2XXQA

A widespread family of bacterial cell wall assembly proteins
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
373
structure length
373
Chain Sequence
SEYSLSVAVLADSEIENVTQLTSVTAPTGTDNENIQKLLADIKSSQNTDLTVNQSSSYLAAYKSLIAGETKAIVLNSVFENIIELEYPDYASKIKKIYTKGFTKKVEAPKTSKNQSFNIYVSGIDTYGPISSVSRSDVNILMTVNRDTKKILLTTTPADAYVPIADGGNNQKDKLTHAGIYGVDSSIHTLENLYGVDINYYVRLNFTSFLKMIDLLGGVDVHNDQEFSALHGKFHFPVGNVHLDSEQALGFVRERYSLADGDRDRGRNQQKVIVAILQKLTSTEALKNYSTIINSLQDSIQTNVPLETMINLVNAQLESGGNYKVNSQDLKGTGRMDLPSYAMPDSNLYVMEIDDSSLAVVKAAIQDVMEGRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords CPS2A
publication title A Widespread Family of Bacterial Cell Wall Assembly Proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule tags Replication
total genus 133
structure length 373
sequence length 373
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03816 LytR_cpsA_psr Cell envelope-related transcriptional attenuator domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.260.150 Mainly Alpha Orthogonal Bundle 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 2xxqA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxqA01
5JTYB 3FJ7A 3IO6A 3V83A 3IB2A 1MM7A 1H44A 2DWHA 3MVZA 3UIFA 4ZEBA 1NH7A 2UYEA 3VXCA 3C36A 2OWTA 3G3IA 5I58B 1S9TA 4G77A 2CZLA 5CMBA 2I49A 4RA1A 5L9SA 4OFJA 1B51A 2VOZA 1B5JA 3H3GA 1NMUA 4ND9A 1QJMA 1I6BA 1A54A 1Q35A 1LFHA 1B3EA 4F18A 2QRYA 1SW2A 3H6TA 1LFIA 3MC2A 4TLLB 3C32A 3OENA 1DPEA 1QW0A 2XHDA 3O28A 3EHSA 4ESWA 4DE9A 1USYH 5I57A 3BKIB 4FATA 3IOTA 3H7MA 2XXHA 3PUXE 1EZOA 3K1PA 2HFBA 1MY2A 3T9VA 3OMBA 4YZZA 1MDQA 3G3HA 2NVUB 3MZ9A 1H43A 3S9MC 2W7YA 4EQ7A 2YPNA 1PB7A 2OBGA 4JXIA 4ELRA 4O3BA 4X1DA 4JBZA 5J1DA 3QUFA 5FTIA 2F8DA 1MH4A 4OXVA 3H4ZA 5TPAB 3G3GA 3O97A 3R7XA 1JW4A 3RTFB 4ELOA 1NNKA 2DE3A 1AL3A 4ZEIA 4ONYA 4LATA 3MWBA 4JB7A 4PFWA 3IL1B 2PX1A 5FHOA 1P1NA 3T9HB 2KLFA 3DP8A 1IXIA 1Y1MA 4MFIA 2QL3A 4XKPA 1SI0A 1URGA 3S9NC 1PB8A 4LZ8A 1ELJA 1I6QA 3OOAA 3RNNA 4G8NA 5DYHA 2WKYA 3V89B 4F31B 3PPRA 4LZ5A 1GR2A 2UVIA 3OELA 1LSTA 2DE4A 4EDPA 3K6WA 4U21A 3LUYA 