The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
ASDYCKVIFPYEAQNDDELTIKEGDIVTLINKDCIDVGWWEGELNGRRGVFPDNFVKLLPPLEHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Distinct Ubiquitin Binding Modes Exhibited by SH3 Domains: Molecular Determinants and Functional Implications.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
SH3 DOMAIN-CONTAINING KINASE-BINDING PROTEIN 1
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Signaling protein
|
| total genus |
10
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| structure length |
67
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| sequence length |
67
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-03-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1PHT A; 1YP5 A; 1YCS B; 4AG2 C; 2GTJ A; 1PRL C; 1U3O A; 1E6H A; 2KT8 A; 1T3S A; 3THK A; 4HVW A; 2HBW A; 2EYZ A; 2HDA A; 2EVR A; 2JS0 A; 1TUC A; 4OMO A; 3M0S A; 2DL4 A; 2O31 A; 3EG0 A; 1G2B A; 4GLM A; 1U5S A; 1UG1 A; 1JQQ A; 2D8H A; 2DE0 X; 1QCF A; 3R6N A; 1ZLM A; 2KRN A; 3EHR A; 1Z9Q A; 2YT6 A; 3I5S A; 2KRO A; 1SEM A; 3CQT A; 1E6G A; 4F16 A; 1OOT A; 2YUN A; 3PVQ A; 4HCK A; 3ZL7 C; 2C0O A; 3M0T A; 1NLP C; 2KEA A; 1Y57 A; 4GBQ A; 4AFZ C; 2JM9 A; 3SEM A; 2P4R A; 2ENM A; 1M3C A; 1SHG A; 2L2P A; 2OAW A; 4HXJ A; 1RLP C; 1CKA A; 2F2W A; 2KYB A; 1SRL A; 2RQU A; 1WIE A; 2DL8 A; 2DL5 A; 2EPD A; 2KYM A; 2C0I A; 1M8M A; 1LCK A; 1JXO A; 1MUZ A; 1YN8 A; 1OPL A; 2FRY A; 1TG0 A; 4JJC A; 4OMP A; 4Y92 A; 1MV3 A; 1W1F A; 2YUO A; 2O9S A; 1I1J A; 1T0J A; 3H41 A; 4IIO A; 1KSW A; 1WXB A; 2DRM A; 4RTZ A; 2L3P A; 5I22 A; 2A28 A; 4IIM A; 5IHN A; 2RN8 A; 3GBQ A; 2OJ2 A; 2DNU A; 1NYG A; 2FPE A; 3VS5 A; 1WXT A; 2K79 A; 3O5Z A; 2CT3 A; 1SRM A; 3ULR B; 2RQR A; 2I0N A; 1UDL A; 2J06 A; 1UUE A; 1Z9Z A; 2LMJ A; 5L23 A; 4RTU A; 2LQW A; 2MCN A; 4LE9 A; 4JZ4 A; 5IHK A; 