2YV9A

Crystal structure of the clic homologue exc-4 from c. elegans
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
285
structure length
285
Chain Sequence
AMAEAYQIQSNGDPQSKPLLELYVKASGIDARRIGADLFCQEFWMELYALYEIGVARVEVKTVNVNSEAFKKNFLGAQPPIMIEEEKELTYTDNREIEGRIFHLAKEFNVPLFEKDPSAEKRIENLYRNFKLFLRAKVEFDKGKKEPSRVEDLPAQIKVHYNRVCEQLSNIDQLLSERKSRYLLGNSMTEYDCELMPRLHHIRIIGLSLLGFDIPHNFTHLWAYILTAYRTAAFIESCPADQDIIHHYKEQMNLFTNQRETLQSPTKTHTIPEKVLSDIRVKGLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Comparison of vertebrate and invertebrate CLIC proteins: The crystal structures of Caenorhabditis elegans EXC-4 and Drosophila melanogaster DmCLIC
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
source organism Caenorhabditis elegans
molecule keywords Chloride intracellular channel exc-4
total genus 93
structure length 285
sequence length 285
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-04-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 2yv9A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2yv9A01
2VCWA 3TOUA 1KNGA 2PERA 5CAXA 1SK2A 2L5OA 1EGOA 3C1SA 1EOGA 1SL1B 2C1YA 2ZNMA 3LWAA 4LLRA 1PKWA 1M99A 4TXVA 4H86A 2PMTA 2WZ9A 12GSA 4HU9A 1W89A 4KCAA 1M2DA 1T8EB 1XWGA 5ID2A 4AF2A 3IK9A 4MPFA 1G7EA 1ILOA 3QCPA 4JE1A 4I6XA 2MYGA 5ENUA 2JACA 4XS6A 1UN2A 3PPUA 3GUSA 6GSSA 4EL1A 1X5CA 4DSQA 1SKRB 2IFQA 2CAQA 3GHAA 2HRFA 5ECHB 5IMFA 2VAFA 3IBHA 3BCIA 4TR1A 16GSA 1Q98A 3QDNA 2YNXA 1TU8A 4D73A 6GSYA 3TKSC 5DAKB 4MH2A 2HRKA 4EUYA 5IPHA 4DSSB 2GQLA 1N2AA 1U6TA 2DSAA 3ZMLA 1V9WA 4ZL7A 1T4YA 1XPVA 1O81A 1BAYA 1T4ZA 2MMOA 3DWVA 4ID0A 3OR5A 2AUVA 2A4VA 2OJLA 3F4TA 3GTUA 4QL9A 4F0BA 2H71A 4IBPA 2JZTA 3RPNA 2HI7A 3N9JA 2L4QA 3IC4A 2VCZA 5D9TA 3EC3A 2GSTA 1SL0B 