4P0IA 3E4RA 2RF1A 3O6GA 2QS4A 1MS7A 2ALUA 3G7WA 1URDA 2O7IA 4LVQA 1J1NA 4DLDA 4U4XA 4EF2A 5HM4B 2DE2A 2DWJA 4F19A 4EF1A 3HV1A 4R6KA 4LP2B 1YPNA 2V3UA 2I6EA 1FQBA 2F97A 1R9LA 4POWA 5I57B 3D4GA 4YKKA 2GHAA 2O1MA 2ZMBA 3IORA 3M3KA 1B3HA 1B46A 2UVGA 1LBCA 5KCJA 1DTGA 4MLQA 1B40A 2DP8A 2ZYNA 3TYHA 1FW0A 4ZE8A 4QFNA 1MQIA 2DXRA 1TXFA 3NXHA 1MY4A 1Z7NE 5DVIA 1ZIUA 5CMMA 4FE8A 5KZTA 4NF5A 4OVJA 4KCDA 5FHNA 4N6PA 2PVUA 2NOOA 3C33A 2Y7RA 5TP9A 5CM6A 2V3TA 3JYRA 3MQ9A 2QJEA 2I4BA 3EHUA 1R6ZA 2GFEA 1P99A 3G3FA 3KEIA 4N07A 3VLUA 2ESNA 1QKBA 4YB5A 4G8MA 1P1OA 3ODBA 3MJNA 1BLFA 2BJJX 4R74A 1B7HA 2I0BA 4KCCA 1LB8A 2XXYA 4ZEKA 1N04A 1B0HA 1MXWA 4GQOA 2H5YA 3C9HA 4BDLA 5AA3A 4H6DA 3IOVA 2IEEA 4PFTA 3GZGA 3DP6A 3HHGA 4JDFA 4BDNA 3IJXB 3MAMA 2AYSA 4H1XA 5EHMA 2AL4A 4DZ1A 3E9XA 1GVCA 2QPQA 4M4GA 4H8JA 3EPEA 1FTMA 4YKJA 1IIWA 4DXCA 3B7DA 3MPLA 4XKRA 3A3UA 2DS9A 1GGGA 2ONRA 1PC3A 4E0XA 3KN8A 4OETA 4RNSA 4G68A 3B6QA 2V3QA 4P11A 4DCYA 2PT2A 1LCTA 3FIRA 4WKMA 5KCJB 3TFLA 3VLWA 4KR5A 1HSJA 1HSLA 3FGSA 3HSTA 2O69A 4ZS9A 3OKZA 3MZ1A 4ZDMA 5EHSA 4BLAA 2Z23A 3S4UA 1B5IA 3C31A 3IOUA 3SDFA 3PMXA 1CB6A 1B6HA 5I56A 1POY1 2D3IA 2XXPA 4NF5B 3KN3A 1MM6A 3DM0A 4EQ9A 3PGFA 2QMWA 5ISUA 1Y3NA 3W15C 5TP9B 4FEBA 1MQDA 3BFTA 2O51A 2ZYMA 1LCFA 4R2BA 4NMYA 4IO2A 5I2KA 3FATA 3PUVE 1IQ7A 5JEIA 3H06B 1TFAA 5CC2A 2FYIA 1OQHA 2ABHA 5ITOA 1LB9A 2ONSA 2QS2A 2Q9TA 1P1UA 4MH5A 4JWYA 2R6GE 2RC9A 3GBAA 3D4CA 4KHZE 4OQOA 1US4A 1IXCA 1A8EA 2DVCA 2F7CA 4OHNA 4XXUA 3K6VA 2DXYA 2OK2A 3N6TA 3B6WA 3MW0A 4OWDA 1XT8A 3CIJA 4H65A 2Q2CA 3RT6B 1Y9UA 3TPAA 2I3VA 4IO6A 4E0WA 1UTHA 4YKIA 2OJTA 3JV9A 5H8SA 1R1NA 3CR9A 3ONMA 1USYE 5CMKA 3DLNA 3Q29A 3CVGA 4H5GA 1Y4TA 3N5LA 4G8HA 2NXOA 1B52A 5KDTA 4BDOA 5L9OA 3K6XA 4LQ2A 1Y4CA 1EZ9A 2UXAA 1MPDA 1OIBA 4FJPA 1EU8A 1PBPA 2R71A 4X48A 5BWJA 3T93B 4ISUA 3M8UA 3FASA 5M2VA 4H67A 1XHYA 3N6UA 5I56B 3PU5A 4AB6A 5BUUA 1S7YA 3KSJA 3JZJA 4EXLA 2P1SA 3U94A 3TEPA 3PUZE 5I2KB 3VVEA 4Q8RA 4MLVA 1MQJA 2H99A 2RC7A 4DE8A 2I4CA 3IX1A 2Y7PA 2REJA 1ZLQA 4HCWA 3HHFA 1BTJA 3KZGA 1D9VA 1SW1A 5DT6A 1S50A 3U92A 4JWOA 1MY0A 