2XJWA

Lysozyme-co releasing molecule adduct
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME C
publication title Corm-3 Reactivity Toward Proteins: The Crystal Structure of a Ru(II) Dicarbonyl-Lysozyme Complex.
pubmed doi rcsb
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2xjwA00
3A93A 1YKZX 1LYZA 1OP9B 1VDPA 4N5RA 1B5ZA 1HFYA 2CGIA 3P68A 4HP0A 5L3IA 1BGIA 5LA5A 4WO9A 4BS7A 2Z19A 1EL1A 1UUZC 4IJ4A 4DT3A 1NMMA 1FKQA 1B5UA 1G7LC 1GXV2 4H9FA 1YILA 5KXRA 5IHGA 5DM9A 4I0CA 194LA 1GF5A 1MLCE 1LSGA 1JUGA 1NKHA 1YANA 3B0IA 1GF4A 4HTQA 1OUIA 1B7SA 3A90A 3WL2A 3WPJA 1GFEA 1BVKC 5KXTA 2ZIJA 4GN5C 1JPOA 1XEKA 1IY3A 4PPOA 1HMKA 4WLXA 4H1PA 1H6MA 1JKAA 4H9CA 2LZTA 5A3ZA 1XEIA 4XENA 2Z37A 1C46A 1GE1A 2NWDX 2D6BA 1XEJA 5FCPA 1REZA 5C6JA 1SQ2L 3B0KA 4LYTA 2BQAA 1IP1A 3N9CA 5DN4A 4ANRA 1JTTL 2D91A 2XBSA 3J4GA 4N1EI 4CGEA 2MEGA 4PRUA 1JJ1A 1IORA 1HELA 4UWVA 1TCYA 2XTHA 1P2CC 5LYMA 1CKGA 4DD2A 5I4YA 3A95A 1RI8B 5FELA 4H9AA 4QEQA 1LJFA 3A6BY 3BKVA 4W96A 2BQBA 5D5CA 4GCCA 2YBNA 4OWBA 3W6AA 4WMGA 1LHJA 1BB5A 3OJPA 1IC7Y 2FYDA 4ETAA 5KXNA 3A34A 4H9EA 3TXIA 1UCOA 1LZEA 1JTOL 4GCEA 1GB9A 1IP6A 4WL6A 1RCMA 2BQDA 2LYZA 2XBRA 1GFJA 2MEEA 1IWTA 4Z3MA 5L9JA 4OWCA 1IEEA 1WQPA 5KXZA 5LIOA 4OOOA 1GF0A 5IDDA 1REXA 4GCBA 1BVXA 5I53A 4DC4A 4ETEA 5LVGA 4ZIXA 1C45A 1LMCA 4TWSA 3FI7A 3T36A 2G4PA 3CSQA 5B05A 1OUAA 2HEDA 4PHIA 1F10A 4B49A 3TXHA 1KIRC 1LSYA 3RZ4A 3AZ5A 3LYZA 1DKJA 1DPXA 1GF7A 1XGUC 1QDRA 1YL1X 5F16A 4B1AA 2DQEY 1J1OY 4ZEEA 3WU9A 3IWRA 1JIYA 1HSWA 1NQIA 1BB3A 4LGKA 4ML7A 1FLWA 2F2NA 1FKVA 1NWGA 5LVKA 4W94A 3ZVQB 2BQCA 4AXTA 1I56A 1HEWA 2Q0MX 4NGKA 9LYZA 3ATOA 4B4EA 3A94A 2HU3A 4R6CA 5KXMA 1GFTA 5B06A 5B1GA 2BQEA 4HJZA 2DQCY 3HFMY 4H91A 4RLMA 4E3UA 4NGLA 1LMOA 3TXFA 1JEFA 3WUAA 2Z39A 4BAPA 4EOFA 1LHHA 3ATNA 1JISA 4NSGA 1UACY 4H9HA 4PRQA 1HEQA 2H9JA 1B7MA 132LA 5KXLA 2BLXA 1B7NA 1IY4A 1IC5Y 2MEAA 1IC4Y 4LT2A 5F9UA 5C6LA 4OWHA 3GXKA 1WTMA 5DN5A 2X0AA 3A96A 5APFA 7LYZA 4KL7A 1LJGA 1GDXA 1F0WA 3M18B 3WU8A 4NHPA 4XJGA 1LZTA 2EPEA 3D9AC 1IP4A 1LZ9A 