The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
CQEANYGALLRELCLTQFQVDMEAVGETLWCDWGRTIRSYRELADCTWHMAEKLGCFWPNAEVDRFFLAVHGRYFRSCPIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the human receptor activity-modifying protein 1 extracellular domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Protein transport
|
| molecule keywords |
Receptor activity-modifying protein 1
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| total genus |
29
|
| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2XVT A; 3AQF A; 3N7P D; 2YX8 A; 3N7R C; 3N7S C; 3AQE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3FDS A; 1URJ A; 3SD7 A; 1TAM A; 4HYK A; 2I9G A; 5EWG A; 2NRW A; 4NXZ A; 5D46 A; 1NK8 A; 3H0M B; 2KIV A; 5CP2 A; 1HJP A; 2D8C A; 2BCS A; 2HVI A; 4Y2V A; 1J2N A; 5AHX A; 4DL6 A; 2XGQ A; 5J0W A; 1KN5 A; 3OPX A; 2YQE A; 5KG2 A; 4OD0 A; 4DF4 A; 4C8K A; 2W55 A; 4EYH B; 1TKD A; 2A1A A; 2IA6 A; 1JMS A; 5KFE A; 4MFF A; 2QLT A; 2ZTE A; 3T5H A; 5ALE A; 4Z6D A; 2KTQ A; 2Y0S F; 4UAY A; 1ZYQ A; 5KT5 A; 4RQ1 A; 2ZTC A; 5G5H A; 1SV4 A; 1SKS A; 1BVS A; 4GLX A; 3LVW A; 1NOM A; 3F2C A; 3SEI A; 4O5K A; 4RPX A; 2OYY A; 1S0O A; 2F2A B; 3OJS A; 2AQ0 A; 1KTQ A; 1DK3 A; 3L4P A; 2HVH A; 4ECX A; 3Q8R B; 3SZ2 A; 2HBM A; 2WB1 F; 3MR3 A; 4R8U A; 3ORY A; 5J0O A; 4RNN A; 5DB9 A; 4PHD A; 1BPB A; 2EAM A; 1X6J A; 4PZN A; 5ALZ A; 4F4X A; 1NZB A; 4UAV A; 4OJ5 A; 5J2G A; 1NJY A; 2BKE A; 2OWO A; 3EPG A; 3AMZ A; 3NVY A; 2KKP A; 3H0R B; 1N5X A; 2P66 A; 2WAQ F; 4NJ8 A; 1NK5 A; 2DGZ A; 3OGU A; 4I2F A; 3H0L B; 2Y9U A; 1ZRN A; 5HR6 A; 5BOL A; 3FYH A; 2ZIV A; 2R18 A; 2LYA A; 1T4G A; 1M6Y A; 8ICA A; 3MBY A; 2BQ3 A; 1SWW A; 4UQG A; 1SXD A; 5AKI A; 2EZX A; 5ALY A; 4F93 B; 5BPC A; 4Q43 A; 2H5X A; 4F5Q A; 5CWR A; 2I1Q A; 3I1Y A; 3IG8 A; 3PX0 A; 3M9M B; 4F4W A; 2FJ6 A; 3G6Y A; 3RB4 A; 2QKQ A; 3AL0 B; 1WWU A; 4C0Z A; 2XCA A; 3IG5 A; 1FO4 A; 1BPX A; 1Z1B A; 1KFD A; 4IRD A; 1O08 A; 4RQ3 A; 2RRD A; 4J9K A; 3AQF A; 4ECU A; 3TQ1 