2XXXA

Crystal structure of the gluk2 (glur6) d776k lbd dimer in complex with glutamate (p21 21 21)
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
SLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRKKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 2
publication title Conformational Flexibility of the Ligand-Binding Domain Dimer in Kainate Receptor Gating and Desensitization
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 80
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxxA02
1B51A 1BKAA 3FVGA 4Z7EA 3CFZA 4GFRA 4OTEA 4RPOA 4GRKA 1LBBA 1POY1 4KYSA 1B46A 1LB8A 2P0SA 1GR2A 2ZYOA 5I2KB 2FA7A 3WAFA 2IEEA 5A5XA 4OVJA 2YPNA 1CE2A 4QHQA 2O1MA 1QJMA 3K4UA 4NF6A 1B5HA 2DXYA 1FQCA 1D4NA 1POTA 3K1NA 1N7WA 1D9VA 3K1PA 1MM7A 3N26A 1NL5A 1ZLQA 2RCAA 3FGSA 3FXQA 3FJMA 5TU0A 4OZ9A 3TUSA 4FATA 5LOMA 4G8HA 2D5WA 4GF8A 5DVJA 3CRBA 4O3BA 1AIVA 3FZVA 1USYE 1N3XA 2OWTA 3VVDA 4F2QA 3CG3A 3V5AA 3V89B 1R1NA 4OWDA 1OLCA 5FHOA 3MVXA 4OEVA 4Z0IA 2REGA 5AA2B 3UIFA 3TCHA 5EYFA 4POXA 2OWSA 4RJZA 1SQYA 1ELJA 3OELA 4R6HA 4QRZA 5B70A 2YJPA 2GHAA 1OVTA 4GXSB 4H0WA 5AA3A 3FJGA 3FD3A 4PP0A 1Z7ME 2E1SA 2Q9TA 5L9MA 4IGTA 1IIWA 2VD3A 3H3GA 1AH5A 3KFMA 3W9WA 4H67A 5K2YA 4YB6A 2PYYA 5H8SA 3RY3A 1BTJA 2G93A 2D21A 3CIJA 1A7LA 1B58A 2QRYA 4KR5A 4L17A 2Q8JA 4EXKA 1M5CA 2H4IA 1Y1ZA 4YKIA 1NFTA 5AA4A 3UK4A 3G7WA 3QUJA 5ELVA 3W15C 1LFGA 3IOWA 1B4ZA 5I2KA 4LATA 1FTJA 4NF8A 3V8XB 3OENA 4HW8A 3FV1A 3TTNA 4P0IA 3H6UA 4NEDA 2Q2CA 4YB7A 1PC3A 4OHNA 3U1OA 2YLNA 2Z8EA 3M3KA 4XKPA 4XKQA 4Q8RA 1B7HA 1B9JA 4IO3A 1URSA 4X9TA 3E9XA 1NNKA 4POWA 3PGFA 2AYSA 2RC8A 3KN7A 3FVNA 3G3IA 1XOCA 1MXWA 5H8NB 4TOZA 1ZIUA 4I1DA 1SYHA 3LSWA 3TTKA 2HXWA 3JYRA 4P0GA 2GHBA 2F36A 4NF4A 