2XX9A

Crystal structure of 1-((2-fluoro-4-(3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7- tetrahydro-1h-indazol-1-yl)phenyl)methyl)-2-pyrrolidinone in complex with the ligand binding domain of the rat glua2 receptor and glutamate at 2.2a resolution.
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Integration of Lead Optimization with Crystallography for a Membrane-Bound Ion Channel Target: Discovery of a New Class of Ampa Receptor Positive Allosteric Modulators.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 85
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xx9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xx9A02
3JYRA 1LFIA 2G93A 4M1VA 1JW5A 1P1UA 2H5YA 1IXCA 1QW0A 4IGTA 2OJTA 4YB7A 3VFJA 4ECFA 2I48A 3VLWA 5I56A 3MAMA 4F3BA 3KSJA 4G2ZA 2F36A 3M3KA 1N76A 2REGA 2UVJA 4F18A 1OIBA 3KN8A 3VLVA 4NF8A 4X48A 2B3BA 4OHNA 3I5OA 4NTLA 5L9MA 1DOTA 4I9DA 3N6UA 1FCKA 4EDPA 1ZMGA 1NL5A 4NF5A 1JEUA 4YICA 2Z8DA 4EF2A 1UIUA 3PPOA 2DXRA 2V84A 3T9HB 5FHNA 4F3SA 3LUYA 1A40A 1MY4A 1SI1A 3FJGA 3I3VA 4QFNA 2UVGA 4YB6A 4H0WA 3MZBA 2THIA 3T93B 1UTHB 3FXQA 5L8DA 4OWDA 1VFEA 1XS5A 3CSBA 3LR1A 1R9LA 4K3FA 4BDQA 4YKJA 4O3CA 1GR2A 2QS3A 4PFTA 2Q88A 2XXIA 1FQFA 3O66A 3IO4A 4U22A 1I6QA 3SDFA 1JVYA 1FQCA 1NNPA 2DS9A 1MXWA 1BLFA 3H4ZA 3IORA 4F2OA 1H45A 5I84A 5DEXB 3WAEA 3B6TA 1NKXA 3DM0A 4PETA 3MQ9A 3MP1A 1ZTYA 4KR5A 3G3GA 2F6GA 3SETA 1T0KA 4R2BA 3C34A 1B6HA 4FECA 1P99A 2PMSA 3M3LA 3RQTA 4GQOA 4HCYA 3OO7A 3QIMA 2DVCA 3USDA 2DQVA 3W15C 4AQ4A 4I1DA 1QVSA 1S7YA 3JV9A 3TZAA 1M5CA 3W9WA 3O2AA 1HSLA 1OQGA 3DP6A 3H6UA 4QFOA 4LP2B 2ZYOA 3LSLA 4MFIA 3K00A 5ICTA 4RJZA 1A99A 1MPBA 3UP9A 4ZECA 4JDFA 4U1OA 4NEDA 5F7VA 1N3XA 5I58A 4OESA 5AA2D 3OD7A 5DT6A 3HV1A 2HZKA 4BDLA 5DVIA 