2XXPA

A widespread family of bacterial cell wall assembly proteins
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
EYSLSVAVLADSEIENVTQLTSVTAPTGTDNENIQKLLADIKSSQNTDLTVNQSSSYLAAYKSLIAGETKAIVLNSVFENIIELEYPDYASKIKKIYTKGFTKKVEAPKTSKNQSFNIYVSGIDTYGPISSVSRSDVNILMTVNRDTKKILLTTTPRDAYVPIADGGNNQKDKLTHAGIYGVDSSIHTLENLYGVDINYYVRLNFTSFLKMIDLLGGVDVHNDQEFSALHGKFHFPVGNVHLDSEQALGFVRERYSLADGDRDRGRNQQKVIVAILQKLTSTEALKNYSTIINSLQDSIQTNVPLETMINLVNAQLESGGNYKVNSQDLKGTGRMDLPSYAMPDSNLYVMEIDDSSLAVVKAAIQDVMEGRKLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A Widespread Family of Bacterial Cell Wall Assembly Proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CPS2A
molecule tags Replication
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 129
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03816 LytR_cpsA_psr Cell envelope-related transcriptional attenuator domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.260.150 Mainly Alpha Orthogonal Bundle 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 2xxpA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxpA01
1RKMA 2BJJX 4FAJA 4N07A 1ZLQA 2F78A 2H99A 4F2OA 3U1OA 1FQAA 4MH5A 1M5FA 4U4XA 3K6XA 3UA8A 1M5CA 2VOZA 4NEDA 3CSBA 3SERA 3IR1A 3MAMA 2GHAA 3F11A 4P0GA 3D4CA 4H1XA 1ELJA 4OFLA 2O7UA 3M3FA 2DOJA 2DSFA 4AB5A 3ZS6A 1B3GA 5TP9A 3KSJA 1URSA 2UVIA 4FATA 4RPOA 1N7WA 3PMXA 4FE8A 4LP2B 1Y1MA 2H5YA 4GL8A 4PP0A 3KN3A 3FVGA 5I84A 3IL1B 1UTBA 2RC7A 3FVOA 3CG3A 1N0TA 4I9DA 1ZKBA 4QFKA 4IO2A 3B7DA 4THIA 1SW5A 3O2AA 4IB2A 1SQYA 3HSTA 1BTJA 3FXUA 2DE2A 4WKMA 5FHNA 2ONRA 4H8JA 3T9VA 1B9JA 2KLFA 3OO8A 1OIBA 1H76A 2G29A 1Q1KA 3TUSA 2UYFA 1SYHA 4R75A 1PDAA 3IK6B 3KBRA 3OWQA 3S2VA 3CRBA 5AA2D 1NFTA 3BFTA 5FHOA 3TTKA 2ALUA 4PFYA 4G68C 1IXGA 2ZYOA 4LVQA 4OERA 1EU8A 4HCYA 3FZVA 1FQCA 1Y3QA 1N3XA 1ZTYA 1B51A 3H6TA 5ITPA 1Z7NE 4XKRA 1OQGA 3C33A 4DIGA 1NMUA 3THIA 3AXFA 3KN8A 4Q5TA 3H03A 3O6IA 2XX7A 4U2RA 4Z0IA 5JEIA 3TAJA 1UIVA 2B3FA 4BDRA 1TT1A 1MH3A 2ANJA 4TLLB 5H8FB 1TFDA 1USYE 4ZE9A 4OXVA 2HXWA 1NH8A 3U8QA 1BP5A 5CBSA 5FTHA 