2XD3A

The crystal structure of malx from streptococcus pneumoniae in complex with maltopentaose.
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
ELTVYVDEGYKSYIEEVAKAYEKEAGVKVTLKTGDALGGLDKLSLDNQNGNVPDVMMAPYDRVGSLGSDGQLSEVKLSDGAKTDDTTKSLVTAANGKVYGAPAVIESLVMYYNKDLVKDAPKTFADLENLAKDSKYAFAGEDGKTTAFLADWTNFYYTYGLLAGNGAYVFGQNGKDAKDIGLANDGSIVGINYAKSWYEKWPKGMQDTEGAGNLIQTQFQEGKTAAIIDGPWKAQAFKDAKVNYGVATIPTLPNGKEYAAFGGGKAWVIPQAVKNLEASQKFVDFLVATEQQKVLYDKTNEIPANTEARSYAEGKNDELTTAVIKQFKNTQPLPNISQMSAVWDPAKNMLFDAVSGQKDAKTAANDAVTLIKETL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Molecular Basis of Glycogen Breakdown and Transport in Streptococcus Pneumoniae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTOSE/MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule tags Sugar binding protein
total genus 132
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xd3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xd3A02
3FJMA 1P1NA 2DS9A 3IX1A 3KFMA 1R1NA 5F7VA 4P0IA 3C34A 4MF3A 1DOTA 3IL1B 3E9XA 3UN6A 1RKMA 1XVXA 4HTGA 5HBCA 4I62A 3PV0E 3IAZA 3Q29A 1H45A 4YKPA 1P1OA 5AE4A 2QSXA 4F22A 1GTKA 1N3WA 4DXUA 1B5HA 1B40A 2F7AA 3Q28A 4IO6A 4FJPA 3S9NC 4POXA 2UVGA 1XVYA 1O64A 1JQFA 1N0TA 1MY0A 3FGSA 4UACA 3UGWA 4R9FA 2DOJA 2F97A 4OEVA 3RQTA 1NFTA 2Y7KA 4TLMB 1D4NA 1ZIUA 3R6UA 3QUFA 4QFOA 1FW0A 5H8HA 4DDDA 2O1MA 3EQ1A 2UYFA 3HHGA 4FIMA 3B6QA 1WDNA 2ZXTA 2RINA 4PFWA 1F9BA 3PPQA 1EZPA 3N5LA 5AA3A 5F1QA 2H99A 4NTLA 2XD3A 1LBCA 4QF9A 4FAJA 3B6TA 1NH8A 5A5XA 4G68A 2O69A 1MH4A 3TQLA 3W15C 4DXBA 2CMOA 3PPNA 1M5CA 1FQCA 1QVSA 4FEBA 4YAHX 2O68A 4GXSB 4OFOA 2VD2A 1N7XA 1B7ZA 3VVDA 1OQHA 2VOZA 5DEXB 5H8NB 2I4CA 3U8QA 3K2DA 5CI5A 1ATGA 5BUUA 5AA2B 3EHTA 3G3IA 4PFYA 1FTMA 5K2YA 2F7CA 4KI0E 4PQJA 4ZS9A 1NNFA 4OMBA 4GXAA 1BKAA 4Q5TA 2AIXA 