5FWB A; 1K9A A; 2DL3 A; 2L3S A; 4RTT A; 2GTO A; 1QWE A; 4CC7 A; 4DEX A; 2AZV A; 2OI3 A; 2HEQ A; 2JTE A; 3M0R A; 1UGV A; 1VYT A; 2DJQ A; 2X3X D; 2CH4 A; 2JMC A; 3M0U A; 2FEI A; 3QWX X; 3I5R A; 2RNA A; 1PKT A; 3FJ5 A; 3IQL A; 2V1R A; 3NMZ C; 2D1X A; 2LX7 A; 2M51 A; 1HSQ A; 3KFV A; 2VVK A; 2MOX A; 2YUQ A; 1GFC A; 2EQI A; 2J6F A; 2BZX A; 4ORZ A; 1V1C A; 1BK2 A; 3VS1 A; 2GBQ A; 3M0Q A; 2PNI A; 1J3T A; 2EW3 A; 2DRK A; 1BU1 A; 3PVL A; 4R0K A; 4CC4 B; 1GCQ A; 2LJ3 A; 2F2V A; 1AVZ C; 2HSP A; 2KXD A; 1PRM C; 2CRE A; 2O88 A; 4JJD A; 2L3Q A; 2KBT A; 3REB B; 2D8J A; 2EGE A; 1U06 A; 2YDL A; 4KRT A; 3UA6 A; 3RBB B; 1JO8 A; 2PZ1 A; 1WFW A; 2CT4 A; 4E6R A; 2DMO A; 4WCI A; 1GBR A; 1JEG A; 1IO6 A; 1T3L A; 1X69 A; 3VS4 A; 3RNJ A; 1AWJ A; 2W10 A; 4HVU A; 2KE9 A; 1JXM A; 2VKN A; 4LNP A; 2JMA A; 2AKK A; 2GNC A; 3I9Q A; 1YWO A; 1XOV A; 3NGP A; 2LJ0 A; 2F2X A; 4AFU C; 2K2M A; 1SSH A; 1QKX A; 1I07 A; 1RUW A; 3VRZ A; 2H8H A; 1BBZ A; 2YUP A; 1PWT A; 2G6F X; 2EYX A; 2DX1 A; 1ZUU A; 4RTY A; 2RQV A; 2DM1 A; 1ABO A; 1PKS A; 2DVJ A; 1YWP A; 2J6K A; 2FRW A; 2DA9 A; 1B3Q A; 1NG2 A; 4Z8A A; 1KFZ A; 3VS6 A; 1AEY A; 2KR3 A; 4CC2 A; 1ZUK A; 2RPN A; 3REA B; 5IHI A; 2SEM A; 1ZBJ A; 2A36 A; 1WA7 A; 1JU5 C; 1X6G A; 2EYW A; 3PE0 A; 1UE9 A; 2AZS A; 2KT1 A; 4J9I A; 1UEC A; 2J05 A; 3VRY A; 2D0N A; 1WXU A; 2EKH A; 3I35 A; 1H92 A; 3U23 A; 1AWO A; 2LCS A; 2YSQ A; 1AWW A; 1K4U S; 3TSW A; 1X43 A; 4LN2 A; 1VA7 A; 2CH4 W; 1UTI A; 2ECZ A; 1CSK A; 2C0T A; 3EGU A; 3VS7 A; 1CKB A; 1M3A A; 4LUE A; 1UHC A; 2CDT A; 3SHW A; 2K3B A; 1AZG B; 2LZ6 B; 2AKL A; 2GGR A; 4CC3 A; 5IXF A; 5HCK A; 1Y0M A; 2B86 A; 2JW4 A; 4J9H A; 4J9F A; 4JJB A; 1OEB A; 1T0H A; 2PTK A; 2RQT A; 3A98 A; 1HD3 A; 4D8K A; 5EC7 A; 2RMO A; 1GBQ A; 3VS2 A; 4AFS C; 1UJ0 A; 5GJV B; 1AOJ A; 2W0Z A; 2RF0 A; 3LH5 A; 2AK5 A; 4F17 A; 2ESW A; 3VS0 A; 1G83 A; 2DYB A; 