2YOIA

Crystal structure of ancestral thioredoxin relative to last eukaryotes common ancestor (leca) from the precambrian period
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
MVIQVTNKEEFEAILSEADKLVVVDFFATWCGPCKMIAPFFEELSEEYPDKVVFIKVDVDEVPDVAAKYGITSMPTFKFFKNGKKVDELVGANQEKLKQMILKHAP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Synthetic construct
publication title Conservation of protein structure over four billion years.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LECA THIOREDOXIN
total genus 35
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2012-10-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2yoiA00
2G2QA 4TR1B 1B48A 11GSA 1XWGA 3GFKA 1YF1A 3IE3A 3IXRA 4XS1A 4OO5A 4K0GA 2ZUPA 2KP2A 1YKCA 5DCHA 2R2JA 1E6BA 3FR3A 1PL2A 4GCIA 2K6VA 1R7HA 1XIYA 1U6TA 2LJKA 2G0FA 3HYPA 2IMIA 4TXOA 1USBA 2JZSA 2R6KA 2CVDA 1F3AA 1X9MB 4RI6A 1FO5A 3F9UA 3UARA 1SK2A 5G1KA 1QXHA 2H6XA 3HHVA 5ECSA 3ZFBA 2OBKA 1AAZA 2X99A 1J08A 1PX7A 5ECMB 4MLYA 4EXJA 3QD9A 3VPQA 2TRCP 2PPTA 5CAXA 4PQIA 1TDIA 2MZCA 4KUNA 4Q5QA 2L59A 2VLUA 4J2FA 1HNCA 2YOIA 1BEDA 3GSTA 5J9BA 4O32A 5FWGA 5D96A 4HJ2A 2L4CA 3DGQA 4HU9A 4KDUA 1EP7A 2GQMA 3G7YA 4PNFA 4HOJA 1GSQA 2FY6A 4ZL7A 2O7KA 3D4TA 2C4JA 4MCUA 2V2GA 4MF7A 4I2UA 2AAWA 2GS3A 4OO4A 2C0DA 2KP1A 2HLSA 2LQQA 3ZZXA 4KSOA 1M9BA 3QMXA 1VF4A 3L4NA 1PKWA 2YWOA 4OFTA 2A2RA 3DKSA 2HI7A 1XOAA 1F3BA 3J7Yb 3RPNA 1TXXA 2X8GA 5HR1A 3FZAA 1XW5A 4XRDA 4XS4A 1GSFA 2O85A 3QFAC 3DVXA 2LNTA 7GSSA 5AIVA 2GT5A 2I9HA 1TRUA 3H1NA 1TRWA 2HE3A 4L0WA 1V2AA 4O5RA 4OWYA 4WF4A 5KN3A 2B1LA 4PXOA 4HEA2 5ECPB 5FT3A 4NV5A 3F63A 2M80A 1QFNA 3C1RA 3IA1A 5H5SA 2WDUA 3A2VA 2WS2A 3EURA 4MJBA 1JLWA 3HJPA 1TOFA 2PVOC 4DSQA 4JE1A 2YWIA 1EOHA 1ZL9A 3TJBA 3CXGA 2C3QA 2VM1A 3I6AA 1SL2B 2TIRA 16GSA 1OE8A 5DQSA 4EDZA 3LEFA 2VCWA 1SENA 5DCGA 1XOBA 1AUCA 3QAVA 5KN2A 3KP8A 3TJGA 2MBTA 1V58A 4YAPA 3VWWA 1JZOA 5ECRB 2IPAA 1O85A 1DE2A 2AJQB 3HA9A 2B7JA 1QUWA 3ED3A 1T4ZA 3UBLA 2I81A 3IK7A 3KMNA 5G31A 1M2AA 2H30A 3FKFA 2REMA 