2XXVA

Crystal structure of the gluk2 (glur6) m770k lbd dimer in complex with kainate
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
SLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPKGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Conformational Flexibility of the Ligand-Binding Domain Dimer in Kainate Receptor Gating and Desensitization
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 85
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxvA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxvA02
3MZ9A 5CRYA 4XKPA 1A40A 1J1NA 2Q2AA 3B6TA 5FTIA 4U21A 5CMBA 1B7ZA 4C1UA 4QFKA 5HM4B 1MG1A 4HS7A 4NF5A 1FTLA 3K01A 1Y3NA 2ANJA 1IUDA 4KCCA 1MRPA 3TCFA 4PFWA 4R73A 1D3KA 4F3GA 3KSJA 3MZ1A 4POXA 3BFTA 5I59A 5DVJA 1LCTA 1ZTYA 4F39A 1JETA 1UTHA 4QSCA 3IOUA 2OWTA 3MJNA 4MFIA 1A7LA 1URGA 1FCKA 4NF6A 1PC3A 3IJOB 4LA9A 3LSWA 4X9TA 1FQBA 1EZ9A 1POTA 3QUJA 2YPNA 3C9HA 3S9NC 2YJPA 2V3TA 4LONB 2NVUB 2G29A 4TOZA 1LAGE 3K4UA 3KJTA 3HSTA 1B3EA 3I6VA 1FTJA 2DYXA 2I4BA 2DS9A 1UIVA 3MP8A 1SQYA 1ZU0A 1MQHA 2Z8FA 1A99A 1N76A 4KD5A 4GQOA 5DT6A 1P99A 3PPRA 4ZS9A 4YKPA 3IO6A 1IZ1A 1TT1A 1Y1ZA 3Q25A 3IJXB 2DSFA 3K6WA 1B5JA 3BKIB 4L17A 2P2AA 2XXUA 3VVFA 1DPPA 5EHMA 2ZMBA 4Z7EA 4LUBA 4ONYA 4TLMB 1OVTA 4I9DA 1MPBA 2UVGA 4GD5A 2Q88A 3OENA 2RCBA 5AA2B 1UQWA 3RGYA 2F34A 4OESA 2UYEA 2XXHA 1H76A 1M5EA 1FQCA 3KN3A 5JK4A 2NOOA 5JEIA 1B3LA 1B51A 5I2NB 2GRVA 2XXYA 4U1ZA 3ILTB 3JZJA 2XXVA 5ICQA 2DOJA 4R9FA 3BBRA 4OWDA 4GF8A 4IO6A 2DWJA 2F6GA 4H0WA 3PUXE 3KG2A 2F6PA 3WAFA 2O7IA 1SW4A 5FHMA 1B7HA 1JEUA 3M3KA 4DZ1A 3FXRA 4LQ2A 2RC9A 2ZNSA 3T9UA 1DPEA 2IA4A 1FQFA 1I6BA 3CG1A 4WKMA 3MWBA 3MVYA 4PQJA 4RJZA 4ELOA 4Q30B 2YLNA 1B1XA 3N5LA 1POY1 4IY6A 4BDOA 4OTEA 3VE1B 3VLVA 4YB7A 3MAMA 4EXLA 3S9EA 1MY4A 1B2HA 4TLLB 3CFLA 3JYRA 5DEXB 5H8FB 4U22A 3WAEA 4FIMA 3RY3A 4PP0A 1SDXA 3D4GA 1VSOA 4LATA 2D3IA 4LP2B 5TU0A 1MH4A 4NF8A 2Q2CA 4YMBA 1JQFA 3CSBA 5F1QA 4OETA 1N7WA 1ATGA 1LGBC 5CMCA 