4NHIA 1LZ6A 5HLLA 1E8LA 1JSEA 2W1LA 5F9XA 4LZTA 154LA 135LA 1IP3A 1GFUA 3D3DA 3HBDA 1LZ5A 4UWNA 4H9IA 4WG7A 3A6CY 4RW2A 1HF4A 4KPMA 4OWEA 2ZQ4A 4YOPA 1INUA 3CB7A 1HHLA 3EBAB 1A4VA 4H8XA 4HJVA 2DQAA 1DKKA 4OW1A 1GD6A 5KY1A 4CHXA 2CJLA 4H9BA 207LA 3WYHA 1MELL 5II3A 1QUSA 2EKSC 3A92A 2W1YA 3WPKA 2D4JA 1AM7A 1LJ4A 4L41A 1IX0A 4BAFA 1XFPL 1V7TA 3CQLA 3EXDA 4NSJA 1GF9A 4LT3A 4H94A 1UA6Y 1ZVHL 4M6DA 1IOCA 1IWXA 1D6QA 3A3QA 4TX7A 3WUMA 1LZ4A 2D4IA 1LSEA 4NWEA 5EBHA 5I4XA 1IR8A 4WM4A 4WLTA 1QSAA 3WUNA 1Z55A 1HENA 2YBJA 3AYQA 4QDNA 3ULRA 2Z18A 2LHMA 5LAGA 1GF8A 1JTPL 1GBYA 1GB3A 1WQOA 1YAOA 2HUBA 2IHLA 5ILCA 4UWUA 2DQGY 4LYOA 1YKYX 5APCA 1FN5A 6LYZA 3ZVQA 1C7PA 1QUTA 2BQGA 4NGYA 3BKHA 1B9OA 1FLUA 1XGPC 3LHMA 1B7QA 3P4ZA 1GE2A 1RE2A 1XGTC 1WQMA 3A91A 1LHMA 3AJNA 1QDTA 1LSDA 4GLAA 3ZEKA 4M4OA 1D0KA 1GBXA 1H87A 1BB7A 1LJKA 1TAYA 2WARA 1TEWA 1UBZA 1IR9A 5KXYA 5KXWA 2ZQ3A 4GCFA 4XADA 5ILFA 4Z98A 2I25L 3AGGG 3W6EA 1FLYA 1QTKA 5D5FA 1CKHA 1AZFA 2BQOA 4GN4A 1GBSA 5C6IA 193LA 1CJ9A 5FHWA 1IR7A 1F6SA 3KAMA 1SLYA 4H8YA 3HBEX 4XJBA 3EMSA 1G7HC 3QY4A 1T3PA 4TTDA 1LMAA 1LHLA 1UIEA 5K7OA 5KXKA 2ZNWY 1GFHA 1WVVA 1GB2A 1DPWA 1GEVA 1UICA 4P2EA 2EIZC 1LMQA 2ZILA 2Y8PA 2HEEA 3OK0A 1LJJA 1HMLA 1IOTA 3W6FA 1W08A 1ZV5L 5LVJA 5T3FA 3LYMA 1HEMA 4J1BA 1IOSA 1LKRA 2C8OA 1BWIA 4J1AA 3RW8A 4XJDA 1YAMA 1IIZA 1D0MA 3E3DA 5LYTA 4NGVA 1GB8A 4HTNA 2GV0A 3WH1A 4G4HA 2HEFA 4BADA 1B5VA 2HECA 2MEBA 2ZWBA 4DD3A 1UIBA 3G3BB 2CDSA 5IELA 1LSPA 3TXDA 1GHLA 1UIHA 1PS5A 5I4WA 1CJ6A 2A7FA 1LJHA 2G4NA 2F4AA 2DQIY 5FSTA 1PZYA 5KXPA 4XJFA 3P66A 4CJ2A 1BB6A 5LA8A 1GBWA 1GFVA 2EQLA 1HFXA 4Z41A 1GB5A 1YAQA 3LN2A 5KKIA 1GE0A 1GAYA 5M1YA 4TUNA 2ZIKA 1LMTA 4LYBA 4XJHA 4H8ZA 4ET8A 1VAUA 3FE0A 5KKJA 1D9UA 4CFOA 3AW7A 1DZBX 3AB6A 3WVXA 1KXWA 1IWWA 8LYZA 4N8ZA 4GN3A 4J0LA 2VB1A 4A7DA 4H90A 1BWHA 3CT5A 3W6CA 4DD1A 5J7CA 5F81A 1QIOA 4Z46A 153LA 1YKXX 1C10A 1I20A 4HTKA 1YIKA 4RW1A 4KXIA 2CWIA 2DQDY 2H9KA 4AGAA 3A8ZA 2HTXA 2BQIA 1FLQA 1LZRA 1VEDA 3LYTA 1LHKA 4HJYA 1IWZA 4XJIA 4G4BA 4C3WA 1B7PA 4NGJA 4G49A 