1DSNA 1FTOA 3H6WA 1B2HA 4JSDA 1SDXA 1O7TA 2QSXA 3TPAA 3RGYA 1TFAA 2HCAA 1MQIA 2VP1A 3KEIA 4G4PA 2ALUA 3TZAA 4Q30B 1MY4A 3QK6A 2GH9A 1LCFA 2XD2A 5AA2D 4UA8A 4IB2A 1JQFA 3DM0A 3H06B 3BFUA 3JZJA 1IITA 1MS7A 1P1OA 1EZOA 1OQGA 5HM4B 1N7XA 2QS3A 1JW4A 3UP9A 3EHUA 3F11A 5KDTA 4OFOA 1B4HA 4GOTA 3VVFA 4U4SA 4F3PA 4ECFA 1JVYA 2RKMA 1IXCA 1WODA 3R6UA 3EQ1A 3SEWA 5DTBA 4OEUA 1TWYA 1MY1A 1QULA 3SEYA 4F39A 4QFLA 4HCYA 1US4A 3B6QA 5JTYB 3MP6A 2M8CA 3MAMA 3U72A 4XKNA 5BWJA 4R2BA 2I0CA 3PMWA 4KYDA 3FVOA 3PUZE 3TKDA 4MBPA 4OQOA 4IY5A 1LB9A 3CR9A 3UA8A 5ICTA 5H8QB 1IZ1A 4HCWA 2V3TA 4ESXA 3RTWB 1XVXA 2OK2A 3S4UA 3O66A 2XXUA 4ZEFA 2P2AA 3BKIB 4R9GA 2AL5A 2XX8A 5L9OA 2THIA 1RKMA 4ISUA 5BUUA 3O9PA 3FATA 1ANFA 4GVOA 1Y3PA 3TMGA 4WEDA 5CRYA 3RQTA 2HAUA 1II5A 1Z7NE 2Y7PA 3RLFE 5J1DA 3HV1A 2XXHA 4YKPA 1O63A 1UTBA 5I58A 4GWOA 3KJ7A 3R7XA 5A5XB 2XXRA 2FYIA 1OLAA 4ND9A 2V3QA 2A5SA 1GGGA 1P1QA 1B6HA 2O69A 2VGQA 2ZNTA 2ZYKA 3M3LA 4R9FA 4F1VA 3M3FA 1PEBA 3FXUA 4F1YA 1ZTYA 3CSGA 2X7QA 1LAHE 3HO7A 3MVYA 3TEPA 2XXWA 4OESA 3N5LA 2XXVA 2DYXA 4YU0A 4ELPA 3IORA 4X1BA 4DLDA 4HS7A 5AA1A 1VFEA 2Y84A 1TXFA 3ILUB 3U92A 4HTGA 1MXVA 1URGA 5AE4A 4AQ4A 1B0LA 3TELA 3QUFA 1MH4A 3GBAA 4X1DA 4WEPA 1S50A 4KQPA 2ZNSA 1MPCA 2UVGA 1Q35A 1M5EA 1SD3A 1B40A 2Y7IA 3E3KA 4I62A 3RNNA 3KOSA 2I4CA 3TAJA 1TFDA 4U23A 1A8EA 2F97A 4P11A 4RYAA 4BDNA 4R2FA 3KN8A 3Q25A 2P1SA 3H6VA 4FE8A 4KCDA 5F1QA 4H65A 5DYHA 4O3CA 5JEIA 1QUJA 1USYH 3FJ7A 5AA4B 5CMMA 3T66A 3MUQA 3TDJA 1UQWA 4XXUA 4R75A 5KCJA 3LBSA 3ZKKA 1LAGE 4NF5A 3S9MC 1Q1KA 3ZSFA 3ECRA 3VVEA 4ZECA 4GL0A 4NMYA 2O1LA 4NF8B 2F78A 1LBCA 4MLVA 3PU5A 4H8JA 2G29A 4ZEDA 4F29A 5M2VA 1PB9A 3H7MA 4YMAA 3Q28A 1UTHA 2IA4A 3SDFA 4I9DA 4EF1A 3HPIA 2WKYA 3IOUA 4YKJA 