2YM4A

Crystal structure of checkpoint kinase 1 (chk1) in complex with inhibitors
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
267
structure length
251
Chain Sequence
PFVEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structure-Guided Evolution of Potent and Selective Chk1 Inhibitors Through Scaffold Morphing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK1
total genus 78
structure length 251
sequence length 267
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2ym4A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2ym4A01
3DAEA 5CAQA 1LEWA 4F7SA 5IEXA 3H0YA 4ID7A 3LHJA 5CSVA 4E4MA 3ZSGA 3FDNA 2QO7A 2YIWA 1M52A 2P2HA 4I0SA 1Y6AA 4BVUA 2WTIA 4BCMA 3KMWA 2J90A 4PNIA 4BCFA 1YOMA 1XO2B 3HEGA 1HCLA 3W2OA 4FT7A 1M17A 2YHVA 1OIUA 2BDFA 1TQMA 4FV7A 5JK3A 2IPXA 2W0JA 5CU3A 3KL8A 4FGRA 2OIQA 3DNDA 2CNUA 4CQEA 2C47A 1AGWA 1Q8TA 2QOIA 2XIRA 3KRJA 4RVLA 3GOKA 4TYHA 2IVTA 5CEIA 3UC3A 5CF8A 4RA5A 3EN4A 4HZSA 3TZ9A 3SDJA 1WVXA 4AFEA 4IHPA 2PUUA 2B4SB 2FB8A 3O23A 5ICPA 2A1AB 4DGOA 3QX2A 2ZJWA 4CKJA 2RL5A 4II5A 3WE4A 3BX5A 5IUIA 1WBOA 3BRBA 5M08A 1Q61A 3MIYA 4B4LA 2V55A 2VTLA 3D5VA 3GENA 2YDJA 4UMTA 3QWKA 1A48A 2QQ7A 4ZJIA 2O0UA 3QAME 3R21A 4M84A 4YC6A 3QGYA 3R7VA 4FIGA 3HV3A 4E6DA 2WQOA 3IECA 5JH6A 5A3XA 4O27B 5M4UA 5M4FA 3GBZA 3LM5A 3QWJA 5EOLA 4O2ZA 4UMPA 4FNYA 2QOFA 5EOBA 2XH5A 2CNQA 5HTBA 5IA1A 2A2AA 2C4GA 4F6WA 5IQGA 4R7IA 3LQ8A 3EB0A 4JG7A 4IX4A 2OG8A 1PXKA 3H9RA 4HOKA 3T3VA 1OMWA 1OVEA 3R1QA 4Q9ZA 3QTXA 3C1XA 2ITWA 1WBPA 1PXIA 4CFUA 3MA6A 4G9CA 5BMMA 4IDTA 4FBXA 5DT3A 1H27A 1PJKA 4NKSA 4CMOA 5HG8A 3DZQA 3QKLA 4M13A 4OLIA 4AAAA 4FKLA 5BVKA 4PPAA 3ZS5A 2PZIA 4GU6A 2ETMA 5AX3A 4EC9A 1GIJA 3LFFA 3ZMMA 3EH9A 3ANQA 5TE0A 2HCKA 3Q32A 3JS2A 3RPVA 3TV6A 5EW3A 3NUNA 3ZRLA 3NNUA 4KS7A 4QMTA 