3EG2 A; 2EGA A; 2ED0 A; 2LNH B; 1N5Z A; 1NEG A; 4JZ3 A; 1YNZ A; 1AWX A; 2EGC A; 5IXB A; 5ECA A; 2EBP A; 2XMF A; 2ROT A; 1H3H A; 2FPD A; 2RQW A; 1WLP B; 4J9D A; 2KXC A; 1GFD A; 4DEY A; 3EG1 A; 1GCQ C; 2DF6 A; 3VS3 A; 2K7A A; 1VYV A; 2NUZ A; 3H0H A; 3QWY A; 1ARK A; 2JM8 A; 2CUB A; 4RTW A; 4Z89 A; 4Z88 A; 3M0P A; 4EIK A; 1SPK A; 2K9G A; 4ESR A; 4OMN A; 1QWF A; 2KNB B; 2LQN A; 2GQI A; 4JPB W; 2LJ1 A; 4M4Z A; 1ZX6 A; 2CSQ A; 1X6B A; 2V1Q A; 3JV3 A; 1NM7 A; 4ZNX A; 1GL5 A; 1ZUY A; 3H0F A; 4QT7 A; 4X1V A; 3UA7 A; 3UAT A; 1K76 A; 2JS2 A; 1SHF A; 1RLQ C; 1X27 A; 1VYU A; 1RI9 A; 1UFF A; 1K0X A; 2BZ8 A; 2DL7 A; 2EYY A; 1KIK A; 3TSZ A; 1GRI A; 3EHQ A; 1QKW A; 4K11 A; 2NWM A; 4RTX A; 2JT4 A; 2LP5 A; 1UJY A; 4AG1 C; 1WI7 A; 2K6D A; 1UHF A; 2JXB A; 2KRM A; 4D8D A; 2FG0 A; 5GJW B; 1M27 C; 2O2O A; 2J7I A; 1ABQ A; 2ROL A; 4LUD A; 1HJD A; 3C0C A; 2L0A A; 1H8K A; 2IIM A; 1AD5 A; 4RUG A; 1I0C A; 2DIL A; 2X3W D; 1M30 A; 2BTT A; 2FO0 A; 1EFN A; 1AZE A; 2DBM A; 4A63 B; 5I11 A; 5FW9 A; 2A37 A; 2BZY A; 2M0Y A; 2VWF A; 1TUD A; 2SRC A; 1X2K A; 2O9V A; 1K0S A; 4OML A; 4OMM A; 2MIO A; 4OMQ A; 4FSS A; 1FMK A; 1ZSG A; 4J9E A; 1A0N B; 3H0I A; 2KGT A; 1GCP A; 1KJW A; 3NHN A; 1OPK A; 2ABL A; 4AFQ C; 2ED1 A; 5IH2 A; 5FWC A; 3NPF A; 3TVT A; 1MV0 B; 2HCK A; 2CUD A; 1NEB A; 1WDX A; 3UF4 A; 4HVV A; 1OV3 A; 2E5K A; 1NLO C; 4F14 A; 1PNJ A; 2DLP A; 4J9B A; 1QLY A; 1W70 A; 4J9C A; 1B07 A; 1S1N A; 2KRS A; 1E7O A; 4J9G A; 1X2Q A; 1K1Z A; 3EG3 A; 1BB9 A; 2CSI A; 2QDL A; 1WX6 A; 4RTV A; 1WYX A; 1FYN A; 1NYF A; 2FPF A; 2A08 A; 1W6X A; 1M3B A; 2DBK A; 2J6O A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4YTL A; 1IZ6 A; 4AG2 C; 4KUD K; 2RHX A; 1ZBX A; 3G1J A; 4D6W A; 4PJO A; 1S72 A; 1E6H A; 3CCQ Q; 5LJ3 d; 3LLR A; 4PNO A; 2EYZ A; 1VQK A; 3UT1 A; 2JS0 A; 3X20 B; 1TU0 B; 2O31 A; 2F1L A; 3D7S B; 1X6O A; 5CKE