2YC4 | Genus

Total Genus 26

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	26
sequence length	135
structure length	131
Chain Sequence	MKDYAREENGGLVVMASCSDERFPPENMLDGKDNTFWVTTGMFPQEFVLRLESCIRVSKITTLSLNVRKLAVEKCDQDKPDQFEKVFEVELANLQTEVHQVNIRAKYLKFILLQGHGEFATVNRVSVVGGD

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transport protein
source organism	Chlamydomonas reinhardtii
publication title	Crystal Structure of the Intraflagellar Transport Complex 25/27. pubmed doi rcsb
molecule keywords	INTRAFLAGELLAR TRANSPORT PROTEIN 25
total genus	26
structure length	131
sequence length	135
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2011-03-11

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.60.120.260	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Galactose-binding domain-like	2yc4A00

3FL7A 2WBKA 5JXJA 2L9LA 4QX0A 3PUHA 4LKSA 4A44A 3LQCA 1EUTA 2WQ8A 3BGAA 3DYOA 2XHNA 4DEQA 4AG4A 1P8JA 3ABZA 3I2KA 1JZ5A 2R7EB 4XVHA 1KGYA 3VD5A 1PMHX 4JKKA 4Z2AA 2E31A 2B4KA 2BBAA 3NJXA 1DYOA 3MV11 3UNPA 3T2OA 2Y6GA 3E1F1 5JXIA 3IAQA 2WN3A 1LNSA 3WF2A 1JZ2A 2J1VA 3C7OA 3MBWA 5DN2A 4PF1A 1W8NA 4A42A 4QDSA 4CVUA 1J84A 4QPWA 2KD7A 4A6OA 3MUY1 1JZ4A 5IFPA 2Y6KA 4QDQA 1CZVA 4JHZA 4M4PA 2JDAA 1DLCA 3OGRA 3OGSA 3AC0A 1JYWA 3ACFA 4RYDA 5LCWL 2WAAA 4CU8A 1NAEA 4ZY9A 2WO1A 4TTGA 2X10A 1SG3A 4BXSV 4XURA 1GMMA 3T2QA 1UZ0A 2EIEA 2WO3A 2VC9A 2EIBA 3SEEA 2VOTA 3HPNA 5JMOA 2X05A 5LA2A 3NRUA 3P1IA 3I2JA 2J22A 2RV9A 4ARYA 1XC6A 3K46A 4DXRA 2Y6HA 3C7FA 4E8DA 3ZM8A 1UXZA 3NJVA 4DUWA 2YC4A 3I97A 1K42A 2W1UA 1J83A 5I0DA 5F7UA 5DQ0A 1IQDC 2YG0A 4XZUG 2CDPA 4ZXEA 1CZTA 3HNYM 1H6YA 4DUVA 1GOHA 2VQUA 3VD7A 2V72A 4BDVB 2RVAA 2VZ3A 3CZJA 3WQBA 1WKYA 4QDRA 3A7QA 1XNAA 1OF3A 2EIDA 3MV01 3WF4A 5C7GA 2WN2A 3PUIA 1UMHA 2E32A 1W99A 2J1RA 4W4ZA 3CQOA 3K4DA 4HG6B 1JZ6A 2VZPA 3I2GA 2ORZA 5G04L 5JUVA 3ECQA 1JYNA 2E33A 4AAXA 1F4AA 3ACHA 3UETA 5CYYA 5A1AA 1JU4A 5HXMA 1UY1A 3FHAA 1OD3A 3EYPA 1UMIA 4MO3M 2LW8A 2PQSA 2VZTA 1KEXA 1UX7A 4P00B 2WO2A 1K45A 3A23A 1W0NA 1SDDB 2V5DA 2W91A 2W5FA 3CZUA 1US2A 4PT6A 3UESA 1JZ7A 4CU6A 1CIYA 2VO5A 2HLEA 4CUBA 2W95A 4GZ9A 1UY2A 2DDUA 3VDCA 4OZOA 2B9VA 4MADA 3F2ZA 