2XX7A

Crystal structure of 1-(4-(1-pyrrolidinylcarbonyl)phenyl)-3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1h-indazole in complex with the ligand binding domain of the rat glua2 receptor and glutamate at 2.2a resolution.
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Integration of Lead Optimization with Crystallography for a Membrane-Bound Ion Channel Target: Discovery of a New Class of Ampa Receptor Positive Allosteric Modulators.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 82
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xx7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xx7A02
4NEDA 1IITA 4KYEA 3RTWB 3FIRA 5I56A 2GHAA 4NMYA 3PMXA 3S9MC 2IEEA 5DVFA 1SI0A 4E0XA 5DEXB 1HSJA 5H8FA 5ICTA 1QKBA 2B65A 3G3FA 3PUZE 3N26A 1B3EA 4H5FA 3T96B 5ITOA 4N13A 2REGA 3T66A 3IL1B 4WEPA 1A8EA 4F22A 5ELVA 2VD2A 4U1ZA 3VVFA 2I3WA 3E9XA 3QUJA 1IXHA 3I5OA 2FYIA 2O68A 4KCDA 4DIGA 1P1UA 1SW5A 1MG1A 1MXXA 4G8HA 3SEXA 2H9BA 1NNTA 2ESNA 4UA8A 2I48A 2OBGA 2FA7A 4PFUA 4G77A 2F7CA 3K2DA 4FAJA 4IO7A 3OXNA 3FVNA 4R6YA 5CMCA 1B3FA 3MPLA 3VLWA 5IAIA 3RUMA 2HCAA 5TP9B 4HTGA 4RA1A 4F18A 5JTYA 3O6HA 3EHUA 1O64A 1BIYA 2PT2A 2DE4A 3IOUA 3FZVA 2HQ0A 3KGCA 4TQUQ 1N3XA 4ZZAA 4XKRA 3CSBA 4X48A 1FTOA 2O1MA 2VOZA 4JDFA 5H8HA 1MY2A 4WEDA 4ELOA 1Q35A 3M3FA 2Y7KA 4XXUA 1B3LA 1URDA 1MXZA 3E4RA 1MPDA 2RKMA 1L5TA 3TZAA 3BKIB 4F19A 5AA1A 4F2OA 1VFEA 1T0KA 3MZ1A 3R6UA 2G29A 3AXFA 2D21A 4GOTA 4H0WA 4GWOA 3SERA 1J1NA 2IA4A 2RINA 3T9HB 4RYAA 4ELQA 1DTGA 1FQFA 4F1YA 2DYXA 3MAMA 1DPPA 1R9LA 3OEKA 1TFAA 3TCHA 3G3JA 3VLUA 4XKNA 3G3GA 3FJMA 1N3WA 3V89B 3VV5A 4IO6A 4ZS9A 4QSCA 3S4UA 2F6GA 5DTBA 1S9TA 2DXRA 4BDLA 3MVWA 3O2AA 1FW0A 1LCFA 2I3VA 4YAHX 1JVXA 4ELPA 1LAHE 4M4GA 5HBCA 