2Y7IA

Structural basis for high arginine specificity in salmonella typhimurium periplasmic binding protein stm4351.
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
ASVSARTLHFGTSATYAPYEFVDADNKIVGFDIDVANAVCKEMQAECSFTNQSFDSLIPSLRFKKFDAVIAGMDMTPKREQQVSFSQPYYEGLSAVVVTRKGAYHTFADLKGKKVGLENGTTHQRYLQDKQQAITPVAYDSYLNAFTDLKNNRLEGVFGDVAAIGKWLKNNPDYAIMDERASDPDYYGKGLGIAVRKDNDALLQEINAALDKVKASPEYAQMQEKWFT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords STM4351
publication title Crystallographic and Microcalorimetric Analyses Reveal the Structural Basis for High Arginine Specificity in the Salmonella Enterica Serovar Typhimurium Periplasmic Binding Protein Stm4351.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica
molecule tags Arginine-binding protein
total genus 83
structure length 228
sequence length 228
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2y7iA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2y7iA02
1LFHA 4G77A 4DXBA 3DELB 5HM4B 2XXTA 2H9BA 2OK2A 3MQ9A 3I3VA 1MY4A 4ZEKA 3C36A 4ZEIA 4NF6B 2I4CA 2OCUA 2XXVA 3M3FA 2H98A 5ELVA 1O64A 3VVFA 3PPNA 4H0WA 1Y1ZA 3FUZA 3CVGA 2I3WA 1MDQA 1NNPA 3K1PA 4JBZA 4RNSA 2Q2AA 4I62A 2AIXA 4XKPA 1AOVA 1B4ZA 3WAFA 1B6HA 3TTNA 3VDFA 2GHAA 4KCDA 1T0KA 2Y7WA 4WEDA 3RPWA 3V89B 2I48A 3VVEA 3R26A 2O1MA 1Z7ME 2H4IA 1D9YA 2UYEA 3B6WA 2HZLA 5TU0A 4X48A 1A54A 3JV9A 3Q28A 2Y7IA 1JW5A 2P1SA 1IUDA 1D3KA 4H65A 3HSTA 4ONYA 3MP1A 5I56A 3S9MC 4JWXA 4OZ9A 4QHQA 1LAHE 3KFMA 3SETA 2THIA 1ELJA 5F7VA 4WEPA 2UVGA 3EPEA 5DTBA 2DE4A 4GLIA 5AA3A 4AB5A 1MQJA 3MVZA 1IXIA 2QPQA 2XX7A 3TQLA 1MQDA 1M5FA 1PEBA 4BDRA 1B0HA 3A09A 1EZ9A 3TMGA 3VLUA 4N6PA 3TFLA 4F3GA 3B7DA 2G29A 3DP4A 2QS3A 4TLLB 1Y4TA 5AA2A 1FQBA 1SW5A 3K1MA 4OWDA 1B1XA 4EUOA 1LSTA 2A5SA 2F35A 3FGSA 2Y7RA 5A5XB 5K2XA 3OOAA 2AL4A 