The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
43
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sequence length |
110
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structure length |
110
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Chain Sequence |
MVNWAAVVDDFYQELFKAHPEYQNKFGFKGVALGSLKGNAAYKTQAGKTVDYINAAIGGSADAAGLASRHKGRNVGSAEFHNAKACAAKACSAHGAPDLGHAIDDILSHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Ligand Migration in the Apolar Tunnel of Cerebratulus Lacteus Mini-Hemoglobin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
NEURAL HEMOGLOBIN
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| molecule tags |
Oxygen storage
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| source organism |
Cerebratulus lacteus
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| total genus |
43
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| structure length |
110
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| sequence length |
110
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-07-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5ILR A; 1A3N A; 1CG8 A; 3QZX A; 3UGZ A; 2D2M C; 2ZLX A; 4TYX A; 2XKI A; 1Y2Z B; 1G09 A; 4N7N A; 2ZS1 D; 1D8U A; 4G1B A; 1JP9 A; 3WCW A; 2ZSP A; 3VRF B; 1LFL B; 1YDZ B; 2MGF A; 1CLS B; 1O1P A; 3ZHW A; 1JL7 A; 3QM7 A; 1NZ5 A; 1MYF A; 1HGB A; 1QI8 A; 1MBI A; 1RQ3 A; 3NFE A; 1DM1 A; 1CG5 B; 1MLH A; 1RPS B; 3WR1 B; 1MLL A; 1VWT B; 1Y4P B; 3S1J A; 1JF4 A; 1HBH A; 1HHO B; 4PQC A; 1Y4V B; 4H2L B; 2D5Z A; 1JL6 A; 1UIW A; 3K8B B; 2Z8A A; 1JZL A; 5AZQ A; 2GKM A; 3ARK A; 3P5Q A; 2D2N A; 1XZV B; 3BOM A; 1IBE A; 1AZI A; 4ODC A; 3IC0 B; 3UHI A; 2PGH B; 4NI1 B; 1F63 A; 3QJB A; 2ZS1 A; 1MOH A; 1C7C B; 3PI2 A; 2Z6N B; 3BJ3 B; 3OK5 A; 3E5O A; 3OO4 A; 1HDS A; 2PEG A; 2O5B X; 1MNH A; 2WTG A; 2GKN A; 4M4A B; 1G08 A; 1BBB A; 2NX0 A; 1HLM A; 1DO3 A; 4VHB A; 3QQQ A; 1IT2 A; 1LFT A; 4XDI A; 1Y22 A; 3LB4 A; 1LFZ A; 1YHR B; 2ZFO B; 1YGF A; 3ODQ A; 1A01 B; 4F6B A; 5CNE A; 4U8U B; 3HHB A; 2AUQ A; 1A0U B; 5HY8 A; 1OUT A; 4YU4 B; 4NXA A; 3UHR A; 1Y4F A; 1GDL A; 1Y45 B; 2KSC A; 1XY0 B; 4MBN A; 2H8F B; 1CH9 A; 3WHM B; 2ZT4 A; 2G11 A; 5KKK A; 1DTM A; 1YOH A; 3AQ7 A; 5JGG B; 1O1O B; 1J41 A; 4MXK A; 3PI3 A; 4ESA A; 1A9W A; 4HRT B; 3D4X B; 1G0A A; 2MB5 A; 4L7Y B; 1MNO A; 5EE4 C; 3UHY A; 1IOP A; 1O1L