2YJHA

Thiol peroxidase from yersinia psuedotuberculosis, inactive mutant c61s
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
TMTQTVHFQGNPVSVAGKLPQIGDKAKDFTLVAKDLSDVALSSFAGKRKVLNIFPSIDTGVSAASVRKFNQLAGELENTVVLCISSDLPFAQSRFCGAEGLSNVITLSTLRGADFKQAYGVAITEGPLAGLTARAVVVLDGQDNVIYSELVNEITTEPNYDAALA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Yersinia pseudotuberculosis
publication title Structural Characterisation of Tpx from Yersinia Pseudotuberculosis Reveals Insights Into the Binding of Salicylidene Acylhydrazide Compounds.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOL PEROXIDASE
total genus 43
structure length 165
sequence length 165
ec nomenclature ec 1.11.1.-:
pdb deposition date 2011-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2yjhA00
1I9DA 4IQ1A 5A4WA 2N5AA 1GUMA 4MCUA 1URMA 5LD0A 2GZPA 1O7UA 2V6OA 3UOMA 4IVFA 5JWRB 4O7HA 2TRCP 1ERUA 3CBUA 4KCEA 3M8NA 2HT9A 4LL4B 4TR1B 1X9SB 3TGZA 2AB6A 3ZVJD 4NWYA 2F51A 4ZB6A 1JFUA 3HZ4A 2C1YA 1G7OA 1YKAA 4MDCA 4TN8A 2QSIA 4WKWA 4J57E 3L4NA 4F0CA 2B3SA 1ZGNA 4BPYA 2JZRA 1GNWA 4IQAA 1TK5B 1TTZA 2HFDA 2LJRA 1T3BA 1X5DA 2XBQA 1AQXA 2KUCA 3I6AA 1NM3A 1K0NA 1GUHA 5C00A 4HU9A 4IKHA 1U88A 4MF6A 3BBYA 3QAVA 3FR9A 1M9BA 1YZXA 2A4VA 1A0FA 1A0RP 2F8FA 3VWUA 5AISA 20GSA 2DJKA 1WPIA 2B7JA 1SKWB 1XOBA 3GX0A 4TRXA 3D0ZA 1RK4A 4NAXA 1XFLA 2R2JA 4XS4B 3TRPA 2JZSA 1SKRB 1WRYA 3LXZA 2E0QA 1EOHA 2CVBA 1G7EA 1FOVA 1AW9A 1DE2A 5H5QA 2WZ9A 1O8WA 1H4OA 3SBCA 1XPVA 1B4PA 1PGTA 3FR3A 2B6MA 2HXKA 4PX1A 2L57A 4F82A 1Y25A 5C04A 1OC3A 3N9JA 1X5CA 2RUFA 2EIRA 2FD3A 2WDUA 3HD5A 4MZWA 4XHMA 2G0FA 2LKUA 4AJ6A 4ML1A 3HYPA 3F6DA 2LQOA 2H73A 4WBRD 3MAKA 1ZYEA 2YWOA 1TI1A 3G7JA 4EKZA 