2YJEA

Oligomeric assembly of actin bound to mrtf-a
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
367
structure length
333
Chain Sequence
b'TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title Structure of a pentavalent G-actin*MRTF-A complex reveals how G-actin controls nucleocytoplasmic shuttling of a transcriptional coactivator.
pubmed doi rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
molecule tags Motor protein
total genus 114
structure length 333
sequence length 367
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yjeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yjeA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2yjeA03
4DCHA 3MDQA 4WQ5C 1S22A 3GE1A 5KQDA 4CZMA 4CBXA 2NZTA 4FWQA 3CHWA 2FF3B 2P9UA 2A42A 5JLHA 4FWMA 2E88A 1RFQA 5AQJA 5AQWA 1Q18A 3D2FA 2E1YA 1TYQA 5AQNA 3HI0A 3GL1A 3W0LA 3WXKA 4BRIA 3D7EO 2YHWA 2F9WA 4H0TB 3CI5A 1WUAA 3BUZB 2ZWHA 1NLVA 2E1ZA 3LM2A 3L6QA 3U4LA 3BP8A 3QFPA 3LDLA 3FZLA 4FWOA 1XUPO 3ATVA 4YDUC 3QBXA 1K8KA 4CZJA 3CJ9A 5FPDA 2D1KA 3A5MC 5AZIA 1NGGA 1HUXA 2Q36A 1LCUA 5ADXA 2VYPA 1NM1A 3MN7A 3CERA 3BF1A 5KPRA 1BG3A 2YJFA 4EFHA 4BR7A 1HLUA 2P9LA 3CETA 2D0OA 5AQVA 1EQYA 3A5OC 3EO3A 3ID8A 5AQLA 2P9KB 1RGIA 1U2VB 2P9PA 4ISGA 1GLFO 4H0PA 4CZGA 5TKYA 4BG8A 2ASPA 4JHDB 1JCFA 2HF3A 3UKRB 3RSEA 2QWNA 3BF3A 4DB3A 4B1VA 1NGDA 4XH5A 5AFUA 3WXIA 4BC5A 4Y0WA 1ATRA 3KHYA 4GNIA 3CQYA 3DJCA 2P9NA 5AQRA 4B1XB 1QQOA 3VEZA 3IFRA 4BQZA 4BR5A 1HPMA 4JN4A 3VESA 4I6MA 4FPAA 5AQIA 1GLDG 1TUUA 3ULEA 2QW9A 4H0YB 3SMSA 2CGKA 1X9JA 2GTDA 3HZ6A 5EVZA 2FSJA 2A40A 3HSCA 1P8ZA 4CD1A 4IJNA 4QS7A 4CZIA 2HMPA 2Q0RA 3M1FA 3ZEUB 4BRKA 4DQ8A 3SLCA 3P4IA 4BRAA 3LDNA 3M3ZA 3VGKA 4A61A 3R8EA 1D4XA 1T6CA 2IVNA 3IMXA 3U9DA 2QWRA 3VEVA 3FZKA 4KBOA 4JNEA 4MLEA 3QDKA 4JD2A 1K8KB 1YAGA 4WQ4A 5AQMA 4LC9B 4Z94A 3WXJA 2V7YA 2ZF5O 4CZKA 1OKJA 3GDQA 4MO5A 2GUPA 1ESVA 4IZ9A 2P9LB 1YVNA 4IJAA 4BRFA 2EWSA 2VCPA 4FOEA 4FWLA 3KZBA 1YXQA 1QHAA 3ENHA 4BRMA 3FGUA 3H3OB 4H03B 4H5NA 3L4IA 3ZX2A 1BA1A 1QQNA 1NMDA 3O1WA 1JCEA 1LOTB 5AQFA 