3TJFA 1F3AA 1JZRA 2YN1A 4PXOA 1ZYQB 3V1WA 3ZFBA 3DYRA 2CZ3A 4YQVA 3HJOA 2H66A 2O89A 3CBUA 4PNFA 1TK0B 4ML1A 1B8XA 4O5RA 3KM6A 2B3SA 4E8EA 4IJIA 3O3TA 3FR6A 5CRHA 4FQUA 3KTBA 1PMTA 3APOA 2QC7A 2OKAA 3UVTA 1B48A 4FYUA 4ECJA 3C7MA 3HYPA 3TKQA 2QGVA 3N5OA 5F06A 3KEBA 1B9XC 1MD3A 3NZNA 3LYPA 1PL1A 5ELGA 2FHEA 3ME8A 1Z7RA 3TB2A 4I97A 3LYKA 2HSMA 2LTKA 3GFKA 3A2VA 5EVOA 2H75A 2RUEA 2LV3A 3DVXA 4K7NA 1EEJA 2WCIA 2X8GA 2C4JA 2DIZA 3LSZA 4MABA 4MJCA 3W8JA 1FHEA 3IE3A 2RIIA 5DQYA 2V41A 2O85A 2R3XA 1TP9A 2WS2A 5EL8A 4MLYA 5CP1A 1XW5A 1U3AA 2I81A 2F8FA 2GZYA 4FH8A 2KLXA 4X0XA 3EYTA 3PGTA 2K6VA 3H8QA 19GSA 3IPZA 2VLUA 5DDLA 3KJYA 3HD5A 4JEDA 4I2TA 2K8VA 3H1NA 2VCVA 5H5SA 3KGKA 4G0IA 1THXA 1AQWA 1V98A 5IMVA 4TKYA 5CRGA 2VL2C 1Z6NA 3ZREA 2XPDA 4I8BA 2WDUA 3HDCA 1OC8A 2M46A 2ZUPA 5CRWA 2VL3A 4J57E 1VGLA 4ACSA 1NHOA 3TDGA 4NV5A 1GUMA 5GAND 5B6MA 1MDKA 2B5XA 2H73A 1MEKA 3QAGA 5F0GA 5CRDA 3RAZA 1LU4A 1TU7A 2AB6A 5HR1A 2CVKA 5HFIA 2DMLA 4OFNA 3VWXA 5ECLB 2XC2A 3IV4A 4WBJA 5JCWA 1B4PA 3KP9A 1A0FA 2KUCA 5DJLA 2FUG2 2IPAA 2GSSA 4MJAA 5IIZA 2H0GA 3R3EA 1GNEA 2N5FA 2B7KA 2EIQA 3GSSA 3FR9A 3GX0A 1Z5YE 3H79A 2C0DA 3KIJA 4TN8A 1YDKA 3WD6A 1A2LA 3GNJA 4N30A 1V57A 1HNAA 6GSWA 3FYGA 2H72A 2HYXA 2YP6A 5F8BA 3SWLA 4GXZA 3IK7A 1ZZYA 1HQOA 3FZ9A 1OE8A 4KH7A 4RQRA 2EIOA 4EE0A 4K8MA 4N11A 4X1UA 5ID2B 1DSBA 2HRNA 4BVYA 4KDYA 2PPTA 3F9UA 3S9FA 2GQMA 3Q6OA 4HJMA 3UEMA 4ECCA 4NV2A 1GRXA 3D4MA 2HQTA 4XS1A 1GLQA 3GN3A 1SU9A 3QPMA 3F3RA 1SL2B 1XOAA 1FB6A 2H70A 3G7JA 4GLTA 3ED3A 5HFGA 1NM3A 1AAZA 2IMEA 1K0AA 1SK0A 1XWKA 4TR1B 2NPBA 4ML6A 4NWYA 4MF6A 2P0GA 2A2RA 4D73B 2HRKB 2KHPA 4V2LA 4ZL9A 3PH9A 1X5EA 4YQUA 2X8CA 4ZBAA 5ECPB 3FY7A 4ZB9A 1DBYA 2VD0A 1HYUA 2MZCA 3FZAA 3ZVJA 5ECOB 3IDVA 1F2EA 2GT6A 2DBCA 