A; 2GDM A; 1NZ4 A; 5JDO F; 2HBS A; 2G3H A; 1LA6 B; 3UH5 A; 5F2A A; 1R1Y A; 4N7P A; 1NS9 B; 111M A; 4IRO A; 5JDO D; 3UHH A; 2HCO A; 1MBO A; 2YRS B; 1FDH A; 2VEE A; 4H07 A; 2DN3 B; 1HBA B; 1VXD A; 3G4W A; 1MWB A; 4TWU A; 3MYN A; 2B7H A; 1Y0D B; 2QSS A; 1XYE A; 1MKO A; 1A4F A; 2OHA A; 3VRE B; 4XS0 B; 5HLQ A; 1IDR A; 1GCV A; 2MGM A; 2VYZ A; 3S66 A; 3D17 A; 1M6C A; 2QLS A; 1YE2 A; 4FC3 A; 1OJ6 A; 3R5I B; 3MKB A; 4M4B A; 6HBI A; 1Y5F A; 1GVH A; 1XZ4 B; 3O7N A; 2SPL A; 1BZ0 B; 1Y01 B; 1GBU A; 1Y4R B; 1YIH A; 1LH6 A; 1LH7 A; 1V4U B; 3OZU A; 3ZJQ A; 1PMB A; 1MGN A; 1SHR B; 1X9F A; 3UHW A; 1SDL A; 1G9V B; 1OFJ A; 2HZ3 A; 2SPM A; 2ZS1 C; 1FSX A; 4H0B A; 1ASH A; 1J40 A; 1Y7D B; 1Y4G A; 2FRJ X; 1FSL A; 1XCH A; 1DO4 A; 3GQR B; 2GTL C; 3PEL A; 1CBL A; 2MGG A; 3GQP A; 2G0S A; 103M A; 1J3Y B; 1CH3 A; 1BAB A; 5D5R A; 5EYS A; 2D60 B; 1O1K A; 106M A; 1MBD A; 4ROM B; 3QZZ A; 3WCV B; 3WFX A; 3E5I A; 1S0H B; 4O4Z A; 1FCS A; 3S65 B; 1Y0W B; 4HHB A; 3GDJ B; 1J7Y B; 1J7S A; 1VHB A; 1YOG A; 5CND A; 3A0G B; 1MLO A; 1JP6 A; 3BJ2 A; 1Y35 B; 1B0B A; 1A6N A; 1DXV B; 3HEN A; 1QXD B; 1VXC A; 3UHT A; 1SWM A; 4YU3 B; 4AVE A; 1N9X A; 3HYU A; 1SDK A; 1Y8W B; 1YHE A; 5KDQ A; 1OFK A; 3HF4 A; 1Y7G B; 4MAX A; 2HBC B; 3R0G A; 3ZJN A; 1CBM A; 3A9M A; 3UBC A; 110M A; 1URY A; 2MGE A; 2ZSQ A; 5C6E B; 3ONZ A; 1Y0C A; 1T1N A; 4MQH B; 1V9Q A; 1COH A; 3TLD A; 3ZH0 A; 1THB B; 5E83 B; 2DC3 A; 4MXL A; 4UIQ A; 2W72 A; 4NI0 B; 3WCU D; 2ZLT A; 1QPW B; 3HRW B; 1HAC B; 4G51 A; 3ZOL A; 2R50 A; 3WTG B; 2O58 X; 3GKV A; 1QSI A; 2WY4 A; 1BUW A; 4C44 A; 4SDH A; 4O35 A; 3WI8 A; 2ZLX B; 1YHU A; 3NG6 A; 1G09 B; 2EB8 A; 3OVU C; 1V4X A; 4MQG A; 3WCW B; 4N8T B; 4MQI B; 1HDB B; 1YMA A; 2G10 A; 1HGB B; 1MWC A; 1QI8 B; 3AQ6 A; 3ECL A; 3G4U A; 1J3Z A; 2G0X A; 2AV3 A; 2XKH A; 2HBG A; 2BWH A; 3HXN B; 1A3O A; 3W4U B; 1HBH B; 1LFY B; 1Y5J B; 2MHB A; 1YEQ A; 2LH2 A; 1GDJ A; 1CH5 A; 5CHQ A; 4F68 A; 3ZJR A; 4MQC B; 1CP5 A; 5EUI A; 2D5Z B; 3WCU A; 4PQB A; 4HSX A; 5CHR A; 5JDO C; 3ZJJ A; 2R1H B; 2H8D B; 2HBE A; 1Y7Z A; 1MLF A; 1ABW A; 1MCY A; 2Z6S A; 1Y85 A; 3S48 C; 2G0Z A; 1W92 A; 3UGY A; 4F6I A; 1YVQ A; 2D2N B; 1IBE B; 1N9H A; 4ODC B; 1C40 A; 1YFF A; 3QJB B; 5MBA A; 1TU9 A; 5AZR A; 3ZJL A; 3OO4 B; 1HDS B; 2PEG B; 3WFW A; 1XZ5 A; 2VYY A; 3ASE A; 1J7W B; 1C7D B; 1HV4 A; 1F5O A; 3UI0 A; 1EWA A; 1YEN B; 3A59 A; 1Y22 B; 1ABS A; 4JYQ A; 2GNV A; 3MJU B; 1G0B B; 1YGF B; 2W31 A; 3QM8 A; 2LHB A; 1S5X B; 1TES A; 101M A; 1IWH A; 2DHB B; 3GYS A; 1A00 A; 2OLP A; 3D1K A; 4KJT A; 5E29 A; 2HHB B; 1SI4 A; 2GL3 A; 1DXT A; 1GDK A; 3OO5 B; 3MVC A; 1MLS A; 1YIE A; 1Y8H B; 1CMY A; 3HC9 A; 3G4Q A; 1YZI A; 3GOU B; 1YH9 A; 2G12 A; 1YGD A; 1Y0T A; 3QJC A; 1I3D A; 2V1F A; 1SPG A; 1YE0 A; 2HZ2 A; 4F4O A; 2DN1 B; 1WVP A; 1J41 B; 3UHK A; 3V2Z A; 4ESA B; 3G4Y A; 2ZLU A; 3A2G A; 2ZSX A; 1HAB B; 2BK9 A; 2CMM A; 1M6M A; 2W6V B; 2V1J A; 5F0B A; 1R1Y B; 3BA2 A; 2ZFB B; 3ZJM A; 4N7P B; 1UVY A; 3UHV A; 1LFV A; 3CY5 A; 3MJP A; 1CIO A; 3DHT A; 1GCW B; 1UT0 A; 1VXB A; 3AT6 A; 3PT7 A; 1Y83 B; 1DLY A; 1LHT A; 3TM3 A; 3WCT D; 2ZSR A; 1OR4 A; 1F5P A; 1O1M A; 4BJA A; 2B7H B; 1CPW A; 5EOH A; 1MKO B; 1A4F B; 2D5X B; 2D6C A; 1GCV B; 1LUE A; 3G53 A; 3ZJH A; 3D17 B; 2GTL D; 3EU1 A; 3CIU A; 1DO7 A; 2HBD B; 3EDA A; 5KER A; 1CH4 A; 7HBI A; 3DHR A; 3BCQ A; 1XZ7 A; 4M4B B; 1Y5F B; 3WCU C; 1YEU B; 1HBB A; 4MQJ A; 1Y8K A; 1MYH A; 1K1K A; 1GBU B; 1YIH B; 2ZS0 B; 1XZ2 A; 1DXC A; 5HBI A; 1JZM A; 1S61 A; 1X9F B; 5C6Y A; 2MGB A; 1FHJ B; 2AA1 A; 4OOD A; 2OIF A; 3HEO A; 1GBV B; 1FSX B; 1J52 A; 2EB9 A; 3EOK B; 1YEV A; 3WCT A; 2MGK A; 4IT8 A; 2O5L X; 3PEL B; 3GQP B; 1MLR A; 3BJ1 A; 2DN2 A; 1GZX A; 2C0K A; 2GTL A; 1DWS A; 1CP0 A; 3PI1 A; 2R4Y A; 1BAB B; 1BIJ B; 2MGJ A; 1JEB A; 3KMF C; 1A6K A; 3SZK A; 3LQD B; 3RJN B; 1UVX A; 3UH7 A; 1HDA B; 1QSH A; 1Y5K A; 1YG5 B; 3G52 A; 5HLX A; 4B3W A; 3ECX A; 3IXF A; 3UH6 A; 2ZWJ A; 1Z8U B; 3BJ2 B; 5B85 A; 1VXE A; 5EU2 A; 5HLU A; 1NWN A; 2H35 A; 4O4T A; 3DUT A; 3ZJP A; 1MOC A; 5EQM A; 5KDQ B; 4KN3 A; 1XQ5 A; 4JAC A; 1LJW B; 1R1X A; 3ONZ B; 5M3S A; 1Y0C B; 4UUR A; 5CN9 A; 2GRF A; 1O1N A; 2R80 A; 2RI4 A; 2W72 B; 4NXC A; 2ZLT B; 1MNI A; 4G51 B; 1OUU A; 1Q1F A; 1MLJ A; 1DXU B; 1DWT A; 1BUW B; 4X0L A; 5EET A; 1K0Y A; 1NZ2 A; 1YHU B; 1HGC A; 4MQK A; 1Y8I A; 2BLI A; 3HEP A; 1DUO A; 5SW7 A; 1MBS A; 2D2M B; 4F69 A; 3QQR A; 1JDO A; 1NS6 A; 2HHD A; 1X46 A; 3K3U A; 3MN0 A; 1V4W A; 1XXT A; 1J3F A; 2NSS A; 3NMM B; 5CN6 A; 1J3Z B; 2RAO B; 1HBI A; 1DKE A; 1QXE A; 2BLJ M; 3VRG A; 1IRC A; 1A3O B; 4WJG 1; 1Y4B B; 2IG3 A; 3D7O B; 4ROL A; 5EUI B; 3VRF A; 4MPM A; 2R4X A; 2MGL A; 3QJE A; 1MTI A; 4F6D A; 3FS4 A; 1RPS A; 1LTW A; 1Y85 B; 3D1A A; 4G1V A; 1LH5 A; 1Y4P A; 2XKG A; 2ZFO D; 2BMM A; 3UH3 A; 3WCT C; 1YMC A; 1HGA B; 3B75 B; 