1S3DA 4MJCA 3HY2A 5ECIB 3EVIA 3FHKA 3HCZA 3F6DA 3LFLA 3WGXA 1KBNA 1HNBA 2FNOA 2C0EA 4N0ZA 5CRWA 2GLRA 1QQ2A 4QL7A 1XVQA 1GTIA 13GSA 1OE7A 3KXOA 1QK8A 1PGTA 1OC8A 3MSZA 4PQ1A 3TCOA 2CAIA 3FZ5A 1XWBA 3D0ZA 1EEJA 2H66A 1FVJA 1IYIA 3ERWA 1YEXA 1R5PA 19GSA 1TI1A 3LYPA 4KX4A 2VCZA 2PU9C 3L9VA 1G6WA 1PL1A 1MDJA 1GSYA 2ON7A 1GNEA 2HT9A 2TRXA 2CT6A 3MAKA 1BX9A 2GGTA 4MA9A 2L6DA 3IRAA 4OCEA 3IV4A 4ZBBA 1X9WB 5HR2A 6GSVA 3F0IA 4HJMA 5D9TA 2PWJA 4FYBA 2CVBA 4EKZA 1OC9B 5EPFA 5JCGA 4BL7A 2CZ2A 1H75A 1Z5YE 1SK0A 2VCQA 2AYTA 4LL1B 14GSA 3GTUB 4ZB9A 5DALB 3EU3A 5J9CA 2VLVA 1ABAA 2P0GA 4QQ7A 4F0BA 3J7Yk 3ZIJA 3PR8A 3LSZA 3UBKA 2H74A 3EWLA 5AN1A 4IQ1A 4KAEA 2E2GA 4LLRA 4EDYA 1UVZA 1WP0A 5CRGA 1TP9A 3W8SA 2DJKA 2JSZA 5ECOB 3LG6A 1W4VA 1O81A 1QGVA 5J4UA 4GWRA 2ALBA 2EIRA 4KNDA 2GVPA 2LRNA 3GURA 1JZRA 1AC1A 2IMEA 1M2BA 5E4WA 1A2MA 1TK8B 4GXZA 3DWVA 3GYKA 3BCIA 2QSIA 4LMVA 1VF1A 1WJKA 4GSTA 3FR6A 5DDLA 2H1BA 3I69A 2B7KA 4AGSA 4BVYA 2K8VA 2LKUA 2IFQB 2LV3A 1WPIA 2NDOA 4AF2A 2PGTA 2H1AA 1U88A 1FB6A 2OACA 1S3AA 3FW2A 2YV9A 5IO2A 1R5AA 3O3TA 1TRVA 2HRFA 2GT6A 4KDYA 2JADA 1PKZA 2GZPA 2VM2A 4TRXA 2VCXA 2HNLA 3BBYA 2N5FA 1M99A 1RW1A 3S9FA 3P2AA 4MF5A 2GTUA 3KTLA 2K8SA 1GLPA 1SD9A 4IN0A 2XPEA 1FOVA 1V57A 2IJYA 2HSYA 5HR0A 1ST9A 2JZTA 1G7EA 3LJRA 2BMXA 1OC9A 5D73A 3EE2A 5FHIA 4JRRA 4K7NA 3RBTA 4XTSA 1Y25A 3DVWA 3FYGA 5ID2B 2C0FA 2GZYA 2QKEA 4EE0A 1XWCA 5DALA 5L71A 2EIQA 3HKRA 1GTBA 2C80A 2DJ0A 5LCZA 3C1SA 1FVKA 4FO5A 2X8CA 5B6NA 3UIWA 4OFMA 2LEGA 4F82A 1EEMA 1TKDB 5D93A 2V41A 2LRTA 2ES7A 2WZ9A 5ECQB 1XW6A 2I4AA 3HD5A 2DC5A 3C71A 4TXVA 2IMKA 3F4SA 1THXA 3UAPA 1UA5A 5F0GA 2CX3A 5G5EA 3ZL5A 3GUSA 2IWTA 1VF2A 4L8EA 5ECKB 4DEJA 5H5RA 4NPBA 1MD4A 5IMVA 1TK5B 2HRNA 4CDOA 3GKKA 2H76A 3CMIA 2E2MA 1JHBA 5CNWA 3Q19A 1PA3A 4YQUA 3F3RA 5CO3A 4G9HA 2IFQA 3TRXA 1EOGA 2C8UA 1A24A 4YQVA 3UJ1A 3D5JA 1G7OA 2IMDA 2CA8A 5J41A 3GRXA 2FA8A 4FIWA 1SKWB 1B8XA 3VWUA 1U3AA 2N5BA 3IAS2 2VL9A 1FG4A 2CVKA 3TKSE 2C3TA 2JSYA 1A0FA 5ELGA 3TUEA 1XFLA 1W89A 3GNJA 4WKWA 5GSSA 