The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
26
|
sequence length |
67
|
structure length |
67
|
Chain Sequence |
TDCSIVSFLARLGCSSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKGILDHRQLHEFS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural Basis of P63Alpha Sam Domain Mutants Involved in Aec Syndrome.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Apoptosis
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
TUMOR PROTEIN 63
|
| total genus |
26
|
| structure length |
67
|
| sequence length |
67
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-02-16 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2E8M A; 2KSO A; 2LPE A; 1WWV A; 1B4F A; 4RQN A; 2E8P A; 2DKX A; 3SEI A; 3HIL A; 1DXS A; 2F44 A; 2YTU A; 4NL9 C; 4PZN A; 4RQM A; 1Z1V A; 1LKY B; 4NJ8 A; 1SXE A; 1LKY A; 5JRT A; 3TAD A; 2Y9T A; 2ESE A; 2F8K A; 1KW4 A; 1RG6 A; 2K4P A; 1WWU A; 3K1R B; 2E8O A; 1PK3 A; 3KKA C; 2LMR A; 2Y9U A; 2D8C A; 5F3X B; 2D3D A; 2QB1 A; 2KIV A; 2B6G A; 3BS5 B; 4NL9 A; 1B0X A; 1OW5 A; 1X40 A; 3BS5 A; 2KMD A; 1SV0 C; 5J8Y A; 3BQ7 A; 1V85 A; 2DL0 A; 5JTI A; 1V38 A; 1SXD A; 2KE7 A; 1COK A; 2QB0 B; 1PK1 B; 5KNI A; 3H8M A; 2QB0 A; 1PK1 A; 4PZO A; 2ES6 A; 2K60 A; 3TAC B; 2FE9 A; 1OXJ A; 3KKA A; 5JU5 A; 1X9X A; 2EAO A; 2L5Y A; 1SV4 A; 2EAN A; 2QKQ A; 1X66 A; 1SV0 A; 2F3N A; 2EAM A; 2GLE A; 1JI7 A; 1UQV A; 3IDW A; 4MHV A; 3BS7 A; 2EAP A; 2QAR B; 5J8Y C; 3SEN A; 2DKZ A; 2QAR A; 2JV3 A; 3TAD C; 1SGG A; 4IS7 A; 2E8N A; 2KG5 A; 5L1M A; 1F0M A; 2KSO B; 1UCV A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2P35 A; 2W8L A; 5J0O A; 1B4F A; 4I2C A; 3PR5 B; 5L1K A; 2HMX A; 1PVQ A; 3NAS A; 4NJ8 A; 4DQR A; 1ZQQ A; 4YG2 A; 9ICR A; 4KX5 A; 4QWD A; 2YMQ A; 3R9K A; 5ALM A; 2JR5 A; 3I76 A; 3WKB A; 3Q8R B; 2UVW A; 5KFT A; 3FYH A; 1NKB A; 4EX7 A; 2W9A A; 2UVV A; 4XRH A; 3SAF A; 1J2N A; 5AI6 A; 2A1J A; 4C80 A; 5F3X B; 2AGQ A; 3ZDA A; 2HI0 A; 1ZD3 A; 4FO6 A; 1BGX T; 3Q8Q B; 4US8 A; 4Z6D A; 4UB8 U; 3M6Z A; 1NK0 A; 