3RN8A 4C1UA 3V5AA 3U93A 2PX1A 3V83A 4TOZA 4P0GA 4Z0IA 4DLDA 1M5EA 2P2AA 1MM6A 2GRVA 2XXVA 3MP6A 3I6VA 3Q29A 2D3IA 5L8DA 1CB6A 1PB7A 1IUDA 2Q2CA 2Q89A 4OYVA 4OXVA 2GHBA 4RNSA 2HAVA 2Q8JA 5CM6A 1FTJA 2O51A 4I9DA 4L17A 4ZZEA 3TUSA 1II5A 1NH7A 4H5GA 5ICQA 2XX7A 3RT6B 4GVOA 1Y4TA 4BDOA 2Q9TA 4BDNA 3KJ7A 1ZLQA 4O3AA 4GXSB 4EQ9A 1B05A 4QFOA 4DCYA 1US5A 3M3KA 4F3BA 4GFRA 3TYHA 4GL8A 3H7MA 2I49A 3TPAA 1NH8A 5DYHA 1B1XA 2XX8A 1Y4CA 1B4ZA 1ELJA 2HEUA 4RXLA 1BKAA 1VSOA 1QULA 3B6WA 3HV1A 3Q28A 1UIVA 3H6UA 4ZEFA 3V8XB 2REJA 2ZNTA 3H03A 1ZJLA 1MQIA 4FORA 4OTEA 4F29A 3H3GA 4DE8A 3TTNA 1XS5A 4JBZA 2NVUB 3THIA 5I84A 2Z8DA 4MBPA 2RC7A 3TEPA 1SYHA 3K1NA 4OFOA 1LB9A 2O69A 4M1VA 1O63A 1RYXA 3VXBA 4NF5B 2RC9A 3OSQA 3ZS6A 3C35A 3HSTA 2W7YA 2UYFA 5BWJA 2P0SA 3QYTA 1XOCA 4R6HA 4C1TA 1S7YA 5HPQA 1SYIA 2DE3A 2X7PA 5K2XA 3HHGA 4X9TA 3G7WA 4F1UA 2Y7WA 1ZU0A 4U1OA 1SW2A 2ANJA 3FXUA 5IKBA 1MXUA 3HN0A 3JV9A 1Y3PA 3D4GA 1QVSA 3PUVE 4ONYA 4TLLB 4TLMB 3Q27A 3KSJA 4LUBA 5FHMA 1ANFA 4ESWA 1QUIA 1IIWA 1H44A 1NMUA 5H8NA 1GVCA 3RY3A 5JEIA 4LP2B 1JVYA 3IR1A 3K02A 3IOWA 3KZGA 3FUZA 3B6QA 1TWYA 1EU8A 1SVXB 5ITPA 2QS3A 3U92A 1A55A 2XXPA 5I2KB 4F3PA 1A54A 4OETA 4ESXA 4H8JA 4GRKA 2QMWA 1R6ZA 4OQOA 1B52A 1ZKBA 1LCTA 4OMBA 1H45A 2F7AA 2QL3A 4QSDA 3RQTA 1MH4A 1Z7NE 4RPNA 2O7UA 1LFGA 3DLNA 3ONMA 1NKXA 1Y1ZA 4IGTA 5B70A 4O3BA 3FJGA 1P1OA 2ZYKA 5H8QA 1RYOA 1MH3A 2O6AA 3MZ9A 5CBRA 3C31A 4Q5TA 3UIFA 3W9WA 2ALUA 2DP8A 4F3SA 3MP1A 4HCWA 1A99A 3LSFB 2DWJA 3K6UA 1FQCA 2QPQA 5AA2A 1NNPA 2O7IA 5L9MA 5LOMA 1H43A 5CMMA 2YJPA 3QXMA 3ZKLA 5CMKA 4AB5A 1XHYA 3H06B 4LZ8A 2WKYA 2X7QA 4EUOA 2HZKA 1B51A 4LZ7A 3PGFA 1B4HA 1I6BA 2V93A 3O28A 3SEUA 3VVDA 2F78A 2E0SA 1FQDA 1MQHA 1MS7A 1POY1 3IO4A 1JQFA 4NE4A 3H6VA 1SQYA 1Q1KA 1N04A 