2XD3A

The crystal structure of malx from streptococcus pneumoniae in complex with maltopentaose.
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
ELTVYVDEGYKSYIEEVAKAYEKEAGVKVTLKTGDALGGLDKLSLDNQNGNVPDVMMAPYDRVGSLGSDGQLSEVKLSDGAKTDDTTKSLVTAANGKVYGAPAVIESLVMYYNKDLVKDAPKTFADLENLAKDSKYAFAGEDGKTTAFLADWTNFYYTYGLLAGNGAYVFGQNGKDAKDIGLANDGSIVGINYAKSWYEKWPKGMQDTEGAGNLIQTQFQEGKTAAIIDGPWKAQAFKDAKVNYGVATIPTLPNGKEYAAFGGGKAWVIPQAVKNLEASQKFVDFLVATEQQKVLYDKTNEIPANTEARSYAEGKNDELTTAVIKQFKNTQPLPNISQMSAVWDPAKNMLFDAVSGQKDAKTAANDAVTLIKETL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Molecular Basis of Glycogen Breakdown and Transport in Streptococcus Pneumoniae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTOSE/MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
molecule tags Sugar binding protein
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 132
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xd3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xd3A02
3E9XA 3VE1B 1XHYA 2XXVA 1JQFA 1NNFA 2I6EA 4OZ9A 1IXCA 5H8NB 4R72A 3DP4A 3KN3A 4IO4A 2FA7A 5HPQA 2DOJA 1JNFA 5EHMA 3Q25A 5I58A 2H5YA 3HPIA 4X9TA 3RN8A 5I84A 4GQOA 3V5AA 4UACA 2Z8EA 4MBPA 3OSQA 4P0IA 1MPDA 1M5BA 3K6VA 1B4ZA 5CMKA 1MY4A 3RY3A 1P1QA 5AA2A 1AMFA 3MW0A 4JB7A 4PETA 1L5TA 1RYOA 4F3PA 4IY6A 4ZZEA 2I58A 3K6UA 1SI1A 2I49A 3RTWB 4Q0CA 1JVYA 3DP8A 3IOVA 3VXBA 5DVIA 5AA4B 2NWJA 4I8CA 4WXJA 4BDOA 2X7PA 3ZKKA 4NWDA 2XXWA 2AL4A 3FIRA 4Q5TA 1B3FA 1XC1A 1R6ZA 4DDDA 1ZJLA 3CFXA 2CZLA 5CMMA 1JW5A 4OXVA 3N5LA 5FHMA 1OQHA 3C9HA 2HCAA 4PFTA 3BBRA 4ELRA 1Z7NE 3F11A 4EXLA 4PFYA 3EHUA 1A8EA 1OVBA 4BDQA 4EF2A 1JVXA 3H3GA 3TCHA 5ICQA 2UVGA 1JETA 4FEDA 3SERA 2V3UA 1CB6A 2O7UA 2Y7PA 2DQVA 4YB5A 3U92A 2F7AA 1SBPA 4F2OA 2RKMA 2B3FA 4OWDA 3OOAA 3I3VA 3OO9A 1ZKBA 2YPNA 1LSTA 1YAEA 