A; 1IM4 A; 3HPO A; 4O5C A; 1A6S A; 4FS1 A; 1ZQS A; 4GXJ A; 3WU2 U; 4I28 A; 5KNI A; 1Z4N A; 3C2K A; 4F4K A; 4KLS A; 4DQR A; 3GV5 B; 4BXO A; 1UQV A; 4NLN A; 2EZY A; 5BOM A; 3QZ8 A; 2NRT A; 3PX6 A; 2F1J A; 3JPT A; 2DQN B; 9ICE A; 8ICZ A; 5DGA A; 1XSL A; 4Q44 A; 2HHT A; 3ISD A; 2MAX A; 5ALF A; 2DUY A; 5C0Y A; 2YMP A; 4EBC A; 3AU6 A; 5AKK A; 3M7D A; 2NO5 A; 1Q46 A; 5AI0 A; 4BGD A; 2DBY A; 3QUB A; 3IDW A; 2KG5 A; 4QWE A; 3GZF A; 4DFD A; 2FPL A; 4DSJ A; 5DBC A; 1KL9 A; 3HW8 A; 5KFT A; 7ICV A; 4YD2 A; 2NRZ A; 3WKE A; 3HWT A; 1ZQR A; 5AIC A; 2WAQ C; 4EZ6 A; 4QW8 A; 4O3N A; 4F71 A; 4C8L A; 4RQM A; 1X66 A; 2F8L A; 1KW4 A; 3SV3 A; 4UB8 U; 3EYZ A; 5KFS A; 2ZUC A; 4C4T A; 1IV8 A; 3K75 D; 1S0V A; 2F44 A; 4KLJ A; 3JPQ A; 8ICB A; 1FIQ A; 8ICL A; 5J2F A; 2F76 X; 4O3R A; 2YB4 A; 3BS7 A; 4M47 A; 1ZQI A; 1XSP A; 1BPD A; 1FFV A; 1ED1 A; 2E8O A; 3E58 A; 4UB3 A; 4FFD A; 2XIC A; 4XUS A; 1LKY B; 1RQN A; 4OO1 J; 1JX4 A; 3PSI A; 2I5H A; 1F44 A; 2WTF A; 5ALQ A; 4ELT A; 4R8U B; 3ETR A; 1TFR A; 4I2A A; 1UA0 A; 1TAQ A; 4UAW A; 1XSN A; 3SI8 A; 2K60 A; 1U49 A; 1H38 A; 4KLL A; 2W9C A; 5KFO A; 1N2X A; 3RBD A; 3MDC A; 3ZDA A; 3UXP A; 2AGQ A; 2K4H A; 3T79 A; 1SXE A; 3TFS A; 1C7Y A; 3HIL A; 3QZ7 A; 2DKX A; 3NVZ A; 4F2R A; 4K4H A; 5GTH U; 3T3F A; 3ALR A; 3N4M B; 3H8W A; 3IRU A; 5AI9 A; 3M9N B; 2BCR A; 4UAU A; 1A0P A; 3C29 A; 5J8Y A; 2QB1 A; 1ZD2 P; 4DSE A; 1ZD5 A; 4M9J A; 2ODG A; 5J2B A; 2HDO A; 2PFP A; 3RR8 A; 1S0N A; 5HML A; 3C28 A; 1XWL A; 4R64 A; 1PUZ A; 1U4B A; 4YXM A; 2EAP A; 1NKC A; 3HKZ F; 1Q3V A; 2OHF A; 5HMM A; 5TZV A; 1T8E A; 3N97 B; 9ICG A; 5J2H A; 3V6K A; 1Y88 A; 2KV2 A; 4QZG A; 2KK0 A; 3GIK A; 4O3O A; 4I2B A; 8ICW A; 4BJQ A; 1FFU A; 2K4I A; 8ICH A; 3V6J A; 2ASL A; 1V85 A; 5KT3 A; 1SZH A; 4JB3 A; 2GH1 A; 2G5I B; 4M6W B; 4I2G A; 4PGQ A; 3WKC A; 5AM4 A; 3RRG A; 4QJF B; 2VJ5 A; 4P2H A; 8ICS A; 2E3T A; 3UMC A; 5AM0 A; 1EXN A; 5J0S A; 1NZP A; 2E1E A; 3K1Z A; 2H3Q A; 2QB0 B; 1ZJM A; 3WK5 A; 1U9L A; 2XCP A; 1RQL