3WF3A 2WABA 5DMYA 4A45A 1UY4A 3VD3A 1OF4A 2Y8KA 3HNMA 4DEVA 3U37A 5G05L 1NUKA 4DUXA 4QB6A 1GNYA 2WZ8A 3OB8A 3IB3A 4KWUA 3JXSA 2W94A 4ZZ8A 1GU3A 2J1UA 2QQNA 2WYSA 4UOJA 4W8JA 1GOGA 4KI5M 3FN9A 1TG7A 1PMJX 2XOMA 1WCQA 4LPLA 1UXXX 3WF0A 1CX1A 4TXWA 2VZUA 3NNGA 4GWIA 1US3A 3WNLA 4FI9A 4JX0A 2ZEYA 1W9SA 4P02B 4XUQA 3OBAA 2CDOA 4QX2A 1YQ2A 3LE0A 3C7GA 3VD4A 3MUZ1 1O8SA 1OT5A 1W9TA 3A21A 3WNKA 2ZXQA 1O8PA 4XUNA 1R64A 1PX4A 2YFUA 3C7HA 1W9WA 5LA1A 4P5YA 3DYMA 2VZVA 5J1XA 4CUAA 3T09A 3K77A 1L7QA 3I3EA 2JKXA 3K75B 3OGVA 2QQIA 4M4RA 3ACIA 3T2PA 2VL4A 1UYYA 1ULOA 3P6BA 2Z4FA 3NQHA 5CZKA 1RYYA 2W9XA 2QQJA 1JI6A 4QAWA 1PX3A 4A4AA 1UWWA 4MOAA 3CMGA 3HN3A 5IFTA 5EIYB 1BHGA 3I2IA 2C9KA 5JR2A 4OUEA 2HYXA 1K3IA 4W50A 5HPOA 5DPNA 1NX9A 1D7PM 2BGPA 2W1SA 1JYVA 5C71A 2Y64A 2J1AA 2BZDA 3T08A 1UY3A 2J1EA 4CUCA 2W46A 2VQTA 2W1QA 5IJRA 4UAPA 2W47A 2OKXA 3WNMA 3I3BA 3THCA 3VD9A 2ORXA 2ZEXA 1JZ8A 1GQPA 2ZEWA 5C70A 4ET7A 2W87A 3THDA 3ETPA 4MGQA 4ARXA 2WDBA 3SKJE 4P08A 4CU7A 3OG2A 1ULPA 5JXGA 2YC2A 2WZEA 4MGSA 3K4AA 1TVGA 2VM9A 2VMFA 3W5NA 3FHQA 1HN1A 1UYXA 2VZSA 1H6XA 3IAPA 3WNPA 3W5MA 5IHRA 3ACGA 4OYUA 4IUGA 2RJ2A 3WNNA 3WEZA 4GWJA 4CU9A 3LPFA 2JE8A 1UYZA 1JZ3A 2J1SA 4BK5A 1OH4A 3VDAA 3DECA 4E8CA 3I2FA 3D3AA 2VTFA 2VZRA 3LEIA 2X09A 2VCCA 3T0BA 4OMDA 2QQLA 5EJ1B 1T2XA 3DYPA 2VJXA 3OEAA 3GDBA 2W3JA 2DCJA 2Y6LA 3GGLA 3HJRA 4XUOA 3MO4A 3T0AA 2LS6A 1EUUA 2BGOA 1SHWB 2VZOA 4JKMA 2VMDA 3EB7A 2WAOA 3LEKA 3SKVA 1O59A 2VCAA 3I3DA 4DXTA 3GXUA 2W1WA 4DXSA 3CKHA 1K12A 2YFZA 2DCKA 3LEGA 1NKGA 4PQQA 3IIIA 4BJ0A 1I5PA 2Y6JA 2XQXA 1GUIA 2ID4A 2E26A 1CZSA 5LA0A 4KMQA 2QQKA 1L7RA 4L0PA 1JHJA 3A22A 3C8XA 4BK4A 3CDZB 3J7HA 3OEBA 2JD9A 3VDBA 2VZ1A 4LQRA 1DP0A 3I2HA 5EJZB 1MPXA 2VCBA 2YB7A 3HEIA 3IDAA 5B4NA 3LPGA 4OMCA 5JXHA 3WNOA 3HOBA 3K4ZA 4XUPA 2VZQA 4QB1A 4D8MA 3T0DA 5B4XA 2W92A 2XONA 2WUHA 4XUTA 4A3ZA 4UI9L 2VMEA 4A41A 2BERA 2QQOA 3BN6A 2ZEZA 1XPWA 3GM8A 1W8OA 4QB2A 4YPJA 4QX1A 3CIHA 4ZZ5A 2QBXA 5FUIA 2C26A 2QQMA 4RN5A 4D0QA 2VMCA 2J7MA 1GOFA 2V4VA 4JKLA 3C7EA 3WF1A 3WSOA 3SEPA 4QX3A 5IYYA 2VR4A 1XNTA 1JU3A 2C4XA 3HNBM 1F4HA 2J1TA 4LHSA 1UY0A 1JYXA 2EICA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

