2YJEA

Oligomeric assembly of actin bound to mrtf-a
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
367
structure length
333
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of a pentavalent G-actin*MRTF-A complex reveals how G-actin controls nucleocytoplasmic shuttling of a transcriptional coactivator.
pubmed doi rcsb
molecule tags Motor protein
source organism Oryctolagus cuniculus
molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
total genus 114
structure length 333
sequence length 367
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yjeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yjeA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2yjeA03
3F9MA 4DQ8A 1X9JA 1KAXA 2E2OA 3KVGA 4K41A 4JAXA 4LC9B 4WYBA 2P9NB 3BUZB 3EKSA 3RSEA 4BRDA 4FL9A 5AQMA 5EX5A 5AQJA 2QWQA 1ATSA 4L3QA 2BUPA 4BRNA 2YI1A 2QWMA 3HZ6A 4QS8A 2H3GX 1HUXA 3M1FA 4CZGA 4H5WA 4B1VA 1IG8A 4CZJA 2D0OA 3CQYA 4ISFA 4EHUA 3DJCA 4YDUC 4BG8A 2Q1NA 3S41A 2GTDA 4BRQA 1QQNA 1BOTO 3MK6A 3VESA 3IUCA 3EN9A 1U2VB 4IJNA 3VERA 5ADXA 2A6AA 1NGBA 4C23A 3WXIA 2QXLA 4BC5A 3EZWA 1U6ZA 3O08A 3UB5A 3LDLA 4CZIA 2CGLA 1Q18A 4B1ZA 2E8AA 3VEXA 4BC4A 4CZMA 5I9EB 3ZEUB 1NGJA 2E2PA 4FSVA 3VEVA 2FF3B 4K25A 4ISEA 1D4XA 4CJ7A 2BTFA 2NLXA 1GLCG 2CGKA 3FZMA 3L0QA 3DXMA 3QBWA 1IJJA 5FPDA 3BF1A 1QHAA 3QDKA 3SK3A 4DB3A 5EXWA 2QWLA 4DCHA 4BC2A 2ZF5O 4EAHD 3ULEB 2P9UB 2EWSA 1V4TA 2CH5A 1QQMA 4CD3A 5KPTA 1JCEA 2IVOA 2ITMA 1TUUA 4H0VB 4H5VA 4WQ5A 1LCUA 4H5TA 5F2RA 3VF6A 3G25A 5AZJA 4A61A 1NGAA 5EVZA 3RSEB 3VPZA 5F1XA 5TKYA 5FPMA 2IVNA 2YHWA 4AM6A 4CZFA 1HKCA 4PKGA 1BA1A 2J4RA 2E1YA 4FWPA 4XH1A 1Z05A 3CJ7A 3VF2A 3GBTA 3WXKA 4B1WB 5E84A 3KZBA 2CH6A 5F0XA 4FWSA 4FO0A 3O1WA 2Q2RA 4H5RA 1NGEA 4Y0WA 4CZEA 4CBUA 5FPEA 3HSCA 4J8FA 2A5XA 2I7PA 3LDNA 3A5MC 1T6CA 3CIPA 1NBWA 2GUPA 3IFRA 1JCFA 1KAYA 1EQYA 3HTVA 4CBXA 4H5NA 1XC3A 3SMSA 5BN8A 3ID8A 2PBDA 2V51B 1LOTB 5JLHA 3QB0A 3I8BA 3CHWA 4FOIA 5JLFA 3H46O 5AQYA 3LDPA 4BRLA 1NGIA 3MN6A 2QWOA 2P9UA 4XEIA 1MA9B 1HX1A 3DAWA 1H1VA 3DXMB 4IWVA 5KQDA 4XH4A 5KPRA 