The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
79
|
structure length |
79
|
Chain Sequence |
GSSGSSGRLCKALYSFQARQDDELNLEKGDIVIIHEKKEEGWWFGSLNGKKGHFPAAYVEELPSNAGNTATKASGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein transport
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of human Nostrin
rcsb |
| molecule keywords |
Nostrin
|
| total genus |
7
|
| structure length |
79
|
| sequence length |
79
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DNU A; 1M8M A; 4D8K A; 4JJC A; 1J3T A; 2JS2 A; 2KRM A; 4X1V A; 4AFQ C; 4OMM A; 4RTU A; 4Z8A A; 1BU1 A; 4J9F A; 1ABO A; 1NYF A; 4LUE A; 4RTT A; 1X2K A; 1QWF A; 1NEG A; 2DL5 A; 1B3Q A; 1VYT A; 2CT3 A; 2K2M A; 1GRI A; 1T3L A; 4JPB W; 1SRL A; 2EVR A; 5GJV B; 1V1C A; 2F2V A; 1AVZ C; 2EBP A; 2OAW A; 2RQU A; 4J9D A; 2BZ8 A; 2CSI A; 1WXT A; 3THK A; 1YWO A; 2LZ6 B; 2K79 A; 2YUO A; 3I5S A; 1VYV A; 3NGP A; 1M3C A; 1WYX A; 4AFZ C; 4D8D A; 3RBB B; 5L23 A; 2LP5 A; 2FG0 A; 2DE0 X; 1W1F A; 2L3P A; 3I5R A; 3M0U A; 4FSS A; 2I0N A; 2AZS A; 2EW3 A; 3M0Q A; 2YUQ A; 2P4R A; 1UTI A; 1WDX A; 3M0P A; 4J9I A; 4Z89 A; 2M0Y A; 2AKK A; 3UF4 A; 2ECZ A; 2DRM A; 2X3W D; 4KRT A; 1K1Z A; 2MCN A; 4AFU C; 5IXF A; 1GCQ C; 2JW4 A; 2D8H A; 1E7O A; 2CDT A; 2JTE A; 1MUZ A; 1OV3 A; 4ZNX A; 2LX7 A; 1EFN A; 3JV3 A; 1Z9Z A; 1E6H A; 1UG1 A; 2DIL A; 2YDL A; 1U3O A; 4LUD A; 2ABL A; 2DA9 A; 2O88 A; 2LMJ A; 1NG2 A; 2NUZ A; 1Z9Q A; 2O31 A; 1JU5 C; 2A36 A; 2DL8 A; 2EQI A; 2RF0 A; 1Y0M A; 4RTZ A; 2O2O A; 4JZ4 A; 1BBZ A; 1QKW A; 4CC7 A; 2EKH A; 2EPD A; 4J9C A; 2K7A A; 5IH2 A; 2LJ3 A; 1NYG A; 2RNA A; 1UFF A; 1CSK A; 2A37 A; 1YCS B; 2J7I A; 1YN8 A; 3SEM A; 2KR3 A; 2KGT A; 5FWC A; 3UA7 A; 2DL3 A; 2KXC A; 2HCK A; 1JEG A; 4JJB A; 3VS1 A; 2FO0 A; 1K9A A; 1H3H A; 2YUN A; 1G83 A; 2DVJ A; 2L2P A; 1LCK A; 2ENM