2YOIA

Crystal structure of ancestral thioredoxin relative to last eukaryotes common ancestor (leca) from the precambrian period
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
MVIQVTNKEEFEAILSEADKLVVVDFFATWCGPCKMIAPFFEELSEEYPDKVVFIKVDVDEVPDVAAKYGITSMPTFKFFKNGKKVDELVGANQEKLKQMILKHAP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Conservation of protein structure over four billion years.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LECA THIOREDOXIN
source organism Synthetic construct
molecule tags Oxidoreductase
total genus 35
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2012-10-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2yoiA00
2AHEA 2LKUA 3FW2A 2CX3A 4ECCA 4ECBA 2C80A 4F03A 2EIOA 4TVEA 3ME7A 1LBKA 2A2RA 3ZFLA 3D5JA 3GKMA 2CA8A 4MCUA 5JCGA 4ISDA 4KE3A 3H8QA 4NPBA 1T4YA 2LV3A 5DQYA 2VO4A 4P3YB 2H76A 5JWQB 3O76A 4EF0A 3UMAA 1GWCA 2CAIA 3F63A 4YQMA 3QMXA 3ZMLA 5ID2B 1T7PB 3F3QA 1HYUA 4POKA 1S3CA 1AXDA 1Y25A 1G0TA 2CV4A 6GSWA 1EP7A 5D9WA 3GUSA 3ERWA 1VF3A 3CXGA 3DKSA 2H0GA 4ECJA 4GSSA 1PRXA 3VK9A 1XXUA 4RI6A 3HJMA 2PMTA 2ZNMA 1QQ2A 4ZILA 2FWHA 4TW5A 1G7OA 2AJQB 2O8VB 2XPEA 4ID0A 2C0GA 5D9VA 3US3A 5DJMA 1LJRA 1GUHA 1BEDA 1F6MC 4XRAA 5EPFA 2I9HA 3DYRA 4XS4B 3UVTA 3WGXA 1B48A 2L6CA 2PBJA 5B6MA 2DLXA 1EV4A 4EDYA 2LS5A 4TR0A 3UOMA 4LL1B 2L4CA 3N9JA 5J3RA 4ML1A 2E2MA 3M9KA 2FHEA 1TTZA 1YEXA 2I3YA 4MPFA 4BPYA 5ECMB 1GSDA 3Q74A 2VAFA 4OO5A 2FA4A 3A2XA 2XBQA 2JU5A 5IMCA 2MMNA 2YNXA 3EC3A 2LTKA 1YJ6A 1GSQA 3VURA 1GTAA 4JE1A 1UVZA 1SK1A 1YKAA 3L9VA 1ZZYA 4POBA 3L78A 3N5OA 16GSA 4KA0A 1GUKA 4PQ1A 2H72A 2VM1A 3CTGA 4HJ2A 1VRSD 2MYGA 1W4VA 1ZMAA 2VCQA 4ZB8A 1T8EB 4MZCA 3HVSA 4FYBA 4KSMA 1GLQA 4XS6A 3JCML 1K3YA 1OC3A 4CHSA 4N0ZA 1U6TA 1ERTA 2L5OA 4TOPA 5GSSA 1WE0A 4G9HA 1A23A 1TRVA 4F2IA 1XW5A 4V2NA 2C0FA 3GTUB 3LG6A 5D9TA 3QD9A 5GZZB 4MABA 1B9YC 2AV4A 3KXOA 4MZBA 2RM6A 3G9BA 3HDCA 1YF1A 2XHFA 4BA7A 1OC9A 1A8LA 1XVWA 4XTSA 1K3OA 1ZOFA 4GRFA 1F3AA 3A5WA 1H75A 5D8IA 4POLA 3EU3A 4BVYA 2XBIA 3IDVA 2VCWA 