2YHYA

Structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetylmannosamine and adp
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
313
structure length
308
Chain Sequence
GTLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTGGRVNPREGIVLHSTKLIQEWNSVDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLDGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structures of N-Acetylmannosamine Kinase Provide Insights Into Enzyme Specificity and Inhibition
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
molecule keywords BIFUNCTIONAL UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE 2-EPIMERASE/N-ACETYLMAN
total genus 105
structure length 308
sequence length 313
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2011-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhyA02
4FWSA 1KAYA 5AQXA 4FWLA 1QQMA 2PAVA 3C7NA 3LDNA 3R8EA 3H3OB 3BUZB 2CGLA 2FF3B 3CJ9A 5KQ8A 3ZEUA 5F1XA 4B9QA 3U4LA 2QWOA 3OHRA 3CJ1A 5F2RA 5I9EB 5AQYA 1X3MA 4BRIA 4BG8A 3QDKA 1JCEA 3UB5A 4BVPA 5BRHA 2QWNA 1KAXA 4H5NA 3UKRA 1DGKN 1T6CA 3ZX2A 3MN5A 4BQZA 2GUPA 3CJBA 1NGDA 4DQ8A 5AZIB 3VEVA 3FZFA 5KPZA 2QWMA 5AQRA 3DWLA 4CD1A 3CJCA 2ITMA 5BR9A 4HWIA 2CH6A 4MO4A 3U9ZA 3VGKA 3MN6A 2D4WA 2D1KA 3FZLA 5CE3A 4K41A 4CZEA 4ISEA 3CHWA 4FPBA 1YXQA 1S3XA 4BRNA 2P9SB 3D2FA 5AQZA 4H03B 1GLEG 2Q36A 2Q2RA 3RSEB 3CI5A 3F9MA 4CZJA 3QB0A 4MLEA 4B1UB 3QFUA 3A0IX 4AM7A 4BG9A 1G99A 1LOTB 4IXCA 5FPEA 2D0OA 4M7XA 3QMLA 3O80A 2OANA 4I6MA 2IVPA 2NRHA 4XH1A 2FSKA 4XH4A 3LM9A 4CJ7A 5AFUH 4BRMA 2P9LA 5LJVA 2AA4A 3C0BA 2F9TA 1JCGA 3DXMB 5AQNA 2J4RA 2P9UB 2V52B 2QM1A 3FZKA 1V4TA 3QBWA 3SJHA 5AQLA 1HKGA 4WQ5A 4CZLA 3VEXA 3AAPA 5BRFA 2A5XA 2NZTA 2P9NB 1U2VB 4XEIA 3U8XA 1Y64A 3IFRA 3CQXA 1ATSA 5LY3A 4DB3A 3SMSA 4B1VA 4BQLA 1C0GA 3LL3A 3H3NO 4JAXA 1MWMA 3S41A 1BG3A 1MDUB 2E2NA 2FLOA 3EZWA 4WQ4C 1DKGD 