2YWNA

Crystal structure of peroxiredoxin-like protein from sulfolobus tokodaii
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
157
structure length
150
Chain Sequence
GHMVEIGELAPDFELPDTELKKVKLSALKGKVVVLAFYPAAFTQVFRDSMAKFNQVNAVVLGISVDPPFSNKAFKEHNKLNFTILSDYNREVVKKYNVAWEFPALPGYVLAKRAVFVIDKEGKVRYKWVSDDPTKEPPYDEIEKVVKSLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of peroxiredoxin-like protein from Sulfolobus tokodaii
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Sulfolobus tokodaii
molecule keywords Peroxiredoxin-like protein
total genus 43
structure length 150
sequence length 157
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ywnA00
1LJRA 3VI7A 4TR0A 3DGQA 4FYCA 5ECQB 2P31A 3RAZA 4ECBA 1OYJA 2JL4A 2R4VA 3GL5A 3CSHA 1F37A 1OE7A 2WRTA 1V40A 2FHEA 2C0GA 4CW9A 3SWLA 4MABA 4TOPA 1USBA 4IW9A 4E8HA 3QPMA 1XWAA 2XHFA 3C7MA 2ON5A 5EY6A 1MDJA 3TJJA 1X9MB 3MWHA 1A8LA 5G5FA 4MP4A 4XCSA 3SBCA 2GDRA 1BQ7A 1SL0B 3IK9A 2OJLA 4YAPA 3GX8A 5ID2B 5IOWA 1S3DA 1GSEA 3KTBA 4HEA2 2H74A 2PVOC 4I2UA 1V58A 1DSBA 4MCUA 4PNFA 5ECIB 3TRXA 1AUCA 1BG5A 5ECMB 2E2GA 2JSYA 4TR3A 5CRGA 3VLNA 1XPVA 1BAYA 4MJBA 3RPNA 1UA5A 1FG4A 1PKZA 3TJFA 3ZVJA 5IO2A 2ES7A 3EMXA 4TXOA 2YOIA 1GTUA 4N0VA 1LU4A 2C4JA 3Q18A 3F6DA 3H4KA 5B7CA 2NDOA 3IBHA 5EL8A 4XS4B 1IYHA 1U3AA 19GSA 2PU9C 3W8SA 1M9BA 1V98A 4DSSA 4MJCA 2LEGA 2DJ2A 4HJMA 4PUFC 3DKSA 4F03A 4MH3A 4TR1B 1TRSA 2RUFA 2I81A 1QXHA 5IO0A 5KN3A 1ABAA 3C71A 2B3SA 2LRCA 2YWMA 1GTAA 3LFLA 4J56E 4G2EA 14GSA 1EGRA 4CHSA 2HLSA 3GA4A 4HQSA 6GSWA 2YZHA 1K0OA 3GSSA 3APSA 1JZDA 3IAS2 1JZOA 4IJ3A 5DQSA 1TXXA 3UEMA 4Q5RA 4FYUA 4AJ7A 2VLTA 4I97A 1PL1A 1MDIA 5HR3A 1THOA 2VCZA 3D4TA 3PH9A 4K8MA 16GSA 1M7TA 1A0RP 4GSNA 1YY7A 2V32A 2C8UA 5J3RA 2V2GA 2V1MA 2YJHA 3FY7A 3GRXA 2OBKA 1IYIA 3D4MA 5IQYA 5IOXA 3G9BA 1J9BA 4J2FA 3VPTA 9GSSA 4MZCA 1QMVA 4AGSA 3FEUA 3GN3A 1ERUA 4OWYA 4F0BA 1XWBA 2LRNA 1YF1A 1A24A 1KNGA 4FYBA 4HJ2A 1K3YA 2OACA 22GSA 2VCVA 4K7IA 4RI6A 1F9MA 1MEKA 3KD0A 1H4OA 1ZGNA 4IBPA 1PA3A 1HNCA 4BL7A 3GX0A 1DBYA 1M9AA 4PURA 4MF6A 3HJPA 4L8EA 4YH2A 2DLXA 3M9JA 1Z7RA 1A2MA 2FWEA 4MH2A 1OVNA 4AJ8A 4F0CA 5F07A 2WFCA 3DXBA 2M72A 2X64A 3GV1A 1PN9A 3BOAA 1YDKA 2ZNMA 2YCDA 4IGJA 4I2TA 1X9WB 1CQHA 3RHBA 4KDYA 3FRCA 2B5EA 4RUVA 5CREA 2LSTA 2L5OA 4O92A 1SKWB 5F0GA 3U5RE 2H0HA 3KP8A 2KP2A 10GSA 1TRUA 1EV4A 4ZBDA 1OE8A 3ERFA 4DSRA 2WJUA 2HYXA 5GAND 1B48A 4G10A 2NTOA 4GF0A 5C04A 3VWUA 1XWGA 1F3AA 4IS0A 1PSQA 1J0FA 3UVHA 3KH9A 3IV4A 3IC4A 3I6AA 1R5PA 3ZRDA 2YN1A 5COHA 4WF4A 3O6TA 1F3BA 3M8NA 3GH9A 1XWKA 5CRDA 1PMTA 3CRTA 1YKAA 4L0WA 1W89A 3US3A 2H1AA 3F4TA 4XS6A 5HFGA 2EIRA 2HZEB 3KTLA 2H19A 5IPHA 4O32A 2E2MA 5ECHB 3J7Yk 1JZRA 4YQVA 4HOJA 2EIOA 3FYGA 1WE0A 4WETA 2R3XA 1T4YA 3MDKA 1S3AA 2VL2A 1AXDA 1OC9B 2FWGA 2I1UA 5CNWA 17GSA 1KBNA 4GCIA 4XS1A 4ID0A 2CVDA 5ABRA 3JCML 3BD2A 4BPYA 1EWXA 5G5EA 1NM3A 5D9VA 3ZIVA 2C0EA 2K18A 1WRYA 2DJKA 2VOCA 3L9UA 3L9VA 1SJ6A 2O7KA 1TU7A 5DCGA 2X8GA 5CO3A 4LL4B 2B1LA 3A2XA 1RQMA 1GTBA 1G6YA 4ZB6A 1VF1A 5D93A 1VF2A 5ECOB 1K3LA 4NPBA 1ERVA 1FAAA 3I43A 4PQHA 1C72A 5IMFA 3QR6A 5DAKA 1R7HA 2MMOA 3OR5A 2ON7A 3APQA 3LGCA 3EINA 2JADA 3QD9A 1ZYEA 5DCHA 4RI7A 1E2YA 5DJLA 2EC4A 4IP1A 5LCZA 3NIVA 3LORA 3TJGA 1KTEA 1AC1A 3CXGA 3LSZA 6GSTA 12GSA 2V6KA 1WWJA 2M46A 2QSIA 4KDXA 3ZFBA 1WJKA 4K9ZA 3M0FA 3UIWA 2IL3A 2LNTA 2GQLA 4G19A 3HVXA 1QGVA 5ELGA 3GFKA 1R5AA 1OKTA 2X8CA 1LBKA 3TKPA 2ZCTA 3C73A 2I9HA 2HSYA 3GNJA 4WBJA 4N30A 3UAPA 3GL3A 3D5JA 3GUSA 1K3OA 5G1LA 3O3TA 2HFDA 5J9BA 2RIIA 5IMZA 4GWRA 1B9XC 2AV4A 5DDLA 3FZ9A 5A5KA 5HR2A 1SKSB 3IPZA 2AJQB 5JWQB 1WOUA 3DYRA 3ZITA 5JWRB 1QK8A 1TTZA 1YQ1A 4LL1B 5H5SA 5IM9A 3TKRA 3CBUA 4TXOB 1RK4A 2F8AA 3BCIA 3GTUA 3FZAA 2IMEA 3KIJA 3KMNA 4Q5NA 3TJKA 1UVZA 3VURA 4MPGA 5H5QA 1F6MC 4DSSB 2FA4A 2LNSA 7GSSA 4JBBA 4EDZA 1GWCA 3A5WA 3GMFA 2P0GA 4KCAA 1XW9A 1SENA 2GZYA 2IN3A 3M3MA 4ZILA 3ZVJD 1SU9A 2WCIA 2DJ1A 2H0GA 1U6TA 4EO3A 6GSVA 1GNWA 2KP1A 4KGIA 3GKNA 1FOVA 5B8BA 2LJKA 1Y25A 1B4PA 2IFQB 5DQYA 5IPGA 4L0UA 4GTUA 2CV4A 2L59A 5HR0A 3TOUA 3VPQA 3L9SA 2GVPA 2HZFA 2CVBA 1MDKA 