3HVXA 2GZZA 1T3BA 2B7JA 1MD3A 4G19A 1ERUA 5A5KA 5CP1A 5ELGA 5J9BA 4POMA 4E8EA 1DE2A 4GQFA 2J23A 2ON7A 3TKPA 2ALBA 4PQIA 5ECLB 5DJLA 3IXRA 4JBBA 3TJKA 4F0BA 1TI1A 2R5GA 2GZPA 4D73A 3CBUA 4ZBDA 2K9FA 3D4TA 1AQVA 1ZL9A 3TJBA 2I4AA 3FR9A 3M3MA 1AQXA 2FCHA 5G1LA 2LQQA 1M9BA 5EL8A 5IPGA 3TRXA 5J4UA 4OCEA 2RUFA 5CO3A 1F37A 1ABAA 4MDCA 3GN3A 2M72A 3KMNA 3MWHA 4YAPA 1PL1A 3C8EA 4WBRD 22GSA 3MAKA 4EVMA 4HUAA 2LJRA 3GMFA 2VLUA 5IMZA 4GTUA 5ECKB 2VL9A 4JEDA 4PUFC 4IS0A 1CQGA 5ECNB 1B8XA 3SBCA 4CW9A 3TKSA 4PUAA 4NHWA 1GP1A 4PQHA 5DCHA 3GL5A 3GNJA 4IQ1A 5KN1A 2M80A 2JL4A 5C00A 3GV1A 3ZIVA 3FZAA 3HA9A 3VPQA 1SU9A 3FZ5A 3C71A 4H86A 3M0FA 4PGTA 2GLRA 1PN9A 4TKYA 1THOA 4JR6A 2WFCA 3BCKA 3KTLA 1OC8A 4YH2A 4KCAA 3QAWA 1R4WA 1K0BA 2CAQA 2O85A 5IMFA 4HZ2A 5CRDA 3U6VA 2H1DA 4JZQA 3UIWA 1YKCA 5J9CA 1OC9B 3RHBA 5F0GA 1TK5B 3EE2A 1EOGA 1PX7A 2DJJA 4K0GA 1VF4A 3LGCA 5ECQB 4I6XA 5GAPD 3DVWA 1EEJA 1EOHA 5F07A 3KGKA 4KW6A 4O5RA 5L71A 4JU5A 2XPDA 2H75A 17GSA 2HNLA 4KUNA 2X64A 1KNGA 3VWXA 2VOCA 3TOTA 1A24A 1O8XA 3AY8A 4Q5NA 2NPBA 1O85A 3A2VA 4ZIJA 2OE3A 1X0RA 1VGLA 4TRXA 2X8CA 1BQ7A 4D73B 1OE8A 2YJHA 5G5FA 4O92A 3RAZA 2VCVA 4MH3A 3PGTA 3Q6OA 4IBPA 3EWLA 5FHIA 3IOSA 3DMLA 1MD4A 2JZSA 1Z6MA 18GSA 4HQSA 4KSOA 2CT6A 5ID2A 1HNAA 1V40A 3LSZA 3J7Yb 4MF5A 4FIWA 2VLVA 3F8UA 1GSYA 2YP6A 1TU8A 1A0FA 1XWAA 4N30A 1EGRA 3GX0A 3F4RA 1V2AA 3L0HA 2PVOC 1OYJA 3LXZA 3TRPA 3LJRA 2GDRA 3DD3A 4WF4A 1FB6A 3BBYA 3FZ4A 1WPIA 5DVBA 2A2SA 5IO0A 3WT2A 2HT9A 3QAVA 2NBSA 2G0FA 2EIQA 4G2EA 1JHBA 2VUPA 3LWAA 4WBJA 5JWOB 4I2UA 1OKTA 1ZCPA 5C04A 1XIYA 7GSSA 3ZLPA 3ERGA 2HXKA 4E8HA 2C0DA 13GSA 2GSQA 1A2LA 2DJ3A 4FH8A 5KN2A 1NHOA 4PNFA 3D21A 4LL4B 5ABRA 2QKEA 1J9BA 4ACSA 2WDUA 2HZEB 4GF0A 3GRXA 1HD2A 4HEA2 3QOUA 1GSUA 4L0WA 1SKSB 2WGRA 3E9JB 5AIXA 3IAM2 5F05A 2H73A 3M8NA 4TR3A 5KN3A 3ZL5A 3HJPA 2VCZA 3LORA 4L8EA 5IQYA 3KJYA 2PWJA 1M2DA 4LMVA 2LRNA 5GSTA 2JADA 3NOFA 1RW1A 2IWTA 4IJIA 3GTUA 4KX4A 1QFNA 4WEYA 3IE3A 4IP6A 4IGJA 2ZCTA 2DJ2A 1M9AA 4WF5A 2CVDA 3E0UA 4YAVA 3DEXA 1B4PA 