4PTSA 3ZIJA 4KB3A 4WXTA 3GTUB 5DJMA 4O92A 2DJ0A 1M7TA 4XS4A 1OC9A 1QMVA 4NHZA 1VF1A 2P5QA 5GSSA 4P3YB 3M9KA 5A5KA 4ZBDA 2AJQB 1O6JA 2HXKA 1BX9A 3L4NA 2P31A 2GTUA 2H0HA 1XVQA 1O8XA 2CVBA 5D9WA 2P5RA 3ZMKA 4POMA 3EWLA 5COHA 1AQVA 4EXJA 3F6DA 2H1AA 3LFLA 2B6MA 1A2MA 2V32A 1OE7A 1BYEA 4IW9A 3TKPA 5HQPA 4G0KA 1EEMA 3SBCA 1A8LA 2V1MA 5D8IA 3ERFA 1GNWA 2H6XA 2IMKA 4ZXGA 5IM9A 3VPQA 1GSFA 1GTUA 1G0TA 4BVXA 4GQFA 4MA9A 2CX3A 3QFBC 4WR5A 3WGEA 1PN9A 2YWIA 1A8YA 1JZDA 2C3TA 3GH6A 1Z7PA 5D73A 1QK8A 4MZBA 2B7JA 4OMVA 3L0HA 2HSMB 2NBSA 17GSA 4GF0A 3HVXA 3GMFA 2K8SA 1TKDB 22GSA 1X9MB 3D0ZA 3WGXA 1XW6A 5FWGA 3VWVA 2FWGA 1T3BA 1ZL9A 1ZCPA 4ZIJA 1EOHA 3G7YA 4OO4A 1SK1A 8GSSA 3DVWA 4XIHA 4POKA 1A2JA 2YZHA 2PVQA 4BWQA 1Z3EA 2B1KA 2IL3A 5IMDA 3I6AA 1ON4A 1FG4A 4JR4A 2B1LA 4YAVA 1J08A 2IN3A 3KMNA 4GRFA 3HVVA 1J0FA 2M72A 1F6MC 2O8VB 3M1GA 1LBKA 3QAVA 3ZLPA 1B4QA 4TXOA 2H19A 2ES7A 4JR6A 2H1BA 3HXSA 3P90A 4MJEA 1S3AA 1O7UA 5IMZA 4ZB6A 1GWCA 1OC3A 2FNOA 1MTCA 4KE3A 1OYJA 4TR0A 4HU7A 4TW5A 4F03A 2OACA 4CDOA 1O8WA 1TI3A 6GSXA 1MD4A 5KEJA 2YCDA 1USBA 2I4AA 2FWFA 1PQNA 3UJ1A 4LL1B 5KN0A 3GURA 1EV4A 4EKZA 2XBIA 2R37A 2YJHA 4LMVA 5J9CA 2LNSA 2R2JA 3FZ4A 3Q18A 2WJUA 3Q74A 3GKNA 1B9YC 1XOBA 2ALBA 4AJ6A 5DCGA 5D93A 2HSHA 4WF5A 3EMXA 2CZ2A 1XWCA 4WKWA 3GA4A 2DJ1A 1RQMA 3W8SA 4YH2A 2IWTA 1XWBA 4MP4A 3KMOA 1EZKA 1K3LA 4PGTA 1WPIA 4G0LA 3E0UA 1MDIA 3DGQA 5KN1A 1K0NA 3HZ4A 4F9ZA 1SYRA 3F4SA 5KN2A 1EV9A 3IHQA 4PUFC 2YZUA 1ZGNA 3GKKA 4KUNA 5AIVA 4J2FA 1K0OA 1TRSA 4ECBA 3L9SA 3CYNA 4ZILA 1T1VA 4HQSA 3GIXA 3WGDA 5EPFA 1IYHA 5J5NA 1AC1A 5JCUA 4I5QA 2QSIA 1YKCA 3PR8A 4GTUA 4OCEA 1WOUA 3VWWA 2OBIA 4BL7A 1BJXA 13GSA 4G10A 1YF1A 3M0FA 3A2XA 4F82A 1YZXA 4MPGA 4IJ3A 4NPBA 3HHVA 3GYKA 2KP1A 3TJBA 2C0FA 