4GXI A; 3RJJ A; 5KT4 A; 3NRZ A; 1U9L A; 3M1Y A; 1JAL A; 2YB4 A; 7ICG A; 2ZTC A; 4ZOH C; 4PZO A; 4F72 A; 1S0O A; 3Q8P B; 2L5Y A; 5AI9 A; 5KFO A; 4O3O A; 3WKC A; 3ZI4 A; 4K4H A; 1WCL A; 4IRK A; 1XSN A; 3NTU A; 1ZQO A; 4DFD A; 4F71 A; 5KFB A; 1ZQS A; 2EAM A; 3CYM A; 3E58 A; 3BS7 A; 3EWA A; 4KLL A; 3M6K A; 1ZQJ A; 5DQI A; 2W9B A; 4I2J A; 4EEN A; 1PZN A; 2K8C B; 5B66 U; 1N2X A; 2K8A A; 1L3U A; 5L1M A; 5JUM A; 5KFC A; 1ZQF A; 4M9H A; 3PX6 A; 2ZIV A; 5AM2 A; 4KMO B; 3SEI A; 4Q43 A; 4CCH A; 4CGZ A; 4PHE A; 2FLL A; 3BDP A; 2F2A B; 3UQ0 A; 5J2F A; 4RQM A; 2BCV A; 3C28 A; 3RJK A; 4DLE A; 5EE3 A; 2FMS A; 3GV7 B; 2KZ3 A; 3Q8M A; 5DB9 A; 3M8S A; 5EE1 A; 4FZN A; 3TAD A; 1DGS A; 5J2K A; 9ICV A; 3NVV A; 4CNQ A; 3QE9 Y; 1KW4 A; 4Y2J A; 5J2J A; 2ATL A; 4AYB C; 4YCX A; 2W7O A; 2LM4 A; 4M9N A; 1NZB A; 2DFL A; 2OYY A; 1QQ6 A; 3GV5 B; 1RXV A; 4G9B A; 2EDU A; 4KTQ A; 3M9O B; 4QZG A; 1X6I A; 2C2D A; 1KQQ A; 4J9O A; 4O5K A; 1COK A; 4C8L A; 4UAT A; 1Q46 A; 4J9R A; 1QCK A; 3K75 D; 4PL2 A; 3OSP A; 1Z00 B; 1OXJ A; 3AMZ A; 4P4O A; 4MFC A; 1FO4 A; 3ETR A; 2ZUD A; 4YXJ A; 5ALR A; 5AK3 A; 2AXT U; 2ZIW B; 5J0P A; 2JEG A; 4EX6 A; 4DOA A; 4B9U A; 1N60 A; 2KTQ A; 1QSY A; 3M9N B; 3C5F A; 2R8J A; 5KT3 A; 4ED3 A; 1XC9 A; 4YMM A; 4C8M A; 1ZQM A; 3LVW A; 2RHF A; 5AI4 A; 3PV8 A; 5J8Y C; 2ODG A; 2HBL A; 5D4B A; 3VCB A; 5ALE A; 2MA1 A; 3QU5 A; 4C0Z A; 2HOI A; 1YZ7 A; 1T94 A; 3RH5 A; 7ICS A; 2BGW A; 3RJH A; 2OM6 A; 2ISP A; 3OJS A; 3PSF A; 3RFA A; 2E8P A; 3TAQ A; 3RJG A; 1CEZ A; 1RZT A; 3HT3 A; 1NK9 A; 4DL6 A; 4FE3 A; 2N1R A; 4RQ1 A; 5DLF A; 3T5L A; 3A0B U; 4M6W A; 1C7Y A; 5L9X A; 1BPD A; 4Y2T A; 2ESE A; 5ALG A; 5KG6 A; 4P0P A; 4C4T A; 2VAN A; 1WWU A; 2EQY A; 2KP7 A; 2JEF A; 1X9W A; 3ISD A; 3C5G A; 4YVZ A; 8ICI A; 1Z3E B; 4QWE A; 3JPT A; 2P6U A; 4O3Q A; 1UHU A; 3RJE A; 1B0X A; 4JWN A; 9ICO A; 2CPR A; 1ZQV A; 2WHE A; 5IIN A; 1ZQH A; 5HR6 A; 4Y2Q A; 3H40 A; 3D6J A; 3QU7 A; 1ZQA A; 2Q0Z X; 5EWE A; 4RQ8 A; 5J0Y A; 1K1Q A; 4UAS A; 2NO5 A; 4BWJ A; 5EWG A; 1J2M