2YC4 | Genus

Total Genus 26

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	26
sequence length	135
structure length	131
Chain Sequence	MKDYAREENGGLVVMASCSDERFPPENMLDGKDNTFWVTTGMFPQEFVLRLESCIRVSKITTLSLNVRKLAVEKCDQDKPDQFEKVFEVELANLQTEVHQVNIRAKYLKFILLQGHGEFATVNRVSVVGGD

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal Structure of the Intraflagellar Transport Complex 25/27. pubmed doi rcsb
source organism	Chlamydomonas reinhardtii
molecule tags	Transport protein
molecule keywords	INTRAFLAGELLAR TRANSPORT PROTEIN 25
total genus	26
structure length	131
sequence length	135
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2011-03-11

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.60.120.260	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Galactose-binding domain-like	2yc4A00

2VZUA 2J7MA 2HLEA 2VQTA 2E32A 2RJ2A 3FL7A 4ZY9A 1SDDB 2Y6HA 1GUIA 4XUPA 1JZ8A 3LPGA 1DYOA 2VZQA 2VZ1A 1GMMA 3MV11 1EUTA 4RN5A 2XOMA 4MOAA 3DYPA 3HPNA 2Y6GA 2VMCA 2J1AA 3K4DA 2XQXA 2WQ8A 5JXIA 4JX0A 4UAPA 1O59A 3P1IA 1CX1A 1EUUA 3I2HA 1GOHA 2ORXA 2LW8A 2WO2A 5G05L 2XHNA 3OGSA 2YC4A 2B4KA 4OMDA 2JD9A 2Y6KA 4P08A 1XNTA 1K42A 5HXMA 3VD7A 3C7GA 1JYVA 1RYYA 3IAPA 2VZ3A 4A3ZA 2W46A 1O8PA 4Z2AA 2ZEXA 2Y6JA 3MV01 3WSOA 2YB7A 4FI9A 3K75B 1CZSA 1UYXA 2E31A 3I2JA 2CDOA 2OKXA 1JU3A 1GNYA 3VD3A 2BGPA 4BDVB 2VMEA 1W8OA 1ULOA 3OGVA 4A42A 4CUAA 5IFPA 2ZEZA 3EYPA 2QQMA 2VOTA 4HG6B 1JZ7A 2W87A 1K45A 4BK4A 4OUEA 1W9TA 3LEGA 4A6OA 3D3AA 3OEBA 2W95A 4DXTA 5LA1A 2VL4A 1JZ2A 3LE0A 5IJRA 5C7GA 4CVUA 3FN9A 3HJRA 1SG3A 4DXRA 4CU6A 2E26A 2WBKA 4QPWA 1UY3A 2WAAA 4LQRA 4TTGA 1UY0A 4XUOA 2WUHA 4M4RA 4DEVA 5B4XA 1PX3A 1UY2A 2XONA 5DPNA 3UETA 1NX9A 3VD4A 2VZVA 1H6YA 1BHGA 2Z4FA 4PQQA 3K4ZA 1F4HA 4QB6A 2Y8KA 4CU7A 4KMQA 1CIYA 3NJXA 4OYUA 3I2IA 3WF3A 4DEQA 4ARXA 4KI5M 2V72A 4RYDA 3T09A 4QAWA 2LS6A 1US2A 2EIEA 2VO5A 3GXUA 5F7UA 3F2ZA 4XVHA 2VZSA 2EIDA 2QBXA 2V5DA 5LCWL 3WF4A 2X05A 1GOGA 4UOJA 4P5YA 1UMHA 4DUXA 2W1WA 1JI6A 3UESA 5JXGA 2B9VA 3HNYM 4BK5A 1HN1A 1CZVA 1OD3A 3JXSA 3ZM8A 2VMDA 5JUVA 2JE8A 3ACHA 4UI9L 2J1TA 4MADA 4JKMA 5C71A 1JYNA 4DUWA 2VCAA 3VDCA 2VTFA 3A21A 2JDAA 1H6XA 5EJ1B 3DECA 4QX2A 