4YB6A 4R2FA 4U2RA 1ZBMA 1MXXA 4HW8A 3V8XB 4ELQA 3LSFB 5F1QA 3K1MA 1AH5A 4F29A 3GBBA 3TQWA 1JVXA 3LSLA 1IUDA 3LR1A 4XKQA 1FTOA 2Z8DA 5K2XA 2ZNSA 2XXWA 1UTHB 3T9XB 3K01A 1OQGA 1ZMGA 4H5FA 4U1OA 1NH8A 2OCUA 4ZZEA 1FTJA 4KQPA 3UK4A 3HO7A 2R9JA 4GIZA 1EZPA 2HAVA 3DELB 4GL0A 3VVDA 4OTEA 4Z7EA 2XX8A 3IB1A 2HEUA 3M3FA 2P2AA 5B70A 5KDTB 4OMBA 1FTKA 5H8NA 4GXSB 1M5EA 5CMCA 5DVJA 3ZKLA 4R72A 3FJMA 1N0TA 3TCFA 2P0SA 2VGQA 4R6YA 3Q28A 3KSXA 3O2AA 2H4IA 2THIA 4ZZAA 1AMFA 4PFYA 2QS3A 4ELPA 3EHTA 4OZ9A 4GD5A 2PYYA 1JEUA 3PD8A 4LONB 5FTHA 4U1ZA 3IO4A 1FQEA 3RGYA 4NWDA 1RYXA 3IB0A 2F7AA 2X26A 4THIA 3ILUB 4XTCQ 2GRVA 1N7WA 2XXTA 1POTA 2OWSA 4I62A 3FV2A 4NF6A 4FEDA 4QSEA 3WAEA 3EN3A 4G2ZA 1SQYA 1MQGA 1QUKA 2XD3A 2HCAA 1XOCA 1MPCA 1JW1A 3FJGA 2XXVA 3H6VA 4Q30B 4U4SA 4RJZA 1TWYA 5CI5A 3NROA 3FXQA 4YMBA 2YJPA 5EYFA 4DDDA 2VD3A 3S9LC 5ICQA 3ECRA 3SEUA 2Q8JA 5F7VA 3K2DA 2Z8EA 4TOZA 1FTLA 2E0SA 3PPQA 1ATGA 2GH9A 3RUMA 4FIMA 4IY5A 3G3KA 3FVOA 1B3FA 1OVBA 1B32A 4NF4A 2O1LA 4LQ5A 2QMXA 4PFUA 3WAFA 2F6PA 4HCYA 4ECFA 2AIXA 2O84X 3CI8A 2V84A 4IO7A 5AE4A 3W9VA 1A7LA 1B3LA 4GLIA 3S2VA 4QFOA 5H8NB 1GV8A 3KJ7A 3TZAA 3O6IA 1M5CA 1SYIA 4F3SA 4IY6A 4KYEA 3TAJA 3RT8A 1I69A 3L6HA 3TELA 1UIUA 3PUWE 3FXUA 4I9DA 2M8CA 4QSDA 2HZKA 3OSQA 3E13X 1GTKA 1IXGA 4NWCA 3B6TA 3RPWA 3OD7A 5CRYA 1JQFA 3TDJA 2I48A 3CFZA 3TODA 2DQVA 2HQ0A 5TU0A 1BIYA 4NF6B 1UQWA 4OFLA 3ZSFA 3PPNA 3IAZA 3O29A 3FXRA 3O6HA 2OLBA 3GXAA 2F36A 2F6GA 1R9QA 4EQBA 3K6UA 3OEMA 1TFDA 1MQHA 2REGA 3QFIA 2CMOA 1YTVA 4I1DA 4GXAA 5JK4A 3K0VA 3MVYA 5H8QA 2O68A 4F3GA 2G93A 1WVJA 1BP5A 4NF4B 4FAJA 3OEKA 4FORA 3CG1A 2Q88A 2Q89A 1LAFE 3MBPA 4YMAA 2XXQA 1SBPA 4GRKA 4LA9A 1QUJA 2H9BA 4RYAA 3KOSA 5AA1A 1MH3A 4Q0CA 2FA7A 4TLMB 2B65A 3QSLA 1XVYA 3LC8A 4WXJA 3DP4A 3U72A 4QFLA 2RINA 3OWQA 4KFQA 1Z7ME 1VFEA 3T66A 2XD2A 4NF8A 1LBBA 2HZLA 4PP0A 2YLNA 3Q26A 1JNFA 1PBQA 1UTBA 4OBMA 1PEBA 3UGWA 3P7IA 2F35A 4KD5A 1LFGA 4ZE9A 4KPTA 4PQJA 3QIMA 1FQAA 3OO8A 4OFOA 3THIA 4C1UA 4Z0IA 4GWOA 3CSGA 3K00A 1QKAA 2V25A 1L5TA 2QS1A 2H25A 2V93A 3VFJA 1LAHE 4F2OA 1YAEA 1MXZA 2NWJA 2UVJA 4YICA 4AB5A 