2XX9A

Crystal structure of 1-((2-fluoro-4-(3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7- tetrahydro-1h-indazol-1-yl)phenyl)methyl)-2-pyrrolidinone in complex with the ligand binding domain of the rat glua2 receptor and glutamate at 2.2a resolution.
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Integration of Lead Optimization with Crystallography for a Membrane-Bound Ion Channel Target: Discovery of a New Class of Ampa Receptor Positive Allosteric Modulators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 85
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xx9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xx9A02
1N0TA 4DLDA 3PU5A 3SDFA 2H4IA 3LSLA 2QL3A 1IIWA 1MDQA 2I0BA 2F6GA 1UIVA 1WODA 3FZVA 1XS5A 3VV5A 2RKMA 2OWSA 1JVYA 3K2DA 1US4A 2RF1A 1Y1ZA 4G68A 5I2NA 1N7XA 1S9TA 5FHNA 3CFXA 3TEPA 4H5GA 4DIGA 4F2OA 2FNCA 1XOCA 3IOTA 3C4MA 1B3EA 3E4RA 2ZYNA 2A5TB 1USYH 2QMWA 1SVXB 1A7LA 1LFGA 3MVXA 4K3FA 4QFNA 4YB6A 2NVUB 2DWJA 2OCUA 3KGCA 4PFUA 1B5HA 5AA3A 3K1NA 3VDFA 2OLBA 1R1NA 1NNTA 4OTEA 3FV2A 2XXXA 2ONSA 1M5FA 2ZNSA 1DMBA 2XXWA 3FIRA 2I4CA 5DVJA 1TWYA 2I6EA 3N26A 4XKNA 4QFLA 3QYTA 3FJGA 1M5CA 1NMUA 2F7CA 4MBPA 4JDFA 1AH5A 4KCDA 5EHSA 3K6UA 2NXOA 3ILTB 1B5JA 3BFTA 2DWHA 2H99A 3ZSFA 1Y1MA 2PX1A 3FXUA 4NWCA 3TCFA 2ZYKA 3M3KA 2F8DA 1OMPA 4BDNA 4PETA 5JK4A 1I6AA 1B9JA 1MQIA 2F5XA 1UQWA 3DP8A 3CG3A 1CB6A 4AB5A 3PD8A 4KYEA 4JBZA 2RC7A 4QFPA 2RC8A 2VHAA 3HSTA 4R6HA 1USYE 1J1NA 4H65A 2IEEA 4ISUA 4YB5A 5ITPA 3IOUA 5I59A 4IGTA 5EHMA 2UYFA 3V5AA 1MPDA 4LUBA 3DP6A 3BFUA 4ELRA 3HO7A 3LC8A 4TLMB 4QFKA 2XX7A 1YPNA 4MLVA 5L9MA 3V89B 5IKBA 4KHZE 3SEVA 3MVWA 1MY4A 1N3XA 3FGSA 3S9MC 1N76A 4ELOA 3UP9A 1ZJLA 3FJ7A 3T9VA 3T22A 1LB8A 4NTLA 2ABHA 4X1BA 3I5OA 