2YJEA

Oligomeric assembly of actin bound to mrtf-a
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
367
structure length
333
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title Structure of a pentavalent G-actin*MRTF-A complex reveals how G-actin controls nucleocytoplasmic shuttling of a transcriptional coactivator.
pubmed doi rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
molecule tags Motor protein
total genus 114
structure length 333
sequence length 367
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yjeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yjeA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2yjeA03
3DJCA 4L3QA 4CZGA 5I9EB 4BG8A 2GTDA 3QFPA 4BC4A 2E88A 5AZJA 5FPDA 2Q97A 3LM2A 3FFKB 1E4GT 3LDPA 3O8MA 3L6QA 3VEVA 2F9WA 4H0XB 4FOEA 1LCUA 3IMXA 4HWIA 5BRHA 3GBTA 4EHTA 5JICA 4CZIA 3KVGA 3VPZA 1GLFO 4PL7A 4K25A 3CI5A 3MN7A 3S41A 2YHXA 1KAYA 5F2RA 3HI0A 3L4IA 4CZLA 3GL1A 1RGIA 2GWKA 4JD2A 4H5VA 5KQ8A 4LC9B 4WQ5A 4H5WA 3VF2A 3BF3A 1GLDG 2QWOA 3LDLA 4FWPA 4BQLA 3ZX2A 3ULEA 1K8KB 3ZX0A 4AM6A 2AP1A 1H1VA 5AQYA 1HUXA 3FGUA 3W3DA 2DPNA 4PKGA 4B1VA 4CZHA 3WXKA 2A5XA 1X3MA 2FSKA 3ENOA 4WQ4C 5BPNA 1WOQA 2FF6A 3U9DA 3BP8A 4B1ZA 1ZBSA 4FWSA 4BRGA 5LJWA 5B8HA 2ASOA 4H0VB 1X3NA 3CIPA 1JCGA 4QS8A 2P9KB 1HX1A 2YJEA 3BEXA 5AFUA 2YJFA 2ZWHA 3GOIA 3VGLA 3MN6A 3O80A 4H5TA 5BN8A 3WQUA 5AQJA 1Z05A 4IO8A 1V4SA 3H3OB 1YVNA 1LOTB 1OKJA 3SK3A 2E2NA 3H46O 3I8BA 2P9LA 4JN4A 2IVPA 4DCHA 2EWSA 3EKSA 4JNEA 4A2BA 3HZ6A 5AQQA 3WEEA 3O4WA 4BRAA 5FPEA 2VYPA 3VF6A 4QS9A 1ATSA 5FPNA 1NGAA 3LM9A 5AQFA 3R9PA 5AQUA 2CH5A 4PKHA 3SLCA 3G25A 4QS7A 4H5RA 2ZF5O 3CJ7A 5FPMA 5BRFA 1HKCA 4J8FA 3ZETB 5BRDA 2YCHA 5EOYA 3HTVA 3LL3A 4ISGA 4WQ4A 3UKRB 4H0TB 2HMPA 2YHWA 3L0QA 2P9IA 4CZFA 5AQOA 1ZXOA 4BC3A 1TUYA 4K42A 5AQXA 4DQ8A 1NMDA 1XC3A 2V7ZA 4H0YB 4XH1A 3VENA 3FE1A 1MWKA 4B1YB 4FSVA 3IUCA 2E1ZA 2H3GX 2GUPA 1GLBG 1NGJA 1HKGA 4BR0A 1QQOA 2Q0RA 2I7PA 4ISFA 4ISEA 3O5BA 3P4IA 3VGMA 3D2FA 1BWFO 2PAVA 3MN9A 2Q0UA 1CZAN 4BRIA 4DB3A 1TYQA 4MLEA 3FZLA 