2FF6A 4I6MB 1GLJO 5AZJA 1GLCG 1QQNA 2P9KA 3VGLA 4PL8A 4PKGA 3TU5A 2V7YA 4FWKA 1T44A 3VEOA 2E20A 3CETA 4BGBA 4NB4A 1X9JA 5AQWA 3AY9A 3VEZA 1TUUA 4CD3A 3H6EA 1RFQA 1NGFA 3D2EB 1V4SA 3HBTA 5BN9A 3D2EA 5EVZA 5ADXA 4CZMA 4NO7A 1GLFO 4PL7A 1HKBA 4A2BA 1NBWA 3O08A 4H5VA 4YDUC 4CZIA 3LDOA 5FPMA 4BRDA 4CZFA 3H1VX 5AZJB 4M7YA 3VGMA 3IMXA 1ATNA 1ATRA 2FSNA 4H5WA 4Y0WA 4CZGA 3KHYA 3M3ZA 1NGGA 4FOIA 5AR0A 1YUWA 4H0VB 5AQJA 1NGHA 1XC3A 2BTFA 2V51B 2ZWHA 2Q1NA 2HOEA 4JN4A 1BA0A 2HF4A 5AFUA 5AQVA 3UKRB 2P9IA 3GBTA 2VYPA 2BUPA 3HM8A 3I8BA 1BUPA 2H3GX 5AQIA 1HUXA 1ESVA 3HI0A 3SMPA 5EXWA 1QQOA 2UYTA 1Z05A 4A62A 2A42A 4Z94A 2CGJA 4FWMA 2QXLA 1BA1A 2AP1A 5F0XA 5KPTA 4H0XB 1X3NA 2HMPA 5AQQA 3ZETB 3A5NC 4DHYA 5EX5A 3GE1A 3R9PA 2GEMA 4EHUA 3LM2A 1YAGA 3RSEA 5KPRA 4BRLA 3GDQA 4A2AA 4BREA 4BRKA 4B1YB 5BREA 3B8AX 4M63C 1GLAG 3H46O 3EKUA 3CJ7A 1XUPO 2YJFA 4CBUA 3ENOA 3ENHA 1NMDA 4RTFD 2P9PA 1TUYA 3VF6A 4J8FA 3WUHA 2YJEA 1J6ZA 1P8ZA 3AAQA 4K43A 1NWKA 3VEWA 3VERA 5AQTA 3GL1A 2GTDA 2QWRA 2YHWA 4BR7A 3W3DA 2WUSA 4BRFA 2A3ZA 4WYBA 5AZIA 2IIRA 3CJAA 2QW9A 4H0PA 3VEYA 1DEJA 3FR0A 4BGAA 3GG4A 1QZ6A 3GOIA 4KBOA 1HJOA 3BF3A 2A40A 4EFHA 4BRQA 4FWOA 4PKHA 2V7ZA 1NGCA 1OKJA 3HTVA 1BO5O 2GWKA 3W0LA 3ZETA 3QICA 3U9DA 1U6ZA 3G25A 3L4IA 3LDLA 4FSVA 3FZMA 3TPQA 2E8AA 2VWBA 3DJCA 3JS6A 4QS7A 1EQYA 1HPMA 4JNEA 1S22A 3DXKB 2ZGYA 4IJAA 3EN9A 4FPAA 3WXLA 3MMVA 4RWTA 2KHOA 2W40A 3O5BA 4EIAA 4MO5A 1WOQA 3D7EO 3I33A 1KXPA 4CBWA 3L6QA 3WEEB 1HLUA 1IG8A 2P9NA 4L3QA 1CZAN 2EWSA 2ZF5O 2P9IB 3VF4A 4BR5A 2IVOA 4EAHD 2CGKA 3VF2A 1ZXOA 3O1WA 4YDUA 5BRDA 5FPDA 3A8YA 2VCPA 1NM1A 5E84A 2Q0UA 4BRHA 1Q18A 4H5TA 3AARA 5FPNA 3EO3A 4C23A 2P9LB 4IO8A 3ZX0A 4IJNA 5E26A 3VOVA 3O4WA 5BPNA 3P4IA 3HZ6A 2Q0RA 4BR2A 2ASOA 2FSJA 4HTLA 1HX1A 3FE1A 3FFKB 1MA9B 1WUAA 2QWPA 2E2PA 3HSCA 1TYQB 5BN8A 3MDQA 4IWVA 3QFPA 4XH5A 3FLCO 4BVOA 2P9SA 1D4XA 