2HZKA 5I56B 2Q2AA 4ZDMA 4H8IA 5KDTA 2RC8A 1A55A 3K01A 3QXMA 4POWA 4F19A 4R75A 2I4BA 1VFEA 2F7BA 2IEEA 4BDMA 4F1YA 3DP6A 3LUYA 4R9GA 1B1HA 3T66A 1JETA 3C9HA 1SW5A 3CFXA 3CSBA 4KCCA 2REGA 3KSJA 3A09A 2Y7RA 1LB8A 4R72A 3GLBA 2GHBA 1Y4TA 3K1PA 1B05A 3TODA 3MAMA 1H43A 1DPPA 3TTMA 3UORA 3MUQA 2ONSA 2G93A 3K4UA 3KN3A 1MQHA 4NF6B 1MY1A 2I58A 2DQVA 2I49A 1UTHB 1H3DA 2OLBA 4MFIA 1A7LA 4WEPA 3MP8A 1XOCA 1P1UA 3M3KA 3PMWA 3UK4A 1LFIA 3ZS6A 3S9EA 4KQPA 3ZKLA 3QIMA 2D21A 1US5A 1POTA 2CZLA 4IGTA 3M3LA 1LFGA 3H6VA 3DELB 2ALUA 4YZZA 1SYIA 2V25A 5DYHA 1FQBA 5ISUA 2XXIA 1NH7A 4ZEFA 3DP4A 4F2OA 4H5FA 3LC8A 3PMXA 3BFTA 3O29A 1LAXA 4GF8A 4GL8A 2XD2A 4DIGA 1SW1A 5EHMA 3IJOB 4U21A 3U1OA 1MH3A 5L9SA 4IY5A 5L8DA 4KHZE 3F11A 3H03A 5LOMA 3PD8A 1IXGA 4QFPA 2FA7A 1FTKA 1PBQA 3PUWE 4KYEA 4EUOA 2F8DA 3BKIB 4DLDA 4OENA 4U4SA 3DM0A 2F78A 1FCKA 3K0VA 1ZKBA 3IOTA 3UP9A 2E0SA 1LAGE 4X48A 3V83A 1LAFE 3PMVA 4ZE9A 5CBSA 1N3XA 2DE2A 4OXVA 3RPWA 2YJPA 1N84A 1UIVA 2V3TA 2V3QA 1B9JA 4M4GA 1M5BA 3HSTA 2Y7IA 4O3AA 3QSLA 4FATA 1AIVA 3DLNA 2F34A 5I2KB 3PPPA 2HXWA 2O7IA 1FQEA 3A3UA 2R71A 1ZTYA 2O1LA 2B3BA 4QFNA 1UQWA 3C4MA 5FHMA 3IOUA 2AL5A 3A3CA 4YMAA 2W7YA 3H06B 3FD3A 1LAHE 3TAJA 3VLVA 1ELJA 3C35A 3CVGA 5M2VA 2A5TA 4F29A 1MDQA 2QS2A 4XKPA 1FQFA 2BJJX 4R6KA 2OCUA 1PB8A 3SERA 3WAFA 4BDLA 2B65A 5FTHA 3PUYE 5H8NA 3KZGA 4AB5A 1PB7A 4F1VA 2D5WA 2PT2A 3VLWA 3O6IA 3E3KA 5AA2A 1L5TA 4BLAA 1IXIA 3I5OA 4DZ1A 4F3SA 1Y1ZA 1PEBA 3K1NA 2Q89A 1H76A 1SYHA 1ZJLA 5I56A 3T9UA 1LCFA 4JWXA 3V89B 3SEWA 1MQDA 2I48A 1D9VA 1N7WA 5L9OA 3MWBA 4BDRA 2Y7WA 3KN8A 4ND9A 2VGQA 3TCGA 1LGBC 1AL3A 1YPNA 3FUZA 5ELVA 3C33A 2XXPA 4GLIA 2XX9A 3TUSA 4JDFA 4LP2B 3BFUA 1MQIA 5ICTA 4OFLA 2Q88A 2OJTA 5TP9B 3S9LC 3L6GA 2XXRA 3TEPA 1H44A 4YB7A 3TMGA 3K02A 2O6AA 1A8FA 1POY1 1Y1MA 4NEDA 3AXFA 3VE1B 3OENA 2ESNA 