4BVPA 1J6ZA 3DXMB 3GBTA 2Q31A 3LL3A 3VENA 4EIAA 3RSEB 4EHTA 3R6MA 2I7NA 3VERA 1E4GT 2YHXA 1ZC6A 3CJCA 3R9PA 3VPZA 4B1ZA 1BWFO 2V7ZA 5LJWA 4MO4A 3H46O 3H45C 2QWQA 3EKUA 2ASOA 3ZETB 5LJVA 1NGAA 1TUYA 3ENOA 1DEJA 3I33A 3WEEA 4I6MB 4FWSA 4BRPA 3FZMA 3O08A 3VEWA 3ZX0A 4FWKA 2P9IB 3O1BA 3DWLA 1CZAN 3MMVA 4NB4A 4CD3A 1IG8A 5F1XA 5EXWA 4CBWA 3AAPA 3HTVA 4NO7A 3C7NB 4BRQA 2E2NA 3H1VX 1X3NA 4WQ5A 3A8YA 5AQHA 4F9OA 3WQUA 3S41A 2W41A 3CJ7A 5AQQA 1R59O 2Q97A 3JXUA 3UB5A 4BR9A 1KXPA 2BUPA 4FWRA 4EHUA 3ATUA 2Q2RA 4K41A 4K43A 4DHYA 2Q1NA 1IJJA 2W40A 4RWTA 2A5XA 3CJBA 4CJ7A 1YUWA 5AZJA 4L3QA 3VETA 3O8MA 3MN5A 3UKUB 1MA9B 3HBTA 3LM9A 4BR0A 1V4TA 4RTFD 5AQGA 3AARA 2GWJA 4IXCA 1XC3A 5BPLA 3UE5A 3OHRA 2IIRA 4H0XB 4YDUA 4JAXA 4ISFA 3VEYA 3VGLA 4CBUA 1ZXOA 5KQ8A 4PKIA 4FOIA 2E20A 4CZHA 2A3ZA 3CJAA 1DGKN 3U8XA 1BA0A 4BVOA 4K25A 2P9UB 2Q0UA 1Z6RA 3WUHA 1NGBA 2V52B 3D2FB 2CH6A 1TYQB 2YCHA 5AR0A 4BGAA 4CZLA 3FE1A 5E84A 4K42A 3IUCA 1QQMA 3B8AX 3QB0A 3H6EA 4BRLA 4BR2A 4BRCA 3WEEB 1QZ5A 1C0GA 1NWKA 2NLXA 2FSKA 5JMVA 5ELZA 5EY4A 3JS6A 1G99A 2QWLA 4B1WB 4BC3A 5BRDA 3MN6A 2ZGZA 3CQXA 1T44A 2OANA 5AZIB 4MLHA 2CH5A 3D2EA 3EKSA 4BQLA 1BOTO 3QBWA 1HX1A 1NGCA 2PBDA 2YI1A 2FSNA 3CJ1A 1GLAG 1XQSC 2J4RA 3MN9A 1NGEA 1MWMA 3H1QA 1GLJO 2P9KA 1KAYA 3FLCO 1U2VA 4QS9A 4B1YB 4O8KA 2WUSA 3MK6A 2P9PB 4BR4A 5AFUH 3KVGA 1MDUB 4ISEA 4WYBA 1BU6O 2V51B 4B1UB 3LDQA 2HF4A 4E1JA 5KPTA 4BREA 3DXKA 2P9SA 3UKRA 3BEXA 3I8BA 4FO0A 1GLEG 5AZJB 5AQYA 3VEOA 1MWKA 5CE3A 2E2OA 1RDWX 1SAZA 2IVOA 4GY2B 3GG4A 3EL2A 3VF6A 2GELA 2YJEA 4XH1A 5AQXA 3AAQA 4CZEA 5BREA 2P9NB 2QWMA 2QXLA 5BN9A 3SJHA 4BRNA 4H5RA 1QZ6A 5EX5A 3VEXA 3WXLA 5AQUA 1T6DA 3ULEB 4C23A 1SZ2A 2E8AA 1GLCG 2CGLA 1KAZA 4FSVA 4H0VB 5JLFA 2GEMA 3SK3A 5BR9A 4BRDA 1DKGD 4BROA 5BN8A 3A0IX 2H3GX 3ZEUA 3G25A 3GOIA 1ATSA 5AQTA 5BRFA 4BC2A 4BRGA 1NBWA 4PKGA 3L0QA 1BO5O 1KAXA 4EAHD 4BC4A 4FWPA 1WOQA 3W3DA 4RCHA 3HM8A 4JD2B 1E4FT 1H1VA 3QFUA 2F9TA 2ASMA 3FZHA 3TU5A 5FPMA 3VGMA 3U9ZA 2AA4A 4A62A 3FFKB 1JCGA 3D2EB 4M7YA 3VF2A 1NGIA 3ZX3A 1BDGA 3F9MA 4HWIA 5E26A 