3UP9A 3K4UA 2ZNSA 4M4GA 4FIMA 3KG2A 4O3CA 5B70A 3IOWA 2Y7KA 5LOMA 2HFBA 1QULA 5FTHA 4O3BA 4KD5A 4YB7A 1FQEA 1AL3A 4Q5TA 2QJEA 4RPNA 1NH7A 3FVGA 4F39A 1XS5A 3MUQA 1LGBC 1GVCA 3A3CA 1H45A 3PUYE 4FJPA 1JEVA 4PQJA 3IB2A 3S9LC 1PBPA 3E3KA 1SI1A 2GH9A 1N0TA 3TPAA 1B7HA 2HZKA 3SEXA 1LFIA 1M5EA 5H8NA 2UVJA 2ZXTA 5I2NB 3T22A 2I6EA 3Q27A 4F1VA 3USDA 1QKAA 3KN3A 2O7IA 1B05A 2V3TA 1N76A 4KQPA 1MPDA 4KYEA 4C1TA 3LSLA 4YKKA 2ALUA 4PP0A 3TCHA 2R9JA 1MRPA 3ZSFA 4JWOA 3R7XA 5H8QB 1QVSA 2ANJA 3RUMA 3ZKKA 1UTBA 4LP2B 4KFQA 4NTLA 1TT1A 4G68B 2XXXA 4YZZA 3LSWA 1UIVA 1A8EA 3MAMA 1P1OA 4H6DA 2Z8EA 1LAXA 1H43A 1OLCA 3L6HA 3UK4A 1II5A 3IL1B 3MWBA 4ZEDA 1IXHA 3CFXA 5K2YA 4EQBA 1M5DA 2X7QA 3OO7A 3MJNA 4HS7A 3LUYA 4OFLA 1MM6A 3JYRA 1OIBA 1YAEA 4NE4A 1Q35A 4QFKA 1FTLA 4MH5A 1JEUA 2OWSA 3IOTA 4IGRA 3ZKLA 5H8FA 4NF8A 4XKRA 5KCJA 3MP8A 5AA1A 1DTZA 2V84A 3K02A 1B5HA 3TAJA 1MQGA 1VFDA 3G3KA 1VE4A 3EQ1A 3QXMA 3K2DA 3M3KA 2HXWA 3PMWA 3VLVA 1B3HA 3O29A 2B65A 5BWJA 2O7UA 5H8HB 1B0LA 4AB6A 4RK9A 4P11A 4DCXA 1POTA 3K6WA 1RKMA 2P2AA 3OXNA 4O3AA 5DEXB 3SDFA 3C31A 2XXYA 4KPTA 4U23A 1R9QA 1MPBA 1A55A 3FJGA 3IJXB 2I58A 4YKJA 4GRKA 4E0WA 1D4NA 3DLNA 1BLFA 4JXIA 1B3GA 4NF6A 3V5AA 3KBRA 1N04A 1SW2A 1XVXA 3RNNA 3CFLA 2ZYNA 3Q26A 3MZ1A 3RTWB 1R6ZA 5DVIA 2DXYA 3H03A 1R1NA 1PBQA 1DPEA 3TELA 1FQCA 1MY0A 4QSDA 2Q89A 1SVXB 2Q9TA 2V25A 3T9VA 4POXA 1S9TA 1SYHA 4OFJA 2Q8JA 4AQ4A 4OHNA 5FTIA 3I6VA 4NF4B 1POY1 1GGGA 1USYH 3OO9A 1JVYA 4R74A 2ONRA 3MPKA 4KI0E 2DE2A 4JSDA 4NEDA 1SW1A 3V8XB 2ZYKA 3C33A 1OVTA 3UGWA 4OETA 2UVHA 5L8DA 3KOSA 2I4BA 3T93B 2DYXA 4IY6A 1MPCA 4PETA 2VHAA 2Y84A 4LONB 4F18A 4EF1A 1IIWA 1SD3A 3HHGA 4BDLA 3EF7A 1IQ7A 3CR9A 4ZEFA 1I6BA 4QSCA 4ECFA 4R9GA 4YMBA 2PX1A 4MFIA 3CFZA 3ZS6A 3PMVA 3Q29A 1B46A 1ZMGA 3K1NA 2I0BA 3LR1A 4F19A 5I58B 3KEIA 3D4CA 5IAIA 1PB8A 