A; 2G5H B; 4C7Z A; 3OGU A; 1ZQG A; 4UQG A; 4UAV A; 4C8O A; 4Y2X A; 5BOL A; 3TAR A; 1RM6 C; 4O9M A; 4Q8E A; 1L6N A; 2W9M A; 2W3S A; 2KV2 A; 3SV4 A; 2PFN A; 1JI7 A; 1NK4 A; 4F4Z A; 2HHQ A; 2EAP A; 8ICN A; 3Q8K A; 2PXI A; 3MAB A; 1F5S A; 1Z4N A; 1N5X A; 2PFQ A; 5III A; 1T8E A; 4IQW A; 5T14 A; 1T7P A; 4BJQ A; 9ICI A; 1IG6 A; 2KG5 A; 2WF8 A; 4RNN A; 2E8M A; 1ZQZ A; 4MFF A; 4P0Q B; 4UB2 A; 3HX0 A; 3JPP A; 1NJZ A; 1DGJ A; 8ICU A; 5J0R A; 3TI0 A; 9ICW A; 1B43 A; 2Y9T A; 3KHH A; 2WAQ F; 9ICK A; 3FC4 A; 4O0I A; 5ALP A; 2K4P A; 4RQ2 A; 3UM9 A; 2E8O A; 5C5J A; 4X5V A; 2R8K A; 2LMR A; 5L1J A; 3KOO A; 3F2C A; 2FLP A; 4KLE A; 2KZM A; 2ZUC A; 3MBY A; 3JPO A; 4RUC A; 4KN4 A; 5J0U A; 4QZF A; 2W9C B; 3D2Q A; 3D2S A; 3PNC A; 2DL0 A; 2W04 A; 1V38 A; 1UT8 A; 4Q45 A; 1FFV A; 4QW9 A; 1NK8 A; 3H8M A; 5EOZ A; 1PK1 A; 3KZI U; 5KFK A; 1RYR A; 1KDH A; 2ISO A; 4WJ3 B; 1NJW A; 2YX8 A; 4Q44 A; 3T5K A; 4RPZ A; 2KHV A; 1SV4 A; 3C2K A; 4NY8 A; 5J2A A; 5AKG A; 2K4H A; 4B6J A; 1ZQ1 C; 2HHV A; 3WK7 A; 4RQ3 A; 3QXG A; 5KAF U; 5DQG A; 5AKL A; 1KSP A; 2PI5 A; 3A0H U; 2B21 A; 2IHM A; 4PGQ A; 1KFS A; 1F44 A; 5ALT A; 4UW9 A; 1P7D A; 1ZQU A; 3TAD C; 5J2C A; 5AM0 A; 5KG4 A; 3PVX A; 4IQV A; 3RB4 A; 1ZOL A; 3NVZ A; 1IV8 A; 4XQ8 A; 3BQ0 A; 3NGD A; 5J2B A; 2F1J A; 5DG8 A; 3KD3 A; 4PL1 A; 1SL2 A; 8ICJ A; 2K4E A; 2W3R A; 2G09 A; 2OXO A; 4PZN A; 5IIJ A; 4CE6 A; 4R63 A; 4EZ9 A; 5KTQ A; 4CDG A; 5KFL A; 1ZQW A; 5J2H A; 4B9L A; 2HHS A; 3O0F A; 1D8Y A; 3KHG A; 4JUZ A; 2IOF K; 2YMM A; 4KMU A; 1ZQC A; 4Y2V A; 1RG6 A; 1X9M A; 3K1R B; 3QYP A; 5IIM A; 3GIJ A; 2DPI A; 3DDH A; 1S9F A; 3AQE A; 2D3D A; 4DEZ A; 4ECR A; 3BS5 B; 4C7Y A; 1N61 A; 4IRD A; 2LM1 A; 4ECZ A; 4KLT A; 1XU4 A; 4DL4 A; 5J8Y A; 4BGD A; 2KFN A; 4ECW A; 5EWF A; 3PML A; 5JTI A; 1L7O A; 5DGA A; 2LYH A; 4RQ4 A; 3WKD A; 2DQN B; 3IG8 A; 7ICT A; 1HEK A; 9ICA A; 4QZ8 A; 4KLH A; 3GII A; 1SL0 A; 2HHX A; 2FE9 A; 4ECU A; 2HHT A; 2EH9 A; 2JHD A; 4FBT A; 1IIP A; 1JXL A; 8ICG A; 1HUO A; 1TAM A; 4EEL A; 2AGP A; 5ALD A; 