2XPEA

Oxidised thiol peroxidase (tpx) from yersinia pseudotuberculosis
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
TVHFQGNPVSVAGKLPQIGDKAKDFTLVAKDLSDVALSSFAGKRKVLNIFPSIDTGVCAASVRKFNQLAGELENTVVLCISSDLPFAQSRFCGAEGLSNVITLSTLRGADFKQAYGVAITEGPLAGLTARAVVVLDGQDNVIYSELVNEITTEPNYDAALAALK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Yersinia pseudotuberculosis
publication title Structural Characterisation of Tpx from Yersinia Pseudotuberculosis Reveals Insights Into the Binding of Salicylidene Acylhydrazide Compounds.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOL PEROXIDASE
total genus 48
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.-:
pdb deposition date 2010-08-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2xpeA00
2L57A 3BD2A 1CQGA 1DE2A 3G9BA 4ZBDA 3O6TA 1TRWA 1QXHA 1F9MA 2H74A 1M2AA 4HQZA 2X8GA 1NSWA 1OC8A 4ZILA 2VCQA 3BCIA 2N5FA 3UIWA 4QL9A 5D9VA 1TU8A 5ABRA 3VI7A 2NDOA 3KTBA 3HY2A 4BVYA 3VURA 5ECNB 1AAZA 2PVOC 2YV9A 4JZQA 4E8HA 1EGOA 5IOWA 3FHKA 2IWTA 3UL3A 2CZ3A 2XPEA 4HU7A 4LMVA 1G6WA 5GAPD 3EMPA 1SJIA 5ID2A 1AIUA 1T3BA 3MAKA 4LL1B 5B8BA 2QSIA 5KN1A 1GRXA 3IOSA 2GQMA 5HFKA 3TJGA 3Q18A 1TRSA 1WP0A 4MDCA 2M46A 5F05A 1K0DA 5G1KA 1AC1A 1YDKA 1F2EA 4CHSA 4F2IA 3SBCA 1DUGA 3M0FA 2HYXA 3QOUA 3WGXA 4N11A 4DSRA 4FYUA 2JL4A 1XWGA 4D73B 2DC5A 1OAZA 1V40A 4BWQA 2M72A 1XIYA 5DCGA 4MPFA 5ID2B 1GLPA 3M9JA 2HE3A 3QAWA 1X9WB 3GNJA 1OC3A 1GSDA 1W89A 4X43A 7GSSA 1R26A 1A2MA 4XRAA 3CTFA 2VL2C 2YANA 3I9V2 2GSSA 3W8SA 2RM5A 2DIYA 2I9HA 4YQMA 4ML1A 4DSQA 1I5GA 1AQVA 2NBSA 3Q6OA 1AUCA 1VF3A 3IDVA 6GSXA 5KN2A 4ECJA 4RQRA 2MBTA 3US3A 1HD2A 3C8EA 5CO3A 3D4TA 3NIVA 3ME7A 3IBHA 1UVZA 4WXTA 4K2DA 