3QBXA 4BC5A 3O1WA 1XUPO 5AQHA 2ASPA 3H1QA 2D4WA 1U2VA 3ZX3A 3IDHA 4O8KA 1G99A 2FSJA 3A5NC 1QHAA 2KHOA 3B8AX 5AQRA 3EZWA 4Z94A 1NGIA 1RDWX 1NBWA 1C0GA 3A5OC 3D2EA 1JCFA 2PBDA 2P9NA 4FWOA 3VEWA 1BDGA 4M63C 3AARA 1GLJO 3EN9A 4YDUC 1NGEA 4PL8A 3AY9A 3R6MA 2A42A 4FL9A 3MDQA 4Y0WA 2NLXA 1BOTO 4BC2A 4WYBA 1DKGD 3ULEB 2Q1NA 4CZKA 2IVNA 4BG9A 5AQKA 3WXJA 2QWQA 2FLOA 3BF1A 3C0BA 1Q18A 1TUUA 5JMVA 2E2QA 4B1XB 5AZIA 2NZTA 2FF3B 5BPMA 3UKUA 4M7YA 5LJVA 5F1XA 2ITMA 2ZGZA 3R8EA 3O08A 2P9SA 1HPMA 4IJNA 3LDQA 3M3ZA 3C7NA 4CD1A 3BUZB 3QBWA 2D0PA 4RTFD 4JAXA 2E2OA 4EAHD 4BRNA 3VEOA 2HF3A 3J8AA 5AR0A 4XEIA 2HF4A 5AQLA 3WQTA 4EHUA 3M1FA 2E20A 2NRHA 5AFUH 3LDOA 3UE5A 2CGKA 4FWKA 1T6CA 3DXMA 2QW9A 2GEMA 4K41A 3ZEUA 2QWPA 4BRCA 4AM7A 2P9UA 2FSNA 3WEEB 1GLAG 1BG3A 4I6MA 2E8AA 1IJJA 1EQYA 2CGJA 1YUWA 2P9PA 4JHDB 4E1JA 1NLVA 4BRPA 3TU5A 2V7YA 4FWQA 1NGGA 3FZKA 4YDUA 1BA0A 3CJAA 4MO5A 3TPQA 4CZEA 1QQMA 1BUPA 3DXKB 4CD3A 3A5MC 2F9TA 2P9KA 3FR0A 3VEYA 3A5LC 5KPRA 2QWLA 4BR7A 1MWMA 4FPBA 3ATUA 5BN9A 5AQZA 4EFHA 4FO0A 4BRFA 2P9IB 3ENHA 4KBOA 1WUAA 4CBWA 2A3ZA 2W41A 1HJOA 3SMSA 3RSEB 1MA9B 4FPAA 3IFRA 4CZMA 5E26A 3FZFA 1T6DA 5AQNA 4BRQA 4DHYA 4NO7A 3D2FB 1J6ZA 2BUPA 1NM1A 3GE1A 3FLCO 4B1UB 5KQDA 2ZGYA 1KXPA 1HLUA 5AQSA 3EL2A 1SZ2A 5AQWA 4WQ5C 5AZJB 1NGFA 1ATRA 4BRHA 4BVPA 1DEJA 2YHYA 3CQYA 2CGLA 4BR9A 5KPTA 5KPZA 4B1WB 3AAPA 1U2VB 1X9JA 2Q2RA 3QB0A 1U6ZA 4H5NA 1YXQA 2J4RA 3UKRA 1V4TA 4GNIA 2V52B 4BQZA 3F9MA 3VETA 2Q36A 3A0IX 2VCPA 1RFQA 4IZ9A 4BR5A 2D1KA 3CJBA 4C23A 3FZMA 2QM1A 2IVOA 4PKIA 1GLLO 3ID8A 2AA4A 1BA1A 2HOEA 3QDKA 4JD2B 3CJ9A 1NGHA 4JHDA 3SJHA 4HTLA 4BREA 4BRKA 4BROA 5AZIB 3UKUB 5AQPA 3JS6A 1HKBA 3VEZA 4XH4A 3MN5A 1NGCA 1NGDA 2BTFA 4MLHA 3ATVA 1ATNA 4BRLA 2IIRA 3SMPA 3VF4A 2P9SB 1ZC6A 1NWKA 2QXLA 3U9ZA 3KHYA 4RCHA 3C7NB 3U8XA 3W0LA 4FWRA 2A41A 3WUHA 4GY2B 5BREA 4O5FA 2Q31A 3CHWA 5JLHA 3CJCA 3MMVA 4A61A 1QQNA 5EX5A 1KAZA 2E1YA 3EO3A 2OANA 3DXMB 2QWRA 4XH5A 3ZEUB 1ESVA 3HBTA 2P9UB 4F9OA 1QZ6A 2FXUA 1Z6RA 2E2PA 2GWJA 4I6MB 2P9LB 1GLEG 5AQMA 1K8KA 2P9PB 5ELZA 4BGAA 