5CNWA 2CT6A 2YJ7A 5IQYA 3CSIA 2L6DA 4NAXA 4O32A 1WWJA 3TJKA 1GSQA 1TXXA 5C04A 4V1Ap 6GSUA 4AGSA 1EGRA 1FOVA 3D4TA 4L5LA 1SENA 3QMXA 3MWHA 3F6FA 3IR4A 5DALB 5F07A 3PINA 4OD7A 3VLNA 1K0CA 2HE3A 2LEGA 4XS4B 2K18A 1OC9B 3DXBA 1FB0A 1E6BA 1EP7A 5ECQB 2IMFA 6GSTA 4KGIA 4KDUA 2AAWA 3UBLA 1GLPA 4FIWA 4TR3A 1PX7A 3EU4A 1Z9HA 2H30A 2E7PA 5E59A 4USSA 4ULXA 3ZVJD 1BEDA 4XCSA 4JU5A 3QD9A 1T7PB 3IAM2 2JZRA 1SJZA 4E8HA 1DUGA 2FWEA 4TRXA 3TRPA 1YY7A 2E0QA 3ME7A 3ERGA 2LQQA 3HZ8A 2VCXA 5HR2A 11GSA 4DEJA 4IQAA 1Y25A 4ILFA 3DKSA 5J9BA 3TKSE 1SKWB 3IOSA 2DJ2A 2H8LA 1I9DA 1SYXA 2F3MA 3U5RE 2I1UA 3APSA 2TRXA 3FEUA 1E2YA 2VM1A 4OFMA 4V2NA 5IOWA 1X5DA 4BVXB 3CRTA 3LEFA 2F9SA 1FW1A 5FHIA 4WF4A 3RHCA 1VF4A 2VUPA 4MMMA 3TRQA 2JU5A 4G2EA 5IPGA 1WE0A 3F8UA 1WP0A 2AV4A 2L57A 2GGTA 2CVDA 3P8WA 3ZFLA 4V2MA 1SKSB 2LRNA 1PKZA 3DRNA 3HJMA 2CX4A 5AN1A 4EDZA 1R7HA 2MBSA 4KF9A 2X99A 5AIXA 1S3DA 3RPPA 4WR4A 3EMPA 1URMA 2GZPA 4NMUA 2YWMA 1OKDA 2H1DA 3BD2A 5EY6A 1JLVA 2IMDA 1LJRA 3IAS2 5IO2A 3TGZA 2X8HA 1G6WA 3KP8A 4IVFA 4K6XA 4RI7A 4EC0A 4TXOB 5G2ZA 2F8AA 2R6KA 3BCKA 3FK8A 1XIYA 2VM2A 4K1FA 4HS1A 1RW1A 3HVSA 3ZZXA 1QFNA 4MK3A 4LMWA 1M9BA 2M80A 2GZZA 2MBTA 4PURA 1QQ2A 1GTIA 4DVCA 1THOA 1F9MA 2HZEA 3U6VA 2LNTA 2ON5A 2G0FA 3IC8A 4K0NA 3NIVA 3TRXA 5AGYA 1ST9A 2IFQB 5D9VA 2VL9A 2D2ZA 4XRDA 4G9HA 4PQIA 1EP8A 2B5YA 4JRRA 1Q4JA 3LJRA 5A4WA 3HY2A 1AW9A 2C0EA 2FCHA 1C72A 1FVKA 1ABAA 5KN3A 3CSHA 3DIEA 1F3BA 3HA9A 2YV7A 4X43A 2GSQA 1GSUA 4YQMA 2L6CA 4YAPA 2PVOC 4I2UA 2DIYA 3A5WA 2VCQA 3UIWA 5IMAA 1G6YA 1XVWA 4IKHA 1TK5B 1WMJA 2YOIA 2HNLA 3BJ5A 3NOFA 4IN0A 5FT3A 2O87A 2DJKA 5ECKB 5IO0A 4HDEA 3GV1A 2N5AA 2HLSA 1ERVA 1ERWA 1TRWA 2QKEA 2MMNA 5LD0A 5JWQB 2L4CA 1GSEA 1JHBA 1FVJA 5B6NA 3TJGA 1U3IA 2BMXA 2GQKA 