4OEVA 3R7XA 4U4SA 2A5SA 3PUXE 3S9LC 3R6UA 3SERA 1OLAA 3G3HA 1XVXA 1MPDA 5I2NA 3K4UA 2VGQA 5H8QB 2ALUA 2LAOA 4JSOA 2HFBA 3FVGA 4OENA 2Z8EA 4I8CA 3SEYA 4FORA 2Z8FA 2Q8JA 4GXAA 3FASA 5A5XA 1ZIUA 4NF4B 4PFYA 4LATA 3K02A 3HSTA 3KGCA 2XXRA 1EZ9A 4LZ8A 3RT6B 1JW4A 5FHMA 3FVKA 2V3TA 5I57B 1UTBA 1IXHA 3KN7A 3QK6A 3KJ7A 3FATA 1B2HA 2ANJA 3VVFA 1NNTA 3H06B 1AL3A 1II5A 1FTOA 3C4MA 3UIFA 2QPQA 5IKBA 3FXRA 4H5FA 1URSA 1MQHA 2OBGA 2PYYA 1F9BA 3RUMA 4OERA 5AA4B 2HCAA 1NH7A 1MM7A 3UN6A 3MBPA 4LVQA 2UYEA 3VXCA 4PQJA 1SW1A 3MC2A 4ZEBA 3CIJA 3MW0A 2R9JA 2M8CA 4QFKA 1ATGA 1UTHA 4G8MA 2ZYKA 4DCYA 1H44A 1QKAA 1B4HA 3VVEA 4IO5A 3OO6A 3ILTB 3C32A 3TCHA 3Q29A 4YB5A 2Y7IA 1VSOA 3B7DA 4RNSA 4PFUA 2FYIA 1L5TA 4RPNA 5TU0A 1CE2A 3GBAA 3LBSA 1EZOA 4YMBA 3CG3A 1LBBA 2ZNSA 3VE1B 1OQHA 4QF9A 3VXBA 3CR9A 3TTNA 1M5FA 3EN3A 5TPAB 1IZ1A 1FW0A 5CMCA 4OFLA 5DEXA 2OK2A 5CC2A 4IY6A 1YCJA 1B3GA 4PFWA 2ESNA 4PP0A 1MXUA 1GVCA 1NMUA 5I59B 4RK9A 1OLCA 3FVNA 3PUYE 3TCFA 5IAIA 4IGRA 4H65A 1EH3A 2E1SA 3N6TA 1MXXA 1B51A 5ITOA 1YTVA 5KCJA 3KN3A 1OVBA 3PPRA 3TFLA 4G68C 4M4GA 5AE4A 3H7MA 1B0LA 1WVJA 2NUVA 5H8FB 1B7HA 2DE3A 1Y3QA 2XX9A 3K2DA 4X1DA 1VFDA 3SKPA 1NFTA 4GWOA 4G77A 3KFMA 1Y3NA 1ZLQA 3PMVA 4L17A 1MM6A 5EYFA 1Q1KA 2W7YA 2F7AA 1H43A 3E4RA 2GFEA 4JSDA 3M8UA 3MJNA 4WXJA 3W9VA 1PB8A 1ZJLA 4O3AA 1P1OA 4IO3A 1B0HA 3I6VA 3T9XB 3V83A 2R6GE 2DE4A 2QMWA 1HSJA 3QAXA 4IO4A 4MH5A 1TFDA 4UA8A 4EQBA 2I4BA 4XKQA 1FTMA 1QKBA 1UIVA 5TP9B 4FATA 4KI0E 4EQ7A 3G3JA 3TQWA 2QL3A 1HSEA 3GLBA 3G3IA 2ZMBA 3TMGA 4ZEIA 5LOMA 4HTGA 5JTYA 3FGSA 4FIMA 1ZU0A 4DZ1A 4R6YA 4G68A 2AL5A 2B3FA 1POTA 4DXBA 2X26A 1IIWA 3B6QA 4ZEKA 3O6IA 1IEJA 3IB2A 3K6VA 4R72A 2Q89A 5AA4A 3IX1A 4ND9A 4GRKA 2HXWA 3MP8A 5EHSA 4JXIA 3ODBA 3F11A 4ZZEA 4Z7EA 3BKIB 