4ELPA 3RN8A 1D3KA 1MPCA 4ZE8A 2GRVA 5I2NB 3WAEA 2XXVA 1MPBA 1OLCA 2RF1A 1MM7A 3BBRA 2P0SA 5HPQA 5I84A 1PC3A 2UVHA 3Q25A 4O3BA 4XXUA 5HM4B 1DPEA 3O66A 3U94A 4DCXA 2RCAA 4G8MA 3W9WA 4OETA 2OK2A 1IEJA 1DMBA 2V84A 3K6VA 3N94A 1OQGA 3KSXA 4GFRA 4NF4B 2DP8A 4LQ2A 1B6HA 1ZU0A 5I57A 3TCFA 1CE2A 2ZNTA 4YB5A 4LVQA 1MPDA 3RT8A 5H8FB 3IB0A 1I6BA 3H6UA 3CG3A 4C1TA 3FIRA 4FECA 4YKJA 2F6PA 3FXUA 2DWHA 2ZYMA 1B3LA 1IXCA 5DVFA 3MJNA 1EH3A 1QUJA 4UA8A 1IIWA 3MVYA 3MW0A 4I9DA 4EF1A 4YMBA 3RT6B 3Q26A 3SETA 2O84X 3TQWA 2DWIA 3CFLA 3OO6A 4NMYA 5I2KA 2ZYNA 1VR5A 4HCYA 3CFZA 4GVOA 4KCDA 3O2AA 2HEUA 1MY4A 3R26A 5ICQA 4RA1A 3OO7A 2A5SA 2DVCA 2A5TB 4MH5A 3RGYA 1AOVA 2UXAA 2PBWA 4ZEBA 3OO8A 4OEUA 1Q35A 1IUDA 3GXAA 3PUXE 3TTLA 5ITOA 1Y4CA 2DVZA 2R6GE 3KEIA 3IOWA 4NWDA 4L17A 1PB9A 2B3FA 2ANJA 3IJXB 5JEIA 1A54A 2QS4A 1HSLA 1ANFA 4G8NA 3IB1A 3CIJA 2X7QA 4RXLA 4F2QA 1Y3NA 1JEUA 3RUMA 3VXBA 3TTRA 1I6AA 3G3GA 4H5GA 5KCJA 3EN3A 1DTZA 2ZNUA 2H9BA 1NMUA 2RC9A 2Z8FA 3EF7A 3KJTA 4NWCA 4G8HA 4RNSA 4U2RA 3MVZA 3RY3A 3MP1A 2XXHA 4NF5B 3K6UA 4KR5A 1B7HA 3HV1A 1YAEA 1OLAA 1YTVA 3I6VA 3IB2A 3U93A 3MPLA 3G3HA 1AH5A 2DE4A 5FHOA 4P11A 4X1BA 3IO4A 4RYAA 1QUIA 3EHUA 2HQ0A 3PUVE 3TPAA 3JV9A 1N76A 1OMPA 5I59B 3HPIA 2RKMA 1MXVA 2VHAA 4H8JA 3ZKKA 1XS5A 3Q27A 5TP9A 2DSFA 1NKXA 2QL3A 1MM6A 2XX8A 4Q8RA 4LATA 2AYSA 4G2ZA 4GWOA 1P1WA 3HO7A 5JK4A 5H8QA 3TELA 1Z7ME 1QULA 5CMBA 2FYIA 1FTJA 4KPTA 4YKKA 3KN7A 2HAVA 3T93B 2DWAA 1IZ1A 1EZ9A 4JSDA 1IXHA 4EXLA 5I2NA 1MQJA 4TOZA 5B70A 3OEKA 1JEVA 2XXWA 3H4ZA 3PPRA 3SEYA 4HCWA 4OHNA 4EF2A 3D4GA 4GD5A 1SI0A 2PYYA 1B5IA 3USDA 1SDXA 2Z8EA 4DE8A 4OESA 3FV2A 4R6YA 4K3FA 1AMFA 3V5AA 5EHSA 5I57B 5KZTA 4OVJA 3OXNA 1B46A 1SW4A 2QJEA 4LUBA 4HS7A 3MQ9A 4LZ5A 4NF4A 3S2VA 4IY6A 4LA9A 4XKRA 3MZBA 2QMXA 4RJZA 4THIA 4GQOA 2ZMBA 4XIGQ 2F6GA 5H8FA 4U23A 