1BYEA 1O8XA 1HD2A 1TI3A 2H19A 5AGYA 5ECHB 4N10A 2HXKA 20GSA 1XXUA 2DJJA 1EWXA 4L5LA 4ZXGA 2FUG2 4G2EA 2VL2A 2VIMA 3IC4A 5DBQA 4JR4A 1K0MA 1OYJA 3IPZA 3KEBA 4WBJA 3GL3A 5HQPA 4ECBA 2GDRA 5G30A 5B8AA 2J9HA 4NWYA 3TKSA 3W6GA 3UVTA 2GSTA 4IBPA 5JWOB 4MZWA 4HQSA 4JR6A 1VRSD 5G1LA 2P5QA 1GWCA 3ZFLA 1M9AA 5A5KA 4IW9A 2FWHA 3WT1A 3KCMA 4TR3A 3D4MA 2QC7A 4WBRD 3D6IA 4EC0A 1GSEA 1K3OA 3KIJA 3CSHA 3F6FA 4HI7A 1MEKA 1GP1A 2ON5A 5CREA 6GSSA 2O89A 4X0XA 4JBBA 3HVVA 4K1FA 4KH7A 3KM6A 4TR1A 4I2TA 4LL4B 1X5DA 2RM6A 3GA4A 1K3YA 2H72A 4KSMA 2L6CA 5D9WA 5COHA 1ZYEA 5CRDA 1ZYQB 1X5CA 3CSIA 1Q98A 1R4WA 4EO3A 3A5WA 4F9ZA 1TU7A 3CTFA 4YH2A 1EV4A 3IR4A 3OR5A 4NXIA 4Q5FA 1MD3A 1JZWA 3DEXA 4YAVA 1O73A 6GSYA 3ZREA 3TKPA 1XWKA 2YP6A 3ZYWA 2IN3A 1B4PA 2YCDA 5A4UA 5C00A 5D8IA 1GLQA 4DVCA 4IJIA 1PRXA 4V1Ag 5ELAA 2MMNA 3TJJA 2KOKA 1I9DA 3QCPA 3RDWA 2VCVA 2IL3A 3F3QA 2MMOA 2H1GA 2KHPA 3WYWA 1BQ7A 3HDCA 1AW9A 5F07A 4ECJA 3TRPA 3KD0A 1K0DA 3UMAA 2B5XA 3L9UA 3SBCA 1T4YA 4GSNA 4TKYA 2CV4A 3EMXA 3UL3A 2B5EA 4NAXA 3ISOA 1WIKA 3M3MA 5CRHA 2YN1A 3LQ7A 5EY6A 2E0QA 1XWAA 4WR5A 1U3IA 1ON4A 4PURA 4KGIA 5H5QA 4TOPA 1EP8A 5GAND 3ME8A 3FZ4A 3VLNA 3JCML 3MDKA 1FB0A 4V2NA 4KA0A 1GSUA 4F0CA 5HFIA 4MMMA 2D2ZA 4L0UA 2FD3A 2LTKA 3NOFA 5KN1A 1FHEA 5ABRA 2JL4A 3A2WA 2DIYA 4ULXA 1TU8A 3Q18A 5J5NA 3LXZA 5AISA 1M0UA 4KDXA 4POMA 1O6JA 2A2SA 5G2ZA 4WEYA 10GSA 2NVLA 3QAWA 1X5EA 1ERUA 3GKNA 1A2LA 3N5OA 4K0NA 3RHBA 3G7IA 2MMZA 1ZZYA 6GSUA 3RAZA 1BG5A 1AQWA 5GAPD 2BJXA 2J23A 3HVXA 4EF0A 1WE0A 1NM3A 5JWQB 4PNGA 3ZMLA 1A0RP 2GZZA 1XVWA 2H01A 4IVFA 3C73A 2C1YA 2YZHA 1A8LA 1NW2A 3GH6A 3CRUA 3A2XA 1U87A 1ERWA 1K0AA 3WT2A 3M1GA 1FW1A 1HQOA 4IELA 3UOMA 1A2JA 3KTBA 2AUVA 3ZMKA 2VO4A 4WF5A 5KEJA 3GHAA 17GSA 1LBKA 4O92A 1MTCA 1O7UA 1YY7A 3ERGA 2R37A 2OE1A 3GKMA 4IP1A 3NZNA 4IHUA 1Z6NA 4TR4A 2FGXA 4K6XA 3FY7A 1X0RA 1B9XC 1MDKA 5CYYA 5DAKB 2B6MA 3DRNA 4N30A 2LSTA 1XZOA 2FWFA 1K0BA 3UEMA 4FYCA 3LORA 2DMMA 1BAYA 1EGRA 4IS0A 1SL0B 1CQGA 4BPYA 4ECCA 2H1DA 4PUFC 4EUYA 1S3CA 4V2MA 2XC2A 4POKA 