2YNXA

Crystal structure of ancestral thioredoxin relative to last archaea common ancestor (laca) from the precambrian period
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
SVVQLNDENFDEVIKKNNKVVVVDFWAEWCGPCRMIAPIIEELAKEYAGKVVFGKLNVDENPEIAAKYGIMSIPTLLFFKNGKVVDQLVGAMPKEALKERIKKYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Conservation of Protein Structure Over Four Billion Years
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACA THIOREDOXIN
source organism Synthetic construct
molecule tags Oxidoreductase
total genus 29
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2012-10-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ynxA00
5ELGA 1XWKA 3AY8A 2IN3A 2N5FA 3ZMKA 2JU5A 4NMUA 3O76A 1H4OA 4PNFA 3MSZA 5HFIA 2HRNA 4MABA 5ECKB 3TJFA 4ISDA 1X5EA 1GUKA 2I9HA 1WMJA 2H0IA 4F0BA 4KGIA 3D5JA 3M9JA 1U87A 2QC7A 1V2AA 2VCVA 4OO5A 3IK7A 5CREA 1ZZYA 2O85A 1K0OA 5JWOB 3HJMA 3LQ7A 1XCCA 1Z6MA 3GKMA 4POMA 1V58A 4MZWA 3S9FA 3MNGA 4K0NA 3DEXA 4ML1A 3NOFA 4DSSB 1BG5A 4MH2A 4IGJA 3LEFA 5FHIA 4GWRA 1FW1A 3KGKA 5HR3A 1NM3A 2DJ3A 2EIOA 3FZAA 1LU4A 1S3AA 4OD7A 4POLA 3ZIVA 1E2YA 2L6CA 3ZLPA 3BBYA 2B1KA 3LXZA 3P7XA 4WETA 4J2FA 4NHZA 1OC9B 3J7Yk 3DKSA 5HFKA 1QMVA 3GH9A 8GSSA 14GSA 2RUEA 1Y6EA 2C3NA 4G19A 2GTUA 3KM6A 1GSEA 3F6FA 2YWNA 2YZUA 5CO3A 4F9ZA 4K7IA 3TJKA 4ML6A 4IW9A 2AHEA 3RHCA 1T3BA 1U3IA 2H72A 1TRSA 2V32A 2H6YA 3U6VA 2RLIA 4XRAA 3UAPA 2R5GA 1XFLA 3UJ1A 2L57A 6GSUA 3VWVA 2PVOC 3Q19A 2VOCA 1GULA 1TK0B 2EIQA 5KN2A 4IJ3A 1G6YA 1Q4JA 3GTUB 3EC3A 5DALB 1TXXA 1A2JA 4ZB6A 4FYUA 1EEMA 1NW2A 4MA9A 2E2GA 3IAM2 4JR4A 2XBIA 3W6GA 3NIVA 4TVEA 2VD0A 1VF2A 4JU5A 1UC7A 1WRYA 1ACVA 3FW2A 3RHBA 1FOVA 1T4ZA 2ON7A 4N10A 1GWCA 4IN0A 4OFTA 1LJRA 18GSA 5ECSA 1F6MC 1YF1A 3LJRA 5A4WA 5CYYA 1VGLA 3QFAC 2GQMA 4WF5A 1O7UA 3PGTA 4KAEA 2Z9SA 1PRXA 2C3QA 1JLVA 4L5OA 4AJ8A 4HQZA 1TI3A 1SK0A 1C72A 2FY6A 4AJ7A 5D9WA 2JL4A 2B7KA 1Z6NA 2E0QA 1T4YA 2HI7A 1CQHA 2DBCA 1GNEA 4N0VA 4QL9A 4Q5NA 3HJPA 1USBA 4JRRA 3US3A 2LS5A 5IMZA 1R7HA 3GIXA 4PNGA 