5KPZA 1HJOA 4HTLA 4XEIA 3VOVA 2YHYA 5BPNA 1HKCA 3WT0A 1X3MA 1V4SA 2IVPA 3A5LC 1GLLO 1S3XA 3O5BA 1HKGA 3J8AA 5B8HA 2FF6A 3M6GA 2QM1A 5F0XA 4FL9A 3DXKB 3DXMA 2P9SB 3O6WA 4WQ4C 1SQKA 5LY3A 4IWVA 5EOYA 5FPEA 3EN9A 4AM7A 1NGHA 2NRHA 4XH4A 5I9EB 2QWPA 3A5NC 3FR0A 2BTFA 3AY9A 3DAWA 3O4WA 4BG9A 5BRHA 3LDPA 5AQOA 2QWOA 3ZETA 1Y64A 4PL7A 5ADXH 3CIPA 2ITMA 3C0BA 4QS8A 3IDHA 2A41A 3TPQA 2DPNA 2AP1A 1NGJA 4M63C 5BPMA 2A6AA 2P9IA 3SMPA 4BGBA 2VWBA 3O80A 3LDOA 2HOEA 3QMLA 2I7PA 4M7XA 5F2RA 2E2QA 4J8FA 4H5VA 4A2AA 3C7NA 5JICA 4BRHA 3QICA 4H5TA 1U6ZA 5AQZA 4CZFA 4H0OA 4A2BA 1ZBSA 5AQSA 1Z05A 4O5FA 3WQTA 2CGJA 4AM6A 2D4WA 4IO8A 2UYTA 4PKHA 3FZFA 2PAVA 5AQKA 1ATNA 2FLOA 4FWNA 4FPBA 4PL8A 2KHOA 1GLBG 4JHDA 5FPNA 4B9QA 2D0PA 2E2PA 2ZGYA 4CI6A 2FXUA 3VF4A 1BUPA 3UKUA 2GWKA 4H5WA 1C0FA 1NGFA 5AQPA 3MCPA 3EZWA 1HKBA 3H3NO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V81A 1I3AA 5FRMA 3KK1A 1BGXT 4CE9A 4KH4A 4FWQA 2HHXA 4CHNA 2FF3B 4E7IA 2P9UA 4CJUA 3CF5L 3KLHA 5AQWA 3NF6A 1Q18A 3D2FA 1TYQA 5GINA 4CGFA 1JXEA 4W5RA 3WXKA 2YHWA 3M8QA 1HQEA 3BUZB 3V9XA 1HJRA 1WSEA 5C25A 3U4LA 3BP8A 4CIFA 1IG9A 3FZLA 4KTWA 1WBDA 3D45A 3KLGA 4JYAK 4NYFA 3ATVA 4YDUC 4KRFA 4LY7A 3L3VA 2HNDA 5AZIA 4FJGA 2Q36A 2WFBA 4YOUA 4I7FA 4IO9L 1NNEA 2KTQA 2YJFA 2X6NA 5TKWA 4DLGA 4B3SK 1ZBIA 3K5OA 3ID8A 1YTUA 4PHTX 4FJHA 2P9KB 3NH2A 1W97L 1Q82O 2PYJA 1RTDA 4CZGA 3TANA 5J2MA 4KHUA 4BG8A 4OKJA 1TKDA 4FJ7A 3UKRB 4YOYA 3VA3A 1EO1A 3RSEA 4DV1K 2G8VA 2KZZA 2F8SA 1DTQA 3DLRA 3V9WA 3SZ2A 4AQYK 4F2SA 4B9UA 3DJCA 2GX9A 3SAFA 1N36K 4BR5A 2YKNA 4JN4A 3N4PA 3K5LA 3P31A 4JI1K 4E1NA 2GTDA 1EP4A 4HCCA 1NJWA 3AVIA 4IJNA 4QS7A 4M3XA 4DTJA 2HMPA 2R7YA 4JS4A 1M1KO 1QVFM 1YI2N 4DQ8A 2NRZA 3THWA 3VN5A 3SLCA 4FLTA 3U6FA 3LP0A 4J2BA 1W7AA 3P4IA 3VGKA 2IS3A 1TVRA 1IKVA 3SPYA 1YIJN 3DMJA 1D4XA 2IVNA 3U9DA 3VQ6A 1B9DA 1S6PA 2YNFA 3FZKA 4JD2A 1YT3A 5C24A 3LP2A 4WQ4A 4LC9B 5KI6A 3IS9A 4Z94A 3HPHA 3WXJA 4B9TA 3HP9A 3CCMN 2ZF5O 3S3NA 3QNOA 4CFAA 5FDLA 4JV5K 4JKHA 4E19A 4FJ9A 3AVCA 1C1CA 1LWCA 1YVNA 4IJAA 3QNNA 2EWSA 4FOEA 4FJJA 