2Y8PA

Crystal structure of an outer membrane-anchored endolytic peptidoglycan lytic transglycosylase (mlte) from escherichia coli
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
190
structure length
190
Chain Sequence
KHDYTNPPWNAKVPVQRAMQWMPISQKAGAAWGVDPQLITAIIAIESGGNPNAVSKSNAIGLMQLKASTSGRDVYRRMGWSGEPTTSELKNPERNISMGAAYLNILETGPLAGIEDPKVLQYALVVSYANGAGALLRTFSSDRKKAISKINDLDADEFLEHVARNHPAPQAPRYIYKLEQALDAMLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
publication title High-Resolution Crystal Structure of Mlte, an Outer Membrane-Anchored Endolytic Peptidoglycan Lytic Transglycosylase from Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-TYPE MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE A
total genus 63
structure length 190
sequence length 190
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.2.n2: Peptidoglycan lytic endotransglycosylase.
pdb deposition date 2011-02-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2y8pA00
194LA 1WTMA 1LPIA 3LN2A 4WOAA 1JKBA 4LZTA 1NKHA 4PGJB 3W3EA 2HEAA 4WM1A 1IWUA 4W96A 153LA 1I56A 1HEOA 3F6ZA 5KXOA 5LVJA 2HEEA 1ALCA 4HSFA 2HU3A 4XN6A 1VAUA 5KXNA 1GBWA 3TXGA 1LSFA 1GF7A 1RI8B 1NF5A 1JPOA 2ZILA 1IWVA 1JJ1A 4QY9A 1OUAA 1T6VL 4ML7A 1FLYA 1WQQA 4J1BA 1DKJA 1KXXA 1MELL 1TCYA 1LJ4A 2Z2FA 3RT5X 1XGPC 5B06A 5HLLA 1B7PA 2BQJA 5LVGA 2BQGA 2Z12A 4H9BA 1LOZA 1LZGA 1LZAA 3M18B 4A7DA 1QSWA 2BLXA 3TMUA 1XEIA 2LYMA 5A3ZA 2BQEA 5I5QA 4G4CA 1LZYA 4HTQA 3EXDA 3WXUA 6LYZA 1D0LA 1REZA 2XTHA 2YVBA 2ZNXY 1C43A 4ZFPA 5IHGA 4TSBA 1LJNA 3P68A 3TMXA 5I4XA 1B7MA 1LHLA 1LKSA 2DQJY 3A67Y 4HP0A 3LYTA 5LVKA 1PZYA 1GE1A 1HSWA 2Q0MX 4MR1A 5FEKA 2Z39A 4ETDA 1JKDA 4H92A 4NGYA 5KY1A 5KXSA 5FCPA 5FHWA 8LYZA 4UWNA 2MEBA 4LT0A 3WW6A 4B4EA 2YBJA 2EIZC 3QE8A 5DN4A 2HEFA 5K7OA 4II8A 1GFGA 4LYBA 