5AQFA 2QW9A 2OANA 3ZX0A 1OKJA 4GNIA 3GDQA 2P9PA 1S3XA 2GEMA 2D1KA 4WQ4A 1KAZA 1C0FA 2AA4A 5AFUH 3CETA 4BG9A 1V4SA 5AQXA 5AQNA 4EFHA 3WXLA 5AZJB 5KQ8A 4NO7A 3U8XA 3B8AX 1XQSC 5JMVA 2A41A 4BR9A 3CERA 4MO5A 4BR2A 1TUYA 4BROA 2A40A 1YVNA 1Y64A 4IJAA 3BP8A 2AP1A 5AQOA 3R8EA 4CBWA 5CE3A 2E88A 2GWKA 4FWLA 4CZHA 3D2EB 3FLCO 2ZWHA 3IDHA 1HKGA 5LJVA 2VCPA 5LJWA 2I7NA 5BRHA 3ATUA 4I6MA 4BQZA 2YHXA 1MDUB 2HOEA 3GE1A 5AQTA 2NRHA 1T44A 3VENA 1C0GA 2FXUA 1ESVA 2WUSA 3EL2A 1BG3A 3I33A 5AQHA 1ZXOA 3HM8A 3ZETA 3VGKA 2E2QA 4BC3A 4Z94A 2F9WA 4M7XA 3H6EA 3O80A 1HKBA 1GLDG 1SAZA 3VEYA 2FSJA 2QWPA 3CJCA 5AZIA 3H3OB 2YHYA 4M7YA 3UKRA 1NGFA 2P9IA 3P4IA 5BRDA 2HF3A 3LDQA 1ZBSA 3GOIA 4BR0A 1RFQA 4H0PA 5AQWA 1K8KB 2P9PB 2Q0UA 4CD1A 5AFUA 3A0IX 3A5OC 1NWKA 4JD2A 5BREA 2F9TA 2VWBA 3AY9A 2QWNA 2ZGZA 4O8KA 1ATNA 1X3MA 3QFUA 4BVPA 4F9OA 3WQUA 4EHTA 3A5NC 3GL1A 4BRFA 1J6ZA 4BRGA 3HI0A 2W41A 2ZGYA 4IO8A 4IXCA 3FZKA 1BDGA 3VOVA 4MLEA 3D2EA 4PL8A 3VEZA 3D2FA 5AQLA 4B1YB 4JNEA 2A42A 3D7EO 3L6QA 1GLFO 3O4WA 3W3DA 3EO3A 3MN5A 1HJOA 3GG4A 2HF4A 2P9KA 2V52B 3BF3A 3R6MA 3VGLA 4H0XB 1BUPA 4I6MB 3W0LA 4ISGA 5EOYA 2YCHA 1BO5O 1Z6RA 5AQSA 2FSKA 1ATRA 4JHDA 3LL3A 3VF4A 3C0BA 3ZETB 2NZTA 5AQVA 3J8AA 3VGMA 3C7NA 4MLHA 1DKGD 4A2BA 4NB4A 3AAPA 4CZKA 2PAVA 4H0OA 2P9LA 2ASPA 3VEWA 5AZIB 4AM7A 1TYQB 3TPQA 4FPBA 4FPAA 2KHOA 4BR5A 1BA0A 1K8KA 3UKRB 2FF6A 3U9ZA 3H1QA 2HMPA 1GLEG 2FLOA 2P9IB 4BRHA 4WQ5C 4QS9A 3BEXA 5BPLA 4KBOA 4K42A 1E4GT 4PL7A 4H0TB 5JICA 3A5LC 3H45C 4RCHA 3QBXA 4A62A 1YXQA 5B8HA 3EKUA 5BN9A 5AQUA 3M3ZA 4JD2B 5AQKA 1NGDA 2DPNA 3A8YA 4DHYA 4JN4A 1RGIA 3CJ9A 3SJHA 5BPMA 2YJFA 3VEOA 1HLUA 4CZLA 1BWFO 3WQTA 4BRAA 2IVPA 3KHYA 4FWMA 3DXKA 1R59O 3CI5A 3SMPA 5AR0A 2YJEA 3R9PA 4HTLA 3QMLA 3D2FB 3ZX3A 2D4WA 3LM9A 4RTFD 4BVOA 4BGBA 2E2NA 5EY4A 4FWQA 2P9KB 3CQXA 3FE1A 5AQQA 3ZX2A 2Q36A 4FWRA 3O8MA 3QFPA 1JCGA 3FZLA 4QS7A 4BGAA 3UKUA 5BRFA 4B1XB 1NGHA 3CJBA 3MN7A 4FWNA 1QZ6A 1P8ZA 2QM1A 3DWLA 4JHDB 5E26A 4BREA 4BRPA 1TYQA 3FGUA 4PKHA 2UYTA 3C7NB 4BRIA 1QQOA 3FZFA 3O5BA 3JS6A 2P9LB 3WT0A 2ASOA 