4XKPA 5DEXA 1A8FA 5K2YA 2Q88A 2XXUA 4I9DA 1SYHA 3C31A 4OETA 1PB7A 2GHAA 1PBQA 1A54A 3S2VA 5H8QB 3HN0A 4F31B 1XVXA 3R26A 3VVDA 1B7HA 1JEVA 5H8FB 1LGBC 2ESNA 4RA1A 3N6TA 5KDTA 4Q8RA 2OCUA 3D4CA 1WODA 2REJA 5HM4B 1FTKA 3WAEA 1H76A 2VD3A 3L6GA 4WEPA 1MXVA 3TELA 3MVYA 3VXCA 3PD9A 4F3GA 4F3BA 4DCYA 1NH7A 2O69A 1AOVA 4EQ9A 4EQBA 4FE8A 3H06B 2O84X 2HAUA 2XXHA 3C35A 3A3UA 4G68A 2Y7WA 1FCKA 3JV9A 3KJTA 2RF1A 1B7UA 3MP6A 1N3WA 3RQTA 5DYHA 1JW4A 2PT2A 1D9VA 2Z23A 1Q35A 5JTYA 3G3IA 5L8DA 1UTBA 1S7YA 1A99A 4C0RA 5JEIA 3EQ1A 3RPWA 3VFJA 4YB6A 1MDP1 1NFTA 4U22A 1DTGA 2Q9TA 2RINA 3CSBA 5CBRA 5CMCA 4QSCA 1N0TA 2I4CA 4RYAA 5FTHA 4ZS9A 2A5SA 1DOTA 3L6HA 3GBAA 3PUVE 3KOTA 1LAGE 4MH5A 1B0LA 1B1XA 3KG2A 2QRYA 2V3TA 1T0KA 1OIBA 1MQGA 4ZDMA 2OBGA 4LZ5A 2Y7RA 4F1YA 1B58A 4R2BA 1XOCA 4G4PA 1VFDA 1BLFA 4ZEKA 1NMUA 1P1OA 3G3GA 3U94A 4GVOA 2QJEA 3KEIA 3OEKA 4QFOA 5CI5A 3BFUA 2REGA 4KPTA 1B3HA 1QUKA 1URDA 4N6PA 5K2XA 1MDQA 4IGTA 3PGFA 3R7XA 1Y4TA 1MM6A 1GV8A 1B4HA 4YMBA 3OO8A 1EU8A 3VLVA 2Z8DA 4XXUA 1UTBB 1B3EA 1MY0A 5AA1A 5TU0A 4FECA 5I2NA 4KCCA 3FJMA 1EZ9A 2OWTA 4NF5B 4IO6A 2QS3A 2DWHA 3TMGA 5JK4A 1TFDA 1NH8A 2DSFA 2F8DA 2UVJA 1SW5A 3TPAA 2XD2A 1MH4A 1MH3A 2I4BA 2XD3A 1NNPA 3RT8A 4DZ1A 2LAOA 1VR5A 3ILUB 1BP5A 1URGA 2RCBA 4HW8A 4YKJA 3GLBA 2Q2CA 1LB9A 4G8HA 1AL3A 4YKKA 4IO5A 4OVJA 4NF6A 1Y3PA 3MVXA 4H0WA 3IORA 5I56A 4M4GA 3TEPA 2P1SA 1DMBA 2DYXA 1R1NA 4GLIA 4Z0IA 5AA3A 1JW1A 3SEXA 4H65A 1MXZA 5I2KB 2GFEA 2D3IA 1MQJA 1B51A 2RC7A 1FQCA 3PUXE 3KBRA 1OLAA 1MPCA 4GIZA 4KCDA 3FGSA 4IO2A 1LCFA 2D5WA 1SYIA 1NNTA 3FV1A 3PV0E 3QUFA 3T22A 4G2ZA 3UIFA 1FQAA 4RPNA 2H25A 4FJPA 2CMOA 3ECRA 4EUOA 3CI8A 1UQWA 2F7CA 1AIVA 4RPOA 2XXTA 3LSLA 4RXLA 3LC8A 3T66A 1B7ZA 5I59B 1B40A 1HSJA 3TZAA 5IAIA 2D21A 3SEWA 2I3WA 2OWSA 3VLUA 4QSEA 1B32A 2HZKA 1AH5A 4LONB 3IOUA 4U1OA 3SEVA 1SW1A 