2YJEA

Oligomeric assembly of actin bound to mrtf-a
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
367
structure length
333
Chain Sequence
b'TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of a pentavalent G-actin*MRTF-A complex reveals how G-actin controls nucleocytoplasmic shuttling of a transcriptional coactivator.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
source organism Oryctolagus cuniculus
molecule tags Motor protein
total genus 114
structure length 333
sequence length 367
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yjeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yjeA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2yjeA03
3A5LC 3C7NA 4JN4A 3CQYA 3A8YA 5AQKA 1SAZA 5AR0A 1ZC6A 2HOEA 1ATRA 3L4IA 5AQZA 4NB4A 3WUHA 4BR7A 4CZGA 1DEJA 1XC3A 4B1XB 4CD1A 5FPDA 4BRNA 4EIAA 1U6ZA 3ENHA 4FWQA 3QFUA 4QS9A 1RGIA 1HJOA 3ZX3A 3CIPA 4WYBA 3CQXA 4H0YB 4ISFA 4CD3A 3VEXA 5BPNA 4FWKA 1QZ5A 3LM9A 2HMPA 3KVGA 4FWPA 4FOEA 5BN8A 5I9EB 3WXLA 2ZWHA 3A0IX 1NGIA 3DWLA 2ASMA 2ZGZA 5KQ8A 4RWTA 3ZEUB 2ZGYA 4RCHA 2W41A 5AZJA 3MDQA 3WXIA 2E20A 3CETA 5LY3A 3WEEA 2P9SB 3IUCA 1HX1A 4IZ9A 4B1VA 1G99A 2GELA 3R8EA 2OANA 2W40A 4B9QA 4FPBA 4JNEA 3FGUA 1NGGA 2V51B 3O80A 2P9NB 4FWNA 3SLCA 1NMDA 2CGKA 4K41A 1IG8A 1NGAA 4EHUA 1V4SA 2NRHA 3KZBA 2P9UB 1K8KA 4BC2A 5AZIB 3S41A 4H5RA 1U2VA 2FSNA 5FPEA 1BUPA 5AQJA 3O08A 4BVPA 5AQSA 3QBXA 1GLJO 2DPNA 4GNIA 4I6MA 2D1KA 3DAWA 1GLBG 2ASPA 5FPMA 3JXUA 4L3QA 5BRHA 3WXJA 4EAHD 4H0PA 3EL2A 4BRAA 3TU5A 3VEVA 2IVPA 1T44A 1HUXA 5ELZA 1BG3A 4H0VB 3QDKA 4FWSA 3CJBA 3FLCO 3HZ6A 2H3GX 2YHYA 4FWRA 1DGKN 3O6WA 1QQMA 5AQOA 3D2EA 3O8MA 1JCGA 3DXKA 3HI0A 4JHDA 2QWPA 4BROA 1MWMA 4QS7A 2A5XA 2VYPA 2VWBA 4H03B 2P9LA 3HM8A 2QWMA 1C0GA 3EN9A 3VEZA 1TYQA 5AQRA 4BR5A 1T6CA 3IFRA 3SMSA 2F9WA 3ZX2A 1H1VA 4CBXA 1HPMA 3U9DA 5KPZA 2FXUA 3CJCA 1S22A 3CJ7A 3VGKA 3UKRA 4EFHA 2GWJA 3VPZA 2YJEA 1MDUB 3F9MA 2V7YA 1HKBA 4FWOA 5KQDA 4DHYA 1GLCG 1ESVA 2YHWA 3A5MC 1QZ6A 3HBTA 5AQXA 1E4FT 3MN9A 3UKUB 3RSEA 4YDUA 5EOYA 3VETA 2EWSA 1S3XA 