4KNCA 4Y5TA 3WOGA 3O1PA 3RYPA 3URFA 1QOOA 1E57A 1QJZA 1WLWA 1RTVA 1GWMA 3UV9A 3I3MA 1HXS3 1RUE3 4DIQA 1MS3A 2WWUA 3LQCA 4XAAA 2XBO3 3DYOA 2WQ8A 4UBGA 4YG3A 1OLMA 4HSLA 2XUEA 1EPWA 1V70A 1VBC3 3U0ZA 2RS53 2E9QA 3I2KA 4NAMA 1JZ5A 1QKQA 1QOSA 3VD5A 3VZMA 1O5LA 1H2NA 1PMHX 1U5XA 5FZBA 1NA1B 4CE8A 1ND3B 1W2TA 4B29A 3R0RA 4TLFA 5JI9A 3QACA 1R093 5FPZA 4I2OA 4ATFA 2B4KA 5L9VA 3NJXA 1DGWA 3ATGA 1D2SA 1DQ1A 3UNPA 5DZGA 4JGZC 3O0WA 4L8QA 5ACA1 2DTWA 1VBD3 5FYZA 5FWEA 1LNSA 3WF2A 1ND2C 3AYDA 4XACA 2Y60A 5D2AA 3MICA 2D6KA 4FPGA 1YEWA 5GZGA 3ZFFB 1MS5A 3PUAA 4FPLA 4O9EA 4PF1A 4LK7A 2C0ZA 1B09A 4R4XA 4BPZA 2XL7A 2W39A 3QD6A 4FP2A 1CAXB 5LW9A 1QGLA 3T4HB 4A42A 3AZWA 4QDSA 1GSLA 2XG3A 4K3UA 4A7YA 5CFCB 4K6BA 5C4WA 4K8RB 4PIZA 4OHYA 4XF3A 2KA3A 2Y6KA 1W2AX 5ABJC 2B9UA 1LR5A 5ERLA 1DLCA 2AUYA 1C57A 2LALA 5BNOA 3MF6A 1QH7A 4EJRA 1AXKA 1K5MB 5FYBA 3KZ4C 3OJBA 4D6SA 1LAJA 1WMXA 3DGTA 5F9TA 5LCWL 2BU9A 1C3HA 5LB6A 5AFBA 2ZGOA 2PAMA 4KH9A 5CAZA 2X10A 3RWNA 5JOZA 3TEZA 5HBAA 1GMMA 1COV1 1POV0 3JUUA 1D2QA 2ARAA 3VUOA 5BNPC 4NJ4A 2VC9A 3WG2A 3SEEA 3KF3A 1W8WA 2X05A 2GZWA 3AMPA 4OVEA 2VGDA 1QH6A 3WD5A 2VULA 4DZGA 2ET7A 5KC6A 2JXAA 2J22A 4ARYA 1WLTA 1MZEA 1JUHA 2VH9A 1PZ8A 2CAVA 4IE4A 3AYAA 1J3QA 1W6PB 3EBRA 4OI0A 2O8QA 3G7DA 1WLCA 2X29A 2XWJB 4CZSA 3ZYPA 5FWJA 4Q0SA 1HRV1 2GDFA 4HXCA 2WSUA 2AREA 2VOKA 1IQDC 3TN93 2YG0A 2HWF3 3H9AA 3KQ4B 3E97A 3RI9A 1UW8A 1ULCA 3ZN5A 4DY5A 4NIIA 4HBNA 2XH6A 5C4WC 2P6CA 4P9IA 3RZGA 1JODA 4BMBA 4CCJA 1JOPA 2DVDA 2XJVA 5LEKA 2UWAA 2XGXA 1QDCA 4GH4C 3AP7A 2V72A 3WT3A 3E6DA 4NOTA 2GNDA 4AVAA 1SPPB 4LK6A 4WVZA 5AVAA 5BNOC 4UBHA 2OXBA 2BOIA 3WQBA 2R062 5FZKA 1XYPA 1BJQA 1XNAA 1NT0A 1VAKA 1NCRB 2VPVA 3BYWA 3U75A 3ZIXA 5L7OA 4RR3A 1W8FA 4FSJA 2D44A 3LB9A 1AUYA 3GZAA 3VBRB 5C9AB 3BTAA 1A8DA 1UNBA 4PLMA 2JG9B 4MLOA 4AAPA 1QMJA 1X50A 1XU1A 1W99A 4GQ7A 1S0FA 4O65A 1AF9A 4UT5A 4Y1YA 5A32A 3K4DA 4NAOA 5JWPA 3KGZA 3I2GA 4LHLA 1PO23 1RHI3 2AGSA 4QKFA 5BNNC 5JUVA 1SLLA 1FPN2 3N9LA 2D6MA 1JYNA 2CSGA 1YXWA 1F5FA 3BVCA 4NUBA 3KT1A 3TYJA 4XFAA 1HXS1 5GLWA 5CYYA 5A7SA 2Q1FA 3UETA 4CA9A 5A1AA 2XBO1 3AJYA 4E2SA 4FTEA 2WJSA 3QLQA 1CVNA 1OD3A 3H1MA 1V9U1 2VZTA 