3FVNA 4R9FA 1PB9A 1ZIUA 1LCTA 4OQOA 1UTHA 4LVQA 3THIA 3PPNA 3MUQA 2FNCA 2QL3A 4NF4A 2QS1A 2P2AA 4O3BA 1SW2A 3FATA 3PPOA 5ICTA 1DPPA 5BWJA 4QFNA 1BIYA 4YMAA 3I5OA 1PBPA 4DIGA 3V8XB 3T9HB 3FXUA 3D4GA 4OFLA 3UN6A 4KYEA 1SW4A 2YLNA 1XVYA 4OENA 3ILTB 4PE5B 1H45A 1O64A 1S50A 3LBSA 2GHBA 3CRBA 3N26A 1YPNA 3T9UA 2E1SA 3SEUA 3HHGA 1FQBA 3K0VA 4IO7A 1IQ7A 1DPEA 3KZGA 3K6XA 1MG1A 2X26A 3G3FA 3SDFA 3GXAA 2QS2A 3ZSFA 2OZZA 1TFAA 4XKNA 4OYVA 2VHAA 4AQ4A 4NWCA 3FV2A 2ZYOA 4PP0A 1D3KA 3O6IA 2GH9A 1UTHB 3QUJA 2HQ0A 3IL1B 5F7VA 2F7BA 2O68A 3R6UA 2NUVA 5I58B 4IY5A 3IO6A 3PPRA 4Z7EA 3U72A 4P11A 3FJGA 1Y3QA 1FTJA 3K1NA 4F19A 1Y20A 1H43A 2NOOA 2WKYA 4KYDA 4JSDA 2Z8FA 3C4MA 3PUWE 1HSLA 4LZ7A 3K4UA 5AA2B 3QYTA 1M5DA 3W9WA 2F36A 5FHNA 1F9BA 2DVCA 1ZTYA 4KI0E 3OD7A 2O51A 2UXAA 3PPPA 2ONSA 4POWA 3KSXA 4QRZA 4ZEDA 2OJTA 3KJ7A 3UK4A 2I48A 2DWAA 1B6HA 3O6HA 1US4A 2H99A 4DXBA 1B0HA 3CG1A 2HAVA 3T96B 1B3GA 2R6GE 3W15C 4RNSA 1B3LA 2H98A 3CVGA 4ELOA 4NF8A 3IJXB 3IB0A 4R9GA 3RT6B 3MZ1A 3O97A 3UORA 3GBBA 3H4ZA 1I6BA 4WEDA 4C1UA 2ZXTA 3FZVA 3VDFA 3HV1A 5EYFA 5ELVA 4R75A 4C1TA 3MVWA 1A55A 4E0XA 3VVEA 2XXQA 2QMWA 3IB2A 4YICA 4MLVA 2PX1A 2Q2AA 1ELJA 1SQYA 3K01A 5AE4A 1GR2A 1PB8A 1YTVA 3WAFA 4LP2B 1N76A 4ZE8A 4H6DA 4NMYA 1POTA 1PEBA 4H8IA 3HHFA 1MXUA 1MPBA 3U93A 2DE2A 4X1DA 3JZJA 3TYHA 3N6UA 3G3JA 3MP8A 4NF8B 2RC8A 2ZNTA 2B3BA 1MS7A 1NKXA 1QKBA 1VE4A 3T9XB 4F2QA 2V25A 2UVIA 5DEXB 5F1QA 3FD3A 2F6PA 1MQHA 4BDMA 5IKBA 3MZ9A 3KFMA 4GL8A 1XS5A 1GTKA 4LQ5A 1FQEA 4X48A 4YKPA 5LOMA 4H1XA 4KYSA 3RNNA 4ZE9A 2ONKE 3PD8A 1LAXA 1USYH 3C34A 3IOTA 4KD5A 5KDTB 2HZLA 4H5FA 1P99A 2VP1A 3B6TA 4JDFA 1FTOA 3OEMA 2W7YA 3MJNA 3QAXA 1P1WA 3GZGA 2AIXA 4RK2A 4OTEA 4F29A 1URSA 1FQDA 5J1DA 5H8HA 4ZECA 3FXQA 2F35A 4G68B 1J1NA 5I57A 3C33A 3H6UA 4I1DA 3MWBA 2Y7KA 3OMBA 5JTYB 3CSGA 4KQPA 3FASA 