1T6DA 1YVNA 2A42A 3D2FA 3DJCA 5AQVA 5ADXH 4QS8A 1QQOA 2ASOA 3MN7A 3MK6A 4LC9B 2PAVA 3H3NO 1X3NA 2QW9A 4MLEA 3O1WA 4FOIA 4O5FA 2A41A 4C23A 5EVZA 3VEYA 1YUWA 3ATVA 2FF6A 5JICA 4JD2B 4BGBA 3U4LA 3D7EO 2A6AA 3EKUA 1GLEG 2E2OA 2P9IA 3DXMB 2I7NA 4WQ5A 5AQUA 3LDNA 2Q0RA 1RDWX 2ZF5O 4IWVA 5AFUA 5F1XA 2BUPA 4BRKA 1Y64A 3VOVA 3P4IA 3TPQA 2QXLA 3I8BA 5KPRA 4B1UB 5EX5A 5F0XA 2IIRA 1EQYA 1BOTO 4XH1A 1NGHA 3U8XA 3ULEB 5AQHA 4BRPA 1KAXA 4PKIA 4CZJA 3BUZB 3LDLA 5BN9A 2P9NA 5AQTA 3LDPA 3LDOA 4MO4A 4CZMA 3EZWA 4BRHA 2P9PA 4HWIA 1C0FA 3MCPA 3HSCA 2Q1NA 2BTFA 4Z94A 1BU6O 4BRLA 4WQ4C 3WQUA 5BRFA 2D0OA 2E88A 1WOQA 4B1WB 4Y0WA 4BC3A 4CZFA 1XUPO 1E4GT 4BRFA 5B8HA 2CGJA 1BDGA 1SQKA 1NGFA 5JLFA 2UYTA 3SMPA 3AAQA 3GG4A 4M7XA 5CE3A 1J6ZA 2D4WA 3JS6A 3H6EA 3L0QA 3ZX0A 3G25A 1NLVA 3O5BA 5F2RA 4A61A 2QWNA 3O4WA 3VF6A 4PKGA 1NWKA 4BRDA 3WEEB 5AQGA 3GE1A 2CH6A 2AP1A 2AA4A 4H5NA 2QM1A 1IJJA 4CJ7A 3FZFA 1KAZA 1NGBA 3H45C 5AQIA 1HKGA 2GTDA 3ZETA 3CJ1A 4FL9A 2NZTA 4A2AA 2FLOA 1CZAN 5AQFA 4CZEA 3U9ZA 3GBTA 4BC5A 2IVNA 4CZLA 1K8KB 3CJ9A 2QWQA 4CBUA 1U2VB 3A5NC 3L6QA 2KHOA 4FPAA 3WXKA 3FZLA 3GDQA 1OKJA 2E2PA 4I6MB 4XEIA 4ISEA 1TUYA 2FSKA 2P9KA 5LJVA 3BF1A 3ID8A 1RFQA 2WUSA 5JMVA 3WT0A 2YI1A 5AQWA 4BRGA 2VCPA 2E2NA 3BF3A 3J8AA 4H0OA 3VF4A 3LL3A 2HF4A 5LJWA 4PL8A 3SJHA 5BPMA 4H5VA 2V52B 3D2EB 4H0TB 4BQZA 3DXKB 3DXMA 3VGMA 2GUPA 3WQTA 1QQNA 3CERA 3EKSA 3R9PA 1ATSA 3VENA 2P9LB 2E1ZA 1YXQA 3BP8A 4J8FA 4BC4A 4CZIA 1NGCA 2YCHA 1TYQB 4BREA 4BGAA 1JCFA 1ZXOA 2E8AA 2NLXA 3MN6A 4H0XB 4IJNA 4PKHA 3ZEUA 1GLDG 5AQQA 3UKRB 2E1YA 3FR0A 4A62A 3FFKB 4B1ZA 3QBWA 1GLFO 1BA1A 5E26A 5AQYA 2CGLA 5AQLA 4BRQA 2P9SA 3LDQA 3RSEB 3W3DA 2PBDA 1MWKA 3A5OC 3EO3A 3H1QA 3D2FB 5AQMA 3M3ZA 4K42A 2Q0UA 1WUAA 2J4RA 1LCUA 4B1YB 1TUUA 3C7NB 4BRMA 5BPLA 3HTVA 4HTLA 3VEOA 4FSVA 3FZHA 3QFPA 3IMXA 5JLHA 4CI6A 1GLLO 2P9UA 2QWRA 3KHYA 5AZIA 1MA9B 2A3ZA 3BEXA 5EY4A 1GLAG 3OHRA 4RTFD 4M63C 2I7PA 3AARA 2P9IB 3FZMA 1ZBSA 5EXWA 3FZKA 4PL7A 3M1FA 4H5WA 3ATUA 3M6GA 4BG8A 3VEWA 4K43A 1NGJA 1R59O 2QWOA 1NBWA 4FWMA 5ADXA 3CHWA 4BR9A 3GL1A 