A; 3RKX A; 2DXB A; 1U1S A; 4HT9 A; 1UG1 A; 2A7Y A; 2D8H A; 2RJF A; 4QQ6 A; 3G6E A; 4BY6 C; 2KRN A; 1Z9Q A; 4TVR A; 2YT6 A; 4A4F A; 3PT9 A; 4F7U A; 1M2O A; 1SEM A; 4XTY A; 2LQK A; 2YUN A; 3PVQ A; 4M7A A; 3M0T A; 2QAS A; 3CD6 Q; 4KBM B; 4HCZ A; 1NLP C; 1Y57 A; 3SEM A; 2P4R A; 1RAG B; 4BI3 A; 1M3C A; 2OAW A; 1UEB A; 4HXJ A; 3CCE Q; 3JCM V; 1LOJ A; 4PK4 A; 2MMP A; 5GAO q; 4JLI A; 1QVG S; 1SRL A; 2DL8 A; 3OMC A; 4OF1 A; 1WHK A; 2NLU A; 1MUZ A; 4PJO E; 1Q82 U; 1QCO A; 4OB3 B; 2FRY A; 3ZEH A; 1TG0 A; 1TUG B; 3CCQ A; 1KHC A; 1OX9 A; 4M77 C; 2X35 A; 1X75 C; 4KGV B; 2PVD B; 1WXB A; 2L3P A; 4NOY A; 2A28 A; 1Q7Y R; 1K8A R; 1MMG A; 1NYG A; 4IUT A; 1WXT A; 2K79 A; 3O5Z A; 1M8V A; 2RQR A; 2VXE A; 2J06 A; 4PJL A; 4F7U E; 5KYU B; 2LQW A; 3CXC S; 2P0K A; 4M7A E; 4M7D E; 4M78 G; 4EDU A; 1MMD A; 2DKG A; 1FMW A; 3HFO A; 5FWB A; 4A4H A; 2CZ7 B; 2K3Y A; 4QVC A; 2DL3 A; 4RTT A; 3CD6 A; 3BW1 A; 4C92 A; 4FCY A; 3C4S A; 4A4K A; 1D3B B; 2HEQ A; 3TU4 K; 1ZHI A; 1FXX A; 4BDY A; 2X3X D; 3CCE A; 3MKD A; 1C6V X; 4DA4 A; 3FJ5 A; 4ELZ C; 2E1H A; 5LL6 S; 3QJY A; 3JCM b; 3NMZ C; 2LX7 A; 4J83 A; 2VGM A; 1HSQ A; 2YUQ A; 1PSE A; 1BK2 A; 2L5Q A; 3M0Q A; 1OUL A; 4FYY B; 2EW3 A; 2VUB A; 2NUP A; 2FYK A; 2I2L A; 4R0K A; 4M75 C; 2FL7 A; 1R77 A; 2HSP A; 2A0F B; 2KXD A; 2EGE A; 1VQ4 T; 1H64 1; 3SWN B; 4KRT A; 3URG A; 3UA6 A; 2PZ1 A; 2D9T A; 1YJ9 Q; 2DMO A; 5J3B A; 3VS4 A; 4C92 E; 2W10 A; 1UGS B; 2KE9 A; 4OGE A; 1JXM A; 1N9R A; 2AKK A; 4B9W A; 5GAN d; 2JOY A; 3I9Q A; 5GAO m; 2HQX A; 4N0A C; 3KBG A; 5GMK l; 2R58 A; 3QBY A; 1YI2 Q; 2Y90 A; 3FEO A; 4AFU C; 1SSH A; 3EFR A; 4C5G A; 5FU7 C; 5KYX A; 4Y28 E; 2QTV A; 4C0D B; 1D3B A; 3UPU A; 2EYX A; 4RTY A; 1ABO A; 1M2V B; 3E9F A; 2J6K A; 3KUF A; 3L2Z A; 3J81 E; 1B3Q A; 4XQ3 A; 4XTZ A; 3QPH A; 1K73 R; 1O9S A; 2DPP B; 1AEY A; 4BDZ A; 1JRI A; 1ZUK A; 5CR2 A; 1XTD A; 