5DVBA 1QK8A 1QGVA 1SL2B 2R3XA 1Q98A 4MF6A 3MSZA 1MEKA 3GFKA 2H1GA 1JHBA 2MMAA 1TI1A 4WBJA 3Q74A 5G30A 1ERVA 1T4YA 2NVLA 4OFMA 1B48A 1XCCA 2EIOA 4ECBA 1GTIA 3TOUA 4POLA 1B9XC 4IKHA 3HJMA 3CXGA 2LNTA 1OC9A 3TRPA 3G7IA 3JCML 4XS4A 4FH8A 1O8WA 4Q5FA 3A2VA 2F51A 1LJRA 1OKTA 1AQWA 5JCUA 4ISDA 1GH2A 1FB0A 2H76A 4QL7A 2LTKA 2VCWA 5COHA 4ZB6A 4V2MA 3L9VA 5DQYA 2RUFA 2A4VA 3UMAA 2GT5A 2GDRA 4HZ2A 4AJ6A 1SENA 5H5QA 2BTOT 3C1RA 4OCFA 3P90A 1SK0A 2IMFA 4J56E 3H93A 4F0CA 1K0BA 2JADA 4WKWA 2HXKA 2R5GA 1Z3EA 3FKFA 3QAGA 3DMLA 5J9CA 4N0VA 4NHZA 1GTBA 1Z6NA 3LFLA 1GSYA 2C8UA 5B8AA 1K0CA 1TRVA 4MZBA 2ES7A 4KH7A 4IELA 1GUKA 2LNSA 2DSAA 2RLIA 1XWCA 3VFIA 3F9UA 1JZRA 3M8NA 3CSJA 4TXVA 5L71A 3IHQA 3KD0A 1A2LA 3UARA 1XWAA 2IJYA 2JU5A 4YAVA 2HSYA 2LJRA 2CVBA 2ON7A 1TJDA 3P8WA 1PMTA 2LV3A 3CRUA 2GSRA 1PL1A 2GT6A 5HR1A 3FY7A 1HYUA 3APOA 3KH9A 4XS6A 4TXOA 2K8VA 2O89A 3UVTA 3D21A 4Q5NA 4ZL8A 18GSA 1BAYA 2PBJA 2G2QA 2ZNMA 2VCTA 4ZB9A 2E7PA 1T1VA 5HFGA 3G7JA 2RM6A 1NHOA 3HXSA 2V6KA 1F3BA 2IIYA 2GVPA 2JSZA 2PWJA 3IXRA 3MNGA 3HVSA 5AIVA 5CAXA 5IPGA 1XVWA 2LUSA 3FRCA 5DALA 2VM2A 19GSA 1UN2A 5JWRB 2VLVA 3ZVJA 2FY6A 4IVFA 4IW9A 1X5DA 3GYKA 3QDNA 1Z6MA 3QMXA 1S3CA 1GTUA 2IL3A 4BL7A 4ZL9A 5DBQA 4HOJA 4PUAA 4AJ7A 4K7IA 2O85A 1VF2A 3TB2A 3ERGA 3A2WA 5IIZA 5IM9A 3FEUA 3EMXA 3OR5A 2VD1A 2VO4A 1EEMA 2TRCP 4PQ1A 3KEBA 3BCKA 4JRRA 4H86A 3KXOA 3TJBA 3LSZA 2YWNA 4L0WA 4KAEA 3Q19A 1FB6A 2NPBA 6GSVA 2R6KA 5GSTA 3LYPA 2H0HA 3ZRDA 4MZCA 4IS0A 4KUNA 5D9TA 2D2ZA 2EIRA 3A2XA 1V58A 3PGTA 1XWKA 3IR4A 3TRQA 4KE3A 1FG4A 3C73A 3E9JB 3LG6A 5ECLB 1K3YA 4ID0A 4KGIA 3APQA 3WGDA 4ZIJA 2CZ2A 2DJ3A 3UBLA 4F0BA 1XOBA 3V1WA 4NXIA 3QD9A 2H6ZA 3IV4A 3E3EA 2WRTA 4GLTA 3TKRA 2XBQA 