2KD7A 3WF1A 2VZPA 1L7RA 1NAEA 5LA0A 5I0DA 3THCA 2W1SA 4PT6A 2YFUA 1NKGA 3CZJA 4CU9A 4BJ0A 4CUBA 1JZ6A 4JKKA 1R64A 2VR4A 2WN3A 3EB7A 3OG2A 2EICA 3MBWA 3WNOA 3NJVA 3OGRA 4QDSA 2W3JA 3W5MA 3UNPA 2QQNA 3K46A 4XUQA 5EJZB 4A45A 1KGYA 1UY1A 4MGSA 4D0QA 2VCBA 2WABA 3MO4A 1XPWA 4JHZA 3A7QA 1LNSA 2C26A 4GZ9A 5LA2A 2YFZA 4P02B 2VZTA 1I5PA 4CUCA 4XURA 3FHAA 4AAXA 2Y6LA 3BN6A 3HNBM 1OF3A 2E33A 3K4AA 1T2XA 2BERA 4DUVA 4W8JA 3NNGA 1YQ2A 1D7PM 5CYYA 3T2QA 3I3BA 3I2FA 1JU4A 1W99A 2YG0A 3HOBA 3IAQA 1MPXA 2BZDA 4AG4A 4LKSA 1DLCA 5JXJA 2J1RA 1UWWA 2PQSA 3C7EA 3HN3A 2RV9A 1PMJX 2W91A 3CMGA 1DP0A 3SKVA 5IHRA 5DQ0A 4A4AA 4E8DA 1W0NA 1UYZA 4IUGA 3WNKA 4M4PA 4KWUA 3LQCA 4ZZ8A 3MUZ1 3C7HA 3GDBA 4TXWA 1ULPA 3WNMA 3VD5A 1UZ0A 2ID4A 4P00B 3T2PA 5J1XA 1UXXX 2W47A 5IFTA 3E1F1 4LHSA 2VZOA 4OMCA 4MGQA 4QB1A 2V4VA 3W5NA 4ZXEA 1UY4A 3CKHA 4XUNA 3C7FA 1XNAA 2X10A 3CZUA 2QQJA 3PUHA 1WCQA 3T0DA 3GGLA 1OF4A 2QQOA 3CQOA 4A44A 3VDBA 3I2KA 5B4NA 1J83A 4QDQA 4QB2A 1GOFA 2WO1A 4QX3A 4BXSV 2L9LA 2R7EB 3T0BA 1UX7A 2VMFA 4GWJA 1US3A 3I3EA 4D8MA 4W4ZA 1OT5A 1GQPA 2WYSA 4LPLA 2HYXA 1TG7A 2QQKA 4ARYA 3THDA 1W8NA 5CZKA 2W92A 3T2OA 5EIYB 3WF0A 2RVAA 2VJXA 5A1AA 3LPFA 5JMOA 1JHJA 4ET7A 2WO3A 4W50A 3SEPA 3DYOA 3ACGA 2C9KA 4PF1A 1SHWB 2J1UA 4JKLA 3CIHA 3CDZB 3MUY1 2C4XA 3ACIA 3ACFA 3I2GA 3SEEA 3C7OA 2VCCA 1P8JA 3PUIA 3BGAA 3A22A 2WZ8A 4YPJA 1WKYA 3HEIA 1KEXA 2W94A 3WEZA 2ZEWA 3T0AA 3VD9A 2CDPA 3NQHA 5JR2A 2W5FA 2BBAA 4A41A 5JXHA 2WDBA 3C8XA 1CZTA 1K3IA 2W1QA 3IB3A 2DDUA 4CU8A 5C70A 4OZOA 2QQLA 3K77A 1IQDC 5IYYA 3IIIA 2YC2A 1W9SA 3WNLA 5DMYA 2QQIA 3WF2A 4XUTA 1O8SA 4QX0A 1K12A 3WNNA 3LEKA 4QDRA 4QX1A 1OH4A 3IDAA 2Y64A 2VZRA 3ABZA 3ETPA 2J22A 3OBAA 2WN2A 2WAOA 2JKXA 2WZEA 4ZZ5A 4MO3M 4L0PA 4E8CA 3U37A 1JZ5A 1L7QA 4GWIA 3T08A 3HNMA 3OB8A 3I3DA 1TVGA 3WQBA 1F4AA 3VDAA 4XZUG 2W9XA 3AC0A 1JYWA 1W9WA 3ECQA 5FUIA 1PX4A 3SKJE 2ORZA 1J84A 1JZ4A 1UXZA 3NRUA 2ZEYA 1PMHX 2X09A 1UMIA 3LEIA 3GM8A 5HPOA 1GU3A 2W1UA 3I97A 4DXSA 3J7HA 2VM9A 2EIBA 5G04L 2VC9A 3FHQA 5DN2A 2BGOA 3WNPA 2J1EA 1NUKA 3DYMA 2J1VA 2DCKA 2VQUA 2DCJA 3P6BA 1JZ3A 1XC6A 3A23A 1JYXA 2J1SA 1UYYA 3OEAA 2ZXQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

