A 3ZKKA 3RPWA 3Q28A 1YCJA 3P7IA 4IGTA 2UYEA 3CFXA 1M5DA 2QJEA 3I3VA 5HPQA 3M3FA 4IGRA 3OD7A 3QUFA 1MXZA 1Y3QA 3PMWA 1VFDA 3SEVA 4JSDA 3MP1A 2Q8JA 2F5XA 3QSLA 4FECA 1OQGA 1FQDA 1Y3NA 1MQDA 1NH8A 3RLFE 2I49A 2QSXA 1MG1A 5L9OA 4R74A 3CSGA 4BDRA 3IO4A 4QFKA 3MZBA 1SW4A 3SERA 1LFHA 1H3DA 4OFOA 3IAZA 4OENA 2DE3A 1MPBA 5I57A 3H3GA 3O29A 4EQBA 2A5TB 2P2AA 4X48A 3TELA 4PE5B 4UA8A 4QF9A 5DEXA 2HEUA 5I59B 5I58B 2I0CA 3HHFA 3K1PA 4F3BA 4KR5A 4JDFA 4OERA 2AIXA 1MXXA 3MVYA 3KSXA 5AA3A 5K2XA 1LAFE 2VP1A 1NNTA 3TQLA 4JXIA 5JK4A 1H45A 2HXWA 4H65A 2UVJA 1NNPA 3I6VA 5ELVA 1BLFA 4PQJA 3IB1A 2DE2A 4XTCQ 2XXPA 3BBRA 3OXNA 2UYFA 3OO8A 2RCAA 2ZYMA 3HN0A 3G3FA 3E4RA 2Q2AA 5H8QB 4G77A 1R1NA 4R2BA 3O66A 4EUOA 3G3KA 4Z7EA 1Y1ZA 4ESXA 4O3CA 2XXRA 3K1NA 5I56A 3B6TA 1EH3A 3FJMA 4U23A 4F1VA 2NVUB 4QSCA 4ZS9A 5CM6A 1A40A 2H99A 1S50A 1B4HA 5TPAA 1B3LA 2Y7RA 4NWCA 4I1DA 3MVXA 2WKYA 3C35A 1QUJA 1H44A 2FA7A 3PPPA 2F36A 2AL5A 3ECRA 3LBSA 4OEUA 1NFTA 5I2NA 4GL8A 4NF5B 1GV8A 3W9VA 3FATA 4ZEFA 4KCDA 4F31B 3IR1A 3HCQA 3OEKA 1LCTA 2ESNA 5BUUA 3IJXB 2F7CA 3KN7A 3W9WA 3MPLA 1XS5A 4IO6A 1IXGA 1A8FA 2F8DA 2NXOA 3MZ9A 3W15C 3ONMA 3FUZA 3UK4A 5CMCA 4U4SA 3PUZE 2W7YA 2UXAA 3LSXA 4G8HA 3TQWA 3IO6A 2R6GE 1QKAA 1IXHA 1MH4A 4FEDA 3FGSA 4RJZA 3MVWA 3KN8A 1MXUA 1AIVA 3IB0A 2HCAA 5AA1A 1IIWA 1R9QA 3UGWA 1Z7ME 3KOTA 4NEDA 1MXVA 4OEVA 4ECFA 5AA2B 3PPRA 3K01A 3TDJA 4ZE8A 4YKKA 4NF6B 2G93A 4RXLA 2A5TA 2OLBA 4M1VA 1O7TA 1IXIA 1OVTA 4IO7A 4Z0IA 1F9BA 5JTYB 1SW5A 4RYAA 4YKPA 3SEUA 2O68A 5LOMA 1GTKA 3MAMA 5I59A 5CMKA 3TMGA 4WEPA 4POXA 1B0HA 3LSLA 3JYRA 4KQPA 4PP0A 5I58A 3PD9A 1LCFA 2ZYKA 4IO2A 4DE8A 4NF8A 2X26A 1P1WA 4FE8A 3G3IA 3Q29A 4XKQA 3EHSA 2GFEA 4DXBA 1WODA 4C1TA 4ND9A 1MDP1 1GVCA 4U1ZA 2BJJX 3LSWA 3TTKA 2VOZA 3EN3A 1URGA 3H4ZA 2XX9A 4YZZA 2XXXA 4Q5TA 2F78A 3T66A 3PUVE 1B2HA 2LAOA 3MWBA 4ELOA 1AMFA 5H8QA 4G2ZA 2ZYOA 2QMXA 3V83A 