2YHYA

Structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetylmannosamine and adp
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
313
structure length
308
Chain Sequence
GTLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTGGRVNPREGIVLHSTKLIQEWNSVDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLDGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structures of N-Acetylmannosamine Kinase Provide Insights Into Enzyme Specificity and Inhibition
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
molecule keywords BIFUNCTIONAL UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE 2-EPIMERASE/N-ACETYLMAN
total genus 105
structure length 308
sequence length 313
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2011-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhyA02
5AQOA 4E1JA 2ZF5O 4BRQA 5F1XA 3KHYA 4RWTA 1U2VB 2P9IB 1ZBSA 3A5OC 4A61A 1HX1A 5FPDA 3BEXA 5E26A 1NGGA 3DXKA 2FSJA 3VEYA 2PBDA 2FF6A 4BRHA 2CH5A 1GLEG 2Q2RA 2Q0UA 4AM6A 2P9KA 1ATRA 4H5VA 1Y64A 3O08A 2DPNA 4BC3A 2P9SA 3DAWA 1NWKA 2FSKA 1BOTO 2HOEA 3WEEA 5AQHA 3ZEUB 4BGAA 1QZ6A 3AAQA 2E2NA 2VCPA 2P9KB 2A40A 3UKRA 4BRNA 4CZJA 2E88A 4NO7A 3GE1A 1GLFO 4DCHA 5F2RA 2Q1NA 4PKGA 1QZ5A 3ULEA 2FF3B 1NLVA 1SQKA 4BG8A 2CGLA 3SMPA 4C23A 3LM2A 2E1YA 1SZ2A 1X3NA 3FR0A 4K41A 2FLOA 4Y0WA 1NGFA 4MLEA 3O4WA 1V4SA 2NRHA 4HTLA 3IUCA 2ASMA 3BF3A 1K8KB 1T6CA 4PL7A 3MMVA 1NGAA 3VEZA 4I6MA 4CZIA 4BR2A 2OANA 3LDNA 4WQ5A 3I33A 3ZETA 1C0FA 3CQXA 3ENHA 2D0PA 2E8AA 4L3QA 2P9UB 5KQ8A 1G99A 3A5MC 1D4XA 3U8XA 4GNIA 5AQQA 2V51B 3R9PA 3W0LA 4BR7A 5BPNA 4PL8A 3VESA 4ISEA 3HZ6A 5AQZA 1NGJA 2UYTA 2VWBA 1HKGA 1R59O 5AFUA 4J8FA 5TKYA 1XUPO 5BPMA 3S41A 2GELA 4CBWA 3EKUA 1YXQA 4K25A 5AQUA 4GY2B 3VEOA 2A42A 1C0GA 5AQNA 2CGJA 1WOQA 5EVZA 5EY4A 3M3ZA 2QW9A 3LDQA 1QQNA 1T6DA 4JHDA 4KBOA 3SMSA 2E2PA 3P4IA 3WQTA 4H5RA 2HF3A 3GG4A 4H5WA 2A6AA 2YJFA 2QWOA 4Z94A 4FWOA 1HLUA 4MO5A 4BRAA 4WQ4C 5I9EB 4IXCA 4B1VA 1H1VA 4CJ7A 4YDUA 2PAVA 3HM8A 3W3DA 4H5TA 4BRDA 5KQDA 4I6MB 4BG9A 4BC2A 5EXWA 2FXUA 3VERA 1QHAA 3D2FB 3LL3A 1Q18A 4HWIA 4CBXA 