1HEPA 1WTNA 4XN6A 1NDGC 1LSBA 1GFAA 1REMA 2YBLA 1EQEA 1G7IC 1AKIA 1JJ0A 1A2YC 1ZMYL 3P64A 1XSFA 1D6PA 1BB4A 1CJ7A 5DLAA 1OUCA 1TDYA 5KXOA 1UIDA 2PC2A 1OUFA 1LSNA 1O23A 3RU5A 1BHZA 1JJ3A 4WO6A 4RLNA 1UIAA 2BQLA 4H92A 1EQ4A 4DYGA 1DQJC 1B5XA 4LFXA 5HNCA 1IP2A 2LYMA 2YSSC 1GDWA 3AGIA 1IP5A 1NHEA 1ZVYB 5HNLA 4MR1A 1GBOA 3TXGA 5KXXA 3AZ6A 1N4FA 4WM6A 1IP7A 1HERA 1LMNA 3T6UA 1LSFA 1IO5A 3TXKA 4WM1A 2BQMA 4X3BA 1C43A 1GBZA 2F4GA 1GFGA 1RFPA 3TMWA 1LJEA 4NHTA 2Z2FA 4LYCA 3TMUA 5I54A 3A67Y 2LYOA 1LSCA 2ZYPA 3AZ7A 5LVHA 5LAFA 3AZ4A 2DQJY 2DQHY 1LJ3A 1LMPA 2G4QA 4ETCA 5APEA 1OUDA 2DQFC 4ZFPA 2YBMA 3B6LA 4YM8A 1UIFA 2MEHA 4DD0A 1UIGA 1LZNA 4NGOA 4DD7A 1YROA 3CT1A 1NBYC 4HSFA 4NHQA 1NDMC 4QGZA 1LTMA 1IWVA 1LAAA 4EMNA 1QTEA 1JITA 1F6RA 4LFPA 2N5ZA 5KXSA 1DXJA 2BQHA 4TSBA 3TMXA 4B0DA 3WU7A 5AMYA 2A7DA 2YDGA 1GPQC 1CJ8A 1B2KA 1UC0A 1DI4A 1JKCA 3GXRA 3TMVA 2YBIA 1DI3A 5L3HA 2C8PA 4NSHA 4NGZA 4FJRA 3EO5A 3RT5X 1FDLY 4XYYA 3CSRA 1JKBA 4HPEA 2MEIA 1XGQC 1LPIA 1VATA 4N9RA 3A3RX 1LZCA 1B7LA 1LKSA 4PJ2C 4D9ZA 2XJWA 4NFVA 1GFKA 3WVYA 3WW5A 1LZ1A 1DI5A 4YEOA 4ETBA 1IOQA 1HEOA 1LZGA 2FBDA 4LYMA 3P65A 1LZ8A 2HEAA 4DDBA 1YAPA 1C08C 4NHSA 1HC0A 1GFRA 1OUBA 2F30A 2BQFA 3QNGA 2I26L 5KJ9A 1J1PY 1B0DA 4MCKA 5B1FA 1OQMA 2B5ZA 1GB0A 3AGHA 4NSIA 4B4IA 4B4JA 3WPLA 3LYOA 1IWUA 1LZDA 1QQYA 1WQRA 2MEFA 4NIJA 2ZNXY 1LZBA 1GE4A 1YL0X 1OUHA 2FBBA 1CNSA 3TXEA 1BQLY 2D4KA 3W3EA 4CFPA 4I8SA 3AW6A 3N9AA 2BQKA 4HV1A 3CSZA 1IVMA 3J6KA 2W1XA 5HMVA 1WVUA 1T6VL 5JENB 1KIPC 2BPUA 4G9SA 5B07A 1LCNA 3B0OA 1IWYA 4NGIA 2H5ZA 1LOZA 5FEKA 1ALCA 3WMKA 5B59A 1REYA 2FYCA 1CKCA 1NBZC 1LYSA 1GF6A 1CKDA 1LZYA 1XGRC 4LT1A 3WXUA 5LXWA 1LZAA 1TBYA 1NF5A 1OUGA 4OWAA 1HFZA 1BWJA 3TXJA 1GB6A 2IFFY 1VDTA 4RDSA 1LZSA 4WLDA 1YQVY 2HEBA 3W6DA 4LYZA 5FDJA 4DDAA 1J1XY 4NG1A 4NGWA 1GE3A 2DKVA 1KIQC 4QY9A 1W6ZA 4YENA 3RNXA 1HSXA 4FDYA 2BQNA 1D0LA 2BAAA 3LZTA 3M3UA 4OOTA 4PGJB 1GAZA 5F14A 2Z38A 4G4CA 3SP3A 3WW6A 4WG1A 3WULA 134LA 4IASA 1HNLA 2YBHA 1LSMA 1WQQA 5I5QA 2BQJA 5LYZA 3TXBA 4DDCA 1KXYA 4WM5A 5A3EA 