5B8AA 1Q98A 4HJMA 1XVQA 2IL3A 3G7YA 1T1VA 1GNEA 3A3TA 1K0DA 4RI7A 2MBTA 3IHQA 1TDIA 1SJZA 3UJ1A 4N0VA 3ED3A 1HNBA 2BJXA 3U5RE 4PURA 2OE1A 5JCUA 3GURA 1O73A 1EWXA 4AJ6A 2X99A 1DSBA 5DBQA 5AGYA 5FT3A 3UBLA 2R2JA 4MF6A 3ZTLA 2E0QA 4NXIA 2YWMA 1R7HA 2D2ZA 2RLIA 1QXHA 1WP0A 1PKZA 1S3AA 4V2LA 3KP8A 4HDEA 4K6XA 1B4QA 4K7IA 1VF2A 3IK7A 1JFUA 1EP8A 3L4NA 3RPNA 4AJ7A 8GSSA 5ECRB 1AQWA 3ISOA 2HRFA 6GSSA 4OCFA 2C4JA 3I9V2 3D0ZA 2YZHA 3WYWA 1YY7A 4BVXA 1X5CA 3DXBA 1KEBA 2VD1A 4JR4A 2EIRA 3I6AA 4EE0A 4LMWA 4MPGA 1UA5A 2MMOA 1GUMA 1JZDA 3DGQA 1OKDA 2YWOA 3VWVA 4PX1A 1FVJA 2K8VA 1THXA 3LYKA 3LQ7A 2R37A 3MSZA 4KDYA 2IMDA 1SL2B 2F3MA 2WZ9A 4GLTA 1O8WA 4V2MA 2HRNA 5CRHA 2E2GA 4FYCA 5B7CA 3TJJA 3UARA 2B5EA 1YDKA 1TKDB 1O6JA 1TU7A 1PMTA 2KOKA 3CSJA 5E59A 1WJKA 2KLXA 4TR4A 2GTUA 3QR6A 3APQA 4TXVA 4LA1A 4QL7A 5HFIA 4AJ8A 1ZYQB 3G7IA 3QCPA 5CAXA 4O7HA 4EXJA 4TXOA 3FEUA 2DBCA 1E6BA 2WB9A 1PGTA 2GT6A 4ZL9A 5H5QA 2X8GA 2YV9A 3KH9A 1YEPA 4YQUA 2GQKA 1IYIA 1O7UA 3WGEA 3IR4A 3DRNA 1PD21 4EUYA 4KNDA 1E2YA 3F4SA 4XS1A 2L4QA 2REMA 4HOJA 1U3IA 3TGZA 4J56E 3HD5A 4ZL8A 3VI7A 3BOAA 2MZCA 3O3TA 5KN0A 1Z7RA 1SKRB 4Q5QA 1XZOA 5ENUA 1FVKA 1XW6A 2H8LA 2WJUA 5DALA 3ME8A 1R5PA 1URMA 6GSUA 3TKSE 1PSQA 3ZVJA 1JZRA 2PGTA 4GSNA 2RUEA 2H1BA 3NZNA 3TB2A 4TN8A 1TJDA 4QL9A 3HXSA 3EURA 4DEJA 1SK0A 2DIZA 1AIUA 3FY7A 3P8WA 2H0IA 4MF7A 4IVFA 1FW1A 1A8YA 1G6WA 2O87A 4KDUA 1MDIA 2VL2C 3HY2A 1TRUA 3O6TA 2B5YA 2VCTA 1TK0B 2I81A 5IPHA 3FHKA 4MJCA 1SKWB 1A2MA 3M1GA 3QDNA 5HR2A 1MEKA 2RM5A 5B8BA 2KP2A 4Z7XA 1QGVA 3VLNA 3FR6A 2FLSA 4OD7A 2IPAA 3GIXA 3FK8A 2IFQA 1JZWA 2LRTA 3ZRDA 2A4VA 1FOVA 3LXTA 2B7KA 1F3BA 3KP9A 2ZUPA 4IELA 5IOXA 2LSTA 1GNWA 4N11A 2GGTA 2QGVA 1TW9A 1Z3EA 3RHCA 2H70A 6GSXA 1XCCA 1GSFA 4MJBA 5HR1A 2TRCP 2WS2A 1OE7A 5DAKB 3CSIA 2EC4A 2GSSA 4O32A 2LNSA 3GA4A 2AAWA 4TXOB 5HR0A 6GSVA 5LNKe 4K9ZA 2TRXA 5CRWA 10GSA 3CSHA 3F4TA 5LCZA 2HI7A 2HZEA 3GFKA 3H4KA 5D93A 2IMEA 1SJIA 1M99A 1PX6A 3S9FA 1FG4A 2IIYA 4WETA 4RQRA 5DDLA 3EINA 1T4ZA 3CRTA 5DQSA 1I9DA 2YZUA 4BL7A 4XHMA 