2DP8A 4AB5A 1B9JA 3R26A 2PT1A 1MXYA 4G8HA 5CBRA 3IOUA 5L9SA 3CG1A 2UXAA 2D3IA 4H1XA 3V5AA 4XIGQ 4C1TA 3VV5A 4G8NA 2NXOA 5JEIA 4ZDMA 2NVUB 3UGWA 2DXYA 3FZVA 1B1HA 3OELA 2V3QA 4KD5A 3TQLA 1MQIA 4LUBA 2A5TB 3PPNA 2UVIA 3SESA 4F1VA 3OO9A 4QSDA 3HHFA 1O63A 1GV8A 3S9MC 3QSLA 3T9VA 4X1BA 4KQPA 5CM6A 1FQBA 2O7UA 1TWYA 4ESWA 5I59A 1DMBA 1WDNA 4O3BA 1A7LA 4P0GA 4P0IA 3PMXA 3OSQA 1D9YA 3VLUA 1I6BA 1N0TA 4KHZE 3TTMA 3DELB 3H3GA 5DVFA 4EUOA 4GD5A 1ELJA 1IQ7A 5KDTB 3K01A 2Y7PA 5ITPA 4JBZA 1D3KA 1MXVA 3PD8A 3TTLA 2O1LA 5HBCA 2CZLA 3L6GA 1I69A 3TCGA 3UORA 2HZLA 1SYHA 2ONKE 2F34A 3ZS6A 3U8QA 3RPWA 3OXNA 2IA4A 4JWOA 1LSTA 1SW2A 1JVXA 5F1QA 3EHUA 4N13A 2XXYA 4F1UA 1JNFA 1EZPA 2I6EA 4YKIA 3HPIA 1H3DA 4YZZA 1DSNA 3K1NA 1SI0A 4OYVA 4LZ7A 2Y84A 1MXZA 3K6UA 1MY1A 4TQUQ 4OTEA 2D21A 2DWIA 4YKKA 4WEDA 2RF1A 3Q25A 3RNNA 4EXKA 1PEBA 4NWCA 1IXIA 3TAJA 4F31B 2AL4A 3HN0A 3EHSA 2XXXA 2GRVA 2RKMA 4R2FA 3EF7A 1URGA 3HCQA 3K0VA 1LCFA 4ELRA 3N94A 1FTJA 2HQ0A 3ECRA 4LQ5A 4H8JA 1BTJA 3AXFA 2VD3A 2XX8A 4U21A 2ZNUA 2REJA 2NWJA 1B46A 1IITA 4R6HA 5H8NA 5AA2A 3O6GA 2GHBA 2QMXA 3U94A 3WAFA 4ELPA 4DCXA 3FUZA 4XXUA 2X7QA 4RXLA 4P11A 4RA1A 4ZEFA 5AA1A 4YMAA 5HM4B 4MLVA 1D9VA 5DTBA 5K2XA 3RY3A 2VD2A 4FJPA 1Z7ME 2XXTA 4NWDA 1SQYA 4HCWA 1MDP1 4XKNA 2ZYNA 1Y20A 4Q8RA 3EPEA 2RINA 3QUFA 1ZKBA 4IO7A 1GGGA 1S9TA 2O68A 4MLQA 4FE8A 4U23A 3C33A 2I3VA 2DSFA 2A5TA 4GXSB 5B7DA 1CB6A 4DE8A 5AA3A 2Q2AA 3MP6A 4ONYA 5FTHA 1AOVA 2H98A 3O29A 4ISUA 3FIRA 1J1NA 1S50A 2XX7A 3E3KA 3LC8A 1RKMA 3FJMA 1DTGA 1TFAA 4TLMB 3ZKKA 3CRBA 3U92A 1B5IA 3C36A 3K1MA 3IOWA 1N7WA 2YLNA 5I56B 1XOCA 2Z23A 4QFLA 2RC9A 2Q2CA 2E0SA 1PB9A 3OO8A 3FVOA 1SBPA 4NF8B 1SW5A 4IY5A 4OETA 1B7UA 4DLDA 1VR5A 4BDOA 4BDMA 4KCCA 4WEPA 3KSXA 5KDTA 4C0RA 4NF5B 4HS7A 2I3WA 