2YANA

Crystal structure of the second glutaredoxin domain of human txnl2
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
SMAPKLEERLKVLTNKASVMLFMKGNKQEAKCGFSKQILEILNSTGVEYETFDILEDEEVRQGLKAYSNWPTYPQLYVKGELVGGLDIVKELKENGELLPILRGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of the Second Glutaredoxin Domain of Human Txnl2
rcsb
molecule keywords GLUTAREDOXIN-3
source organism Homo sapiens
molecule tags Oxidoreductase
total genus 36
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2yanA01
5ELAA 3CXGA 1BEDA 4MK3A 5D8IA 3UL3A 2ALBA 1F6MC 3F3QA 3WGDA 2C3NA 2P5QA 4PUAA 3J7Yk 3TRPA 1AIUA 1HNCA 2B5YA 4BA7A 4FYUA 1TP9A 3Q6OA 2HSYA 1JHBA 5EPFA 2GQMA 4N10A 4GWRA 3GN3A 3N9JA 3KD0A 4TR1A 1QMVA 1TW9A 1GWCA 3BOAA 2L5LA 3G7JA 2CZ2A 5G1KA 4K7NA 1X9SB 4TXOB 1T4ZA 5DJLA 1F37A 2N5FA 2L6CA 1A2LA 2IMDA 2H73A 1IYHA 5ECIB 2B1KA 4PURA 2VUPA 1USBA 3D6IA 3RHCA 3QFAC 1XW9A 1WP0A 3O6TA 8GSSA 2M80A 3IXRA 5HR1A 4MZCA 4ML6A 5ECHB 5F06A 1OC8A 5H5RA 2LEGA 3BD2A 1TI1A 2FLSA 5DQSA 1VF4A 4XCSA 5EVOA 2F51A 5B6NA 2H1DA 2FWEA 4JE1A 2ON7A 4MF6A 3GIXA 3HY2A 5FWGA 4ML1A 3F63A 3L0HA 3HXSA 1THOA 1YKAA 3ZVJD 3QAVA 2L6DA 4MJCA 18GSA 2DJJA 1BQ7A 2KOKA 4MLYA 3D5JA 3BJ5A 3FZAA 2L57A 2PVQA 5IM9A 1O7UA 1S3CA 2NBSA 4DSSB 2G0FA 3A5WA 3FY7A 3ZITA 1FW1A 1VF3A 1O81A 4Q5NA 2C80A 3CYNA 1I9DA 1SU9A 3VWUA 1TK8B 4WR5A 2RIIA 3GYKA 2LUSA 2K8SA 3W8SA 3K8NA 4EKZA 4IELA 2DJ3A 1NSWA 3ME7A 6GSYA 4N0VA 3IPZA 2H0IA 3GKKA 2CAIA 2R5GA 2QC7A 2O8VB 1KEBA 3HD5A 4HEA2 4HDEA 4ID0A 1OAZA 1YF0A 1X5CA 3LQ7A 1EGRA 3WT2A 4EF0A 3F6FA 4AF2A 2NTOA 6GSTA 4BL7A 4IS0A 1XOAA 3H1NA 5GSSA 4F0BA 1XW6A 2FA4A 5JWQB 4NV5A 3GSSA 2YWNA 1A8LA 3HKRA 1X9MB 1HYUA 1RK4A 4F03A 2RLIA 4ULXA 4IGJA 4JBBA 4OFTA 4JR6A 3KXOA 3ZTLA 3HCZA 3FRCA 5E4WA 3KEBA 1ILOA 3VK9A 4NV2A 3F4SA 1OKDA 2VM2A 1QXHA 3H79A 1YJ6A 2PBJA 2VCTA 2VM1A 4GTUA 1EOHA 2H71A 2WGRA 20GSA 3MAKA 3F4RA 3F6DA 3F8UA 3TKPA 4TOPA 3ZZXA 5DDLA 1F9MA 2YZHA 1PA3A 3I69A 5AGYA 4G10A 2VD1A 2GDRA 5AISA 3IV4A 4ECIA 3QAGA 1VF2A 