4XKPA 2Z8EA 1FTJA 1WDNA 2QL3A 1MH3A 2O6AA 3MP6A 4KI0E 5KDTB 3M3KA 4XKRA 4DXCA 1US4A 3PPNA 2XXUA 3IOTA 1D4NA 5M2VA 1JW4A 1GR2A 3QYTA 4ZE9A 1MRPA 1ZMGA 4XXUA 3EF7A 1P1QA 1FQEA 2THIA 3VVEA 4Q8RA 3D4GA 4ZECA 1LAXA 4RA1A 4FIMA 2UVGA 2DXYA 3U92A 3B6WA 3KZGA 4MBPA 4QFPA 4ZEDA 1Y4CA 1B7HA 5DVFA 5EHMA 2H98A 3TCFA 1ZIUA 3ODBA 4BDOA 2Y84A 2Q89A 1N0TA 4P0GA 3OEMA 3TTNA 3HSTA 1VE4A 2VD3A 3EQ1A 2XD2A 4LONB 3U72A 4QSEA 2NWJA 4H8JA 3H03A 1Y20A 5FHMA 1B3GA 4GF8A 1OLCA 3G3HA 4F2QA 1FCKA 1H43A 4MH5A 4U4XA 4GD5A 1MY4A 1VSOA 3GBBA 5H8HB 5ITOA 3O6GA 2X7PA 3LUYA 2O7UA 1YPNA 1Q1KA 4NF6A 1A8EA 4MFIA 4THIA 3KFMA 2E1SA 3VXCA 2ALUA 5JTYA 3FV2A 5B70A 1LAHE 4PFYA 3T96B 4U21A 1PB9A 5B7DA 3TFLA 3KOSA 2I6EA 3G3GA 4NE4A 1URSA 4EF1A 4MLVA 2GHAA 3H06B 3S4UA 1PBQA 3O6HA 2R71A 4R6HA 1B51A 3I5OA 1AL3A 4Q0CA 1J1NA 1ELJA 1S7YA 1H76A 2Q9TA 2O1MA 4E0XA 3LR1A 1SW1A 4F1YA 4MF3A 5H8SA 5TP9B 5AA4B 4F19A 1POY1 3OMBA 2PMSA 1ZLQA 4KFQA 2GH9A 3A3UA 4N13A 4DIGA 3MPKA 3A3CA 1PB7A 3E3KA 1QUIA 5KDTA 1Q35A 2D5WA 1A7LA 4F39A 3FVOA 2O51A 4EQ9A 3H6TA 1USYH 1IEJA 1BIYA 3QK6A 2Z8FA 3T93B 3VLWA 1LFIA 3TZAA 4RY1A 3BKIB 1AH5A 1IITA 4K3FA 4OMBA 1N3WA 3HV1A 4H0WA 3K4UA 3PMXA 4U22A 3U8QA 3HO7A 4LUBA 1POTA 3CG1A 2DSFA 5FTHA 3MUQA 1PDAA 4AB6A 4GRKA 3KEIA 4JWOA 4O3BA 1IQ7A 2D3IA 1XC1A 4NF4B 4KHZE 1USYE 4KD5A 3RY3A 1JW1A 4ISUA 2RC9A 2DYXA 1L5TA 3N6UA 1LGBC 4BDNA 1LSTA 4ZZEA 1QULA 1XVXA 2I3WA 2OJTA 4NTLA 4YMBA 5H8NB 4ZEIA 3VLVA 4ZEBA 3D4CA 3H6WA 3VVDA 2GHBA 1ZBMA 4OZ9A 3O9PA 4H5FA 3MVZA 4QHQA 4GXAA 3DP4A 3TUSA 1NNKA 3SESA 3K6VA 3O2AA 5H8HA 3DP6A 4QFOA 1LFGA 1SI1A 1R6ZA 1I6QA 2HAVA 1BTJA 3RT8A 3RN8A 4HTGA 3V89B 2F6GA 2V3QA 3IORA 4X9TA 4OWDA 2RINA 1JNFA 4PFTA 3IOWA 2DWIA 4FAJA 1UTBB 3TTRA 3OOAA 1SDXA 2V3TA 4H8IA 2Y7PA 3PUYE 2M8CA 1HSLA 1SD3A 1MM6A 3PU5A 2REJA 5FHNA 2I58A 4BDLA 1AOVA 3PGFA 3FD3A 3VVFA 4DDDA 1N76A 3C9HA 2NOOA 2HZKA 4QFLA 4LZ8A 