5AQOA 4E1JA 4BROA 1BU6O 4JD2B 4ISFA 1RDWX 4O5FA 1NGAA 3FGUA 1SQKA 4BC5A 3VENA 5AQGA 2FXUA 2P9KB 4H0OA 3IDHA 5B8HA 2DPNA 1LCUA 3CIPA 3ULEA 4A61A 3KVGA 3EL2A 3MCPA 2D0PA 5AQKA 1KAZA 3ATUA 5TKYA 3H45C 5ADXH 4FOEA 3UE5A 4FL9A 3ULEB 3M1FA 4K42A 3LDPA 1U2VA 4O8KA 3UKUA 4B1XB 1QZ5A 3VESA 4FWNA 4BRCA 2E88A 2A6AA 1E4FT 1NGJA 2P9UA 4JD2A 3BP8A 4FWPA 4H0TB 2CH5A 3DXMA 4LC9B 4QS8A 2QWLA 1H1VA 4H5RA 4JHDA 4BC2A 4CBXA 1Z6RA 1NGIA 3EKSA 3SK3A 2IVNA 4IZ9A 4MLHA 5ELZA 3ZEUB 4BC4A 5KQDA 3O6WA 3VETA 2ZGZA 1JCFA 4BC3A 3WXKA 3MN7A 4GNIA 3ZX3A 5LJWA 3VPZA 4BR0A 3D2FB 4JHDB 5JMVA 3M6GA 2E2OA 2HF3A 3A5MC 4PKIA 3BF1A 2QWQA 2YI1A 5AQPA 4F9OA 1XQSC 1K8KB 4FWQA 4B1WB 1IJJA 4CI6A 3UKUB 3R6MA 1NGBA 5AQFA 3SLCA 3WEEA 4BRGA 1SAZA 2Q31A 5BPMA 4CZHA 1NLVA 1RGIA 2I7NA 3QBXA 1C0FA 4FO0A 3CERA 1R59O 5AQMA 3DXKA 3WQUA 4FWRA 4H0YB 4CZKA 1E4GT 3WQTA 3ATVA 3WT0A 1YVNA 5AQSA 2W41A 3LDQA 1GLBG 3CQYA 3WXIA 3DAWA 4BRPA 3FZHA 4BR4A 3A5OC 5BPLA 5JLFA 4WQ4A 4DCHA 2NLXA 3L0QA 2E1YA 3O1BA 3MK6A 3KZBA 5AQUA 1T6DA 1ZBSA 2ASMA 1MWKA 1TYQA 1SZ2A 2YHYA 3MN9A 3C7NB 4GY2B 4EHTA 1BWFO 2ASPA 2F9WA 5EY4A 3H1QA 2GELA 4BR9A 5JICA 4WQ5C 1NGEA 4BRAA 1GLDG 4QS9A 2PBDA 2P9PB 3WXJA 1K8KA 3BEXA 1QHAA 2A41A 4K25A 1BOTO 5JLHA 1BDGA 4RCHA 3JXUA 1GLLO 5AQHA 3ID8A 4ISGA 4B1ZA 2YCHA 3A5LC 3O8MA 2Q97A 2YHXA 3IUCA 4AM6A 2E1ZA 1HKCA 3J8AA 2E2QA 2GWJA 5EOYA 1ZC6A 2I7PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2IC3A 4KHQA 1TL1A 4BACA 1KAYA 3HP9A 3SAGA 4UY8O 4CVNE 3ZLJA 4IG3A 3AVCA 2QWOA 3AVLA 3CJ1A 5AQYA 1NJWA 3THYA 4LF5K 3L2RA 1JCEA 3UB5A 5BRHA 1KLMA 2NRVA 3CF5L 3QETA 4FJLA 4H5NA 3UKRA 4DUYK 3SYZA 4KHNA 1T6CA 3NE6A 4FJGA 4OO1J 1KFDA 3CJBA 1VRUA 4OGCA 3VEVA 1IBLK 4DTMA 2G8KA 1WSHA 1JLEA 5BR9A 3CCVN 4MO4A 2VQEK 1WSFA 3U9ZA 1HYVA 4DTXA 2PYLA 4ISEA 1U45A 2X74A 3OA9A 2QK9A 1S3XA 2HMIA 5E41A 1S9GA 1EKEA 3D2FA 5AQZA 1VQMN 3O9UA 1GLEG 