2XX7A

Crystal structure of 1-(4-(1-pyrrolidinylcarbonyl)phenyl)-3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1h-indazole in complex with the ligand binding domain of the rat glua2 receptor and glutamate at 2.2a resolution.
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
b'GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Integration of Lead Optimization with Crystallography for a Membrane-Bound Ion Channel Target: Discovery of a New Class of Ampa Receptor Positive Allosteric Modulators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 82
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xx7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xx7A02
2DOJA 3G3JA 1EZPA 1B9JA 1SVXB 5AA2D 1PC3A 2Q2AA 3Q29A 4QFPA 2NVUB 4OEUA 2DE4A 2XXIA 4YB7A 3F11A 4PETA 4G77A 4G4PA 3HPIA 4EQBA 1FQCA 4BLAA 3PPRA 1PB7A 4ZS9A 5I2KA 4QFNA 2HCAA 5I2KB 2HZKA 3IORA 4YMAA 1P1UA 1N84A 4R6KA 3SEXA 2ZYMA 3WAFA 3TAJA 1SYHA 2XXUA 2OBGA 1LB8A 1QUJA 1FW0A 4DE8A 1B05A 4E0WA 2XXWA 2ZNTA 1MH4A 3OEMA 3TCHA 1PB9A 3K6XA 1MPDA 4R9GA 5F1QA 3QK6A 2UVHA 4PFWA 4KFQA 1B40A 2I48A 1SI1A 2PT2A 3C35A 1QULA 4FORA 3B6QA 4ZEDA 2O69A 4RPOA 1MDQA 3MP1A 3K1MA 1UQWA 1JW1A 5H8FA 1OLCA 1MXUA 5L9SA 5H8FB 1NL5A 1P1OA 1LLSA 4IB2A 1M5DA 1D4NA 4ELPA 4ZEBA 2RCAA 2HAUA 1LCTA 3IOVA 3DP8A 4WEDA 4QRZA 3QUJA 4ISUA 3VXCA 3O66A 1P1QA 3BFTA 4IO7A 4OMBA 3RN8A 4JSOA 4RK2A 1H45A 1T0KA 1TXFA 1NH7A 2DVCA 3ECRA 4PFUA 4ZDMA 3MPLA 2R6GE 3QXMA 5AA1A 1FCKA 5FHOA 3B6TA 4KYDA 1NMUA 4ZEIA 3GBAA 4MFIA 1H76A 2Y84A 4G8NA 5ELVA 3G3FA 1L5TA 2NWJA 1HSEA 3O2AA 3LSFB 1ZKBA 1I69A 4C0RA 1OMPA 2F36A 3LBSA 1JEVA 2REGA 2F5XA 1VR5A 1GTKA 1MPBA 4M1VA 2UYFA 3PUVE 2UVJA 3S9EA 3MPKA 4H65A 1EZ9A 3BBRA 2P2AA 1FTMA 3FD3A 2KLFA 3ILTB 3CRBA 3VVDA 1NNTA 