1M5FA 4YU0A 1Y1ZA 5HPQA 3PPPA 4K3FA 1B7UA 4TQUQ 2PT1A 3U8QA 4AQ4A 5IKBA 5DEXA 2A5TA 1N3WA 3FZVA 4X9TA 1II5A 2Y7IA 1AIVA 3QYTA 5H8FA 4KI0E 3FVNA 1QUIA 5H8QB 3T22A 5B7DA 3G3JA 4O3CA 3U93A 4RY1A 3LBSA 1HSEA 3VXBA 3LSXA 3VDFA 2Z22A 2X7PA 4GL8A 1Y3QA 1XVXA 1NKXA 3C34A 1N84A 3KG2A 3O66A 1WDNA 3AXFA 4F2QA 2DVZA 4JWXA 3MVXA 2ANJA 1OLCA 1MRPA 3OO9A 2UVHA 3BBRA 4NF8B 1IZ1A 4R6HA 3E3KA 2A5SA 1IXHA 4N13A 1SW5A 2ONKE 2RCBA 3HPIA 4WEDA 4ZECA 1LGBC 1O64A 1SVXB 5ICTA 3USDA 1UTBB 4HS7A 1M5DA 3PMVA 2PBWA 2B3BA 4OEVA 4OYVA 1SDXA 3TTKA 4IB2A 3OO6A 1UIVA 3PUYE 2GHBA 4H0WA 3CG3A 4GOTA 1NFTA 2DSFA 1RKMA 3ZKKA 5FHMA 4GVOA 1VSOA 3TTRA 2DWIA 3C4MA 3TKDA 4XKNA 4JSDA 3FV1A 1B4ZA 1B3GA 5HBCA 4R75A 5H8HA 3RQTA 1JEVA 2DYXA 1OMPA 2ZNTA 1YCJA 1B1HA 1ZTYA 4ZEFA 3ILTB 3LSWA 4P0GA 4HTGA 4OESA 3W9WA 1JVYA 1VFDA 1PB9A 5DEXB 2A5TB 3UORA 1DSNA 1F9BA 2F78A 3FVKA 3MEJA 2Y7WA 2VHAA 5H8FB 3H03A 3IR1A 1T0KA 3RLFE 2HAUA 3K4UA 1FQFA 1LAGE 4IO3A 3MP6A 2O7UA 3CRBA 1B2HA 4C0RA 4R9GA 4YB7A 4F1VA 3KOTA 1A8FA 1MY3A 4BDRA 2ZNUA 5AA2A 1H3DA 4KYDA 1URSA 2XX7A 3EQ1A 2ZYOA 3PPOA 4POXA 5LOMA 4YKPA 5I2NA 3QXMA 4QFKA 4R9FA 1FQDA 3UN6A 4X1BA 4DXBA 1US5A 2XXUA 3K1NA 3R6UA 4OERA 2OZZA 1MPBA 1XC1A 2H98A 3VVFA 3HN0A 4XIGQ 1BKAA 3SEVA 4NEDA 3TCGA 2RKMA 2XXRA 4O3AA 5AA4A 4U22A 3C35A 2X7QA 3FVGA 1B1XA 1LLSA 4IO4A 4GF8A 5A5XA 4H8IA 1Y20A 4UACA 4OEUA 4ZEDA 3R26A 1O63A 2XX9A 5H8HB 3N26A 3Q27A 1VR5A 1QULA 4LZ7A 4JSOA 5L9MA 1FQCA 4RXLA 3V5AA 2Z8FA 4OENA 3OXNA 3BFUA 3I6VA 3FUZA 1P1QA 1RYOA 4Q5TA 1O7TA 1ZU0A 1OLAA 1EH3A 3QUJA 1ANFA 1B4HA 3TQLA 4F1YA 1CE2A 1KWHA 4IGTA 4GFRA 3EF7A 3S9EA 3TCHA 2IA4A 2XXIA 1MXUA 1A99A 4IGRA 1N3XA 2AL5A 1I6AA 3VV5A 1B5HA 2UYFA 4DIGA 4QHQA 4EUOA 2ZYKA 2VP1A 4UA8A 1N7XA 5AA2B 1DTZA 1JW5A 2F5XA 3O9PA 4EXKA 3A3CA 5I59A 1NNPA 1ZJLA 2D21A 4WEPA 4PE5B 5I2NB 4MF3A 1VE4A 4RPOA 1SYHA 3HCQA 3KJTA 3SESA 1P1WA 1QVSA 5AA2D 5ITPA 1B0LA 3MP8A 2G29A 5DVFA 3M3LA 5CBRA 1IITA 3IOWA 1A40A 5ELVA 2QSXA 3H6WA 3MZBA 1TT1A 2NUVA 1XS5A 1Q1KA 1Y3PA 2Y7KA 3I3VA 1NNTA 3QAXA 2D5WA 3MUQA 3K02A 1B9JA 3FD3A 3I5OA 5AA4B 3PD9A 4QF9A 1B7ZA 3T9UA 1A55A 