3CMIA 2C1YA 5DALB 1F2EA 4NWYA 2FGXA 5G31A 5GAND 2X8HA 2JZTA 5AIVA 5H5RA 2H71A 1K0AA 2HSHA 3TKQA 2CVKA 3FRCA 2YN1A 3GKXA 3IPZA 2ON5A 2K8SA 3LFLA 3MNGA 2K18A 3GH9A 3D6IA 2JSZA 3HHVA 3H79A 3RPPA 1KBNA 3QPMA 2N5AA 3VWUA 1S3DA 1SJ6A 4L0UA 2GSRA 3IRAA 5A4WA 3OR5A 3F0IA 4WKWA 2H6XA 1EEMA 2L57A 4EO3A 2NTOA 1H4OA 2H6YA 4L5LA 5HFGA 1JLWA 3HYPA 2VLTA 3UL3A 3VWWA 1SYXA 2OE0A 3ZZXA 2FD3A 5HQPA 2C0EA 2NVLA 3KMOA 2FWEA 5E4WA 2IFQB 5ECIB 11GSA 4KAEA 3BCIA 2WCIA 3R2QA 2E7PA 3C7MA 3KH7A 2IMIA 3EYTA 2G2QA 1TI3A 5CREA 4HU9A 1A2JA 4ZXGA 1G7EA 5IMDA 1SYRA 1Y6EA 1SD9A 2OBIA 5IMAA 2KUCA 4HI7A 1YZXA 2CZ3A 5J5NA 2LJAA 5G1KA 1SENA 2OACA 2V2GA 3W8SA 2YPMA 4EDZA 1X9MB 1XWCA 2R6KA 1JZOA 3QFAC 2I1UA 1GSEA 3ZITA 1TXXA 4RUVA 3BD2A 3D4MA 4MJEA 3G7JA 4L5OA 2OBKA 2QC7A 1GULA 1WMJA 4MJAA 3HKRA 3ZIJA 2L6DA 3IC4A 1V57A 1FB0A 4MZWA 3I43A 2OKAA 2O7KA 3F9UA 3P7XA 5EY6A 3HZ8A 1NHYA 2GS3A 2H01A 3E3EA 2JSYA 3M9JA 12GSA 3EVIA 2DIYA 5G2ZA 2B5XA 5JCWA 4NV2A 2FWFA 3I69A 1SL1B 4ZBBA 4ML6A 2LUSA 2FNOA 3TJFA 1K0MA 1ST9A 1M2AA 4J2FA 2PVQA 2YANA 1FHEA 1Z6NA 4LLRA 2YV7A 4YQVA 1GH2A 3DWVA 1GTUA 2H19A 1PA3A 2VCXA 4IKHA 1I5GA 3APOA 4EL1A 3ZREA 6GSYA 4IHUA 3F6FA 1ERWA 3UAPA 1SK2A 1AW9A 1NSWA 1FAAA 4MMMA 2PN8A 1QMVA 2CVBA 2R3XA 1A0RP 4K1FA 5A4UA 5D73A 3RBTA 2GZYA 3IAS2 1Q4JA 5G30A 3PINA 1PQNA 2V41A 2Z9SA 2CX4A 4AF2A 1T00A 3VFIA 2GQLA 2YOIA 1U3AA 1X5EA 1EGOA 19GSA 2DJ0A 3D22A 2YJ7A 2M46A 1BYEA 1GTIA 1KTEA 2NDOA 4IN0A 1XW9A 4DSSA 4KCEA 2FA8A 1RK4A 3WGDA 5AISA 1AC1A 2F51A 1N8JA 2DC5A 1K0CA 2OADA 1ERVA 1GTBA 5KEJA 2AUVA 4KGIA 2N5BA 3W8JA 2TIRA 3EU4A 2MMAA 2F8AA 3GX8A 3BJ5A 1Z5YE 4X43A 4IP1A 2YWNA 3RDWA 5HR3A 2P31A 2HLSA 4OO4A 3IV4A 3L9UA 1IYHA 3UVHA 2MBSA 5ECSA 5IOWA 2B1KA 14GSA 3L9SA 1V58A 5J41A 2P0GA 3GKNA 1TP9A 20GSA 5AN1A 4NV5A 2AYTA 4TR1B 5IO2A 4F0CA 3KM6A 1DE1A 1G6YA 2LRCA 1J08A 4KH7A 1F9MA 1MDJA 5CYYA 9GSSA 5INYA 2C3TA 1GRXA 4N10A 3DIEA 2JACA 4K8MA 3HZ4A 4CDOA 1ZYEA 3TRQA 6GSTA 3P90A 4GWRA 1VF1A 5IM9A 5DAKA 2AB6A 4HU7A 4KB3A 2VM2A 5D9XA 1TK8B 3QAGA 3PH9A 2WULA 4ZBAA 2PPTA 