2YWNA

Crystal structure of peroxiredoxin-like protein from sulfolobus tokodaii
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
157
structure length
150
Chain Sequence
b'GHMVEIGELAPDFELPDTELKKVKLSALKGKVVVLAFYPAAFTQVFRDSMAKFNQVNAVVLGISVDPPFSNKAFKEHNKLNFTILSDYNREVVKKYNVAWEFPALPGYVLAKRAVFVIDKEGKVRYKWVSDDPTKEPPYDEIEKVVKSLS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of peroxiredoxin-like protein from Sulfolobus tokodaii
rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-like protein
source organism Sulfolobus tokodaii
molecule tags Oxidoreductase
total genus 43
structure length 150
sequence length 157
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ywnA00
3L9VA 4EL1A 3FZ4A 4LMVA 2B5EA 3FYGA 3LYKA 4JU5A 2H6YA 1GSYA 4CHSA 4PUFC 5D9WA 2VUPA 3EVIA 4HZ4A 3O6TA 2GT6A 3HJMA 4MPGA 2VO4A 1Z6MA 5DALB 2LV3A 3QAGA 1F2EA 1BQ7A 3KTLA 2H76A 4POLA 1M2DA 3US3A 2GZYA 4F9ZA 1JZDA 2C3QA 5AISA 2YV9A 3ZYWA 2TIRA 4NV2A 2B5YA 5HFGA 1XZOA 3ME8A 1A0RP 1WRYA 4GQFA 1JZOA 2QSIA 4HJMA 3LYPA 1TRWA 2FGXA 2MMOA 2V1MA 2ON5A 2H19A 4ZIJA 3TKRA 1ABAA 2LRNA 1GSUA 1TDIA 3G9BA 3EC3A 3IRAA 3QD9A 3EWLA 3WD6A 3FEUA 4V2LA 4I6XA 1O7UA 5H5SA 4K7OA 5CRWA 1WWJA 4TW5A 2DJ2A 3NZNA 1A8LA 4NAXA 2QKEA 2NBSA 3RAZA 3TRQA 4ECCA 1SKSB 5E59A 3MSZA 1GLQA 1M7TA 1AAZA 3UBLA 4ISDA 1OYJA 2RUEA 3IAS2 1V2AA 5EY6A 4ZILA 2IL3A 5F05A 4ZBBA 3HCZA 1XWAA 4E8EA 3IAM2 3E0UA 5DJMA 4F2IA 4PQIA 2HLSA 3I69A 3LQ7A 3HVSA 1GNEA 4YQVA 3LEFA 4LMWA 1JFUA 5DDLA 5A5KA 1FB0A 5INYA 3ZIJA 1ZCPA 4O5RA 2IWTA 3SBCA 2YWNA 4HI7A 2OJLA 3KTBA 3M9KA 2X8HA 1AQWA 4G10A 1Q98A 12GSA 2WS2A 1UC7A 3RDWA 3NOFA 2O8VB 1F6MC 4Q5QA 3MAKA 4KDYA 2CZ2A 5G5EA 4QL7A 4YAPA 2IFQB 2VLUA 1U6TA 4GSTA 5G30A 3RPNA 4TR4A 3GL3A 1AUCA 4MH2A 2CAIA 4FYBA 5ID2B 2AHEA 2AUVA 3IK9A 1GULA 1EV9A 2FWGA 2CT6A 3M9JA 1HD2A 1I9DA 2H73A 2BJXA 3QMXA 3FZAA 2DIZA 3F4TA 3KMNA 1GSQA 3ZZXA 4EVMA 1ZGNA 2C0FA 4DSSB 4H86A 2V6OA 4GTUA 2V2GA 4HEA2 3JCML 2H1DA 4XS4B 5FWGA 2JADA 2LJAA 2WDUA 4KCAA 3EE2A 4MLYA 4I8BA 19GSA 3RPPA 4WF4A 1K0DA 1X5CA 