4H67A 2ZMBA 3T93B 1EH3A 2XXXA 5B70A 1MY2A 1NNKA 2DWIA 4GOTA 5A5XA 3IOWA 1RKMA 4GXSB 1LBBA 4I62A 3ONMA 4JBZA 2H9BA 5L9SA 2PT1A 4N13A 4OESA 3PUYE 1NL5A 3C32A 4R6HA 3MP1A 2Y7IA 4ESXA 4U4SA 4BDNA 2F78A 4BLAA 2KLFA 3H6VA 5TPAA 3CR9A 3G3HA 1FQFA 1LBCA 1N3XA 1MQDA 1S9TA 1QVSA 3EF7A 3LSFB 4ZEBA 4BDLA 2O6AA 1D4NA 4BDRA 1BKAA 1MQIA 1IXGA 1IUDA 4F3SA 3RUMA 3PUZE 2XHDA 3RLFE 4HTGA 4MLQA 1D9YA 2P0SA 2HXWA 2XX9A 3P7IA 4M1VA 5I2NB 4THIA 4JXIA 4JWXA 3CIJA 3OENA 4ZZAA 2O1MA 1USYE 2A5TA 3PU5A 4R74A 4DXCA 4EQ7A 1LAHE 1H44A 2QPQA 2UYEA 2F34A 5DTBA 3IB1A 1MRPA 3MPKA 4PFWA 2Q8JA 3BKIB 1LFGA 3KN8A 2QS4A 4GRKA 1LB8A 3UA8A 3USDA 3KOSA 3EHSA 4KFQA 3QXMA 1B5JA 3PMWA 1OQGA 2DP8A 1LFHA 3FJ7A 4KHZE 5H8NA 4FEBA 1WDNA 4GF8A 1ANFA 1I69A 5CC2A 1O7TA 2AL5A 4F18A 1MY1A 4IB2A 4NF6B 1JEUA 4F1UA 1IXIA 5CBSA 3U1OA 4WKMA 5I56B 1IEJA 3FVGA 4F39A 4EF1A 3DELB 1N84A 2FYIA 3K02A 2PVUA 4LUBA 3QK6A 4QHQA 3V83A 3FXRA 1GGGA 3PMXA 2O1LA 4F22A 3T9VA 4YB7A 1MM7A 3M3FA 4FORA 4XIGQ 1TT1A 4Q30B 3TTLA 3TUSA 4LQ2A 3M3KA 1Z7ME 2DWJA 2QSXA 2XX7A 4TLMB 4NE4A 2NXOA 2DXRA 4XKRA 4POXA 1POY1 1MXYA 3KN7A 4AB6A 3TFLA 2ZYKA 1Y1ZA 1DSNA 1SVXB 3UGWA 3CG3A 4MFIA 2VOZA 4HS7A 3M3LA 1M5FA 4N07A 3DP6A 4OEUA 3EPEA 3O9PA 1BTJA 4FATA 3KSJA 3FVKA 5DVJA 4G68C 3C36A 3SETA 2UVHA 2YJPA 4ZEIA 1R9QA 1VSOA 3M8UA 4OEVA 1B05A 4H8JA 1N04A 3VV5A 4EXKA 3TKDA 1ZLQA 2ZYNA 4NF4B 4QFLA 4JSOA 2PBWA 3Q27A 3TAJA 3H03A 3K2DA 3B6QA 2I0BA 4XTCQ 3HO7A 4ZEFA 1SI0A 2F97A 3MPLA 1QUIA 5KCJA 2XXIA 2F5XA 2XXYA 4LA9A 4O3AA 2HFBA 1GVCA 2UYFA 3Q28A 4PFUA 3K6WA 3OO6A 4R73A 3IK6B 5H8QA 3S9NC 3A3CA 3IJOB 3JYRA 4NTLA 4U21A 4GWOA 4R6YA 5H8FA 3H6TA 5CM6A 1LAFE 3KGCA 4RY1A 1B52A 2R9JA 1SD3A 3UP9A 1P1NA 2ALUA 3ODBA 4U1ZA 3H6WA 2XXRA 3S9LC 1FTLA 2V84A 3EN3A 4QF9A 1P1UA 2DVZA 2ANJA 1YCJA 3PPQA 1OMPA 3IR1A 3TTKA 2IEEA 4ECFA 2Z22A 4U23A 5TP9A 3W9VA 