1LHIA 4WLXA 1C46A 1P2CC 1JJ3A 4OWAA 1LZSA 4YEOA 3D9AC 3ULRA 5KXRA 1IEEA 1QDTA 4O34A 3B6LA 3TMWA 1WQNA 2GV0A 3A94A 3CT0A 5LINA 1OUGA 5M1YA 1BWHA 3LZ2A 1SLYA 2H9KA 4DDCA 2Z38A 5HNCA 1GB8A 1HF4A 3A91A 4ETEA 4PJ2C 1IR7A 1EQ4A 4DWXA 1LJFA 2BQNA 1C08C 4WMGA 3W6FA 1XEJA 1LSDA 1DKKA 3WVYA 3ZVQA 5LA5A 2BQKA 4U3XB 3EO5A 1IOQA 1IVMA 3ATOA 1XSFA 1GFKA 1WTNA 3RNXA 1T3PA 1REXA 2D6BA 1B0DA 1WQRA 2ZIJA 3TXHA 4TTDA 4J1AA 5L9JA 1YAMA 2YSSC 4HTNA 1INUA 3W6CA 2BQHA 2AUBA 1LZ5A 1GF0A 1RFPA 1LZCA 2RSCA 3J6KA 2DBTA 1NBYC 5LAFA 2D4KA 1F10A 5EBHA 1LSZA 2BQOA 3CSZA 4LYMA 1UIDA 9LYZA 1WQMA 1LSMA 2C8PA 2D4IA 4FJRA 1GAYA 1LAAA 4HPIA 3WULA 4DD7A 1F6SA 4TX7A 3FI7A 3TXDA 134LA 4WO6A 1B7RA 3WYHA 1YL1X 5KXXA 4EMNA 3A95A 1GB6A 2XBRA 4H9HA 1JTPL 1IOSA 2W1YA 4NGZA 1CKHA 1AKIA 1GF3A 3P64A 1GBSA 5LIOA 5C6IA 1AT5A 1UIBA 5KJ9A 5F16A 4PRQA 2DKVA 1LMQA 1LSBA 2Z37A 2ZIKA 4M4OA 1UIHA 1GB3A 1YANA 1IC4Y 4CFOA 4I0CA 1LMAA 4H8ZA 3HBHA 5DM9A 2A7DA 1GD6A 1LZRA 1HHLA 2G4NA 1GB5A 2F30A 4AGAA 2EPEA 4HJVA 1CNSA 1GFVA 2F4AA 4C3WA 2HEDA 2HUBA 5LVHA 1B5YA 3GXKA 1H87A 1LZNA 4NGWA 5F81A 2DQDY 1LZ6A 1GB2A 2I26L 1IR9A 1DI4A 1RCMA 1GFJA 4OWBA 4CFPA 4KL7A 3TXKA 4HV2A 1VDPA 1HMLA 4LFXA 1IO5A 3B0KA 1YKYX 4LYCA 1LMOA 1LZDA 3AZ6A 1WQPA 5HMJA 3WL2A 1G7HC 4LYOA 135LA 4B0DA 3LYMA 1JTTL 1DI3A 1RJCB 5LAGA 4NSJA 1NMMA 1B5WA 1VDTA 3IJUA 1JKCA 4LYZA 1GFRA 3G3BB 1OUFA 1HFXA 2I6ZA 1GFUA 1IP6A 4NWHA 1B7QA 2F2NA 3WUNA 1D6PA 3WVXA 4TSCA 1FN5A 1HFZA 1FBIX 4Z98A 1B7OA 4PPOA 4H90A 1RE2A 4E3UA 1XGQC 2D4JA 1LMNA 5E9RA 4DD9A 1DPXA 5HQ1A 5KXYA 1QTEA 3QNGA 1VATA 2ZQ3A 1B7SA 4GCBA 2MEIA 4BAPA 4WO9A 3AZ5A 3TXEA 1DQJC 2F4GA 2FBBA 1LJJA 1WVUA 4NEBA 5KKIA 4DT3A 4N5RA 4CGEA 1DI5A 4J0LA 4MCKA 1LHKA 4NGIA 2YBLA 1BHZA 2PC2A 3AZ7A 4GLAA 4DD1A 3WXTA 1W08A 1LCNA 2YBNA 3WPJA 2LHMA 1CKCA 1AZFA 1EL1A 1TDYA 2YBMA 1IOCA 1QUSA 