2UWAA 1OFNA 1LRHA 3PVNA 3VBSC 4UXAA 3M3QA 1U5XA 4XJ9A 2RJ2A 2A3XA 2ZGLA 4XFAA 1SDDB 4JV4A 2R071 3VB9A 2VQAA 1LOBA 2HWC1 2ZGOA 1GFF2 4COWA 1ZBE2 2OPWA 4HPKB 1QDCA 2VZ1A 3JBG3 3B7MA 5LATA 2EALA 1NXD1 2FCUA 5IW0A 5T50A 1IPKA 2ENRA 3C2UA 1TE1B 1W0OA 2XLFA 1HRV2 5C9AB 1Q56A 5BYNA 2P34A 4NHMA 4YZ5A 1E5SA 2JX9A 1G9AA 2XQXA 1F8VA 4RL7A 2YC0A 5JXIA 4PF5A 3N36A 4JHTA 1QQP3 2D6KA 2E7AA 2VPVA 3O5SA 3P1IA 1U12A 4I3PA 4JGZB 3PU3A 4ES8A 1EUUA 3I2HA 2VGDA 4YZ3A 1R082 2X53S 3F95A 2AEYA 1S0EA 1N47A 1PZ7A 5G05L 5C3PA 1UQXA 2XHNA 1R083 5A3OA 2XBO2 5A7NA 4DOUA 3PHMA 2BP6A 2D6NA 2XBO3 2Y6KA 2ZX0A 4IQPA 4XFFA 1T6GC 3GBFA 1XNTA 4XFCA 3BTXA 2XKPA 4OHYA 1CONA 4QHZA 3MLLA 1JYVA 1OOPB 4K1YA 1PO23 1BZWA 3RNSA 4CA9A 5C8CB 1NE4A 3GF6A 2GP5A 1W6PB 2WZPP 4QGNA 2QVSB 3WNXA 2HWC3 4C1XA 4QQLA 3JQXA 2R49A 4NWWA 2R16A 1QJU3 3H8XA 1MS4A 1Q8SA 3ZXEA 1DQ0A 3WSOA 4IV3C 2JG8B 1TMF1 2FDHA 1GP5A 1VBD1 1UYXA 2WLPA 2E31A 4GMP0 1WCDJ 3IKWA 1N1TA 4Q0VA 1NCRA 3J9SA 4AWDA 1MQTC 4S2DA 5L9RA 5JCTA 3ZFEA 1O4YA 4AQ6A 2PA7A 1GNYA 1QJZA 3M4FA 2RMU2 3ZYIB 4A42A 1W6PA 3ZFGB 1AYN1 2ZEZA 1W6OA 1UYPA 1HV0A 1UZVA 4K8RB 2CAUA 2CU5A 4QD2A 5FTTC 3WQ7A 4BU2A 1UD1A 4XCAA 2VOTA 1JZ7A 2FDKA 1RUD2 2HWB1 5K0UB 2WQZC 2ZA9A 2E7TA 1KS5A 1VBB3 1XNKA 2V09A 1DYPA 1OC1A 4IEOA 1LENA 1VBE2 1W9TA 1XE8A 3LEGA 1G9DA 3PL0A 3WZ1A 2ILMA 5CIRA 3FBYA 3ASIA 1VBC1 2W95A 4AHXA 3PVEA 4AAPA 5FXVA 2WZR1 3R6SA 4S2HA 5AC92 2EAAA 1TEIA 4CDQA 5L19A 1BEV3 2P17A 4CVUA 1FMD2 1AR63 2VU9A 2AREA 4XACA 3ZMNA 5K0UA 2E26A 4QKDA 3VBFC 5IVEA 2H0BA 3ZLIA 1AR91 2WFF2 3VZLA 1WZXA 5FJKA 5FXZA 1UO9A 1UY0A 3IIAA 3HMYA 4IETA 4XUOA 2MNGA 2CNAA 5EP9A 3N9LA 4XQDA 5B4XA 3FLTA 4AVTA 1UY2A 4ITCA 4Q4W1 5HCHA 2UYBA 2XONA 4RS5B 5DPNA 2ZAHA 3KV6A 4HVRA 4IEVA 1QDOA 3UETA 3POGA 3WP6A 2Z4FA 3I49A 4PQQA 5GLUA 1ASJ3 3RFRA 4Z07A 2VVFA 4CCKA 4FOWA 5CNAA 1WBLA 3NJXA 1GR3A 4V2WA 1PO13 3L2YA 2XMLA 5GKAC 3I2IA 2B46X 2VUDA 3MPPG 5BNOC 3ZN4A 2GNBA 3PTYA 4WM8A 5ERLA 1GICA 3WDXA 2UWBA 3LSDA 5FPBA 2I45A 3VL8A 2WYFA 4CSWA 4F8AA 2V72A 1AJKA 1BQPA 4JGYA 3UKNA 1GSLA 1OOPA 3T09A 1LEMA 2WNUA 4OQ8A 1J3RA 4QAWA 2EA7A 5LA9A 3RG0A 2AACA 1US2A 1OOPC 4FPGA 1DYKA 5IK5A 3UJOA 2VZSA 3AFKA 1RXGA 