1SYHA 4H67A 2OLBA 3VVEA 3RNNA 1SW1A 4RYAA 1ZLQA 3MQ9A 1RYXA 3G3JA 3U72A 3EPEA 4DDDA 1VFEA 4H8JA 2XXRA 2R6GE 2RC7A 4G77A 1SI0A 4MLQA 1TFAA 3PUVE 4F18A 4QSEA 1TWYA 1B5IA 4HW8A 3O6GA 1BKAA 4RA1A 1FW0A 1PB8A 1NL5A 4KCDA 4G8NA 2Y7RA 3CR9A 5AA2D 2KLFA 3B7DA 1MH3A 2QS4A 1H43A 2R71A 4QFOA 4E0WA 3TELA 2H25A 5I58A 3U8QA 2HFBA 3BFUA 1UIUA 2Q89A 3CFXA 5I84A 5CBRA 3H6VA 4RY1A 3FVGA 2I58A 4I62A 5TPAB 1B7UA 4OFJA 3EHUA 1US5A 4JBZA 1B32A 5DEXA 5H8FA 4OFOA 1URDA 5AE4A 2HAVA 1JW1A 2CMOA 3A09A 2O1LA 3TODA 1R9LA 3ODBA 2DWIA 2ABHA 1MXWA 3SEXA 2BJJX 1MDP1 1GR2A 2F78A 3VXCA 1ZJLA 4JWOA 3L6GA 1R6ZA 4M1VA 2X26A 2F7CA 4JB7A 4N13A 1Y9UA 1Y3QA 2RC8A 2XXPA 3FUZA 2D5WA 1S50A 5ELVA 3MP1A 4Q0CA 4DLDA 3QYTA 5FHOA 5H8NA 1QKBA 4OFLA 3K1PA 2RKMA 2O7UA 3G3HA 2VHAA 5FHNA 2V3QA 4PFYA 5CM6A 2XXXA 4NF5B 1IXHA 3I5OA 3IAZA 2HEUA 3MBPA 3O28A 4YKIA 1EZOA 4ZE9A 1B9JA 3KZGA 4G68C 2Y7PA 5I59B 3KFMA 3VDFA 1O7TA 3T22A 2XXQA 1UTHB 3TFLA 3CVGA 2B3FA 4ZDMA 3VLWA 5TPAA 5I56B 1FQEA 3S9LC 1II5A 1NNKA 4JSOA 1USYH 4ISUA 2GHBA 2HZKA 4XXUA 3V5AA 3TTMA 2QS1A 3RT6B 1IXCA 3H7MA 5BWJA 1B05A 4YU0A 3G3FA 4FEDA 4H65A 1A54A 1JVYA 3V83A 1LFGA 4P0GA 2DQVA 4G8MA 3UK4A 5TP9B 5HPQA 3IOVA 1A55A 2DWAA 4QFNA 5I57B 2Z8DA 3IB2A 3OO7A 3VLUA 4I1DA 4OZ9A 3IB1A 4ECFA 2ZNUA 4GIZA 1T0KA 3TZAA 2GFEA 3O66A 1XHYA 4O3AA 2ESNA 3SEVA 2Z8EA 2I4CA 3PMXA 3IB0A 4GL0A 3Q29A 1IXGA 4ESWA 4ZE8A 4F3SA 3FZVA 1N84A 3C33A 3IOWA 1N3WA 1LCFA 1O63A 3SESA 2FYIA 2QS2A 3ZS6A 5A5XA 4ZZAA 4YMAA 2H4IA 4AB5A 1GV8A 4K3FA 5I56A 1PEBA 3C31A 2Y7WA 3PGFA 3RT8A 4E0XA 1A8EA 1XVXA 4F1YA 4H5GA 2NWJA 4LZ5A 1GTKA 4YICA 3PPNA 2ZYKA 5TP9A 4IGRA 4HCWA 3TQLA 5DVFA 5I57A 5H8HA 3KN8A 2GH9A 4R74A 4R9GA 3N6UA 4NTLA 4F31B 2B65A 4R75A 2PYYA 2F7AA 1FTKA 2ZNTA 1BTJA 3PU5A 4YKKA 1JEVA 3U93A 4FE8A 3IL1B 4RK2A 3SEYA 1URSA 1P1QA 4JSDA 2B3BA 4EXKA 3EHTA 2OBGA 3TMGA 1IQ7A 1ELJA 3KEIA 4OVJA 1MY2A 5CC2A 1LBBA 4NF4A 4RPNA 3PD9A 3T66A 1MDQA 4NF8B 4FATA 3IK6B 2E0SA 3KGCA 1XT8A 2VD2A 3C35A 2Y84A 