5LY3A 1S3XA 2CH6A 4CI6A 3MK6A 3WXLA 3VERA 2I7NA 5F0XA 2W40A 1BU6O 4RWTA 3EKUA 1SQKA 4IJAA 4H03B 2GELA 2YI1A 3QICA 4IWVA 3GG4A 4K43A 4CBXA 1JCEA 5ADXH 4NB4A 5JLFA 3I33A 1Y64A 2VWBA 1QZ5A 3D7EO 3GDQA 3LDNA 5AQTA 3VOVA 3VGKA 5ADXA 4CZJA 4B9QA 4H0PA 3MCPA 4H0OA 1KAXA 1IG8A 4A2AA 5EY4A 1MDUB 4IXCA 5CE3A 3HSCA 3O6WA 2QWNA 2WUSA 3VEXA 3H3NO 2D0OA 1C0FA 3O1BA 4BGBA 3AAQA 1DGKN 3JXUA 3U4LA 1XQSC 3FZHA 3CQXA 1R59O 4BR4A 3CERA 3DXKA 3HM8A 3WXIA 2ASMA 3H6EA 2UYTA 2A40A 1SAZA 3CJ1A 1TYQB 4A62A 4BR2A 1D4XA 1YAGA 3OHRA 4FOIA 4BRMA 4CJ7A 1S22A 3A8YA 3CETA 3H1VX 3WT0A 3KZBA 3M6GA 4BRDA 3UB5A 3H45C 4MO4A 4FWNA 1T44A 3ZETA 2A6AA 3QMLA 4BVOA 5AQVA 1BO5O 5AQGA 4FWLA 4CBUA 1P8ZA 3RSEA 3VESA 3DWLA 5AQIA 3D2EB 2P9NB 4M7XA 5BPLA 1GLCG 3QFUA 1NGBA 4EIAA 1E4FT 2V51B 5E84A 5BR9A 5EVZA 2QWMA 4FWMA 5EXWA 5TKYA 3DAWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VQMN 4CZGA 4L3QA 4KHNA 3N4QA 4JYAK 4WFAL 3QFPA 4LY7A 5C42A 4WE1A 1KVAA 2E88A 5FPDA 3FFKB 4FJHA 4JK9A 3O8MA 1N33K 1VQKN 3HK2A 2F9WA 1EWRA 4DR5K 3KK7A 4HWIA 1FK9A 3P5JA 3CM5A 4EHTA 2HBLA 4IDKA 2R7YA 3SUPA 1VQON 2UXCK 3CI5A 4LH5A 4X65K 2ZM6K 2G8WA 3E9PA 1HNIA 1TK5A 3HI0A 3L4IA 1C1CA 4DF4A 3GL1A 1RGIA 3T69A 1JJ2M 1Q81O 4OPKA 5AJ3K 4JD2A 1UAXA 4B9NA 4WQ5A 3JYTA 3ISNC 2WTUA 1GLDG 2QWOA 3LDLA 4FWPA 4JKBA 4AM6A 2OPPA 2AP1A 1H1VA 1HUXA 1C0UA 4DFMA 4B1VA 1VRUA 2A5XA 1SL2A 4LF6K 2F7TA 2FSKA 1BL3A 3ENOA 4WQ4C 5BPNA 3J80O 1I3AA 1NOZA 1B9DA 4B1ZA 3CFRA 4FWSA 4ICLA 4AQYK 3O9QA 3E66A 3J7ZO 4LSNA 4QS8A 2KZMA 3VTIA 2YJEA 3GOIA 2PFUA 3O80A 3SPZA 3T3FA 3Q7CA 1Z05A 3K9KA 1P90A 4Z4CA 1XI1A 1TK8A 4FJLA 3SK3A 1RT2A 4CJKA 3OTOK 1ASUA 3HM9A 4HCBA 3HZ6A 1QSLA 1N6QA 2VYPA 4R79A 4M41A 4F2RA 4DFPA 3LM9A 3NF6A 5AQFA 2D0CA 3R9PA 1K8AO 3O9RA 3G25A 3TWHA 4HUEA 2VWJA 4N41A 4H5RA 3PSFA 3CJ7A 3S3OA 4CECA 4W5TA 5JVGL 3EZ5A 3DOLA 4ISGA 4EP5A 2YX6A 4NLBA 4CIFA 2HMPA 5I3UA 3J7AP 3VQAA 4CZFA 4FJJA 3RR8A 1KFDA 1NMDA 2V7ZA 4H0YB 4DQPA 2H3GX 2F96A 2GUPA 1HKGA 3AO2A 4ISEA 3S3MA 3J81O 4KB1A 1YF5L 4PHTX 4E3SA 4MLEA 1RDAA 1NJYA 3QBXA 4E89A 1ZBFA 2ASPA 