3RSEB 3CI5A 3F9MA 4CEEA 4PQUA 1N32K 4ILJA 1RBRA 3MWTA 4U67L 3V9WA 4MLEA 3CCUN 4DFPA 3PIPL 3QEPA 1LOTB 2D0OA 4B8CA 4KFBA 4KREA 4QCLA 1CLQA 1NK0A 3PX6A 2FBTA 3HSTB 3O3HA 4K8XA 3AVKA 2EX3A 4BRMA 4DR7K 4CJPA 3EE9A 3CMEN 3DXMB 5AJ3K 1U04A 3FZKA 3SJHA 3NFAA 2O4IA 2XY8A 4HUGA 5KGXA 1HKGA 4CZLA 3CPWM 2B5JA 3PX0A 1U2VB 3CQXA 4DB3A 3SMSA 4B1VA 2G8FA 5HRRA 1RNHA 3LL3A 4N41A 3S41A 1N5YA 1IKXA 4M3RA 1MDUB 3RMCA 2FLOA 2XRIA 3R1XA 2FF6A 4I6MB 1GLJO 4OVLA 1GLCG 3VGLA 4PL8A 1WSGA 3SUOA 3BZKA 4BGBA 3DRRA 5SZTA 2HHWA 3VEZA 2OYQA 1TUUA 4CD3A 1NGFA 2Y1IA 4NO7A 4DUZK 1GLFO 2E6LA 3KJVA 2ZE2A 3O3FA 4OGEA 1Q9YA 3H1VX 2ATQA 4IFYA 4M7YA 4F8RA 3BGRA 4JRQA 5FRNA 2F8TA 3VQ6A 4CZGA 5HRSA 1SV5A 5AR0A 3TABA 4GVEA 3T69A 3QEXA 3PX4A 4JN4A 3QNNA 4JI6K 3E01A 2ZJRL 3PY8A 5AFUA 4DQIA 2VYPA 1T05A 1OVYA 4ILGB 4HUFA 3OY9A 4FYDA 3HI0A 4WCEL 4YNQA 2JGUA 3SMPA 3VQEA 1TK0A 1OH7A 1F21A 2A42A 4Z94A 4KAZA 1FKOA 4H4MA 2QA4N 4CCHA 2E5LK 2VG6A 2KLAA 1X3NA 5AQQA 4B3MK 4CEQA 3A5NC 4DHYA 3TAPA 2GEMA 3I0RA 3RSEA 3IKMA 4A2AA 1BIZA 4FJNA 2RE2A 3H46O 2HHXA 4NLBA 2YJFA 3CD6N 4RTFD 3HL8A 4FJMA 3MXMA 1NWKA 3GL1A 5M1FA 1NKBA 2PY5A 4IDKA 3RVCA 2IIRA 2QW9A 1DEJA 4BGAA 3JAMO 3P5JA 3G10A 1T7PA 4KH4A 2A40A 3NDKA 2F8SA 4EFHA 3DMJA 3QEVA 3SPZA 4FWOA 1SS6A 3MEGA 3U3YA 1NG9A 3V9UA 3OYLA 3ZSYA 1U6ZA 4IG0A 3TPQA 2VWBA 3T7ZA 3VA3A 1TKDA 1EQYA 4AH9A 2F7TA 2ZGYA 4FPAA 3MMVA 2FBVA 2KHOA 2W40A 4CEDA 4EIAA 1K6YA 4MO5A 1WOQA 3I33A 3LP1A 3L6QA 4FLYA 2P9NA 2RKIA 4L3QA 2EWSA 2IVOA 1S1VA 1IH7A 2CGKA 3VF2A 1X9SA 1D8YA 3AA4A 3MCAB 5C12A 3L2WA 5MLCQ 3OYEA 3EO3A 4C23A 4E1MA 4DFJA 4Z4GA 1YJNN 3ZX0A 4WFNL 3DLHA 2ASOA 3QINA 3PO4A 4DKWA 3SV4A 5TKWA 2E2PA 3M8QA 1OH6A 4GV9A 4DTJA 3HSCA 4BDZA 3TSPA 2EHGA 3LP3A 3T1YK 3LPUA 3V1RA 1RDCA 5AQOA 4RW8A 2O8EB 3AVNA 1S5JA 3FGUA 1SQKA 4O8UA 4JK9A 3D6RA 4MDBA 2KZZA 3LWMA 2P9KB 3TWHA 1EXQA 1M90O 3EZ5A 4H0OA 3ZSXA 