1KWHA 4NMYA 1AH5A 3P7IA 3U1OA 2LAOA 2WKYA 3R7XA 3PMVA 3A3UA 3UP9A 4NE4A 4GOTA 1RKMA 4FORA 2DVCA 5L9OA 3LSXA 4ELPA 2D21A 3H6UA 1B4HA 5J1DA 1YAEA 5ITPA 3QXMA 1LBCA 4KPTA 4H6DA 2P1SA 3LC8A 3UN6A 1D9YA 4FEBA 1H3DA 2Y7KA 1MM7A 1GGGA 3OO6A 4PFUA 3KJ7A 3C36A 2XD3A 1PBPA 3S2VA 5I58B 2I0BA 1TXFA 4F22A 4P11A 3GLBA 3MVXA 1GVCA 5LOMA 3O9PA 3QUFA 4ZEDA 1B3FA 1Y3PA 3RQTA 5CMMA 1HSJA 3OEMA 4THIA 4JWYA 2Q9TA 5AA3A 3FGSA 3QK6A 1N7XA 2I48A 3G3KA 2I6EA 3QSLA 3CI8A 3H4ZA 2G93A 5KDTA 3DLNA 5DTBA 3A3CA 3HN0A 3KOSA 5JTYB 3M3FA 3OSQA 1B58A 1JNFA 2FA7A 1N3XA 3TAJA 4GVOA 2O51A 1O64A 3MC2A 2M8CA 3K6VA 2OWSA 5AA4B 1MQDA 4IY5A 1D4NA 1I6AA 4F2OA 3DP8A 4OEUA 2PBWA 1Q35A 1MY3A 3DP4A 2QS3A 1ZKBA 2AIXA 5H8NB 1SYIA 4YKJA 3THIA 4BDNA 5CI5A 5ICTA 3MUQA 3PPPA 1M5CA 3UORA 1Y1MA 4DE8A 3W9WA 4WEDA 4G8HA 1NKXA 1JW4A 4ZEKA 4N6PA 3K2DA 3HCQA 1ANFA 2QJEA 1H44A 2XXTA 1MM6A 1AMFA 3MPKA 5IAIA 3RLFE 4KQPA 5EHSA 4X48A 3KSXA 1B52A 3LSFB 4C1TA 4YZZA 3M8UA 3QAXA 2OZZA 2I0CA 4LZ7A 1B40A 2XD2A 2R9JA 3SKPA 1MXZA 3TDJA 3TKDA 3PUWE 1Z7NE 3AXFA 4FJPA 1IIWA 1A8FA 4U2RA 3T96B 3Q27A 3FATA 3T9VA 4F19A 1Y20A 4MF3A 5EYFA 4MBPA 4LQ5A 2V3UA 3E3KA 4F1VA 3DM0A 1DTZA 3HHGA 4RPOA 3L6HA 2A5TA 5JTYA 1MQGA 2V84A 3ILUB 4IO4A 2PMSA 2DE2A 2H9BA 1IITA 3HHFA 3H6TA 4H8IA 3ZKKA 2ZYNA 1FQDA 4BLAA 4F2QA 1OLAA 3H6WA 3CG3A 3IR1A 5AA4A 3U92A 4R2BA 4XIGQ 3FV1A 4IB2A 3U94A 2QMXA 1CE2A 3PPOA 4OHNA 1SW2A 5L9MA 3TCGA 1BLFA 3UA8A 1B3GA 1EU8A 2W7YA 2I3WA 4KFQA 4UACA 3O6HA 1JW5A 3EHSA 1YPNA 3S9MC 4MH5A 3OELA 4F3PA 5F7VA 4LZ8A 1IEJA 4U1OA 4WXJA 4OERA 4GXAA 4KHZE 4RK9A 1JVXA 2QRYA 3T9XB 1LB8A 5A5XB 3S4UA 3R6UA 1DOTA 5CMKA 2ZYMA 4GFRA 4QHQA 1MPDA 3PUZE 2OK2A 4HTGA 2DWHA 1QUKA 3PV0E 1LLSA 2DE4A 1B3HA 1P1UA 4XKRA 5K2YA 1F9BA 4OEVA 1QULA 4ZEFA 4O3CA 4YAHX 4ZZEA 3LUYA 3EF7A 5KCJB 3EQ1A 4MLVA 5H8SA 2A5SA 1PB7A 5H8QB 5H8HB 4AB6A 4HCYA 2ALUA 1PDAA 1OVBA 1D9VA 3O29A 3OMBA 4ESXA 1Z7ME 1LFIA 3RN8A 2OCUA 2DXYA 2ONKE 3C32A 3KOTA 1AIVA 4U23A 1LAFE 2F97A 1UTBA 