The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
82
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structure length |
82
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Chain Sequence |
GSYPTDCSIVSFLARLGCSSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKGILDHRQLHEFSSPSHLLRTPSS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural Basis of P63Alpha Sam Domain Mutants Involved in Aec Syndrome.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
TUMOR PROTEIN 63
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| molecule tags |
Apoptosis
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
21
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| structure length |
82
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| sequence length |
82
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-02-16 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QB0 B; 1LKY A; 3BS5 A; 3IDW A; 4RQM A; 1DXS A; 1SGG A; 3TAC B; 2K60 A; 2KMD A; 3KKA A; 4PZO A; 1UQV A; 2B6G A; 3BQ7 A; 3KKA C; 2EAN A; 3TAD A; 2K4P A; 1F0M A; 2KG5 A; 2KSO A; 1WWV A; 1Z1V A; 4MHV A; 1X9X A; 3TAD C; 2DKZ A; 5F3X B; 5L1M A; 1X40 A; 2KIV A; 5JRT A; 1WWU A; 3H8M A; 2EAO A; 2QAR B; 2JV3 A; 2EAM A; 2EAP A; 1SV0 A; 1V38 A; 1PK1 A; 2F44 A; 5JTI A; 2DL0 A; 4NJ8 A; 1OW5 A; 4RQN A; 1SV0 C; 5J8Y A; 2FE9 A; 1RG6 A; 2D3D A; 2DKX A; 2E8N A; 2KSO B; 2ESE A; 2QB0 A; 4PZN A; 2QKQ A; 5J8Y C; 3SEN A; 2F3N A; 2Y9T A; 5JU5 A; 1LKY B; 1X66 A; 3BS5 B; 1COK A; 2F8K A; 5KNI A; 1SXD A; 3SEI A; 2LPE A; 2KE7 A; 1PK3 A; 1B0X A; 2Y9U A; 4NL9 C; 2L5Y A; 1SXE A; 3K1R B; 1OXJ A; 2QB1 A; 2ES6 A; 2QAR A; 1SV4 A; 1B4F A; 1UCV A; 1V85 A; 2E8M A; 2E8O A; 1JI7 A; 2YTU A; 1KW4 A; 2GLE A; 1PK1 B; 2LMR A; 4NL9 A; 2E8P A; 3HIL A; 2D8C A; 3BS7 A; 4IS7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3H0L B; 3EWA A; 4LJX A; 4J9S A; 5EE3 A; 3K75 D; 5ALH A; 2ZJ5 A; 3TQ1 A; 2BCS A; 2ZTE A; 4Y2S A; 4PZO A; 5KTQ A; 2DQN B; 5KFV A; 2ZIX A; 3KKA C; 5DLF A; 4BXO B; 3MBY A; 1SKS A; 1PVR A; 2C2R A; 1LVH A; 4UB4 