3TSUA 4A61A 1S72N 1JL2A 4Z4HA 1DTQA 2JWLA 4MQ3A 3NH0A 3DOKA 1ZBIA 4CJTA 3MCPA 2HHQA 1B9FA 3C95A 1HNWK 2D0BA 1IG9A 5CR4A 1RDUA 2FC0A 2GV9A 1J5EK 1L3VA 2OZMA 4BRCA 2E88A 1NGJA 3P1GA 4Z4EA 1J53A 3BP8A 2CH5A 3DXMA 3QO9A 4QS8A 1L3UA 1H1VA 4H5RA 4BE2A 3V1OA 5KI6A 4FJKA 1NGIA 3EKSA 4IZ9A 3ZEUB 2Z1JA 1EX4A 4BC4A 3AO1A 5I42A 3KLEA 4DU1A 3L3VA 4LH5A 4V19S 1HR0K 3MN7A 3P83D 1TL3A 3E9OA 1NK4A 3VPZA 2HVIA 4IEEA 4JHDB 5JMVA 3M6GA 3A5MC 1RBVA 2QWQA 5FDLA 4F9OA 3C6HA 1DTTA 4CF9A 3F73A 4K0KK 2YHAA 3R6MA 3SLCA 1WLJA 2W6KA 2ZD1A 3HT3A 4DQPA 2I7NA 1REVA 1XMQK 1C0FA 4FO0A 4N76A 1CZBA 3AVHA 3T19A 4CEAA 3O4NA 4CE9A 5AQSA 1YHQN 3CG7A 4U7BA 3G6EN 2RF2A 2YKMA 3SUPA 3PSFA 4MFBA 4FLTA 4WQ4A 4E0DA 3L0QA 3CCLN 1TGOA 1T6DA 2ASMA 4EP5A 3F5TA 1VQKN 2YHYA 3WNFA 4CK2A 4GY2B 3TARA 1SL1A 5JICA 2O8DA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4FK2 A;  4CFC A;  3ZSW A;  4C8O A;  4JI5 K;  1SAZ A;  3QNO A;  2Q31 A;  4CFD A;  5BPM A;  1L3T A;  4OPA A;  1NLV A;  2VWJ A;  2HHS A;  3MEE A;  1JLC A;  4DR4 K;  3THW B;  3CER A;  5AQM A;  4FWR A;  1E4G T;  1D5A A;  4IBN A;  1A5X A;  2RN2 A;  5CHI A;  4JKG A;  4E3S A;  4HVJ A;  2Q3S A;  1GLB G;  4A5A A;  1IKY A;  1GOA A;  4A57 A;  2WFB A;  3DAW A;  4BRP A;  3WNE A;  2XY6 A;  3THY B;  2KZM A;  2O8F B;  3J7Y P;  3MK6 A;  1ZBS A;  4JKD A;  1TYQ A;  3MN9 A;  4EHT A;  4M3Z A;  1YTU A;  2UXC K;  2BH1 A;  1LV5 A;  1RTI A;  1ZBF A;  1XC9 A;  3K5M A;  1HNZ K;  4JK8 A;  5HP1 A;  1GLD G;  3TAN A;  4QS9 A;  5DM6 L;  4KTQ A;  3BEX A;  2A41 A;  2F4V K;  1BOT O;  5GAD P;  3LAK A;  1BDG A;  4RW4 A;  3HOS A;  5IT9 O;  4DV4 K;  4W5R A;  3CFO A;  2Q97 A;  4E7K A;  1IKW A;  3ZT0 A;  2YHX A;  3IUC A;  4AM6 A;  5C10 A;  4QAG A;  4NXN K;  4QOZ B;  1O1W A;  3TAF A;  2I7P A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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