4JB7A 2XHDA 2I58A 4F29A 3E13X 1SD3A 1IUDA 1D4NA 5M2VA 2P0SA 4F22A 1JEVA 4ZEDA 2PBWA 2Q9TA 1LAFE 5CMMA 1PC3A 2XXHA 1IXGA 4R9FA 3PGFA 4U1ZA 4QSEA 3D4CA 2H4IA 3CVGA 2RCBA 2XXQA 2DWJA 3DLNA 4RK2A 2CMOA 4RYAA 1RYXA 3IJXB 2O7IA 2ONRA 4FEDA 2YPNA 3S4UA 4F1YA 2AIXA 4G4PA 1DPPA 3A09A 3KOSA 5FHOA 4E0WA 1O7TA 4GL8A 3GXAA 4NF6B 1URDA 4WKMA 3FV1A 1A8EA 1N3WA 4GF8A 1LBCA 1POY1 1SVXB 1XVYA 2GH9A 4RY1A 4R6KA 4LQ2A 1AMFA 5H8QA 1OMPA 3FJ7A 1P1WA 2AYSA 4IO2A 3SEXA 2I0CA 3PPPA 3TTKA 2QSXA 2XXVA 1MY3A 2O84X 5I2KB 4NF4A 3OEMA 4ELQA 3OENA 1LFHA 2I0BA 3PV0E 1M5BA 4KPTA 4GL0A 4ZZAA 3PUWE 1LLSA 2HAVA 5I57A 3PU5A 1MH4A 4GIZA 4U2RA 1BKAA 3U72A 1PBPA 4F3PA 5CBSA 2RCAA 1A54A 3MZ1A 4OMBA 2FNCA 3ZSFA 1R6ZA 3MUQA 3KEIA 1MY0A 3IOTA 2F5XA 4LONB 4LZ5A 3FD3A 4JWYA 4IO6A 3CSGA 3SEWA 1QUIA 5I2NB 5BWJA 3S9NC 2DWAA 2I4CA 3PUVE 3BBRA 3K6XA 3OSRA 4F2QA 3CI8A 2H9BA 5A5XB 3FXUA 1BP5A 3IR1A 3GBBA 2X7PA 1SDXA 1R9QA 3GZGA 3RGYA 4U4XA 4OZ9A 2V93A 4IB2A 3A3UA 2DYXA 2DE2A 2DWHA 1Y9UA 1B3FA 1PB7A 3PD9A 4OXVA 1UTBB 1LCTA 1YPNA 4H6DA 4XKPA 3TODA 1MRPA 5TPAA 4Q0CA 3PPQA 5H8HB 2UVHA 4POXA 3A3CA 4POWA 5HPQA 2F8DA 1LAXA 3G3KA 1B52A 4TOZA 3ONMA 3VDFA 4YKPA 3E9XA 3LSWA 2V25A 2G29A 4DIGA 1B7ZA 2VHAA 1MQJA 1B5HA 1Y4CA 3G7WA 3BFUA 4FEBA 1H76A 3H03A 3HHGA 4GLIA 3QYTA 1ZBMA 2XXUA 3VVDA 1NNFA 5CMKA 3IB0A 1MS7A 4JWXA 4OQOA 1JW1A 3S9EA 3OOAA 1MPCA 2B65A 3EHTA 2F7BA 4ELOA 1B05A 5H8FA 1QULA 5K2YA 4OEUA 1NH8A 3S2VA 3RTWB 3KOTA 1NNKA 3TKDA 4NF6A 3PMWA 1QJMA 3N5LA 2F97A 5B70A 4KYDA 3O6HA 4QFPA 4BLAA 3IO6A 4THIA 3TUSA 1US4A 2YJPA 3C31A 3TTRA 1YAEA 4KYSA 3MPLA 4EF1A 1FTKA 2O1MA 3UK4A 1Y3PA 4Q5TA 3RN8A 2I49A 1PDAA 3OMBA 5TP9A 5I2KA 2P2AA 1LB8A 2XD2A 5KCJB 2QS4A 1XT8A 5DYHA 1FQEA 1MQDA 1I6AA 3DP8A 4X9TA 3CFZA 2ABHA 2QS1A 2PX1A 5ICQA 2XXPA 