4KW6A 4K1FA 3LYKA 5LNKe 2HLSA 3UBKA 1O81A 2B5YA 3IC4A 5JCWA 3D6IA 1J08A 3GX8A 1K0NA 5EVOA 4IP6A 2P5QA 4EKZA 2B1LA 2L6CA 1YEXA 3FZAA 4KDYA 1EOGA 4V2LA 1TK0B 5ECMB 2B7KA 4MF5A 1TRUA 2WCIA 2H66A 3TOTA 3NZNA 4IP1A 1BG5A 3HJPA 5J41A 13GSA 2H30A 4K7NA 3F63A 5ECHB 3KZQA 2LQQA 4TW5A 1O85A 2ZCTA 4EF0A 3N9JA 5F0GA 2YCDA 2WULA 2YOIA 4FYCA 3IPZA 2VCXA 4YH2A 3BBYA 1X5EA 4KDUA 1TXXA 2MZCA 1TDIA 2PU9C 1JLWA 2DIZA 12GSA 2V2GA 3IA1A 3LXZA 3WT1A 3MWHA 3GH9A 2VUPA 3ISOA 3GURA 4RUVA 5JCGA 8GSSA 2OBKA 1Q4JA 3IRAA 2L5OA 3GKMA 3KIJA 1ZYQB 3RHCA 4POMA 3DRNA 3CYNA 1EV9A 1J9BA 1XVQA 4DSSB 2I4AA 1PGTA 1WRYA 4G10A 4P3YB 1M9AA 4EVMA 2GZYA 3FR3A 5H5SA 5CRWA 2K18A 1VF4A 5AGYA 1IYHA 4NHWA 3TDGA 2X99A 4OFNA 4JR6A 3MDKA 4GQFA 22GSA 1FVJA 3VWVA 2V1MA 2V6OA 4IJIA 5CRDA 4MH2A 2I81A 3UJ1A 4DEJA 1XXUA 1ST9A 2PVQA 2IPAA 4WETA 3TJFA 3VK9A 2IMKA 4PX1A 4KCEA 3QPMA 2KHPA 1HNBA 4I2TA 5G1LA 2H70A 3IK7A 4N10A 3KP9A 5CRGA 5C04A 4PQHA 1DSBA 3HJOA 3L0HA 3W6GA 2CVKA 5IMCA 3VWUA 2AB6A 4HQSA 1EOHA 2YZHA 4AF2A 1JFUA 3LEFA 3F6DA 1ILOA 1M9BA 1YF0A 4N0ZA 2LS5A 3P2AA 2JZTA 2VLTA 4ECCA 2YJHA 1NM3A 1WWJA 3KCMA 4MJCA 1TU7A 1TK8B 4V2NA 2HRFA 1U87A 1FVKA 2GQLA 4JU5A 1R4WA 1SJZA 2C3NA 4NV2A 4IBPA 5D9WA 4GWRA 3TUEA 2RUEA 2AYTA 2CA8A 4Z7XA 4GCIA 4K0GA 2YWOA 1A24A 3VWWA 4MJAA 1V98A 1UC7A 4NAXA 2KUCA 1XZOA 1M2DA 5KN3A 5ECPB 1HNCA 2K9FA 4OO5A 2HNLA 2V32A 4PNGA 1OVNA 3GH6A 5IMVA 4WBRD 2OBIA 1U3IA 1FW1A 1PA3A 16GSA 4FIWA 2G0FA 1EWXA 3HYPA 1PRXA 1Y6EA 3KTLA 2FA8A 2LJAA 2FHEA 4EL1A 5DCHA 4XRDA 2I1UA 2AV4A 5JWOB 5CP1A 1JLVA 4PUFC 3TKSA 1X5CA 1K0AA 3HKRA 6GSWA 3FW2A 3EINA 4HI7A 3LORA 1NHYA 4V1Ag 1K0OA 4ZBAA 3VWXA 3KJYA 4I8BA 2F3MA 4RQXA 4E8EA 2AAWA 3K8NA 4MJEA 4G2EA 1GUHA 3VLNA 2N5BA 