1Z05A 5AQIA 4QS9A 3MCPA 5AQMA 2P9NB 5LY3A 1ATSA 5AQSA 3VF2A 3LM9A 4H03B 4BRLA 4FWRA 4IJAA 5KPRA 1NGIA 4B9QA 1XQSC 2E1ZA 1GLDG 2QWMA 3QDKA 3SLCA 2GUPA 3H45C 4LC9B 3CJCA 5CE3A 4IWVA 4QS7A 3H1VX 4JD2A 2QWLA 3VOVA 3IFRA 3O6WA 3CJ7A 1TYQA 2V52B 4PKHA 1S22A 5AQJA 3WUHA 3ZEUA 4BC5A 2W40A 4H0PA 3M6GA 4XH5A 2YCHA 1KAYA 1BUPA 4K43A 2P9PB 3A8YA 2E2OA 3O8MA 4FOEA 2P9LA 2VYPA 3I8BA 3VPZA 1JCGA 2ASOA 4BQZA 2FSNA 3U9ZA 4K42A 3CQYA 3DWLA 3IDHA 3QBWA 1CZAN 4FWQA 5BPLA 3EZWA 1NGEA 3WXJA 3O80A 4NB4A 3QFUA 5F0XA 3CETA 4FWPA 3GL1A 1KAZA 4A62A 5BRHA 2V7YA 1MA9B 5JMVA 2YI1A 4FWSA 3CJ9A 2A3ZA 5LJVA 1NGCA 3CERA 1RFQA 4BR9A 4JAXA 3H3OB 1MWMA 4CZFA 3UB5A 3ZX2A 2P9PA 2QM1A 1V4TA 2BTFA 3CIPA 5BN9A 2NLXA 3J8AA 4BC4A 2ASPA 3ZETB 3U9DA 2ZWHA 2A41A 3C7NB 2F9WA 1ZXOA 5AZIB 4BRFA 1KAXA 2YJEA 1DGKN 3FZFA 3AAPA 4FWMA 4FWKA 3O1WA 4DQ8A 2GWJA 4RCHA 4B1ZA 1TUUA 3CHWA 3M1FA 3QFPA 5AQXA 1ESVA 4M63C 2GEMA 5JICA 2P9NA 4CZHA 1GLBG 1BU6O 1TUYA 4ISFA 3ID8A 1E4GT 3VGLA 3EO3A 3CJ1A 4H5NA 2IVNA 3FZHA 3FZLA 1P8ZA 1U6ZA 4EHUA 2QWNA 3QBXA 2E20A 4BRCA 1QQMA 2NZTA 2A5XA 4EAHD 3B8AX 4A2BA 1DKGD 2P9SB 4BRIA 3HI0A 4JD2B 1EQYA 1U2VA 2P9IA 3QMLA 3FZKA 4FOIA 3EL2A 4JHDB 4O5FA 4MLHA 4FSVA 3UKUA 3SK3A 4QS8A 5AQRA 2ITMA 3H46O 5AQYA 2QWQA 3TPQA 4FL9A 1NBWA 2P9UA 4CD3A 4ISGA 1GLJO 3L0QA 1RGIA 3HBTA 3WXIA 4CZMA 4H0VB 3D2FA 3RSEB 3MDQA 1LOTB 4H0TB 4H0OA 3F9MA 1NM1A 3DXMA 3VGMA 3FE1A 5FPEA 1YVNA 1MDUB 2IVPA 3D7EO 4MO4A 4IZ9A 3D2EA 2GTDA 2Q97A 3VGKA 3VEXA 1BWFO 1BA1A 3WXLA 2Q0RA 2KHOA 1YAGA 5BR9A 5AQPA 4BQLA 2IIRA 3ZX3A 3OHRA 1NMDA 2W41A 1QQOA 1SAZA 3WQUA 1XC3A 3VF6A 1K8KA 5AZJA 2CGKA 3D2EB 4FWNA 1HUXA 5AQFA 5AQLA 5AQVA 3UE5A 3VETA 1DEJA 3MN9A 4BRPA 3HTVA 1Z6RA 3MK6A 1S3XA 3ATVA 4M7YA 3H1QA 3KZBA 4B1WB 2I7PA 2YHWA 4CD1A 3MN7A 4JN4A 1MWKA 4WYBA 5JLFA 2V7ZA 4IJNA 5ADXA 3GDQA 3GBTA 3A5LC 1BDGA 1JCFA 4CZGA 5BREA 3EKSA 1IG8A 3O5BA 3VENA 1ZC6A 3BP8A 3SJHA 5AQGA 2WUSA 3QB0A 3L6QA 2YHXA 3FGUA 4DHYA 4H0YB 2HF4A 5E84A 2CH6A 4BVOA 3LDPA 2J4RA 4PKIA 3UKRB 2E2QA 5FPMA 1J6ZA 2IVOA 2AA4A 3VEWA 4B1UB 5AR0A 2I7NA 1TYQB 5EOYA 4RTFD 4A2AA 1T44A 4EHTA 4F9OA 1KXPA 