1MDQA 2ZXTA 1B5JA 4QSCA 3V8XB 1MG1A 2F35A 4EQ9A 3MWBA 2Y7RA 2QRYA 1DPEA 1SYIA 4Z0IA 3TPAA 4LA9A 4R75A 2R71A 3O9PA 4E0XA 3H6VA 1Y4TA 4QRZA 2HAUA 1M5DA 3JZJA 2OZZA 3SEUA 3KJTA 3RT8A 2UYFA 3KZGA 1LFGA 4OVJA 3MVXA 3C9HA 3HO7A 2GHAA 1LGBC 4BDNA 2Y7WA 4C1UA 5H8SA 2XD3A 2QS2A 5DVJA 3P7IA 2IEEA 1MH3A 2ONSA 1B3LA 3TDJA 5KZTA 1LAHE 1OVTA 3OEKA 4F19A 1JQFA 1ANFA 2O69A 1BIYA 4H8IA 3B6WA 3T96B 1N04A 5JTYB 4AB6A 1LAGE 2RC8A 1M5EA 4XTCQ 4G68B 3Q26A 1USYE 4KFQA 5ELVA 5H8HA 3TYHA 2DOJA 4GVOA 4YU0A 4EXLA 1FQDA 1SW4A 3MZ9A 3ILUB 2ZNTA 3U1OA 2V3UA 3T22A 5ISUA 1DTZA 3T9UA 3THIA 3IK6B 1UQWA 3RTFB 4ZE8A 4N6PA 5BUUA 1P1QA 3MVWA 1P1NA 4F39A 4ZE9A 3G3FA 2FA7A 3MVZA 1Y1MA 2O51A 3K1PA 4Q30B 2F78A 1US5A 4RPOA 1B58A 3IJOB 4NE4A 3O97A 2PT2A 2DVZA 3N26A 1MY2A 1KWHA 1LB9A 4NMYA 4ZS9A 5CRYA 1RYOA 1N84A 3CFXA 3QXMA 3Q28A 1QUJA 1FQAA 1MQGA 1JETA 2HEUA 3SEVA 3Q27A 4DXCA 5JK4A 2OLBA 2BJJX 1R1NA 3U93A 2Y7KA 1USYH 1AH5A 1B32A 4DXUA 4I62A 2XXWA 2Z22A 2QJEA 2VOZA 3ZKLA 1PBQA 4H5GA 3LSXA 4R73A 2VP1A 5FTIA 2H25A 1N7XA 3MVYA 2H99A 1QUKA 4XKRA 4OFOA 2OWSA 2O6AA 4GOTA 3C35A 1Z7NE 4ESXA 2NOOA 1B3HA 1TXFA 5L9OA 3KG2A 4FAJA 3RLFE 3L6HA 2OCUA 1B40A 1O64A 3IL1B 3MPKA 4KYEA 3IAZA 3TELA 3KBRA 1Y1ZA 3EQ1A 3IOVA 3K6WA 1GTKA 2ZYMA 2RC7A 3BFTA 4H67A 2P1SA 4MF3A 3H6WA 4GFRA 4R74A 4R9GA 1B3EA 1FTLA 3D4GA 4KCDA 4HW8A 5EHMA 4BDRA 3TEPA 3CFLA 1A55A 1VE4A 3DP4A 3IB1A 4F3GA 4N07A 1WODA 3M3FA 5J1DA 5CI5A 1B4ZA 4PE5B 3H6TA 1EU8A 1XHYA 4YAHX 1A8FA 2PVUA 1Q35A 3PUZE 4OFJA 3UA8A 2WKYA 4QHQA 1XC1A 5I58B 2F6PA 3LSFB 3V89B 4UACA 4TLLB 1B1XA 1AIVA 2D5WA 3O28A 3FV2A 2KLFA 2OWTA 4DDDA 5H8NB 5AA2B 3QUJA 3T66A 1TT1A 2F7CA 4MBPA 5CMBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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