3HD5A 2YJ7A 5E59A 5EY6A 5GZZB 4ILFA 3TRXA 2HT9A 4J2FA 3S9FA 1YKCA 4K8MA 2YZUA 2I3YA 2WGRA 4POBA 2GSTA 2YWMA 1ZOFA 5AN1A 4HZ4A 1TP9A 5C00A 4ZL7A 3L78A 2DJ0A 3ERFA 1ZCPA 1BQ7A 2B5EA 3KM6A 1OC9B 5A4VA 4XIHA 1PSQA 2LEGA 1M0UA 3L9UA 2YN1A 2YPMA 4WF4A 4XS4B 3KGKA 5ENUA 4IQAA 1FAAA 11GSA 4TVEA 1K3LA 4LL4B 1WPIA 1GP1A 1Z7PA 3GHAA 1SYRA 4NMUA 5DDLA 1PL2A 4MH3A 4TOPA 4BA7A 5IQYA 3A3TA 5F06A 4K6XA 1ZZYA 1YF1A 2FNOA 1GSUA 2L6DA 4BVXA 2WJUA 2H1AA 2OE3A 3C1SA 4L0UA 1C72A 1Y25A 3F4RA 4HDEA 2VIMA 3GTUA 5IO0A 4XCSA 3N5OA 2FA4A 2DJKA 4GF0A 1ERWA 2WFCA 5ECQB 1M7TA 1WIKA 5AISA 1PD21 2GSQA 1XOAA 5CREA 5IMAA 2A2SA 3APSA 4PNFA 4WEYA 4XTSA 2HZEA 1OE7A 2V41A 5INYA 1SD9A 2E0QA 2H1DA 1S3AA 2WZ9A 3EVIA 1M2BA 4TR0A 1OE8A 2CQ9A 5ECIB 4TR1A 2L4CA 2H19A 1GULA 3VPTA 1KNGA 1ZYEA 3D4MA 1U88A 2FD3A 2L4QA 4GSNA 1PX7A 4GQCA 3IK9A 1RQMA 2DMMA 4XS1A 4WF5A 2IMDA 2VCZA 1MD3A 3FZ4A 4EO3A 9GSSA 1B4QA 1A0FA 1GL8A 4KSMA 4KA0A 4TXOB 1YQ1A 3ZYWA 5DAKA 2H6YA 3HHVA 1ML6A 3H8QA 3IAS2 1HNAA 5B6NA 4EDYA 2XC2A 4YQVA 2BMXA 4IJ3A 2P0GA 1SJ6A 2WDUA 4JBBA 1CQHA 3DYRA 1WJKA 3TKSC 2HI7A 4WR4A 3P7XA 3A5WA 1MDKA 2VL9A 4O7HA 5H5RA 1UA5A 1E2YA 1FO5A 3KMNA 5DALB 5IO2A 1EZKA 3RHBA 20GSA 1ZMAA 3GA4A 3WD6A 6GSTA 2PERA 2FWGA 1H75A 3ZLPA 3FK8A 4F9ZA 1SK2A 2OE1A 5LCZA 5D8IA 2B1KA 4EUYA 1XW6A 4MCUA 2GZPA 2KLXA 1DE1A 5DAKB 2VAFA 1TK5B 5A5KA 4ML6A 3I69A 4MMMA 1TOFA 2AUVA 1KEBA 3BOAA 4F03A 2F9SA 2VCVA 4HUAA 2C0FA 4KSOA 4OCEA 3QFAC 2YWIA 5HR0A 1G7EA 3ZITA 3F6FA 1GUMA 1VGLA 2OKAA 3QFBC 3M1GA 1FOVA 2O8VB 4TRXA 1WE0A 2O87A 1DBYA 3GX0A 1ZL9A 2PGTA 1G7OA 2CT6A 2FCHA 1PX6A 3DVXA 1GNWA 3D5JA 3L4NA 5J5NA 5IMFA 1SKRB 2YV7A 1ZGNA 2B3SA 3J7Yk 2AHEA 4CW9A 5GAND 4AGSA 1OYJA 4LA1A 3I43A 3ZREA 2DJJA 