3AAPA 2IVOA 2YJFA 4DCHA 4CZHA 1Q18A 3H3OB 4BRIA 4K25A 4A2BA 3R6MA 5AZJB 4GY2B 4IXCA 4CBWA 3VF2A 2CH5A 1NGDA 3VESA 4H5TA 4BQLA 3UB5A 2P9PB 4DB3A 4YDUC 1QHAA 2HF3A 1HKCA 3LM2A 3MN5A 4CZKA 4XH4A 1NGEA 3W0LA 1KAYA 4BR0A 1BO5O 4IJAA 5AQNA 5KPTA 1JCEA 4M7YA 3IDHA 3SK3A 1DKGD 1Z6RA 4NO7A 1D4XA 2ITMA 4FO0A 4E1JA 4XH5A 3O1BA 2Q2RA 5BREA 5TKYA 1HLUA 4O8KA 1ATNA 1KXPA 4WQ5C 3UE5A 1YAGA 3UKUA 5AFUH 1SZ2A 3I33A 3QB0A 1V4TA 4BG9A 4MLHA 2QWLA 2FF3B 3MMVA 4WQ4A 4JAXA 2E2QA 3H1VX 5FPNA 3QMLA 4FWLA 3H46O 3CJAA 2GEMA 2Q31A 3ZETB 3ENOA 4KBOA 2YHXA 5BR9A 3GOIA 4MO5A 1BWFO 1X9JA 2D0PA 3VGLA 4JD2A 4IO8A 1XQSC 1Z05A 4ISGA 4F9OA 3QICA 2V7ZA 4JHDB 3C0BA 4BRCA 1NM1A 3VERA 3CI5A 2FSJA 5AQPA 1X3MA 1P8ZA 2GWKA 1BA0A 2A40A 2F9TA 2Q97A 3AY9A 3FE1A 2P9KB 5BRDA 2Q36A 4AM7A 4BR4A 4DQ8A 3ULEA 4AM6A 4EHTA 5E84A 4BR2A 1LOTB 4BVOA 3B8AX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C6VA 4JN4A 1S1TA 3KD1E 1WNSA 3LPTA 5AR0A 1ATRA 4BR7A 4CEOA 3ZSVA 4B1XB 3V1RA 4CD1A 3SYZA 4BRNA 1U6ZA 3TTDA 4DR1K 1C1CA 4QS9A 3ZX3A 3CIPA 1I3AA 4H0YB 1QZ5A 3LM9A 3KWGA 2HMPA 3L3VA 5I9EB 3CC4N 3SPZA 5JENA 1ZBUA 2ZWHA 3NCIA 1T8EA 3ZEUB 2ZE2A 5AZJA 3MDQA 3WXIA 1HNWK 2HBJA 4KB0A 4YY3K 1HNXK 4IFYA 3WEEA 3IUCA 1QE1A 1JLEA 3Q7BA 2W6KA 3CM6A 1G99A 2DFFA 1LW2A 5C24A 2W40A 4JNEA 2EHGA 3SUPA 3OYGA 1YF5L 2V51B 4ZHRA 4CHYA 4FWNA 1C0TA 2CGKA 3CYGA 1VQNN 1BI4A 1V4SA 3DRPA 4ILJA 2XY6A 2VWKA 4CEAA 4NLCA 5AQSA 3K57A 1TGOA 5FRNA 3S3NA 3TTCA 4I6MA 3O3GA 1W7AA 4B9MA 2HHIA 3LWLA 1Q86O 3J81O 4L3QA 4OPJA 1T05A 4M3RA 3OYNA 1QSLA 4H0VB 1JKHA 4LH4A 3CJBA 3HZ6A 3O6WA 4JK9A 3OYAA 5KGWA 1I39A 1JCGA 4JHDA 5LL6Z 2KFNA 1W9HA 3SUQA 4CW7B 5J2QA 4E89A 3ZT0A 4KAZA 1T6CA 3VQ8A 4CGFA 2B6AA 2FXUA 5I3UA 2PYLA 4NLBA 3E9PA 3L2RA 1SL1A 1NK0A 1D5AA 4E7HA 3VPZA 3LAMA 2V7YA 4DHYA 1DT9A 1TAQA 3MN9A 4R79A 1U48A 1NG9A 3NAEA 1S3XA 1SL2A 1T6DA 1YVNA 2KLAA 3C95A 3RMCA 1BISA 4QS8A 1QQOA 2F4VK 2RKIA 1IKVA 3H3NO 3THXA 1RT5A 3N4QA 1YUWA 4JD2B 3ENBA 3MX2A 4BGBA 3U4LA 3D7EO 2A6AA 1GLEG 2F7TA 4L8RB 3IG1A 4KHYA 3DXMB 5J2MA 4FW2A 4O55A 1RBSA 3HSTB 1OH8A 3G6EN 