1FATA 2E63A 5LCWL 5BNQA 1GZ9A 4EJRA 4INDA 4XJWA 4ASLA 5BNPB 3J7LA 3INAA 3BU7A 4UOJA 4XE9A 1UMZA 1UU5A 4CDUA 1LOGA 3SXWA 1W2AX 4KBBA 1UMHA 4P5YA 3SMHA 4WZFA 1S0FA 1H1AA 4DUXA 1W8HA 3HAGA 3ZR5A 1HXS1 1TMF2 3JBG2 4XF9A 1BJQA 1HN1A 3DXTA 4YW6A 4AVAA 2G19A 5LRSA 4YW5A 5FMCA 4OUSA 4L92A 5DUXA 3T4VA 2WWUA 4BXFA 3ZXLA 5T54A 5LBFA 2Y0IA 2P3KA 4ATEA 1RB8G 3LA7A 5EYYA 2XL7A 5FUNA 3ZSEA 1QJY3 5IVJA 5JPMB 3SCFA 3LWCA 2XQRA 3DCQA 5C71A 4IV1B 5ACA2 4MGTA 4N53A 5SV5A 1DF0A 2FHRA 5T52A 1V6KA 2MEV3 2VTFA 5A3UA 2JDAA 4E2GA 4MYEA 2MEV2 5IVVA 2J42A 1OA4A 2OUHA 2G9GA 3ATGA 3H3ZA 4GWNA 1IPJA 1GP6A 3JD73 3MGUA 1NG0A 4LBQD 2DFBA 5T5OA 1FOD1 2D6OX 1D2QA 4AHZA 4UF0B 5JZGA 5B2GB 5F3IA 3KZ4C 2IXHA 3IPVB 4B8EA 1LU1A 1SPPB 4NRMA 1CAVA 1OUSA 5KXCA 5FQ0B 1KS4A 1QXJA 2CGOA 2VH9A 4EWAA 5JI7A 5CA6A 2PHDA 2YFUA 2ZGUA 1NQDA 2JG9A 3CLPA 3CZJA 4XBNA 4XABA 3AKQA 2JDKA 5DUUA 5LASA 3OUJA 4TWTA 3ZMOA 3EB7A 1AL23 4N43A 5CU1A 4CP0A 1FV3A 1S0IA 5AFEA 4HBNA 4O61A 3Q8AA 2JJ6A 5A7QA 3SH3A 3ZSLA 4FOQA 3I2OA 5LY1A 1I9RA 3W9AA 3HBKA 5HV0A 3UNPA 3T2TA 4FPJA 2Y33A 5I8SA 3NVCA 4AVSA 4IW3A 1JYIA 2NZ9A 3RI9A 2ZX3A 2C5DA 5EJZB 3WG2A 4A45A 2RE9A 5K4LA 4D0QA 1CAWA 2A7AA 4BYYA 5ABJB 5J7MA 3OY8A 2Y26A 2RS11 1XPWA 2XVLA 5A33A 4Y1ZA 4ZPIA 4GZ9A 5JOXA 5KHJA 1HX6A 3FMGA 3O1OA 1QGLA 3MIFA 4CUCA 1UZWA 5FK7A 3FHAA 1JYTA 1RUH1 3APBA 1ULCA 4XIKA 3BN6A 1TME1 3B94A 4XYXA 1OH3A 3HBZA 1RUC1 5L73A 4AI0A 2E33A 1AX1A 2BERA 2XLGA 1W2UA 4ISQA 4Q27A 4W8JA 1SLLA 2CYFA 3NNGA 3OY8B 4NAOA 1QXRA 3I3BA 4AF9A 2WL1A 2JD4A 1JU4A 1W06A 1ZM1A 1F2NA 3AYCA 3KF3A 4IEZA 1POV3 4LT5A 1YNAA 5FJHA 4AL9A 5DAVA 2XJVA 4R9BA 1LESA 4NIIA 4WVVA 4CCMA 1W8TA 4JQRA 5F2WA 2A6ZA 3NAPB 5LK7B 4QPGA 2R061 2J1RA 1UWWA 1S2KA 2PQSA 2QQPA 3Q8EA 1VRH3 1D4VB 3AYEA 4V2VA 1E5HA 1A8DA 1PGW1 2FMYA 1E57A 1DP0A 2VE1A 1UAIA 5IUQA 4A4AA 2VOKA 4E8DA 1VAKA 1W0NA 5FREA 1Q5OA 2RDSA 1PO12 2Q5TA 1GNZA 1MZFA 4AQTA 3ZFEB 4HZFA 1CD3G 4Y22B 1HJGA 1IQAA 1NLQA 2JB8A 2QE3A 4Q8KA 3PUAA 1HRI1 3ES1A 4HKLA 4XFGA 4YFZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2YC4A

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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