4OWCA 4NY5A 1IP4A 1GFAA 3AYQA 4WLDA 5HNLA 1IWZA 2NWDX 4GN5C 4P2EA 1UCOA 3D3DA 4NGLA 4NGOA 2LYOA 1TBYA 4WLTA 3WMKA 4XJGA 4XJBA 4ZIXA 1G7IC 3B72A 1PS5A 2Y8PA 1HENA 1GB9A 4OW1A 4PHIA 1E8LA 4WM3A 1HEWA 1OUDA 3WW5A 1HSXA 1SQ2L 4DD0A 1A2YC 2A7FA 1HFYA 1CJ6A 1GF8A 1GWDA 5JENB 1GB0A 1XEKA 4OWEA 1GBOA 4IJ4A 1LJHA 4ETBA 3A90A 4N1CC 3AB6A 1HC0A 4N1EI 1D9UA 1B5UA 1IX0A 3N9AA 3TXIA 2FBDA 1QUTA 5F9UA 4XJIA 4B49A 4WL7A 1B2KA 1QDRA 1HERA 2HEBA 5B07A 5KXMA 2B5ZA 4UWUA 4B4IA 4CHXA 132LA 1JTOL 1O23A 4NFVA 4HJYA 4ETCA 1NBZC 2HECA 2MECA 4GLVA 3CSRA 1I20A 2H9JA 4RW2A 1GE3A 3W6AA 3VWOA 2MEEA 2X0AA 1MLCE 1FKVA 3A3QA 4NGJA 3WUMA 4UWVA 1GE2A 1BB3A 1B5ZA 4LT1A 1LZEA 1J1PY 1LZ8A 2FYDA 4B4JA 1ZV5L 4L41A 1XGUC 4WM6A 3WH1A 4KPMA 1JITA 3B0OA 3BKVA 3CQLA 1GAZA 4GCFA 4R0FA 2N5ZA 2FYCA 3G3AB 5KKJA 5II3A 1OUCA 1LJEA 3A96A 3LYZA 5KXKA 4NHQA 3A92A 3TXFA 4J7VA 1DXJA 2HTXA 1IC7Y 2W1MA 4EOFA 3B0IA 3GXRA 1GXV2 1D6QA 4C5FA 3CB7A 1IORA 207LA 1OUBA 1UA6Y 3CSQA 3N9CA 1EQ5A 2CWIA 3KAMA 2W1XA 1LJGA 4H9AA 1LSEA 4N9RA 3WUAA 3ZEKA 2W1LA 3J4GA 3OK0A 1GFHA 3W6BA 1AM7A 1LJ3A 2XBSA 2ZYPA 3ATNA 2MEHA 4XENA 1LHJA 1BVXA 1KXYA 3AGIA 4G4BA 3CT1A 5L3HA 1UBZA 2LZ2A 3A3RX 4G49A 1GF6A 4NHIA 4ANRA 4D9ZA 1VFBC 3T6UA 1LKRA 3OJPA 2YDGA 1D0KA 2BQMA 1OUIA 2DQHY 3LYOA 4IATA 5A3EA 4HPEA 1BWJA 4RW1A 4NSIA 2BLYA 1LYSA 6LYTA 1IP7A 1VDQA 2G4PA 5FDJA 2MEGA 5C6LA 1KIQC 2DQEY 1GBXA 1H6MA 5LVIA 4ET9A 4M6DA 2YBIA 1VEDA 1OUEA 4ZEEA 1LJKA 2CJLA 3AGHA 1UIGA 1LZ4A 1UUZC 4QEQA 1NWGA 1BB4A 2C8OA 1FDLY 4BS7A 4ETAA 1LSYA 1IOTA 1VDSA 1NQIA 3A6CY 1GBYA 4OOTA 4HJZA 4X3BA 5F14A 3N9EA 1XGRC 4NG1A 1GE0A 3A34A 1HNLA 1OUJA 4G4HA 4NSGA 1J1OY 1OP9B 1BWIA 1CKGA 4G9SA 4OWHA 5LYZA 5C6JA 1JUGA 1CJ8A 3BKHA 1LZTA 208LA 5DLAA 1LMTA 1JSFA 1F0WA 4H9IA 1QIOA 4LYTA 1LYYA 1LYOA 5KXPA 1GDWA 4NSHA 1IY3A 1C45A 1JEFA 4OOOA 1LZ1A 2IHLA 