A; 1ZLM A; 2KBT A; 3ZL7 C; 1I1J A; 2KXD A; 2V1R A; 1KSW A; 4CC3 A; 3VS5 A; 1KIK A; 2ROL A; 3H0F A; 2W10 A; 2YSQ A; 2L3S A; 2BZX A; 1UDL A; 2D1X A; 1JO8 A; 1YNZ A; 4HCK A; 2FRY A; 4OMO A; 1GBQ A; 5FWB A; 1GCP A; 5IHI A; 3VS7 A; 1U5S A; 3NMZ C; 1QKX A; 2V1Q A; 1M3B A; 2K6D A; 3NPF A; 3SHW A; 1SPK A; 5EC7 A; 2DMO A; 1NEB A; 2KNB B; 4LNP A; 1G2B A; 1KJW A; 1K76 A; 1KFZ A; 1JXO A; 2OI3 A; 2H8H A; 4RTV A; 1CKB A; 1UJY A; 2DLP A; 1PRM C; 2O9V A; 3VS2 A; 2AZV A; 4A63 B; 2IIM A; 4J9H A; 2O9S A; 2FPD A; 1NLO C; 2DRK A; 2C0I A; 4J9G A; 1M30 A; 4F16 A; 1X27 A; 1N5Z A; 1SHG A; 1JXM A; 1PRL C; 3UA6 A; 3TSZ A; 1ABQ A; 1SRM A; 1YP5 A; 3EG1 A; 4R0K A; 1T0J A; 2KEA A; 1HSQ A; 1MV0 B; 1SHF A; 1PKS A; 5I11 A; 1QLY A; 4JJD A; 2DL4 A; 1B07 A; 2FPE A; 3QWX X; 1ARK A; 3O5Z A; 3TSW A; 1AWJ A; 2DBM A; 4OMP A; 1HJD A; 2LNH B; 2NWM A; 2A28 A; 3EG2 A; 1FMK A; 1WLP B; 3H0H A; 2VWF A; 3H0I A; 5IXB A; 2HBW A; 1W70 A; 4QT7 A; 4J9E A; 1TG0 A; 1WA7 A; 4IIM A; 1K0X A; 1WFW A; 1X43 A; 1AWX A; 2KT1 A; 4CC2 A; 2GTO A; 2DM1 A; 2RMO A; 1UGV A; 1UJ0 A; 5ECA A; 1NM7 A; 4DEX A; 3GBQ A; 4CC4 B; 1HD3 A; 2YT6 A; 1UUE A; 4HVV A; 2KT8 A; 3VRZ A; 3EHR A; 1W6X A; 1M3A A; 3QWY A; 3M0T A; 1H92 A; 1M27 C; 1NLP C; 2CUB A; 2KRO A; 2RQT A; 4LE9 A; 1ZUY A; 4ESR A; 1QWE A; 2LCS A; 3REA B; 2OJ2 A; 2KRN A; 2LQW A; 2J6K A; 2HDA A; 1OOT A; 2LJ1 A; 2FRW A; 5HCK A; 3C0C A; 2F2W A; 3EGU A; 1OEB A; 2PNI A; 4RTW A; 1MV3 A; 2JM8 A; 2DYB A; 3H41 A; 2KE9 A; 2SEM A; 2EYY A; 4E6R A; 4ORZ A; 1UHF A; 1JQQ A; 1OPK A; 1PHT A; 3M0S A; 4Z88 A; 1ZX6 A; 2KRS A; 1Y57 A; 1BB9 A; 1X2Q A; 2DL7 A; 2EGC A; 2GBQ A; 2J06 A; 2KYB A; 2SRC A; 3VRY A; 1RUW A; 2ESW A; 5I22 A; 3LH5 A; 1GL5 A; 3I35 A; 2GGR A; 1GCQ A; 2AK5 A; 2YUP A; 4DEY A; 3A98 A; 1T3S A; 2E5K A; 1GFC A; 3RNJ A; 1PKT A; 4HXJ A; 1PWT A; 2EYW A; 