1Z7PA 1TU7A 6GSVA 4KUNA 4XS4B 2PN8A 1SK1A 3OR5A 4MJBA 5G2ZA 5ID2B 10GSA 1A8YA 3TKPA 2LEGA 4X0XA 5B7CA 3C7MA 2HYXA 4K8MA 3FR9A 3L0HA 1ILOA 1O8XA 3Q74A 2V6OA 1EV4A 5G1KA 3RBTA 2CX3A 2HNLA 5DAKB 5GAND 1GRXA 3BD2A 3GA4A 3IXRA 2YANA 2VM2A 2H19A 3KEBA 2GT5A 2PWJA 5IIZA 2NTOA 1G7OA 1GTBA 1UN2A 3DVWA 3F63A 4PURA 3GRXA 4OO4A 1QK8A 2ALBA 4OCEA 3HD5A 4IHUA 3K8NA 1S3DA 1G0TA 3UBKA 2AJQB 4I97A 2L6DA 3HKRA 1SD9A 5AN1A 1XVQA 20GSA 3VK9A 1QQ2A 3QFBC 3VFIA 2JZSA 4BWSA 2HFDA 3DRNA 1SJIA 1MDKA 2DJ0A 2VIMA 2FLSA 3I6AA 5D9VA 4ZL7A 1W4VA 4L5LA 1K0CA 2NBSA 4ECCA 1SYXA 3D0ZA 4AGSA 4I2TA 4GLTA 1M2DA 2LRNA 1X0RA 1NHOA 1HNAA 4BVYA 4G10A 2GSRA 2IFQA 3BCIA 7GSSA 1JZRA 5ECRB 2AYTA 4TR1A 3HA9A 2C0FA 3TRPA 4POBA 1MD4A 1F37A 2RIIA 3ZVJA 1ERVA 4V1Ap 2VD1A 4GF0A 2FWFA 5DQSA 3FK8A 2DSAA 4HI7A 3I9V2 4BPYA 2WULA 2R4VA 4J56E 3LYKA 2FWGA 6GSYA 3VLNA 1XWBA 2QKEA 4KB3A 4Q5QA 4YAPA 1PN9A 5ECLB 2YV9A 4XHMA 2CAIA 1IYIA 4MJEA 5ECMB 3A2XA 1EV9A 2DLXA 3VPTA 2C4JA 4MPFA 1UA5A 2H01A 5EL8A 2NVLA 2FUG2 4OCFA 2I4AA 2LNSA 3TB2A 3IBHA 1XVWA 2CAQA 3UVTA 3DIEA 2K6VA 5H5SA 2FGXA 4ZBBA 4KA0A 4V1Ag 1O81A 2HZEA 5GZZB 4F0CA 2OE0A 3IAS2 3IC4A 1U88A 2CVBA 4E8EA 4DEJA 2YWIA 2H1GA 1QXHA 2PVQA 4Q5RA 2FHEA 2NPBA 1JFUA 3DWVA 3EE2A 3FYGA 1DBYA 2AAWA 3IDVA 3EU3A 5B6MA 5HR0A 4MJAA 1FVJA 1K0BA 1RK4A 2A4VA 3F3RA 5H5RA 4FO5A 1GTUA 1HQOA 3MDKA 2GQLA 1BJXA 4BWQA 2V2GA 1GSYA 5CRDA 2QGVA 1TTZA 1OC8A 5A5KA 2D2ZA 2YWOA 2TRXA 2H75A 4QL7A 4F2IA 2CVDA 1A0RP 5ECQB 4HOJA 5ECOB 4WR4A 2LQQA 4BA7A 2MYGA 2WB9A 4LA1A 2XHFA 4EDYA 5B8BA 5J4UA 3F4RA 3ZIJA 5JWQB 4NWYA 2HLSA 1K0MA 4TXOB 4YQVA 2LNTA 4LMWA 4MH3A 2OACA 1TW9A 5CNWA 1ON4A 2X99A 2VCWA 5KEJA 4KCEA 1K3OA 2G0FA 5DCGA 1PKZA 4HDEA 4JEDA 2KHPA 2H0GA 5ELAA 3GKKA 2DJKA 4F82A 3TKRA 1B4QA 5ABRA 2GGTA 4ACSA 4ID0A 3P2AA 3F4SA 4KDYA 2FA8A 4ZL9A 3DYRA 1R26A 1DSBA 4FYCA 3HVXA 4L0WA 1G7EA 2NDOA 1F3BA 3GKNA 1F2EA 3D22A 2LJRA 2L4CA 5IOWA 3KMOA 1J08A 2PPTA 6GSSA 1I9DA 1FG4A 1B48A 1XW6A 2QSIA 5HR1A 4GSTA 4CHSA 3BJ5A 5CRGA 3M0FA 4GTUA 4X43A 4ZIJA 4PXOA 2JSZA 2L5LA 