2HSNB 2FD3A 4GSTA 1XXUA 4FYBA 3FRCA 5D9XA 3JCML 4EDYA 4Q5FA 4L0WA 5INYA 5IMCA 1JLWA 4LL4B 2F51A 2VLTA 4L0UA 4BL7B 2X64A 3KH7A 3TOTA 4MH3A 2OADA 2C3QA 4N0ZA 1X0RA 3C73A 3GL5A 3GKXA 3EINA 1XWAA 1AXDA 3F0IA 1QGVA 1TI1A 2AHEA 4K2DA 4KDXA 5J4UA 1KTEA 3GX8A 4HQZA 2C8UA 1GL8A 1U88A 3VK9A 2LJAA 3GH9A 3IA1A 3DMLA 2LKUA 1XZOA 1PSQA 3TCOA 5AISA 3FW2A 3G7IA 3ISOA 4JBBA 2FA8A 4F0CA 2RUFA 2EC4A 3RDWA 4HZ2A 3F63A 4ZL8A 1WIKA 1JZWA 18GSA 1H4OA 2JSZA 3UBKA 4Q5NA 3C8EA 3MSZA 3O6TA 4BWSA 1SD9A 3CTFA 4HZ4A 2GDRA 2YANA 4V1Ag 5G31A 1A24A 1M2AA 4ISDA 1NW2A 3FHKA 4MDCA 4HOJA 2CAIA 2O7KA 3DEXA 1QUWA 1K0DA 1ML6A 4KAEA 5L71A 1VRSD 2LUSA 3M3MA 4N10A 3WYWA 4GQCA 2C0GA 1NHYA 4IS0A 3MDKA 4POLA 2AYTA 2EIRA 5G5FA 1TW9A 2HRAA 2R4VA 4POBA 4KSMA 2HFDA 3UVHA 3LGCA 1M0UA 1XBSA 2OBKA 1DE1A 2DJJA 5LNKe 3I69A 3GL3A 2WRTA 1K3OA 3VI5A 2IIYA 1J9BA 2H6YA 1VF3A 1Y6EA 2FY6A 2L5LA 1TK8B 2RM5A 2FWHA 2J9HA 3L78A 5JWRB 1Z6MA 3GRXA 1TTZA 1PGTA 5HFKA 3A2WA 3LORA 4NXIA 4FYCA 2GLRA 3ERWA 4EF0A 2V6KA 1VF2A 3DD3A 1OAZA 1YF0A 1AQXA 2TIRA 3UOMA 1YKAA 3BOAA 3FKFA 2CQ9A 1YEXA 4KW6A 4WBRD 3MNGA 1ZOFA 4MF5A 3TKSA 4EO3A 5ABRA 1ZYEA 2DJ3A 4PNGA 2VIMA 1AUCA 2GVPA 2CA8A 3D22A 3MAKA 1R5AA 5ELAA 4OFTA 4ZBBA 1WRYA 4KCEA 4N0VA 2YPMA 3US3A 3L9UA 3WT2A 2MMAA 5GAPD 5DQSA 2H0IA 4OO5A 4PQHA 5A4VA 4KSOA 5J3RA 3UL3A 2RM6A 4OWYA 2NVLA 4XHMA 2PWJA 4BA7A 5B7CA 4BVYB 6GSVA 2H76A 3E3EA 5E4WA 4ZB8A 4MF7A 2LJRA 1PRXA 1I5GA 2K9FA 3KD0A 2HZEB 2R5GA 2H6ZA 5B8AA 4AJ7A 1ERUA 1QXHA 4XTSA 4GSNA 3ZIVA 3EU3A 5D96A 3Q19A 4PQ1A 5BMUA 2LS5A 1UC7A 2WGRA 2JZSA 3UMAA 1OVNA 2VD1A 1HNCA 4ECIA 3GSTA 1V40A 2LJKA 4PUAA 3CRUA 2L59A 1RK4A 3D6IA 2JL4A 5HR0A 4FO5A 1T00A 1R4WA 2IJYA 3ZL5A 4TOPA 4Q5RA 1IYIA 4K9ZA 3I9V2 1ZMAA 1WJKA 1K0BA 1JFUA 1GH2A 1KBNA 4K7IA 3E9JB 