2YHYA

Structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetylmannosamine and adp
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
313
structure length
308
Chain Sequence
GTLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTGGRVNPREGIVLHSTKLIQEWNSVDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLDGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords BIFUNCTIONAL UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE 2-EPIMERASE/N-ACETYLMAN
publication title Crystal Structures of N-Acetylmannosamine Kinase Provide Insights Into Enzyme Specificity and Inhibition
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 105
structure length 308
sequence length 313
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2011-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhyA02
3ID8A 3CQXA 3LL3A 5AQUA 1NGGA 3FZKA 3O08A 3CJ1A 4CBXA 2P9UB 3O1BA 5F0XA 2P9SB 3WUHA 3CJBA 2H3GX 1V4SA 2V7ZA 3H3OB 3M1FA 3M3ZA 1QZ6A 4LC9B 4RTFD 5AQVA 4BRQA 4BQLA 2Q0RA 4BRAA 2CH5A 1HX1A 1TYQB 2A41A 3FE1A 3UKRB 3WXIA 5JMVA 4FWSA 1X9JA 1YAGA 2F9WA 4H0VB 4EFHA 4BG9A 4CZJA 2QWOA 5BRDA 1EQYA 3A5NC 4BVPA 4ISFA 1G99A 3GE1A 2P9IA 2OANA 1X3NA 3TPQA 5EX5A 4CZEA 1BA0A 3MN7A 2E2OA 2P9PA 3BEXA 3HTVA 4DB3A 2I7PA 5BPMA 4WQ4A 1BU6O 2IIRA 3IMXA 4JHDA 2D4WA 3L6QA 5FPNA 2BTFA 5AQWA 1QQMA 1ATRA 1BO5O 2IVPA 2GTDA 4BG8A 3QFUA 3SLCA 1U6ZA 3AY9A 1DGKN 5BR9A 3VGKA 3QBWA 2IVOA 2ASMA 3A5MC 1ATSA 3P4IA 3MMVA 2I7NA 1Y64A 4MO4A 3EKUA 3G25A 3F9MA 2YJEA 4BR2A 3LDNA 4IJNA 3ENHA 4K42A 4BR9A 1YVNA 3MN5A 2VCPA 3D7EO 1K8KA 5FPEA 2GWKA 2P9IB 2A5XA 3VF4A 4DHYA 3B8AX 4A2AA 4H03B 4A62A 4BR0A 3H1VX 5AQHA 5JLFA 4CJ7A 3ATUA 4O8KA 2NZTA 2AA4A 4FSVA 2FSJA 5AFUH 4JHDB 1IG8A 3I33A 4FOEA 4NO7A 5KPTA 5AR0A 2YHYA 1DEJA 4CD1A 3FFKB 3A0IX 2A3ZA 2GUPA 3O4WA 3H6EA 3MCPA 3VEXA 3CQYA 3L4IA 5TKYA 1NGAA 2D1KA 3DWLA 3R6MA 2ZWHA 3EL2A 3QBXA 3VOVA 4FL9A 