1EWQA 3ENHA 4GVEA 1X1PA 3H3OB 2EHGA 1KRPA 4H5NA 1VQ6N 1JL1A 2HMIA 3NGYA 1HNVA 4JKGA 5CR4A 5C2FA 3VTHA 5AQFA 4BVPA 4M3TA 1RDBA 3OYFA 2Q31A 2AJQA 3RSEB 1NKEA 4KREA 1L5UA 4ID5A 3VERA 4E7HA 4E3SA 2YHXA 3DOKA 1ZC6A 4FJLA 4DU3A 3OYHA 1N32K 4C8KA 2P1JA 3H45C 2HHWA 2QWQA 1S9EA 3LAKA 3G4SN 2FBYA 3OY9A 1J53A 1VK0A 3M8RA 4BRPA 3I0RA 1WSFA 3VEWA 3O08A 3ZX0A 1QVGM 1L3UA 1RBUA 2P51A 4FWKA 2P9IB 3N4QA 4B9NA 3MMVA 4CD3A 3VQDA 4CBWA 3AAPA 3OYDA 3THWB 5M1KA 1IH7A 3CCLN 4BRQA 2E2NA 3MAQA 1W9HA 4DUYK 5AQHA 3WQUA 5AQQA 1NKCA 2QA4N 2BUPA 4EHUA 1D8YA 3KWGA 4IFYA 1IJJA 4L8RB 3IKMA 3QINA 4BE0A 3TAPA 4RWTA 4OVLA 2A5XA 1I39A 3C6AA 4JKDA 1YUWA 1NJYA 3CG7A 3UKUB 1Q81O 1MA9B 4DQQA 4O4GA 1KLNA 3AO3A 5LMUK 3UIQA 4ILGB 3AARA 1RBRA 4CIGA 5BPLA 3UE5A 4YDUA 3THVA 2HHIA 4FOIA 3MX5A 4CZHA 3TAMA 4JKGB 2C1GA 4O8UA 4CHYA 4CEQA 5MLCQ 3AVLA 4KH5A 4LH5A 4BGAA 4GV6A 5GIPA 4LH4A 4LF8K 3CMAN 4FLWA 4K42A 3IUCA 3S3OA 1L3VA 1XMQK 3QB0A 1KTQA 3VQEA 4X66K 1CZ9A 1S72N 4BRLA 1ITGA 4BR2A 2XY7A 2KFZA 3JAMO 1JLQA 1FXXA 1C0GA 1TKZA 2FSKA 3O9RA 4RG8A 1I94K 1G99A 4ICLA 4B1WB 4NCGA 3PX6A 3MN6A 4YOXA 3PIOL 4MLHA 1Y97A 3NFAA 3K58A 4M3ZA 3QO9A 3E01A 2PBDA 3NHGA 1U04A 2G8KA 4FVMA 3MN9A 1FJGK 1MWMA 4CESA 3DM2A 1S1XA 4CJLA 4ZTJA 1GLJO 4DR4K 4DR7K 4O8KA 2P9PB 5AFUH 4DF8A 3OYIA 3KTQA 4B1UB 4FLYA 2HHUA 3DOLA 4IG0A 2P9SA 1ILYA 3WXMB 2KZMA 3V9UA 2E6MA 3QLHA 4DF4A 3C65A 4Z4EA 5C12A 4B3RK 1W2BM 2GELA 4CJ3A 2YJEA 4XH1A 5BREA 5LMNK 3J81O 4J2AA 2QWMA 4N5SA 4DTPA 2JGUA 2NUBA 5BN9A 3LWMA 3AV9A 1IV0A 4BRNA 3AVKA 1QZ6A 2PYLA 1LWFA 5HRNA 1NK9A 4Z4IA 1J5OA 3TABA 1SZ2A 2O8EB 2E8AA 4YORA 4JI6K 2YHAA 4C8MA 4KI4A 4FW1A 3A0IX 2H3GX 1ATSA 4PY5A 5BRFA 3WNFA 1EETA 4Z0UA 4PKGA 3H08A 1ZYQA 3C6TA 4EZ9A 4JKEA 2HBMA 2Z1GA 3NVKA 4DTUA 4PA1A 3HM8A 4I2QA 1WSIA 4LF4K 4LF9K 4JI7K 1K6YA 3TU5A 4OPHA 1UA1A 4CEDA 3RMDA 4M7YA 1JLFA 4LFBK 3ZX3A 4HWIA 1HJOA 4HTLA 4XEIA 3P38A 2YHYA 5BPNA 3WT0A 4Y1DA 1KVAA 4H8KA 1VSDA 3M6GA 4FL9A 4FJIA 1C0TA 2WTUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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