2YJEA

Oligomeric assembly of actin bound to mrtf-a
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
367
structure length
333
Chain Sequence
b'TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title Structure of a pentavalent G-actin*MRTF-A complex reveals how G-actin controls nucleocytoplasmic shuttling of a transcriptional coactivator.
pubmed doi rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
molecule tags Motor protein
total genus 114
structure length 333
sequence length 367
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yjeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yjeA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2yjeA03
2HOEA 2Q1NA 3R6MA 5KQDA 4H5NA 3ENOA 1TYQA 4CBXA 1U2VA 5AQPA 2A41A 2P9UB 4BRQA 2D1KA 3M1FA 4PKIA 4JD2A 5ELZA 3IDHA 5AR0A 1BWFO 1GLCG 1V4TA 4PL8A 1TYQB 2YHYA 1U2VB 1BA0A 4BRLA 5LJWA 4JD2B 4A62A 3FGUA 4DCHA 4EHUA 3O1BA 3WXLA 4IXCA 4BRMA 2GELA 1NGGA 5AZJA 4IJAA 3D2EA 4HWIA 2I7NA 2P9KA 3IFRA 2V52B 4H0YB 1NBWA 1U6ZA 3ZETA 4Z94A 3ZEUA 4B1ZA 1NGFA 2HF4A 2A6AA 3CJCA 3VEZA 1K8KA 1J6ZA 2PAVA 3D2EB 4H5WA 4B9QA 1HUXA 2P9KB 3O5BA 4CZJA 2QWMA 3ZETB 2E8AA 4WQ5A 4O8KA 5EOYA 3R9PA 3ZEUB 1X3MA 1NGBA 1LOTB 2VCPA 5KPZA 2ASPA 2OANA 4YDUA 1K8KB 3CJ7A 5JMVA 3AAPA 2ITMA 2D0OA 4H0XB 2CH6A 2UYTA 3ENHA 5JLFA 5E26A 2E2PA 1R59O 1MDUB 3HM8A 4QS7A 3WUHA 3KZBA 5AQLA 2CGKA 1C0GA 1HKGA 3FZFA 1HJOA 1NGJA 3H3NO 5AQQA 3VPZA 1D4XA 2QWQA 5AQOA 5LJVA 4GNIA 1NGHA 1JCFA 4LC9B 4HTLA 3DJCA 3GG4A 2Q2RA 4WYBA 4GY2B 1GLFO 3KHYA 5EXWA 4BRDA 5AQIA 2NZTA 5KPRA 1GLBG 3QBWA 4FWQA 5AQNA 4FOEA 3AY9A 4M63C 3MN9A 3W3DA 3EKSA 1QQNA 3MCPA 1ZXOA 3LDLA 3LM9A 4M7XA 4BGAA 2A40A 3M6GA 4AM7A 3IUCA 3VERA 4MLEA 3QBXA 3O08A 3A5LC 3VGKA 3H6EA 5AQZA 5BRHA 2E2OA 5AQVA 1ATSA 4FO0A 1WUAA 2FXUA 4MLHA 3MDQA 1TUUA 1G99A 4JN4A 1Q18A 3GBTA 4CZEA 1LCUA 1TUYA 4H0OA 5LY3A 2AP1A 5F1XA 3VGLA 2GWKA 3LDOA 3BF3A 4A61A 2ZGZA 3L6QA 4IJNA 4K43A 2ZWHA 4NB4A 1MWKA 2H3GX 1QZ6A 4BG8A 4EHTA 1NLVA 1RGIA 1Z05A 3H45C 4H5TA 4O5FA 4BVPA 2FLOA 3L0QA 1JCGA 4JAXA 4KBOA 3SMPA 5AQXA 