3E13X 1SQYA 5F7VA 4JWYA 5AA4A 1FTOA 1Y1MA 2AYSA 3C33A 4JSOA 2OWSA 3M8UA 2PX1A 1OVBA 3SEXA 4ESWA 4OHNA 3RQTA 1I6AA 4JB7A 2D21A 4X1BA 2DWAA 1P1OA 4YAHX 3MC2A 4YICA 4F18A 4G68B 2XXYA 4Q30B 1TT1A 4R72A 1MQHA 5I2KB 1DPPA 3TKDA 3MBPA 3FJGA 4R2FA 3LC8A 3WAFA 4R9GA 5H8FB 4OXVA 1ANFA 2NUVA 3CVGA 1N84A 1LB8A 2FNCA 3G3JA 1DPEA 4OESA 1JEUA 4TQUQ 2VGQA 2HZLA 2OZZA 3TODA 4BDQA 3C36A 4EF2A 1TWYA 2ZYNA 4H5GA 4H1XA 3TEPA 5L9SA 3ZS6A 4GOTA 1SI0A 3GBAA 1XT8A 1MQGA 1NH7A 5CC2A 4F2OA 1XVYA 3IK6B 3T9UA 1EZOA 3PMVA 5H8NA 4I9DA 1N04A 4KPTA 4EQ7A 4R6YA 3IOVA 3GXAA 3G7WA 1B0LA 4PFUA 3USDA 2CZLA 2UVHA 3SEYA 4U1OA 1B5JA 3OENA 4F3SA 2O7IA 1O63A 2R9JA 3JV9A 5F1QA 3ZKLA 2RKMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DOJA 4E0WA 3S9MC 3OSRA 3VLUA 5IGAA 1NUZA 2ONRA 3ISPA 2QPQA 5CBSA 5AA2D 1SBPA 4KYSA 4X1DA 4PFWA 1QJMA 5ET6A 4LA9A 3THIA 5ISUA 4MEVA 1RYXA 4PGNA 4I62A 2I4CA 1UIUA 1YTVA 4WKMA 1B58A 4NF5A 3C32A 3C31A 4N07A 2RF1A 3KBRA 5HM4B 1KZ8A 5ITPA 4DCYA 1LBBA 3F11A 1TXFA 1FTMA 1KA0A 3BFUA 1B46A 3M3LA 3R26A 2PYYA 2H9BA 2XXHA 3PUWE 4DLDA 4ZEKA 5BWJA 2PT1A 3DM0A 4JWXA 4M4GA 3RPLA 3C4MA 3BFTA 1AWBA 2Y5KA 4MCOA 1B7UA 4I40A 3SZPA 4OETA 2OCUA 2OWZA 2H4IA 3S9EA 2B3FA 2Y7KA 1FSAA 3OO7A 1MQIA 2F7AA 2ZNTA 4GXSB 4AQ4A 4GX4A 2WYPA 1ZKBA 4I8CA 1Y3PA 1YZ0A 3KGCA 1YXIA 4GQOA 2Q2CA 1B6HA 4G68C 2VHAA 1MDQA 1RDZA 4OVTA 1II5A 1EYJA 2P1SA 2F34A 3TTMA 4G68A 3VV5A 2A5SA 5DVJA 2QS2A 2L5VA 2IA4A 5AA2A 4DXUA 2F6PA 5I2KA 1VR5A 1FTAA 2QMWA 1LBCA 2QS3A 2HAUA 3R7XA 4R6KA 3SEWA 5H8FA 3IFAA 4N81A 2B3BA 4IR8A 5IAIA 4TOZA 3FXUA 1M5BA 4AB5A 3IL1B 3U93A 3CI8A 2DWJA 3IOUA 2OWTA 4FATA 5IKBA 2ANJA 3K1MA 1OIBA 3V5AA 3UN6A 1MY0A 1TFDA 2I0BA 4ELQA 3UA8A 2ABHA 4H67A 3K00A 4G8MA 3JZJA 4MMPA 5I2NB 4GIZA 4F29A 5I3SA 3MW0A 1B32A 1FQAA 4F3PA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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