3I56 T; 2PVO B; 5M9O A; 4LDX A; 3E19 A; 3A5Z B; 3OW2 A; 5HK0 A; 1UE9 A; 2EKO A; 4IUR A; 1JB0 E; 3VRY A; 1WXU A; 1OX8 A; 4BI4 A; 1QP3 A; 1SKU B; 3U23 A; 3HPW A; 1AWO A; 4KH1 B; 2LCS A; 1YJ9 A; 1FX7 A; 3TSW A; 1YHQ Q; 1X43 A; 1N6A A; 4EPC A; 1RI0 A; 4LN2 A; 2QGF B; 2C0T A; 5GAO n; 1YIT Q; 1M3A A; 2QA4 T; 1ZSZ C; 2HL5 C; 2H3E B; 1YI2 A; 2PUK B; 1AZG B; 1HXD A; 2DXC A; 1Y0M A; 2B86 A; 2JW4 A; 2L89 A; 4V2S A; 2ZCF B; 5GAN h; 2DJZ A; 4JJB A; 1VQ4 Q; 1OEB A; 3HHT B; 1OYX A; 4D8K A; 1H3Z A; 1Y71 A; 2ATC B; 1GBQ A; 1M9S A; 4AFS C; 4FL6 A; 2F5K A; 4II1 A; 3HRS A; 3L2R A; 1BI1 A; 2RF0 A; 2AK5 A; 2CZ6 B; 2GF7 A; 2JTM A; 3QXE B; 1G83 A; 1OU9 A; 4M78 B; 3EG2 A; 1N9S A; 4HT8 A; 3CCS T; 5ECA A; 3GP8 A; 2EBP A; 1TH7 A; 1TWB A; 2RK2 A; 2X4W A; 1Q7Y C; 5KH6 A; 2XMF A; 1M2V A; 2ROT A; 1K8A C; 1H3H A; 1VQ6 T; 2KXC A; 1EIF A; 4N4H A; 2M9U A; 4P5N A; 4E7L A; 2DF6 A; 1ARK A; 1Q82 R; 4PKC C; 2JM8 A; 4C0G A; 4RTW A; 4Z88 A; 3OMG A; 1YIT A; 1QWF A; 3I56 Q; 1M1F A; 2E10 A; 1GL5 A; 2WSE E; 2RI5 A; 5C0M A; 1NBE B; 4O5V A; 3UA7 A; 4M75 F; 1VQM Q; 1KD1 U; 2JS2 A; 2XIC A; 4M75 E; 1KQS P; 1VQ4 A; 1RI9 A; 2EYY A; 1D0Z A; 3EHQ A; 5CKB A; 5GAN 4; 3CME T; 2NWM A; 3CCU Q; 4KT0 E; 1BCM A; 1UJY A; 4AG1 C; 4B6M A; 3JCM g; 3JCM f; 1WI7 A; 1UHF A; 1WHM A; 2KRM A; 1R0C B; 3OYA A; 2O2O A; 3VKI A; 4LUD A; 4M77 D; 3KXT A; 3C0C A; 2QA4 Q; 2XD0 A; 1H8K A; 1ZQ1 A; 4FU6 A; 1G3S A; 4IUQ A; 2K2V A; 1AD5 A; 1I0C A; 4MDX A; 4C8Q C; 5CCA A; 4M78 A; 4C0F A; 3RER A; 2DTO A; 2DER A; 1VQN T; 2YRC A; 5CKF A; 2M0Y A; 2VWF A; 1RAD B; 2R57 A; 1Y96 A; 8ATC B; 3I56 A; 2OTL Q; 1OU8 A; 1N8R U; 1B7T A; 1K9M C; 2QQ9 A; 3TCJ A; 3CCS Q; 3V7C A; 1C0M A; 4KGZ B; 1ZSG A; 2KGT A; 2LCL A; 1KJW A; 2NUT A; 1VQM A; 2ABL A; 1TSF A; 1UGP B; 1W2B P; 3NPF A; 4N4I A; 3TVT A; 1OZ3 A; 1VQ6 Q; 2DYI A; 1WDX A; 2MWP A; 2XK0 A; 4ZN3 A; 1PNJ A; 1QLY A; 