2B3BA 2Q88A 2X26A 4U21A 1ATGA 4YU0A 1UTBB 3EPEA 2OK2A 2ABHA 3C33A 3HCQA 4OERA 2XD3A 2AIXA 4PETA 2H4IA 4F39A 5H8NB 3USDA 5AA4A 3Q25A 4QFKA 5K2YA 1JEVA 1B7HA 1FTKA 3PV0E 3O97A 2RF1A 1OLAA 1TT1A 3G3HA 3N6UA 3UN6A 2Z23A 1Y1MA 2HAUA 3T9XB 4F2QA 1M5FA 3K6WA 1XC1A 3BFUA 1MY3A 3LSLA 4BDQA 4NF8B 3IX1A 3K1MA 3MWBA 1B0LA 1MY0A 2F7BA 3F11A 4GD5A 2H99A 1QW0A 1OIBA 5I56B 4I8CA 3TCFA 3IJOB 4KCCA 1AOVA 1B5HA 2ZYOA 4U22A 1TXFA 1DTZA 4ISUA 1NNKA 1GGGA 2H25A 1PDAA 2PVUA 5EYFA 3L6HA 1QUKA 5KCJA 1M5DA 1SW4A 4EF1A 1ZBMA 4U4XA 1IEJA 1Y3NA 1LLSA 2DXYA 3DP6A 4FEDA 1NFTA 1KWHA 3PPNA 1ZMGA 4OEUA 5TPAB 4YMAA 1Y9UA 2G93A 2RCAA 4FEBA 5CMBA 4OEVA 2H5YA 1JW1A 5B7DA 5I57B 3FV1A 2CMOA 2DOJA 3G3KA 4EQBA 1MQJA 3ILTB 3TAJA 2HXWA 1IXCA 3IJXB 3OO7A 4YB7A 1Z7ME 2ZNUA 5M2VA 3S9NC 3G3IA 2UXAA 3FVOA 4PFYA 1OQGA 2DWIA 3K1PA 4UACA 4EDPA 5TPAA 3SEWA 3DM0A 3MPKA 3MP8A 4LQ5A 3IAZA 3PD8A 4G2ZA 3PUWE 1D3KA 1LSTA 4JXIA 1FCKA 3TELA 1XT8A 1N7WA 3EN3A 1QKAA 2DVCA 2XXUA 3IOTA 1LBCA 2VP1A 5EHMA 5AE4A 1BP5A 2ZMBA 3JZJA 2OWTA 2XXTA 3H6WA 3JYRA 2XXRA 2ZYNA 3KEIA 1B5JA 4OVJA 1CE2A 4KYDA 4POWA 3K00A 1B3HA 1BLFA 3OEMA 3OO8A 2PT1A 4NWCA 2Q2AA 3C34A 3KN8A 3UK4A 3TODA 3K6XA 3M3LA 4MFIA 3EHTA 3VE1B 4NF8A 1DMBA 3KJTA 3SEYA 3RNNA 2AL4A 2XX9A 2DQVA 3PD9A 4NF4B 4NWDA 4R2FA 4R74A 2ONRA 1O7TA 4YICA 4BDMA 2XD2A 2R6GE 3TMGA 4KR5A 2V3UA 4EXKA 3T93B 3C36A 5KCJB 3ODBA 2DS9A 1B1HA 2F97A 3LBSA 4GF8A 3KOSA 2H98A 3C9HA 4RPOA 4H1XA 1EZ9A 4G68C 4IO2A 3W15C 2DWAA 3OO6A 3OSRA 5I59A 1IZ1A 1JW4A 4JWYA 5I2NA 2NUVA 4NF6A 4THIA 4Q0CA 4I1DA 3CG3A 4LZ5A 1DPEA 4OZ9A 4OESA 4H8IA 3BFTA 3MC2A 5BUUA 1PB9A 3OENA 3LR1A 4Q8RA 3FJ7A 1D9YA 4Q30B 4MLVA 5F1QA 2I58A 1JEUA 1LFIA 1WVJA 2A5TB 1FQBA 1MDQA 1UIUA 1TFDA 3L6GA 3I3VA 1SI1A 5H8HB 5EHSA 3T22A 1WODA 2OCUA 