2M80A 3FY7A 1XWGA 3GURA 3KJYA 4MJCA 2VLUA 3E0UA 3GL3A 1KNGA 3CSIA 4JR6A 4WBJA 1XW5A 3L9VA 2RUFA 5HQPA 2R37A 1VF3A 1ZOFA 3TGZA 3W8JA 3H93A 4K2DA 3LGCA 5H5QA 3RAZA 2H8LA 2IMIA 4DVCA 2AUVA 3C71A 2KUCA 3FR6A 1TRVA 2VM1A 3FR3A 1EGRA 5G5FA 1KTEA 1R5AA 4ZB8A 1A24A 1FO5A 3DGQA 1PX6A 3CXGA 4HZ4A 4DSQA 2CT6A 2XPEA 2IMDA 1YQ1A 4K9ZA 4V2NA 3N5OA 16GSA 13GSA 1AAZA 3HVVA 3KZQA 4CDOA 2N5BA 4AJ6A 5F8BA 1A8LA 1SKSB 1Y25A 2WZ9A 3RPNA 1OYJA 3TCOA 2K18A 2N5AA 4N0ZA 3O3TA 1K3YA 1ERWA 1M9BA 2F8AA 1JHBA 2IMEA 2O87A 1ERTA 2VL2C 5JCWA 1ABAA 5ECNB 2K8SA 2LJAA 3Q18A 3L9UA 1S3CA 3EWLA 4GQFA 3GUSA 1GSQA 5IMFA 3RPPA 5L71A 3TUEA 1EZKA 1KBNA 2H74A 3ZRDA 4HU9A 3QMXA 1Z9HA 2HZFA 3APSA 5D93A 4EF0A 5AIXA 1NHYA 2PBJA 1GSSA 3EINA 2OADA 3ERGA 1WPIA 1XWAA 2HT9A 2A2SA 4LL4B 1HNCA 3CMIA 1GL8A 1T1VA 4TKYA 3TKSE 4RI6A 1AQVA 4RQXA 2K8VA 1QGVA 6GSXA 3GV1A 1PGTA 1ZYQB 2GZPA 2C8UA 1PD21 4MK3A 3F8UA 3WT2A 2OJLA 4O32A 1W89A 2OBKA 2JADA 2BJXA 2X8HA 2J23A 3P8WA 4PUAA 1ML6A 2IPAA 3IA1A 1ZGNA 3QAGA 2REMA 4GSSA 4HS1A 2YCDA 3D21A 2XPDA 5D73A 5IMDA 3ISOA 1SD8A 4N11A 3ZITA 1DE1A 1YEPA 2GLRA 4KH7A 2LRTA 1SK2A 4IS0A 1M2AA 5IMAA 3A2VA 2VL3A 4DSRA 3M8NA 5IMCA 3GHAA 4EE0A 1O73A 5AGYA 1H75A 2YPMA 5GSTA 6GSWA 2YNXA 1B9XC 1O85A 3FZ9A 3WGXA 1A2MA 4D73B 1U3AA 4E8HA 2KLXA 5D9XA 5E59A 1M9AA 3EMXA 2P5QA 3HXSA 2AB6A 4NPBA 1OKDA 1SKWB 3CSJA 3M1GA 3C1SA 4OWYA 3KMNA 4ZBAA 2R2JA 2V41A 2OKAA 5J5NA 3KTBA 1GSDA 5G31A 3TKQA 4WF4A 4EL1A 2YV7A 2CQ9A 3I69A 4ZBDA 2P0GA 1J0FA 3W8SA 2L5OA 4MZBA 2MZCA 1O6JA 2RM6A 5D8IA 4WXTA 3IPZA 3GX0A 4MP4A 2I81A 1ST9A 1XBSA 2WJUA 2MBSA 1J9BA 3ZVJD 4DSSA 1F3AA 3SBCA 4QQ7A 2RM5A 3WGEA 5F0GA 2YWMA 3F9UA 3GMFA 3NZNA 3JCML 1X9WB 1SKRB 3FZ5A 5B6NA 5IMVA 1K3LA 3PH9A 2F3MA 2PUKC 2GZZA 2DIYA 4V2MA 1GSFA 4I6XA 3H4KA 2VLVA 1OE8A 2GS3A 2FWEA 2TIRA 1OC9A 2I3YA 2H76A 1SL1B 5KN3A 2V1MA 3KD0A 5IPHA 1ZYEA 2C0EA 3HVSA 5KN0A 1THOA 3I43A 1OAZA 3BOAA 4MPGA 4EC0A 4MF7A 3V1WA 3CTGA 3Q6OA 5IM9A 2X8CA 5LNKe 1TU8A 1Z3EA 4PQHA 2LUSA 2A2RA 3KH7A 3QR6A 3IK9A 4PGTA 4KX4A 1ZMAA 1WJKA 4OFNA 2PU9C 