4IELA 3RPNA 1PQNA 4ZBBA 4WBJA 4TR0A 1PRXA 2H71A 1V2AA 5CP1A 1I5GA 2C0FA 2FWGA 2O8VB 4K1FA 9GSSA 3FK8A 3ZL5A 3GIXA 4HOJA 1MDKA 1WWJA 2DIYA 4ECIA 1MD4A 2GS3A 2JL4A 11GSA 4JR4A 4MPFA 5EY6A 4V1Ag 5KN0A 4EXJA 2OJLA 1EEJA 3BCIA 2CX3A 3GTUA 3KM6A 5FT3A 3WT1A 2PVOC 3UARA 4N30A 3ZZXA 3GSTA 3WYWA 2HZFA 2LEGA 1RQMA 4K7IA 5ECLB 1AC1A 1GLPA 5ECHB 5IM9A 3VFIA 1BYEA 2FUG2 1QGVA 4Z7XA 4K0NA 3ZFLA 3CRUA 5DJMA 3V1WA 1EZKA 2L6CA 3WGXA 4HI7A 2ZUPA 2F8AA 2XPEA 1QUWA 1FVKA 1DSBA 1KBNA 1ZYQB 3HVSA 2JSYA 2FLSA 3KEBA 4LA1A 4LL1B 1GSYA 3LORA 4KE3A 3C8EA 4EO3A 2LNSA 3TKSA 2CZ2A 4IGJA 3A5WA 2C80A 1EWXA 2AYTA 1OVNA 4POLA 3C1RA 2LS5A 1B9YC 1PD21 3IBHA 5IMAA 3UVTA 1X0RA 5B8AA 3F3RA 4FYBA 3M3MA 4PUAA 2JACA 1SK2A 1EGRA 2EIQA 4V2NA 3HDCA 2H6YA 2OE1A 2E2MA 4JU5A 2C0DA 2CQ9A 5AIXA 2EC4A 2M46A 2G2QA 2IMKA 1SJIA 2C3QA 4OMVA 2NVLA 4NPBA 1WIKA 5IO2A 3GFKA 4EUYA 4MF7A 3P2AA 1X9MB 3R2QA 1B9XC 3TJFA 4WF5A 1LJRA 1GTIA 3TKRA 4ZB8A 2C0GA 4N11A 4OCEA 2VO4A 3LSZA 3E9JB 4OFNA 4BL7A 2VL2A 4P3YB 4V2MA 5AGYA 3QD9A 1AUCA 4YQUA 2V1MA 4OO5A 2H1GA 4MF5A 2X8HA 2H0GA 1SJ6A 1M0UA 4ZBDA 4RUVA 4L5OA 1U87A 3A2WA 3QMXA 5HR1A 2IMEA 2LTKA 2LJKA 2R6KA 3CSHA 3EINA 1X5EA 4ISDA 4PQIA 4GCIA 4JR6A 1G0TA 4ZIJA 3DYRA 3D6IA 3RPPA 1BEDA 5D93A 4DVCA 1E2YA 2O85A 3FHKA 1TK8B 2MMNA 4LLRA 1VGLA 5IPHA 1PN9A 4PURA 4HDEA 3U6VA 5B7CA 3LGCA 5B6NA 2NTOA 1SD9A 1OKTA 1OC8A 1ABAA 4AF2A 2BJXA 1YEPA 4AJ8A 2KOKA 1MD3A 3APSA 3TRQA 1OE7A 1U3IA 4HQZA 1S3CA 1GRXA 2H1BA 2REMA 2YZHA 3FZ5A 4X0XA 2YOIA 14GSA 1WJKA 5FHIA 5JCUA 3KZQA 1G6WA 4CDOA 1F3BA 3L78A 2BMXA 3GTUB 5D73A 2YJHA 1JHBA 2CZ3A 1M2AA 3NZNA 1O8XA 1QMVA 1W89A 2ALBA 2GT5A 2F3MA 1N2AA 1ZOFA 2HI7A 2FWEA 2AAWA 3S9FA 3TOTA 2L5OA 1T1VA 3PINA 3QFBC 1HNCA 