2YWMA

Crystal structure of glutaredoxin-like protein from aquifex aeolicus
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
b'MLLNLDVRMQLKELAQKEFKEPVSIKLFSQAIGCESCQTAEELLKETVEVIGEAVGQDKIKLDIYSPFTHKEETEKYGVDRVPTIVIEGDKDYGIRYIGLPAGLEFTTLINGIFHVSQRKPQLSEKTLELLQVVDIPIEIWVFVTTSCGYCPSAAVMAWDFALANDYITSKVIDASENQDLAEQFQVVGVPKIVINKGVAEFVGAQPENAFLGYIMAVYEKLKREKEQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of glutaredoxin-like protein from Aquifex aeolicus
rcsb
molecule keywords Glutaredoxin-like protein
source organism Aquifex aeolicus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 76
structure length 228
sequence length 228
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13192 Thioredoxin_3 Thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ywmA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ywmA02
3ZYWA 5IMZA 1B9YC 4N0ZA 4ACSA 3HZ4A 1X5DA 5DAKA 4MJEA 4IKHA 3BBYA 2HZEA 1SJ6A 2M80A 3GRXA 2DBCA 5JWOB 4MF5A 2C4JA 2V6KA 3FKFA 4WR4A 3IDVA 4D73B 2H76A 3O6TA 2PBJA 1KBNA 1GUMA 1ML6A 4JEDA 17GSA 2D2ZA 4I6XA 5L71A 3QOUA 5ECKB 4Q5FA 4NV2A 1NSWA 2R3XA 2H6YA 4IJ3A 5ELGA 3GHAA 3MDKA 4IHUA 4BPYA 1FVKA 3Q18A 2IWTA 3RBTA 1B48A 3WYWA 1JZOA 4ZL8A 5J5NA 5GSSA 1NHOA 2F51A 3UJ1A 2C0GA 5CRWA 3VWXA 4N10A 4TR0A 3VWWA 2JU5A 2HSHA 5KN0A 5FHIA 3C71A 4POMA 1EGOA 4BVXA 4GLTA 2HRNA 4IQ1A 1K0MA 1HYUA 3GFKA 1DBYA 13GSA 5F0GA 4WF4A 5A4UA 2C80A 5DALB 5IQYA 2KLXA 2LRTA 5A4WA 2E2MA 4OO4A 4MZBA 4TXVA 3ZIJA 2RIIA 2L57A 3C8EA 2OACA 3TJBA 4WEYA 1TRUA 3DYRA 2L6DA 2RM6A 1GULA 1Z9HA 1XPVA 5DAKB 2HSYA 3GTUA 2IMDA 3GX0A 1M0UA 3OR5A 1AQVA 1GTIA 4O92A 3F3RA 1TP9A 4P3YB 2YN1A 4GF0A 6GSUA 3HHVA 2X64A 3BJ5A 3P8WA 1VF4A 2GT6A 2ZUPA 3WD6A 2C1YA 2DC5A 