A; 4BJQ A; 5AM3 A; 2HHQ A; 5TZV A; 5KG1 A; 1BNO A; 1KRP A; 2QAR B; 2E1E A; 4UQG A; 4WJ3 B; 2P6U A; 2G07 A; 5HHI A; 3AEV A; 4RQN A; 2W9C B; 4XUS A; 3CNH A; 1D8Y A; 3HKZ C; 3NRZ A; 4B9M A; 2F2A B; 1RXV A; 2HBJ A; 5J2D A; 3N4M B; 1ZQQ A; 1HJP A; 3KTQ A; 1NK6 A; 2EH9 A; 2XCA A; 2HBK A; 2YY6 A; 3B0X A; 4Y2X A; 1SL2 A; 3RAX A; 4CDG A; 1FO4 A; 4I2J A; 5KFE A; 4IRK A; 2QB1 A; 4NM1 A; 1A76 A; 2NYV A; 2JRZ A; 1QQ6 A; 4FZM A; 3DEE A; 9ICQ A; 9ICI A; 3C5F A; 2EZX A; 5HML A; 4KMU A; 4YFK A; 2D8C A; 2KVS A; 3UXO A; 4QZC A; 1N5X A; 5KT4 A; 1FEZ A; 3CYM A; 4Y2V A; 1TV9 A; 2C22 A; 4UB1 A; 3PW4 A; 3PW7 A; 3MAB A; 4M6W B; 1Z1B A; 5KT7 A; 3PST A; 4RU9 A; 4FZN A; 1QQ5 A; 8ICI A; 1ZQZ A; 1ECW A; 4FBT A; 4AYB C; 5J0T A; 2OM6 A; 1ZQT A; 5AM4 A; 8ICB A; 1S76 D; 2KHQ A; 3B0Y A; 4EX6 A; 5DQI A; 4UB3 A; 4EX7 A; 2LKY A; 5KFL A; 4GXK A; 2ASD A; 1ZQI A; 4ED8 A; 5J0W A; 1BPY A; 1Z4N A; 1D8B A; 1XSL A; 2H3Q A; 3SV3 A; 4JB3 A; 2EZY A; 3Q8Q B; 2P66 A; 2QB0 A; 3WK6 A; 4NLB A; 5G5G A; 2F3N A; 3HP6 A; 3VCB A; 4RQ8 A; 4J9Q A; 1Z00 B; 7ICL A; 4F4Y A; 3QX7 A; 4GC7 A; 4QW9 A; 1N5W A; 4UB6 U; 4KLI A; 2HVH A; 7ICV A; 2ZIU A; 3SAG A; 3UQ0 A; 9ICR A; 3KZI U; 4JV0 A; 2ZIX B; 8ICT A; 2YX8 A; 3C29 A; 4QNL A; 3ISC A; 4EEY A; 5DB8 A; 5KFP A; 4G3I A; 9ICW A; 4F8R A; 3SZ2 A; 3FM9 A; 2NO5 A; 4ED3 A; 1D9D A; 3BQ0 A; 2KJ8 A; 1V85 A; 2F77 X; 2MRL A; 3AMZ A; 4A8E A; 1RPL A; 3AU6 A; 4FS1 A; 3JPO A; 3GIJ A; 2LMR A; 4DL4 A; 4RPX A; 4DSL A; 1S8O A; 3BS7 A; 2RHF A; 1T7P A; 4IS7 A; 2F8L A; 1U49 A; 8ICR A; 1ZQL A; 3D6J A; 3TI0 A; 4UBB A; 5AK4 A; 3MR5 A; 4ECW A; 3GV7 B; 4F4K A; 4QZF A; 1T4G A; 1X9S A; 2W7P A; 2JGA A; 1VDV A; 4Y2Q A; 2CRX A; 5AM0 A; 1BGX T; 4IQU A; 4DOA A; 1MQ2 A; 4ECV A; 8ICE A; 1L7N A; 2KG5 A; 7ICR A; 4JMU A; 7ICT A; 5JRT A; 1DK3 A; 5CR0 A; 4ED6 A; 2HDO A; 2W11 A; 2J6S A; 4CRX A; 2XGQ A; 4O9M A; 2MAX A; 2F44 A; 2AQ4 A; 3D2S A; 2EQY A; 3C2K A; 2PFP A; 3QZ8 A; 3BZC A; 4OJO A; 4IQV A; 4RNN A; 1K1S A; 1Q46 A; 3F2B A; 3GFK B; 1NKC A; 1J97 A; 2E5S A; 2W43 A; 3NVW A; 3C28 A; 3L3F X; 4ECZ A; 2Y0S C; 4PGX A; 