5T7BA 2D4WA 4DUYK 1U2VA 3ZX3A 1RBTA 3OYHA 1G99A 3KKSA 1QHAA 4Z94A 3KK1A 2EHGA 1C0GA 1VSMA 3TTCA 2P9NA 2DFFA 2YV0X 3AARA 1GLJO 3ITHA 4B9VA 1WSIA 4PL8A 3ZCMA 1VQ5N 3V81A 4E0DA 3AA3A 2NLXA 3OBWA 4WYBA 1L3VA 1VQ4N 1TUUA 2E2QA 4KV8A 4B1XB 5AZIA 1FJGK 2NZTA 2FF3B 4M7YA 2ITMA 3VQ4A 2ZGZA 3R8EA 3P38A 4CJFA 3DMJA 2QKBA 3C7NA 1EO1A 2D0PA 3L2WA 3L2VA 4DTRA 3DM2A 5AQLA 3WQTA 2GV9A 2NRHA 4A57A 4AHCA 3LDOA 3UE5A 2Y1JA 4FXDA 4FWKA 3KWGA 3DXMA 2GEMA 3ZEUA 1TVRA 4WCEL 4E7IA 4F3OA 1NK8A 1YJNN 2CGJA 2O8CB 4E1JA 1NLVA 4BRPA 3V9SA 2V7YA 3FZKA 4B3MK 1BA0A 3NGYA 5HRSA 2VQEK 4CJWA 5M1OA 4CGGA 2P9KA 3A5LC 3OY9A 1BI4A 3NH2A 2HBJA 4Y1CA 3HP6A 3TAFA 5AQZA 2KZZA 1LAVA 4OGEA 1WUAA 5JENA 1UWBA 1QSSA 3ZT4A 3RSEB 3HPOA 2NRXA 4B8AB 1HPZA 1SKSA 1VSLA 1RBUA 1RT4A 4H4MA 3SUNA 4J2AA 3N4PA 4DTPA 1BCOA 1RTJA 3SPYA 3VQ5A 2ZQBA 3S9HA 1EX4A 1X9WA 3ZLJA 4UQGA 1YIJN 4CHOA 4WFBL 4DS4A 2ZGYA 1HLUA 1KXPA 3OYIA 1JLBA 1L3UA 1SZ2A 3SQ2A 5AZJB 4BRHA 1B92A 1DEJA 5KPZA 1U2VB 1X9JA 2Q2RA 3QB0A 3CD6N 5CR4A 4H5NA 1YXQA 2V52B 2D0AA 1VSDA 3MXJA 4FLUA 2VCPA 1RFQA 4CJSA 2RPIA 2XY8A 3IAYA 4B9TA 2OCEA 2NNWA 1BQMA 4JI4K 1M1KO 2HOEA 3QDKA 4JHDA 1IKVA 1NGHA 3NF8A 3SJHA 4HTLA 4BREA 4CK2A 3AVNA 3OYGA 4CFDA 5AZIB 1HNWK 5AQPA 4X64K 4JKFA 1BGXT 1NGDA 4J2DA 4Z4GA 2PY5A 1ZC6A 1NWKA 1QHTA 3CCQN 3KHYA 4RCHA 3C7NB 2QEXN 4KH5A 3I0RA 5IT9O 1NJXA 2XY7A 3G6EN 3THXA 4V19S 2Q31A 1RT3A 3DI6A 3Q7BA 4CJEA 5JLHA 4CJ3A 3CJCA 3V1RA 3P39A 3HRGA 4E7LA 2OZSA 2E1YA 3CCLN 2VG7A 4FZYA 3DXMB 3ZSOA 3ZEUB 3ZT3A 3RWUA 3HBTA 4F9OA 4FJIA 1ZBIA 4DR1K 3VMFB 2P9LB 4YOYA 1K8KA 2FBXA 5LY3A 2RF2A 2O8EA 2NRWA 3L4QA 4WF9L 1RCHA 3HP9A 3MK6A 3WXLA 5C25A 2I7NA 2W40A 4J2EA 1BU6O 3EKUA 2Z1GA 3C6HA 4IJAA 1O1WA 1N5YA 4BDPA 2UUCK 1VQ7N 4JS4A 1BI4B 2YI1A 3QICA 4IWVA 3L2RA 4FJ5A 1N36K 4LFCK 1W7AA 1JCEA 2HNYA 5ADXH 2UXDK 3GDQA 3LDNA 3VOVA 5ADXA 3VGKA 5BR8K 3NH1A 4DR4K 1X1PA 3MCPA 3HL8A 3VN5A 5EY4A 3JAMO 3OYAA 3HSCA 1KVCA 2QWNA 1Q9YA 3KKRA 2OYQA 3H3NO 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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