4N0VA 2C3NA 3D22A 1F9MA 3CTGA 4FYUA 3VWXA 3HVSA 3TKQA 3HJOA 1XCCA 4JZQA 3VPTA 1OAZA 3ZVJD 4I8BA 4LA1A 2JU5A 2LRCA 4G19A 2RUEA 3GSSA 3PH9A 1G6YA 5DJLA 4L5OA 3C8EA 3GMFA 3TDGA 1NSWA 5DVBA 4K2DA 4RI7A 1KEBA 1DUGA 1YKAA 4KW6A 2B5YA 1SYXA 3L9SA 2RUFA 2H0GA 2HZFA 2H0IA 1THOA 4XRAA 5G5FA 2MBSA 3C7MA 4GF0A 4IQAA 1M2DA 4GRFA 3DMLA 5GSTA 1ZMAA 1A8YA 1SU9A 3ME7A 3ZITA 4ZL9A 5JCWA 4CHSA 2DLXA 3GTUA 2X8HA 4TN8A 9GSSA 4DSSB 1JFUA 2H71A 4ILFA 5DQYA 4GQCA 1SJIA 1XBSA 3M0FA 1GSDA 3LXTA 4MPFA 4XS6A 3TJKA 4MJAA 2O8VB 1YJ6A 2PBJA 3ZRDA 1MDIA 1GTAA 2VD0A 1GTUA 3APOA 4PUAA 3R2QA 5F06A 1RK4A 1TW9A 1Z3EA 2VOCA 3QOUA 1NHYA 3IBHA 5EL8A 1TRSA 3ZTLA 5HFGA 2WULA 2FHEA 2L5LA 1T8EB 4ISDA 3O6TA 2AB6A 4WETA 1GUKA 4P3YB 1H4OA 2L57A 3GIXA 3EINA 3HJMA 4PQHA 2R5GA 3GV1A 4JU5A 1V98A 3FRCA 4TR0A 2A4VA 5ENUA 3RHCA 1PX6A 1Z7PA 2WCIA 4NHWA 1KTEA 5D9XA 1UN2A 2YV7A 4I6XA 1K0OA 1Z6MA 3E9JB 2KUCA 2FWEA 2IMFA 3FZ9A 3N9JA 1YQ1A 3GN3A 2DJ1A 2YPMA 4RUVA 5IOXA 1ACVA 2AHEA 4E8HA 3I9V2 4V2LA 2H70A 5IMAA 1VF3A 4ID0A 5F05A 3BD2A 5HFKA 2F8FA 3I43A 5LD0A 1A23A 4XS4B 5F8BA 1Z9HA 3PINA 5JCUA 1PQNA 2R3XA 1T00A 2YJ7A 3CRTA 4I97A 1RQMA 3D21A 2VAFA 2CX4A 4MH3A 2YZUA 1WOUA 5LNKe 5IO0A 3A3TA 1WMJA 1SKRB 3GKXA 2XBQA 3VWVA 4GQFA 5ID2A 5JWRB 4DSSA 1TTZA 2F3MA 4TW5A 1SYRA 3DXBA 4K7OA 3PGTA 1GRXA 3EYTA 4ZL8A 1M7TA 2GSQA 1SL1B 1OVNA 1PN9A 2LUSA 4BWSA 3P90A 2RLIA 3APSA 4EVMA 2HZEB 1FAAA 3VI7A 4J57E 1DBYA 4MPGA 3H79A 4GLTA 1K3LA 3DD3A 1GUMA 3RPPA 2FCHA 1BJXA 2OBIA 1YZXA 3CBUA 2EC4A 3E3EA 2VUPA 3VURA 2RM5A 3QDNA 2F8AA 2I1UA 4MF6A 2E7PA 4MZBA 2OADA 3H93A 4NMUA 4O7HA 4Q5NA 3DYRA 4AJ8A 4HZ4A 4WXTA 1F6MC 5IQYA 2N5AA 2NPBA 2XHFA 4POLA 4GTUA 1AQVA 5DJMA 2JZRA 2HSHA 5B6MA 2OJLA 4K9ZA 2FA4A 4HUAA 4D73B 3GL5A 4GSSA 3KMOA 1V40A 3VI5A 3BJ5A 5KN0A 2YWNA 1Y6EA 1GSSA 2M72A 22GSA 3WGEA 2PN8A 4HU7A 4WR4A 2GSSA 3L78A 2H8LA 1XPVA 3UVHA 4FH8A 4PX1A 4CW9A 5INYA 3NIVA 5J3RA 3WGDA 3KH7A 2XBIA 4E8EA 2DJ2A 3LWAA 4IP6A 1J9BA 5A4WA 1T7PB 1JZDA 3IHQA 2F51A 4ACSA 3BOAA 2HYXA 2VCTA 4X1UA 1F2EA 3AY8A 2C0GA 2V6KA 