3H6UA 4M1VA 1MXYA 4NE4A 4ESXA 5A5XB 2Q2AA 3SEXA 4RPNA 2RCAA 2DOJA 3TTNA 2ZXTA 4F3BA 1DMBA 4F39A 5CBSA 1LAXA 2FNCA 2E1SA 5JTYA 2B3FA 4BDMA 3L6GA 4BDQA 3PMWA 1OVTA 1MG1A 4YAHX 1DOTA 4F1UA 3F11A 4FECA 5I84A 5L8DA 1H45A 3CFLA 2PMSA 5I58A 3TTMA 3ZS6A 1PDAA 3A09A 5IAIA 4DXUA 1D3KA 3KBRA 1FCKA 3QK6A 2HXWA 3KGCA 4PETA 4RK2A 3KFMA 1D4NA 2RC8A 2Y84A 1SD3A 4KYSA 1MY1A 3RTWB 3RN8A 3VE1B 3MPKA 3VLVA 4DCXA 3Q25A 1B05A 3SETA 1SW4A 2XXXA 3N94A 5DTBA 5I59B 1IEJA 3OO7A 4L17A 4LUBA 4G4PA 3U1OA 3GLBA 2F7BA 4MBPA 3UP9A 4NTLA 4R73A 4IO5A 3SERA 4G68C 3PE5A 2DWAA 1DPPA 3SEWA 3TMGA 4RK9A 2LAOA 1ZKBA 3SEYA 4QSCA 1SI1A 1NL5A 1B58A 3UA8A 1WODA 4C1TA 4F22A 1MXVA 3TTLA 1JETA 2I3WA 3CSBA 3KN7A 1N76A 5TPAA 1AOVA 2O6AA 3CFXA 1NNFA 3IK6B 3MVWA 3RY3A 4QFPA 1D9YA 4U23A 3SKPA 2VD2A 2I58A 4G68B 5K2YA 4QRZA 2F34A 3TUSA 1H76A 3T96B 4F3PA 3MP1A 3IJOB 3PV0E 1MDP1 2I0CA 1M5BA 3OSRA 4I8CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JTYB 3FJ7A 4ER3A 2P3VA 3IO6A 4OVSA 3V83A 2IV1A 3IB2A 1MM7A 4X4DA 1H44A 4LN5A 2DWHA 3MVZA 3FXBA 3UIFA 4ZEBA 1NH7A 2UYEA 3VXCA 3C36A 2OWTA 3G3IA 3OQMA 3B50A 5I58B 1S9TA 4G77A 2CZLA 1BDHA 2CZHA 5CMBA 4NAPA 4PFIA 2I49A 3DM5A 2FHYA 4PBHA 4RA1A 5L9SA 3FBPA 4OFJA 1B51A 2VOZA 2L1PA 1B5JA 3H3GA 1NMUA 4ND9A 1YXIA 5JUWA 3BIGA 1QJMA 1I6BA 1NV6A 5ET8A 1A54A 2KEJA 2GZUA 1Q35A 1LFHA 4OVTA 1B3EA 1NW3A 2HXRA 2HINA 4F18A 2QRYA 4WVLA 1SW2A 3H6TA 1LFIA 3MC2A 4TLLB 3C32A 1YYZA 3OENA 1DPEA 1QW0A 2XHDA 3O28A 3EHSA 4ESWA 4DE9A 1USYH 5I57A 3BKIB 4FATA 4H46A 3IOTA 3H7MA 2XXHA 3PUXE 1EZOA 1PRUA 3K1PA 2HFBA 3LQXA 1JWLA 1MY2A 3T9VA 3OMBA 4YZZA 1MDQA 3G3HA 2NVUB 3MZ9A 1H43A 3S9MC 2W7YA 4EQ7A 2YPNA 1PB7A 2OBGA 1D9QA 4JXIA 3SX0A 1SPIA 4Z5HA 4ELRA 2LLWA 2XI8A 4O3BA 4X1DA 4JBZA 5J1DA 3QUFA 5FTIA 2F8DA 1MH4A 4OXVA 3H4ZA 5TPAB 4GBVA 3G3GA 3O97A 3R7XA 1JW4A 2R1JL 3RTFB 4ELOA 1NNKA 2DE3A 1AL3A 4ZEIA 4ONYA 4LATA 3QOWA 4IVZA 3QMFA 3MWBA 4JB7A 4PFWA 3IL1B 2PX1A 2KZ8A 5FHOA 4HXVA 1P1NA 3T9HB 2KLFA 2D5VA 3DP8A 1IXIA 3MSTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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