3VLVA 3CFLA 5EHMA 4WKMA 4K3FA 2F7BA 1AH5A 3O9PA 1II5A 3C9HA 2ONKE 3HCQA 4YU0A 4AB6A 2F7AA 1JW5A 3V8XB 2GHBA 3W15C 4HCWA 4N6PA 1IXHA 3MP6A 1MY1A 3DELB 1A40A 3N6UA 4DCXA 2QMXA 1B52A 3TYHA 3M8UA 1M5EA 1NNFA 3TEPA 4FIMA 1A55A 1B7UA 4R72A 1TT1A 2PT1A 3H6TA 3KN7A 5CBSA 2O6AA 2H9BA 2RCBA 5B70A 2O1LA 2H5YA 4LQ5A 4PFTA 3QSLA 2YLNA 2QS3A 1JQFA 2HFBA 5L9MA 1Y3QA 3ZKLA 1LFGA 2O7UA 3VLUA 3GXAA 1MM7A 4GVOA 3PUXE 2XXPA 1UTBA 1DOTA 3IJXB 1CB6A 1UTBB 4NMYA 3SESA 1UIVA 1POTA 2THIA 2ONSA 1GR2A 4IO6A 4PFYA 4F2QA 1N3WA 1IITA 1R9LA 2I0BA 1O63A 3RGYA 5FHNA 1DPEA 3HN0A 2I4CA 2H25A 1B3EA 2I0CA 2ESNA 4GD5A 3UGWA 2I3WA 1PBPA 1FQBA 2B3BA 4F1YA 4DXCA 2QL3A 5JEIA 2QPQA 2RC7A 3T9UA 1FQFA 4Z0IA 2V3TA 1B4HA 1LAHE 3G3KA 4NF5A 3S2VA 4MBPA 4NF5B 2NOOA 1LBBA 3QYTA 3EQ1A 3MWBA 3TZAA 2QMWA 1R1NA 3T9VA 1QVSA 1URDA 4OYVA 4DCYA 1AL3A 1IUDA 3OO6A 4IGTA 3TODA 2D5WA 4MF3A 2VGQA 5DTBA 5CRYA 4JWXA 4LP2B 4E0XA 3E13X 5AA4A 1JVYA 2I6EA 4YKPA 5AA4B 3KEIA 3TFLA 2HQ0A 1USYE 4YMBA 4ZEKA 4DXBA 2ZYKA 3KN8A 1VE4A 4KYSA 2B3FA 2YJPA 2XX7A 4AB5A 1YTVA 2I4BA 3K02A 2Z8DA 3UORA 3C36A 3RTFB 1MY4A 4ZZEA 4OFOA 3FXRA 4RPNA 3A09A 4UA8A 4U2RA 4DZ1A 3TUSA 4ZEFA 2ZMBA 1MH3A 3ZS6A 2NUVA 5DYHA 4X9TA 3O6GA 4MLVA 3VVFA 4BDNA 2UXAA 1S9TA 3D4GA 4MH5A 4ECFA 5CM6A 2F35A 5DVIA 4R2BA 1MY2A 1Y9UA 3N26A 1FTLA 2UVGA 4FEBA 3EHUA 5TU0A 4BDMA 3I6VA 1B3GA 4QHQA 2B65A 3C31A 3O97A 4FE8A 2UYEA 4LZ7A 5H8NA 1XS5A 1ELJA 1S7YA 3MQ9A 2DE3A 1BIYA 3QIMA 3DP4A 4F3PA 3TDJA 3K00A 3EHTA 1M5BA 1MG1A 4EUOA 4KHZE 4FATA 4GOTA 4G2ZA 5I59A 1ZLQA 3DM0A 2H98A 5I59B 5JK4A 3H3GA 3SDFA 4ELRA 1B51A 3E9XA 1Y1MA 4R6YA 1JVXA 3R26A 1PBQA 1I6QA 4HCYA 4WXJA 1NH8A 4POXA 3BKIB 1JEUA 2XX9A 1QKAA 4THIA 2ONRA 2XD2A 2Z23A 3PPOA 1MXVA 4ONYA 2H99A 2RF1A 4F3BA 4OEVA 5HBCA 5CMKA 1B1HA 4OENA 