4YDUC 3TU5A 3ATUA 4BRGA 1BA0A 3BF1A 3WXKA 2AP1A 4B1YB 3LDOA 4DB3A 4WQ4A 3BUZB 4BREA 3VF4A 3DXKB 1HPMA 1HKCA 1IJJA 4CBUA 2ZGYA 3EN9A 1OKJA 4CZEA 3ENOA 3A5NC 2D4WA 1GLLO 3H3NO 5KPZA 5ELZA 5LJWA 4BRMA 1X9JA 1YUWA 5AQWA 3CJAA 4B1XB 1ATNA 4H0XB 4AM7A 4EIAA 2BUPA 4BROA 2QXLA 4XEIA 5B8HA 4IO8A 3UKUB 3FFKB 3AARA 3FLCO 5AQTA 4BR5A 2ZGZA 3WT0A 4CZKA 5KPTA 3C7NA 4BR4A 4CI6A 3CI5A 4XH1A 4CZLA 3KVGA 5FPNA 3JXUA 5ADXH 1NGDA 1NGBA 2Q31A 2QWRA 3G25A 5AZJB 4WQ5C 3JS6A 4FO0A 2F9TA 5AQKA 5AFUH 4BVPA 4BGBA 5JLHA 4FPAA 3R8EA 3L4IA 2H3GX 5BN8A 1X3MA 2D1KA 1E4FT 3ZX0A 3CJBA 3MN5A 2HMPA 2GWKA 3IMXA 2Q36A 3VEVA 3MN6A 3C0BA 4JNEA 3DXMB 1LCUA 3LDLA 4M7XA 1BO5O 1GLCG 2P9LB 3QICA 4FWLA 1WUAA 3FZMA 1HJOA 3H6EA 3ULEB 5BRDA 4O8KA 1HKBA 5BRFA 4FPBA 4BRKA 4EFHA 5EX5A 2D0OA 3AY9A 5AZIA 1NGHA 3A0IX 1BG3A 1JCEA 2QWPA 1GLAG 1RDWX 2YHYA 3RSEA 4BR0A 3HSCA 3R6MA 3U4LA 4XH4A 2EWSA 3GOIA 3DJCA 3O1BA 3WEEB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RW8A 4Z4FA 3JAMO 4E1JA 1JLAA 3DLEA 3KHYA 2P9IB 1VQON 2OPRA 1NOYA 4F2SA 4A61A 4OGEA 2LSNA 3B6OA 2FSJA 4BE0A 2PBDA 3ZT0A 1GLEG 1WSEA 1WNSA 2Q2RA 4AM6A 3K5LA 4GV6A 4DSEA 1N32K 3NF9A 3MEEA 1RBTA 4BC3A 2P9SA 3AV9A 4B8CA 1BOTO 5EU7A 1CXQA 4IG3A 3LZJA 2O8CB 3AAQA 1EO1A 3UKRA 2VCPA 3VQPA 2A40A 2A1SA 2HHHK 2F4VK 5CZ2A 3GE1A 4B3SK 5HBMA 2WOMA 4PKGA 3V1QA 1SQKA 3ZSOA 3QEPA 3PSIA 4CEDA 1X3NA 2O8DB 5C12A 4CK1A 4CIGA 1WAJA 5SWMA 2HHXA 1NGAA 3AGKA 3VEZA 1OH5A 4BR2A 2OTJN 4CJUA 2VQEK 4LD0A 3L2QA 2E8AA 5HP1A 2P9UB 1G99A 4DMNA 1WB9A 5AQQA 5FROA 2HBKA 4JI6K 5BPNA 4PL8A 2YKMA 2IAJA 2UXBK 4W5QA 4DUZK 3ZSQA 2AJQA 5HLFA 2XRIA 5KRTA 2DFEA 2VWBA 4JLHA 1QTMA 4CHYA 3AO2A 3IS9A 4FJ9A 4J8FA 5SZTA 1XUPO 4B9TA 1RTJA 3EKUA 2D0BA 1KCFA 3VEOA 1JLEA 1C0GA 3PO5A 3S3NA 5BR8K 3O3HA 4JHDA 4KBOA 3SMSA 2E2PA 3SV4A 1X1PA 2HF3A 3GG4A 3AA2A 2PYJA 3O3FA 1U45A 1Q86O 2RN2A 3OYCA 4OJRA 4KHSA 3I0SA 1HJRA 4IXCA 4CW7B 4GVEA 4JKFA 3AVLA 2ZD1A 1HR0K 4CEBA 3ALYA 4Q0BA 4C8KA 3SUNA 3DOLA 3AA4A 3AGRA 1RBVA 4H5TA 3ENBA 1K9MO 2Z1JA 2FXUA 3VERA 1QHAA 3J7ZO 1Q18A 4HWIA 1EWQA 4B3MK 3F9KA 4OVLA 3U3GA 3CCUN 3LM9A 3IAYA 4BRLA 