5TKYA 3WXJA 3QFUA 4FWKA 3RSEA 1RDWX 1BG3A 3VEOA 2KHOA 4MO4A 3FR0A 4MO5A 2IVPA 3FE1A 1HLUA 4BR7A 4DHYA 3VESA 2ASOA 2P9PA 4H0VB 5BREA 3HI0A 4WQ4A 5E84A 2D4WA 3RSEB 1MWMA 2GWJA 1GLLO 2J4RA 4B1VA 4XH1A 3FFKB 3ULEA 3H1VX 3C0BA 2FSJA 2P9PB 4CI6A 1BUPA 3O1WA 3LDQA 3VEYA 2ZF5O 3VF2A 1KAYA 5BN8A 5ADXA 3CJ9A 1DGKN 3FZMA 1T44A 3SK3A 2V7YA 4K25A 3R8EA 3MN6A 5AZJB 3S41A 3ULEB 2YI1A 3WEEA 4DQ8A 3HTVA 1IJJA 3C7NA 5EX5A 2E88A 5FPDA 2WUSA 4B1UB 3O8MA 4BC5A 4CZMA 2CH5A 3GE1A 3WXIA 2NLXA 3WEEB 5FPEA 5AFUA 3C7NB 5KQ8A 4WQ5C 2QM1A 1DEJA 4PKHA 3VOVA 1NGIA 2FF3B 4ISEA 2A42A 1YAGA 5AQSA 4YDUC 4BRAA 2YHXA 4IO8A 1T6CA 2QXLA 4H0PA 4BQZA 5AQMA 3EZWA 1HKCA 5AZIA 2A5XA 4J8FA 1GLDG 4CZGA 2AA4A 3A5MC 4CZIA 4FWOA 1DKGD 1NM1A 1T6DA 2E1ZA 3CQXA 4FWSA 2FF6A 5FPNA 1SZ2A 1NWKA 1ATNA 1NGCA 1ESVA 4H5RA 1GLJO 1SQKA 2A3ZA 3ZX2A 3EN9A 1X9JA 3U4LA 3JXUA 4FSVA 3QICA 3VGMA 3A8YA 2F9WA 1CZAN 5EY4A 4BRCA 3ATUA 1BDGA 2BUPA 4A2AA 4CZLA 2Q31A 4FWLA 3CJ1A 3O4WA 2E2QA 4QS9A 5AQHA 3CJBA 3H1QA 3WT0A 4BR4A 3G25A 3WQUA 1XC3A 2V51B 3L4IA 2FSNA 4EFHA 3VEWA 3CHWA 1HPMA 5AQRA 3OHRA 3CETA 4BRFA 3DXKA 4BC4A 3VENA 1WOQA 2QWRA 2IVOA 4CZFA 1NGEA 2QWPA 3WQTA 2HF3A 3LM2A 4BRHA 1ATRA 2YCHA 4BC2A 3QMLA 4DB3A 2GTDA 3DXKB 5F0XA 4EAHD 4CZHA 2YJFA 3MN5A 1C0FA 1OKJA 2QWLA 3ID8A 3MK6A 2YHWA 3U9DA 4CD1A 4B1WB 1XQSC 1QZ5A 3HBTA 5AQFA 1HX1A 3BF1A 1NMDA 3U8XA 4BRIA 1QQOA 5AQUA 5AQTA 2NRHA 3ATVA 3UE5A 4BR5A 4NO7A 4B1XB 1JCEA 3KVGA 4RTFD 2PBDA 4K42A 3VF6A 3ZX3A 1NGDA 1Z6RA 4PL7A 2HMPA 1V4SA 3VETA 4BQLA 3DWLA 3IMXA 4CJ7A 3QB0A 2GEMA 4L3QA 2DPNA 1IG8A 3JS6A 4AM6A 1ZC6A 2YJEA 3DXMA 3P4IA 4BROA 2F9TA 3VEVA 1BO5O 3BUZB 1YUWA 3AARA 3UKUA 4WQ4C 1GLAG 3DXMB 5KPTA 3UKRA 4RWTA 1QQMA 3TPQA 2QWOA 3MMVA 5BRFA 2Q0UA 1BU6O 3F9MA 5BR9A 3CERA 4CBWA 3ZX0A 2P9NA 3UKUB 4PKGA 3EKUA 2P9LA 3CI5A 1ZBSA 4I6MA 3I33A 4FL9A 2W41A 3UKRB 2Q97A 1YVNA 4BVOA 1MA9B 4CZKA 3VEXA 1E4GT 3M3ZA 2P9NB 4XH5A 3QFPA 4I6MB 2P9LB 3O80A 4FWMA 1YXQA 3H3OB 2FSKA 4QS8A 4BG9A 2E20A 5AQYA 3DAWA 1P8ZA 4H5VA 1KAZA 2W40A 1S22A 3B8AX 4H0TB 3TU5A 5BPMA 3U9ZA 4XH4A 5ADXH 2P9SA 