2Z12A 1JWRA 4R0FA 1LSAA 2RSCA 3HBHA 2W1MA 4N1CC 5E9RA 3LZ2A 4DWXA 1LJIA 2LZ2A 3IJVA 2MEDA 3MGWA 2YVBA 4N0JA 4YEMA 1EQ5A 1GB7A 4U3XB 1G7JC 3B72A 5HQ1A 2HU1A 5HMJA 4HV2A 1FBIX 1GF3A 4WLYA 3N9EA 1G7MC 1LYYA 1OUEA 2DBTA 4GLVA 1LYOA 4WM3A 3QE8A 4GCDA 4NY5A 4C5FA 1CKFA 4IATA 3F6ZA 4NG8A 208LA 4H93A 133LA 4J7VA 1B7OA 1JSFA 4KT3A 1B7RA 2Z2EA 1GWDA 4TSCA 1JHLA 1LJNA 5LVIA 3K3TA 5E4PA 1QSWA 4ETDA 2BLYA 3WXTA 3VWOA 1OUJA 4II8A 4MSTA 1VFBC 5APDA 2ZYCA 3CT0A 1I1ZA 1V7SA 4NWHA 4DD9A 1WQNA 1B5WA 4ET9A 1B5YA 3IJUA 1GEZA 1LHIA 4WOAA 1GXXA 1VDQA 4YF2A 1AT5A 1AT6A 1KXXA 1RJCB 4HPIA 2AUBA 4NEBA 1VDSA 4WL7A 1LSZA 5DL9A 2MECA 6LYTA 3G3AB 2I6ZA 4WM2A 1JKDA 3W6BA 4O34A 4LT0A 5LINA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YKZX 253LA 1LYFA 2CGIA 227LA 3GULA 1BGIA 2OTZX 1NMMA 1GXV2 1L70A 1YILA 1L65A 1MLCE 3DN2A 1YANA 5KXTA 4GN5C 1JPOA 146LA 1C6FA 4PPOA 1CUPA 5A3ZA 2D6BA 5FCPA 5C6JA 163LA 1L99A 4LYTA 5DN4A 1L33A 3N9CA 2D91A 3J4GA 1JJ1A 4UWVA 2XTHA 1CKGA 1CTWA 195LA 4W96A 2BQBA 201LA 4OWBA 3W6AA 3OJPA 1C63A 4ETAA 1LYGA 2OEAX 4H9EA 3SB8A 1GB9A 4WL6A 2LYZA 1KW5A 2XBRA 1CU3A 1CX6A 2Z6BA 4GCBA 3HT8A 196LA 3GUNA 1QS5A 2G4PA 3CSQA 1F10A 4B49A 1C68A 1KIRC 3RZ4A 3AZ5A 3LYZA 2DQEY 1J1OY 1L53A 3C81A 1JIYA 221LA 1BB3A 1L16A 1LW9A 1HEWA 9LYZA 213LA 3A94A 5KXMA 1GFTA 2BQEA 4HJZA 3TXFA 4EOFA 1L26A 1L67A 1C6KA 5KXLA 4LT2A 1SX2A 3A96A 3C8QA 1LZTA 2EPEA 3D9AC 2HUMA 1LZ9A 4NHIA 5F9XA 199LA 166LA 262LA 3HBDA 4UWNA 3A6CY 4OWEA 1L93A 1KS3A 4OW1A 2CUUA 5KY1A 1DKKA 4H9BA 1L45A 1MELL 226LA 3GUOA 1LJ4A 4L41A 4IAPA 3VW7A 220LA 3V2WA 1ZVHL 1B6IA 1P2RA 1LZ4A 1LSEA 1L35A 3AYQA 4QDNA 2Z18A 5LAGA 197LA 1YAOA 5ILCA 4LYOA 1YKYX 1L15A 177LA 158LA 4OO9A 2BQGA 1QTBA 2RAYX 1B9OA 1XGPC 1WQMA 2RBQA 1QDTA 1TEWA 1C6AA 5D5FA 1CKHA 1AZFA 2BQOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3A93 A;  1YKZ X;  1LYZ A;  1OP9 B;  1VDP A;  4N5R A;  1B5Z A;  1HFY A;  2CGI A;  3P68 A;  4HP0 A;  5L3I A;  1BGI A;  5LA5 A;  4WO9 A;  4BS7 A;  2Z19 A;  1EL1 A;  1UUZ C;  4IJ4 A;  4DT3 A;  1NMM A;  1FKQ A;  1B5U A;  1G7L C;  1GXV 2;  4H9F A;  1YIL A;  5KXR A;  5IHG A;  5DM9 A;  4I0C A;  194L A;  1GF5 A;  1MLC E;  1LSG A;  1JUG A;  1NKH A;  1YAN A;  3B0I A;  1GF4 A;  4HTQ A;  1OUI A;  1B7S A;  3A90 A;  3WL2 A;  3WPJ A;  1GFE A;  1BVK C;  5KXT A;  2ZIJ A;  4GN5 C;  1JPO A;  1XEK A;  1IY3 A;  4PPO A;  1HMK A;  4WLX A;  4H1P A;  1H6M A;  1JKA A;  4H9C A;  2LZT A;  5A3Z A;  1XEI A;  4XEN A;  2Z37 A;  1C46 A;  1GE1 A;  2NWD X;  2D6B A;  1XEJ A;  5FCP A;  1REZ A;  5C6J A;  1SQ2 L;  3B0K A;  4LYT A;  2BQA A;  1IP1 A;  3N9C A;  5DN4 A;  4ANR A;  1JTT L;  2D91 A;  2XBS A;  3J4G A;  4N1E I;  4CGE A;  2MEG A;  4PRU A;  1JJ1 A;  1IOR A;  1HEL A;  4UWV A;  1TCY A;  2XTH A;  1P2C C;  5LYM A;  1CKG A;  4DD2 A;  5I4Y A;  3A95 A;  1RI8 B;  5FEL A;  4H9A A;  4QEQ A;  1LJF A;  3A6B Y;  3BKV A;  4W96 A;  2BQB A; 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 2DKV A;  1KIQ C;  4QY9 A;  1W6Z A;  4YEN A;  3RNX A;  1HSX A;  4FDY A;  2BQN A;  1D0L A;  2BAA A;  3LZT A;  3M3U A;  4OOT A;  4PGJ B;  1GAZ A;  5F14 A;  2Z38 A;  4G4C A;  3SP3 A;  3WW6 A;  4WG1 A;  3WUL A;  134L A;  4IAS A;  1HNL A;  2YBH A;  1LSM A;  1WQQ A;  5I5Q A;  2BQJ A;  5LYZ A;  3TXB A;  4DDC A;  1KXY A;  4WM5 A;  5A3E A;  2Z12 A;  1JWR A;  4R0F A;  1LSA A;  2RSC A;  3HBH A;  2W1M A;  4N1C C;  5E9R A;  3LZ2 A;  4DWX A;  1LJI A;  2LZ2 A;  3IJV A;  2MED A;  3MGW A;  2YVB A;  4N0J A;  4YEM A;  1EQ5 A;  1GB7 A;  4U3X B;  1G7J C;  3B72 A;  5HQ1 A;  2HU1 A;  5HMJ A;  4HV2 A;  1FBI X;  1GF3 A;  4WLY A;  3N9E A;  1G7M C;  1LYY A;  1OUE A;  2DBT A;  4GLV A;  1LYO A;  4WM3 A;  3QE8 A;  4GCD A;  4NY5 A;  4C5F A;  1CKF A;  4IAT A;  3F6Z A;  4NG8 A;  208L A;  4H93 A;  133L A;  4J7V A;  1B7O A;  1JSF A;  4KT3 A;  1B7R A;  2Z2E A;  1GWD A;  4TSC A;  1JHL A;  1LJN A;  5LVI A;  3K3T A;  5E4P A;  1QSW A;  4ETD A;  2BLY A;  3WXT A;  3VWO A;  1OUJ A;  4II8 A;  4MST A;  1VFB C;  5APD A;  2ZYC A;  3CT0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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