5AIVA 4ACSA 4F2IA 4KAEA 1O81A 4K0GA 4KDUA 1XWCA 1ERWA 4I6XA 1EV9A 2GT5A 4HQZA 3TKSA 3TKSE 2VL3A 2L5LA 2HI7A 4IQ1A 1A23A 2GSSA 2P5QA 5FHIA 3N9JA 4AJ6A 4KE3A 1XVQA 1TK0B 4QQ7A 1Q98A 2XPEA 3FZ5A 3UVTA 2H66A 2FA8A 4OO5A 5AISA 3IOSA 3ZLPA 1R4WA 4KSOA 4LA1A 1SL2B 4NWYA 3D22A 3DIEA 2O8VB 2JZSA 3ED3A 3D0ZA 3E0UA 1GLQA 2G0FA 2VAFA 1GLPA 2GGTA 4P3YB 8GSSA 1SK0A 4EE0A 2R2JA 3F4SA 3Q6OA 1M2BA 3ZMKA 2YWNA 2BTOT 4K2DA 3C1RA 2LQQA 3MAKA 1ZL9A 2HRFA 4EVMA 4PNGA 4MJEA 1AAZA 2H76A 1TI3A 2GZPA 2XBQA 1G7OA 3GSTA 3H8QA 3HKRA 2FD3A 4ILFA 5ECNB 2HRNA 2HNLA 1FB6A 3L0HA 4O7HA 3ME7A 2YWOA 4D73A 2PWJA 5GZZB 2IMFA 2IJYA 2DBCA 1T3BA 2JU5A 2GSTA 4MMMA 4AF2A 3P7XA 4F82A 5KEJA 2VL2C 4HUAA 2WB9A 4EXJA 2YV9A 1YJ6A 3F3RA 4OCEA 1JHBA 4TR4A 4ZL8A 2IMIA 2YZUA 3IA1A 4LMVA 1XW6A 4MDCA 1SD9A 5L71A 1H75A 4JRRA 3F3QA 3IE3A 2KOKA 2KHPA 4OFMA 3ZMLA 3S9FA 3FHKA 1AQXA 2N5BA 3LYPA 2PMTA 2CZ2A 4TW5A 1SK2A 4ZL9A 4PXOA 1EZKA 3KH7A 4YQUA 3U6VA 3QAGA 2ALBA 3WT2A 2CAIA 2DJ0A 5LD0A 5E4WA 1KEBA 4KB3A 3W8JA 4BVYA 3KJYA 5IMCA 2I4AA 3A3TA 4DVCA 4OMVA 1ILOA 1T1VA 3KP9A 2TIRA 1TRWA 4KUNA 4KCEA 5CYYA 3N5OA 4CDOA 3EWLA 4MJAA 6GSUA 2PERA 4KSMA 3RBTA 2KLXA 4IN0A 2FY6A 2JZRA 5DALA 1I9DA 1UN2A 2FGXA 1ON4A 3IRAA 3WD6A 1SJZA 1EP7A 3HY2A 3BJ5A 4MK3A 1G6WA 1DUGA 2AAWA 3EU3A 1YEXA 4F9ZA 1I5GA 2GLRA 2WULA 4K1FA 4J57E 1VF3A 1O8XA 2F51A 3CTFA 3VWXA 5D9WA 1ZYQB 1BYEA 1K0CA 5DAKB 1GRXA 4V2NA 3ZFLA 4GLTA 3LXZA 2OA7A 5F05A 1MTCA 1U3IA 2H75A 2MMZA 4MZWA 5GSTA 2GZZA 4MF7A 2YP6A 5HFKA 4JEDA 1ACVA 2LUSA 4LMWA 1U87A 1XFLA 1YF0A 20GSA 3D6IA 1T8EB 3ISOA 3FR3A 4L5OA 3E3EA 2KUCA 3F6FA 2WS2A 4HZ4A 5AIXA 1X5EA 3A2VA 3IHQA 1O85A 5G31A 1ZCPA 3GYKA 2B7JA 2H1BA 2P5RA 4OO4A 3RHCA 4MF5A 2H73A 4IQAA 3CSIA 2DC5A 2XC2A 4Z7XA 2VLUA 1GUHA 3Q74A 5JCWA 2YJ7A 5B8AA 1TDIA 4JU5A 3FR9A 3DD3A 5IMVA 3FKFA 1WMJA 1Z7PA 1FB0A 3MNGA 2N5AA 1M2AA 4QL9A 1EP8A 5J41A 11GSA 5IIZA 4N0ZA 3G7YA 3GTUB 4BVXA 1NW2A 1Z5YE 2GTUA 3CRUA 4ML1A 1WIKA 1Z3EA 1G7EA 3ZTLA 4Q5QA 1SJIA 4H86A 1GH2A 2H1DA 3I69A 3PGTA 1PGTA 3UOMA 2QC7A 3WGDA 2X8HA 2E7PA 