5A6NA 2WXVA 4AOIA 2ESMA 2BIKB 3VRYA 2C3JA 1E1XA 5I4NA 3B8RA 3DBCA 3MFUA 3O51A 3QTZA 4FV0A 2UZUE 4DFLA 4O6EA 3D7TB 4CFWA 4PY1A 3O71A 4L00A 1YXTA 4P5QA 3HVCA 3SV0A 4XP2A 2FVDA 4O0VA 4C4GA 4Z55A 1Q99A 2YISA 4U80A 4MNEB 3DTCA 4XX9A 4ERKA 3QQUA 2VWBA 4MBJA 3V8SA 3LOKA 4ZZOA 5DRDA 2JAVA 4BZDA 3V6RA 4C02A 1IAHA 4BDKA 2XK8A 4DHFA 4F1OA 3ZRKA 2YJSA 1PKDA 3EYGA 4PPCA 2PMNX 3PDTA 2OIDA 4NTSA 5T68A 3TIZA 4AA0A 4IXPA 4U8ZA 2UZNA 5D7VA 3F5GA 2C6LA 4DEEA 2PZ5A 3QLGA 3NUUA 4RWIA 5HTCA 3IS5A 2YITA 3C50A 4NIFB 4FEVA 2HK5A 4YPDA 2C69A 3GVUA 5H8BA 4JQEA 5FP5A 3BU6A 3G0EA 1I44A 2BDWA 1H07A 3DBEA 4RZWA 4AE6A 5JN2A 4E26A 3HA6A 1KV2A 3BIZA 4CMUA 5AUUA 3P4KA 4OTWA 5LCJA 4FV5A 2VAGA 2BROA 4NWMA 4O96A 4PPBA 4M66A 4WSQA 5AEPA 3FMDA 4FGBA 3VRZA 4O83A 5AUZA 4JAJA 2C3IB 5ITAA 5LARA 3BYOA 2XCHA 3DDQA 2W06A 3EQHA 3MPAA 3UBDA 2Y6MA 4C4JA 2NNWB 3WZJA 2WMAA 2HY0A 2XEZA 4U3ZA 2W1IA 1XBBA 1UKHA 4U0IA 3FMHA 5HLPA 4FKIA 3RZBA 2YAAA 2CKQA 2PU8A 3TM0A 5JGDA 1WZYA 3C4WA 4I3ZA 5ACKA 4L3JA 3PLAE 2ZDTA 2JLDA 4ZSJA 4P4CA 3IGOA 4LRKA 4CZYB 3NS9A 1ZMVA 1V1KA 3PJCA 3IOPA 4LFIA 5DR2A 3QTIA 1NVQA 3GB2A 4HVHA 4M14A 5EYKA 5C4KA 4CG9A 4PMTA 2UW6A 4KIQA 3PXFA 5HO7A 3FPQA 4L9IA 4AWIA 4O7VA 3FMLA 3EN5A 4FYOA 3Q4TA 2CSNA 2Z60A 3MB6A 2UUEA 3JVSA 2FSMX 3FI4A 3LCDA 3MI9A 4Z9LA 1Q5KA 5JSMA 3I60A 3K3IA 5FDPA 4CFXA 4HGTA 3QTWA 1W7HA 5EQYA 3I0QA 1PHKA 4OGRA 3RK7A 4DTBA 2CLXA 3QC4A 2PTKA 2X9EA 5HO6A 2UZWE 3MVJA 3GOPA 3FZ1A 5HBJA 5L2TA 2GNGA 2GTMA 3KXNA 2XK3A 4BKZA 3OBGA 3QCQA 5EK7A 5KKRC 3VUKA 1H1RA 3FXWA 5A46A 3QXPA 3H9FA 2CN5A 4LMNA 4EK6A 5AWMA 3CS9A 3GFWA 2NRYA 3CJGA 2AYPA 3NW7A 4FEQA 4KS8A 3OFMA 4NT4A 4R3RA 3R6XA 5DNRA 2YEXA 1CSNA 4E8AA 4G5PA 3NZ0A 3LCOA 4B99A 3D7TA 4IAAA 1QPEA 1W84A 3FSFA 3LPBA 3QF9A 3E62A 4QQCA 2OK1A 2W1ZA 4UB7A 3W16A 5AFVA 1J1BA 3DPKA 4FL1A 