1CPMA 1VBC1 2RS51 4Y1UA 3NNLA 2NLRA 5FV3A 2VNOA 2WO2A 2RR12 5GALA 1W3VA 4MSVA 3V64A 3CZUA 4GALA 2VW1A 3ILRA 3RDIA 3UESA 1JZ7A 4CTEA 4CU6A 4XJWA 4RFRB 4YW3A 3JQWA 1VRBA 3DCQA 5IT6A 3Q8EA 2WNUC 3MLJA 3N36A 1QJU3 3J4UH 3B69A 2I2SA 1DFQA 3VD3A 1H30A 3K3NA 4CEYC 1O5UA 1OF4A 5JPNB 5E16A 3SLIA 4DEVA 1SBDA 2CAUA 3R6SA 1DQ2A 1NUKA 2WZ8A 3GF6A 3VDDB 3WDTA 1TMF2 1CAWB 4RR3C 3ZDVA 4IGQA 3Q8FA 3JXSA 5C5UA 3J9SA 3JBG1 1TEIA 2QQNA 1NZIA 4MH0E 2YZ4A 4H3WA 4Q26A 4UOJA 5KHHA 5AFEA 1HQWA 5KHIA 1RUD2 2IXIA 1Q8VA 5FZ3A 4Y20B 5A7PA 3FN9A 2ZGLA 4YW6A 3ASIA 3KCXA 4P9YA 1OFSA 2ZKNA 4N8MA 1H1AA 5JSPA 4URTA 4LJHA 5C8WA 4IESA 2ARBA 1NY71 2MEV3 1CJDA 3UKVA 5I0SA 3GJBA 1CX1A 1GNHA 1QJY3 3P5BA 4YFWA 3NNGA 4GWIA 4I30A 4RS5A 1US3A 3WNLA 4CDUB 1WLDA 5I8TA 1HRI3 5LRSA 2ZEYA 1W9SA 3ELNA 4RFT0 5A6YA 5KC5A 3OBAA 1BEV3 1C8M1 1OC1A 1YQ2A 3CJXA 1DF0A 4UF0B 1LRHA 1PGW1 1S0DA 4Y4YA 4FAHA 1S4CA 3VD4A 2EF6A 1VBE1 3AYEA 5C33A 5FAXA 1V6NA 1STMA 3USUA 4NHYA 1JYCA 4HMZA 3ZYHA 1VBB1 1X7NA 1R64A 1SCSA 3O1TA 1RMU3 1JBCA 4KWJA 2YFUA 3GCXA 1W9WA 5FXZA 4CCNA 1X9TA 3OGJA 3H42B 1PM7A 4Q4V2 3POJA 1HN0A 4LHKA 4JDNA 2WZR1 1Z78A 3WG1A 1NA1A 1TNFA 1ND3A 1VBA2 2VZVA 2WA3A 5J1XA 4ISQA 5I8SA 1WA6X 2ZCWA 2QCSB 1GP5A 2FZ2A 3I3EA 3TN91 3UYJA 1S0IA 4META 3WVJA 1KFXL 3I3QA 3OGVA 4Q5OA 4M4RA 4XJZA 1XOYA 3T2PA 4LO8A 5C6CA 2GN3A 5FY8A 4QXKA 4NRPA 1AL21 2ETEA 3AXDA 2Z4FA 3RMXA 5FYCA 3UGHA 3EXUA 1ZZ8A 1RYYA 1YFUA 2BNOA 2DVFA 3VZOA 1JMUB 4AVVA 4QWNA 3RI8A 4JTOA 1CAXA 3HIFA 3M4FA 2H6BA 2P5BA 3S30A 4BZ4A 5JZGB 4MOAA 4W6XA 4GMP1 3H8XA 5EIYB 2JG8B 4RS5C 1RINA 4NPLA 3LIHA 4R8HA 3POFA 3RJRA 4Y33A 5GLVA 4R9DA 1H2LA 4ZKTB 5DPNA 4CSWA 1NX9A 4N53B 4XJ8A 3RZJA 5LY2A 2BGPA 4PJYA 5H9QA 5FLHA 2XJUA 2UY9A 3VZKA 2ZKLA 4NIAA 2CHHA 2WWSA 1ZRRA 4GB33 1PO13 1MVEA 1PO21 1K5MA 1W0OA 2OZJA 4IV3C 4YVSA 1AR93 1FOD2 1LENA 4NPRA 3T08A 3LD8A 2ZGNA 3PMEA 5IJRA 2FD8A 3IDCB 2W47A 4PLNA 5FZAA 1DCSA 5EPAA 2OKXA 4LOSA 3WNMA 3I3BA 3FLTA 1TNRA 5JIUA 1DZTA 3WUDA 1GQPA 4M00A 4IV1B 1S2BA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2YC4A

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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