3U3YA 5AFUA 4CJ5A 3RTVA 1VSEA 4FZZA 4NXNK 4B1UB 4FLVA 5EX5A 5F0XA 2IIRA 4BRPA 1D9DA 4PKIA 1SS6A 4KTWA 1ZBLA 1FK9A 4CF2A 2HW3A 2HVHA 3V6DA 3KK2A 4CZMA 3EZWA 3TAMA 3T1HK 2DTUA 3ITHA 2Q1NA 4JI0K 4Z94A 4BRLA 4WQ4C 2PY5A 4QOZB 2D0OA 5J2PA 4BC3A 2CGJA 1SQKA 4DTMA 4IBNA 2UYTA 4DLGA 5LMUK 4CE9A 4BE0A 1YI2N 2O8EA 3GG4A 2D4WA 3H6EA 4DV7K 3ZX0A 4CEFA 3G25A 5F2RA 3O5BA 4FLXA 4FJLA 2YX6A 3TTFA 3VQCA 3O4WA 3WEEB 3GE1A 4H5NA 3VA0A 4M3WA 4IFEA 2KZMA 1HKGA 3CJ1A 2HHWA 4E7LA 3VQQA 4FL9A 2NZTA 3C6HA 2FLOA 4DUYK 2VWJA 4CZEA 4FJNA 4CHQA 1NJZA 5HRSA 4JEPA 3P38A 1SL0A 3VTHA 1QSSA 3OYIA 3KKSA 4LF9K 2HB5A 4A5AA 4JKGA 1ZBFA 4CBUA 1LAVA 1RDAA 4C8NA 5C2DA 1C1BA 3NF6A 1OH6A 1VQ4N 1A5VA 4LF8K 3FZLA 4DFPA 4Z4IA 2E2PA 4I6MB 4E1NA 4E0DA 2IDOA 1TUYA 3HOTA 2P9KA 1P90A 5LJVA 3MAQA 1NKEA 4BECA 5JMVA 3T1YK 3WT0A 2YI1A 1VQPN 2E4LA 4FCYA 4CGDA 3BF3A 4AH9A 1TK8A 5E41A 4DUZK 5JVGL 2HHHK 3LL3A 1HMVA 2P51A 4WFBL 4DQSA 5BPMA 4B8CA 4CJTA 4H5VA 3M8QA 3OYCA 4HVJA 1Q9YA 3PY8A 4CF0A 3L3UA 4KHUA 5FROA 4FM2A 1TVRA 1YXQA 4GVMA 4BC4A 4CZIA 1NGCA 4KHSA 2BH1A 1WBDA 4MDBA 3JYTA 2D0CA 4C1NI 4GKJK 3NF7A 3U3GA 3VQ4A 1OVQA 3QBWA 1NJYA 5AQYA 5HL7L 3AA3A 4DV2K 1XNQK 3NGYA 3D45A 4O44A 3KTQA 3SQ0A 1RTIA 3OYBA 3QNNA 4LFAK 4C8LA 1YTUA 4B1YB 2P1JA 3THXB 4CIFA 5BPLA 3FZHA 3QFPA 4A59A 2QWRA 3SAFA 3HJFA 1MA9B 1NMNA 4RTFD 4M63C 4YFUA 1DTQA 2W6LA 2JGUA 3E01A 3I0SA 4PL7A 1NJXA 4M3UA 4FVMA 4IO9L 3KK7A 2KKZA 1TL1A 3M8PA 4BG8A 1M1KO 3VEWA 4K43A 3OVNA 3KD5E 4BR9A 3AAPA 4DCHA 4CZHA 3AO5A 4OLBA 3PSFA 1B9DA 4BRIA 3E9OA 4GY2B 5C25A 4IXCA 4FXDA 3H08A 3G4SN 3OTOK 3TAQA 3VESA 3AO1A 4BQLA 1IO2A 2GX9A 4DB3A 1QHAA 2HF3A 3QIOA 3MN5A 1BGXT 1VSDA 3AGKA 3VA3A 2VGNA 3DLKA 3OBYA 4CIGA 1NGEA 4YORA 1FW6A 3K2PA 1JCEA 3IDHA 1T3VA 1DKGD 1Z6RA 4E1JA 2O8EB 1L5UA 3TSUA 3T7ZA 5DM7L 4ILGB 3MX5A 5C42A 1RDUA 4BG9A 4CESA 4DR3K 2QWLA 3AVAA 4JI2K 2QA4N 4DTXA 2E2QA 5FPNA 3QMLA 4KTZA 4FJXA 4YOUA 2Q31A 4B9UA 1JLFA 1Z26A 4KBOA 4MO5A 1X9JA 2D0PA 3CG7A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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