1RLP C; 1ZUU A; 2K9G A; 4EIK A; 2D8J A; 3UAT A; 4JZ3 A; 2F2X A; 2C0T A; 2JT4 A; 1UHC A; 2DBK A; 2D0N A; 5FW9 A; 2ED0 A; 4F14 A; 1GFD A; 2GQI A; 3FJ5 A; 1U06 A; 2DF6 A; 2GTJ A; 4Y92 A; 3VS0 A; 2J6F A; 4J9B A; 3TVT A; 2MIO A; 4RTX A; 2LJ0 A; 5IHK A; 3EHQ A; 4RTY A; 3R6N A; 1QCF A; 1BK2 A; 1E6G A; 3VS4 A; 1SSH A; 2GNC A; 2RQR A; 2G6F X; 3ULR B; 2EYZ A; 1SEM A; 2XMF A; 4OMQ A; 4LN2 A; 2MOX A; 2JM9 A; 3PE0 A; 1RI9 A; 2DX1 A; 1S1N A; 2FEI A; 2CH4 A; 4RUG A; 2A08 A; 2PTK A; 2JMA A; 3I9Q A; 1AWW A; 2ED1 A; 1AD5 A; 2BZY A; 1ZSG A; 4AFS C; 2B86 A; 1PNJ A; 1ZBJ A; 1FYN A; 2CRE A; 5GJW B; 1K0S A; 2J6O A; 2J05 A; 2RN8 A; 1WI7 A; 2ROT A; 3PVL A; 4IIO A; 3REB B; 2K3B A; 2M51 A; 1I0C A; 2W0Z A; 2C0O A; 1TUD A; 4M4Z A; 2RQV A; 3EG3 A; 3CQT A; 2AKL A; 1A0N B; 1OPL A; 1VYU A; 4HVU A; 1WXB A; 2KYM A; 3VS3 A; 3NHN A; 2HEQ A; 2BTT A; 2EYX A; 2CSQ A; 5IHN A; 4HVW A; 1AEY A; 1TUC A; 1AZE A; 3M0R A; 1RLQ C; 2PZ1 A; 2JXB A; 1UEC A; 2EGA A; 1WXU A; 2FPF A; 2LQN A; 1UE9 A; 3IQL A; 1ZUK A; 1XOV A; 4GLM A; 2QDL A; 1IO6 A; 1AZG B; 3KFV A; 1AWO A; 1T0H A; 2CT4 A; 1WX6 A; 2RPN A; 2JMC A; 4K11 A; 2VKN A; 1K4U S; 2X3X D; 2EGE A; 1X6B A; 4WCI A; 4OMN A; 2VVK A; 2JS0 A; 2CUD A; 2RQW A; 1WIE A; 1AOJ A; 1H8K A; 4AG1 C; 1CKA A; 1I07 A; 4F17 A; 2L0A A; 3EG0 A; 2CH4 W; 2HSP A; 1YWP A; 4OML A; 2DJQ A; 1X6G A; 1GBR A; 1X69 A; 3VS6 A; 3PVQ A; 4GBQ A; 4AG2 C; 2L3Q A; 3U23 A; 1VA7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DNU A; 2RK2 A; 4PJO D; 5DLO A; 1J3T A; 3CCS Q; 2KRM A; 4AFQ C; 1ZQ1 A; 4M78 B; 4Z8A A; 3CCU Q; 4J9F A; 1VQ5 Q; 4BAC A; 4EPC A; 1NEG A; 1WJQ A; 2DL5 A; 2CT3 A; 2E3H A; 2JNG A; 1D0Z A; 4PJO A; 5GJV B; 3ER0 A; 4MDW A; 2RQU A; 4J9D A; 4CRI A; 4OMF B; 3V7S A; 3GNG A; 1ZSZ B; 2JOY A; 2K79 A; 1VYV A; 1HYO A; 1WYX A; 4GY5 A; 4IUR A; 3UPU A; 