2TRXA 2VL3A 4X1UA 4PQIA 1FHEA 1AW9A 2MMZA 1AXDA 5EL8A 1S3DA 3TKPA 2XHFA 1R5AA 4K9ZA 3EU3A 4I5QA 4OFTA 5HR3A 2CX4A 1Z5YE 3ZFBA 1MD4A 3LXTA 2VL2A 3KP8A 2MBSA 3DD3A 5J3RA 4NV5A 1SL1B 4MPGA 3DXBA 1YJ6A 4WR5A 1SYXA 3RAZA 3AY8A 2K8SA 2E2MA 5J4UA 1XBSA 1B8XA 1V9WA 2P5RA 1MDJA 1F3AA 2DBCA 3H4KA 1M99A 5HFIA 1GWCA 3FR9A 1EV4A 3RBTA 3M9KA 1O7UA 2KP1A 2RIIA 3UOMA 3FZ9A 3GL3A 2H75A 3J7Yb 1LBKA 1THOA 5B6MA 2PMTA 4IHUA 2X8HA 5F07A 3TKQA 1YY7A 1XFLA 2R4VA 3ZIVA 3GKNA 3M3MA 2CX3A 2K6VA 4O5RA 2IN3A 5IOXA 3O3TA 4EE0A 14GSA 2NTOA 4L8EA 2ALBA 5JWQB 1EEJA 3CSHA 2VD0A 4ECIA 4PURA 2H72A 2OADA 4GTUA 1T00A 4HJ2A 2JZRA 4I97A 1PKWA 4D73A 1XW5A 3D22A 3TJKA 3LGCA 1RW1A 6GSSA 1ERUA 1SKWB 2MMOA 4MA9A 5CYYA 3KMOA 1YKAA 2HZFA 2JZSA 1SK1A 2ON5A 2X64A 3UVHA 2DJ1A 5DJLA 5ELGA 2TIRA 3EC3A 4JEDA 5D93A 2X8CA 2OACA 6GSYA 2C3QA 1SKSB 1PQNA 3LQ7A 1N2AA 4AJ8A 3G7YA 3E0UA 1QUWA 4TR3A 2GTUA 4IGJA 3HVVA 2H01A 3F0IA 5ECRB 4X0XA 1B9YC 2A2RA 2GGTA 4KX4A 4Q5QA 4YAPA 2QC7A 3CBUA 2J9HA 2REMA 4EC0A 4RI7A 3VI5A 5FWGA 4IQ1A 4L5OA 2MMNA 2HRNA 5EPFA 3GMFA 2LKUA 4GXZA 5D96A 1XPVA 1A23A 1YZXA 2Z9SA 6GSUA 1O73A 5IPHA 1ON4A 3SWLA 1N8JA 1XWBA 3EURA 1JZDA 5AIXA 2E2GA 2AJQB 3U6VA 4I2UA 3GV1A 5ECOB 1URMA 1V2AA 1QQ2A 4LLRA 3EU4A 1O8XA 3PR8A 4L5LA 4F82A 4FYBA 2GQKA 4RI6A 2H71A 4GSSA 2OE0A 3DWVA 5ECKB 1X0RA 2CAQA 4N30A 1WMJA 5DJMA 1AQXA 1NW2A 4TKYA 1T7PB 3CRTA 3TJJA 1VF1A 3IAM2 4ZXGA 3FR6A 4OO4A 3VPQA 2FWEA 2VLUA 2C0GA 2PPTA 4ACSA 2R2JA 4Q5RA 4V1Ap 2F8AA 2FWFA 4JE1A 3GL5A 17GSA 3HZ8A 1TKDB 5DQSA 3F3RA 1SD8A 2FLSA 3TGZA 3EWLA 1EP8A 1G6YA 2B5XA 1F6MC 2WB9A 1ACVA 4HJMA 3UAPA 3C71A 3FZ5A 2KP2A 3WGEA 3F4TA 2OJLA 1BX9A 4MZWA 2GLRA 2H1BA 5D9XA 2L5LA 5D73A 2H0IA 1KBNA 2YP6A 3CTGA 5CRHA 