3FDS A; 1D8L A; 4DSK A; 3WK5 A; 4UB6 U; 1NNL A; 1VDV A; 5DLG A; 4GLX A; 2I6X A; 1L7P A; 5ALU A; 5CJ7 A; 5J2D A; 4P4M A; 7ICQ A; 4ELU A; 3RAQ A; 4KIT B; 3C21 A; 4KLJ A; 4IS7 A; 2P66 A; 9ICS A; 1JXE A; 4JB3 A; 3KBB A; 4JV1 A; 1UPH A; 1A76 A; 2VIX A; 4PH5 A; 3HIL A; 2MSN A; 2WAQ C; 1TK8 A; 2MUT B; 1LKY B; 2ZIU B; 5ALK A; 3RBD A; 3OHB A; 2NRW A; 4O5E A; 5KG3 A; 5HMM A; 1NK6 A; 3PO5 A; 1TK5 A; 3SAH A; 1XO0 A; 3UQ2 A; 3IP4 B; 2C2E A; 2FMQ A; 1D8B A; 2KZZ A; 3QUC A; 3QUT A; 1VLB A; 2F77 X; 3MGH A; 5KG2 A; 8ICF A; 2RDJ A; 2AQ4 A; 4TUP A; 1NK5 A; 4P4P A; 4YXM A; 5DB7 A; 1WG8 A; 2F8L A; 4QJF B; 5J2G A; 4QW8 A; 1ZQL A; 3ISB A; 3DEE A; 1KN5 A; 4ICA A; 1KEJ A; 2JGA A; 1Z00 A; 1GO3 F; 3QX7 A; 1KBU A; 2E3T A; 1QQ7 A; 4QZD A; 1SIJ A; 2BPF A; 1JN3 A; 2WF5 A; 1DK3 A; 3HP6 A; 3WKE A; 4NLK A; 2M9N A; 1A0P A; 2HBM A; 2NRX A; 4DSF A; 2ZIW A; 2UVU A; 3MR5 A; 2Q4T A; 5KFR A; 2PMZ C; 4FS1 A; 4KLD A; 3M7D A; 2FI1 A; 9ICP A; 1NI3 A; 4OO1 J; 3QU4 A; 5KFU A; 1UQV A; 5KL8 B; 1RQL A; 3UMG A; 4JWM A; 3RH6 A; 3FM9 A; 5ALH A; 5EE0 A; 3WU2 U; 5TIS U; 1B22 A; 4IC9 A; 1Q8K A; 2B0C A; 4YP3 A; 5DBA A; 3BZC A; 3L3F X; 8ICL A; 2F76 X; 4K4G A; 1DXS A; 1KLN A; 3PZP A; 2W55 A; 2LKY A; 2NYV A; 2FLN A; 4DFK A; 1S77 D; 1NOM A; 4ZH4 A; 1L3T A; 5AKK A; 1HIW A; 4PPX A; 1SXE A; 3NVY A; 4MFA A; 4PJ0 U; 5KFN A; 2QLT A; 1X6J A; 4I29 A; 1ZQR A; 7ICK A; 2CN1 A; 4DS4 A; 2K4I A; 3MGI A; 4R8U B; 1ARO P; 1X2I A; 3MFI A; 2BKE A; 1LB2 B; 2M0N A; 3K1Z A; 2B6G A; 4KLO A; 4UAW A; 4J9S A; 4C4R A; 3B0X A; 3CP8 A; 2XC9 A; 2BDP A; 3PY8 A; 2HBK A; 9ICH A; 1SXD A; 2WTF A; 3MGV A; 4EZ6 A; 4M9G A; 4J9M A; 1ZJM A; 5HHH A; 2KE7 A; 2ZIX B; 8ICY A; 5KFW A; 2QB0 B; 9ICL A; 4Z6E A; 1JIH A; 2HOQ A; 2PFP A; 8ICA A; 1XSP A; 2A1A A; 4LZG A; 1JRP A; 4EBD A; 1MQ3 A; 5B5E U; 4BXO B; 2KVC A; 4KLF A; 5J0Q A; 1L8O A; 4KLQ A; 2WF7 A; 1ZQX A; 5KT2 A; 5KFX A; 5KAI U; 4ED7 A; 2W11 A; 1JX4 A; 2ZUB A; 3HW8 A; 5F9L A; 3T5J A; 4O3R A; 2XID A; 2MAX A; 1NJY A; 4DL7 A; 2W7P A; 1QH9 A; 4FBU A; 2RQ5 A; 4JK1 