2Q2RA 4RCHA 4CBWA 3A8YA 3HI0A 5AQOA 3UE5A 2P9NB 3BP8A 4J8FA 1T6CA 4H0XB 4PKIA 5F1XA 2D0PA 3JXUA 4BRFA 3CIPA 1BWFO 2YI1A 4BC4A 3WT0A 1NWKA 2YCHA 5AZJB 3A5OC 1KAZA 3QICA 1LOTB 4QS7A 1NGJA 3MN9A 2FSNA 3WXJA 5AQFA 3MDQA 3VF2A 5EOYA 1MWKA 5ADXA 1Z6RA 3GBTA 4BRKA 4AM6A 3VEWA 5AQKA 3ZEUA 1XQSC 2Q0UA 2HMPA 4MLEA 5EVZA 3ZX3A 1Q18A 3O5BA 1R59O 2BUPA 4PL8A 1LCUA 1U2VA 2D0OA 5BN9A 4EAHD 4A61A 1JCEA 2W40A 3O80A 4Z94A 3IDHA 3LDOA 2ZGYA 1NGBA 1RFQA 1HLUA 1RGIA 1P8ZA 3FZMA 3FZHA 4FWKA 3RSEA 3VERA 3S41A 1HKCA 2GELA 4C23A 3QDKA 3BF1A 4B1UB 1E4GT 4H5VA 2QWLA 5AQSA 3SMPA 2V52B 2ZF5O 3AAQA 4BR4A 1TUUA 4FOIA 2IVNA 3WEEB 5LJWA 5AQZA 2FF6A 2V7YA 4IXCA 5AQYA 5KPZA 1NGFA 4CZKA 5LJVA 1E4FT 3DAWA 3H45C 3VEZA 3GDQA 5AQIA 3ZEUB 3A5LC 4H5WA 1IJJA 4K41A 4DQ8A 4BREA 3CERA 2QWNA 1U2VB 2A40A 4FWNA 4FWOA 3CJCA 5BN8A 3OHRA 1C0GA 2FLOA 4A2BA 4ISGA 2E88A 5JLHA 3KHYA 1HJOA 2NLXA 3MN6A 4BRNA 1ZBSA 3RSEB 1CZAN 1S22A 2E8AA 4GNIA 4H5RA 2E2QA 5EY4A 3FR0A 5BPLA 1GLJO 3U8XA 2P9NA 4BQZA 1NGHA 4QS8A 2FXUA 4QS9A 1HKBA 1GLAG 2HOEA 3MK6A 3O1WA 4JN4A 4ISEA 4JNEA 5B8HA 1XC3A 5AZJA 5LY3A 4BRDA 3FZLA 1HUXA 3L0QA 4BGAA 3LDPA 3W3DA 3ZX2A 4CZIA 4E1JA 3ZX0A 4XH1A 4FO0A 3CI5A 3BUZB 4H0PA 2PAVA 3DXMB 5E84A 4O5FA 3WQTA 4BGBA 5AQRA 3R9PA 3WQUA 4B1VA 5CE3A 1QQNA 2NRHA 3EZWA 1GLEG 5E26A 3ZETA 1KAXA 2P9LB 4RWTA 2FF3B 2A6AA 5AQPA 5AQLA 1MA9B 1ZC6A 2Q36A 4I6MA 1QHAA 4EHTA 3U9ZA 3R8EA 5KPRA 3FZFA 2PBDA 4WYBA 1GLLO 3AAPA 2YHWA 3ENOA 1BA1A 5KQDA 5BRHA 5BPNA 3HM8A 3H3NO 2E20A 3VEYA 3CJAA 1HKGA 4BC3A 1WUAA 3EKSA 3FLCO 1RDWX 1NBWA 2UYTA 4MO5A 3W0LA 2QM1A 3WEEA 4BC5A 3WXKA 4MLHA 5AQGA 4BRCA 3EO3A 4M7XA 3D2EA 4CI6A 1GLFO 3VGLA 4PL7A 1C0FA 3ZETB 4CZGA 3UB5A 2FSKA 4AM7A 5AFUA 2ITMA 2A42A 5JICA 3KZBA 2Q97A 2YHXA 4FWQA 4I6MB 1D4XA 2QW9A 3IUCA 2GEMA 1ATNA 4M7YA 1MDUB 3HSCA 3WXLA 4BR5A 3ATVA 2KHOA 2J4RA 1SZ2A 4CD3A 1MWMA 4IJAA 4F9OA 5AQTA 4GY2B 2P9KA 1JCGA 4L3QA 1YXQA 