4RPOA 3TDJA 1SQYA 3LSLA 4EXKA 4Z0IA 2XX7A 5BWJA 1BP5A 3ILUB 4M1VA 3OO9A 3TFLA 2AL4A 3MPKA 2ZYOA 3ODBA 2DE3A 3HCQA 3KOSA 1MRPA 5CRYA 2FNCA 5DVJA 4OFJA 2VD3A 2PVUA 2UVIA 3N6UA 4IO3A 2GFEA 4NF8B 3MBPA 3KJ7A 3N26A 1SW2A 4O3CA 4JB7A 4FE8A 1B3EA 4IO2A 2DXYA 3H3GA 3CG1A 1BIYA 1URSA 2F36A 4JXIA 3FJGA 3N6TA 2O7UA 1OVTA 1Y3QA 3CI8A 4PE5B 3RTFB 4RY1A 3MZ9A 4ZZEA 2R9JA 3RTWB 4G68C 3V8XB 1MXWA 5TPAA 1URGA 3SEXA 4E0XA 2G29A 5CC2A 4ZEIA 5K2XA 4YB6A 1OVBA 5KCJB 1B0LA 1NNPA 4PFTA 1GV8A 3GBAA 1JNFA 1WODA 2QMWA 1ZBMA 4BDOA 4LZ7A 4LZ8A 2X26A 2OWSA 3K6XA 3P7IA 4F31B 2V3UA 1UIUA 1MG1A 3SKPA 3PGFA 2XXXA 2NOOA 1B32A 1M5FA 4F3PA 3IO6A 1SI1A 4NF5A 1A8EA 2O51A 3VV5A 1SVXB 4G4PA 2PX1A 2LAOA 2PMSA 1MXUA 4IO7A 1USYH 2HAUA 1LFHA 4ELQA 1FQDA 3JYRA 4JWOA 1R6ZA 1GVCA 1Q1KA 3T96B 1B1XA 2OBGA 5JTYB 1GGGA 4GL0A 4P0GA 4PETA 4MLVA 1NNKA 5I59A 1P99A 3PUZE 4AQ4A 3FATA 1A40A 2NXOA 4WKMA 3ONMA 3VVEA 3QYTA 1B3GA 3O6GA 1BTJA 4N13A 3G3FA 5H8QB 3DP8A 4BDQA 5CMCA 4RK9A 3PD9A 4BDNA 3O28A 4FEDA 1MXYA 4EQ9A 2Y84A 3T9HB 1OIBA 5AA4A 1UTBB 1S7YA 4OZ9A 4F39A 1Y20A 3TYHA 4OQOA 3TZAA 2YLNA 3T9XB 1D9YA 4OERA 4OTEA 4H0WA 4QFLA 3TCHA 2I0BA 2VP1A 4KD5A 3UA8A 1JW5A 3O9PA 1MQGA 2XXYA 3O6HA 3S9MC 1R9QA 4GIZA 3U72A 1JW1A 4I8CA 4EQ7A 4ESXA 3FZVA 3C36A 3L6HA 4DCYA 5J1DA 2HCAA 5ITPA 4LQ5A 4H1XA 2H4IA 1LCTA 3K6WA 1B3HA 1USYE 2Q2CA 1DTGA 3RNNA 4GOTA 5L9MA 3T22A 4KYSA 4MBPA 4R74A 3VLUA 1LBBA 1XT8A 1TFAA 2ZYKA 3PPOA 1MY2A 1TT1A 2DWJA 2ONRA 1XC1A 2F35A 2H5YA 4H6DA 1JVXA 3GZGA 4ESWA 4ZECA 4ELRA 4OWDA 3OSRA 2REJA 3CSGA 3C31A 3M3FA 4ECFA 1VE4A 4U4XA 4NF8A 4C0RA 4QRZA 1QKAA 3FVKA 1B0HA 3VDFA 3H7MA 1P1QA 2E1SA 1QKBA 5CBRA 2XXUA 4F18A 5DTBA 5TPAB 4OYVA 4I1DA 3PU5A 1EU8A 1MXZA 1B58A 1MDP1 2PT1A 3MZ1A 3R7XA 5AA1A 1SBPA 1SD3A 1ZMGA 4ZEDA 2ONKE 4QSCA 4PP0A 4X1DA 3TTNA 5I58B 1M5DA 1VFDA 1S9TA 3SESA 