3IAZA 1EZPA 5CMBA 2HQ0A 1NNFA 3D4GA 3G3HA 2ZYMA 4R72A 4YKKA 3THIA 1H43A 4KHZE 4U1ZA 4NF4B 1RYXA 3VXCA 3K6WA 2V25A 1H76A 1MY3A 3CFXA 4PFYA 2LAOA 2H5YA 1Y3QA 4H5FA 2GFEA 2HFBA 4FEDA 4PFUA 4ZE9A 3IO4A 5F7VA 3PUVE 1AOVA 2UVIA 2ESNA 4DIGA 1EU8A 1DTZA 1I6QA 4JWYA 3DLNA 4U4XA 1B5JA 4ELQA 1AL3A 3KGCA 4IO7A 1BIYA 3MZBA 2V3UA 1B3LA 5H8HB 3CI8A 3ODBA 4IGRA 3FV2A 4PE5B 4QFOA 1R6ZA 1B7UA 3EPEA 1OIBA 5KDTB 3PMVA 3T22A 5CBRA 2F7BA 3PPOA 3S9EA 1MY2A 1MRPA 1SI1A 2D3IA 1LGBC 2ONRA 4H5GA 2Z23A 4LZ7A 2OZZA 1WDNA 1QUIA 1NMUA 3BFTA 1HSEA 3N6UA 1MXYA 2O7IA 1KWHA 3VLVA 4OERA 3SEUA 1T0KA 2UVHA 3N6TA 4EUOA 1B32A 1I6AA 1FTLA 3I6VA 3T9VA 3LSLA 5I57A 2DE4A 4GQOA 1MG1A 1D3KA 3U93A 4DXCA 4IO2A 1FCKA 3PPNA 4LQ5A 2X7PA 4G77A 4R74A 4RPNA 4QSCA 1IEJA 3L6GA 3C33A 4ZE8A 4ZZEA 3TCGA 4LZ8A 4THIA 2DE3A 2XD3A 3IB1A 5H8FA 4GIZA 4OMBA 1MQGA 4FORA 1O64A 1N04A 3QYTA 3VDFA 1UTBB 3BBRA 4DXUA 5I58B 3TODA 2VOZA 1L5TA 2ONKE 4OXVA 3O97A 1WVJA 4RXLA 4PETA 4GD5A 1H45A 5IAIA 4WKMA 4TLMB 5H8HA 1FQBA 4RK9A 2Q89A 3O28A 3OD7A 3K00A 1Y9UA 4LA9A 5JK4A 2F34A 4OYVA 4OFJA 3IB2A 2DSFA 5I84A 4GLIA 5I56A 1PB7A 3IOVA 4NE4A 3H4ZA 3MVWA 2H99A 2DE2A 1YTVA 4C1TA 3KJTA 4LP2B 1FTMA 2F5XA 4U1OA 1FQEA 2NUVA 4EXLA 5K2XA 2ABHA 3GBBA 2HZKA 5CMCA 3PUWE 4F3GA 4MF3A 3S2VA 1DPEA 4EQBA 1FW0A 3QIMA 1B3HA 3IR1A 2OBGA 4H6DA 3FASA 5ISUA 4ONYA 1QKAA 2E0SA 3S9NC 1GTKA 2W7YA 1N0TA 1IUDA 1JEVA 1LFIA 3HSTA 4ZEBA 1JEUA 3V83A 3TTMA 3SESA 4H8IA 1PBQA 1UIUA 2I0BA 1GVCA 4QFKA 4OFLA 1P1WA 3SEXA 3RT6B 1P1UA 5ITOA 1ZU0A 1IXIA 1YPNA 1QUKA 2UVJA 5KCJB 1MQDA 3OO6A 4NF5B 3IJOB 3VV5A 3WAEA 1LAFE 5DVIA 1IXHA 3ZKLA 3VFJA 3ONMA 1MXXA 5FTHA 5I59A 1ZKBA 2BJJX 3DP6A 1FQFA 3MW0A 1NH7A 2HEUA 4ZZAA 4ZEKA 1ATGA 1A8FA 3O29A 4TQUQ 3OEMA 2RC7A 4QSDA 