3DLM A; 4AFZ C; 1VQ6 T; 3A8G B; 3RBB B; 5L23 A; 4XTU A; 3I56 A; 2FG0 A; 2RI2 A; 2O4X A; 2L3P A; 3M0U A; 2I0N A; 2EW3 A; 3M0P A; 2EQJ A; 3C4S A; 4N0A A; 2X3W D; 5KYX A; 2DXT A; 2QYZ A; 1K1Z A; 2MCN A; 4NL2 A; 1WGS A; 5IXF A; 1GCQ C; 2CP3 A; 1Q7Y C; 2JTE A; 1U1S A; 4DOW A; 2KK4 A; 2QAZ A; 2O4X B; 4HKE A; 3I55 Q; 2LX7 A; 1YI2 T; 1EFN A; 2AHJ B; 1Y07 A; 1Y7X A; 1I5L A; 5CAI A; 3G6E Q; 1FXX A; 1U3O A; 1WPY A; 5GAM j; 3V8K A; 5KYX B; 1VQM A; 2VXE A; 1BYM A; 1QVF P; 2RF0 A; 3CXC S; 5J39 A; 3QJ6 A; 3JCM g; 1MMG A; 1BBZ A; 1QKW A; 4CC7 A; 2D0Q B; 2K7A A; 4X9C A; 2OAU A; 4QQD A; 2E6Z A; 3WXM B; 2RH2 A; 3E9F A; 3EG9 B; 3OQ5 A; 2KGT A; 4FM4 B; 5FWC A; 2DL3 A; 2CZ7 B; 2KXC A; 2LRQ A; 4DBR A; 1K9A A; 4C8Q E; 4M75 D; 2L2P A; 3CC7 A; 5A0G A; 3QBY A; 1JJ2 S; 3H0F A; 2W10 A; 3M4G A; 3RR6 A; 4MZM A; 3SWN A; 1G3W A; 2BZX A; 1YJN A; 4QW2 A; 2D1X A; 5LJ5 e; 1GCP A; 4M75 A; 3VS7 A; 3ME9 A; 2QA4 T; 3CEY A; 4JRK A; 3SHW A; 2NLU A; 1FMW A; 1WJS A; 1NEB A; 3G71 Q; 1Q7Y U; 1KJW A; 1K76 A; 2LQK A; 2DLP A; 3OYI A; 1YJW Q; 2FB7 A; 3A8O B; 1KHI A; 4EDU A; 3RDV A; 2AT1 B; 2IIM A; 4M75 B; 4J9H A; 2O9S A; 1K73 C; 2FPD A; 1NLO C; 3MET A; 1M30 A; 3S3M A; 1X27 A; 3CPW P; 1JXM A; 4EMK A; 2CZ6 B; 4KH0 B; 1QVF A; 4M7A C; 3HHT B; 4R0K A; 3CPF A; 2E1H A; 2KEA A; 1SHF A; 1XJW B; 4BE1 A; 5GAO m; 3CME A; 1R8O B; 3KUF A; 3JCM J; 1B07 A; 4FSX A; 1TTH B; 3NTI A; 3JCM b; 1ARK A; 2LNH B; 2A28 A; 3H0H A; 1UGQ B; 1PM3 A; 4RG2 A; 1VQN Q; 4RG8 A; 2QQ9 A; 1YJW T; 2PVD B; 5D6Y A; 1YJ9 A; 2F5T X; 1K0X A; 4M7D C; 1WFW A; 1AWX A; 1WHJ A; 4F7U F; 3I56 T; 4HCB A; 1SG5 A; 4RMO A; 1UGV A; 1UJ0 A; 3QYG B; 4DEX A; 2P0Q A; 2RA2 A; 5CIU A; 2COY A; 1KQS P; 2CP5 A; 1HD3 A; 4HVV A; 3WVE B; 3VRZ A; 5LJ3 j; 5KYU A; 4HT8 A; 3M0T A; 1NLP C; 2CUB A; 1SSF A; 2KRO A; 3X26 B; 2DEU A; 4M7A E; 