4OFJA 1LAXA 1LBCA 3VXCA 1SI1A 4HTGA 2PVUA 1FQAA 1SBPA 4KR5A 3CVGA 4OYVA 4TOZA 3KJ7A 4TQUQ 1A40A 4DDDA 2QSXA 3N94A 1HSEA 3QXMA 2DE4A 1A8EA 4ZEKA 5CC2A 3TPAA 3T96B 5CRYA 4NF8A 1B40A 4O3CA 3PUYE 1B3GA 4EQ9A 1QVSA 3SEYA 3PPRA 1NKXA 1I6QA 1GTKA 4YZZA 3LUYA 4TLLB 5H8SA 4POWA 5I57B 1QKBA 4KYSA 1I69A 1XT8A 1N04A 2NWJA 3Q26A 3EF7A 4OFOA 2VOZA 4ZE9A 1B3LA 4NF6B 3RPWA 1URGA 4OQOA 1GR2A 2Q88A 1PDAA 2XX8A 5H8FB 4C1UA 4AQ4A 3L6HA 4ZE8A 3B6TA 1S7YA 3PPQA 2G93A 1H76A 3IK6B 2E1SA 2UXAA 1JNFA 3K1MA 2ANJA 5CMMA 3VLUA 4QSCA 1GVCA 2V3UA 5DT6A 3TODA 4ELQA 1O63A 1LGBC 4Q30B 1P1NA 5J1DA 2R9JA 3EN3A 4LONB 4R9GA 1MH3A 3CIJA 4H8IA 4WEPA 1H3DA 2OWTA 3FVKA 3RGYA 1MQJA 4BLAA 4KFQA 4GF8A 4G8NA 5FTIA 1LAFE 4BDRA 5CBSA 2M8CA 2F7BA 4HS7A 1JW5A 2X26A 2XXYA 4DZ1A 3BBRA 4ZS9A 3OO9A 4LQ5A 1JVXA 4Q5TA 4ZEFA 2XXVA 1FTMA 4YMBA 3C36A 4H67A 4Q8RA 1M5DA 2H98A 1JEUA 1A8FA 4I9DA 4YU0A 4XKRA 1IZ1A 4ZDMA 2ZMBA 3MVYA 1MQHA 1S50A 1TT1A 1QJMA 4X1DA 5ISUA 5DEXA 5TPAA 3I3VA 1FQBA 1QUKA 2GHBA 4ELPA 4U23A 2DWAA 3FUZA 1URDA 3K00A 5KCJB 4OEVA 4OFLA 1XHYA 5I2KA 4U4XA 3CFZA 4OESA 3ONMA 3FASA 4G68C 1MXWA 3UIFA 3RNNA 3FJMA 3KJTA 3EHUA 3CSBA 1IXIA 2PT2A 2D21A 1OIBA 3C33A 3IL1B 2REGA 4GWOA 2H5YA 2QJEA 3SEUA 1Y4CA 1JQFA 5H8NB 1UTHA 2VD2A 1B46A 3Q29A 1IITA 4U2RA 1A99A 3H03A 1B3HA 1M5EA 4R6KA 4IY5A 3O6GA 3MBPA 5L8DA 1UIUA 2HXWA 1NH8A 1POTA 3R6UA 3K1PA 2AL4A 5TP9B 1EZOA 4JWYA 4H6DA 4C0RA 2QMXA 1ZMGA 3QUJA 2NOOA 1ZU0A 1OQGA 4QRZA 4DXBA 1POY1 1B5IA 3SEXA 1QKAA 2GRVA 4EXKA 3M3LA 1P1OA 2ZXTA 4ESXA 3PGFA 2HEUA 4F1YA 2HFBA 2V3QA 5I57A 1ZKBA 1IUDA 1Y3NA 1Z7ME 1LSTA 3O2AA 3TFLA 3JYRA 1KWHA 3OD7A 5A5XA 1EH3A 2R6GE 4MH5A 2XXTA 2Q9TA 3FXRA 1MY2A 3BKIB 3FV1A 1UTBB 5AA4B 5F7VA 4EF1A 3HHGA 5KDTB 3PPPA 1B7HA 1MM6A 4F2QA 5H8FA 1AMFA 1A54A 