2EIQA 2JACA 4O92A 1A0RP 2YNXA 1K3OA 3DKSA 2C0DA 5J9BA 4GSTA 2M80A 3NOFA 5A4WA 4TR4A 2J23A 1G0TA 5LD0A 3GSTA 3LWAA 3GKKA 2C0EA 3CMIA 1GNEA 4MF7A 3EYTA 5B7CA 1SL0B 5HR2A 4HS1A 1GTAA 2R37A 1V57A 3WT2A 4DVCA 3RPPA 1A2JA 1MTCA 2QGVA 4HEA2 2C4JA 2CAIA 1TW9A 5G5FA 3H79A 4QQ7A 2VM1A 2KOKA 4NPBA 3O76A 1QFNA 3C7MA 1BJXA 4MLYA 2N5AA 4FO5A 4EDZA 3PINA 2QKEA 3HDCA 4OMVA 3QR6A 4XHMA 1O6JA 1Z7RA 3HA9A 3TKSE 1TTZA 1B4PA 1R7HA 1BYEA 1GLQA 2OA7A 2C80A 3HVXA 2XPDA 2F8FA 5KN0A 1KTEA 3GN3A 1OKDA 4OD7A 4I6XA 3ZVJD 2HSHA 5GSSA 3RDWA 2PUKC 2WS2A 1VRSD 1LU4A 4KNDA 1MDIA 2MYGA 2VOCA 4BWSA 1R5PA 3QAVA 2EC4A 3TCOA 3ERWA 3GTUB 3L9SA 3F8UA 1ERTA 1I9DA 4BPYA 2B7JA 3ZTLA 4ULXA 3KH7A 2H0GA 2PN8A 2LSTA 2C3TA 3ED3A 3EE2A 5A4UA 1T8EB 2HZEB 4J57E 1WOUA 2P31A 1PN9A 3FYGA 5G5EA 4MABA 4TN8A 1A8LA 1TI3A 1JZWA 3UEMA 4TR1B 3I6AA 3D0ZA 4PGTA 5ELAA 4K0NA 3DIEA 5G31A 3WYWA 1GSQA 2FGXA 3ZIJA 4O32A 1W4VA 5FT3A 1BEDA 1EGRA 3DGQA 4JR4A 1GSSA 3GRXA 3CSIA 3IE3A 4MJBA 4HU9A 2BJXA 5E4WA 1QMVA 4PXOA 2L59A 1THXA 2IMEA 1SU9A 4G19A 2H8LA 4K7OA 4G9HA 4LMWA 3GIXA 2LRTA 1IYIA 2DLXA 3R2QA 5IMDA 4CDOA 2FWHA 5FHIA 3ZFLA 4NWYA 1YEPA 3H1NA 2HFDA 3QCPA 2JSYA 4IN0A 5ECSA 2IFQA 1U6TA 1USBA 1HQOA 4MK3A 3U5RE 4ZB8A 2H73A 3GKXA 2C1YA 5G2ZA 5IMZA 3ZZXA 3F3QA 3W8JA 1J0FA 2CV4A 3RPNA 1X9SB 4KB3A 2DMLA 10GSA 2B6MA 1E6BA 1A8YA 5F8BA 1JZOA 2CVDA 1ABAA 4ZBBA 3HCZA 4EXJA 2GZZA 3F4SA 3HZ4A 2LRNA 3GUSA 2IMIA 3ME8A 4MP4A 5CNWA 1RK4A 1H4OA 1EP7A 3BJ5A 4YQUA 1PKZA 2LJKA 2IFQB 2O7KA 4KDXA 1F37A 2LRCA 5KEJA 4DSSA 1K0MA 2XBIA 2H6XA 1GSFA 3DVWA 1T4ZA 3LJRA 4OWYA 1U3AA 3GSSA 1Z9HA 4GRFA 2FUG2 1XW9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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