4ZZEA 1SYIA 4IO4A 1A40A 3A3UA 4HTGA 1JVXA 4XKQA 2DE3A 3AXFA 3GBAA 4PFWA 4WKMA 1FQFA 2O6AA 2V3UA 2PVUA 3UIFA 4LUBA 4DXCA 4JDFA 4YKPA 2M8CA 2H99A 4G8HA 3CI8A 1BKAA 1JQFA 1Q1KA 1LCTA 4N07A 3S2VA 4YMAA 4X1BA 1LAGE 4DE8A 2XXUA 2V93A 2F6PA 3DM0A 2H5YA 4OEUA 3PGFA 3TQWA 5I2NA 2O1LA 2XXRA 1UQWA 3FXRA 3FVKA 3C32A 4FORA 5TPAB 4KYSA 1US4A 1H76A 3IAZA 3RTFB 4NF5B 2CMOA 2Z23A 1N7WA 1USYE 3QAXA 4GF8A 1I6AA 2RF1A 5F1QA 3T66A 4HCYA 2OJTA 2ZMBA 2QS1A 1SW4A 2FA7A 4DCYA 5H8QA 3TKDA 3TTKA 2F36A 3HO7A 3FJMA 4R6KA 4THIA 4G68A 3OSQA 4XTCQ 1UTHA 2I0CA 3QIMA 1Y3PA 3SKPA 2F34A 4H8JA 5FHNA 4U22A 3H06B 2H25A 1RYOA 4ZZAA 5KZTA 1GV8A 3TODA 5JTYB 3SESA 3PU5A 3PPPA 1ZIUA 3G3GA 5CMKA 2E1SA 4ZE8A 3BFTA 3N6TA 4YB6A 4PE5B 1NL5A 3BBRA 4NWDA 3TCFA 3HV1A 2FYIA 3KZGA 1MH3A 3QYTA 5EHSA 5EYFA 5DYHA 2UYFA 1IXCA 4R75A 2OZZA 1L5TA 4ELRA 3W9VA 5HBCA 3GZGA 4EQ9A 1FW0A 2F78A 4L17A 4F2QA 4RXLA 2RCBA 3FIRA 3U8QA 1EU8A 4N13A 1LFGA 4MBPA 3QUJA 5CI5A 4NMYA 3FV2A 4C0RA 1VFEA 4YAHX 2XXIA 3CRBA 3KJTA 1A7LA 3OEKA 4DXUA 1LCFA 1PC3A 5H8HA 3VXBA 3IO4A 3CIJA 4IO5A 3G3HA 1Y3QA 3VVDA 2WKYA 5DEXA 2Y7PA 5I2KB 2NUVA 4ESXA 3T9XB 3C4MA 1SI0A 3OMBA 4QFOA 1UIUA 1O7TA 3C9HA 4ISUA 2F97A 2D5WA 3MVYA 3VFJA 2V3QA 3PUVE 3FD3A 1EZPA 5AA4B 3UN6A 3S4UA 3UA8A 1TXFA 4Z7EA 4LA9A 3KJ7A 3MZ9A 1LB9A 3IK6B 4GL8A 1AH5A 3RGYA 3Q25A 1YPNA 1LBBA 3N94A 2XXPA 4LQ2A 1IXGA 4OESA 3D4GA 2BJJX 2F7AA 4OYVA 1MG1A 1O63A 2LAOA 1YCJA 4TLMB 4R2FA 1TFDA 1SBPA 3KOTA 4NF4A 3TUSA 4OERA 4IO7A 4GXAA 2P0SA 1MY3A 5IKBA 4BDNA 2F6GA 4OFOA 4QFLA 3PD8A 3ILTB 2PYYA 1JW4A 4Z0IA 1QW0A 4FEDA 2QSXA 5CC2A 4U4SA 3KN8A 1ZU0A 1LBCA 2DWAA 5CBRA 4JB7A 1GR2A 3QK6A 4YU0A 2VOZA 1QJMA 3KGCA 4KR5A 2PT1A 3O66A 3H4ZA 3WAEA 1I6QA 2QRYA 2R71A 3O6IA 5B7DA 3GLBA 5AE4A 1JW1A 1FTMA 4IO2A 1XOCA 3KSXA 2QL3A 4U2RA 3THIA 3LBSA 3SEYA 1B9JA 3MC2A 2DWJA 1EZOA 3CG1A 