1X3MA 3GG4A 1V4TA 3TU5A 3U9DA 3EN9A 3VEOA 3LDLA 4KBOA 4B1YB 3HZ6A 4XEIA 4HTLA 2E1ZA 3HBTA 3D2EB 2GWJA 3SJHA 3SMSA 3VF6A 3FGUA 1HPMA 3C0BA 3DXMA 3GOIA 4BRGA 2W41A 1H1VA 4EHUA 4BRHA 1NGCA 4XH5A 1SQKA 4FWMA 4IO8A 4WQ4C 1NGEA 3JS6A 3GL1A 4BRMA 4HWIA 3VESA 2P9LA 3CJ7A 3ULEA 3O8MA 2F9TA 5I9EB 3UKUB 5AQMA 1KXPA 2WUSA 1BG3A 4DCHA 4BRIA 1S3XA 3AARA 1GLDG 1QQOA 4CZLA 5FPDA 3VENA 4FPBA 1Z05A 2AP1A 2P9KB 3H1QA 1ZXOA 5BRFA 5AZIA 2ASPA 3VEVA 2Q31A 4PKHA 4BR7A 2QWMA 2CGJA 1T44A 1NM1A 1BOTO 4NB4A 4JD2A 2QWRA 2ASOA 1QZ5A 4H5NA 3SK3A 1BDGA 3CHWA 3QMLA 1ESVA 4FWPA 4BRPA 1BUPA 1TUYA 5AQNA 4IZ9A 4EIAA 2ZGZA 3C7NA 4XH4A 5ADXH 4BVOA 3LM2A 4WQ5C 2HF3A 2V51B 4BROA 3BF3A 5FPMA 3ULEB 2P9PB 4K43A 1NMDA 3I8BA 4B9QA 2CH6A 3D2FA 3H46O 3QFPA 4CZMA 3VPZA 1KAYA 4CZFA 4WQ5A 3J8AA 4BC2A 4H0YB 5EXWA 4B1ZA 4CBUA 2VWBA 3LM9A 3DXKA 4FWRA 4B1WB 4CZHA 4M63C 1T6DA 2E2PA 5AZIB 1NLVA 2CGLA 2DPNA 1JCFA 3VETA 3M6GA 5AQQA 2VYPA 4K25A 2P9UA 1SAZA 4JD2B 4FWLA 2P9SA 5F2RA 3VGMA 4H0OA 3DJCA 3QB0A 4H5TA 2EWSA 1GLBG 2Q1NA 3CJ9A 3O6WA 2QWPA 1TYQA 3C7NB 5BREA 3UKRA 1K8KB 1NGIA 2E1YA 2CGKA 5AQXA 5ELZA 3LDQA 4YDUC 1DKGD 1OKJA 4H0TB 4PKGA 3CETA 2HF4A 4FPAA 1WOQA 1NGDA 1YUWA 3D2FB 3U4LA 4IWVA 1J6ZA 4YDUA 3DXKB 2QWQA 4Y0WA 3UKUA 3IFRA 1XUPO 5AQJA 4B1XB 2QXLA 1GLCG 3KVGA 2YJFA 2E2NA 4BRLA 5KQ8A 4JAXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3S9HA 3LL3A 3L2WA 1NGGA 2D0BA 3DRRA 3O08A 3CJ1A 4DQQA 4CBXA 3MEGA 1D8YA 3WUHA 2H3GX 3C65A 3ZSRA 4RTFD 4FJJA 4BQLA 2OCEA 2Q0RA 1TYQB 4JKGA 3UKRB 4DR3K 1XC9A 4FWSA 2F9WA 4H0VB 3CF5L 3OYGA 3O4NA 3CCQN 2HBJA 1BISA 4NXMK 3DRSA 1Q81O 1S6QA 4BVPA 1G99A 1NK8A 5CYMA 4B8CA 1EWRA 4CEDA 4CJ4A 4NYNA 3TPQA 3AVKA 1BA0A 3BEXA 4B08A 4WFAL 3LZIA 3THWB 2D4WA 3L6QA 1RNHA 5FPNA 2XY8A 3CMEN 1E3MA 4CJPA 3KWGA 3R3LA 4KV8A 4HTUA 1U6ZA 3AY9A 3ITHA 1DGKN 1BCOA 2D0CA 3A5MC 1YJNN 3P4IA 2O8BA 4DV2K 1RTIA 1WAJA 3EKUA 3LAMA 3RWUA 3NCIA 