1N8JA 5ECPB 2LRTA 3IXRA 4RQXA 4PUAA 2RM6A 4K7NA 2PPTA 5CP1A 3LG6A 3ME8A 5HR1A 4IELA 2CX3A 3TKSC 1K0MA 2AYTA 4IKHA 1M0UA 2G2QA 3H1NA 5FT3A 3RDWA 1SK1A 2GSRA 2PN8A 2OBIA 2R5GA 1VF4A 5J9CA 4JZQA 3LXTA 2H01A 5ENUA 3H79A 1FVJA 3EC3A 2A4VA 4PGTA 1K0DA 2TRCP 3HXSA 2HSHA 3VK9A 3HYPA 2L4CA 4X43A 2J23A 3LEFA 4ZB8A 4NAXA 3P90A 2GQMA 4EDYA 3FR6A 4GSSA 2FWHA 2DJ3A 5AN1A 3GURA 1EOHA 2V6OA 4KA0A 5IMAA 2B5YA 3F4RA 5F06A 4GQFA 2PVQA 4K6XA 4IVFA 1PX7A 4FH8A 1Z6MA 1ZZYA 3DMLA 2M80A 3HVVA 1PQNA 3TB2A 1OC9A 2MMNA 4G9HA 2MZCA 2CZ3A 3TRQA 1JLWA 4TXVA 2B5XA 4ZXGA 1B8XA 2O87A 3HA9A 3QAWA 6GSSA 4V2LA 2K6VA 1A2LA 2R37A 2C3NA 1S3CA 4YQMA 3QDNA 4FIWA 1A2JA 4V1Ap 3HZ8A 3CYNA 3ZL5A 4Q5FA 1TU8A 4JR4A 1OC8A 1V9WA 3HD5A 3D21A 2CT6A 2AB6A 1VGLA 2RM5A 4WKWA 2VCXA 1CQGA 1GP1A 3HZ4A 5B6MA 3EU4A 4L5LA 1SD8A 2VM2A 2F8FA 5DBQA 1Q4JA 4OFNA 5ECKB 1MD4A 1XBSA 1K0BA 3CMIA 1DE2A 2OE1A 4YAVA 3NZNA 1GTIA 4EF0A 1A8YA 3TOTA 4NHZA 4JR6A 3VFIA 2CX4A 3TGZA 2FCHA 1TK5B 3EYTA 4K0NA 1E6BA 2CA8A 4D73B 2NBSA 3HJMA 2MBSA 3APOA 3IAM2 3WT1A 1DE1A 4HU7A 1SYXA 2LTKA 2A2RA 2C0FA 5KN0A 1EEMA 1SL1B 3A2WA 5EVOA 3P8WA 4ZL7A 1GULA 2JACA 4ISDA 1Z6NA 2WGRA 4V2MA 4WR4A 3GKXA 4ECCA 1WPIA 2PBJA 3ZREA 1EGOA 1NHYA 4X0XA 2AUVA 1MD3A 1PD21 2DMMA 2NVLA 3L4NA 2VL9A 1XOBA 2A2SA 2DMLA 4KH7A 3DRNA 3BCKA 1FO5A 5C00A 1TJDA 4GRFA 2HE3A 4X1UA 1GSFA 1O73A 3EURA 18GSA 1T00A 1UC7A 3V1WA 4WEYA 4XHMA 5EPFA 1U88A 2VD1A 2H6YA 4MLYA 3FK8A 2H72A 5F8BA 3UJ1A 4IHUA 3WYWA 2FLSA 4E8EA 2C3TA 2EIQA 3GH6A 5GAPD 4O5RA 5A4WA 3IR4A 5H5RA 2GS3A 2F9SA 5HFIA 2Z9SA 1THXA 2HXKA 3LWAA 3ZZXA 5DALB 4POLA 5DVBA 2WDUA 2H70A 4XTSA 1W4VA 3HJOA 1GSQA 2YNXA 1PX6A 2GSQA 2CAQA 1XOAA 2VIMA 5G30A 1Z9HA 3KEBA 4LLRA 2FWFA 3TJBA 3NOFA 2VM1A 3EE2A 2K8VA 2JSZA 3EVIA 4XRAA 4EKZA 5D8IA 2NPBA 3DVXA 3QMXA 6GSYA 3F8UA 2OKAA 1BX9A 4GSTA 4OFTA 2IFQA 3M9KA 1AQWA 2O89A 4DEJA 3QCPA 1RW1A 4ECIA 3VI5A 1XCCA 2GQKA 4HI7A 1JLVA 5ID2A 3CTGA 2LS5A 3UBLA 4ML6A 3P2AA 1R26A 4BWSA 3QFAC 3GKMA 3HDCA 4KW6A 3KZQA 3TCOA 3TKQA 2X99A 3LQ7A 3G7IA 2IIYA 2LV3A 2VCWA 