3FVOA 2B65A 1LCTA 2UVGA 3E3KA 4FE8A 3OELA 2UVIA 2D3IA 1B2HA 4POXA 2ZNTA 5JTYA 5DYHA 3SESA 4KD5A 5H8QA 3MZ9A 2F6PA 1ZLQA 4GQOA 1O7TA 2Y84A 4FEDA 2XXUA 3GBBA 3W9WA 1B58A 2Y7WA 1IEJA 1IXGA 2DYXA 1BLFA 3UGWA 5H8HB 2F36A 3LSFB 3IORA 4F39A 5I58B 3ZKLA 4H5FA 2Z8EA 3LBSA 2BJJX 3OEMA 5TU0A 1OQHA 4NF4B 1H43A 3G3HA 3C32A 5CMCA 2X7QA 5AA2B 3MP6A 3TTMA 4FIMA 2O51A 3O6HA 3TUSA 2PT1A 3RTWB 1NH7A 3N5LA 3OO7A 1PB7A 3TQLA 1B51A 4NF5A 1B4HA 3VVDA 3H6UA 3KOSA 4G77A 2FA7A 4GXSB 1FTKA 2OJTA 3TTNA 4F31B 1VFDA 2F35A 2DSFA 1IXHA 4F3BA 4X48A 1XVXA 5K2XA 3EHSA 5CI5A 1JW1A 4EXLA 4OHNA 2I48A 4P11A 1B3FA 3S9LC 1D9VA 4LP2B 4JSOA 5I56A 3M3FA 4IO2A 3FVNA 2GFEA 4YICA 2ONRA 4QHQA 5CBRA 4RPOA 3U93A 3B6QA 1JETA 1Y20A 2I58A 2AYSA 2AL5A 1Y3PA 2O1MA 1NFTA 3E13X 3VVFA 4HW8A 3OENA 4Z7EA 5FHMA 5H8NA 4F3GA 1MDP1 3T93B 4OERA 2WKYA 4O3BA 4GFRA 2DVZA 3CG1A 3KOTA 3WAEA 4U22A 2QS2A 1URSA 3MZBA 3OMBA 2NUVA 2XHDA 3IX1A 4P0IA 3TAJA 2W7YA 1JW4A 4G8HA 4YAHX 3OEKA 1LBBA 1MRPA 4GL0A 1N3WA 3OOAA 4IY6A 3K4UA 1P1QA 1MY3A 4YKJA 1PBPA 1Z7NE 3O28A 2A5SA 3KSXA 4PFWA 3Q28A 3S4UA 2OK2A 1OLCA 4HCWA 3U72A 3EPEA 5KZTA 1PB8A 4L17A 4DCYA 1RKMA 3MQ9A 2P2AA 3C35A 4R74A 5DTBA 2HQ0A 3MAMA 2ESNA 2O7UA 1H45A 1NL5A 2QS1A 5L9SA 5AA1A 2HAVA 3KEIA 1IXCA 4JWXA 3TDJA 3MPKA 1LAGE 4H8JA 3C34A 3E9XA 4C1TA 1FQCA 4GIZA 3A09A 4DXUA 2A5TA 4N13A 3DM0A 4ZZEA 1LCFA 4KI0E 5DVFA 1D4NA 4YKIA 3D4GA 1II5A 1MG1A 4R73A 2VP1A 4LZ5A 4OVJA 2UVHA 4DXCA 3MZ1A 3B7DA 4G68B 2YJPA 4WEDA 4YMAA 3KG2A 1FTJA 4OZ9A 3H6WA 3N6TA 2UYEA 1PB9A 1VE4A 1SW4A 4MF3A 4NF4A 1MQGA 1OLAA 5BWJA 1RYOA 2ZNUA 3CSGA 2DQVA 2DOJA 3O29A 1MQDA 4RJZA 3KN8A 5LOMA 3TQWA 5AA2A 3OXNA 2Q2AA 3UA8A 4XTCQ 1FW0A 1SD3A 2D5WA 3UN6A 1B1HA 1MM7A 3H7MA 2F7AA 3PMXA 3RTFB 2Y7PA 4ZECA 1Q35A 1B4ZA 5IAIA 1MS7A 1US5A 