4DE8A 1JVYA 3W15C 5AA1A 3TTNA 5I2NA 3PUXE 3QXMA 3KOSA 1S9TA 2OWSA 4I1DA 1O63A 3W9VA 2IA4A 2P2AA 2DVZA 4DXUA 4OEUA 5DVFA 1URDA 1LFIA 3G3HA 1LAGE 4GIZA 3FV2A 1MQDA 3GLBA 1NNTA 3N6TA 1VFEA 1XOCA 2REGA 2H25A 4JBZA 1MY3A 4QF9A 2QS2A 1MXVA 2QS1A 1FTMA 3TODA 1SVXB 1SBPA 4G68B 1B05A 4IO5A 3OOAA 4IO3A 5EHMA 4DE9A 4JDFA 5AA4B 3EQ1A 2PYYA 1B58A 1B5JA 5DT6A 5KCJB 1EZOA 4F1VA 2O68A 2NVUB 2DWAA 2UVGA 2XHDA 4U22A 4KYDA 1EZ9A 1QVSA 3R26A 4OETA 3KOTA 1EZPA 3OEMA 4QFOA 2X7PA 3C4MA 2H98A 2ABHA 1OLAA 1SW1A 3O29A 1LGBC 1LLSA 2RC8A 3UORA 3K6WA 4MBPA 3SKPA 2F5XA 3PPOA 4F29A 1Y4TA 2Z22A 3Q28A 1IUDA 3Q26A 4NF6A 1MM6A 3FXRA 1A8EA 5L9SA 4QFLA 4PFWA 2I58A 3PV0E 3E4RA 2Q2CA 3OD7A 3TCFA 3CR9A 1LB9A 1JEVA 4NTLA 4QHQA 4POWA 4WEPA 1P1WA 3MJNA 1POY1 4IGRA 1FCKA 5F7VA 3VVDA 2QS3A 4YAHX 4OENA 4OFJA 3TEPA 3FJ7A 3LSFB 5TP9B 1B3EA 2RF1A 1P1UA 4JWYA 2Y7PA 5JK4A 2O1MA 4RJZA 1VE4A 1AOVA 4YU0A 1PBQA 4KCCA 4GLIA 2THIA 1VFDA 3QIMA 2QMWA 3HPIA 3IORA 4EXKA 2Y7WA 2O51A 3R7XA 3EHSA 3HCQA 4HTGA 4G8MA 2D3IA 3WAFA 3ILTB 1JW4A 2XX9A 5JTYA 3GZGA 3LC8A 4FEDA 1MPBA 1OMPA 3N94A 1MY1A 2XXIA 3E9XA 4YB6A 3BBRA 2I3VA 1MQGA 5IAIA 3TELA 5I2KA 2HCAA 1QUIA 4GOTA 4KYEA 4ZZEA 4F3PA 4NF8A 4LA9A 4YKPA 1SI1A 4NE4A 1JVXA 4GWOA 3I3VA 3RTFB 1ZMGA 4HCWA 2VP1A 1ANFA 2DE3A 3ZKLA 4R2BA 5L9MA 4ESXA 3EN3A 1UQWA 5DEXB 3SEXA 1T0KA 4QFPA 4H6DA 4EF1A 2XXVA 1OVBA 1SW2A 3IB2A 1UIUA 2A5TB 4ZEKA 1IXHA 3OSQA 2UVHA 4F2QA 1Z7ME 4JXIA 2OBGA 1EH3A 5BWJA 1PEBA 2B65A 5EHSA 2IEEA 3T9XB 4F1YA 5I56A 2GHBA 5B70A 5TPAA 3OKZA 2I48A 4E0WA 1AH5A 3L6HA 5CI5A 3PPNA 3TQWA 3TDJA 5B7DA 3IO6A 1H3DA 3OO7A 4RA1A 3CI8A 1MXUA 3B6TA 4RXLA 1US5A 4OMBA 5H8QB 1MH4A 4YKKA 3DP6A 4IO4A 5KDTB 2XD2A 4NF5B 1AL3A 1B6HA 4KD5A 3PUZE 1DTGA 4LZ7A 2W7YA 1FQBA 3VV5A 1P99A 2FNCA 4U1OA 4FECA 1NNPA 3QUFA 3CFLA 3Q27A 4EQ9A 4POXA 3UIFA 2I3WA 4RPNA 5LOMA 3IOUA 1CE2A 4N13A 4G77A 2E1SA 1URGA 4I62A 2V3TA 1QKAA 4AQ4A 4F31B 2R6GE 4G4PA 1MY0A 2ZMBA 3UP9A 1B0HA 3CSGA 1SI0A 1DPPA 4H5GA 4XTCQ 5A5XB 3V89B 2AYSA 2XXPA 5DVJA 4R2FA 2HZKA 3VLWA 1MXYA 4ISUA 3MBPA 4U21A 2DVCA 4OWDA 4QSDA 1MRPA 2O1LA 1D9VA 1PC3A 