3P90A 2EIRA 2GVPA 1YEXA 2O89A 2B1LA 1AIUA 2C3TA 4TR4A 4I2UA 2WDUA 4XCSA 1XOAA 1HD2A 2KP2A 3UL3A 3GTUA 4POKA 1FAAA 5DALA 3TDGA 2H0HA 3C8EA 3ZZXA 3H8QA 1M99A 5DJLA 1QFNA 2OA7A 2F8FA 4FH8A 3M9KA 3KXOA 4TR3A 4K7OA 1YZXA 4MMMA 4TR0A 2C0GA 1B9YC 5D96A 2LV3A 5CRHA 2VCTA 5ENUA 1MD3A 4AF2A 5G30A 4TOPA 4PQ1A 1GP1A 4XRDA 1EGOA 1YDKA 3MWHA 2OE1A 1EP8A 1OE7A 3CRUA 1VRSD 5G5EA 4MF5A 3KH9A 4L8EA 4KSOA 22GSA 4K6XA 5CAXA 3KTLA 1SYRA 2E2MA 3HCZA 3PR8A 2LKUA 3FHKA 4X1UA 1Z7RA 2H1AA 4PUFC 5JCUA 2X64A 2YP6A 1PX7A 3IRAA 2JZTA 2EC4A 4TN8A 1EEJA 2MBTA 4YQMA 4ZB9A 3HJOA 1X5DA 4RI7A 2M46A 1RQMA 1T00A 3TJJA 1XWCA 2YZHA 5DBQA 1K0DA 2H1BA 1V40A 3IOSA 1N2AA 3VI5A 5IQYA 5LD0A 3KIJA 3HZ8A 4XS4A 4CW9A 5ID2A 4EVMA 4EDZA 2GZYA 1FB0A 1QUWA 3ME7A 3DXBA 2I1UA 3GSTA 3GNJA 2M72A 2JZRA 1AQXA 3FKFA 1DUGA 3ZFBA 3GFKA 5DAKA 5G1LA 2WCIA 12GSA 3FZ4A 4KCAA 3F3QA 3GL5A 2FA4A 2HSYA 1PL2A 2CZ3A 3G7IA 3IHQA 4GSNA 1THXA 1M0UA 2B6MA 3G9BA 4XTSA 2WGRA 2R3XA 2HE3A 2MMNA 2XBQA 5A4UA 4O92A 3WT1A 5ECHB 5B8AA 3CRTA 4HUAA 5IO2A 4O7HA 2OE3A 1FB6A 2H66A 1OC3A 2HSHA 4XS1A 1PL1A 1YF0A 4IVFA 1JLWA 2V6KA 1TDIA 2LJKA 3GN3A 4RUVA 2LTKA 2CV4A 1MDJA 4LLRA 5E4WA 2DJ2A 4KE3A 2B5YA 1PQNA 1B8XA 4ECBA 3H79A 1GSUA 4G2EA 1R4WA 5GSSA 2VCQA 5IPGA 4XIHA 2IMFA 1T8EB 3UIWA 3ZTLA 2AV4A 3RDWA 4GQCA 4L0UA 2H1DA 2MMOA 3D4MA 3TKSC 4O5RA 5ECIB 2H30A 3ZFLA 1GLQA 1YJ6A 4FIWA 4YAVA 1F9MA 3O6TA 5FT3A 4JE1A 4P3YB 4GCIA 3VI7A 1G6WA 3GSSA 4FYBA 4WBRD 5F07A 3ZYWA 2C0DA 1SJZA 5JWRB 3EU4A 2ZNMA 1EP7A 3U5RE 3L78A 4J57E 3HY2A 3LSZA 3E9JB 4ULXA 1AC1A 2IFQB 4NV5A 1URMA 2OBIA 4TR1B 1GLPA 1SU9A 3GYKA 3ERWA 3VURA 5J9BA 1BAYA 5EVOA 1N8JA 3IV4A 5C04A 1BYEA 2WS2A 5CRWA 2DC5A 3C73A 5DCHA 3QD9A 3UBLA 17GSA 3L9SA 3CSHA 4ILFA 3VWWA 5J9CA 2PGTA 2H71A 2VLTA 2MMAA 4TW5A 5IO0A 3QDNA 2FCHA 5GAPD 4H86A 2VCZA 1WE0A 4TXVA 5EPFA 3J7Yb 4OFMA 1EOHA 1MTCA 4IP1A 2TRCP 3C1RA 2L4QA 1VF1A 1ERUA 1SL2B 3KCMA 3MAKA 1WIKA 2R6KA 3ZMLA 2WFCA 4WR5A 11GSA 3N9JA 1XIYA 2H6ZA 2O7KA 3VWUA 2HZEB 1GUHA 1MEKA 2VCXA 5AIVA 3D6IA 4TXOA 2P31A 1A2LA 1TK5B 