1AQXA 1KEBA 3TB2A 5IPHA 1EP7A 3VWVA 1R26A 5J4UA 1G7OA 1M99A 4O32A 5IMFA 5IM9A 1LBKA 3DD3A 3IOSA 2YV7A 1A2MA 2WB9A 2H0HA 4KCEA 2B3SA 4KSMA 4HDEA 4XS6A 2L4QA 3BBYA 22GSA 4XCSA 3RBTA 3IDVA 5HQPA 4J56E 1YEPA 3ERWA 3U6VA 4F0CA 1I5GA 3O76A 1GL8A 1YJ6A 3F6FA 3F63A 2F9SA 4EKZA 2JACA 3EURA 4TR3A 4OCFA 3M0FA 5KEJA 5ECPB 1ZL9A 2YWIA 2O89A 2ES7A 1K3LA 2WCIA 3TJFA 1B4QA 3FZ9A 4PQHA 3GHAA 1ERUA 5E4WA 3SWLA 3L0HA 2GSRA 1T1VA 1T4YA 4K6XA 4I2UA 5ECLB 4TR1B 4IELA 4TN8A 4JR6A 4NHZA 14GSA 4GF0A 1ACVA 4EE0A 1N8JA 4XIHA 4DEJA 4IQ1A 2LRTA 2LSTA 5L71A 4X0XA 2LJRA 2MMNA 1BEDA 1WJKA 2N5BA 3KD0A 3F4SA 3G7YA 4AGSA 1G0TA 2JSZA 4TOPA 1GP1A 2HI7A 2LUSA 2DC5A 4IHUA 1S3DA 1WMJA 5DAKA 3PINA 3UARA 1J0FA 5GAND 1X9MB 5G5FA 5EL8A 2AAWA 4BWQA 2JZSA 3BJ5A 8GSSA 4Q5FA 5DCGA 1GH2A 1PX6A 2GVPA 1EOGA 5J9BA 5A4WA 4E8HA 4XRDA 4ZXGA 1YKCA 2GZPA 5KN1A 2F8FA 3IHQA 2MBSA 2L6DA 2M46A 1YZXA 1XW6A 2OA7A 2VAFA 3VWWA 1NSWA 3H79A 2G2QA 4QQ7A 1XBSA 2V32A 1EWXA 1XCCA 2N5FA 1DE1A 1RK4A 2CAQA 3HHVA 1E6BA 3QAVA 3BCIA 3VI7A 2KLXA 2YANA 1XVWA 4IKHA 4WETA 3M8NA 2EIRA 1K3OA 3FHKA 4EUYA 3GH6A 3LWAA 4EDYA 4X1UA 4AF2A 4HQSA 5J5NA 3J7Yk 4N0ZA 3GNJA 1W89A 3PH9A 4RI6A 1YF0A 2GQKA 2JSYA 2K18A 5IMVA 1M0UA 1PD21 1K0MA 3GRXA 6GSWA 2FWEA 4N30A 4FYCA 3A3TA 1U87A 3GSTA 2F8AA 3FKFA 2FHEA 3H93A 2K8VA 3QAWA 5DALA 5CAXA 1JZWA 1CQGA 3DWVA 1G6YA 1TTZA 4EC0A 2XBIA 2VCTA 2HT9A 4HUAA 1FAAA 4EO3A 2LS5A 1A2LA 4TXOA 2OADA 2VCVA 2D2ZA 3C8EA 5EVOA 3F0IA 1XVQA 2B1KA 1FVJA 4P3YB 1MTCA 4LL1B 1XWBA 3MWHA 2H1AA 1R4WA 1TI3A 2I9HA 2K8SA 3L4NA 4KE3A 3UEMA 4WXTA 1MDIA 3KJYA 4JR4A 3GV1A 2VCWA 2JL4A 9GSSA 2YCDA 1B4PA 2GT5A 1YY7A 3GX0A 2REMA 1PX7A 3D0ZA 3TKQA 1F3BA 4KDXA 3U5RE 4ZL9A 2E7PA 1HYUA 3Q18A 20GSA 1TRUA 2LKUA 1RQMA 1VF2A 2NVLA 3FRCA 5G1LA 5A4VA 4I97A 1GTBA 3ZIVA 6GSSA 1TOFA 2AV4A 3P8WA 3W8JA 4ZB8A 2WFCA 1V9WA 1AQVA 3CXGA 4ILFA 1YEXA 3VPQA 2H71A 4MJEA 4YQUA 5IMZA 4MDCA 2WJUA 3D4TA 1OE8A 2IFQA 2OACA 1ZOFA 3GUSA 5HR1A 3TDGA 3TKSE 4BVXA 1O8XA 3HD5A 2PGTA 4Q5RA 4MABA 5ID2A 4IN0A 3KP8A 1SL0B 4TXOB 1BYEA 16GSA 3PR8A 