2YANA 5HFGA 2EIOA 3NIVA 2R5GA 1SENA 3GURA 1QFNA 3HCZA 5EPFA 2CAQA 2IWTA 5HR2A 1TKDB 2I4AA 2FHEA 2X99A 4G9HA 1GTUA 2L6DA 4YH2A 2K8SA 1T4YA 3ZITA 4NHWA 3DWVA 1F37A 5CYYA 3GL5A 2YV9A 5G30A 2AV4A 2WGRA 3ZMKA 1SL2B 2VL2C 5EL8A 3EURA 2AUVA 4BWQA 3EMPA 1DE1A 3P8WA 3FYGA 3G9BA 4PQ1A 3HY2A 2ES7A 1OYJA 2GT6A 3C71A 3H79A 5CREA 3GSSA 1SU9A 1MTCA 1W4VA 2LQQA 1XXUA 3IA1A 3CTGA 1PSQA 5DALA 1E6BA 2P0GA 2RLIA 3HKRA 2C3NA 3HJPA 5INYA 1O73A 3QDNA 3TKSE 2IL3A 1K0OA 3QFAC 4PUFC 5H5SA 3UMAA 2WS2A 4RI6A 3O6TA 1XVWA 5IOXA 5ELAA 1TU7A 3BJ5A 3KCMA 2H1DA 5F07A 2LRCA 1GSDA 4FIWA 3HA9A 5DAKA 2VL3A 2VLTA 3G7YA 1JZDA 3KTBA 4K8MA 3F4TA 4E8EA 3RDWA 3RHBA 4CW9A 6GSXA 1A2MA 3ZREA 4MLYA 3M0FA 3CRTA 4GF0A 1S3DA 3TKPA 3KIJA 3GNJA 1EV9A 3ME8A 2GSSA 3LXTA 4EF0A 2O89A 3FKFA 4NXIA 4KDUA 2QKEA 3KD0A 3GYKA 5CRHA 2YV7A 2CT6A 4GSNA 3H93A 3CXGA 3F63A 3CTFA 4FYUA 1HNAA 2XPDA 4QL9A 2MMZA 1GLQA 2VCZA 3GN3A 4KNDA 4GQFA 3RAZA 2H8LA 2WJUA 1NHOA 4ULXA 3Q74A 4LMWA 4PNFA 2H1AA 5EVOA 3VI5A 3W8SA 2V41A 4MH2A 1QK8A 5DJLA 4ZBAA 7GSSA 4POBA 3LJRA 2IMFA 1UN2A 1TK0B 1JLVA 3SWLA 4N0ZA 2TIRA 3C7MA 4O92A 1TRWA 3M1GA 2GQKA 1EP8A 1GH2A 4KB3A 3VWXA 4KX4A 1M9AA 2DBCA 2HRFA 1TOFA 2D2ZA 3PGTA 5ECOB 4TR3A 4LMVA 1Z7RA 1TDIA 5F05A 4IP1A 2GSQA 3ZIVA 4HJMA 3KJYA 3IXRA 5CNWA 2R3XA 2L4CA 3ZLPA 2WFCA 5J9CA 4MPGA 3CMIA 2I9HA 2I81A 5D9VA 1GTAA 3EVIA 3K8NA 2K9FA 22GSA 2YZUA 1GWCA 1USBA 2MBSA 2VD0A 3FRCA 4OD7A 3Q18A 1VF2A 3GKNA 1XWBA 1DBYA 3D5JA 4OCFA 3TRXA 2B5EA 1PL2A 3G7IA 2NBSA 2CV4A 5LCZA 1VF1A 3CYNA 2OBKA 1PKZA 1BJXA 4BA7A 3APQA 2XBIA 3IDVA 1SK1A 1HYUA 4IHUA 3APOA 3GX8A 5HR0A 2V6KA 2H6ZA 3ISOA 1U3AA 3A2XA 3KH9A 1XBSA 2DMMA 5HR3A 2X8GA 3WGDA 2YNXA 2YN1A 4HQSA 3LYKA 2VCTA 1CQGA 5IQYA 4TXVA 3HJOA 