4DTKA 4ZY6A 3QZGA 4XS2A 1GZ8A 3VHEA 4D4YA 3TZMA 5BNJA 1YDTE 4JQ8A 4I93A 4TRLA 4D0WA 4P5ZA 1ND4A 1BLXA 4D28A 5HIEA 3ORTA 4JLCA 3UMXA 4BI1A 4C3FA 4CFNA 4O7ZA 4PRJA 5A4CA 4TYJA 1P14A 3H9OA 4GJ3A 3FY0A 2W1EA 4F0IA 5FTOA 1G3NA 2VTSA 3OCGA 3D2IA 1OI9A 5JFXA 2W5BA 5AR3A 5C1QB 4KBKA 4I23A 4NIFA 2X4ZA 4AZFA 1H26A 3T9IA 5ANIA 5HO8A 1OKVA 3R7EA 2WIPA 1FVRA 1OL7A 2FGIA 4GMYA 4IACA 4J97A 4YJVA 1O6LA 5E8WA 5A4TA 2PVRA 3FKLA 1UU7A 2HW7A 1RQQA 3QYWA 2RGPA 4FUXA 4LGDA 4MD8E 3FUPA 3TV7A 4J7BA 3UJGA 4BIEA 4CKIA 2JFLA 4DGLC 1QPJA 3BI6A 4OTGA 4RVTA 2VU3A 2ZDUA 4L67A 4NU1A 4RGJA 3U87A 3R9RA 3MPMA 3PFQA 2YCSA 4X7QA 3II5A 3ZM4A 3FQEA 5L8LA 2OU7A 2QLUA 3MH2A 4K9YA 5I5ZA 2R3PA 3OTUA 4F7JA 4ANNA 5A9UA 4FIJA 5HGIA 3GQLA 2VO7A 1PXOA 1XH6A 4HCUA 4RVMA 3NCZA 5CASA 5BYLA 5AAGA 2RG6A 5CENA 3FXXA 1YHVA 1ZMWA 5DYJA 4LL0A 5CAUA 3QTUA 5IUGA 3AXWA 2KTYA 4KRCA 4XLVA 4ANBA 2X81A 4E6AA 1Q3WA 2DS1A 3TNQB 4UALA 5K5XA 3P08A 3COKA 5EQEA 5DE2A 2GPHA 5AV1A 1ZARA 3OVVA 4ANOA 4IVAA 4O81A 4IBMA 1Q97A 1JVPP 1PMUA 2FUMA 2JGZA 4AN2A 1K2PA 2CCHA 2IW6A 3PG3A 1X8BA 2GNIA 2J5EA 2ZB1A 3FY2A 4RWJA 5AV0A 2ITPA 3ULZA 5LWMA 5IQFA 1ZWSA 4E6CA 2OJ9A 3PP0A 4NM7A 3ZFYA 5HBEA 4TYEA 4APCA 4ENYA 4LOOA 3TDWA 2QR8A 5CEPA 3ZU7A 5HU9A 4TXCA 3TCPA 2FO0A 4I20A 4EJ7A 5L4QA 3QQKA 2IZSA 2VTQA 2IW9A 4U42A 5IQCA 3QTQA 4UV0A 4C4IA 3EQFA 4FF8A 4TY1A 3TI1A 3C4XA 3BQRA 3L8PA 2W1GA 1KV1A 3OY3A 3SA0A 3U6IA 2WMBA 5ANEA 3PVUA 1GZNA 3MBLA 3OD6X 4EOSA 4FSMA 5L8JA 2A27A 3CSVA 2CKPA 3LCSA 3DV3A 4AZVA 2PY3A 3HRCA 1QPDA 2VNYA 3PPKA 4V0GB 4BB4A 4TWCA 2HENA 4K33A 3O8PA 3OWJA 3BGPA 3KVWA 4YLJA 3KU2A 4GVJA 4HPTE 2QLQA 2XP2A 4GK2A 4KUJA 3P7AA 4F9CA 3UIMA 4RBLA 4RJ7A 3DBFA 3E87A 3LFBA 4GCJA 1FOTA 2YAKA 4M69B 2JAMA 4WO5A 3OEFX 4YTIA 4CT2A 3E64A 4EQCA 3HGKA 5DVRA 3ROCA 2WMWA 1GOLA 3VN9A 4O84A 5HTIA 