2E2GA 2GS3A 2PGTA 4E8EA 2FUG2 2YP6A 4DSRA 4ZB9A 3ERGA 3HZ8A 4GRFA 1DE1A 2DIYA 1IYIA 1T3BA 1PL1A 3IBHA 1PMTA 4ZL8A 1PD21 1NM3A 4POMA 3GH9A 4KUNA 3LXZA 4EC0A 1Z3EA 5E59A 3QMXA 5ECPB 3FR3A 2OE1A 1PL2A 4IW9A 2C0EA 5CRHA 4HI7A 1UVZA 3WT1A 1SL2B 1SKSB 1JZWA 2LRTA 4XS1A 2OACA 2X8GA 3D4TA 1ABAA 2JL4A 3D4MA 14GSA 1J08A 1R5PA 4KX4A 1Y6EA 3KH9A 3BBYA 5KN0A 3MDKA 5AN1A 4DEJA 1U88A 2IFQB 2TRCP 2H30A 3KH7A 2B5EA 4D73A 3TOTA 5HR2A 1A24A 2M46A 3FZ5A 2N5AA 3RDWA 4LL1B 5IPHA 3IK9A 1NW2A 3LYPA 2PVOC 4NPBA 4YQMA 5ECRB 4OO5A 2R4VA 2V2GA 4JU5A 2RUFA 2V32A 1K0MA 3UVHA 1Z9HA 2FHEA 2HRNA 3KMOA 3CTGA 5A4VA 4K7IA 3F9UA 2GT5A 4HQZA 2GVPA 3TRXA 1SJIA 5H5SA 3I6AA 1TXXA 4L5LA 2B1LA 2NPBA 1CQGA 5J5NA 1OVNA 4YH2A 4MDCA 4TW5A 3VWXA 2LSTA 4D73B 4LLRA 2GTUA 1BG5A 4FIWA 4YQUA 2B7JA 3UJ1A 1Z6MA 4BVYA 4ILFA 19GSA 4RI6A 2YWOA 1PSQA 5HFKA 3IE3A 4RQRA 5IIZA 3MWHA 2KP1A 1Q4JA 1B8XA 4BWQA 5GSTA 3UIWA 3ZFBA 3N5OA 4EE0A 3TJFA 2TRXA 2HT9A 1EWXA 5B8AA 4KAEA 2C0GA 4KSOA 5F07A 1V2AA 2YPMA 2H66A 1GSUA 5G5FA 2PMTA 3ME8A 4F0CA 2GSSA 3ZYWA 3KP9A 3LG6A 1JZOA 4ZL7A 1B9XC 2DBCA 2XHFA 1DUGA 5ABRA 1F3BA 1R26A 1M2BA 4GSSA 4OFMA 3DKSA 1GSQA 4POBA 2WDUA 2PERA 3GX8A 3ZIJA 4KE3A 4GQCA 2DJ1A 2CVKA 1A0FA 5KN1A 4F82A 4MF5A 1V9WA 3U5RE 1A2MA 2DJKA 3D21A 4I2TA 1O8XA 9GSSA 3ZVJA 3H4KA 5CO3A 3GKMA 4BVXA 2PUKC 2IN3A 2IPAA 2YCDA 1TI3A 2REMA 3PGTA 3RPPA 2NVLA 3ERFA 1TTZA 3DVXA 1JZRA 4PGTA 5IQYA 1M2AA 4GSNA 3S9FA 4K1FA 1SK1A 1SK2A 2C0FA 2OJLA 3KIJA 3P7XA 2IIYA 5IMDA 2H1BA 2G2QA 1SD9A 3C7MA 4PNFA 6GSWA 1K3LA 1TJDA 2LKUA 2F8AA 5IMCA 3F0IA 1PKWA 3ZMLA 2FA8A 4K7OA 1GSDA 1OKTA 2P5RA 1TU8A 1Z7RA 1ZCPA 2CQ9A 1A0RP 4RQXA 2HE3A 1K0CA 4KDXA 3LXTA 3IR4A 3IAM2 4O32A 3GA4A 3QR6A 1JFUA 4TR4A 1PKZA 3O3TA 1BAYA 1M9BA 3ZMKA 4XRAA 2IMEA 3KP8A 5CRGA 5IPGA 3EURA 1GULA 1FB6A 4RUVA 1GSYA 2VIMA 1E6BA 2PN8A 1XWKA 5IMFA 3FHKA 2AHEA 3VLNA 4OO4A 4J56E 4PQHA 4EDYA 2P31A 1M0UA 1J9BA 3UBLA 2FWGA 4KB3A 1AAZA 3FR6A 3G9BA 2OBIA 1SK0A 1N8JA 4ZL9A 2IL3A 2XBQA 1B4QA 1QUWA 3EINA 1O6JA 4O5RA 