3DIEA 4ZBDA 1O8WA 5IMZA 5IMDA 1GUHA 6GSWA 3APQA 1ML6A 1AIUA 1GULA 3G7JA 4MABA 2VD1A 1T3BA 2JACA 2DIZA 3Q74A 4MDCA 4K7IA 2HZEA 1I5GA 3KH9A 2O87A 4N11A 2YJHA 1DSBA 3TRQA 2WFCA 3TB2A 2Z9SA 1GH2A 2B3SA 4TVEA 2QGVA 3LGCA 1PD21 1ZCPA 2BTOT 4BWQA 1Q4JA 2PERA 4RQXA 2PUKC 2GSRA 2OKAA 1X9SB 2PVQA 3MWHA 4XIHA 5GZZB 1ERTA 4XHMA 3HZ8A 2DBCA 2LJAA 2WRTA 3Q6OA 4X43A 3M8NA 1HYUA 4AJ6A 4DSRA 2CAQA 2LNSA 1Z7RA 3IOSA 3QR6A 3TGZA 1UC7A 4Q5RA 2LS5A 2H75A 5D9VA 4D73A 3MNGA 2M46A 3CYNA 1ZGNA 3EMPA 4H86A 3K8NA 3O76A 2K18A 2V6OA 4OD7A 4POBA 1YDKA 3P8WA 1LU4A 3IAM2 1KNGA 4KCAA 3WD6A 5IIZA 3F4RA 2RIIA 3QFBC 1C72A 1VGLA 4KE3A 4NV2A 2AV4A 3CSJA 1EZKA 4V1Ap 1E2YA 2OE0A 2OE3A 1AQXA 1HNAA 2DMLA 1PSQA 1B4QA 3QAGA 2K9FA 6GSTA 3U6VA 2NTOA 4EL1A 5EVOA 3EU4A 4PGTA 1N8JA 3FEUA 1OC3A 5IM9A 4J56E 5E59A 1K0NA 2P31A 1GNWA 4OMVA 5A4VA 2WJUA 3IK9A 3KJYA 2MMAA 4HZ2A 4K8MA 1AXDA 3KZQA 1WRYA 2LJRA 4BVXA 2GQKA 4MZCA 4MJEA 1SKSB 2I3YA 5IOWA 1PMTA 3ZVJA 1G0TA 1YF0A 3TKRA 4F2IA 1B9YC 5HR3A 1LJRA 2FLSA 3HZ4A 5IMCA 3ERFA 4ZBAA 1F37A 3F8UA 3L0HA 3M9JA 3V1WA 4HS1A 1YEPA 1TK0B 2ZNMA 1OKDA 2L4QA 5IPGA 4OFNA 3FR9A 4NHZA 2H6ZA 2X64A 8GSSA 5AIXA 2B1KA 3M9KA 3GX8A 2WGRA 1R26A 2IIYA 2CZ3A 4JEDA 1JLVA 18GSA 1WWJA 2H73A 3US3A 5IPHA 1K0CA 1TJDA 3F4TA 1SK1A 1DE1A 2PMTA 2F9SA 2HFDA 3U5RE 3ZIVA 2V1MA 3GX0A 2YANA 3VK9A 4OCFA 4YQMA 3EC3A 3TJFA 3SWLA 4AJ7A 4BA7A 4ZB8A 2KLXA 2L5OA 4ZILA 5ECLB 1ZOFA 3E0UA 3TOUA 1SJZA 4TXOB 2MYGA 2YWMA 3H4KA 2DJ3A 2GQLA 1EGOA 4G10A 2V32A 3TOTA 3QPMA 5ECNB 3P7XA 4RQRA 5CP1A 4ML1A 4I5QA 5IMFA 1SJ6A 2H6YA 5C04A 1EV9A 4IJ3A 1V9WA 3VFIA 2ZCTA 4QL9A 1ERVA 1URMA 4KCEA 4MP4A 4IKHA 1XW9A 1OKTA 6GSXA 4Z7XA 3LYKA 1IYHA 4F03A 2XPDA 2VL2C 2OA7A 3KGKA 1NHOA 2P5RA 3HXSA 12GSA 1SD8A 2NBSA 4ML6A 4IGJA 4ECIA 1N2AA 3FK8A 4LMWA 3GH9A 3G9BA 2DSAA 2VLTA 2R4VA 1CQHA 5DAKA 3TKSC 2VL3A 2H0HA 4HDEA 5B7CA 1QMVA 3H8QA 2WB9A 3BCKA 4ZIJA 3ZLPA 2CQ9A 4MK3A 4ZB6A 2LQOA 3IDVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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