1TJDA 5F05A 3KH7A 1Z7PA 4MK3A 2L4QA 2DJJA 5CRGA 5AGYA 1JZRA 2YCDA 2LEGA 4XRDA 1GSUA 1MTCA 1T3BA 2A4VA 2P5QA 1X5CA 1WE0A 2DJ2A 2GZZA 1XZOA 2HT9A 4KUNA 2BJXA 4ZL9A 2WULA 1SKWB 4HJ2A 4F03A 3IHQA 2K18A 3UIWA 5J4UA 3L9SA 2H1DA 3VI7A 1V2AA 5IMFA 1A2JA 1TDIA 3CTFA 3HA9A 1XIYA 3BCKA 4POBA 3UARA 3WT1A 3IBHA 2HI7A 4HZ2A 5B7CA 4DEJA 2FUG2 1XWKA 5J3RA 1S3AA 5HFKA 1SD8A 3APSA 1WMJA 3FZ5A 4LLRA 1T1VA 1JZWA 1PSQA 4MF7A 3LWAA 4ULXA 2A2RA 2IPAA 4O32A 4OFNA 3CSJA 4OO5A 3IAM2 4HOJA 3FK8A 2ZNMA 5GSTA 1W4VA 2GSTA 2FWEA 1SK1A 3KCMA 3F63A 4LL1B 4KNDA 5ENUA 2JZRA 4WKWA 2CZ3A 3C1SA 1GSFA 1AQWA 1F3BA 2CT6A 3J7Yk 4K7NA 3EU3A 2CX4A 3A3TA 4I8BA 3A2VA 3ZL5A 5ELAA 4TR4A 4PGTA 1EOGA 2WJUA 2YOIA 1Q4JA 2GLRA 1SK2A 4ECCA 1Q98A 5DCGA 2PMTA 2FLSA 3N5OA 1ZGNA 3RHCA 2O87A 7GSSA 1K3OA 1ZMAA 2E0QA 2H0IA 1XBSA 2LQQA 1WPIA 5AISA 3P2AA 4Q5QA 4E8HA 3SWLA 2DJKA 1NM3A 3FYGA 3ZRDA 3QPMA 4EL1A 4WF5A 1B8XA 1Y6EA 4TR3A 5IMCA 3QFAC 3UL3A 3H79A 1X9MB 5G1KA 1XOBA 3Q74A 4HU9A 4PXOA 1B4QA 1Z6MA 5EPFA 2FCHA 1SL1B 5FT3A 2FGXA 2KUCA 2CAIA 3G7YA 1GSQA 1MEKA 2JSZA 3HJMA 5DJMA 4EUYA 2GVPA 2GSSA 2N5AA 3KP8A 1I9DA 3KMNA 4TR1A 1R26A 3EE2A 3I6AA 3ME8A 2JADA 3IE3A 2H6XA 1GTUA 2JZTA 4GCIA 4NHZA 1TW9A 4QL7A 1U3AA 1AC1A 2LUSA 4LA1A 3JCML 3GSTA 3IR4A 3WGDA 2H71A 1TKDB 3Q6OA 2PU9C 2VLUA 1FG4A 1SJZA 3RPNA 4K7IA 2LTKA 2HLSA 5GZZB 1URMA 3HVSA 3D6IA 3I43A 3GURA 5GAND 4GSTA 4Q5RA 3G7IA 5JWQB 1WOUA 3IOSA 2LS5A 5CRHA 6GSTA 1Z3EA 4IVFA 1GLPA 2OBIA 2J9HA 8GSSA 2GDRA 1V40A 3A2XA 3D0ZA 3US3A 2H1GA 4EE0A 4IP1A 5EL8A 2YNXA 3EWLA 5G31A 1OYJA 1YQ1A 1B9XC 4ML1A 4ZIJA 2IIYA 3RAZA 1ZCPA 2R5GA 3N9JA 2RUFA 4XS1A 3LG6A 1TRWA 4HDEA 1T4ZA 2RM5A 3HYPA 4IP6A 3VPQA 2K6VA 3L9UA 4FYBA 2F8FA 1CQGA 1U88A 2FY6A 2OA7A 2GZPA 