5J5NA 3LYPA 2E7PA 3WGEA 3TUEA 1DUGA 2JZTA 4AGSA 3DGQA 5DALB 1S3AA 2X64A 3E3EA 2GQLA 5DDLA 2FA4A 2C4JA 1Z6NA 1TXXA 3MSZA 3DD3A 3I69A 1T7PB 4ECBA 3TB2A 5J4UA 3DIEA 5DAKB 12GSA 2QC7A 1ZZYA 4MJAA 13GSA 1YDKA 4O32A 1NW2A 2B5XA 2FWFA 2GQMA 3F4SA 4I97A 5D9XA 2K8VA 2FNOA 4HS1A 4GTUA 1IYHA 4XS1A 17GSA 1V57A 4MZCA 3LWAA 4L0UA 3N5OA 5COHA 4MMMA 2OKAA 4G19A 1XW9A 2H19A 2DMLA 4BVXA 1OKDA 2IIYA 5G1KA 5IO0A 4EVMA 1Z5YE 4FH8A 4K7OA 1EGOA 3HJMA 3L9UA 3H4KA 3W6GA 1WMJA 1JZWA 3BOAA 3FZ4A 1YKCA 3WD6A 1THXA 2LJAA 4K7NA 4PGTA 5ECQB 4HUAA 4OO4A 4IJ3A 2L59A 4GSSA 1N8JA 5GSTA 1K0MA 1GULA 2MMAA 2LRTA 3QOUA 4CHSA 2VOCA 4ID0A 4TXOA 4WF4A 4WETA 4J56E 4EE0A 1R5AA 4DSQA 2WULA 3CSJA 3D4MA 3TOUA 4I2UA 1GSQA 3GKMA 1YF1A 4ZL7A 4YQVA 2P31A 3ZTLA 5J3RA 1M7TA 3UBLA 2DJ3A 3EU4A 2GSTA 1KTEA 1G6YA 3Q19A 4JBBA 4OFMA 4ZXGA 1SL0B 1TI3A 3KMOA 4AJ7A 1TRSA 1EOGA 2JSZA 4QL7A 2N5BA 1WP0A 2OADA 3L9VA 4TR1A 2DJ2A 2QGVA 4OFTA 2GTUA 4MH3A 6GSYA 4NMUA 2XHFA 2JU5A 1VRSD 1AQWA 2VAFA 3AY8A 3F3QA 1NHYA 4KDXA 3IC4A 3UEMA 5AN1A 4L0WA 1V98A 1Q98A 4ACSA 2IMIA 1THOA 2A2RA 6GSVA 1B4QA 4I6XA 3FW2A 1J9BA 1QQ2A 1R4WA 4L5LA 3IRAA 1FW1A 4JE1A 2HSYA 1K0AA 1XZOA 4MJBA 1Z9HA 2H30A 3BCKA 4Q5QA 5KN3A 4Q5FA 4K0GA 2MYGA 3IK7A 6GSWA 2MZCA 3VPQA 4PNGA 2VLVA 2DLXA 5A4VA 3VI7A 1JLWA 1PX7A 3E0UA 1O6JA 2CA8A 2RM6A 3LQ7A 5D8IA 3IK9A 1TRVA 3P90A 4MJEA 5D9TA 2IJYA 3IOSA 4KSMA 1F2EA 3CSIA 3O3TA 5ABRA 4EL1A 3FEUA 3M9KA 4JEDA 3HVXA 1K3YA 3ZRDA 4F2IA 5ECPB 5E59A 4X43A 1HQOA 2PMTA 4IP6A 5H5RA 1GUKA 2GZZA 5DVBA 3JCML 3L0HA 1Z3EA 1XWCA 1LU4A 3MNGA 2FA8A 1A24A 1V9WA 2C3TA 3FZAA 2V2GA 2L4QA 4IW9A 2DIZA 3U5RE 5G1LA 3WT2A 1J0FA 4GLTA 4V1Ap 4ZL9A 3A3TA 2VCVA 3ZFBA 2H75A 1SJZA 4IJIA 1T8EB 3H8QA 4J2FA 2P5RA 