2B3BA 3O9PA 4EQ7A 2F6GA 2A5SA 3SDFA 3MP1A 3WAEA 1LFGA 2XXTA 1VSOA 1FQDA 4MLVA 3LR1A 1L5TA 1QJMA 1R9LA 4G8HA 3MW0A 2Q88A 5ITOA 4P11A 3C32A 3MVWA 3PD8A 2P0SA 5H8HB 1N76A 3EHUA 2QS4A 4F22A 1N7XA 1B4ZA 3O28A 3PMVA 3H6UA 2X7QA 5H8NA 1Q35A 4DXCA 4OHNA 2E0SA 3PE5A 1IXIA 3SESA 1NL5A 1LAXA 2DE4A 3K00A 4HW8A 2XXXA 2Z8FA 1NNKA 2DXYA 4YZZA 3PUVE 4H5FA 3TTLA 3T9UA 2Q9TA 3KZGA 2NWJA 4F19A 3VDFA 2F7CA 1R1NA 1DMBA 4GRKA 4R6KA 1I69A 4X9TA 1J1NA 1GTKA 3S9NC 2V84A 2Z8EA 3UK4A 4JB7A 5CBRA 3OEKA 4G2ZA 1GV8A 3O66A 3CIJA 1SYIA 4OESA 4PETA 4TQUQ 3IJOB 4F18A 1I6BA 3T66A 3JYRA 3IO4A 1P1NA 1B4HA 1YTVA 4MLQA 4YICA 4C0RA 3TTMA 1BKAA 3PMWA 2X26A 5L8DA 3K1PA 4BDNA 2Q89A 1LAHE 4UA8A 2RKMA 4FIMA 4GF8A 5I57B 3SETA 3TYHA 2QPQA 2VHAA 3LBSA 3Q25A 1QUKA 4OVJA 3CFZA 4TOZA 4ZEBA 4RYAA 4P0IA 2XXYA 3DP4A 3FVNA 3ONMA 3FGSA 4MFIA 5KZTA 4GD5A 4RK2A 1LFHA 4LUBA 1MXZA 1XC1A 2HAVA 2DWJA 1ZBMA 2ZYNA 3DLNA 5L9OA 2V3UA 4ELOA 1B7HA 5I58B 2NUVA 4H67A 2I6EA 1UTHB 3TCHA 3B6QA 4I8CA 5CMKA 1WVJA 1AIVA 5HM4B 4AB6A 3FJGA 4NF4A 1Y3NA 4DCXA 5IKBA 3RT8A 5AA2B 1ZU0A 3IB0A 3C31A 5HPQA 4C1UA 4PFUA 1JQFA 5I59A 4IGTA 3H06B 2ZNTA 3V5AA 4H0WA 3NXHA 3UGWA 3IJXB 3EHTA 3H6WA 3KEIA 4ZEFA 2PMSA 2F8DA 4Q30B 3OO9A 4BDOA 2QL3A 4LZ5A 1HSLA 1O7TA 1JETA 3G3FA 3QUJA 3MQ9A 4PE5B 2UVJA 4GFRA 3K1MA 2HAUA 5H8SA 1B0LA 2Q2AA 3V8XB 4IO7A 3VVEA 3MP6A 3N26A 3RGYA 3A3UA 2R71A 4M1VA 1PBPA 1IITA 3FD3A 1FTJA 5K2YA 3O6HA 3U92A 1A54A 4OZ9A 1A8FA 4G8NA 3OO6A 2R9JA 2Q8JA 3ZSFA 1WODA 3FJMA 3MVXA 1UTBB 3H4ZA 3RUMA 3A09A 4R72A 3EPEA 3H6VA 1B7UA 1S7YA 3MZ1A 3K2DA 3K1NA 3FXQA 2I4CA 4O3BA 1N84A 3R6UA 1FTKA 4LONB 2O7IA 3SEWA 3G3IA 4X1BA 3A3CA 4ZEIA 2FYIA 3PUWE 4LZ8A 4U23A 5CRYA 4FEBA 1LAFE 4JWXA 4UACA 2D5WA 2ESNA 1XHYA 2YLNA 2CMOA 3C9HA 3MC2A 1B1HA 4U4SA 3HV1A 4DDDA 4ELPA 2PT2A 5J1DA 1N3WA 1HSEA 3S9EA 1RYXA 2PX1A 5H8FA 3LUYA 4RNSA 1B32A 3MZ9A 3GBAA 1IXCA 2H9BA 3JV9A 4YB7A 4FJPA 3K0VA 1B3FA 3H7MA 4QSEA 1B5HA 2OLBA 2YJPA 5FTIA 5DYHA 3MUQA 1OVTA 2UXAA 4X1DA 3PPPA 1MG1A 3HN0A 2P1SA 4QSCA 5I2NB 1XVYA 1Y20A 1CB6A 4R73A 3FUZA 1B2HA 3KFMA 1DOTA 1YAEA 3W9WA 3TTRA 1PB7A 