A; 4O3S A; 5GTI U; 4R66 A; 2GWS A; 3C1Y A; 3V7K A; 2ZXI A; 5DG7 A; 2V9W A; 3SMV A; 3H0L B; 3LK9 A; 4YMO A; 1X42 A; 5J2E A; 3RAX A; 1UA0 A; 3KFU F; 4ED0 A; 2LPE A; 3JPN A; 3H8J A; 1M6Y A; 2XY6 A; 2G07 A; 4P0Q A; 4FZL A; 1V97 A; 5H2F U; 3EYZ A; 3GZF A; 3GIL A; 3M8R A; 4I2E A; 4DQS A; 3DV9 A; 1KL9 A; 2GO7 A; 2IOF A; 4C8N A; 1VJ5 A; 2BR0 A; 3C1Z A; 3QEB Z; 3AN1 A; 1MN8 A; 5F9N A; 5AKY A; 1UA1 A; 4J9Q A; 2BHN A; 4AP9 A; 2I5H A; 3LYS A; 5KFM A; 4ECT A; 4OJ5 A; 1S0N A; 2W9C A; 2XI9 A; 4DF8 A; 1U49 A; 1ZJN A; 4F5R A; 5J0W A; 3EZ5 A; 5KNI A; 4QZH A; 2RLT A; 4O3M A; 3VC8 A; 1RQN A; 4ECV A; 1YZ6 A; 2RDI A; 3ICX A; 4NWI A; 2LI6 A; 8ICT A; 4MF2 A; 5CB1 A; 5JU5 A; 4KLU A; 1XS9 D; 1URJ A; 3MFH A; 2V4R A; 2WB1 F; 3N97 B; 3PMN A; 4RQ6 A; 4DQP A; 4ECY A; 9ICF A; 3TAP A; 7ICH A; 2ZJA A; 5A0L A; 2JZB B; 2KKP A; 4OJ6 A; 2DF4 B; 3GQC A; 3WK9 A; 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1TV9 A; 2JEJ A; 1SGG A; 4F4X A; 2EZX A; 4US9 A; 2XO7 A; 3RB3 A; 2E8N A; 2H5X A; 2J6T A; 1A6S A; 4GXK A; 4DWI A; 4NLB A; 4QWA A; 2HOF A; 1SKS A; 1ZXI A; 4F8R A; 2H3I A; 2MUT A; 3GIK A; 1LKY A; 4OD0 A; 2ZIU A; 3N7P D; 5KFQ A; 8ICQ A; 8ICH A; 5ALQ A; 2C2R A; 1WYG A; 3L4P A; 1ZD4 A; 4O3P A; 1MSW D; 5AKE A; 1BVS A; 2FJ6 A; 3C2M A; 2QB1 A; 4G3I A; 4RQ5 A; 8ICR A; 2GOL A; 1T4G A; 1MC8 A; 3UMB A; 3PW2 A; 3BZK A; 2YB1 A; 4OJP A; 1S97 A; 2H3Q A; 1ZD2 P; 4CF5 A; 1KFT A; 3F5A A; 3F2D A; 4RT2 A; 4RNM A; 2IHN A; 4IL6 U; 2GH1 A; 4YD1 A; 3RR7 A; 5AIA A; 3B0Y A; 2MU2 A; 3FAH A; 1FFU A; 5DBB A; 2WB1 C; 2D6F C; 4NLZ A; 3T79 A; 8ICS A; 3AU2 A; 2KEY A; 4DF4 A; 3N7R C; 2MRL A; 2EAN A; 3NRW A; 1BPE A; 1X66 A; 1PVR A; 3RF9 A; 1BNO A; 8ICC A; 2E5S A; 2KNJ A; 4O5C A; 2K89 A; 2KJ8 A; 3JPS A; 4F5O A; 3TAN A; 2I1Q A; 5D49 A; 3V6K A; 4QWB A; 4ECQ A; 4DS5 A; 8ICW A; 5KG7 A; 1V9P A; 2JV3 A; 3LWM A; 4M0A A; 4UAR A; 3V6H A; 5CWR A; 4ELT A; 2ZJ8 A; 3HJE A; 2VJ4 A; 4QNL A; 3PW4 A; 7ICI A; 2G08 A; 3I1Y A; 4RQN A; 1WWV A; 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