1ZVYB 3TMVA 5I4WA 2BQCA 4GCEA 1JISA 1AT6A 4NHTA 2MEFA 4KT3A 1JJ0A 1GEVA 1JSEA 1LZBA 4DYGA 2ZNWY 1B5VA 4CJ2A 2BQDA 5I4YA 1BB7A 1FLUA 1GPQC 4RLMA 5D5FA 1FLQA 3WU9A 1LSAA 1WVVA 4GCDA 4WG1A 1B7LA 1GDXA 4HV1A 4KXIA 4DDAA 5F9XA 2LYZA 1LTMA 4YM8A 1IWWA 133LA 1B5XA 1JKAA 1JIYA 1GFTA 1KIPC 1QSAA 1ZMYL 2I25L 2MEAA 3AJNA 1JWRA 4HTKA 4PRUA 4WM5A 3AW6A 4H9CA 1KIRC 5APDA 3WPLA 4QDNA 4WM2A 1REYA 3SP3A 1GFEA 1GEZA 1WQOA 3HBEX 4NIJA 4XADA 1NDMC 3WPKA 1HEQA 1LHMA 1IWXA 2BQLA 5I54A 1ZVHL 4DD2A 2Z18A 1LJIA 1G7JC 1C7PA 1TAYA 1LSPA 3A93A 4TUNA 3IJVA 3P66A 5DN5A 2BQAA 4DDBA 1YKZX 4YF2A 5D5CA 2MEDA 2CDSA 2EQLA 154LA 2CGIA 4DD3A 1UIFA 3HFMY 4H8XA 1HMKA 2BPUA 4NG8A 3EBAB 4NGVA 1B7NA 3AZ4A 5KXLA 1GB7A 4H8YA 1LHHA 4LGKA 3EMSA 1BVKC 1UIEA 5AMYA 2DQIY 1HEMA 4LFPA 7LYZA 5DL9A 1I1ZA 3ZVQB 1YL0X 2ZYCA 1IWYA 1J1XY 1C10A 4FDYA 5B59A 1GF4A 1IP5A 1GHLA 2EKSC 5I53A 1EQEA 1IR8A 1REMA 5J7CA 4MSTA 2DQCY 5LYMA 1QTKA 4N8ZA 4WLYA 5ILCA 5ILFA 5KXZA 2LZTA 4YEMA 1NDGC 5HMVA 5KXTA 4NHSA 1CKFA 2ZQ4A 193LA 1KXWA 5LYTA 3WU7A 1G7MC 3LHMA 4H1PA 1YAQA 5APCA 1UICA 1GF9A 5B05A 5FSTA 4XYYA 4WL6A 1IP2A 3P65A 1GBZA 5B1FA 4RDSA 3RU5A 1IWTA 5E4PA 4Z3MA 4H9FA 2BQBA 2DQAA 1DZBX 5LA8A 3W6DA 1HEPA 1CKDA 4H94A 4Z41A 4IASA 1UC0A 4XJHA 3HBDA 1XFPL 3TXJA 4I8SA 4DC4A 1GF5A 2HU1A 2Z19A 2DQFC 4H93A 4BAFA 2BAAA 1BB5A 1UACY 1LSCA 1YILA 3RW8A 1YAOA 3MGWA 1YKXX 5APFA 1G7LC 2D91A 4BADA 3TXBA 2BQFA 1CJ7A 3P4ZA 4RLNA 3WU8A 2H5ZA 1IP1A 1YQVY 2ZWBA 4YOPA 4TWSA 3IWRA 3M3UA 4LT2A 1LSNA 4LT3A 4H91A 1LMPA 1LMCA 3FE0A 1LZ9A 2VB1A 1NHEA 5KXWA 5L3IA 2DQGY 1FKQA 3LZTA 3QY4A 4ET8A 1QQYA 1OUHA 4XJDA 1IY4A 1IIZA 1GE4A 1TEWA 4WM4A 3W6EA 4B1AA 4NGKA 2BQIA 5B1GA 1A4VA 4N0JA 4Z46A 4NWEA 1N4FA 5IELA 3RZ4A 1IC5Y 2WARA 1CJ9A 5LXWA 1YAPA 4YENA 1OQMA 1IP3A 3CT5A 1V7TA 1BB6A 2YBHA 1XGTC 1D0MA 1BQLY 4GCCA 1YIKA 5APEA 1JHLA 