4P0IA 1MS7A 3OO9A 1I6QA 1EH3A 4RNSA 3E13X 2VP1A 4IO7A 3O2AA 3PPQA 4R72A 3K6UA 5L9SA 4H1XA 4QSDA 4NF4B 3RTFB 2I49A 2Y7IA 5K2XA 4FECA 1YCJA 1OMPA 3OOAA 3K1NA 1MPCA 1SVXB 1MY0A 4DCYA 1B5HA 4U4XA 1FTOA 4OMBA 4QFPA 1MQJA 3EN3A 3FVKA 1MQIA 3R26A 4LVQA 3I3VA 3N94A 2DE3A 1N0TA 2F8DA 3HV1A 1XOCA 4QF9A 4EF2A 2QL3A 4EF1A 1FTMA 1XS5A 5KCJA 2V25A 2RINA 4BDMA 4OYVA 5H8QA 2HXWA 3HO7A 4JWXA 2ZYOA 3KBRA 2F36A 1Y4CA 4POWA 3C4MA 2XX7A 5HBCA 1VFDA 4XTCQ 4KYEA 2RF1A 1ZIUA 1H45A 1ZBMA 2QSXA 3E4RA 3TTLA 3TTKA 2O68A 4F1UA 4IGTA 1DMBA 3IX1A 4GL8A 3FJMA 1OQHA 4OENA 5KZTA 4R6YA 4NWDA 4ZEBA 3LR1A 4H5FA 3SETA 1XVYA 4RXLA 5KDTB 4F3BA 5L8DA 5AA1A 2I3VA 1MXYA 3C34A 3FXQA 1P1WA 3FV2A 1OLCA 2F7BA 1S7YA 4YB6A 4ELRA 3K00A 1EZPA 4DXBA 1SBPA 4G4PA 3ZSFA 2E1SA 4JXIA 2NXOA 4R2FA 1NFTA 1B0LA 2O6AA 4OQOA 4IO5A 1S9TA 4IO2A 3MVZA 2NUVA 3RUMA 2REGA 4DXCA 3O97A 2QMWA 3SDFA 4PFTA 3OXNA 1HSLA 3DELB 5B7DA 4GRKA 4EQ9A 2HCAA 3W9VA 3PD8A 3CFZA 1R1NA 2X7PA 1P1NA 3TPAA 4KYSA 2O69A 4ZECA 4QFLA 3MZBA 3B6WA 2XXIA 4YB5A 1XC1A 3W15C 3K6XA 3FJGA 1NNPA 1LFHA 5BUUA 3ECRA 3TEPA 2O84X 2HZLA 2THIA 4PETA 5FTHA 3MP6A 3N26A 1M5FA 4U4SA 4M4GA 3TCHA 4FAJA 1M5BA 1NNFA 4KI0E 3ZKLA 3G3GA 4N07A 2AL4A 2F5XA 1WODA 5ISUA 1QUJA 1SW5A 4PE5B 4ELQA 2GHAA 3G7WA 3FIRA 3JV9A 3IORA 1L5TA 2A5TB 1DTGA 2OJTA 4NEDA 3RPWA 2VD3A 3OEKA 1QKAA 3IOTA 1QVSA 2AL5A 5AA2A 2UXAA 3H3GA 1LSTA 1WDNA 3FXUA 4X1DA 1AL3A 4R6KA 3DP6A 3E9XA 3UGWA 2HAUA 1VR5A 2VOZA 4DIGA 1QUIA 1MXUA 2O1MA 5I2NA 2H99A 1NH7A 1USYE 4ZEIA 3RTWB 3OO8A 1Y4TA 3GBBA 4GWOA 2DP8A 3D4CA 4KR5A 2AYSA 3VVDA 1P1OA 3TTNA 1LB9A 1B46A 1BIYA 4I8CA 4C0RA 2PT2A 1CB6A 4O3BA 2QPQA 3PMWA 2XXWA 3TQWA 2Q8JA 3FD3A 3SERA 3Q26A 5DYHA 1QW0A 4R6HA 4G68B 4AQ4A 1LAHE 1FQAA 2DVZA 3H03A 4BDLA 2RCAA 2H98A 3K1MA 3VXBA 5I2KB 1MXVA 3GXAA 2ZXTA 3V89B 1OQGA 3MVWA 3M3LA 2VGQA 5ITOA 3Q28A 3HPIA 2PVUA 3QIMA 4QRZA 4ND9A 3SEWA 3OSRA 1I69A 4BDRA 3LBSA 5IKBA 3K02A 1M5DA 3CRBA 2HQ0A 2Z23A 4EUOA 5CBSA 1OIBA 4TQUQ 4EQ7A 3N6TA 3F11A 