2QSXA 3QAXA 2YLNA 3UGWA 2CZLA 2XXQA 5KDTB 1FTLA 4RK9A 2Y7RA 5H8QB 2NXOA 2ONSA 2QRYA 3PUXE 3B6TA 3PUYE 3E13X 4H67A 1MRPA 3E3KA 4DDDA 3LSWA 2UVGA 4ZEBA 1UTHA 3EHSA 4N6PA 2UVHA 3GBBA 1UQWA 3OD7A 3D4CA 4ND9A 4JSDA 1GR2A 1MXVA 2HFBA 3U8QA 1JNFA 4PE5B 3CFLA 3UP9A 5I2KA 3PPOA 5KDTA 4R9GA 1AIVA 2I0CA 1US4A 2V3QA 3A3CA 1P99A 3DP4A 3RTFB 1A7LA 1URSA 1OLCA 1YCJA 4IO5A 4LA9A 4QHQA 4JB7A 4ZE8A 4BLAA 1NNFA 3CFXA 3SEVA 5FHOA 2O84X 2OJTA 3OO9A 3K6VA 3LSXA 3PPPA 4JWXA 4AQ4A 1VFDA 2XHDA 2NWJA 5FTHA 3QUFA 1H76A 5TP9A 3SETA 1MPCA 5I57A 1B40A 1B3GA 4DXUA 1MPBA 4FE8A 1B32A 1IXGA 3MVZA 2UVIA 4U23A 5I2NB 4QRZA 3IORA 4KYSA 4KPTA 1WDNA 4G68B 2YPNA 4R6KA 4R72A 3WAEA 3RGYA 2QS4A 3ZKKA 4XKQA 4MF3A 4YB6A 5L9SA 1LAGE 2F8DA 4ZECA 2PMSA 4X1BA 2UYEA 2ONKE 4IY5A 4DZ1A 1Y20A 1OVTA 3VVEA 4EF2A 3IB1A 3EF7A 3A3UA 4KQPA 3A09A 1MY4A 3KG2A 1MQGA 4NF4A 2QJEA 4JWOA 3TTMA 2NOOA 4GL0A 2F35A 1JETA 4G4PA 5I58B 2I4CA 2V25A 4GQOA 4QF9A 3O66A 4IO4A 4N07A 3VXCA 5J1DA 2B3FA 2PBWA 3PMVA 1MXWA 3FASA 3S9EA 3QIMA 4OWDA 2Z8EA 1LAFE 3C4MA 3CG1A 1B0HA 2R9JA 5DVJA 1UTBA 1OQHA 1XVXA 1EZPA 3QK6A 4OFLA 2BJJX 3S9LC 3H4ZA 3CR9A 5F7VA 1M5BA 2I0BA 2ZNSA 4G8NA 3HHFA 4GLIA 2E1SA 4QFPA 1YPNA 1MXYA 1QJMA 5CRYA 3TQLA 4QFLA 4PFTA 2M8CA 5H8SA 1QUJA 1AMFA 3TQWA 2OLBA 1HSLA 1P1WA 1URGA 4WXJA 1GV8A 5A5XB 4KHZE 2VGQA 1AL3A 4FJPA 2QS1A 3N5LA 1FTMA 2XXWA 1I69A 3FV2A 4DCXA 2OWSA 5I58A 3FXRA 3PPQA 1MDP1 3O9PA 2AYSA 2QS2A 4F3GA 3P7IA 3KN7A 4PP0A 3UORA 3TTKA 4DXBA 5JK4A 3KBRA 5H8FB 4ELRA 1SW1A 4R73A 2XXXA 1D9VA 2HZLA 3UA8A 4G8MA 2Z22A 4FECA 2A5TA 3Q26A 3U1OA 3VDFA 4F31B 1H3DA 1IXIA 3KSXA 4E0WA 2Y7PA 2ZXTA 3B7DA 2A5SA 2R71A 5JTYB 4NTLA 3MQ9A 3KFMA 3MUQA 4U4SA 2RC8A 5HM4B 3K01A 4EQ7A 3SKPA 4G68A 4MLQA 4YKPA 3SESA 3GZGA 5CBSA 4PQJA 1R9QA 3C32A 