2G0A A; 3GU3 A; 3SR6 A; 1X6J A; 3PW5 A; 4RT2 A; 3PX0 A; 4IQT A; 4IRD A; 5KFG A; 2KD1 A; 5KFW A; 4P4O A; 1Z4O A; 2E8O A; 1FFV A; 4QJF B; 3JPP A; 5G5H A; 1HUZ A; 2ZUD A; 5AIB A; 2WTF A; 1NJW A; 4YR3 A; 2W54 A; 1RM6 C; 3LWL A; 2G5I B; 2MUT A; 5AK6 A; 2QB0 B; 1PZN A; 4RUA A; 4O5C A; 4LZD A; 5IIL A; 3RBE A; 5KFU A; 4I2A A; 5DBC A; 1NZP A; 5ALP A; 3HW8 A; 4YD1 A; 4O0I A; 1ZRM A; 2ZIU B; 1SIJ A; 2K4P A; 1N62 A; 1K5O A; 4HAI A; 4DSI A; 5AM2 A; 3BQ2 A; 2FMP A; 4KLL A; 3V6J A; 9ICT A; 2K8B B; 1M6Y A; 2HCF A; 1NK4 A; 4OJ5 A; 1XS9 D; 1ZQA A; 5ALQ A; 3V7K A; 3LYS A; 1SV0 C; 4JUZ A; 5ALM A; 2YMQ A; 2JZB A; 7ICI A; 3I28 A; 5L1I A; 2BDP A; 5DDY A; 3SEI A; 1QCK A; 2KEY A; 2PFO A; 3RJH A; 1RQL A; 1JXE A; 1ARO P; 4C4R A; 2E1F A; 5IIM A; 8ICS A; 3M8R A; 2LYB A; 5ALO A; 4DLE A; 1SV4 A; 5KAI U; 4I2H A; 3AUO A; 3RF9 A; 5DG7 A; 5ALK A; 3M8S A; 2YN4 A; 1SL1 A; 1MA7 A; 3IN5 A; 3UMG A; 3OSP A; 4UW9 A; 4YR2 A; 1KL9 A; 5ALD A; 3RBD A; 1ZQH A; 1DOQ A; 4QWB A; 4TUP A; 4I2E A; 1IXR A; 2LYA A; 4QZB A; 5F9N A; 2K4E A; 1U9L A; 5EE1 A; 2XGP A; 1ZQE A; 2GH1 A; 3E58 A; 4CF5 A; 1PVQ A; 4KN4 A; 1ED1 A; 2YB4 A; 1ZD4 A; 1YZ6 A; 4RZR A; 1V97 A; 3LVV A; 2YQE A; 4XA5 A; 3QE9 Y; 3ZD8 A; 4FO6 A; 3M6Z A; 1N48 A; 4DFK A; 3OPX A; 3TAD A; 4EEK A; 2W9C A; 4NLK A; 2KZZ A; 4UAS A; 4UB5 A; 1QSY A; 2GO7 A; 2VAN A; 4DQR A; 3MGI A; 2BGW A; 2DKZ A; 4B9L A; 4DL7 A; 3EUB 2; 3UM9 A; 5ALU A; 1N60 A; 1IM4 A; 3HRD D; 4DS4 A; 4DSJ A; 4KN7 A; 1ZQM A; 3H4D A; 3JPN A; 3E0F A; 2HSZ A; 1ZD5 A; 5DGA A; 5KFF A; 3TAP A; 2LBO A; 2M0N A; 1WCN A; 1BPB A; 4GIB A; 2KNJ A; 5JU5 A; 3V6H A; 1SB3 C; 1JRP A; 5HR7 A; 5J2A A; 1ZQP A; 1L7M A; 3Q8S B; 1N63 A; 4DSE A; 2YML A; 1ZJM A; 4OD0 A; 2AGP A; 5DDM A; 1ZXI A; 1B22 A; 2BKE A; 3OSN A; 2K89 A; 4QZE A; 3QU4 A; 3GQC A; 4ACO A; 2H5X A; 3T5J A; 2DFL A; 2W03 A; 1JXL A; 2CXY A; 2XCP A; 5K4L A; 2W9B A; 2WHE A; 2UVR A; 5CRX A; 4M9N A; 2HBL A; 4IR9 A; 4QIW F; 4M9J A; 2YTU A; 1TK8 A; 1P7D A; 1ZQG A; 4Y2T A; 3KD3 A; 4YMN A; 7ICS A; 2JZB B; 2HHX A; 2FMQ A; 9ICX A; 2KZ3 A; 5AK5 A; 4ELV A; 4P0Q A; 1L3U A; 