2QWRA 3WXJA 2Q31A 1XUPO 2VYPA 4HWIA 3CJ1A 2P9SA 1CZAN 5AQZA 2W40A 5AQRA 1WOQA 4WQ4C 3OHRA 4B1UB 1X3NA 1MWKA 2CGJA 3H3NO 3TU5A 2Q0RA 2IIRA 2ASMA 1RDWX 3SLCA 2Q97A 3HBTA 2P9NA 3AAQA 4BRMA 1SZ2A 3LM2A 1SQKA 1NGCA 3WEEB 3WUHA 3MDQA 5KPZA 5AQIA 3ATVA 3H1VX 4PKIA 2V7ZA 3FFKB 1G99A 1GLBG 3L4IA 4FWKA 3M6GA 1HPMA 4A2AA 3CJAA 4H03B 1MWMA 3ENHA 3FR0A 3JXUA 3DXKB 1QZ5A 4M63C 3FZHA 2E1ZA 2FSNA 4YDUA 1WUAA 1YAGA 1BU6O 1GLAG 1S22A 2E20A 3LDOA 1NLVA 3MMVA 1U2VA 5BR9A 5ELZA 4BRKA 4BR4A 1T6DA 3VETA 4O5FA 4RWTA 2V7YA 4FWOA 5AQGA 1NGGA 5ADXH 4CI6A 4GY2B 1KXPA 4IZ9A 4B9QA 3QICA 4EIAA 3UKUB 4MO4A 4BQLA 3U9DA 3AARA 3O1BA 3ZEUA 4XH5A 5BPNA 3MN9A 1DGKN 2A3ZA 3UE5A 4FOEA 4E1JA 3MCPA 1NMDA 5LY3A 4K43A 1GLLO 1ZC6A 4BR7A 2GWJA 5AQPA 1DEJA 1GLJO 3O6WA 5FPNA 4BRCA 1E4FT 2GELA 2P9SB 4H0YB 3IMXA 1NM1A 1YUWA 2D0PA 3ULEA 3ENOA 3WEEA 3U4LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V9UA 5I42A 1X9JA 1HRHA 3NBPA 4K41A 4LC9B 3MXMA 2P5OA 3BUZB 3EKSA 4BRDA 4CGDA 4JKDA 1TVRA 3EEQA 5C42A 2QTDA 4RW8A 2ZQBA 1HUXA 4JI2K 1NJWA 4CZGA 1NOYA 4ELVA 2B4JA 4R5PA 1HYSA 4AH9A 4BG8A 4CK2A 2GTDA 4FLZA 1BOTO 4CESA 1YTAA 3BGRA 1XNQK 3ZT2A 3VERA 2W00A 1JLCA 2GX9A 2A6AA 4KAZA 2O8FA 3OJSA 1VQPN 3WXIA 4YY3K 2HHSA 4I2PA 3ZSRA 3BDPA 5FDLA 1U6ZA 3QEWA 4GV6A 1Q18A 1VSEA 1RDAA 4OGCA 4BC4A 1NGJA 3HOTA 4B9SA 2QKKA 4X62K 4FSVA 3J80O 3PO4A 3VEVA 3THYA 4ISEA 3OW2M 4M3TA 1A5WA 1RBUA 4BE1A 3FZMA 3L0QA 4LH4A 5TKWA 4E1NA 1IJJA 1FKOA 4IBNA 4Z4FA 3MXIA 4M3UA 3BF1A 1C1AA 4PHTX 3CCUN 4LF8K 1J9AA 5JS2A 4DV2K 4DCHA 4JYAK 2P9UB 4LFBK 3J7ZO 4FLTA 1JCEA 4WQ5A 1LCUA 3E1YA 5AZJA 1HPZA 4A61A 3SAFA 5EVZA 3VPZA 4DMNA 5SZTA 3PX4A 3DI6A 4CJ5A 2YHBA 2IVNA 4CZFA 3ZSVA 4JI5K 1BA1A 4E7IA 5D3GA 4GV9A 3CJ7A 5H1SQ 3GBTA 1D5AA 3J81O 4IOCL 4Z4IA 3KZBA 2CH6A 4DG1A 3K5MA 2BGGA 1S9GA 3O1WA 2WC9A 2UUCK 4H5RA 4Y0WA 1SKRA 2RHKA 1ILYA 2A5XA 3AV9A 3VQ7A 4Z0UA 4E7JA 2FBXA 5I3UA 3V9WA 3V9XA 3IS9A 1JCFA 2O8FB 3AO1A 4CBXA 4FJ5A 2OPPA 1SKSA 1BCOA 1MU2A 2ITGA 3SMSA 4E1MA 4DWIA 3OVNA 2G8VA 3AA4A 3QB0A 3AA5X 4JRPA 1LWEA 1QQCA 1SL2A 3CHWA 1Q81O 4AHRA 5CZ1A 