4JZQA 3HZ8A 2DMLA 2H72A 2OE3A 1B48A 4N11A 5H5QA 5G2ZA 1JLVA 2VCQA 5DCHA 3ERFA 1HNCA 2YJ7A 2NTOA 3GX8A 4GLTA 4KA0A 5CRHA 1EV4A 3LJRA 4JRRA 1PRXA 5D96A 4DSSA 1X5DA 3CRTA 4OO4A 2GZZA 4WR5A 1HNAA 3IC4A 4XS4A 3Q74A 1NM3A 1HNBA 2KHPA 3C1RA 3DKSA 1YQ1A 4IJIA 3VFIA 3L9SA 4WBJA 4ZB6A 1FB6A 3F9UA 2C3NA 3BD2A 2X99A 1GWCA 1USBA 4KGIA 5IMAA 4L8EA 1WOUA 1V57A 2IJYA 1VF3A 2YWOA 5D9TA 4ZBDA 3OR5A 3UOMA 1M2BA 3FY7A 3BCKA 4POBA 3QDNA 1R5PA 3LORA 3RHCA 1X9SB 5LNKe 3L9UA 4MZBA 3TUEA 3HVVA 1G7EA 2I4AA 4OO5A 4HU7A 1XW5A 4GQCA 4GXZA 4AJ7A 1SYXA 2A4VA 1VRSD 1X9WB 3LGCA 2H8LA 3I43A 2H0GA 1TK5B 2VL9A 3GKNA 3Q19A 5D73A 1TU8A 1TW9A 3DIEA 1VF4A 4POMA 3ZVJD 2YNXA 3I9V2 4TRXA 2ON7A 3W8SA 1U3AA 3VWUA 3UJ1A 2IMDA 1ZMAA 1DE2A 2H1GA 2GQMA 4GWRA 2VM1A 2OE1A 1T00A 1GNWA 3VI5A 1TI1A 1GUKA 4YAVA 4BWSA 4PURA 3FR3A 2HNLA 4TR1A 10GSA 2CVKA 5DVBA 1O81A 1MEKA 5H5RA 1R7HA 1DUGA 2WRTA 1JLWA 1OC9B 2WULA 4DSRA 2I81A 1PMTA 2BMXA 4K7NA 3LFLA 3QOUA 2CVDA 2DJ3A 3TOUA 2O85A 4CW9A 1OC3A 2BTOT 4KX4A 3VWXA 2LQQA 2YWMA 4WEYA 5FHIA 2HRFA 3KEBA 3P2AA 4FYUA 4IQAA 2LNSA 1EZKA 2GSTA 1BG5A 2B7JA 3WT2A 4MK3A 4MZCA 1MDKA 4BPYA 4XHMA 4NV5A 5HR3A 2H70A 4EDZA 2C0EA 5FT3A 2A2SA 2VL2C 1ON4A 1TK8B 2IMEA 3UAPA 3DEXA 4NMUA 4KW6A 2K9FA 4N10A 2A2RA 2DJJA 1UA5A 3IXRA 2JZRA 1FO5A 1S3CA 1S3AA 2V6KA 2WZ9A 6GSVA 1TRSA 3HA9A 2H75A 2CX4A 6GSTA 2IPAA 3F4RA 4JE1A 2MMZA 2VOCA 4YH2A 3R2QA 1C72A 5F06A 3ZVJA 4MP4A 5GSTA 3C71A 2DMMA 4IBPA 4O92A 5ECOB 2EIQA 3DVWA 1FG4A 2WGRA 4FO5A 1Y6EA 1K0OA 1TKDB 3ME7A 1R5AA 1GUHA 1Z9HA 3BOAA 3TOTA 3TJGA 2MYGA 4TKYA 3GTUB 4PX1A 3TRXA 1UVZA 1Y25A 1DBYA 4NHWA 2DJKA 1FOVA 4MJCA 1XIYA 1AXDA 3M3MA 2I3YA 5J3RA 3KCMA 4V2MA 1W4VA 4L0UA 4OD7A 2EC4A 1SD8A 2HSYA 2HE3A 4JBBA 1QUWA 1SL1B 2VCXA 3KGKA 4XS1A 2FD3A 3CSIA 3ERGA 1QGVA 1URMA 3GKMA 1IYIA 2L57A 3V1WA 2LQOA 1FW1A 1PQNA 2QC7A 1V58A 3LXZA 4V1Ag 5LCZA 2FA8A 5HFIA 2F3MA 4IVFA 2H0IA 4K0NA 3DRNA 2RM6A 1PL2A 1BAYA 4PNFA 5JCGA 5JWOB 1QK8A 5COHA 3HXSA 3QR6A 1ML6A 3TKSC 1SKRB 4OWYA 2B5XA 3D21A 3FR6A 4TR0A 4EF0A 1EEJA 4PNGA 1NHYA 5IQYA 