3ETR A; 5AKI A; 5AKE A; 3ZDB A; 3OGU A; 3H40 A; 3KKA A; 4Z6C A; 5KFM A; 3RR8 A; 4QZH A; 4P4M A; 3Q8K A; 2PMZ C; 2FI1 A; 4QWC A; 1COO A; 2LM4 A; 4Q8E A; 3KFU F; 3ZDA A; 3TAQ A; 5F3X B; 2F1I A; 4KLH A; 2R8K A; 5CEH A; 7ICP A; 4XRH A; 2WB1 C; 5H2F U; 4P0P A; 1ZQR A; 2BQU A; 1Z00 A; 3SD7 A; 3KHR A; 4ED2 A; 5ALV A; 1ZQF A; 3HJE A; 2ATL A; 4R65 A; 4QW8 A; 4PHD A; 2NV3 A; 4RPY A; 2BQ3 A; 2WF9 A; 4IRC A; 2JR5 A; 3AL0 B; 3SYZ A; 3ED5 A; 4RT3 A; 4YQW A; 1X9M A; 4Y2R A; 2PFQ A; 2K8A A; 5AM5 A; 3EYZ A; 2BDU A; 4NLC A; 5KFH A; 4I2F A; 1IV8 A; 3Q8P B; 5HNK A; 3F53 A; 2W7O A; 4DWI A; 1RQN A; 8ICW A; 4J9O A; 2IOH A; 4XQ8 A; 5ALL A; 5T14 A; 1NKB A; 1NJZ A; 1T3Q A; 2XC9 A; 1MQ3 A; 2JXJ A; 1Q8K A; 1RXW A; 2E8P A; 3HIL A; 1Y88 A; 4RPZ A; 2JH7 A; 8ICQ A; 4ED0 A; 1ZQD A; 2IOF A; 1LKY A; 5IIK A; 5E79 U; 2FPK A; 2C2E A; 5J0P A; 4RQM A; 3FAH A; 1NOM A; 5J29 A; 5ALX A; 4QWD A; 1TVA A; 4F2R A; 5DGB A; 4IC9 A; 1KFD A; 3H7I A; 1HEK A; 3ZDD A; 1TFR A; 3WK7 A; 5BPC A; 4KLJ A; 5KT3 A; 1LB2 B; 1SWW A; 4OO1 J; 2W8K A; 4KTQ A; 3EPI A; 7ICF A; 2FJ6 A; 4EYI B; 1Z1V A; 3C2M A; 4C4S A; 2R8G A; 4FFD A; 2HBM A; 4F71 A; 2KIV A; 1ZRN A; 3PY8 A; 2W9B B; 1T8E A; 1HUO A; 4QZA A; 4C7Z A; 7ICK A; 2R8I A; 5AI0 A; 3G6V A; 4R8U B; 3WK5 A; 5J0Q A; 2OH2 A; 3M9O B; 1D9F A; 1UA0 A; 5KFX A; 2G09 A; 3N7P D; 4J9K A; 2DKX A; 2VA8 A; 2ALZ A; 3IRU A; 5J8Y C; 3QXG A; 5EWG A; 3PW2 A; 5KFR A; 2FMS A; 1RDF A; 2EDU A; 4QZG A; 3TAN A; 9ICC A; 5EWE A; 4P0Q B; 3KHL A; 1XC9 A; 4C8M A; 3SV4 A; 2ZG6 A; 1H38 A; 4DSF A; 3F5A A; 4Y2P A; 2HVI A; 2BHN A; 2RDJ A; 4AP9 A; 2KE7 A; 3OHA A; 4P2H A; 5KG7 A; 4ELU A; 3RB6 A; 4F5O A; 4PHE A; 4I29 A; 7ICQ A; 5KG4 A; 4OJ6 A; 1ZQV A; 3CRX A; 5AI5 A; 3N7S C; 4P0P B; 4QZ9 A; 5EWF A; 3GIL A; 3NVY A; 2I9G A; 3H8W A; 8ICF A; 3RRG A; 4RNO A; 4B9V A; 3N97 B; 3L4P A; 1U45 A; 1ZYQ A; 2VJ5 A; 8ICO A; 8ICN A; 1NK0 A; 9ICA A; 3TKA A; 3NGD A; 3UMB A; 2NO4 A; 1JN3 A; 5ALJ A; 1NJY A; 3TFS A; 4C80 A; 1S0V A; 5AKK A; 3RJK A; 2HHW A; 3PR4 A; 3DV9 A; 1N2X A; 2FLN A; 3IM1 A; 5ALW A; 1X2I A; 4C8K A; 8ICC A; 2XIC