1UTHB 2CMOA 4GXAA 3RPWA 3CG1A 2A5TA 4BDOA 1HSJA 3LUYA 4H1XA 3KSJA 5IKBA 1SW1A 3C36A 2QS2A 1DTGA 3KN3A 3PMXA 1SW2A 1EH3A 1LSTA 3SETA 3LSXA 3OMBA 1JW1A 1B7ZA 2GRVA 3UN6A 2DVCA 2B3BA 1US5A 1Y4CA 5CI5A 1CB6A 2XHDA 3C32A 3OO7A 4YAHX 3TYHA 4LONB 1TT1A 3LC8A 2OCUA 3OSRA 4DXBA 4O3AA 1LAXA 3N94A 4MLQA 2QJEA 3U94A 3SERA 1H3DA 2QMXA 3KG2A 3MP8A 3RUMA 2DS9A 3FUZA 4G8NA 3S9LC 4G68A 5CMKA 4X48A 4RA1A 3TFLA 3JV9A 2QMWA 2V93A 1DMBA 4AB5A 2ZYNA 3PUYE 3IX1A 1P99A 4U21A 1SYIA 4FIMA 4K3FA 3CSBA 1F9BA 3TTLA 3G3JA 1BLFA 3IOTA 4BDLA 4KPTA 4N6PA 2F6PA 5EHMA 4R73A 2Q88A 3I5OA 2DWAA 2NWJA 2XX9A 3EHSA 3OOAA 1ZJLA 2B65A 3KZGA 2O51A 5I57B 1PB8A 3IK6B 1IQ7A 2I6EA 4WXJA 2XXIA 1NNPA 2O68A 4E0XA 1QW0A 1M5DA 3DP8A 4QSEA 1I69A 4C0RA 5FTIA 3G3GA 4E0WA 1SW5A 3MJNA 1S9TA 4PQJA 4F31B 1N76A 2VHAA 3K1MA 5CM6A 5TPAA 4NWCA 3FVKA 3MPKA 1DPPA 3L6HA 3P7IA 3LR1A 4JXIA 3E13X 2F35A 1MM6A 5FHNA 2I3VA 3Q26A 4KFQA 5H8FB 3HHFA 3HCQA 4R6YA 4BLAA 2V84A 1MXZA 2UYFA 3PV0E 1SW4A 2XXPA 1JVXA 3HHGA 3KSXA 5DEXA 2ZXTA 3ZS6A 2HAVA 2XXYA 4IO4A 3C35A 4JWOA 1A55A 3AXFA 2UYEA 3K01A 2VD2A 4OETA 4DCYA 2I58A 2ZNUA 1B1XA 3SKPA 1MDQA 4TLLB 4ELRA 5TP9A 4JSOA 2H25A 1FTKA 1LCTA 4ZEIA 3T9UA 2DQVA 1GV8A 3G3KA 3TCFA 4QFNA 3GXAA 3UGWA 1A40A 3ILTB 2Q2AA 3O6IA 4N13A 4F19A 3IB0A 3MVZA 1JETA 5KZTA 2B3FA 4MFIA 4XKRA 2PBWA 3B6TA 3K02A 1LFHA 2PVUA 1P1NA 3C4MA 5I56B 3QAXA 1MQJA 3PPQA 3C9HA 4YICA 4ESWA 3MC2A 4LVQA 3EF7A 2F7AA 1MPDA 3PPRA 1I6BA 5I2NA 4EQ9A 3C31A 4IO5A 5DVFA 3RT8A 1MY0A 3W9VA 1Y3NA 3MPLA 3T93B 3MZ1A 4LZ5A 1Y4TA 1B3FA 1A54A 2DVZA 2PT1A 3H03A 3PUXE 1JNFA 3GLBA 3B7DA 3IO6A 2REJA 1M5FA 4UACA 1LLSA 1B3GA 3T9XB 2PMSA 3QSLA 4Q5TA 2I3WA 1ZBMA 2QPQA 3B6WA 4PFWA 4BDRA 1YCJA 4JWXA 4EF2A 1UIVA 4EDPA 3IJXB 2RF1A 