3ZH8A 4EORA 4ALVA 2QKRA 3AT2A 3Q96A 3W8QA 4BN1A 4O21A 5IH5A 5M44A 4W9XA 1TKIA 4RFZA 4I0RA 4QYEA 3KN6A 3PSDA 4EHVA 1ZOHA 3OW3A 2WQNA 3HUCA 3HDNA 4GK3A 2F49A 2YFXA 4DFUA 1NXKA 3TNHA 1Y8GA 1KUTA 4NFMA 5EG3A 4W4XA 5CANA 2G01A 5CAOA 4IIRA 2H6DA 1T45A 5BVWA 5B7VA 1H8FA 3PJ8A 4F9BA 4BKJA 3GCQA 3VHKA 4CV8A 3HX4A 4DCAA 2J51A 2B54A 4JQ7A 4YJUA 5J9YA 3BEGA 4WG5A 4EC8A 4RC2A 4IANA 5IPJA 2WMSA 2OJGA 1MRUA 5H8EA 3MSSA 3P78A 1YXSA 5D11A 4EK3A 4G3CA 4EL9A 4W4YA 2UVYA 2WHBA 4PWNA 3DDPA 1H1SA 4FV6A 5DN3A 4FTAA 4IWDA 5EHLA 2WMVA 4HGEA 2CGVA 2QO2A 4F08A 1PXMA 5KE0A 3GC9A 4WUNA 4BC6A 1TQPA 3A7IA 4YJTA 2XUUA 4FKQA 2AUHA 4PNKA 5M09A 4IZ7A 3U9NA 4YZCA 3SRVB 1GIIA 3B2TA 2YJRA 3RJCA 1Q62A 4JJRA 4EHEA 3BLQA 4FKPA 2VTIA 4V01A 3HUBA 3V5JA 2Z02A 4RSSA 3WF6A 3TKUA 1F3MC 4ZTLA 4CGAA 4K11A 5KMNA 3FLQA 3WI6A 3IW4A 4XV1A 5A4EA 5GIPE 4X3FB 4KKEA 1ZZLA 5JZJA 4M68A 2YWVA 1BKXA 3QHWA 4KBCA 4N4SA 5HNIX 1FGKA 3D0EA 1OIYA 2YM4A 3F7ZA 3FSKA 3GUBA 4LRJA 3R7IA 5DIAA 3RCJA 3RNYA 3FWQA 3ZLXA 4OW8A 2XNEA 3GP0A 3QGWA 1RJBA 3IDBA 3HRFA 4IM2A 3RWQA 3UVQA 4RG0A 4DG3E 2NRUA 4AZTA 5AAEA 3QCYA 4I0TA 5C9CA 3RWPA 3V51A 3WF9A 2BHHA 4IJPA 4MK0A 1PYEA 2W9FB 4QPSA 1PRYA 4RC3A 3HV6A 3UIBA 2OZOA 3JPVA 2XB7A 3ORXA 4X3JA 4AE9A 4DEAA 3GU6A 5CF5A 3QD2B 4B9DA 2XIXA 3K5UA 4HNIA 3VS3A 2R2PA 3HMOA 3QZFA 4H39A 1ZOGA 2IZTA 4JBQA 5IA2A 3A7HA 4AOJA 2VX1A 1YKRA 2V0DA 3KVXA 4V0GA 2HELA 2YM6A 1KOAA 4WNOA 5FD2A 5AV3A 4EONA 4IE9A 3FLWA 1W8CA 3OY1A 3R8LA 4B6LA 3NWWA 5LVNA 4IX6A 2EUFB 1BYGA 4ACGA 4CFFA 5IG1A 2P55A 5GZ8A 2RIOA 3CLYA 2JKKA 4C59A 4O82A 3EFWA 3NYXA 4KABA 3LM0A 3OMVA 1Q8WA 3MW1A 3MY0A 1DI8A 4FIHA 4QP9A 1ZAOA 3DS6A 4DEBA 2I0HA 3P9JA 1REJA 1GJOA 3ZTXA 3U8WA 4X2KA 3UPZA 3CD3A 3K54A 4LRMA 4A9YA 4EK8A 4YSJA 4MBIA 4CFVA 4C3PA 1HOWA 3FBVA 3R30A 4EH8A 3SQQA 1Y6BA 2H96A 4LV8A 