2F97A 2XXRA 1US4A 1MY4A 3PD9A 1NNFA 2F36A 4GXAA 2QSXA 2ONSA 4RY1A 3RT6B 2DYXA 4G68A 1MXXA 4YKIA 3VFJA 5CC2A 2XXQA 3CFXA 3OXNA 3U94A 5AA4A 1LCTA 5KCJA 2V25A 2Y7RA 4KHZE 3N5LA 3VXCA 4OEVA 3E3KA 4OTEA 4IO6A 2AL4A 3E13X 3IAZA 1B3HA 5AA3A 1DTZA 3USDA 3I6VA 1PB9A 4N6PA 1HSJA 2O84X 1B46A 4EUOA 3GXAA 4LQ2A 2XD3A 1FQEA 4KI0E 1USYH 1MXWA 4KCDA 1GGGA 3VXBA 5I59B 1SW4A 2XX8A 4QRZA 1JNFA 3K6VA 3MVZA 1OQHA 3PPQA 3QFIA 3NROA 3IOVA 2REJA 4NF6B 1N04A 4ECFA 1M5EA 3IOTA 3P7IA 1MY2A 1NKXA 1MDQA 5M2VA 1QULA 3DM0A 1TFAA 3U93A 2AL5A 3M8UA 3TPAA 3RN8A 2Z8DA 1B5IA 1MS7A 4DLDA 4LATA 3T9HB 3M3LA 2DXRA 3KN7A 1H43A 1MQJA 1B1XA 3L6GA 4YB5A 2VD2A 4IY6A 1LBCA 3SEVA 4EXLA 1FTLA 5FHMA 4EF2A 3PPRA 2FA7A 3EF7A 4KYSA 4OYVA 1H44A 4TLMB 2GRVA 2HFBA 3TMGA 4F3SA 4QFNA 5F1QA 3KSXA 2Y84A 1B7ZA 3HO7A 1XS5A 4DXBA 4MF3A 4XKQA 1D3KA 2RCAA 3OENA 2RCBA 3D4GA 5JTYB 4OFOA 3RQTA 2HQ0A 1PB8A 4O3AA 1FTOA 1MQHA 4GQOA 5I2KB 3CVGA 3FATA 4H65A 4WEDA 2O69A 3RPWA 5DEXA 3FVKA 3S4UA 1LCFA 4NF8B 2A5TA 1FQFA 1MQIA 3DELB 3MVYA 2Y7IA 2Z23A 4IY5A 4ZDMA 2LAOA 2GFEA 1OLCA 1FW0A 2OCUA 1Y3PA 5CMMA 4ELQA 3QK6A 2PT1A 1ATGA 4R6HA 3ODBA 1A7LA 4C1TA 3TQLA 4R74A 2DP8A 2Y7KA 3G7WA 1JW1A 1JEUA 3VE1B 4BDLA 5I56B 2QMXA 4EQBA 1B40A 3M3KA 5H8QA 5TPAB 3LSWA 3N6UA 3MP8A 5KDTA 3PGFA 4NF5A 2HEUA 4M4GA 4WXJA 2F7BA 4DCYA 2ZNSA 5ICTA 4F1UA 4NWCA 3T22A 1H45A 2DWIA 2RC9A 4KPTA 1MM7A 2ZNUA 1JW5A 3BFUA 3LSXA 5TU0A 4NMYA 2M8CA 4BDMA 4F3BA 1YCJA 2HZLA 1GVCA 3MPLA 4E0XA 2OK2A 3PUYE 2UYEA 1XVXA 2YPNA 1B3LA 4Q8RA 3DP8A 3H3GA 5CMBA 2PBWA 1VR5A 1IZ1A 1I6QA 3MPKA 3LSLA 3KJTA 1MDP1 5DTBA 1RYOA 4JWOA 3G3GA 3OMBA 3TZAA 5ISUA 3FASA 3K4UA 3FIRA 3MZBA 2F34A 3PU5A 3RTWB 5BUUA 4EDPA 3C34A 5CMCA 3T93B 1Y9UA 2DS9A 5A5XA 3TCGA 1A55A 1DPEA 4H8IA 4L17A 4KR5A 1D4NA 4NWDA 3G3JA 3I5OA 4YMBA 4BLAA 3BKIB 2G93A 4XKNA 4RK9A 1F9BA 2GH9A 1R9QA 4Z7EA 2XXWA 3IB1A 4JSOA 3U72A 1ZJLA 1GR2A 4O3CA 1II5A 1BLFA 3HHFA 4OBMA 3S9MC 5H8HA 1QW0A 4FORA 2WKYA 3ECRA 3TKDA 1KWHA 3B6WA 3KJ7A 1A99A 3K01A 1POTA 4GVOA 3RLFE 2PVUA 3V83A 4X48A 3TFLA 4ZECA 2NXOA 2O6AA 3RY3A 1DSNA 2F7AA 1IIWA 2XXUA 1LB8A 2F35A 