1SJIA 2BMXA 3UVHA 1G6YA 1NHYA 3LXZA 3EYTA 4IW9A 2RUEA 1QMVA 5E4WA 1CQHA 4IS0A 2H75A 4KDXA 1BYEA 4H86A 4ZXGA 2DIZA 3KTBA 1XFLA 3LSZA 1A24A 1A2LA 3FR6A 1KTEA 3LGCA 3VI5A 3F4TA 1LU4A 5A4VA 2GSQA 1GUHA 3F3QA 5ECQB 1B4PA 3M9KA 1AAZA 1VF2A 2IN3A 1FO5A 1X9WB 3KD0A 5ECPB 4X0XA 1JFUA 4TR1B 5JCUA 3GN3A 3G9BA 3TRQA 4ZB9A 1FVJA 3GSSA 3F6DA 2I3YA 2AHEA 1KNGA 2X99A 5J9CA 5G5FA 3L78A 1EV9A 3DVXA 3PINA 4LMWA 5DALA 3U6VA 5AN1A 1T8EB 2V32A 5HFIA 2PERA 3IAS2 4CW9A 4PUAA 2OJLA 3TDGA 4KAEA 4I97A 1VF1A 1TI1A 2HE3A 2NPBA 2LV3A 4V2LA 4TW5A 4AJ6A 3EU4A 2C0FA 3CTGA 5CNWA 1PL1A 4G2EA 2FNOA 2OE0A 1QGVA 4DSSB 2E2GA 3M3MA 5B6NA 2PVOC 2TRCP 2I81A 2LSTA 2L4CA 1G0TA 3CSHA 3IA1A 1PD21 2AJQB 1RQMA 3I69A 1AIUA 2DJ1A 2WCIA 4K6XA 1ERWA 1PN9A 2H30A 4HQSA 4PQIA 5ID2A 3RPPA 4YQMA 2N5FA 2WB9A 2YPMA 4BL7A 3HZ8A 1GLQA 4L5OA 1AQXA 4EVMA 3A5WA 5DDLA 3ZITA 3P7XA 1JZDA 2KP1A 3KJYA 3CYNA 1S3CA 3DEXA 5IPHA 1O8WA 3QAWA 1R5AA 2H0GA 2DLXA 3APOA 3W8SA 1O73A 5IMAA 3E3EA 1K3LA 1K3YA 2YZUA 4CDOA 1PL2A 1ZOFA 1A2MA 5HR1A 5JCWA 4JR4A 5EVOA 4CHSA 1TK8B 1DUGA 2P31A 4ECJA 1ERVA 2YV7A 3VPTA 2PN8A 2MMAA 3ZMLA 3PR8A 4FIWA 4RQRA 3KMOA 3MWHA 1FW1A 2C8UA 2OE1A 4MF6A 4GSNA 2VO4A 1RK4A 1K0CA 3ZLPA 4I2TA 10GSA 1O6JA 2H1BA 2MZCA 5B8BA 3C7MA 3CMIA 4ISDA 4DVCA 2RLIA 4MMMA 1WRYA 2M72A 2X8CA 4F2IA 1ERTA 1WJKA 2AV4A 4N0VA 3I9V2 1SYRA 1OC3A 1X5EA 2AYTA 5ECMB 2VLVA 3DRNA 2HFDA 3F0IA 4I5QA 1IYIA 4V1Ap 3S9FA 2F8AA 3VWUA 3CXGA 2B7JA 5IMVA 1A0RP 1O81A 3IK7A 4F0CA 4JR6A 3FRCA 2H19A 4KSOA 5ID2B 2L59A 1HQOA 5F06A 2B5YA 1EZKA 2DJ0A 4TOPA 2B6MA 3VFIA 2JSYA 2F9SA 3WGEA 4OCEA 1GH2A 5CRDA 4TKYA 2CV4A 3KM6A 3HJOA 3GKMA 3DVWA 5B6MA 4GSSA 1OC8A 2NVLA 4E8EA 4MZWA 2DSAA 2J23A 3KZQA 4OMVA 4ZBBA 1C72A 4KX4A 1K0AA 3BD2A 