4FIMA 3TTRA 3K00A 3TTMA 3E13X 3BFTA 5KCJB 3EHTA 3DLNA 2X7QA 4TLLB 1ZU0A 3IAZA 3LSXA 3TCFA 3DM0A 2V3QA 3RGYA 4FAJA 4OFJA 1M5EA 4UA8A 1LFIA 4RK9A 3O29A 4OERA 5FTIA 2GRVA 2ONRA 4OFOA 3S4UA 3K1MA 1UIUA 2I3VA 3VLWA 1QUJA 2R71A 2VD2A 4F1VA 1MXXA 1II5A 1I6AA 1FTMA 4QFKA 4DXUA 2OLBA 3SKPA 1IXHA 1XT8A 5TP9B 3VVFA 3FVOA 3MQ9A 1CE2A 3ZKLA 5EHSA 3B6WA 3TQLA 3RTFB 4GD5A 3PMVA 5DT6A 3O28A 1A7LA 3G3KA 5HBCA 1N7WA 2DE3A 4LZ8A 1SDXA 3MZBA 1B5HA 4YAHX 3U8QA 2I0CA 3OO7A 4NF5A 3E3KA 5B7DA 3OXNA 3B7DA 4ESWA 1IZ1A 3I6VA 4GFRA 4G8MA 2M8CA 2O7IA 1QULA 4RJZA 5L9MA 3FUZA 4R2FA 1PC3A 4G77A 1IIWA 3OELA 3CFZA 4L17A 5ITPA 2ABHA 4DLDA 3MVZA 5CRYA 1EZOA 1Y9UA 1PDAA 3V89B 4ISUA 4XKQA 3MBPA 4JWOA 4QFPA 4NEDA 4X1BA 4KR5A 1WVJA 4ELQA 4DCXA 1Y4CA 3TDJA 5ITOA 5AA2D 5DVFA 2NVUB 2THIA 4YU0A 1HSEA 2Q89A 4O3CA 4TOZA 2HEUA 5H8SA 1KWHA 3ZS6A 1B2HA 3S9MC 4U2RA 5M2VA 3HCQA 1ZBMA 4JWYA 3MC2A 4MF3A 1O63A 3Q29A 1A40A 3N94A 1TXFA 4EDPA 1B5IA 1QKAA 2QMXA 3O6GA 2ZYMA 1H3DA 4OMBA 3A09A 4H5GA 2PYYA 5I2KA 3S9EA 3LR1A 1TWYA 3G7WA 5H8HB 3HSTA 4G8NA 4ONYA 4YKIA 1B9JA 2OK2A 1B46A 5I57B 4GXAA 3SESA 3LSWA 3TQWA 2B65A 1Y1MA 3LUYA 2G93A 1IITA 2G29A 2DXYA 4OHNA 3IO4A 1B1HA 2XX8A 1MY3A 5FHOA 4YZZA 5CMBA 3SEYA 2E0SA 4HCWA 3Q26A 1QJMA 5A5XB 2XXPA 3O2AA 1QW0A 4IGRA 5I59A 1ATGA 2PMSA 4DE8A 4LATA 4ELPA 5BUUA 3TODA 1VFEA 1ZMGA 4QSDA 5L9OA 1RYXA 4U4XA 1FW0A 1OVTA 4PQJA 5TPAB 4AB5A 3QIMA 1US5A 2V93A 4GL0A 4IO3A 1N7XA 3TCGA 3QSLA 2DS9A 3O66A 4E0WA 2ZNSA 3H7MA 4P0GA 2VGQA 1EZPA 1MXWA 1Y3NA 2AYSA 2DE4A 4TQUQ 3CFLA 5KZTA 2H4IA 2ZNUA 3TTNA 4R6KA 3E4RA 4K3FA 1UIVA 4ND9A 4HCYA 2A5TB 2BJJX 2RCAA 1OLCA 2IA4A 2RC9A 3IX1A 1Q1KA 3OSRA 3AXFA 3K1PA 1I6QA 2F6GA 5ISUA 3MAMA 1LLSA 1DTZA 1M5CA 1R9LA 2Y84A 5AA4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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