4WR4A 1W89A 4K8MA 4I8BA 5ECMB 3KGKA 4PQIA 1RQMA 3TKSA 4KA0A 3GUSA 2H8LA 1F2EA 2QGVA 2LNTA 4KCEA 2D2ZA 4EVMA 5GZZB 2EIOA 1KTEA 2B5XA 2VLTA 2DIZA 1W4VA 1TRSA 1HNAA 3ZLPA 4ZBBA 1K0DA 3NOFA 2VL9A 2AUVA 4DSSA 2PWJA 4OMVA 3QPMA 4EL1A 2WCIA 4MZWA 3EWLA 2I81A 2DLXA 3DXBA 2K18A 1FAAA 2HNLA 2RUEA 3HA9A 5D9WA 4DSQA 3CSHA 1T4YA 5AIVA 4TVEA 1AXDA 2J9HA 16GSA 2YNXA 3L9UA 5IMZA 4HJ2A 4KNDA 3US3A 4MF7A 1ERVA 5JWRB 3UEMA 3UMAA 2H70A 3HHVA 3CTFA 4V2NA 4G2EA 1EEJA 1HQOA 3DYRA 4G19A 3DRNA 2EIRA 1ERTA 1JZDA 3WD6A 1K0BA 5DQYA 3RHBA 3E3EA 4MP4A 3IHQA 3C1RA 3TJBA 5ID2A 3CSJA 3HVVA 5HR0A 5B6MA 3JCML 3C71A 3UAPA 1AUCA 2R37A 1H75A 4KSMA 5G1LA 2I4AA 4OCEA 1AC1A 5KN3A 1YQ1A 4F2IA 1O8WA 2GZPA 3TJGA 1Z7PA 1GL8A 2CA8A 3GH6A 1PX6A 4LA1A 3Q19A 3Q18A 1XPVA 2K6VA 1CQHA 2OBKA 3G7YA 2QKEA 3VFIA 1ON4A 4GQFA 5HFIA 3A2XA 2RM5A 5G5EA 3TOUA 2VL2A 4ZXGA 1YF1A 2CX3A 1FHEA 4EXJA 2FWFA 3VI5A 4MABA 1U87A 4I2UA 2YJHA 5COHA 5ID2B 2VCWA 1O85A 3A2WA 1SJ6A 3V1WA 3EVIA 4L0UA 5ECLB 3HVSA 5IMAA 4JEDA 4CW9A 1MEKA 4IP1A 2H6ZA 2XBIA 2KLXA 5ENUA 3CBUA 2GQLA 2MMNA 3VI7A 2VCZA 4WBRD 3KZQA 5H5QA 4NHZA 3M9JA 1M7TA 5J3RA 3GTUA 2H0HA 1ZYQB 2O87A 2I9HA 3SWLA 4P3YB 4MPFA 3TKQA 1QK8A 4HQSA 2VD0A 2CX4A 2ES7A 3EMPA 3EMXA 4PUFC 2HSHA 1ZYEA 2L4QA 4F9ZA 2IFQA 12GSA 3GHAA 1Y25A 1UN2A 1XZOA 1MTCA 3Q74A 2YN1A 3M9KA 2NDOA 1F3AA 1SKRB 1T8EB 5G31A 4NHWA 1PN9A 6GSXA 1KBNA 3TUEA 1ZGNA 2OE3A 5FT3A 2LTKA 3GKNA 5C04A 3GTUB 5JWOB 4MPGA 5G2ZA 2HZFA 5IO2A 2I1UA 5KN2A 5GAPD 2JZRA 4BPYA 2TIRA 2E2MA 1R5AA 1U6TA 4IN0A 3LJRA 3TKSE 1XBSA 4EUYA 2C8UA 4XHMA 6GSVA 1XOBA 1YEPA 3LEFA 3LFLA 2CVBA 3PH9A 2ON5A 4HU7A 3IAS2 1OYJA 2WFCA 2MBSA 1ZOFA 4X43A 2HFDA 2MMZA 2DMLA 2PPTA 3VPTA 1AQWA 1WE0A 3GKXA 2YV7A 4QL9A 2FD3A 2JSYA 4ZBDA 2C0DA 4CDOA 4NXIA 3GSTA 3P2AA 1G6YA 1XWCA 3M3MA 2ZUPA 3D0ZA 6GSSA 4LMWA 2HLSA 1FVJA 3E0UA 3H8QA 4L0WA 4FH8A 1A8YA 1EEMA 1SENA 3MSZA 5ELGA 1R7HA 2YOIA 5L71A 5D73A 1GUHA 3APSA 1G0TA 1YY7A 2FY6A 2V6KA 3C73A 5IO0A 4Q5QA 2H19A 4ECJA 1FO5A 3ZFLA 2FNOA 1I5GA 2O85A 