3JYRA 2OWTA 3TTKA 1H43A 2DYXA 4O3AA 1A99A 3OEKA 4LATA 1N7XA 1YCJA 1OIBA 4KCDA 1LAXA 4C1UA 1H44A 1Y4TA 2AL5A 2A5SA 5CMBA 1UIUA 5H8QA 4Q8RA 2V93A 5H8QB 4OVJA 5DVJA 1MQJA 1MQHA 3Q26A 1B1XA 1GV8A 5EHSA 3IOUA 4GIZA 2ALUA 1M5FA 2HZLA 2QSXA 5DEXB 2XX8A 1XOCA 4G68A 1RYOA 2NXOA 4QF9A 3UIFA 3H03A 4RK9A 5AE4A 4G68B 2G29A 4M4GA 3FVOA 3O29A 3U72A 4Q0CA 2OLBA 3R7XA 1A54A 4F3GA 5DVFA 2PMSA 3N5LA 4WEPA 2GRVA 4YZZA 1AMFA 2QS2A 3CVGA 4POWA 2WKYA 3VV5A 4PP0A 2XXTA 5CC2A 2O7IA 1MM6A 4YKIA 1FQEA 3IX1A 4L17A 3TQLA 1JW4A 3HSTA 4HW8A 3MVYA 4IO2A 1B3HA 3FV2A 3T9XB 1B5JA 1HSJA 2GHAA 2F8DA 2REJA 4OETA 2ZNSA 1IZ1A 5LOMA 4LVQA 3CR9A 3T96B 1N7WA 2ZYNA 4U22A 3G7WA 4I1DA 4FEDA 2A5TA 5IKBA 1ZU0A 2A5TB 2RKMA 4TOZA 1B5IA 4OESA 3MVZA 3V89B 3HHGA 1DPPA 2OK2A 3LR1A 3S9NC 1XC1A 2X26A 1FQAA 1SDXA 4GL0A 2FYIA 2Q9TA 1AOVA 1P1NA 1A8FA 4YB5A 3H6VA 4KD5A 5A5XA 3N6TA 5A5XB 5L9OA 4JDFA 4ZE9A 2F34A 2E0SA 3K1PA 1LGBC 3K6WA 4GXAA 3MUQA 4FJPA 1EZOA 3ONMA 3FXUA 2D3IA 1RYXA 1NKXA 1N76A 2DXRA 3H4ZA 3PU5A 3USDA 4EF1A 4KCCA 3DP6A 1UTHA 2F78A 5ITPA 1UTHB 1WDNA 3U92A 3K1NA 3V5AA 3IOTA 2G93A 2OCUA 3K2DA 2VD2A 3GLBA 2ZXTA 1IEJA 3JZJA 2R71A 2V84A 1Z7NE 2V25A 3MP8A 2BJJX 3FATA 3O28A 1LAFE 4QFOA 1A8EA 1WODA 1B46A 2RC8A 1ZTYA 1D3KA 4PE5B 1VFEA 1MQIA 1XVXA 5F7VA 3FGSA 3FVGA 3FJGA 3KOTA 4Q30B 3CI8A 1EU8A 5CI5A 2XXVA 1Z7ME 4RNSA 1BP5A 5KDTA 4QFLA 2DS9A 2DE2A 5KDTB 3MVWA 1Y1ZA 3TPAA 3PUWE 1QUIA 5FTHA 2DXYA 4P0IA 1POY1 4BDQA 2AL4A 3PPNA 3DLNA 3OENA 5ICTA 1XHYA 1BKAA 4AQ4A 2XXYA 3KOSA 3A3CA 2PVUA 1YPNA 3MZ1A 3T9HB 3VVEA 3SEWA 3HO7A 1B6HA 4G8MA 3TMGA 3OO9A 3SERA 3C34A 5J1DA 1KWHA 3CSBA 4OWDA 4TLMB 4ZECA 3MZ9A 1LAGE 3G3IA 3KBRA 4RYAA 1B4ZA 2RC9A 3FVKA 3T93B 3GZGA 3KN3A 1SW1A 3S9LC 3LUYA 1FTJA 5TPAA 2DWHA 3M3FA 4OERA 4OZ9A 3PMWA 2D21A 5TPAB 