3AT1 B; 3CBO A; 2Y90 A; 1JBM A; 3HRU A; 1OUL A; 3P8H A; 4KH1 B; 1QQJ A; 1Q86 R; 4FT4 A; 2EQM A; 5GAM g; 1M4Z A; 3L2Q A; 4J83 A; 3GPL A; 2KRN A; 3OS0 A; 1BCO A; 4P5N A; 3JB9 F; 4M77 A; 3PTA A; 5HCK A; 2LC4 A; 3C0C A; 2F2W A; 3EGU A; 1VQM T; 1PD0 A; 2GFA A; 3CPW A; 1ZA1 B; 3M4Y A; 4MML A; 4JS4 A; 3OS2 A; 3H41 A; 1V29 B; 6AT1 B; 1OPK A; 4Z88 A; 4PL6 A; 1H64 1; 2WSC E; 3CXC P; 2SRC A; 2J06 A; 2VXF A; 5I22 A; 2K3Y A; 1Q7Y R; 1WNL A; 4M77 B; 5GAM d; 2DD4 A; 3I35 A; 2NUP A; 2ZPF B; 1RAI B; 2GGR A; 1GCQ A; 2HKN A; 5A0D A; 1WQ7 A; 3RNJ A; 1YIT A; 1QP2 A; 1PWT A; 3OBW A; 2WSF E; 3DLL A; 3UAT A; 3OSV A; 3M58 A; 4JZ3 A; 2G3R A; 4JRQ A; 5FW9 A; 1SF9 A; 1FX7 A; 3M56 A; 1YIJ A; 4Q5W A; 1JJ2 P; 1KQS A; 2GTJ A; 5GAN 2; 4LDU A; 4PJL A; 3X25 B; 2CP7 A; 3TVT A; 4E7I A; 2MIO A; 3GLX A; 4KGZ B; 5IHK A; 4DBH A; 3JCM V; 3MO8 A; 1E6G A; 4JUV A; 4J6Y A; 4Y28 E; 2RQR A; 3CC4 A; 4BI8 B; 2G6F X; 1PCX A; 5I2S A; 2JN0 A; 2FZG B; 4A4H A; 1W2B S; 4OMQ A; 4LN2 A; 3HRT A; 1RI9 A; 2FEI A; 1S1N A; 4C8Q G; 2L8D A; 4C8Q F; 1QVG P; 2WAC A; 2QGG A; 4AFS C; 1RAF B; 2EYQ A; 1KG1 A; 1PNJ A; 4PLL A; 4A4K A; 2CP6 A; 1R0B G; 5CCA A; 3NTK A; 2NYS A; 5EG2 A; 2HNI A; 1QP3 A; 4PJJ A; 4LD9 K; 2VAS A; 3JCM h; 1QCN A; 2ROT A; 2K5F A; 4IIO A; 3CME T; 2RK1 A; 3CXC A; 5KYY A; 2OTL A; 2K3B A; 1TUD A; 2NUT B; 2RQV A; 2DER A; 3CQT A; 1IGQ A; 1VOM A; 1VQ9 Q; 1A0N B; 4HVU A; 1NZ9 A; 3OYY A; 1UB4 A; 3PMI A; 4NOY A; 2HEQ A; 1YJ9 T; 3GP8 A; 4XU0 A; 1D3B A; 5IHN A; 1BI3 A; 4C0D C; 4M7A D; 1AEY A; 1TUC A; 2LX9 A; 5LJ3 g; 1AZE A; 1RLQ C; 4QQG A; 1TXQ A; 2JXB A; 3EGX A; 1UEC A; 4IUP A; 2DYI A; 1UE9 A; 1JJ2 A; 2EQK A; 1ZUK A; 3S3O A; 1XOV A; 2QDL A; 1AWO A; 3E9G A; 2CT4 A; 4AT1 B; 3CCL A; 1WX6 A; 2RPN A; 4OB0 B; 5GAN 6; 1K4U S; 1D3B B; 1K9M C; 3A5Z B; 2VGN A; 2IPO B; 1H8K A; 4M7D D; 4N4H