2W42A 4KRFA 3THYB 3DLRA 3CCLN 1T7PA 5J2MA 1MA9B 3WNHA 1H1VA 4IWVA 2YNHA 1TKZA 5M1FA 1N8RO 2QW9A 3OS0A 5J2NA 3TAGA 4DR2K 3QIPA 2GEMA 3M8PA 1J5EK 1WSHA 1VQ6N 5IWAK 1KAZA 4IOXA 4FJLA 3F5TA 5AQXA 4O0IA 4GMJB 5AQNA 1Z25A 2HBJA 5AZJB 5KQ8A 4NO7A 3JYTA 2X6NA 3CMEN 1RTHA 1EETA 2O8EA 2A41A 3TSUA 3T1HK 5IT9O 4HVJA 4AHSA 1VSIA 4MO5A 3VA0A 3R1XA 3S3OA 2NRWA 4IJAA 4B8CA 1EWRA 3M8QA 4M42A 5E41A 2AP1A 5AQOA 4OKJA 2GWKA 3OYIA 4DV3K 4CZHA 1L3SA 3FLCO 2OPQA 4JKEA 5LJWA 5BRHA 1VSKA 2HOEA 3GE1A 3AO5A 3VENA 4JS5A 1ESVA 2LSNA 3HM8A 3ZETA 4DF8A 5C0YA 4BC3A 3AO2A 4F2SA 3V9ZA 5M1KA 3WNFA 3H6EA 3E01A 3O9UA 3VQ5A 1J5OA 2Y1JA 3H3OB 2BE2A 4DU4A 4YOUA 1NGFA 3BZCA 3O4QA 3OBWA 1ZBSA 4BR0A 3RMDA 4H0PA 5AQWA 3CF5L 3HP6A 3NVMA 3ZSZA 3A0IX 3QFUA 1VQ9N 3J7YP 1C1CA 3V81A 4RW4A 3A5NC 4BRFA 1J6ZA 4BRGA 1SL1A 2O8EB 2W41A 2UU9K 1BCMA 2GV9A 3VOVA 2OA8A 3CPEA 1WAJA 4RW9A 4FK4A 4PL8A 3KLHA 5HRPA 2HB5A 1C6VA 3D7EO 2Z1IA 4NLBA 4CGIA 3CCEN 3QETA 2G8UA 4ZTFA 5EOYA 5AQSA 1UA1A 4I9QA 4CFAA 3ZETB 1XI1A 1NJYA 2NZTA 1DKGD 1HNIA 4EP5A 4OLBA 3AAPA 3CD6N 3DRSA 1VQ8N 1HMVA 1YT3A 3OYMA 1S72N 2XO7A 3PIPL 5HROA 3LDSA 1VQLN 3P39A 3OYKA 3KK2A 2KHOA 5C2DA 4MDAA 2JGUA 4LFCK 4W5OA 3OS2A 4GW6A 4WQ5C 1WN7A 4QS9A 3BEXA 1WSJA 2F96A 4DTOA 4GVMA 1FKPA 3EY1A 1ZBHA 3MWPA 1T8EA 3VQ4A 1KRPA 4AHUA 4YHHK 5KTQA 3M3ZA 3EZ5A 2DPNA 3A8YA 3AVIA 3NFAA 4JN4A 1WSIA 3VQPA 3RVCA 2YJFA 3ZT4A 4DV7K 4BRAA 3DXKA 4NCBA 4HTLA 3AA3A 1YJWN 4B9VA 5FROA 1LV5A 3LM9A 4RTFD 4CJTA 5HRSA 4DV1K 4DFMA 2OYQA 4BVOA 4JI3K 5CYQA 3G6EN 4DV5K 1NKCA 1JL2A 4FWQA 3TANA 4PUOA 3VA3A 1IV0A 2Q36A 2YNFA 3MN7A 4DUYK 3KLEA 2QM1A 3DWLA 4FW1A 4DTXA 2VGMA 3C65A 3FGUA 4PKHA 1Q9XA 2O8BB 3ZSQA 2EHGA 3OJUA 1NK8A 3O5BA 3JS6A 2QWRA 4JV5K 5A2QO 2Q31A 1R0AA 2VYPA 4HWIA 3CJ1A 5GINA 3TAPA 2JWLA 2Z1GA 5C2FA 1RTJA 5C12A 4V19S 4CJVA 3OHRA 4DSLA 2D0AA 2BANA 3SPYA 3TU5A 2CGJA 4JKFA 4LF7K 2Q97A 1W97L 2P9NA 3AAQA 1SQKA 3QIOA 1Y97A 4O5BA 1WSEA 2PY5A 1X9MA 2F4VK 1G99A 3HSTB 3L4IA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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