1B9YC 1N2AA 4KDUA 2VL2A 4PQ1A 2YJHA 3O3TA 2PMTA 18GSA 5JWQB 4MH3A 3CRUA 5CREA 3E3EA 5IMDA 4GCIA 5J9CA 2B1LA 3N5OA 4X43A 4PXOA 2H74A 1NHOA 1QFNA 4K0GA 1JZRA 2C3TA 1K0BA 1WIKA 3GSSA 2N5AA 3IBHA 3ZREA 1AC1A 3D6IA 1YKAA 3FR9A 4MF7A 3LG6A 4IS0A 1YF1A 4ML1A 1Z3EA 2DLXA 3TGZA 2GS3A 5EPFA 2FCHA 2NPBA 2XC2A 4MCUA 3VLNA 3C73A 5CNWA 4BA7A 5JCWA 5GAPD 2JZTA 1JHBA 2L59A 2R4VA 2E0QA 1XOBA 5CO3A 4CDOA 4MA9A 1TK0B 5KN3A 5DQYA 3GH9A 2PERA 4ECJA 3CBUA 2GTUA 4GSNA 2GSQA 5ECRB 3EU4A 2R6KA 2B7KA 2M72A 2GDRA 2XPEA 3WT1A 4PUAA 4YQMA 1Z5YE 4KAEA 2P5RA 4HQZA 5IO2A 5ELGA 2H1BA 4OMVA 4JEDA 2NDOA 3HY2A 5B6MA 5ECKB 3GN3A 1XWKA 1H4OA 4D73B 4RUVA 4HS1A 2IMFA 1X0RA 5ECQB 2R3XA 5LD0A 3QFBC 4I2TA 4K1FA 2FLSA 1Z7PA 5IIZA 1EGOA 1PA3A 1U3IA 1GTIA 1SL2B 5ECHB 1PKWA 1A24A 4GRFA 4RQRA 2YZUA 1GTAA 5D9XA 3P7XA 1QMVA 1X5EA 2PVQA 5B6NA 3Q6OA 3ZMLA 1GSEA 1QQ2A 2H01A 3F8UA 3A2XA 2OE0A 2IMKA 3TKSA 4IP6A 5GZZB 1PGTA 2B6MA 4BL7A 2H6ZA 4WBRD 3KP9A 7GSSA 2L6CA 2VLTA 2PVOC 2L5LA 2F51A 3IE3A 1ST9A 1ERWA 2FWFA 4HJ2A 2LEGA 1Q4JA 4FH8A 3ZRDA 5HFKA 1XWCA 4BVYA 13GSA 2MBTA 2XPDA 3ZLPA 1A0FA 1HQOA 1VGLA 4L5OA 5D9VA 3F6DA 1SENA 3J7Yb 2C0DA 1F3AA 4L0WA 2GGTA 3GKKA 4F82A 4NWYA 3H1NA 2IN3A 3TJJA 2L5OA 2GLRA 3WGEA 2J9HA 2CV4A 4OCEA 2KOKA 1BX9A 3UIWA 5ELAA 1ILOA 4TXVA 2CA8A 1OC9A 3QCPA 4QL9A 4ZL7A 3LXTA 5ECIB 5IO0A 1B9XC 1KBNA 2OBIA 1T8EB 1B8XA 4ECBA 5CRDA 2ZNMA 4AJ8A 3UL3A 3A2VA 5B7CA 4J57E 1WP0A 4KNDA 2YOIA 1ZYQB 3F3QA 2YN1A 3LSZA 2LNTA 2PU9C 3EINA 5F07A 1XPVA 2YP6A 3EU3A 4XTSA 1GSDA 3AY8A 5IMCA 5G31A 4KSOA 1KNGA 4HOJA 3IPZA 2VIMA 3CTFA 3TJBA 3A2WA 2QGVA 4ML6A 5ECSA 4F03A 1O73A 5C04A 3IV4A 3QFAC 1V40A 3N9JA 2CX3A 4GSSA 1A8YA 2P0GA 3GL5A 2HXKA 2J23A 2ZUPA 1K3YA 4LA1A 3APSA 1GLPA 3GYKA 1F9MA 1OKTA 1EGRA 5D93A 1XW9A 3D5JA 2O87A 3WGDA 1LJRA 3KH9A 2FY6A 4OFMA 3C7MA 3GKXA 4N0VA 2R5GA 1SJZA 4RQXA 3A5WA 5JCUA 1IYHA 2HFDA 3ZFLA 3EMPA 2PN8A 2GSSA 2DJ0A 3K8NA 2CZ3A 1U88A 3C1SA 5F8BA 5JWRB 1SK1A 2HYXA 4ZL8A 3ED3A 2AJQB 5DJLA 4XRAA 1SU9A 1TRVA 6GSYA 5AIVA 1KTEA 1GTUA 2OKAA 3FK8A 3GTUA 2VL3A 