5AA2A 1Y3NA 5AA2B 4F3SA 3E4RA 1BLFA 2VP1A 1URSA 1ZMGA 4P11A 4DLDA 4H1XA 3FIRA 1XT8A 3K6UA 3K4UA 2DSFA 3QUFA 1A7LA 3TTNA 3RT8A 5FTIA 1B7HA 4EQ9A 2M8CA 1OVTA 1N0TA 3OO8A 3IK6B 5B7DA 4LZ8A 3TKDA 4GFRA 3THIA 3KJ7A 4C1TA 2E1SA 1LCFA 3PPQA 2P1SA 1HSLA 3WAEA 3P7IA 1LFHA 3PGFA 4XKQA 4U21A 4OQOA 1MDP1 2V3UA 3OELA 3KGCA 3RNNA 4DXUA 4IO5A 4H8IA 3T66A 1QJMA 5FHMA 4JSDA 5TP9A 4KI0E 3CG1A 3CSGA 3CIJA 5BWJA 1J1NA 5TP9B 1ZIUA 4N07A 4KYEA 4U1OA 2ZNUA 3HV1A 1EH3A 1Q1KA 1N04A 3FVNA 2Q89A 3MW0A 2X7QA 1MY3A 1B32A 4X48A 2XHDA 3VE1B 3PV0E 4H5FA 2IA4A 4GXSB 4XKNA 4EXKA 2QS4A 2ZYOA 4LZ5A 4XXUA 3SEUA 1TFAA 1LBCA 4I9DA 1DSNA 1H3DA 4IGRA 2Z8EA 2F7CA 4NF8A 4YKJA 3B6WA 3H7MA 4NF8B 4JWYA 3R6UA 1SQYA 3Q28A 2ABHA 4GLIA 2PYYA 5BUUA 3HHFA 4JXIA 4XKPA 3EF7A 1I6BA 3IO4A 3K6VA 3OSQA 3FJMA 1P99A 1D9YA 4I8CA 1ATGA 4NWCA 3C32A 3M3KA 1LFIA 4DIGA 4QSDA 3MJNA 3Q27A 1IQ7A 4LUBA 2V3QA 3TELA 3I5OA 3G3HA 3UP9A 1MQDA 3EN3A 2Q2CA 2FNCA 5I56A 5EYFA 3IO6A 4F29A 5KCJA 3OOAA 4TQUQ 5I56B 3SKPA 2Y7PA 4H5GA 4U4SA 5KCJB 1SW5A 5CBRA 1WVJA 4NF4A 3AXFA 3Q25A 3CFXA 4NF6A 4NF4B 2FA7A 3KZGA 4H6DA 4IY5A 3B7DA 4NF6B 1NNKA 3E3KA 3ZSFA 2H4IA 2Q88A 3ILUB 2O51A 3U94A 1FQDA 1B7ZA 2QJEA 4YB6A 3W9VA 2Q8JA 1QW0A 1M5CA 3VXBA 5ITOA 3RLFE 1R6ZA 1I6AA 1B2HA 5CMMA 1Y4CA 3G3GA 4O3CA 5M2VA 2Y7RA 1TWYA 2Y7KA 3FASA 5DEXA 4RJZA 2OWSA 1USYH 3FV1A 1SBPA 2DVZA 2DQVA 1MQGA 3IB0A 2HEUA 4F1VA 4R75A 4JB7A 2F6GA 2QS1A 1MRPA 3TTRA 5IAIA 4G8HA 3K01A 3RY3A 2CMOA 1NNPA 2Z22A 4R9FA 1O64A 3K0VA 4LA9A 1P1WA 3KSJA 4OXVA 2XXXA 1QKBA 5I58A 3FUZA 4N13A 3IOWA 3C4MA 1B5HA 5I58B 4R2FA 4RY1A 3IL1B 3JV9A 1D9VA 3LSXA 4BDRA 4NWDA 3ZKKA 4YICA 3IAZA 4OHNA 3SETA 1B0LA 2R9JA 4QFKA 3IR1A 1MXYA 3N94A 2YPNA 4EXLA 1NFTA 3MBPA 1IXIA 1N3XA 4R73A 3S4UA 3VDFA 3EHSA 2I3VA 3U8QA 4KQPA 4NEDA 