3HZ6A 1RFQA 4BRGA 3QDKA 5I9EB 2BTFA 3HSCA 3D2FA 3EO3A 1XUPO 3FZLA 3J8AA 3LL3A 5AZIB 5BPNA 5AQKA 2P9SB 1BOTO 3A0IX 4BR0A 3MN7A 4H03B 2EWSA 5AQGA 3D2FB 3H46O 1Y64A 5EVZA 2E2NA 2I7PA 5AQWA 5AFUH 1SAZA 2V7ZA 5BRDA 4B1YB 3A5NC 3BEXA 4FWRA 3GDQA 2E1YA 3A5OC 4BR2A 2CGJA 3FLCO 1KXPA 1HKBA 3I8BA 2ASMA 3W0LA 4BGBA 4RCHA 5JICA 4JNEA 3UB5A 4K41A 2P9IA 4C23A 2QWNA 1EQYA 4Y0WA 2D0PA 4ISFA 5CE3A 2Q0RA 3SMSA 3CQYA 2VWBA 3WXKA 2P9IB 4BREA 2IIRA 3LDNA 3GOIA 4IZ9A 4EIAA 2IVNA 5BPLA 4CBUA 3SLCA 1BA1A 4FWPA 4JHDA 4BRPA 3FZKA 1QHAA 4F9OA 1H1VA 4XEIA 4FPBA 3FZHA 1NGAA 3VF4A 1GLEG 1KAXA 1S3XA 4A2BA 3AAQA 4JHDB 3SJHA 4FWNA 4BRNA 3BP8A 3D7EO 4CD3A 4FOIA 4BC3A 3GL1A 2ZGYA 5AQJA 4E1JA 5FPMA 3LDPA 5F2RA 5BN9A 2GUPA 2QW9A 2VYPA 3O6WA 5B8HA 5JLHA 4FPAA 3EL2A 4BR9A 1E4FT 2P9UA 2CGLA 4ISGA 4BRKA 4IWVA 1X3NA 2Q36A 4M7YA 3CIPA 3CJAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HOEA 1T8EA 3KJVA 1NOZA 3CMAN 4H5NA 1QS4A 1JLFA 4FJNA 4W5TA 4DR7K 1FKOA 1A5VA 1N33K 5AR0A 1BWFO 4PL8A 1TKZA 1S1TA 4O5BA 3ULDA 5LMUK 4JEPA 1BA0A 4ID5A 3RMAA 1N6QA 4CEEA 2NRWA 3QEVA 1IKXA 3O1BA 2GELA 2HBLA 3B6OA 4OKKA 5GADP 4HWIA 1RT3A 1K8AO 2I7NA 3IFRA 4H0YB 2V52B 3ZETA 2PYLA 3OTOK 2HB5A 3L3VA 3CJCA 3SQ1A 3VEZA 3ZSYA 2YHBA 4M3RA 4CZJA 3CG7A 3CD6N 3ZETB 2O8CA 3WXMB 4JYAK 3KKSA 3R3LA 1ASWA 2ASPA 4YDUA 3CFPA 3N4PA 5CZ1A 3K9JA 5SWMA 2UYTA 2O8CB 1C6VA 2HHUA 4FLUA 3TAMA 3AO4A 3HOTA 3HT3A 3KK1A 3KZBA 4JLHA 5AQLA 4NXMK 1KTQA 3PIOL 4LF8K 5CYQA 1VHXA 2WONA 5AQOA 4KHWA 5LJVA 2HNYA 5GAHP 3PX4A 4C1NI 4HTLA 4O44A 3GG4A 4C8NA 4KHNA 4JKGA 5JENA 1GLFO 3KHYA 4YHHK 4JRQA 1CZ9A 2PFUA 3AO3A 3SQ4A 4GKJK 3QBWA 5HROA 5J2QA 1NU0A 3DLRA 4JKGB 5CYMA 3W3DA 3VQCA 2XY5A 2OPQA 3EKSA 4HUFA 3SUOA 3VQEA 4JI3K 2Z1JA 4BGAA 3K59A 3M6GA 3G10A 3QO9A 1ZYQA 4DR3K 3A5LC 4AHTA 3J80O 3CCVN 2O8BA 4RW6A 2OYQA 5AQVA 1HYZA 3RMDA 3CXCM 4IOCL 3PIPL 3MDQA 1TUUA 1RT5A 3ID6A 1Q18A 2O8BB 4OKJA 2O8DA 4NYFA 1OH8A 4AHSA 5F1XA 5I3UA 3L2QA 4A61A 5GIOA 1L3TA 3L3UA 3K5LA 2ZWHA 3DLGA 1MWKA 4NB4A 2O8DB 1W2BM 3AGRA 2FLOA 3NGIA 4JAXA 3K5MA 3WXJA 2QTDA 3EYZA 2QA4N 