3VLUA 1BIYA 2D21A 4LQ5A 3RNNA 4DZ1A 2ZYKA 4F3GA 3ILUB 2VD3A 3IOWA 1IEJA 2NOOA 3SEYA 4ONYA 5H8NB 4ZEDA 4ESWA 5CM6A 5ELVA 3JZJA 4K3FA 1M5DA 3GBBA 1TWYA 4R6YA 2V93A 4F39A 1NH7A 4KFQA 1B52A 1QUJA 3OSRA 1TXFA 1A40A 1R6ZA 2QJEA 4R9GA 2OJTA 4PQJA 2VGQA 4Q0CA 1D9YA 4BDQA 2I0BA 2OWTA 3C36A 4PFTA 1LSTA 4HS7A 4GXSB 4JSDA 5K2XA 4U1ZA 1Y1ZA 5AE4A 3SEUA 3O97A 3VVFA 2H4IA 4OQOA 2I49A 5DVIA 2OZZA 1XT8A 1Y4CA 4YKJA 3ZKKA 3HHGA 5I57A 2ZXTA 3Q29A 4XIGQ 2QRYA 1M5BA 3CG1A 4YMAA 3O6GA 4R9FA 2RINA 1MPCA 1IQ7A 1P1OA 3KG2A 3K6UA 1LBBA 2AIXA 3IX1A 5EYFA 4ND9A 3UN6A 1O64A 1SDXA 2I4BA 4ZZAA 3S9LC 5I58A 3QAXA 3VLVA 1UTHA 3G3KA 1S50A 1YPNA 2I0CA 3K02A 2F6PA 1MPDA 3T96B 3MWBA 1AMFA 1P1QA 3MEJA 1QKBA 4GL0A 4KQPA 5ICQA 4ZS9A 2CZLA 2ZYMA 5HBCA 3QYTA 3KGCA 4ELRA 2DQVA 1I6AA 5AA2A 2XXHA 3QSLA 3OELA 1SD3A 2ONKE 1ZIUA 2V3QA 1WDNA 2DWHA 3FV1A 3C35A 4NF4B 4XKPA 4ZE8A 4XXUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MSTA 4J1WA 4AS5A 1YSEA 1RKMA 2CZKA 2BJJX 4FAJA 4N07A 1G0IA 1ZLQA 1KA1A 2F78A 2H99A 4F2OA 2Q74A 3U1OA 3ZKCA 4OVQA 3A9YA 1FQAA 4MH5A 1M5FA 4U4XA 3FYAA 3A9XA 3K6XA 3UA8A 4PFBA 1M5CA 1FPKA 2VOZA 4NEDA 3CSBA 2ZZXA 3SERA 4PFRA 3IR1A 1XI6A 2EBYA 3MAMA 2GHAA 3F11A 4P0GA 3LUZA 3D4CA 4H1XA 3OP9A 4X4FA 1ELJA 4OFLA 2O7UA 3M3FA 2DOJA 2BJCA 2DSFA 4AB5A 1IC8A 3ZS6A 1B3GA 5TP9A 3KSJA 1URSA 2UVIA 4FATA 4RPOA 1N7WA 3PMXA 4FE8A 4LP2B 2ICTA 1Y1MA 2H5YA 4GL8A 2MQKA 4NAPA 4PP0A 2LLWA 3KN3A 3FVGA 1X2LA 5I84A 3IL1B 4HXVA 2OFYA 4Z59A 1UTBA 2RC7A 3FVOA 3GN5A 3CG3A 3A29A 1N0TA 4I9DA 1ZKBA 4QFKA 4IO2A 2PXBA 3B7DA 4THIA 4X04A 1SW5A 3QWGA 3O2AA 4IB2A 2XWIA 1SQYA 2Y5KA 3HSTA 1BTJA 2O38A 3FXUA 2DE2A 4WKMA 5FHNA 2L5VA 2ONRA 4H8JA 3T9VA 1B9JA 2KLFA 3OO8A 1FBGA 1OIBA 4XEQA 1H76A 1DBZA 1EFAA 1YZ0A 2G29A 2PCRA 1Q1KA 3TUSA 2UYFA 2GZUA 1SYHA 3HZIB 4R75A 3BS3A 1NV7A 1PDAA 1NUWA 3IK6B 1Y9QA 1WIZA 4N15A 3PXPA 1RDXA 3KBRA 3OWQA 3S2VA 3CRBA 5AA2D 1NFTA 3BFTA 5FHOA 1JH9A 1AWBA 4GWSA 3TTKA 2ALUA 4PFYA 4G68C 1IXGA 2ZYOA 4LVQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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