1SW2A 2Y7WA 3RQTA 5ICQA 5I57A 3LSWA 2LAOA 4JBZA 2PBWA 4DDDA 4BDOA 3M3LA 4ZZAA 5I57B 1DTGA 4O3BA 3OMBA 3H6WA 3RPWA 1YAEA 3RTWB 4H67A 4IO4A 1PB8A 1XVYA 1B3LA 1MXXA 3OXNA 3O6HA 1SW4A 1US4A 4EF2A 3H06B 1PEBA 4U1ZA 4I62A 3KJTA 5HPQA 4RXLA 4X1BA 1RKMA 4RA1A 1IXCA 4F22A 2W7YA 5JTYA 4F19A 5H8SA 5JTYB 4UACA 3MAMA 5K2YA 3KFMA 1O7TA 3H6UA 1PDAA 4GL8A 2I58A 4IY6A 1MY0A 1OLAA 3U1OA 4ESXA 4EDPA 4YKKA 1MXWA 1R9QA 1IIWA 3UK4A 1ZJLA 4GQOA 1IXGA 4KPTA 4TLLB 3PMXA 1DMBA 4OTEA 1VSOA 2XD3A 3IJOB 2HAVA 1B0HA 2I49A 1MPCA 3UN6A 3OD7A 3PMVA 3LC8A 1LB9A 4U23A 4R74A 3CG3A 2VD3A 3PD9A 4XKRA 4HS7A 2IEEA 3KSXA 1URGA 4LQ2A 4U4XA 4PQJA 1OQHA 2AYSA 4F18A 4ZE8A 3BFUA 4R6HA 5K2XA 3RUMA 1B3FA 4XIGQ 4GWOA 4FAJA 4OFJA 4X1DA 4F39A 5L8DA 1BTJA 2GFEA 4FECA 3PUZE 4Z7EA 1DTZA 3C33A 1B58A 1US5A 4ELOA 2RINA 5DT6A 1AIVA 1LSTA 2DWJA 2O1MA 5AA3A 1S50A 4YAHX 1VFDA 3TTLA 5ISUA 1FTKA 3GBBA 3MZBA 3PUYE 2GH9A 2XXRA 3V83A 4F31B 4HTGA 2QRYA 3CFZA 1ZBMA 4G68C 1Y3PA 3SEVA 3FJ7A 3TCFA 2CZLA 4ND9A 2ANJA 4KR5A 3TCGA 2O84X 3U93A 4MLQA 3FXQA 3L6GA 1JETA 2AIXA 2DP8A 2DWAA 3TTMA 3VFJA 3MVXA 2PX1A 1MS7A 4NE4A 4ELQA 1F9BA 4NTLA 1QUKA 4LONB 3KG2A 2P0SA 1ANFA 2UVIA 4JWOA 1JNFA 3MC2A 5I2NA 3VLWA 3OO7A 2VOZA 5I2NB 2DWIA 1TFDA 4H8JA 1GGGA 2O68A 2Z8FA 2F6PA 2HXWA 5KZTA 4P0GA 2OZZA 3FZVA 3OSRA 4ESWA 3S9MC 2OJTA 3RT6B 3QAXA 1OVBA 2XXHA 3L6HA 1Q35A 2Y7IA 4F1UA 2VHAA 3TQWA 4BDLA 3T22A 1OQGA 4GRKA 3A3UA 4F2OA 3D4CA 1CE2A 4IO3A 1GVCA 1SD3A 3W9WA 3LSLA 1MXZA 4H0WA 5I84A 3I3VA 1SYIA 3IB1A 5H8HA 5HM4B 5H8HB 1FTOA 3IB2A 4XTCQ 3SEYA 4Q5TA 3EPEA 3O6IA 2F97A 4OFLA 4GF8A 5H8NB 4QSCA 3ODBA 3UA8A 1Y20A 3PD8A 3PPPA 4QSEA 4EQ7A 1SI0A 2XXQA 2X7PA 5CMCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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