1LB8A 3SEUA 1ANFA 3G7WA 5I58A 5I84A 5JEIA 4M1VA 2ONKE 1B4HA 3OENA 1GTKA 1KWHA 3GBBA 1RYXA 3IJOB 4RPOA 4F29A 3M3LA 1URGA 1WODA 4WXJA 3C35A 4KHZE 4MF3A 1Y3NA 1MXZA 3EHUA 3RLFE 2YLNA 2ZNTA 2Z8DA 3IB0A 1HSJA 2HAUA 3BFUA 5L9SA 2D3IA 3UORA 2DS9A 3N5LA 3KSJA 2D21A 2E0SA 4R2BA 4H5FA 4FAJA 4GWOA 3MPLA 3CG3A 1IZ1A 1DTGA 2DWHA 4NF5A 4MLVA 4HW8A 2ZYOA 5I57B 2YPNA 1B5IA 3FVOA 2OBGA 4FECA 1J1NA 2CZLA 1P1UA 1A8FA 1N3XA 3K01A 1US5A 4RK2A 1B52A 1SQYA 1ZBMA 4I1DA 3W15C 4ZEBA 4IGTA 1BTJA 4FEBA 2UXAA 3PPRA 1URSA 2PMSA 4ND9A 3H6WA 3K00A 2RC9A 1B40A 4LVQA 1MXYA 5H8SA 2Q88A 5EHMA 5JTYA 1HSEA 2O84X 2B3FA 2DSFA 2RKMA 3IOUA 4GFRA 3ECRA 2Q2CA 1NMUA 1FCKA 4ELQA 4H5GA 5ICQA 1DMBA 1FQDA 4TOZA 4EXLA 4EDPA 1VSOA 4GQOA 1TFAA 2GHBA 2XXHA 3PV0E 4JSOA 5J1DA 3MP6A 1NNKA 4I8CA 5A5XA 5H8FB 3G3IA 3P7IA 5KCJB 3G3FA 4ELOA 3RN8A 5KDTB 3FZVA 4IY5A 4C1UA 4OTEA 4LQ5A 4E0XA 1JNFA 3C34A 1JETA 2UVIA 3W9WA 4EXKA 2R6GE 1YTVA 2F7BA 5TP9B 4F2OA 4PFUA 3DP6A 3HPIA 3H6UA 3T9HB 2QS4A 3CSBA 1MDP1 2A5TB 2VGQA 3IR1A 5I2KA 3S9NC 4ZDMA 1FTOA 4HCWA 3LSXA 1P1WA 2O68A 4I9DA 4KCCA 3PUWE 3HN0A 4RJZA 5I59B 3FV1A 2FNCA 3OD7A 3N26A 2DQVA 5AA4A 4F3SA 1MXWA 3EN3A 1S7YA 3FJ7A 4QRZA 2XD3A 2F7CA 2DWIA 2XX8A 1P1QA 1B58A 1MXUA 1DPPA 5ISUA 1Y1MA 3N6UA 2NVUB 1EH3A 2VP1A 4R72A 5M2VA 1BP5A 3E13X 4QSEA 4F3PA 3HHFA 2W7YA 4IO6A 3FXUA 3F11A 3FASA 3TZAA 3E9XA 4XIGQ 2YJPA 3ILUB 2I49A 4JWYA 4QFPA 4H67A 2XD2A 1D9VA 2RC7A 4Q0CA 1OMPA 1M5BA 3VLWA 1B3FA 1QKBA 5DVJA 1DSNA 3H7MA 3VXCA 5ITOA 3OO6A 3MVXA 3EHTA 3V83A 4ZE9A 2OLBA 2X7PA 4UACA 5CRYA 1NFTA 1B32A 2X26A 4G8NA 4F1YA 4RY1A 2DP8A 2HCAA 3K6XA 2QS2A 3O2AA 2DXRA 4R73A 4U1ZA 1QUKA 1Z7NE 3EHSA 3H6VA 1B3LA 1MY2A 3T96B 2PBWA 2NWJA 3OEMA 1XC1A 1DOTA 2B3BA 4BDQA 2HAVA 3K0VA 3RT8A 2XXQA 4PFTA 3U1OA 1PB9A 1B1HA 1MQIA 3H3GA 3IO6A 3SEVA 1BIYA 1LAFE 3K6UA 5FHMA 3LSFB 