A; 2IBK A; 3M6K A; 2KKV A; 2VIX A; 2VJ4 A; 3SMV A; 1YZ7 A; 3M1Y A; 4BX9 C; 5KFX A; 3LDA A; 5ALU A; 3MFH A; 5D4B A; 4KLF A; 5AKZ A; 1TE2 A; 1JRO A; 5AI6 A; 4QIW C; 1Z00 B; 2FPM A; 4GFJ A; 2UVV A; 1TAU A; 2NRX A; 4EBE A; 2EAN A; 3MGV A; 8ICT A; 1F0M A; 1Z1V A; 4QZA A; 3AQE A; 3IP4 B; 3TFR A; 4PZO A; 5HP4 A; 4WJ3 B; 4FZM A; 7ICJ A; 4NL9 A; 5DB6 A; 2J6S A; 2XY6 A; 3PW0 A; 9ICQ A; 5AKH A; 2PXI A; 3H8S A; 1WWV A; 4NLG A; 3DV9 A; 3BQ0 A; 4O3S A; 1TK8 A; 3ZD8 A; 4J03 A; 2FPK A; 5J0T A; 5L1J A; 4P4P A; 4C8O A; 2BCU A; 1UT5 A; 2QB0 A; 2KVS A; 2Y0S C; 1QTM A; 4M9G A; 3K4G A; 2CN1 A; 2HI0 A; 3KBB A; 2K8A A; 1J97 A; 5ALH A; 3WK6 A; 5KFC A; 8ICO A; 3C2L A; 4ELU A; 1KRP A; 4X5V A; 2G08 A; 4J9L A; 2DPJ A; 1JAL A; 3E2E A; 3ZDD A; 1JIH A; 1JRP A; 4I27 A; 4DWI A; 3C1Y A; 3RJF A; 5IIK A; 7ICS A; 2WF8 A; 4F5R A; 3A0B U; 1XC9 A; 4KX3 A; 2BDP A; 1COK A; 2ZIX B; 4EX6 A; 4Y2Y A; 4I2C A; 3TAD C; 4UB1 A; 2G07 A; 4C80 A; 3IN5 A; 5KFW A; 1IXR A; 3QUT A; 2RDJ A; 4KLE A; 3OSP A; 2DL0 A; 2CPR A; 4Y2J A; 4DSF A; 1COO A; 5HHI A; 1NK0 A; 2BQU A; 4BUG A; 2NO4 A; 5AM5 A; 5KT4 A; 5AIB A; 2W7O A; 2DKZ A; 1K5O A; 1J2M A; 2XY7 A; 1QSS A; 5D49 A; 3RB3 A; 3HJE A; 5KT2 A; 1U45 A; 3TAC B; 4J9O A; 4C8N A; 4QZF A; 3C1Z A; 2WF5 A; 5KFU A; 5KFL A; 1KSP A; 4O5E A; 4FZN A; 4ECT A; 9ICJ A; 4EBD A; 1PZN A; 2K8C B; 4KLU A; 2JH1 A; 1ZQW A; 1L7O A; 3MGH A; 4QZE A; 3WK4 A; 2KFZ A; 3KKA C; 4JK1 A; 1C20 A; 3K1R B; 2FMP A; 4B9L A; 2P6U A; 3OSN A; 3PO5 A; 4EZ9 A; 1JN3 A; 1B0X A; 1UHU A; 4UB5 A; 1TV9 A; 2KZM A; 3PZP A; 5AKY A; 1L8O A; 1SKR A; 4PHE A; 4UAR A; 4RPZ A; 1LVH A; 4YN4 A; 2XO7 A; 1WYG A; 5ALN A; 3UQ0 A; 1NI3 A; 4I2J A; 4AYB F; 2K8B B; 2WHE A; 3QU5 A; 5KFR A; 5KT6 A; 4IL6 U; 4IQU A; 1NK9 A; 2FE9 A; 9ICA A; 4K4I A; 5KG3 A; 4ZOH C; 4JUZ A; 3QU4 A; 1L3T A; 2LYH A; 1N56 A; 5AK6 A; 1ZQP A; 3L5K A; 5E79 U; 5EE1 A; 4P0Q A; 4C7Z A; 3D2S A; 5DBA A; 1JXE A; 1NK7 A; 4YR0 A; 4DLE A; 4ECV A; 7ICT A; 1L7N A; 3T5L A; 1RZT A; 1KFT A; 5ALL A; 3R9K A; 