4FWRA 3OYLA 4KHPK 2W42A 2E1ZA 1GLDG 2D5RA 2ATQA 3VQ7A 4KB1A 2FBXA 1WLJA 1D9FA 4HCCA 4X64K 2QWLA 4JKAA 3JYTA 3IFRA 3O6WA 3MCAB 4BDZA 4PKHA 1Q8IA 4DR5K 5AQJA 1FK9A 3MEGA 1WSHA 2IDOA 2W40A 1DLOA 3LWMA 3M6GA 4M3TA 3NFAA 4XH5A 3OYFA 4K43A 1BUPA 3KJVA 2P9PB 3DM2A 4E7JA 3QEWA 2E2OA 4FOEA 3AVCA 5M1FA 1S9EA 3LALA 4KFBA 2NRVA 3VPZA 3M8SA 1JCGA 2IGIA 4BQZA 2FSNA 4FZZA 2PZSA 3KK3A 3L2RA 3WXJA 3NE6A 3RR7A 4MFBA 2ZJQL 2F7TA 1BIUA 3V9WA 3CETA 3OW2M 3BY5A 2G8IA 4FLVA 3TWHA 2V7YA 1MA9B 4LF6K 2OPPA 3CJ9A 2A3ZA 4I2QA 5LJVA 3KWIA 4JAXA 3RRHA 5JS2A 3UB5A 5KRSA 2QM1A 1V4TA 2HVIA 3J8AA 3P38A 2A41A 4X65K 1RT2A 4BRFA 1KAXA 4DSKA 4FK4A 1YJWN 4A57A 2I5JA 2YJEA 1QS4A 3FZFA 1CZ9A 4FWMA 1LWFA 1W97L 4DQ8A 2GWJA 1HNZK 3CHWA 3QFPA 1ESVA 4LSLA 4UY8O 4M63C 2XY8A 2P9NA 4CZHA 3K57A 4CJQA 4CJSA 2JWKA 1TUYA 3L8BA 4DTXA 3PUFA 4CGFA 3TANA 1VQ6N 4FXDA 2OPSA 3QEXA 4F4KA 1J9AA 3OBWA 4F3OA 2P9SB 3QNNA 3K2PA 2HSTA 4JD2B 2P9IA 3TR8A 3QMLA 4FJXA 3FZKA 4IDKA 4CHNA 4H4MA 4HUFA 4C8LA 4N47A 3OYIA 2QI2A 3H46O 1TKXA 3QETA 1NBWA 4JK9A 2GV9A 4CD3A 4ISGA 1HYVA 1GOCA 4CZMA 4CFCA 3KK1A 4E89A 3LP1A 3MDQA 1LOTB 4AHVA 1VRUA 3CC2N 4H0OA 1T3VA 3CCRN 1VSKA 1WSFA 4FW1A 5FPEA 1RTIA 2HHTA 3THXA 1MDUB 4RW7A 4WFAL 4MO4A 3T19A 1JKHA 4PHTX 3NH2A 2NRZA 3ZSYA 5BR9A 4IO9L 1C0TA 5AQPA 4CJ4A 4WFNL 1NMDA 3WQUA 1SKWA 1XC3A 3CM5A 1K8KA 2CGKA 5AQFA 4FLUA 1HUXA 5AQVA 5FRNA 2WBNA 4BRPA 1IKWA 1NK9A 3TARA 4CJTA 3H1QA 3IG1A 3MN7A 4JN4A 2V7ZA 3L4QA 1RBRA 1XC9A 1BDGA 1JCFA 1TGOA 4MQ3A 1IG8A 3O5BA 2PFUA 4FJNA 3BP8A 1LW2A 3V9ZA 4WF9L 1JL2A 4CFAA 1T05A 1GOBA 4E19A 5FPMA 1J6ZA 3HPHA 3NBPA 2AA4A 4B1UB 5AR0A 3I55N 5EOYA 4RTFD 4F9OA 4KI6A 4QAGA 3F73A 2AP1A 4C8MA 2DY4A 2OPQA 2G8KA 1Q7YO 4PWDA 3TSUA 4KH5A 4HCBA 3VF4A 3DXKB 3T1YK 4CBUA 2ZGYA 1OKJA 3P31A 1KC8O 3ENOA 1HQEA 2D4WA 3PY8A 1GLLO 1NMNA 4BWJA 1TK0A 4OPJA 4FVUA 1ASUA 2O8BB 1XHZA 3D6RA 3KKRA 3KD5E 4AHUA 4CEEA 2FBVA 3ITHA 4EIAA 1QVGM 3A2FA 2D0AA 4DU1A 4DFMA 1JLGA 1Z25A 1B9DA 4BR5A 1Q82O 1KVAA 4KV8A 2KZMA 4CI6A 4Y1CA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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