2VLVA 3KMOA 3UBKA 5A4UA 1NW2A 2PBJA 1TXXA 1ERTA 1OVNA 1THXA 2DSAA 2E2GA 2M80A 1M9AA 5CYYA 3G7JA 4K9ZA 3L78A 2IIYA 4RI7A 4HU9A 5F0GA 2FA4A 4WKWA 5AGYA 1PSQA 1T4ZA 4O7HA 5DBQA 2VM2A 4K7IA 1VF1A 2X64A 3MDKA 2LJKA 3DVXA 4L5LA 3KIJA 3GFKA 3ZTLA 1G6WA 4FIWA 1XOAA 3W6GA 2C1YA 2GQLA 5IOXA 1DSBA 3DGQA 1V98A 2PPTA 1UN2A 4V2NA 5B8BA 3MNGA 6GSXA 2LRCA 4Q5NA 1TP9A 3WYWA 4IP1A 2KUCA 1ERVA 3H8QA 4IW9A 5CRGA 3ISOA 4PGTA 4K2DA 3VURA 2H6XA 3HYPA 1OE7A 1E2YA 2VD0A 3IA1A 3TJKA 4MF6A 3IK7A 3KXOA 2TRCP 1F37A 17GSA 4MMMA 1T7PB 2RM5A 3KH7A 1WE0A 2OBKA 1TU7A 3E9JB 2CQ9A 4ZBAA 3UVTA 1K0AA 3G7IA 1ZYEA 3EYTA 1AW9A 1SK2A 2V41A 1PL1A 3HJOA 2KP1A 1SJIA 4J2FA 5ECMB 5D8IA 1Z7RA 3DXBA 5AN1A 2AB6A 1GSFA 4MJBA 2X8GA 5KN2A 2I1UA 2RLIA 2PWJA 1H75A 3VK9A 2LTKA 3M1GA 2XHFA 5J41A 1EOHA 2L4CA 2AYTA 2EIOA 3H4KA 1XXUA 1MD4A 1J9BA 4MZWA 1AIUA 5C00A 2HZEA 4WF5A 3HDCA 2O7KA 3ZL5A 1PN9A 3GURA 2PUKC 2XBQA 1EEMA 4MJAA 2TRXA 3CYNA 3CSHA 2MZCA 3DYRA 3GIXA 4POKA 2YPMA 1GRXA 2FNOA 1K0NA 3QPMA 3HJPA 5B8AA 3KZQA 3HZ4A 1TJDA 2MMAA 2R2JA 5ECNB 4F0BA 5DQSA 3HKRA 4OFTA 3KM6A 5HR2A 2HRNA 4IGJA 1GUMA 2DIYA 4V1Ap 3D4MA 1LU4A 3NIVA 4AJ6A 3TCOA 2FWHA 1M9BA 2ZCTA 6GSUA 3ZMKA 1SJ6A 4MPFA 2FUG2 1QXHA 3CTGA 4K8MA 1O6JA 4WR4A 2IMIA 2YZHA 4D73A 3FZ5A 1CQHA 5CP1A 3TRPA 2E2MA 5ENUA 1J08A 1K0CA 4NPBA 1MDJA 4KB3A 4DVCA 4I5QA 4EXJA 3UVHA 2RIIA 2C0GA 2HZFA 1OAZA 4ZB9A 1FHEA 1SD9A 1YDKA 5IPGA 2G0FA 4LL4B 2K6VA 1PKZA 5ABRA 11GSA 4TVEA 4KH7A 1BJXA 2P31A 2JU5A 1EP8A 3CSJA 2DJ1A 1Z6NA 3PGTA 2HZEB 1MD3A 4OFNA 2C8UA 1XFLA 2X8CA 4G19A 4HZ2A 5DAKB 4LLRA 5AIXA 2R37A 3ZITA 1XWGA 1WPIA 3ZFBA 4ECIA 3UMAA 3APQA 2DBCA 4ID0A 3FW2A 1M2AA 1OKDA 4G9HA 4ACSA 3TKPA 3DMLA 3WGXA 3P90A 5GSSA 2C80A 4NXIA 5IOWA 3GMFA 3EMXA 3F3RA 1OC8A 1FVKA 1SYRA 3GA4A 2RUFA 5G1KA 2H66A 4DSQA 2VD1A 3HVXA 3S9FA 4G2EA 1GSSA 3D22A 1A23A 3IR4A 1O85A 2HSHA 3APOA 1A2JA 1ZZYA 1SK0A 4MF5A 2H30A 2KP2A 2Z9SA 1T3BA 2ALBA 1O8WA 4KUNA 4Z7XA 3VPTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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