6GSVA 1U87A 5F8BA 4TVEA 3ME7A 1K0BA 1U3IA 4O5RA 4XTSA 1EEMA 5D9WA 3ERGA 3H93A 3G7JA 2I4AA 1ZZYA 2REMA 1G7EA 4MJBA 5DQSA 1M7TA 3K8NA 3ZFLA 3UBLA 5DJLA 1AUCA 1O7UA 3AY8A 3VK9A 2PGTA 5IIZA 3FY7A 2C3QA 3FHKA 2FWHA 2E7PA 3ZVJD 3ZZXA 2LNTA 1XVWA 2YWNA 1R4WA 1UA5A 1U6TA 3MAKA 1G7OA 5C04A 4O7HA 1V98A 1V9WA 1LBKA 4HQZA 2PPTA 5ABRA 2KHPA 4N30A 2LQOA 2C3NA 3LXTA 1OKDA 1Y25A 4TN8A 3TOTA 3TJFA 1WWJA 4IELA 1TRVA 3UEMA 3LFLA 2PVQA 3ED3A 2VCVA 1RW1A 4PNGA 5D96A 2H01A 4PX1A 4EC0A 3QAGA 4AGSA 5ECIB 1MDJA 1DSBA 1N8JA 4OFMA 2VD0A 1M2AA 1F9MA 2EIRA 6GSYA 2H1AA 3BOAA 1WP0A 2H73A 3F4SA 1GNEA 2VUPA 2LJKA 3GIXA 2QC7A 1PA3A 3TKQA 3RHBA 1F37A 1XWBA 3IK9A 5J41A 2A2SA 1NW2A 1EV4A 1BG5A 2XBIA 3ZTLA 3P90A 3V1WA 2EIQA 1TOFA 3MSZA 2CVBA 1XWAA 3BCIA 1HD2A 3VURA 2FWGA 1XVQA 2ALBA 2C3TA 2O89A 4IQAA 2R6KA 2WFCA 2VCWA 4MH3A 22GSA 3IV4A 2VIMA 3GL5A 3ZIVA 2VL2C 3UAPA 1AXDA 2IMEA 2QKEA 1GNWA 4K9ZA 4KCAA 2CQ9A 4ECIA 4J57E 2GSRA 2VOCA 4NMUA 3FEUA 1HNCA 1FB6A 4GTUA 2XHFA 1SENA 3ISOA 3QR6A 3FR9A 1YY7A 2LJRA 5IO2A 4DSSA 4QL9A 3H8QA 1V57A 1PKZA 4BWSA 2O85A 1YF1A 1K0NA 1K0OA 1EWXA 2AB6A 4HS1A 4K7OA 4YAPA 2YWIA 1M2BA 1MDIA 1QFNA 4MH2A 1Z6NA 3EMPA 4L5LA 1ON4A 2R2JA 4K8MA 2MBTA 1ILOA 1SK0A 3ZMKA 1EP7A 2EIOA 3W6GA 4MJCA 2WZ9A 3M9JA 2HZFA 1TU8A 2TIRA 3ZVJA 4MJAA 3L4NA 3QAVA 1OE8A 3WGXA 1UC7A 2NTOA 3LORA 1GTBA 1YDKA 5D9TA 2FHEA 2YJHA 4G9HA 1ZYEA 3CSIA 2X8HA 2OBKA 19GSA 3EVIA 4NV5A 1ST9A 4TXOA 2GQKA 3TJKA 2MMOA 1F6MC 3CRTA 4FO5A 4FYCA 3QDNA 3FZ9A 4MABA 3TUEA 2LJAA 1AW9A 2GGTA 2IFQA 2ON5A 1TU7A 1MD3A 3GKKA 3IXRA 2HNLA 5G5EA 2GS3A 4K0NA 5CREA 1SYXA 2VCQA 4XS4A 3Q19A 4BA7A 1JHBA 1THXA 1PX6A 4ZBAA 4J2FA 3TGZA 5AIVA 2NBSA 2FA4A 5G1LA 5CAXA 11GSA 2LRCA 4FYUA 4IJIA 12GSA 5LD0A 2H70A 