3HJPA 1GLPA 1GTAA 4TR3A 2JU5A 1QQ2A 4PXOA 1N2AA 4YAVA 2WZ9A 3QDNA 3PINA 3DIEA 3NZNA 3HYPA 4MJAA 1EOGA 3DD3A 4IQ1A 2A2SA 2GT6A 3TB2A 2M72A 2FCHA 3VWVA 2JZTA 4IJIA 3TGZA 2LRCA 2X64A 4WF5A 5EL8A 3ISOA 5A4WA 2EC4A 2GSTA 1C72A 3RAZA 5F8BA 3DWVA 1K3OA 1GSFA 3TKSC 1O73A 4WKWA 1XWAA 5G30A 7GSSA 1AQXA 3G7IA 3EU4A 3H93A 1G6WA 4AJ8A 4H86A 4ZBAA 4OD7A 2R2JA 2DC5A 3KM6A 13GSA 5ECSA 3GFKA 1SL0B 4V1Ag 4O92A 2DMMA 2O7KA 1NHYA 2I3YA 1ST9A 1X5EA 1EGOA 3GMFA 3R2QA 2R3XA 1G7OA 3NIVA 2HI7A 5DCHA 3BCIA 1MD4A 3CRUA 4MCUA 4WXTA 5CREA 3HJMA 1A2JA 4ZB8A 2VL3A 3P90A 2YZUA 10GSA 1EV4A 5CNWA 3J7Yb 3UOMA 4IBPA 4POLA 2CVDA 3PR8A 2WJUA 4QQ7A 3VPQA 4N0ZA 2F8FA 3A3TA 5D96A 3LORA 2JZSA 3QAWA 11GSA 3EU3A 4XRDA 1GUMA 4X1UA 1BX9A 3FW2A 2X99A 5ECNB 2L4CA 4XIHA 2ZNMA 2H01A 3CRTA 4V2MA 4I5QA 3KCMA 1LU4A 2HRFA 5F0GA 2YJ7A 4X0XA 4HS1A 2OA7A 3EE2A 2GZZA 2FGXA 4HUAA 4ACSA 1DBYA 2H6XA 1GTUA 2K8VA 2WRTA 1GNWA 4GCIA 2VL2C 1WIKA 4E8HA 1SYRA 4WF4A 4KDYA 1B4PA 4KCAA 1YKCA 1V57A 3DMLA 4TRXA 3ZREA 3ZL5A 2F9SA 2LNSA 2JSZA 1EZKA 3APOA 3KTBA 2L59A 2A2RA 2ZCTA 4MJBA 5DAKA 3F3RA 1LBKA 2O89A 1T00A 3WGEA 4OCFA 4JZQA 1SD8A 3LYKA 1HD2A 2GQKA 2KUCA 5ECKB 4POKA 4N30A 4ISDA 3TKRA 2CZ3A 1PQNA 1LJRA 1XFLA 2CV4A 5CRDA 5D9TA 1KNGA 3C1SA 2WS2A 5JCUA 2YWIA 2VAFA 3L78A 4NAXA 2GLRA 2JACA 2LV3A 2OADA 3CMIA 1HNBA 3GURA 5CRWA 2OE0A 4TN8A 1V98A 1FOVA 2C3QA 1XIYA 1WRYA 4KDUA 4K6XA 2GZYA 4L5OA 4GF0A 4XS6A 1XXUA 1OE8A 5DAKB 1XCCA 3IDVA 2F3MA 3WYWA 3APQA 1EV9A 3LGCA 1TRVA 3EYTA 3VWWA 2IMFA 3D22A 3GNJA 1MD3A 4TR1B 1XW5A 1VF1A 3FYGA 4IVFA 2VCVA 1TKDB 3TJKA 3TJJA 2BMXA 4HZ2A 3TDGA 4GLTA 5EY6A 4GSTA 2LQOA 5KEJA 3RPNA 1ERWA 1AW9A 2LJRA 5A5KA 5DVBA 4KW6A 4IJ3A 4ECCA 4XTSA 5D9XA 4Q5FA 1TRWA 1A23A 2E7PA 2VOCA 2VCXA 3M0FA 3MNGA 2B3SA 5IMVA 2K9FA 3F4TA 3QOUA 1S3AA 3SBCA 1ML6A 4EO3A 4DVCA 1WPIA 1ZZYA 3KTLA 4N11A 1XVQA 1K3YA 1TOFA 1E2YA 4G9HA 1PGTA 4L8EA 2H75A 2LQQA 1T7PB 5ECOB 2WB9A 3TCOA 3OR5A 5GAND 2LJAA 1X9WB 4LMVA 1MDKA 1SJZA 2OKAA 1UA5A 4EDZA 5DCGA 4GXZA 4TXVA 5J9CA 