1S50A 3LR1A 1B4HA 1N04A 4Z7EA 2X7PA 3G7WA 3OD7A 4H67A 4HW8A 1M5EA 5IAIA 2QS3A 1JW4A 3ZSFA 3THIA 1GR2A 2I6EA 2Q8JA 4XKNA 2DYXA 1O63A 2WKYA 2Z23A 2ABHA 4NE4A 1PBPA 1TWYA 1RYOA 3VFJA 3VXCA 5IKBA 1B3FA 3LSWA 4ONYA 2V93A 3TKDA 5AA2D 2OZZA 4LONB 4TLLB 4FORA 2H98A 3VVFA 4XKQA 3CRBA 5JTYA 3O97A 3QUJA 1O7TA 1B51A 2QS1A 4E0WA 4U1OA 3KG2A 4Q30B 5CMMA 3MVWA 4AB6A 3MC2A 3IOVA 2RC7A 4IO4A 2D3IA 2RCBA 2YPNA 5AA4B 4JBZA 1WVJA 4IGRA 1IQ7A 1B7UA 4GRKA 3IORA 1UTBA 4G77A 4R73A 4QSEA 1ZLQA 4IB2A 3EPEA 2IA4A 2THIA 4R2BA 5B7DA 1I6QA 4R2FA 5EYFA 1DSNA 4WEDA 5TU0A 1R9LA 1QW0A 1YCJA 2Z8DA 3KGCA 4KFQA 1NL5A 3HHFA 1BLFA 2F5XA 3TTKA 4JWYA 1A99A 3FXRA 2QPQA 3OELA 2ZNSA 1JVYA 3LSFB 1NNTA 2NVUB 1PDAA 3C32A 4XTCQ 3LBSA 3JZJA 3KBRA 4QSDA 1FTLA 3K00A 2I3VA 3FVOA 3SEUA 4JSOA 3GBBA 2XXQA 4DXCA 3H6TA 4C1UA 3IR1A 5H8HB 3ECRA 5FHNA 2M8CA 4KYDA 2DXRA 4R6HA 4U1ZA 4WXJA 1TFDA 4QHQA 4QFKA 1FQAA 1B52A 3B6WA 3OOAA 3QAXA 1QJMA 3S4UA 3G3KA 3IK6B 3EHSA 3LSXA 5CMKA 4TQUQ 3MVXA 3OMBA 4ELOA 2Q9TA 5A5XB 4YICA 4G68B 4EQBA 2NUVA 5H8SA 1B2HA 1HSEA 1TXFA 4EDPA 4YKIA 3FVNA 3SDFA 3M8UA 3D4CA 1KWHA 1T0KA 3FJ7A 4RK2A 4RPNA 1J1NA 5DVIA 3U92A 2H25A 1EZOA 3T9VA 2HFBA 3W9VA 2I0CA 1LSTA 3FXQA 1B5JA 4X9TA 2XHDA 4U22A 5DEXA 1LB9A 2UVJA 2OWTA 2UYEA 5CM6A 1HSJA 5I58A 4Q0CA 1Z7NE 2I3WA 4H65A 5KDTB 2Z22A 1US4A 3KOTA 4MLQA 1QUKA 4F3GA 3CR9A 3K1MA 3FVGA 2QRYA 4F3BA 1VSOA 2KLFA 4N6PA 3FV1A 1Y9UA 1MXXA 1IITA 1RYXA 3OSQA 1I69A 4ISUA 3E13X 3ILTB 1URDA 3H6WA 1MY3A 1FTOA 4YU0A 2GHAA 3UIFA 1II5A 3G3JA 3FASA 4IO5A 1MS7A 2HZLA 5DT6A 2Y7PA 2XXTA 4ZZAA 2P1SA 1CB6A 4ZEKA 4N07A 4F1UA 2P2AA 2NWJA 5FTIA 2GH9A 3RLFE 4NF6A 3E4RA 4PFUA 3I3VA 1B4ZA 1XHYA 3MP6A 3QK6A 3B7DA 3OEMA 1UTHA 3HN0A 1LLSA 1Y3PA 3SEVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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