3O76A 3ZITA 3VWUA 1R5PA 2I3YA 1TDIA 3LXTA 2PBJA 4PX1A 3ZYWA 1CQHA 1GTBA 1XW9A 3P2AA 1XCCA 3EURA 1EWXA 4L8EA 4CHSA 2V2GA 4KX4A 4CW9A 1AIUA 3H4KA 1PX6A 2FGXA 4MZWA 4DSRA 3KZQA 4GSSA 3LXZA 4OCFA 3P7XA 2VL2A 4RQXA 3J7Yb 4O7HA 3D5JA 1PD21 4KNDA 2XBQA 3J7Yk 2N5BA 1TJDA 3C71A 1HD2A 3VI7A 3QR6A 4IP6A 4HI7A 4F2IA 2JADA 2TRCP 2LQOA 2XHFA 1CQGA 4HUAA 2JSYA 1GSSA 4G19A 2IMIA 2LSTA 5HR3A 1TOFA 1OKTA 3IRAA 3RBTA 5DVBA 5DCHA 4QL7A 4IELA 1A23A 4WETA 1M2BA 5CO3A 3APQA 5A4UA 2WFCA 3CMIA 3M9JA 4IHUA 3IXRA 1UA5A 1O73A 5DAKA 4HEA2 1PA3A 4RI6A 14GSA 3M8NA 4DSSA 2OA7A 5ECIB 1GSDA 1G7OA 1R26A 3WT1A 3D21A 1DE2A 3EE2A 20GSA 2CV4A 2REMA 5JCGA 5H5RA 5GZZB 2DMMA 3KXOA 2NDOA 2PN8A 1U87A 1S3CA 3HKRA 2B5EA 1W4VA 2V6OA 1JZOA 4MCUA 2LRCA 1GULA 2FLSA 1TRVA 1M9AA 2GSRA 4IP1A 3W6GA 1NSWA 3FZ5A 1K0MA 3UAPA 4Z7XA 1ACVA 1PL2A 2Z9SA 4LA1A 5G30A 5G1KA 1YEPA 1SJ6A 4JZQA 2PU9C 4MZCA 3FR3A 5DBQA 1F37A 2HZFA 2KOKA 3QFAC 1YJ6A 5CREA 3L9VA 1X9WB 3I43A 2OE0A 1GUKA 1SD8A 2FA4A 1X9SB 3R2QA 4NHWA 2E2GA 3G9BA 1YQ1A 1GUHA 4BPYA 4IQ1A 1MDJA 2E2MA 4RUVA 5GSTA 9GSSA 2VO4A 2PUKC 7GSSA 2BJXA 3ZRDA 3F4RA 4GWRA 5ECNB 5DALA 2VLVA 1HNBA 4TR4A 2WULA 2DC5A 2LRTA 2YWNA 5J41A 1FAAA 2YWOA 1XFLA 2GS3A 2C3NA 3HJPA 1ERTA 4J56E 2GT5A 10GSA 3VFIA 2KP2A 2OE3A 2BTOT 1BQ7A 3K8NA 4XRAA 1FO5A 4WEYA 5IOXA 2DLXA 2G2QA 3UARA 3TJJA 4HJ2A 1GP1A 4K7OA 2NTOA 2WB9A 2UZ8A 5H5QA 3H93A 2PGTA 2VOCA 1TRUA 5ECRB 1UVZA 4K0GA 2RLIA 2H74A 3TKRA 1V58A 5ECMB 3A3TA 1SJIA 1O85A 4TVEA 3F3QA 4EVMA 2ZCTA 5CYYA 1KEBA 5G5EA 4IGJA 1V2AA 3KCMA 3VURA 3C1RA 3QAWA 5JWOB 2HT9A 3CTGA 2YV9A 4Q5QA 5F05A 4AJ8A 3BBYA 2I9HA 2HSYA 4L5OA 3ZTLA 1H75A 3CXGA 1N8JA 2MMZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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