4ZL7A 4BWQA 2KHPA 4ECIA 2K6VA 3TOUA 3IK9A 1TRWA 4Q5RA 4HS1A 2H30A 1M7TA 1RQMA 4X1UA 4KDXA 4DVCA 2O89A 3TUEA 1BJXA 2IJYA 3QFBC 2GQMA 2VL2A 1XWBA 2QSIA 1WWJA 1TOFA 3KTBA 4ZB9A 1USBA 4ZB6A 5H5SA 3F6DA 1UN2A 2HE3A 4AGSA 2V6KA 2DJKA 1GL8A 4Q5FA 4MP4A 5ELAA 3IBHA 1K0OA 2HZFA 2N5FA 2F8FA 4DSSB 1NW2A 4DSQA 5A4VA 3GHAA 1LU4A 2B6MA 1X9SB 2BTOT 5EVOA 2H6ZA 5DCGA 1M2BA 3HCZA 3APSA 2LJKA 2C3NA 4K7NA 4OFMA 4I97A 4F9ZA 2P5QA 2V1MA 3Q18A 3GSTA 1O81A 3TKRA 2FUG2 1XPVA 2YWIA 5F06A 1UC7A 3GL3A 3CYNA 3C73A 2HSYA 3EMPA 3FYGA 1X9WB 1WOUA 3V1WA 1U87A 1GLPA 4QQ7A 2OA7A 4EC0A 2V32A 4NAXA 1OAZA 1V9WA 1M0UA 2L59A 3VPTA 2VD0A 2CZ2A 4NMUA 1JLVA 5D96A 3C1SA 3UEMA 2LEGA 4GXZA 3WD6A 2PERA 2MMZA 2XC2A 3SWLA 4V1Ag 3GKKA 1V98A 3HVVA 1W89A 4F82A 3CTFA 5ECOB 5JWRB 5G5EA 2B1LA 3EMXA 2VL3A 2OJLA 3UBKA 4ILFA 2IMFA 1PL2A 1ML6A 4FYUA 3KZQA 1B9XC 2DMMA 3ERFA 1HQOA 3TKSC 1WRYA 3IA1A 3FR3A 3TCOA 2BMXA 4V1Ap 4MK3A 2RIIA 3TJGA 4GCIA 4DSRA 2GT5A 4K2DA 3TDGA 4I5QA 1EZKA 3C1RA 4OMVA 4HQZA 4MA9A 1XWGA 2B3SA 2WRTA 1HNCA 3K8NA 2GVPA 3H1NA 2FY6A 4J57E 1K0NA 1MDKA 1Z7PA 3LYPA 2LNTA 4XCSA 1QK8A 2IMKA 2H1AA 2F9SA 3Q19A 1MTCA 1ON4A 1ZGNA 1R5AA 3FZ9A 4PNGA 4IJ3A 4GSTA 2H1GA 1XFLA 4PXOA 1N2AA 1AAZA 4HZ4A 4I8BA 2GSTA 2DJ1A 2ES7A 3LEFA 2VIMA 2YCDA 3MDKA 4WR5A 4XRDA 1CQHA 1EV9A 4RQXA 5IIZA 4OWYA 5CRGA 1K3LA 4GQCA 2LQOA 4IW9A 4WXTA 3GSSA 3ZFBA 2DMLA 1DBYA 1XOAA 1BX9A 4G10A 2H0HA 2DSAA 3FKFA 4MH2A 1C72A 4OFNA 1J0FA 2PUKC 1XOBA 4K0NA 1XWKA 1GSSA 5CNWA 1Z9HA 5ECHB 3ZYWA 3W6GA 3ZVJD 3H93A 5FWGA 1PKWA 3KCMA 1ILOA 3PR8A 5COHA 3HJOA 1U88A 4NHZA 5B6NA 1SL0B 1FO5A 1BG5A 1YF0A 1AUCA 2JZRA 2PU9C 1TRSA 2FWGA 4JRRA 5IMVA 2H66A 1X5DA 5HFKA 1QUWA 4EKZA 4XS4A 3P2AA 3DVXA 2CQ9A 3CRUA 2V6OA 4ULXA 1R26A 3A2WA 1NM3A 3WT1A 1SD8A 1BAYA 5LD0A 2L5LA 2KP1A 1ACVA 4OFTA 2HYXA 3GH6A 3GYKA 3KEBA 2IN3A 2J9HA 2P5RA 1XBSA 3J7Yk 4K7OA 1YQ1A 5ECPB 4BWSA 4IQAA 3KIJA 3F3RA 3ZMKA 3NIVA 4X0XA 2H74A 4FO5A 1DUGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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