A; 4AG1 C; 4F17 A; 5LJ3 d; 3MP8 A; 1IHW A; 1G3Y A; 1Y96 A; 2CH4 W; 3EG0 A; 2HSP A; 5CK9 A; 2DIQ A; 3TCJ A; 2Z0W A; 1QVG A; 3CCE Q; 2EAY A; 4B9X A; 4XQ3 A; 4BD3 A; 1M90 C; 1PC0 A; 2R57 A; 4M7D A; 5GAO q; 1X69 A; 2XDD A; 1MNE A; 4C0Z A; 1M8M A; 2YLB A; 2DK3 A; 5LJ5 j; 1VQ7 A; 4X1V A; 2P84 A; 4RTU A; 2DD5 A; 2QQS A; 3L2W A; 4RTT A; 2BE7 D; 1VYT A; 4M7A G; 2JTM A; 2MK5 A; 4JPB W; 1S72 Q; 3EFR A; 2VUB A; 1N9R A; 3THK A; 1N27 A; 2LZ6 B; 2YUO A; 1YIT T; 4BY6 B; 1I4K 1; 4D8D A; 1D09 B; 1YHQ Q; 2ZGW A; 5DM7 R; 2DE0 X; 1DJ7 B; 3CCE T; 3RUX A; 2P4R A; 3MEU A; 3CCM A; 1PG5 B; 1XQH A; 2M0O A; 2M0Y A; 2MF2 A; 2AKK A; 1OZ3 A; 2ECZ A; 2DRM A; 2R5A A; 2QAS A; 2I2L A; 1K9M U; 4AFU C; 3X28 B; 3MEW A; 2D8H A; 3URG A; 2GF7 A; 1O9S A; 3JCM f; 1OX9 A; 2E10 A; 1G5V A; 3JV3 A; 3OY9 A; 1Z9Z A; 3TU4 K; 1E6H A; 1I8F A; 1VQK A; 5GAM h; 3HP9 A; 1VQL Q; 3CMA A; 4LUD A; 3QXE B; 1K8A C; 1M90 U; 3OW2 S; 5CKE A; 2PUK B; 1W2B P; 1VQ4 A; 2A36 A; 2DL8 A; 2EQI A; 2RHY A; 1ACM B; 2O2O A; 5KYW A; 2EKH A; 4J9C A; 5IH2 A; 1UFF A; 4R56 A; 4ATO A; 5FRN A; 2J7I A; 1WQW A; 1YN8 A; 3OSS C; 1Y71 A; 2LNV A; 5I21 A; 4BUG A; 1BIA A; 2FO0 A; 1G83 A; 4PNO A; 3T9N A; 2PQW A; 1VQ6 Q; 2KBT A; 1ZLM A; 3FRN A; 1LNX A; 1PSF A; 2KXD A; 5CKD A; 1KSW A; 4E7Z A; 3JCM Q; 3VS5 A; 1M1K U; 2YSQ A; 2L3S A; 1WHH A; 5KE3 A; 1JO8 A; 4HCK A; 4IUT A; 4OMO A; 5FWB A; 5GMK l; 4N4G A; 4XTV A; 3F70 A; 3NMZ C; 1PSE A; 3LYI A; 3VYG A; 3OYJ A; 3CCL T; 1QKX A; 1SPK A; 5CKH A; 2KNB B; 1G2B A; 1KFZ A; 1NPP A; 5HY6 A; 1JXO A; 1WZO A; 2H8H A; 2OI3 A; 4RTV A; 1UJY A; 5GAN 5; 2O9V A; 1C6V X; 2ZPG B; 3M9Q A; 1YI2 Q; 3MPU B; 3MP1 A; 2ZZD A; 4XTX A; 3QZ9 B; 4A63 B; 3VUB A; 1RAE B; 3LGL A; 2DVE A; 2MPX C; 2DIG A; 1K8A U; 3VYH B; 2Y4X A; 2M02 A; 5LJ5 g; 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