1TJDA 4MF6A 4KW6A 1AQWA 5J3RA 2MMZA 2VUPA 3F4TA 3APQA 4G9HA 1GNWA 4PX1A 2BMXA 5KN1A 1Z5YE 5C00A 1ZCPA 1YKCA 4NXIA 1X9SB 1YY7A 3WD6A 4BVXA 3QAWA 1XOBA 1E6BA 1NSWA 5FWGA 9GSSA 2FD3A 4IQAA 5COHA 5HR2A 2VO4A 2H6XA 2IL3A 4JZQA 1FVKA 1I5GA 1PMTA 1TRWA 3TKSA 2DJ1A 4EKZA 5DDLA 4MZCA 1VF4A 4NAXA 1A0FA 3BCKA 3ED3A 3ZL5A 1BEDA 3F6DA 4HQSA 3GX8A 4TRXA 1HYUA 3ME8A 4I5QA 1CQGA 3EYTA 4IKHA 1UVZA 1OKTA 5F05A 2F51A 2GDRA 19GSA 3LWAA 2YJ7A 2BTOT 4IJIA 2CVKA 2GQKA 4Z7XA 1GTIA 5CP1A 5HFGA 2J9HA 2HXKA 2X8GA 5AISA 3UOMA 3A2WA 3IR4A 4F03A 1O8WA 3SWLA 1JZOA 1DE2A 2O8VB 1KEBA 2IJYA 3LYPA 1SENA 4HZ2A 1K0AA 1TK8B 1XW9A 4YH2A 6GSTA 2DJJA 3CTFA 4EO3A 1B4PA 2H73A 2VL2A 3DMLA 3QOUA 1M7TA 2F9SA 3QAVA 1XPVA 4WKWA 4KNDA 4HJ2A 1LBKA 1TOFA 3TOUA 2G2QA 4IP6A 4OMVA 1BQ7A 1M2BA 4PQIA 2HRFA 3DVXA 2ZCTA 5LCZA 2VL9A 1X9MB 1AW9A 2B5XA 3G7YA 4YQUA 1WP0A 2CX4A 3TOTA 3QCPA 4JBBA 1X5CA 1A23A 3HDCA 4BL7A 3G7JA 3GH6A 1PKWA 3R2QA 3FRCA 2WRTA 2C1YA 5ECPB 1EOGA 4NHWA 4LL1B 3PINA 2CZ2A 3WGDA 2DIZA 2K9FA 3TJGA 4MLYA 2YOIA 2LSTA 3GKXA 1PA3A 3KP8A 1SJ6A 3CBUA 4IBPA 4GRFA 3HHVA 5DQYA 5DVBA 2H70A 5IOXA 1V98A 4NV2A 1V9WA 3IE3A 3A3TA 3TRXA 4ECIA 5J41A 2B5EA 3VWXA 4EXJA 5A4VA 4GXZA 3LG6A 1U6TA 3EMPA 3E3EA 2FNOA 2CA8A 4HJMA 1TRUA 4K1FA 3LXTA 4WEYA 2KP1A 2JACA 3TJBA 2LRCA 4MCUA 4N30A 3UARA 1XZOA 2IWTA 3UVHA 4XS6A 2GSTA 3UEMA 1ZL9A 3FEUA 2C80A 3LFLA 4ECJA 5JCGA 1JZWA 2YJHA 1RW1A 3UMAA 2IIYA 3CYNA 1Q98A 3H1NA 4Q5FA 2KOKA 3HZ4A 1HNBA 3TRQA 1GTAA 3L4NA 4MDCA 2YN1A 1MDIA 2IMKA 4ZILA 2VAFA 1IYHA 3ERFA 1AXDA 4IQ1A 3EURA 1JZDA 1TKDB 2XC2A 1T7PB 1FHEA 2B3SA 4LMVA 3QPMA 2GT6A 2B7JA 4KDXA 5EY6A 1OVNA 3APOA 2DMLA 4HU7A 2JSYA 4ZXGA 3HYPA 3EVIA 4KSMA 3F0IA 3WYWA 4V2LA 2FWHA 1WOUA 2GSSA 1SL0B 2GSQA 1AUCA 4HEA2 3D4TA 1K0NA 2ZUPA 1PSQA 1GH2A 3KP9A 3ZREA 3VPQA 4IELA 4D73A 3LORA 1EWXA 2L59A 5DJMA 4K7NA 5INYA 1R5PA 2LQOA 1TI1A 2ON5A 5F06A 3A5WA 4I8BA 2DMMA 1V57A 4ZL8A 1XXUA 4KDUA 1BX9A 2PERA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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