1XVYA 1VR5A 2QMXA 3R26A 3M8UA 4LATA 2I6EA 4U2RA 4ZEKA 1USYH 2GH9A 2THIA 3GXAA 3CFZA 3MBPA 4OHNA 1MY1A 3IO6A 3W9VA 3CIJA 3U94A 1LB8A 1B46A 1MM7A 1POTA 3FXQA 5TU0A 4DXCA 4IGRA 3FD3A 3QSLA 1P1QA 1Y3QA 4P11A 2GFEA 4JSOA 4POXA 4HW8A 5AA2B 4RY1A 1A8FA 2ZYMA 4RJZA 1AH5A 1B58A 4F1VA 4EXLA 1SDXA 3KN3A 1FQAA 1YTVA 1RKMA 4YKIA 3GBAA 4HCYA 3CSGA 1PB8A 1N84A 3EQ1A 3ILUB 3RLFE 3TKDA 1DSNA 3LC8A 2Y7IA 3RT8A 4LQ2A 3TTRA 2F36A 3HO7A 5A5XA 4R2BA 2AL5A 2XXYA 2Y84A 1LGBC 1OVBA 1UTHB 2VHAA 4KI0E 3PPRA 1A40A 1BTJA 2VD3A 4MH5A 3HPIA 1M5CA 1LBBA 3FVKA 3U72A 2FNCA 2F34A 1R1NA 2KLFA 3H6TA 2F5XA 3IOVA 4HS7A 5DVIA 4OENA 4RK2A 3VLVA 4LONB 3VFJA 1B9JA 3OOAA 4XKPA 4YKKA 1B7ZA 1B6HA 1B7UA 2OZZA 1B2HA 3MW0A 3MZBA 2XXHA 3N94A 4IB2A 4OFJA 4R75A 4R9FA 1DOTA 1B5IA 2DE2A 4PFWA 5FTIA 4KFQA 4YMBA 4Z7EA 4ZEDA 1FQEA 1HSEA 2DVZA 3FGSA 3IB2A 3OELA 1JW5A 3PMWA 3K0VA 4YKJA 2UVJA 3RPWA 1USYE 4FATA 1OMPA 3SDFA 4ZE9A 3TTLA 5DEXA 3R7XA 3CRBA 5KZTA 4NF6B 5DT6A 5I59B 4KD5A 3OMBA 4XTCQ 3MJNA 4XIGQ 1N76A 4YZZA 1PBQA 1VE4A 2F6PA 4WKMA 2Z8FA 3O6GA 1SBPA 4YB5A 3IK6B 2D5WA 1LAXA 1P1NA 1ZTYA 1F9BA 1MQDA 3CI8A 3FVGA 4K3FA 1PC3A 3KOTA 4QFNA 5FHNA 2XXIA 2V84A 1PBPA 5CC2A 1GTKA 4X1DA 3S2VA 4IY6A 2LAOA 2I4BA 1PEBA 3FATA 1SD3A 1I6AA 3IB0A 1I6QA 1N0TA 1YAEA 2PYYA 4GXAA 4H6DA 4O3CA 4ZEIA 2DSFA 4P0IA 3DELB 4C0RA 4FIMA 5AA3A 1IQ7A 4IO3A 1N7XA 4BDRA 3DP8A 4I62A 5L9OA 1D4NA 1S50A 3PU5A 4ECFA 3CVGA 3MVXA 3O6IA 4ZDMA 4AB6A 3ECRA 3TFLA 5AA4B 1EZOA 5AA2D 3GLBA 5ISUA 1EH3A 2RCBA 3ZSFA 1NL5A 4NF5A 4GIZA 4QSEA 5CI5A 3TDJA 3BBRA 3N6TA 3T9VA 4LVQA 2O1LA 1LFHA 3LUYA 2DWHA 3MVYA 3O29A 3T9UA 1ZIUA 2P1SA 3WAFA 3TCGA 4H65A 3K4UA 2V3TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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