2AL4A 4ZS9A 3M8UA 4I8CA 5I59B 4ELOA 3PPPA 3A09A 1FQDA 3A3UA 1NNTA 2O84X 1J1NA 1SVXB 3Q29A 4XTCQ 3HN0A 5HPQA 1SI0A 1NKXA 4U2RA 5AA2A 2OJTA 2UXAA 3MQ9A 4RY1A 1PDAA 5ICQA 3OXNA 1MPBA 1D9YA 2A5TB 5FHMA 4M1VA 2CZLA 2X26A 2ONSA 2Z8DA 3A3CA 1B52A 4Q0CA 4YB5A 2H9BA 4F1UA 2DWIA 3MBPA 5CC2A 4NTLA 4F18A 3E4RA 4IY6A 1S7YA 2XX7A 2HZLA 4G68C 3C34A 2Y7KA 3MZ9A 4F3BA 3UORA 1MH3A 3VLWA 3EHTA 4LQ2A 2Y7WA 1URDA 3K6VA 3TTRA 4C1UA 5ITPA 4FEBA 1N3WA 3OO9A 2QS4A 1H44A 3T9HB 3K6UA 4RNSA 1MDP1 4ZDMA 2XXQA 1OMPA 1XHYA 4FECA 4G68B 1VR5A 2O7UA 3FXRA 1AMFA 3USDA 2XXTA 1XVYA 3O2AA 1Y1MA 3OO8A 3TQLA 4LUBA 4JDFA 4BDMA 1OQHA 3I3VA 4QF9A 4EQ7A 4IO6A 3VE1B 5EHSA 1M5BA 4PFTA 4KCCA 3OEKA 3DELB 2Z8FA 1VSOA 4DDDA 2F8DA 2RINA 4MH5A 2F7CA 3EN3A 4G2ZA 4M4GA 1NH8A 3QXMA 4F2OA 1ZMGA 2F6GA 2QL3A 4U22A 1BP5A 5B7DA 1XT8A 4AB6A 1Y20A 5H8NA 2R9JA 4F3SA 2FNCA 3K6XA 2I48A 1RYOA 1IXGA 3SEVA 1N84A 3LSFB 2PX1A 1YAEA 2R6GE 3VXBA 3GZGA 1B05A 4DZ1A 5TPAB 2DWHA 1HSLA 2Z22A 3FIRA 4NF6B 2R71A 4DE8A 3PD8A 2DP8A 1R9LA 1VE4A 2AIXA 1MQHA 2XXXA 5L8DA 1DOTA 4GL8A 1B5IA 2DWJA 5DEXB 2ZMBA 2DXRA 4F22A 3KBRA 3DP4A 4DCXA 1QVSA 3G3FA 2QS1A 1JW5A 5HBCA 2RC9A 3K0VA 3RN8A 5TP9B 4OENA 2KLFA 4FJPA 1MXUA 1XC1A 2RCBA 5DT6A 2NVUB 3IL1B 3H6TA 4R6KA 4YMBA 3U8QA 5JTYA 2I49A 1A99A 3KOTA 3RTFB 1B3EA 4QFPA 2Y7RA 3TQWA 3O6GA 3K2DA 1B0HA 2DOJA 2OLBA 3PD9A 5L9SA 4KD5A 4FAJA 1SBPA 2O6AA 3CVGA 4XIGQ 4NWDA 1QKBA 2PT2A 1PBPA 4G8MA 4KI0E 4YZZA 3O6HA 2H98A 1OVBA 3OSQA 5CBSA 5H8QA 4N07A 1B1HA 4JBZA 1R9QA 1VFDA 3MP1A 4KYEA 3MWBA 5I2NB 1EZ9A 3T96B 4RK2A 1XS5A 2ANJA 4BDQA 3R26A 2NOOA 3D4CA 3VLUA 3CFLA 2I4BA 3Q27A 2NXOA 4JB7A 1FQAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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