3T36A 1LSGA 4XJFA 1Z55A 1B9OA 3A8ZA 3AW7A 3A6BY 5IDDA 4AXTA 1W6ZA 4QGZA 4WG7A 1GXXA 4GN4A 1YROA 4H9EA 1FLWA 1DPWA 2XJWA 2Z2EA 4NHPA 1F6RA 2IFFY 1HELA 4R6CA 2G4QA 3K3TA 4W94A 1V7SA 1UIAA 5T3FA 1BGIA 5FELA 3E3DA 3AGGG 1LYZA 4GN3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1D3JA 1WTMA 3LN2A 1QTZA 4PGJB 2HEAA 1IWUA 153LA 1I56A 1HEOA 3F6ZA 1ZURA 1JTNA 4W59A 2HU3A 128LA 5KXNA 4I7LA 4I7JA 1L30A 2ZILA 1C6FA 251LA 4PK0A 1CU3A 1OUAA 259LA 1FLYA 1WQQA 6LZMA 1DKJA 2Z2FA 2B6YA 5B06A 5HLLA 2Z12A 1L20A 3M18B 1QSWA 1XEIA 2BQEA 5I5QA 1L37A 1LZYA 4G4CA 6LYZA 1REZA 5IHGA 1B7MA 224LA 2DQJY 3A67Y 4ARPA 3LYTA 5LVKA 201LA 4NGYA 5KY1A 4LDEA 152LA 3WW6A 4LT0A 1L88A 5DN4A 3QE8A 4LYBA 3GUPA 5KXRA 213LA 3B6LA 4I7MA 248LA 3TMWA 1OUGA 2O7AA 1SLYA 1L49A 1GB8A 4DWXA 1PQMA 1DYCA 2BQNA 3HDFA 2BQKA 4U3XB 1L23A 1T3PA 2RBOA 1WQRA 3DMVA 3TXHA 4TTDA 5L9JA 2YSSC 1INUA 2BQHA 2RSCA 1NBYC 4EXMA 2D4KA 1LSZA 1QSQA 4HPIA 1LSMA 2C8PA 2NTHA 3HH6A 1C6NA 3WYHA 141LA 4EMNA 1GB6A 261LA 2XBRA 1IOSA 1L63A 1L03A 2F2QA 1CKHA 1L58A 5LIOA 5C6IA 1UIBA 2Z37A 4M4OA 4I0CA 3SBAA 1L94A 2L78A 3HBHA 4H8ZA 4AGAA 4C3WA 1CNSA 1GFVA 1C62A 2HUBA 1P64A 1LZNA 2LCBA 1CU5A 4OWBA 3TXKA 4LFXA 1LMOA 4W58A 4EPIA 4B0DA 1C6EA 1QT5A 3LYMA 1OVKA 3G3BB 2B74A 1B7QA 220LA 4Z98A 2D4JA 1LMNA 5E9RA 3HU8A 1QTEA 1LYDA 2ZQ3A 2MEIA 4WO9A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 194L A;  1WTM A;  1LPI A;  3LN2 A;  4WOA A;  1JKB A;  4LZT A;  1NKH A;  4PGJ B;  3W3E A;  2HEA A;  4WM1 A;  1IWU A;  4W96 A;  153L A;  1I56 A;  1HEO A;  3F6Z A;  5KXO A;  5LVJ A;  2HEE A;  1ALC A;  4HSF A;  2HU3 A;  4XN6 A;  1VAU A;  5KXN A;  1GBW A;  3TXG A;  1LSF A;  1GF7 A;  1RI8 B;  1NF5 A;  1JPO A;  2ZIL A;  1IWV A;  1JJ1 A;  4QY9 A;  1OUA A;  1T6V L;  4ML7 A;  1FLY A;  1WQQ A;  4J1B A;  1DKJ A;  1KXX A;  1MEL