5C5J A; 4R65 A; 2XC9 A; 4DFJ A; 3I76 A; 4A8E A; 3NVW A; 3ZI4 A; 5DB8 A; 4KIT B; 3G6V A; 4RQ4 A; 5AIA A; 3WKB A; 3SV4 A; 4QW9 A; 5AKL A; 2ZUB A; 4QWC A; 2H3F A; 2N1R A; 1L6N A; 1ZQH A; 4Q8E A; 3T5K A; 1TK5 A; 3FAH A; 3RJE A; 4DQP A; 4UB2 A; 3TAD A; 3UXN A; 3PY8 A; 3HT3 A; 4M04 A; 4F2S A; 2LKY A; 4IQV A; 5KFQ A; 5T14 A; 4DOA A; 3KZX A; 4Y2R A; 3JPN A; 1IG6 A; 2KSO B; 1L3U A; 4ECQ A; 5KFB A; 4Q45 A; 2XY5 A; 2XVT A; 4QZD A; 3TAR A; 3BDP A; 5F9L A; 1SL2 A; 8ICK A; 2ZJ5 A; 4C7Y A; 3NUQ A; 3F5E A; 4F72 A; 3QUQ A; 4QZH A; 3EWA A; 4IC9 A; 1DK2 A; 5DDY A; 2BR0 A; 9ICL A; 4XA5 A; 4Z6F A; 3CP8 A; 2F77 X; 5KFD A; 5KFA A; 4GXK A; 5KT7 A; 4XRH A; 4CGZ A; 4RT2 A; 2NRV A; 3RBE A; 3F2B A; 2BPG A; 5AKE A; 4B6J A; 4LJX A; 5J2I A; 3H8M A; 1ZXI A; 2R8J A; 4G9B A; 4FBT A; 4EEN A; 2KN7 A; 4P4M A; 3C2M A; 3GII A; 4QZC A; 5ALP A; 5H2F U; 4Y2S A; 1NK6 A; 5AI5 A; 4KLI A; 8ICE A; 1T3Q A; 3GDX A; 3AU2 A; 3LWM A; 2K4P A; 3B9J A; 4JWM A; 2HMX A; 4Y2T A; 2R8G A; 4OJ6 A; 2B6G A; 4M9L A; 4UBB A; 9ICI A; 2H3V A; 1N62 A; 5KFJ A; 2IOF A; 8ICR A; 2MRL A; 1B4F A; 2EQY A; 3C21 A; 3OHA A; 2UVW A; 8ICJ A; 4DLG A; 4ED7 A; 2A1J B; 2KMD A; 1ZOL A; 5DQH A; 5CEH A; 5J2J A; 2KIC A; 3ZD9 A; 4AYB C; 2V4R A; 2YN4 A; 1RYU A; 2KZ3 A; 5B5E U; 2VA2 A; 4Y2X A; 2BPC A; 1SL0 A; 3BQ7 A; 3GIL A; 1A77 A; 4DOB A; 2RHF A; 3M8R A; 3GQC A; 4KN4 A; 1BGX T; 3KHG A; 9ICV A; 1SB3 C; 2HHX A; 1SV0 C; 2A3V A; 3PST A; 4J9S A; 5KL8 B; 2AU0 A; 7ICK A; 2G06 A; 1YZ6 A; 4NLK A; 1ZQX A; 3FM9 A; 3AEV A; 4F91 B; 4O3Q A; 3JPO A; 5F9N A; 2FMQ A; 5J0U A; 4PPX A; 5L1L A; 1FEZ A; 1D9D A; 4ECY A; 3RTV A; 2MUT B; 1KKX A; 1ZQO A; 2V4Q A; 3JPP A; 5KFI A; 5ALK A; 4RT3 A; 4DOC A; 5KG6 A; 4ED8 A; 1ZET A; 5AK4 A; 2WB1 C; 1OXJ A; 3Q8S B; 4MF2 A; 5GTI U; 1NJZ A; 1S10 A; 1F5S A; 1N60 A; 2CRX A; 4CCH A; 2ISO A; 4F4Z A; 4O0I A; 2AXT U; 3CNH A; 1TK0 A; 4F5O A; 4KMO B; 4HAI A; 1DOQ A; 1RYR A; 4JV1 A; 9ICF A; 3SAG A; 4I2E A; 1JXL A; 3ZDE A; 3UMG A; 1S77 D; 9ICB A; 2KSO A; 1SWV A; 