1T7PB 4GQCA 2H6XA 5GSSA 4MZBA 2B1KA 2B6MA 4PQ1A 3LJRA 1QQ2A 1YKCA 13GSA 2DIZA 1AW9A 4K7OA 3IDVA 4EUYA 2XPDA 5KN1A 4BA7A 4OD7A 1AIUA 3HCZA 2J9HA 4KX4A 1HYUA 5JCGA 4ZBAA 1OAZA 1BJXA 3E9JB 1GSUA 2VLVA 2VO4A 1PL2A 2TRXA 4HS1A 2RUEA 3MSZA 3DWVA 1FVKA 2H8LA 2RLIA 2QGVA 1M2DA 1FHEA 5B6NA 2BMXA 3WGXA 2IWTA 1JZWA 2VD0A 4XS4A 1O8WA 4N10A 4TRXA 1SKRB 1YEPA 3UARA 1X9SB 2I3YA 5G2ZA 1GUMA 1N2AA 2YANA 4TR1A 3RPPA 4NXIA 1GUKA 3C1SA 4QL7A 5ELAA 1EOGA 1G0TA 3R2QA 1EEJA 3DEXA 1HNAA 4WBRD 3F63A 2MBTA 4GXZA 3QAVA 4NV5A 5CRWA 1YZXA 2AHEA 1TW9A 1F2EA 1SYRA 2L6DA 1XW5A 2K9FA 2VCQA 3F0IA 2DJJA 1HQOA 1ST9A 2D2ZA 3KCMA 3PR8A 4WF5A 2O85A 1Y6EA 3G7JA 3WGEA 1QUWA 2K8SA 4I5QA 2H6ZA 3PINA 1WP0A 1T4ZA 1GSDA 4HU9A 3VWWA 2FUG2 3Q19A 5J4UA 4DSQA 1XVWA 2VCTA 2L57A 3O76A 3GHAA 3VWVA 2LQOA 1GL8A 1XIYA 2C80A 2H30A 2IMKA 1PRXA 4TVEA 1XXUA 1TP9A 3M1GA 3LYKA 1OC3A 4EC0A 1TKDB 1K0AA 1FW1A 1A0FA 4NV2A 3QFBC 4MPFA 3KXOA 4TKYA 1XZOA 2DSAA 2C3QA 1URMA 2CQ9A 3UMAA 2N5FA 3TRPA 2QKEA 3ERWA 1GSYA 5JWOB 5D9XA 2IMDA 1TOFA 1ML6A 4BWQA 2YV7A 3GIXA 3BBYA 3KGKA 1TRVA 2OE3A 2LJAA 1X0RA 4ZBBA 2BJXA 5DJMA 1O7UA 3ZYWA 4MA9A 1OKDA 4KNDA 2WZ9A 3IK7A 2OADA 3ERGA 4JE1A 3QOUA 4ULXA 2F3MA 5AGYA 2IPAA 2B7KA 4POMA 4WR5A 1HD2A 1B9YC 2L6CA 2REMA 1TK8B 2PUKC 4POBA 3UL3A 5D96A 5JCUA 4ZB9A 5ECLB 3J7Yb 3EMPA 4EL1A 2R6KA 3H93A 1B4QA 3L78A 4TN8A 3ZIJA 4PX1A 1J08A 4IP6A 2C1YA 1V2AA 3HHVA 5INYA 3FZ4A 2H0IA 3CSJA 4HZ2A 2MYGA 2LJRA 2YWIA 5A4VA 1M99A 2ZUPA 5IMDA 3FW2A 1BEDA 2L4QA 4V1Ag 3HVSA 2VUPA 2XBIA 4NHWA 1QFNA 2H1GA 5G1KA 1GSSA 2HZEA 3K8NA 4I8BA 1X5DA 4ZIJA 1K0NA 2PGTA 2DIYA 5D73A 4N11A 2FNOA 1AQVA 1TI1A 5E59A 5HQPA 2YPMA 4WXTA 2OE0A 3DVWA 2JZTA 4NMUA 3KMOA 3KM6A 5J5NA 1GNEA 3F9UA 5KN2A 3UBKA 5ECSA 1JFUA 3TUEA 4XIHA 1ZOFA 5ECRB 3GKKA 1NHOA 4ECJA 2LKUA 2V41A 2GT6A 6GSXA 5D9TA 1NSWA 2HT9A 5CRHA 4FO5A 4OCFA 5FWGA 4IJIA 2C0DA 2CVKA 2E0QA 3W6GA 3C8EA 5CAXA 5LNKe 4POKA 3AY8A 4XRDA 1VRSD 3I9V2 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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