4K6XA 5ECSA 5D9WA 1J08A 4WR5A 1M2BA 5G31A 4K2DA 4ZILA 2H76A 2YJ7A 5DCHA 4I8BA 1A8LA 3EU3A 3IV4A 4O5RA 2BTOT 4TXOB 2H70A 1TU8A 3IAS2 5ENUA 2LUSA 2IMDA 4HZ2A 2FWHA 4TKYA 4FO5A 4KDYA 3EYTA 3L9SA 5IOWA 3IPZA 3DMLA 5F8BA 2FCHA 2I1UA 5F06A 5B6MA 5L71A 2HRNA 1PMTA 5A4UA 1ON4A 3UAPA 1IYIA 1K0DA 2C0EA 3QPMA 2VCXA 1CQHA 4XCSA 3KGKA 2YPMA 3HXSA 4IBPA 5DQSA 4Q5NA 1ILOA 1UVZA 1GSUA 1GSFA 5J9BA 4V2LA 5DCGA 4Q5RA 5JCGA 1VF4A 1GNEA 1K3OA 1PKWA 2YWMA 4ZL8A 2LSTA 1AXDA 1SKSB 4MZBA 4RQXA 2GSRA 2O87A 1TRUA 2LRNA 3GL3A 10GSA 1XIYA 1Z7PA 1F3AA 2NDOA 5JWQB 2PERA 1BG5A 1YJ6A 2ON7A 1YQ1A 2LV3A 3FZ9A 3UIWA 3KP9A 4KCAA 2OBIA 2PU9C 5IMDA 3PR8A 1FG4A 1A8YA 3GH6A 4DSRA 1OC9A 2H66A 4I2TA 3VWVA 3FY7A 2CVKA 3TJKA 1ACVA 4DSSA 3ERGA 3FR6A 4ML6A 3TJJA 4K9ZA 1ERVA 5ID2A 2AHEA 3EWLA 1H75A 1Y6EA 5ECMB 1RW1A 2CVDA 4MP4A 3W8JA 2WCIA 1FO5A 5J41A 4MA9A 3H1NA 1SL1B 3GHAA 2B1KA 5HFKA 4XTSA 1XW6A 1TP9A 4NV5A 4EC0A 1FVJA 2LNTA 2VM2A 1XW5A 3F9UA 3UBKA 2MMOA 5IMVA 2B1LA 4PXOA 5JCWA 3GA4A 3I9V2 4WXTA 5IIZA 4TOPA 2HSHA 4N10A 3F0IA 1SD8A 4EDYA 4KH7A 4TVEA 2I3YA 5A5KA 4G2EA 1MEKA 3GMFA 3DVXA 2ON5A 5CRWA 1T00A 4IN0A 4GQCA 1XVQA 1M2DA 1BX9A 3KTLA 6GSTA 2TRXA 2WRTA 3RBTA 1UC7A 3ED3A 2J9HA 3BD2A 4G10A 4L8EA 4NHZA 3IAM2 1R7HA 5HFIA 1R26A 2GDRA 3KH7A 2IFQA 4GSTA 5ECNB 1YEXA 2GVPA 4MABA 3D22A 1XWGA 3I43A 3TJBA 1B8XA 3C1SA 2JADA 3QCPA 3J7Yb 4IS0A 2DC5A 2VL9A 2AJQB 1B48A 1O81A 4HZ4A 3GKXA 2GZYA 2PWJA 1K3LA 1KEBA 3GUSA 1O85A 2XC2A 1ZCPA 2H0HA 3P7XA 2PVQA 1MDIA 1XCCA 5GZZB 4F03A 1UA5A 3QAWA 3ZMLA 3DRNA 2FGXA 4E8HA 1XOAA 2KP2A 4KAEA 3A2VA 4HU7A 2M80A 2PN8A 3GKKA 5DQYA 1JZOA 3KMNA 3O76A 4NV2A 2R37A 4HEA2 3F8UA 2C8UA 1BQ7A 1NSWA 4RQRA 4D73A 4MK3A 4RI7A 1A23A 3J7Yk 4GRFA 1EP7A 2PGTA 