L;  1TCY A;  1LJ4 A;  2Z2F A;  3RT5 X;  1XGP C;  5B06 A;  5HLL A;  1B7P A;  2BQJ A;  5LVG A;  2BQG A;  2Z12 A;  4H9B A;  1LOZ A;  1LZG A;  1LZA A;  3M18 B;  4A7D A;  1QSW A;  2BLX A;  3TMU A;  1XEI A;  2LYM A;  5A3Z A;  2BQE A;  5I5Q A;  4G4C A;  1LZY A;  4HTQ A;  3EXD A;  3WXU A;  6LYZ A;  1D0L A;  1REZ A;  2XTH A;  2YVB A;  2ZNX Y;  1C43 A;  4ZFP A;  5IHG A;  4TSB A;  1LJN A;  3P68 A;  3TMX A;  5I4X A;  1B7M A;  1LHL A;  1LKS A;  2DQJ Y;  3A67 Y;  4HP0 A;  3LYT A;  5LVK A;  1PZY A;  1GE1 A;  1HSW A;  2Q0M X;  4MR1 A;  5FEK A;  2Z39 A;  4ETD A;  1JKD A;  4H92 A;  4NGY A;  5KY1 A; 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 1IWT A;  5E4P A;  4Z3M A;  4H9F A;  2BQB A;  2DQA A;  1DZB X;  5LA8 A;  3W6D A;  1HEP A;  1CKD A;  4H94 A;  4Z41 A;  4IAS A;  1UC0 A;  4XJH A;  3HBD A;  1XFP L;  3TXJ A;  4I8S A;  4DC4 A;  1GF5 A;  2HU1 A;  2Z19 A;  2DQF C;  4H93 A;  4BAF A;  2BAA A;  1BB5 A;  1UAC Y;  1LSC A;  1YIL A;  3RW8 A;  1YAO A;  3MGW A;  1YKX X;  5APF A;  1G7L C;  2D91 A;  4BAD A;  3TXB A;  2BQF A;  1CJ7 A;  3P4Z A;  4RLN A;  3WU8 A;  2H5Z A;  1IP1 A;  1YQV Y;  2ZWB A;  4YOP A;  4TWS A;  3IWR A;  3M3U A;  4LT2 A;  1LSN A;  4LT3 A;  4H91 A;  1LMP A;  1LMC A;  3FE0 A;  1LZ9 A;  2VB1 A;  1NHE A;  5KXW A;  5L3I A;  2DQG Y;  1FKQ A;  3LZT A;  3QY4 A;  4ET8 A;  1QQY A;  1OUH A;  4XJD A;  1IY4 A;  1IIZ A;  1GE4 A;  1TEW A;  4WM4 A;  3W6E A;  4B1A A;  4NGK A;  2BQI A;  5B1G A;  1A4V A;  4N0J A;  4Z46 A;  4NWE A;  1N4F A;  5IEL A;  3RZ4 A;  1IC5 Y;  2WAR A;  1CJ9 A;  5LXW A;  1YAP A;  4YEN A;  1OQM A;  1IP3 A;  3CT5 A;  1V7T A;  1BB6 A;  2YBH A;  1XGT C;  1D0M A;  1BQL Y;  4GCC A;  1YIK A;  5APE A;  1JHL A;  3T36 A;  1LSG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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