1FTKA 4Q8RA 4ZS9A 4G68C 2Z22A 1P1NA 4BDMA 2Z8FA 4X1DA 3MVWA 1ZJLA 4XKNA 3O9PA 5L9OA 1H44A 1QUJA 3MW0A 4ZECA 3ODBA 4EQ7A 3SERA 1N3WA 4ELPA 4ESWA 4POWA 1XT8A 4U4XA 3PPQA 1OLAA 1CE2A 3MZBA 3GXAA 5FHOA 4F3BA 2O51A 3IOVA 4GD5A 5I57A 2IA4A 3PPOA 4OEVA 4DLDA 4R6HA 3CSGA 1M5CA 4RYAA 5I56B 1ZKBA 1ZTYA 2OWTA 4GVOA 4R9FA 1VR5A 1B7ZA 3MBPA 2REJA 4H8IA 1N84A 1UTHB 4OMBA 4LZ5A 3TTLA 1H3DA 2HEUA 1MXXA 1R9LA 1B3EA 1NH8A 1XVYA 3PD9A 4DDDA 3OO8A 2VD2A 4LZ7A 3RQTA 3TCGA 3TYHA 1WVJA 3FXQA 4P0IA 3SEWA 1QUIA 2NOOA 4LZ8A 1B51A 3PUZE 1TWYA 5AA2B 1FQAA 5HPQA 2IEEA 4QF9A 1MM7A 5CMMA 5AA2D 3OELA 2XXWA 3FVNA 4FATA 1Y20A 4OXVA 1B7UA 4U1OA 3K6VA 5BUUA 2XX9A 2ONSA 1B5JA 2VD3A 4K3FA 1PB7A 3U93A 5JK4A 5KDTA 4TQUQ 2RINA 5L9MA 4BLAA 1Y9UA 2GFEA 3BKIB 1FTJA 5CM6A 4KYDA 1N7XA 5TP9A 4H1XA 2G93A 3PMXA 5CMBA 5CMCA 3TEPA 1ATGA 3S9EA 2HQ0A 4IB2A 3OSRA 3QUFA 3KN7A 3H6TA 1AIVA 3VV5A 2A5TA 4R6YA 4RA1A 2KLFA 3IORA 4PFYA 3PUXE 2XHDA 3FATA 5I59A 1WDNA 4GOTA 4F1UA 4YB5A 1SDXA 4GL0A 2AL5A 4BDOA 1NNFA 4IO3A 3L6GA 5H8NB 2ZYMA 4NWCA 1NKXA 5TPAA 2DVCA 3R6UA 3TDJA 1HSLA 1S50A 3E4RA 3B6QA 4U21A 1LLSA 1MY1A 1F9BA 3IX1A 4MLQA 3RT6B 2DOJA 3G3JA 2F8DA 4F22A 3M8UA 1MQHA 1MH4A 1OQHA 4P0GA 2F5XA 3DP8A 4OVJA 1OQGA 1ZLQA 4FE8A 1UTBB 3HCQA 5ICTA 2ABHA 1PDAA 1OVBA 1IEJA 1IITA 5DVFA 1A99A 3I5OA 2O69A 4X9TA 2DVZA 1AMFA 2QMWA 4F31B 1CB6A 4YKIA 1NNTA 4DZ1A 5CBSA 3TTRA 5DT6A 4Q30B 2I3VA 1I69A 3LC8A 1P99A 3O28A 1MXVA 2REGA 3VE1B 4YICA 1B2HA 5ITPA 3QSLA 3JZJA 2NXOA 2ZNUA 1Y4CA 4EF2A 3B6TA 3TTMA 1XHYA 4G2ZA 2GRVA 3O6HA 4XXUA 4OENA 4NF8B 4UA8A 2PT2A 4GXSB 4QFNA 4G8MA 2QMXA 3IB1A 3O97A 4G4PA 2RCAA 4GIZA 3ONMA 4OQOA 4LATA 4DIGA 3O6GA 3RY3A 3T9UA 2AYSA 2ESNA 3U94A 3U72A 3U92A 2RC8A 1URDA 1MS7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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