4OJP A; 5EOZ A; 5ALM A; 2HBL A; 2KJ8 A; 4E0D A; 2AH5 A; 3PR4 A; 4C4S A; 2PFQ A; 3RFA A; 1ZQJ A; 1ZQF A; 4RQ0 A; 3S6J A; 1ZQC A; 4I2I A; 3DDH A; 2ZJA A; 1X2I A; 4KLD A; 3PW2 A; 4P0P B; 7ICQ A; 1OUQ A; 4RUA A; 1DGJ A; 5IIL A; 1X9W A; 1ARO P; 5DBB A; 3UPQ A; 4JV2 A; 3GV7 B; 4GIB A; 3WK8 A; 4IS7 A; 4ECR A; 3UXO A; 3KKA A; 1CUK A; 4NWI A; 2HOQ A; 3MAB A; 5J2E A; 3V6H A; 2IMW P; 1DGS A; 1O03 A; 9ICP A; 1L3V A; 2JXJ A; 2IOH A; 2YML A; 7ICE A; 5JUM A; 1MQ2 A; 2FMS A; 1ZQQ A; 3ZDC A; 1D8B A; 2LPE A; 1T3N A; 1X42 A; 5CRX A; 2JR5 A; 4YD1 A; 3KOO A; 3BZK A; 9ICS A; 3TAP A; 1SV0 A; 4MHV A; 4O9M A; 2ZXI A; 4Z6C A; 7ICF A; 1AQ6 A; 2UVR A; 3V7K A; 4I2D A; 3CYM A; 5EWF A; 4QWD A; 1ZQU A; 3N7R C; 2KHQ A; 3J81 j; 5IIN A; 2ISP A; 2L5Y A; 2LM1 A; 3D2N A; 1XS9 D; 4PL2 A; 4IR1 A; 4ELV A; 2B0C A; 1ZQV A; 5DGB A; 3V72 A; 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4B9S A; 1PK1 A; 2BDU A; 2ZIW A; 5HNK A; 1X9X A; 4CE6 A; 1VDV A; 3Q8L A; 3O0F A; 4UAS A; 5J29 A; 1QQ6 A; 2E8M A; 4QZ9 A; 4RQ8 A; 4US8 A; 3PVX A; 3UQ2 A; 5ALW A; 4CF4 A; 1D9F A; 4I29 A; 4U7C A; 1V97 A; 4KLG A; 3HRD D; 2ZIU B; 1GO3 F; 5AM3 A; 1HIW A; 1WUD A; 2O6K A; 4EEL A; 4KN7 A; 1RXV A; 3QYP A; 1LKY A; 1L7M A; 4Y2P A; 3IV6 A; 5J2C A; 5DQI A; 2E8P A; 2JGA A; 3PV8 A; 2ALZ A; 1XO1 A; 4NM2 A; 8ICM A; 3V7J A; 1RYS A; 1Z00 A; 2J6T A; 4M0A A; 5KG7 A; 2KD1 A; 4FE3 A; 5AI4 A; 9ICO A; 2Q4T A; 3N7P D; 4TQR A; 1RPL A; 4YMO A; 3RH6 A; 1L7P A; 2HHS A; 4YR2 A; 2OEH A; 2OH2 A; 2IOF K; 2BQR A; 3QNM A; 3C5G A; 3JPS A; 2E8N A; 4YMM A; 2W9B A; 4O3P A; 3VC8 A; 4MEY A; 3WKD A; 5CB1 A; 5J2D A; 2Y9T A; 3RAQ A; 1K1S A; 3TAN A; 1MC8 A; 4M9N A; 2AJQ A; 2MA1 A; 2KJ5 A; 2HCF A; 4O3M A; 4F92 B; 4LVS A; 1ECW A; 5AI8 A; 2W9M A; 4RQN A; 1ZQA A; 4PL1 A; 4DFK A; 4BXO B; 5KAF U; 5JU5 A; 4OJL A; 2ZIX A; 1ZQE A; 1NK4 A; 3LVV A; 3M9O B; 5HHH A; 5EWE A; 1S0M A; 1CI4 A; 3LK9 A; 1LB2 B; 2OM6 A; 5DG9 A; 4MEX A; 5DDM A; 1SGG A; 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