1TK5B 1OE7A 3TB2A 3DD3A 1LJRA 1VGLA 3KGKA 3ZFBA 3LEFA 3SBCA 3PH9A 2CAQA 3GKXA 1TI3A 1HNBA 2VL2A 4ZB6A 1YZXA 3F6FA 4LL4B 6GSSA 2YV9A 1YKCA 2LNSA 2B5EA 2H72A 4L0WA 1GSDA 1G6WA 3RDWA 2IJYA 2XPEA 3FZ4A 3LJRA 2L6CA 5ECHB 1FB0A 2JL4A 4NAXA 3QD9A 4ILFA 5LNKe 4MPFA 3M1GA 5G30A 5G2ZA 2WDUA 2L5LA 3HXSA 1OC9A 2B1LA 3UVTA 1X9SB 3IC4A 2YANA 1J0FA 4ZL7A 3APQA 4GRFA 1R5PA 3HD5A 4V2MA 1QQ2A 2VL9A 3GV1A 20GSA 1TRSA 4EDZA 4IBPA 2R37A 5INYA 4GQFA 5ECNB 2VAFA 1EGRA 1Z7RA 4NXIA 1EEJA 4TXOB 1GRXA 1BJXA 3L0HA 1SU9A 3MNGA 1E6BA 4HU7A 4MLYA 3E0UA 3U5RE 3DMLA 2V2GA 1USBA 4EKZA 2IFQB 5FWGA 4XIHA 3TKSE 3EURA 3HDCA 3VWVA 3DKSA 4RI6A 1M2DA 4F82A 4XCSA 1QK8A 3HVXA 3NZNA 1F2EA 3LYPA 5F07A 3UBKA 5ECRB 1BX9A 1R7HA 1THOA 4KB3A 4XS4B 3FZAA 3C73A 2NDOA 1QXHA 1FHEA 1H4OA 4WBJA 3J7Yb 1MD4A 4Z7XA 1GUKA 4K2DA 3QCPA 5DCHA 4RUVA 4AJ8A 3A2WA 4GQCA 2H6ZA 1DE2A 2CZ2A 3H4KA 3F4RA 1BQ7A 2PWJA 2IMIA 2IMKA 5CYYA 5H5SA 3GMFA 3GH6A 2ON7A 5IOXA 1UN2A 3CBUA 4RI7A 4N11A 2YP6A 3KTLA 2C0EA 3TKPA 1ZL9A 3IPZA 1T4YA 1GSYA 1HNAA 2Z9SA 2WGRA 3TOUA 3GH9A 5IOWA 4EXJA 2C0DA 4K1FA 1OKTA 1SKRB 2HXKA 2HZEB 4EO3A 2OADA 2QSIA 4HI7A 1XW5A 3KH9A 1A23A 1TTZA 5H5RA 4MA9A 3NIVA 4WXTA 5IM9A 16GSA 3DIEA 1PX7A 1KEBA 3UOMA 4AJ7A 1WIKA 2G2QA 4HUAA 1OC9B 4YQVA 2B7KA 2OE3A 1FOVA 3DGQA 3HVVA 4V2NA 4KE3A 3M0FA 2OKAA 4KDUA 5DQYA 1XOAA 1X0RA 1K0DA 5C00A 3KP9A 1OAZA 3TKSC 2VCTA 3C1RA 4F9ZA 18GSA 1PKWA 3TJJA 1GP1A 2B3SA 4KCEA 1GSSA 3NOFA 1XWCA 2VL3A 4BWQA 1A8LA 4PURA 2O7KA 4PUFC 3D4MA 4GXZA 4YH2A 5KN2A 1H75A 1PRXA 4MCUA 2VM1A 1BEDA 1JLVA 2HRFA 4GWRA 5ECLB 5AIXA 4NPBA 2XC2A 4G19A 4OWYA 4V1Ag 1O8XA 2WRTA 5B8AA 4KW6A 1Z5YE 3R2QA 4KGIA 1ZYQB 1VF3A 1PGTA 4Q5NA 1YKAA 3DXBA 5D9VA 4YAVA 2GQMA 5DBQA 2DMMA 3KEBA 5GAPD 