2IN3A 2KLXA 1ERTA 2H74A 3DKSA 2O7KA 3LEFA 3UVHA 2K6VA 3UJ1A 1PA3A 4ILFA 4JRRA 2RUEA 1HD2A 1PX6A 4F9ZA 2HZEA 3UL3A 4YAPA 1ML6A 2VCQA 2V32A 1FAAA 4X1UA 8GSSA 3HVVA 3MWHA 2A2SA 2ZCTA 5CRGA 3VLNA 4I5QA 5IMZA 3ZVJA 1K0CA 1KNGA 2N5FA 3D4TA 5JWOB 4JZQA 1YY7A 1OC9B 5ECRB 1GP1A 4DSSB 1GSSA 5GAPD 2YWIA 4GXZA 2DJ0A 5CRDA 1XWAA 4ZB9A 4KW6A 2KHPA 3US3A 1LBKA 6GSSA 3M9JA 2OE3A 4KA0A 2IPAA 4DEJA 3GRXA 5IMCA 5ID2B 4ECJA 3VWWA 1F9MA 2HLSA 2OE0A 2DJ1A 3RHCA 5D96A 4POKA 4WEYA 2VIMA 2K18A 18GSA 2X8CA 19GSA 2VLUA 4N0VA 2ZNMA 2YWNA 3KXOA 5DBQA 4POMA 3QR6A 3EE2A 1M99A 2VCWA 1PL1A 3VK9A 5KN2A 1Z6MA 3HHVA 2H72A 1GL8A 5CO3A 4YQMA 3QAGA 3ERFA 1V40A 2YCDA 1QXHA 5G5EA 3LFLA 2RIIA 4GWRA 1F6MC 3ERWA 1R5PA 3PH9A 3IE3A 1A2JA 5GAND 2FY6A 3F6FA 3DEXA 2PUKC 4XS4A 2M72A 1U6TA 1BAYA 1MDJA 4TW5A 2GLRA 2YP6A 1SYXA 1GTBA 1ERWA 3Q6OA 4XRAA 1XWKA 3TKQA 3TKSC 5GSSA 5IPGA 2H6XA 3IHQA 3F4RA 2IFQB 4TR4A 4PQHA 1FB6A 1T4ZA 3EC3A 5B8BA 2DSAA 1C72A 1Q4JA 3ME7A 16GSA 1AAZA 4BVYA 5F0GA 5IMFA 4HJ2A 3TCOA 5ECIB 5ECKB 4OWYA 2R4VA 4FYCA 2PBJA 3OR5A 3VURA 1X9WB 2CX4A 3EMXA 3HZ8A 3LG6A 2P5QA 2CAIA 2NPBA 4MJCA 5HQPA 2HE3A 1OE8A 1GSEA 4F0BA 3TJGA 1EV4A 4H86A 2MBTA 1TW9A 3ZYWA 4QQ7A 1WE0A 5FWGA 5KEJA 4KGIA 1WOUA 2HYXA 2KP1A 5G5FA 1K0BA 2RM5A 1OAZA 2Z9SA 3IR4A 1ZMAA 1SK0A 4D73B 2E2GA 1AIUA 1V58A 3C73A 5CAXA 1ST9A 1FHEA 2OA7A 4XIHA 6GSUA 1EEMA 2HNLA 2WB9A 5G2ZA 2DJJA 1VF3A 2J23A 1FB0A 4KUNA 3NOFA 5KN1A 3VPTA 4BWSA 4KSOA 1JZRA 2PPTA 5ELGA 5E4WA 2H0IA 2OACA 3ZIJA 2VD1A 3TDGA 3DXBA 3GH9A 2B5YA 3MDKA 1SYRA 3D21A 2HZEB 1A2LA 1HNBA 1YF0A 2H01A 4WR4A 4EDZA 4XRDA 2F9SA 1AQVA 4XS6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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