A; 1U4B A; 4KLO A; 4ECQ A; 1TK0 A; 3NVZ A; 9ICK A; 4BGD A; 2EAM A; 5ALR A; 1PK1 A; 3PZP A; 3PVX A; 2DL0 A; 4ELT A; 1RG6 A; 1YT3 A; 3SEN A; 2KK0 A; 5KFS A; 3RB4 A; 2DPJ A; 3GZF A; 1ZQN A; 3HX0 A; 1LKY B; 4O3Q A; 4CE6 A; 4PJ0 U; 3M6K A; 4F2S A; 3QEB Z; 4B9T A; 5J0S A; 3NTU A; 2BPF A; 4DF4 A; 2W04 A; 5KFI A; 1XNS A; 5EE9 A; 2AH5 A; 3KZX A; 3WU2 U; 2RP5 A; 4B9S A; 4KX5 A; 4C0Z A; 5AKL A; 4KLM A; 2ODG A; 1DRG A; 5EOZ A; 4O3N A; 4F4Z A; 4RUC A; 1WUD A; 1B4F A; 2RQ5 A; 2KN7 A; 2HOI A; 1D8L A; 1DGJ A; 1KN5 A; 4ECS A; 4FE3 A; 3M9M B; 1JI7 A; 5AK3 A; 3ZDE A; 3BQ1 A; 4NL9 A; 4YR0 A; 3IV6 A; 2WAQ F; 4TQR A; 3PO4 A; 2AQ0 A; 8ICG A; 5KFK A; 1L3T A; 1BPE A; 4C8L A; 5III A; 1JAL A; 4KLQ A; 2K8C B; 1SGG A; 1O03 A; 4TUS A; 3BJY A; 1RZT A; 3RJG A; 1KQQ A; 4ZOH C; 3J81 j; 3E2E A; 3T5H A; 4NLN A; 1KDH A; 4J9N A; 1L7P A; 3PR5 B; 1X40 A; 3SMV A; 1RYU A; 3MFH A; 4DS5 A; 4EBE A; 3NVV A; 5DBB A; 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2A1A A; 1UT8 A; 3FYH A; 3U26 A; 1S10 A; 4O3R A; 4KLS A; 4PL2 A; 1ZJN A; 3ISD A; 5KFQ A; 1S0M A; 2K4I A; 4I2D A; 5KFD A; 1PK3 A; 2DBY A; 2XVT A; 2ISP A; 4MFC A; 4OJL A; 3RJE A; 3UQ2 A; 3AQE A; 2IMW P; 1MSW D; 5AIC A; 2OWO A; 4DFM A; 5DB9 A; 4DL2 A; 3MGV A; 2ES6 A; 4G9B A; 2NRV A; 3V72 A; 4UAR A; 4ECU A; 1Q3V A; 1JUD A; 4PPX A; 1K1Q A; 2ZXH A; 1S5L U; 4YMO A; 4O5E A; 3RJF A; 5KL8 B; 3WK4 A; 5J0U A; 3ETL A; 4RNM A; 1ZQC A; 2GWS A; 4RQ1 A; 1Z19 A; 5ALS A; 5CP2 A; 2AGQ A; 1ZQJ A; 3BS5 A; 4IQW A; 3LWM A; 9ICH A; 3UXP A; 4UAT A; 1KFT A; 3T79 A; 2J6T A; 4R8U A; 2MA1 A; 5ALN A; 1N61 A; 3QUT A; 5J0Y A; 4Q44 A; 3GV5 B; 3ICX A; 5KFN A; 4IL6 U; 5KG3 A; 4C8O A; 1MN8 A; 4F72 A; 2V4R A; 3MC1 A; 4DO9 A; 3TAR A; 1PVP A; 4YVZ A; 4UBC A; 3S6J A; 4TQS A; 1ZQ1 C; 2EAO A; 4TUQ A; 3QUQ A; 3IG5 A; 4K4H A; 5KFJ A; 5J2F A; 1CEZ A; 1IG6 A; 4O3M A; 1KBU A; 2V4Q A; 3IG8 A; 4JV2 A; 4QWA A; 2ZJ8 A; 4Y2U A; 3QNM A; 1QQ7 A; 5HR6 A; 8ICV A; 2E8N A; 2ESE A; 2XO7 A; 2QKQ A; 5BOM A; 2ASL A; 1KKX A; 8ICA A; 2ZUB A; 5B66 U; 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