5J2NA 2G8FA 4MO5A 1IKVA 1LAWA 4O4GA 3NAEA 3HI0A 5LMNK 4WE1A 1WAFA 5E84A 4LH5A 3M8QA 1MWMA 5T7BA 1SKRA 4DTSA 2J4RA 2W00A 3O9TA 4XH1A 4A5AA 3LAKA 4KHUA 4LFBK 4DTNA 4I2QA 4DTXA 3SUNA 1OH5A 3NGZA 1T44A 3SK3A 3SBTA 3P83D 4MQ3A 3HVTA 5AZJB 1HRHA 3I0SA 3C7NA 1QQCA 2WC9A 5EX5A 4X65K 3EY1A 2WUSA 4B1UB 4CJFA 3O8MA 2CH5A 3IAYA 5FPEA 2BH1A 4FZXC 1QE1A 2QXFA 3C7NB 5KQ8A 4DFJA 2A42A 1YAGA 1VSIA 4IO8A 4BQZA 4KH5A 1JLAA 1S72N 1O1WA 2A5XA 4J8FA 1TGOA 4CHZA 3AV9A 1S5JA 2ZD1A 3AVFA 4CZGA 5I42A 4F3OA 5CZ2A 2E6MA 3KIOA 1NM1A 5FPNA 1ATNA 2O8FA 3EN9A 3CF5L 4FSVA 3QICA 3TTDA 3AO2A 4DMNA 1BQNA 2KW4A 3ATUA 4ILJA 1BDGA 2BUPA 2O8FB 2Q31A 4FWLA 3NCIA 1N5YA 3LWLA 4DR4K 1S6QA 4QS9A 4OJRA 5AQHA 3TAQA 3WT0A 1L5UA 3WQUA 4V19S 3L4IA 3TAGA 1WLJA 3WNHA 4U7BA 4EFHA 1SKSA 4OPAA 3OHRA 3NH0A 1J5OA 4BRFA 3LP0A 4JI2K 4BC4A 1RT4A 4LF9K 3TABA 5EU7A 3SV4A 3QEIA 1YVUA 5HBMA 3WQTA 3K5NA 2HF3A 3JSMA 2UUCK 5IWAK 3LM2A 3CPEA 3V1RA 4PWDA 3QMLA 2UUAK 3P5JA 1RTHA 4EAHD 4ID1A 2B5JA 1RTDA 1RBSA 3CFOA 1OKJA 2QWLA 4DU1A 3TAFA 3DI6A 4FJGA 2X6SA 4CGIA 5J2MA 1NMDA 4MDBA 1OH6A 4LF5K 2FBTA 4FJXA 1DT9A 3LANA 4BR5A 3UE5A 1JL2A 2X74A 3DMJA 3F9KA 3MWTA 2PBDA 3VF6A 3SUPA 1D5AA 4JI6K 5DMRA 3MECA 4BQLA 4IKFA 1EKEA 1Q9YA 2GEMA 4O0JA 2PZSA 2DPNA 2NRXA 1IG8A 3P4IA 3VQBA 4DV1K 4IFYA 2Y1IA 4KPYA 3NVMA 4JKDA 4DFKA 3DYAA 1BO5O 3BUZB 1C0MA 1HJRA 2DFHA 3UKUA 4Z4FA 2IDOA 1GLAG 1FKPA 2WOMA 4DKWA 3MMVA 4DTPA 3SPZA 2F7TA 3KLHA 3OS2A 4I7FA 4Y1CA 3CERA 2P9NA 3UKUB 3NH1A 4LD0A 2ZJPL 4PKGA 4I6MA 2P9LA 1ZBSA 4BE2A 1SUQA 3AVIA 4OGEA 4CHOA 1MA9B 3ZSWA 4FXDA 4FLZA 1FXXA 2YKMA 4BE1A 2P9NB 4OKEA 2PYJA 4KREA 2FBVA 3QFPA 4I6MB 2P9LB 1VSEA 1SL1A 3ZT0A 4KTZA 4FM0A 3OW2M 2E20A 3DAWA 1P8ZA 1A5WA 4H5VA 3VQQA 3TU5A 4ILHA 4LH4A 5BPMA 4FLYA 3U9ZA 1UOCA 5ADXH 1VRUA 3HZ6A 1RFQA 3QDKA 4JK7A 1UWBA 4CJTA 3MXJA 4FLTA 2BTFA 4JK8A 4FM1A 4KKOA 3EO3A 4BWJA 3FZLA 3LL3A 5AZIB 2ZE2A 4BE0A 3M8PA 1BOTO 3CM5A 4O55A 3IS9A 1RBVA 4W5OA 4BACA 3NGYA 3HO1A 1BIZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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