4G2ZA 4XKNA 1YTVA 1HSEA 1AOVA 2ONSA 3ONMA 4JDFA 3FASA 2V93A 2PX1A 3TTRA 3FVOA 2DXRA 1SI1A 3T9HB 3MPLA 1UTBB 4UA8A 1NH8A 3PUYE 4EDPA 2UYFA 1Q1KA 3G3IA 4WEPA 2XHDA 3GBAA 1QJMA 3T93B 3O6IA 3SEUA 4GLIA 1DSNA 1B0HA 1VE4A 1RYOA 3TYHA 3FVNA 1IXIA 1MY1A 1PBQA 2FNCA 1BP5A 2UVJA 3UIFA 3OD7A 4DXUA 3K0VA 4G68A 1R9QA 5I2KA 1MXXA 2CZLA 2ONRA 3GZGA 3MW0A 4Z0IA 3IO4A 4IO3A 2IEEA 3TUSA 1N04A 1ZMGA 3CSGA 2PT1A 4Q8RA 2UVHA 4BDQA 2REJA 3LSLA 4GXSB 4NWCA 4NF6B 1US4A 1WVJA 4KYDA 5DVIA 2XX8A 1NMUA 4OXVA 4Q5TA 1NNTA 4X1BA 1TFDA 4F29A 3FJ7A 2F35A 1B4ZA 3USDA 1B1HA 4EQBA 3H06B 2P0SA 2XX9A 1LAXA 4DCXA 2UVIA 3VFJA 1B6HA 1SD3A 3KN7A 2H5YA 4XKQA 1PB9A 3CIJA 5M2VA 3V8XB 3B6QA 2Z22A 5B70A 2X7QA 3VV5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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2WYKA 2UYEA 4OESA 2XXHA 1CNQA 1H76A 1M5EA 1FQCA 3KN3A 5JK4A 1QGXA 2NOOA 5JEIA 1B3LA 1B51A 1K9YA 5I2NB 2GRVA 2XXYA 4U1ZA 4N6KA 3ILTB 3JZJA 2XXVA 1IMDA 5ICQA 2DOJA 5LDZA 4R9FA 3BBRA 4OWDA 4GF8A 4IO6A 4PGNA 2DWJA 2F6GA 3ISPA 4H0WA 1FPGA 3PUXE 3KG2A 2F6PA 3WAFA 2O7IA 1SW4A 5FHMA 1B7HA 1JEUA 3M3KA 4DZ1A 3FXRA 4LQ2A 2RC9A 2ZNSA 4MIJA 3T9UA 1DPEA 2VPOA 2IA4A 1FQFA 1I6BA 4HXVA 3CG1A 4WKMA 4JVIA 3MWBA 3MVYA 4PQJA 4RJZA 4GBWA 4ELOA 4Q30B 2YLNA 1B1XA 3PTYA 4GX3A 3E79A 3N5LA 1POY1 4IY6A 4BDOA 4OTEA 3VE1B 3VLVA 4YB7A 3MAMA 4EXLA 3S9EA 1MY4A 1B2HA 4TLLB 3CFLA 3JYRA 5DEXB 5H8FB 4U22A 3WAEA 4FIMA 3RY3A 4PP0A 1SDXA 3D4GA 1VSOA 4JVDA 2CZHA 4LATA 2D3IA 4LP2B 2XWOA 5TU0A 1MH4A 4NF8A 2Q2CA 4YMBA 1JQFA 2ZZXA 3CSBA 5F1QA 4OETA 1N7WA 1ATGA 1LGBC 2JJKA 5CMCA 1SYHA 4H67A 1IMFA 2OLBA 3VVEA 3RNNA 1SW1A 4RYAA 4KXPA 1ZLQA 3MQ9A 1RYXA 3G3JA 3U72A 3EPEA 4DDDA 5I3SA 1VFEA 5ET5A 2XWIA 4H8JA 2XXRA 2R6GE 3IFAA 2RC7A 4G77A 1SI0A 4MLQA 1TFAA 3PUVE 4F18A 4QSEA 1TWYA 2VPNA 1B5IA 4HW8A 3O6GA 2GQ1A 1BKAA 4RA1A 1FW0A 1FBPA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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