2FZK B; 1B07 A; 1S1N A; 2MI6 A; 1K73 C; 2Y4X A; 1LJO A; 3QYG B; 1QVF A; 2BE7 D; 3WXM B; 2XDP A; 3MPU B; 3OYB A; 5FRN A; 3G6E T; 2FPF A; 4C5H A; 2QA4 A; 3GIB A; 4M75 D; 4CI0 C; 3I55 Q; 2J6O A; 2E64 A; 1YCS B; 3M55 A; 1YJW T; 4J8O A; 3X24 B; 3LGL A; 5GMK h; 3THK A; 4HVW A; 1WHH A; 2EVR A; 3EFO B; 3E2U A; 4OMO A; 1TUC A; 2QAZ A; 3M0S A; 2C06 A; 1RAF B; 1G2B A; 1YCY A; 1PM3 A; 4PJO C; 2OTL A; 1IGQ A; 5CAI A; 2RHU A; 1ZLM A; 3CCS A; 1G3T A; 2YRD A; 4L59 A; 4X9D A; 1AHJ B; 3MEA A; 3QDF A; 3CQT A; 3OYH A; 4F16 A; 1TS9 A; 3HFN A; 4XU3 A; 1VQ6 A; 2C0O A; 1QQJ A; 1Q95 G; 3V8J A; 3CPW A; 3OY9 A; 4GBQ A; 2GFA A; 3MP6 A; 3LWI A; 1IRE B; 4BAC A; 1RLP C; 5LJ5 h; 4M7A C; 3AT1 B; 4M7D C; 2EJF A; 4AMC A; 1WIE A; 2DL5 A; 2QK0 A; 1Q81 R; 2HL3 A; 1WQW A; 1D1C A; 2KQW A; 3GNG A; 1JXO A; 3PMT A; 3V8L A; 1MV3 A; 2YUO A; 2O9S A; 4FYX B; 3HSB A; 4OB2 B; 1OI1 A; 4E2F B; 4L5G A; 1NJI C; 1Q82 C; 4IIO A; 4M77 G; 2DRM A; 1QVP A; 2K5L A; 4RTZ A; 3CCE T; 5LJ3 e; 5LJ3 g; 5LJ3 f; 3GBQ A; 3GOX A; 2CT3 A; 2EFI A; 4OB0 B; 2MYS A; 2QG9 B; 4EMK C; 1WJS A; 1UUE A; 1Z9Z A; 3QG1 A; 3EFO A; 5L23 A; 3MCA B; 3SB2 A; 4WTO B; 4LE9 A; 1YJW Q; 4JZ4 A; 5FU6 B; 2KVQ G; 1Q86 R; 5KYW B; 2DXT A; 4CC7 A; 2AZV A; 3VV0 A; 3FC3 A; 4ZTF A; 4MMK A; 4C8Q F; 2EIF A; 3RKY A; 2CH4 A; 2JMC A; 2DIQ A; 4E47 A; 2FEI A; 4OVA A; 1NPR A; 2RNA A; 1I5L A; 3IQL A; 4C92 C; 2COY A; 1KC8 U; 2JNG A; 3OBW A; 5I2S A; 4BE2 A; 4KUL A; 3NTI A; 5KE3 A; 2VVK A; 1VIF A; 2MOX A; 1GFC A; 4XU0 A; 3OW2 P; 2BZX A; 1V1C A; 4VUB A; 3OYM A; 1KD1 R; 1VOM A; 1XNI A; 1IB8 A; 3PVL A; 2CGH A; 2QXF A; 2HAX A; 3JRZ A; 4DOV A; 2HQE A; 2LJ3 A; 4FW1 A; 1JJ2 S; 2V8K A; 1MMN A; 4M75 G; 2YLC A; 1QVG A; 1Y7X A; 2CRE A; 2DXU A; 4JJD A; 2O88 A; 5GAN j; 1MGQ A; 2ZPB B; 3CMA T; 2YDL A; 3CCJ T; 1VQP Q; 1YJW A; 1X69 A; 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