3VHB A; 3PI4 A; 1HHO A; 2MGH A; 1C40 B; 4H2L A; 104M A; 4U8U D; 2MGD A; 1Y0A B; 2HHE B; 2G14 A; 3GKT A; 2O5M X; 1BVD A; 1UX8 A; 1DTI A; 3M3A A; 2VRY A; 2HBF A; 5B84 A; 2ZT1 A; 1O1J A; 3PI9 B; 3IC0 A; 107M A; 6HBW A; 1NIH A; 2AV0 A; 1CH1 A; 1KFR A; 2AUO A; 1SI4 B; 3PIA A; 4M4A A; 1FLP A; 1CMY B; 4F6G A; 1YHR A; 2GRZ A; 2ZFO A; 4ZVB A; 1JF3 A; 3PT8 B; 1ABY A; 1Y0T B; 3QJC B; 1BIN A; 1LFQ B; 2ZLW B; 1N9I A; 1Y7C A; 1A01 A; 3UHZ A; 1MNJ A; 1AJG A; 4F4O B; 3ZJS A; 3QM6 A; 1HBR B; 1A0U A; 1Y09 B; 1CO8 A; 2FAM A; 2GLN A; 1HLB A; 1HCO B; 1Y45 A; 4DWT A; 3QJD A; 5HAV A; 2H8F A; 1RQ4 A; 1BZP A; 1FAW A; 1CH7 A; 4NZI A; 3GQG A; 1HSY A; 1S69 A; 1V5H A; 3V2V A; 1MOA A; 2AUR A; 1DWR A; 5E6E A; 5JGG A; 1VRF A; 1O1O A; 4ILZ A; 4FWZ A; 5HU6 B; 1MDN A; 2ZSY A; 3NL7 A; 1XZU B; 2LH6 A; 3SDN A; 2QSP B; 3MJP B; 1A0Z A; 3NML A; 102M A; 1A3N B; 1CG8 B; 2ZSO A; 2O5O X; 3AT6 B; 3PT7 B; 4L7Y A; 1Y31 A; 4N7N B; 4F6F A; 1RQA A; 3QM9 A; 2VYW A; 1FN3 A; 3AT5 A; 1DXD A; 3GK9 A; 4FWY A; 1S5Y A; 1O1P B; 5CN8 A; 3CIU B; 2YRS A; 1RQ3 B; 3NFE B; 4O1T A; 4HSW A; 3BCQ B; 1V75 A; 3U3E A; 1Y0D A; 3LB3 A; 5D1V A; 4HBI A; 1MWD A; 1UIW B; 1BZ6 A; 1XZ2 B; 3WFU A; 2G0V A; 1NWI A; 2AA1 B; 3WCV D; 3P5Q B; 3BOM B; 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2QLS B; 1YE2 B; 3VRG B; 1ECO A; 1VXA A; 4FC3 B; 1YOI A; 1LHS A; 3LR7 A; 4ROL B; 3MKB B; 4N8T A; 4MQI A; 1HDB A; 3QJE B; 2FRI X; 1ECA A; 3FS4 B; 1YCA A; 4HRR A; 1B86 A; 3D1A B; 3HXN A; 1MNK A; 3W4U A; 1DUK A; 1SDL B; 1LFY A; 1Y5J A; 3ZJO A; 1YVT A; 1NAZ A; 1BZ1 A; 5AB8 A; 1IRD A; 4MQC A; 1GDI A; 1J40 B; 2GRH A; 1MYG A; 1Y4G B; 4TWV A; 2QFK A; 2R1H A; 2H8D A; 4MBA A; 2MYC A; 1WLA A; 2HBF B; 1O1J B; 1MLN A; 2HZ1 A; 3M3B A; 6HBW B; 1O1K B; 1NIH B; 2LH7 A; 1KR7 A; 3OJ1 A; 1MYJ A; 2O5Q X; 3PIA B; 1J7W A; 4HHB B; 1C7D A; 1J7S B; 4O2G A; 1LH3 A; 2MYA A; 1YEN A; 3WCV C; 5CN4 A; 3A5G A; 1KD2 A; 3MJU A; 2BW9 M; 2NSR A; 3LHB A; 1G0B A; 1YEO A; 2V1G A; 1ABY B; 3UHB A; 1S5X A; 2DHB A; 3HYU B; 1Y7C B; 2EVK A; 1SDK B; 1YHE B; 2HHB A; 1CH2 A; 2DXM A; 3HF4 B; 1MBA A; 3UHU A; 2QU0 A; 3OO5 A; 3ARJ A; 3E55 A; 1Y8H A; 3M39 A; 4KMW A; 2NRL A; 5IKS A; 3GOU A; 1S56 A; 1MTJ A; 5EYJ A; 1A9W E; 1OR6 A; 3QJD B; 1GLI A; 1AJ9 A; 3UHE A; 1T1N B; 1RQ4 B; 1FAW B; 1COH B; 3GQG B; 2DN1 A; 2LH3 A; 1LH2 A; 2OH8 A; 1CQX A; 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