2V25A 5CM6A 4FAJA 5B7DA 3O9PA 2RC9A 4EQBA 2REJA 3TZAA 4RK2A 4Z0IA 4OWDA 1MPBA 1DOTA 2XX9A 4BDMA 1FQFA 3K01A 4M4GA 1BTJA 3VE1B 4GVOA 2Z8DA 3IR1A 1P1WA 3SETA 2AIXA 3HHFA 1O64A 2FYIA 3GXAA 2I49A 3H6VA 4LVQA 3MP1A 3RT8A 1FTLA 4UA8A 2DE3A 4XXUA 3EQ1A 3PD9A 4WKMA 2DXYA 4NEDA 3PPNA 2Y7RA 4G2ZA 3UORA 3C31A 2YLNA 1N84A 2ALUA 3LSWA 4R9FA 1LB9A 1FCKA 2I4BA 3V8XB 2DS9A 1T0KA 3K0VA 5K2YA 2Q89A 3FVGA 1HSJA 1MY0A 1ZTYA 1ZIUA 4RYAA 4F18A 4XKPA 2ZYMA 4FECA 2PMSA 3U94A 3V83A 4F19A 3IJXB 5L9OA 5AE4A 1QW0A 1TFDA 3FXQA 1BKAA 4GL8A 5HBCA 3IB1A 4PFYA 2HZKA 2CMOA 4YKKA 2ONKE 2QRYA 3QAXA 4UACA 2O6AA 4GD5A 3K6VA 3SKPA 4F3PA 1LFIA 4FEBA 4GXAA 4X9TA 4OMBA 3B6WA 4Q0CA 4RXLA 3ECRA 4NE4A 3N6UA 4P0GA 5FHOA 3PMWA 3G7WA 4ZEIA 1LAHE 2VD3A 5DVIA 1CE2A 3T66A 2QS4A 3CR9A 2P1SA 3IOVA 3PUXE 4NF6A 2H25A 1I6BA 3VLWA 3MUQA 4NF8B 3CRBA 3TCGA 1NNKA 4MLQA 3ZKKA 3JV9A 1TFAA 2XXIA 1DPEA 3TMGA 3IO6A 1BIYA 1H44A 3Q27A 1SW1A 1D3KA 3U8QA 3PUWE 4IO7A 3O6IA 1FQEA 4F1UA 3PV0E 2Y7IA 3W9VA 3VVEA 3RUMA 2KLFA 1ANFA 3MJNA 5ICQA 3IOWA 4ND9A 3PUVE 4IGRA 1JEVA 3O66A 5F1QA 2DWIA 3FATA 1NNFA 3QUFA 2F78A 2V93A 2Q2CA 4BDQA 3RT6B 4RNSA 1OVTA 1WDNA 3MPLA 5BUUA 2HAUA 4U21A 2R71A 3H3GA 3U1OA 3OSQA 2OZZA 4OETA 1QULA 3HPIA 4RK9A 4NWDA 3MP8A 2UVJA 1A55A 2G29A 4OENA 3KSJA 2RCAA 1F9BA 3L6GA 4DE8A 1AOVA 3ILUB 4MFIA 3S9NC 3KFMA 2Z23A 3TTKA 1XC1A 3DLNA 3C9HA 4KCCA 3CFLA 4JSDA 5I84A 4U1ZA 1IQ7A 1DSNA 1ZBMA 1L5TA 4LATA 4LZ8A 3OSRA 2PYYA 2O69A 1XVYA 1DPPA 3KN3A 1SQYA 5KCJA 4EUOA 3GZGA 1SI0A 3ZS6A 3O97A 1BP5A 4JWOA 3AXFA 4I62A 3IJOB 1LFHA 1VFEA 4XIGQ 2DVCA 4ZZAA 4EDPA 3G3IA 3GBAA 1HSLA 5HM4B 1Q1KA 3PPOA 3ODBA 4QSEA 1D9YA 5DEXB 4FJPA 5TPAB 1Y9UA 3QSLA 4PE5B 3K6XA 4IO6A 4PP0A 3PMVA 4BDOA 3LSXA 4OXVA 3SEWA 3VFJA 3D4CA 2I3WA 3CI8A 5I2KB 2QPQA 2B3BA 