5HR3A 3LSZA 2HZEA 1X5DA 3E9JB 2MZCA 1GNEA 3FR9A 4HJMA 4MA9A 5FHIA 3IK7A 4CHSA 3HVXA 5IOXA 2R6KA 1ZL9A 1MDJA 3RBTA 1Q98A 3VURA 4BWSA 1V58A 1OE7A 2H1GA 4IQAA 3CSIA 4FYCA 4J2FA 1GUKA 2V1MA 1GP1A 3HJOA 2XPDA 2XPEA 2H1AA 1EP7A 3LWAA 4V2LA 3C8EA 1TRUA 4KGIA 2Z9SA 3L4NA 1H4OA 1FB0A 2RM6A 3FKFA 2AB6A 3FZ4A 2HZEB 3I9V2 2GSRA 2BTOT 2X8HA 2PU9C 2VLVA 3WGXA 1TDIA 2LS5A 2EIQA 1S3DA 4NMUA 5AIXA 4ZILA 4ZB6A 4WETA 4K0NA 5LD0A 1WMJA 1G7EA 2KP2A 1SL1B 2AV4A 1YEXA 4V1Ap 2CT6A 3GRXA 1ACVA 2MMAA 3BCKA 1GLQA 3IRAA 4OWYA 1WWJA 1K0OA 2AAWA 4K0GA 5DJMA 1PRXA 3UBKA 3FK8A 3HZ4A 1X0RA 1K0NA 1XWBA 1AQVA 5JCWA 2WULA 1K0AA 4HOJA 2BJXA 4AJ7A 5LCZA 4YQVA 2MMOA 4PX1A 3KMNA 2KHPA 5IOWA 1QFNA 2LJKA 5C00A 3M8NA 1WOUA 1J0FA 4I97A 1GTBA 1DE2A 3EC3A 1Z5YE 1JLWA 5A4UA 3GL5A 1URMA 2V6OA 2B6MA 4I6XA 1TK0B 3A2VA 1VRSD 1BYEA 4JR4A 1GRXA 4AGSA 1TU7A 2P0GA 1DSBA 1M99A 1SYXA 4J57E 4Q5RA 5INYA 2QSIA 2HXKA 4YAPA 4ECBA 1PX7A 2IWTA 3P8WA 1MDIA 2VCQA 6GSUA 3IA1A 3AY8A 3GX0A 4WEYA 1ERUA 5HQPA 4FO5A 1T1VA 2MBTA 3ZRDA 2VO4A 4TKYA 4Z7XA 2DJ2A 2VLUA 3UARA 1FVKA 1EP8A 1GH2A 3KJYA 2JADA 5CYYA 5DBQA 5J41A 2GSQA 1TK5B 1UC7A 2HYXA 3I43A 2C3TA 3ERWA 4K9ZA 4AJ6A 2MYGA 3DVWA 4MMMA 4TR0A 1B9YC 4HZ4A 1RW1A 2A4VA 2H74A 4IP6A 4IHUA 2X8CA 4HU9A 2DSAA 3IOSA 1OC3A 2E0QA 1BJXA 3HDCA 2B7KA 1U3IA 2IMIA 3QCPA 3DGQA 4FYBA 5ECQB 1ZMAA 5DALA 2H6YA 1SKWB 3O76A 4NWYA 1FG4A 4WBJA 3M1GA 1YZXA 3L9VA 3GV1A 1THXA 5J4UA 3ZIVA 3TRQA 2CAQA 1YDKA 2YV9A 5B7CA 3W6GA 1WJKA 2FWHA 2LRNA 2XC2A 4MJEA 2DJ0A 2AJQB 2H72A 1B48A 17GSA 4LL4B 4XS4A 1VGLA 1OC9A 4QL7A 5DALB 5LNKe 4K2DA 3FZ9A 3GL3A 1NHOA 4ZIJA 2L5OA 3UVTA 2J23A 3IC4A 5JCGA 1XVWA 1R4WA 2V41A 2IMKA 4OFNA 1GTIA 3U6VA 4KH7A 4PQ1A 1QGVA 1U3AA 3QD9A 4RI7A 1JLVA 1Z6NA 2H76A 3DEXA 22GSA 5F05A 1GSSA 4O7HA 5D9VA 2H0GA 4PNGA 2C4JA 4IKHA 2IJYA 4MZBA 2N5BA 2GGTA 4XS4B 5B8BA 1V40A 2YWMA 1OC9B 4JRRA 2YANA 4MH3A 5J9BA 1M2DA 4TXOA 1XWGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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