5CEKA 5K4JA 2PUNA 2IZUA 5HX6A 2QURA 3TUBA 4DBXA 3NYVA 5AP4A 3A7FA 2A0CX 3DB6A 3VS4A 4FKOA 1UVRA 4L53A 1NW1A 3MTFA 4D4VA 4FV1A 3GU4A 4HGLA 3FHRA 5LMBA 4XV3A 4UMRA 5IH6A 2NPQA 1Y57A 2CMWA 4HYIA 5M56A 2OBJA 3GCPA 5KMLA 3Q9XA 3ZFXA 2X8DA 4DN5A 2GNHA 2O8YA 5C8KA 3L8SA 4DG0E 2UZEA 4M0ZA 3Q52A 3QC9A 3R63A 3LFCA 2XKDA 3DJ6A 1XH4A 4E5AX 3DT1A 4FTLA 5CZIA 5CSXA 3MWUA 1YRPA 3PVWA 3AD5A 2BMCA 4CRSA 4Z3VA 3G33A 2X7GA 3Q9YA 4QP3A 5T3QA 2GHMA 5IQDA 3W18A 3G6HA 3DZOA 3PJ1A 4CKRA 3CXWA 2R3OA 3EN6A 2ITXA 2QOQA 2XS0A 4HCVA 4PL4A 4ZLOA 2HAKA 1OPLA 1I09A 4FTNA 5AUXA 3CPBA 4YJOA 4AGCA 4ZLYA 5DT0A 4BZNA 3K5VA 3PJ2A 3VS7A 2IWIA 4GUEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DAE A;  5CAQ A;  1LEW A;  4F7S A;  5IEX A;  3H0Y A;  4ID7 A;  4QEB A;  3LHJ A;  5CSV A;  4E4M A;  3ZSG A;  3FDN A;  2QO7 A;  2YIW A;  1M52 A;  2P2H A;  4I0S A;  1Y6A A;  4BVU A;  2WTI A;  4BCM A;  3KMW A;  2J90 A;  4PNI A;  4BCF A;  1YOM A;  1XO2 B;  3HEG A;  1HCL A;  3W2O A;  4FT7 A;  1M17 A;  2YHV A;  1OIU A;  3W0Q A;  2BDF A;  1TQM A;  4FV7 A;  5JK3 A;  2IPX A;  2W0J A;  5CU3 A;  3KL8 A;  4FGR A;  2OIQ A;  3DND A;  2CNU A;  4CQE A;  2C47 A;  1AGW A;  1Q8T A;  2QOI A;  2XIR A;  3KRJ A;  4RVL A;  3GOK A;  4TYH A;  2IVT A;  5CEI A;  3UC3 A;  5CF8 A;  4RA5 A;  3EN4 A;  4HZS A;  3TZ9 A;  3SDJ A;  1WVX A;  4AFE A;  4IHP A;  2PUU A;  2B4S B;  2FB8 A;  3O23 A;  5ICP A;  2A1A B;  4DGO A;  3QX2 A;  2ZJW A;  4CKJ A;  4DHI B;  2RL5 A;  4II5 A;  3WE4 A;  3BX5 A;  5IUI A;  1WBO A;  3BRB A;  5M08 A;  1Q61 A;  3MIY A;  4B4L A;  2V55 A;  2VTL A;  3D5V A;  3GEN A;  2YDJ A;  4UMT A;  3QWK A;  1A48 A;  2QQ7 A;  4ZJI A;  2O0U A;  3QAM E;  3R21 A;  4M84 A;  4YC6 A;  3QGY A;  3R7V A;  4FIG A;  3HV3 A;  4E6D A; 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