3ULDA 4DQPA 1EXQA 4C1NI 2IC3A 3DLRA 3NF8A 2G8KA 1HNZK 1Q9YA 1YVNA 1QQCA 4FJHA 3ENBA 3VQ5A 4DS4A 5GINA 5FPEA 1XI1A 1EO1A 3VF4A 3B8AX 3V9ZA 4BR0A 3H1VX 1GOBA 5JLFA 2NZTA 3TAPA 5KRSA 4GV3A 4E7HA 1T05A 4JHDB 3I33A 5GAGP 3VQDA 4E1MA 3MXIA 1BCMA 4CJKA 1HNXK 3V4IA 1TGOA 2YHYA 1DEJA 1HQEA 4B9TA 3PUFA 1EWQA 3O9QA 4B3TK 1OH6A 1YF5L 3L4IA 3E9LA 1KLNA 4FK0A 1RT7A 2F96A 4OPKA 3R6MA 3UIQA 3VOVA 4LF5K 3OYCA 3KK1A 4CF9A 3NH2A 1I39A 2Z1IA 2QKBA 5IWAK 4FYDA 4PKIA 1BHLA 1LWEA 1OH8A 2D0PA 1BWFO 2QK9A 3EE9A 1NWKA 2YCHA 3A5OC 4QS7A 3QICA 4BDYA 3K5NA 3HO1A 3HM9A 4KKOA 2YHAA 3ZSVA 3ZSQA 4W5RA 3NVKA 5AQFA 3MDQA 3VF2A 5EOYA 5ADXA 1Z6RA 4BRKA 1D9FA 3THVA 4WE1A 2JGUA 3HVRA 5AQKA 1RDUA 3SBGA 2HMPA 4DV7K 4ELVA 4CESA 5T7BA 4DSIA 3DLLL 4ILGB 2IS3A 1HPZA 2W40A 1HYZA 3IDHA 1RFQA 1HLUA 2WTUA 3FZMA 1O13A 3THYB 4NCGA 4RW4A 2VGNA 1OVYA 3M5RA 2V52B 2ZF5O 3IG1A 3AVNA 4GV6A 3AA4A 1KLMA 3OW2M 3K2PA 3WEEB 1BQNA 4Y1DA 3CCVN 5KPZA 1XMQK 3E01A 1E4FT 3DAWA 3H45C 4KTWA 3KTQA 4DLGA 5AQIA 3NF7A 2PYLA 4CHQA 1J53A 1KFDA 5CR4A 5SWMA 3HT3A 4CIGA 1I3AA 2F4VK 1U2VB 1RBRA 5FLXO 2O8FB 4OLAA 3CJCA 3T1YK 3VA0A 2FLOA 1QSSA 3KHYA 1HJOA 3MN6A 4BRNA 1RTDA 3OYDA 1S22A 4HUGA 2WFBA 2P9NA 4AHRA 1RBTA 1VSMA 4IG0A 4FZXC 1GLAG 2G8IA 2HOEA 3HRGA 4JN4A 4JNEA 5B8HA 4DV4K 4KH6A 1C1BA 2WC9A 3FZLA 3LDPA 3W3DA 1JLQA 5LMUK 5D3GA 3CI5A 4H0PA 3DXMB 5C2FA 3QEIA 3PIPL 2ZJQL 3KJVA 4FJNA 3C94A 3R9PA 4CJSA 1WSFA 4O4GA 1XHZA 4CCHA 1QQNA 1UWBA 4FCYA 1KAXA 1IBLK 4JI5K 4FLTA 5AQLA 3TTFA 3KD5E 1MA9B 4FZZA 1ZC6A 2P5GA 2QA4N 1CXUA 1NJZA 4KHQA 4CJWA 5KPRA 3DLEA 5LMNK 1DTQA 1FXXA 3P31A 1KVCA 3EZ5A 3CFOA 4WYBA 5C10A 4LF6K 4IFEA 5BPNA 1RDCA 1WBBA 3VEYA 3SQ4A 2OTLN 3EKSA 3AO2A 4A5AA 4X65K 2UYTA 1NKBA 4MO5A 3S3MA 4XIUA 3AO4A 4YOXA 3U3YA 3D2EA 1T7PA 2HHUA 1NKCA 5CHIA 2Y1IA 1GLFO 4DTRA 1YVUA 3VGLA 2OA8A 1C0FA 4O55A 1T8EA 3F9KA 4Z4HA 2HMIA 3UB5A 4ILHA 3NGIA 4B9LA 4DSKA 3KZBA 2Q97A 4FM2A 