3KZGA 4AB6A 1ATGA 3MC2A 1R6ZA 2I3VA 1N7WA 3JZJA 3KBRA 2XD3A 4KQPA 3RN8A 3TTLA 3EHTA 5TP9A 3WAFA 2DXRA 5EYFA 2OBGA 3RLFE 1EZ9A 1OVBA 3G3KA 1MXZA 1B7UA 2GH9A 3R7XA 4IB2A 2P0SA 1B1XA 3SERA 1R9QA 1PEBA 1UTHB 2IA4A 1P1UA 2H9BA 3T9XB 4KPTA 1PC3A 3T9UA 4IO5A 4R2FA 3W15C 4FORA 4N07A 4OEUA 3S2VA 4GRKA 1MPCA 5ITOA 5FTHA 3G3JA 4LZ7A 2Z22A 4E0WA 4R6YA 2O84X 4WXJA 4RY1A 1P99A 2V84A 1VR5A 1UTBA 5AA4A 5KDTA 5JEIA 4ECFA 3HCQA 2XXRA 1LLSA 3QK6A 1YCJA 1SW5A 1PBQA 1B0HA 1SDXA 5M2VA 2O1LA 5B70A 3OO6A 3RQTA 4H1XA 1YAEA 4PFTA 4E0XA 3A3UA 2B3FA 3IAZA 3FD3A 4R2BA 1QUIA 4F3SA 3P7IA 5A5XB 1B7ZA 5HPQA 5H8HA 5I2NB 1MXYA 1R9LA 5I58A 2RCBA 4JXIA 4N6PA 1EU8A 3MWBA 2LAOA 4ZEBA 3TCHA 2GHAA 4QF9A 1M5BA 1MY1A 5JTYB 3IB0A 3S9EA 1YTVA 1RYXA 5H8QB 5CMKA 4ONYA 1VSOA 3HN0A 3T9HB 2E0SA 3DELB 4RPNA 2QS3A 4EF2A 4U1OA 3TTRA 5ELVA 2DP8A 1FQDA 4NMYA 1FTOA 1TXFA 4ESWA 1MXXA 4I8CA 4LQ2A 1GV8A 2Y7KA 3USDA 2O68A 1WVJA 1AIVA 3H6TA 3RY3A 3IB2A 3VLVA 2Q8JA 1B52A 3G3GA 4O3AA 3GLBA 2PBWA 3KN7A 3LR1A 5CMBA 2HZLA 1B0LA 4U4SA 2HCAA 1NNPA 4R75A 2Z8FA 1SW2A 3H4ZA 3Q25A 2XXPA 4THIA 4QFOA 2ZYOA 2CZLA 4LA9A 4PQJA 3TKDA 1MXUA 3U92A 4NF5B 1SYIA 4YB7A 3G3FA 1DTZA 4KYDA 4RA1A 1MXVA 4DCXA 1Y3QA 1AL3A 1SYHA 4H0WA 3IO4A 4G8MA 2YPNA 3TYHA 3R26A 3K6WA 3QIMA 5AA2D 4ZEDA 2DE2A 1QUJA 5I56B 4FATA 5I59B 4JB7A 4F22A 4M1VA 4XKQA 1DTGA 1B05A 1Y4TA 3DP4A 1GGGA 4I1DA 3VXBA 3A3CA 4BDLA 2F97A 2X7PA 4IO4A 1MH4A 2VGQA 3M8UA 2O7IA 3MVZA 4EQ7A 3UK4A 3K02A 1B6HA 4F29A 3MW0A 1EZPA 4HCYA 3F11A 2V3TA 2XD2A 4GLIA 2XXQA 3I6VA 3TELA 4F1VA 2XXHA 2THIA 3THIA 4QSDA 4R72A 5ICTA 3OO8A 4G4PA 2F34A 4YKPA 3PUZE 3HV1A 3H06B 2I0CA 4GOTA 1ELJA 1B32A 2RINA 4IO3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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