2IL3A 3DWVA 2WS2A 2MYGA 3HCZA 4L8EA 5DVBA 1DE1A 2V1MA 2MMZA 1W89A 3UMAA 1EOHA 4JZQA 6GSXA 1M99A 3PGTA 4X43A 2MMNA 2XPDA 1J08A 3L9VA 1QUWA 4POLA 2GQLA 2ZCTA 3W8JA 5JWRB 2K8VA 3D21A 4X1UA 1SL0B 4TRXA 3D5JA 5HQPA 4IN0A 5EY6A 5HR3A 2HYXA 3M8NA 3GTUB 2I9HA 5KN3A 2V6OA 4L0UA 2YZHA 4YQUA 5A5KA 3GL3A 2B1KA 3FR3A 2VM2A 1PMTA 1S3DA 2CVKA 2M46A 3D4TA 1GWCA 3E9JB 1MDKA 5CO3A 1SKSB 1I5GA 2VLTA 2H0HA 2YWMA 5J9BA 3O76A 3GKNA 1TXXA 2QGVA 1XXUA 1F3AA 6GSWA 2JZSA 1PQNA 4OFTA 2YWOA 4G10A 3IRAA 2TRXA 4MDCA 3QFBC 2V41A 4DSQA 1EP8A 3HKRA 3LQ7A 5E59A 1UVZA 2CVDA 2ES7A 3EC3A 3ERFA 2VD1A 3F9UA 3TKSA 4NWYA 2LKUA 5D93A 4AF2A 3TRPA 3VLNA 1M9BA 5HR2A 3LYKA 4FH8A 9GSSA 2AAWA 4JBBA 2DMLA 4NHWA 5D73A 3O3TA 2MBSA 2R4VA 2H8LA 3H1NA 2DIYA 1GTAA 5COHA 4QQ7A 3KXOA 4HEA2 4EF0A 3F8UA 5IO0A 4OCFA 1A0FA 1M9AA 4MZCA 4WETA 2DJ3A 3GNJA 5H5QA 2GT5A 4RQXA 1YEPA 2FWFA 5LCZA 4KDYA 1GL8A 1ACVA 5ECSA 2JACA 5KN1A 2XBQA 4MP4A 5HR0A 14GSA 2L5OA 3HJPA 2CX3A 3TCOA 1SD9A 2KP2A 2O8VB 1IYHA 4JE1A 3HY2A 1JLWA 3TRXA 4LMVA 4D73A 3D22A 2FD3A 3GA4A 3CRUA 3EINA 2EC4A 2H74A 1ABAA 2LRNA 4K0GA 2KOKA 1E2YA 4XRAA 2F3MA 2PUKC 5JCGA 4BVYA 4ZILA 4ZB8A 2GTUA 2H66A 1GSEA 1YF0A 1O85A 2YJ7A 2GZYA 1OVNA 1ERUA 1T00A 2K9FA 4KH7A 4XHMA 2P0GA 4MPGA 1A8YA 4KSMA 1FAAA 4WR5A 4PNFA 3FW2A 1BAYA 3ERWA 4DSRA 2P5RA 4I2UA 4PQ1A 5CP1A 4JRRA 2K8SA 4WBRD 3TKRA 4F0BA 4JU5A 1XW9A 1T7PB 2G0FA 3GYKA 4XS6A 1TK0B 2AUVA 3ZREA 4ID0A 3EMXA 4PQHA 1YJ6A 2BTOT 2N5BA 1XWGA 5IPGA 4HZ4A 1VRSD 2VCZA 1N2AA 4ECBA 2CA8A 5IMDA 4IGJA 5HFGA 2B5XA 3KIJA 3GX8A 4ML6A 3TJGA 4POKA 1XW6A 5ECOB 5D8IA 3QMXA 5KEJA 4J56E 1J9BA 2VCXA 2I1UA 1XCCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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