2QW9A 1NJXA 3MCAB 3NAEA 4DV6K 2GEMA 4J2EA 4TSXA 1JLCA 1QS4A 1MDUB 4LF7K 3ATVA 2J4RA 1SZ2A 4CD3A 4F9OA 4JKCA 3V6DA 5AQTA 3SUNA 4GY2B 3DLBA 1BI4A 1JCGA 4HVJA 3DOKA 1V4TA 3U9DA 4ELTA 3ZYYX 1HR0K 4CJQA 3KLHA 4DUYK 1FW6A 1HNWK 2JWLA 3TAFA 4B9SA 4CVNE 3OYEA 2NRRA 4HTLA 4DV5K 5CZ2A 5IT9O 1ZBIA 4NXNK 3KLFA 3SJHA 3SMSA 1NG9A 5HRPA 3RMAA 3VF6A 3OJUA 3FGUA 2XY7A 3GOIA 3C0BA 4BRGA 4JI6K 2W41A 4XH5A 1SQKA 1ASVA 4WQ4C 5GIOA 4KRFA 3JS6A 2P9LA 5HLFA 1S72N 3DLHA 2F9TA 5FROA 3CMAN 4A59A 4DU4A 4C8KA 1QQOA 2WONA 5GAHP 2KW4A 4LY7A 1OVQA 1ZXOA 1NK0A 2Q31A 3ALYA 3VQCA 4JEPA 1KCFA 4BR7A 1SL1A 2PFUA 1W0HA 3KK2A 4FJ7A 4NLBA 3LP1A 1NM1A 4JD2A 2QWRA 4R79A 1CXQA 3PY8A 3CHWA 4JKDA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3ID8 A;  3CQX A;  3LL3 A;  5AQU A;  1NGG A;  3FZK A;  3O08 A;  3CJ1 A;  4CBX A;  2P9U B;  3O1B A;  5F0X A;  2P9S B;  3WUH A;  3CJB A;  2H3G X;  1V4S A;  2V7Z A;  3H3O B;  3M1F A;  3M3Z A;  1QZ6 A;  4LC9 B;  4RTF D;  5AQV A;  4BRQ A;  4BQL A;  2Q0R A;  4BRA A;  2CH5 A;  1HX1 A;  1TYQ B;  2A41 A;  3FE1 A;  3UKR B;  3WXI A;  5JMV A;  4FWS A;  1X9J A;  1YAG A;  2F9W A;  4H0V B;  4EFH A;  4BG9 A;  4CZJ A;  2QWO A;  5BRD A;  1EQY A;  3A5N C;  4BVP A;  4ISF A;  1G99 A;  3GE1 A;  2P9I A;  2OAN A;  1X3N A;  3TPQ A;  5EX5 A;  4CZE A;  1BA0 A;  3MN7 A;  2E2O A;  2P9P A;  3BEX A;  3HTV A;  4DB3 A;  2I7P A;  5BPM A;  4WQ4 A;  1BU6 O;  2IIR A;  3IMX A;  4JHD A;  2D4W A;  3L6Q A;  5FPN A;  2BTF A;  5AQW A;  1QQM A;  1ATR A;  1BO5 O;  2IVP A;  2GTD A;  4BG8 A;  3QFU A;  3SLC A;  1U6Z A;  3AY9 A;  1DGK N;  5BR9 A;  3VGK A;  3QBW A;  2IVO A;  2ASM A;  3A5M C;  1ATS A;  3P4I A;  3MMV A;  2I7N A;  1Y64 A;  4MO4 A;  3EKU A;  3G25 A;  3F9M A;  2YJE A;  4BR2 A;  3LDN A;  4IJN A;  3ENH A;  4K42 A;  4BR9 A;  1YVN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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