The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
CQEANYGALLRELCLTQFQVDMEAVGETLWCDWGRTIRSYRELADCTWHMAEKLGCFWPNAEVDRFFLAVHGRYFRSCPIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Receptor activity-modifying protein 1
|
| publication title |
Crystal structure of the human receptor activity-modifying protein 1 extracellular domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Protein transport
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| total genus |
29
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| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3N7R C; 2XVT A; 3AQE A; 3N7P D; 3AQF A; 3N7S C; 2YX8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3ZDB A; 1YZ7 A; 1JMS A; 2F8K A; 4OJP A; 4KLF A; 1NKE A; 4UAW A; 2VA3 A; 2OM6 A; 3F5A A; 3BQ1 A; 3EYZ A; 2V9W A; 8ICK A; 1JIH A; 2M9N A; 3QU2 A; 3RRH A; 1BNP A; 3GFK B; 4KLI A; 5AI9 A; 4BJQ A; 4UBC A; 3PML A; 3QUB A; 1X66 A; 1U4B A; 4RUC A; 1RYU A; 1N2X A; 4NLG A; 3KBB A; 4CE6 A; 4BWJ A; 1Z4O A; 9ICP A; 1NZP A; 7ICM A; 2ASD A; 4WJ3 B; 8ICP A; 4KMU A; 2BQU A; 5DQG A; 9ICH A; 3WK4 A; 1ZOL A; 2XI9 A; 5DBC A; 1NK6 A; 1KN5 A; 4BGD A; 2BCR A; 1KFT A; 2MA1 A; 3N4M B; 2JXJ A; 3LYS A; 3WKB A; 1COO A; 2F2A B; 5KFL A; 4ACO A; 4F3O A; 4DL5 A; 8ICL A; 2W9B A; 3FC4 A; 4IQT A; 4YD2 A; 2HHX A; 4RUA A; 1TK0 A; 2BHN A; 4UB5 A; 2LI6 A; 1RG6 A; 1ZD5 A; 2KV2 A; 9ICS A; 2BPC A; 4JMU A; 3WK9 A; 8ICW A; 2GLE A; 3HP6 A; 1KEJ A; 4AP9 A; 2NRX A; 3SD7 A; 5J8Y C; 5HR7 A; 1MN8 A; 4YVZ A; 4YR3 A; 3RJE A; 3SZ2 A; 3C1Y A; 5EE9 A; 3G6Y A; 4I2B A; 4O5C A; 4Q45 A; 4QWA A; 4BXO A; 2K4E A; 2LMR A; 2XC9 A; 1D9F A; 1X9X A; 2YMP A; 5KFQ A; 4J9Q A; 4PH5 A; 1ZRM A; 3UXP A; 3GV5 B; 1RDF A; 8ICH A; 1HJP A; 3C2L A; 3G6V A; 5AIB A; 2LBO A; 4KN4 A; 1ZD3 A; 2BZF A; 2W03 A; 1SL1 A; 1NK5 A; 2BPF A; 2DPJ A; 4TQR A; 3TAP A; 2J6U A; 4O3R A; 4CRX A; 1ZQO A; 9ICM A; 3C29 A; 2H3Q A; 4M6W A; 4DLE A; 2BCU A; 4QZ9 A; 4P4M A; 2FPM A; 1ZQG A; 3V6H A; 4Y2P A; 2EQY A; 4FFD A; 3QZ8 A; 2IHM A; 2J6T A; 3IP4 B; 3TAC B; 3IN5 A; 4RQN A; 5DGA A; 2HHT A; 1S0M A; 1N62 A; 4C4T A; 2HHS A; 2HSZ A; 4UBB A; 3PX6 A; 2CPR A; 1AQ6 A; 4F4X A; 2P6U A; 2ZXI A; 1L3V A; 5KG4 A; 4UB6 U; 4C8M A; 1NK0 A; 3RJK A; 4F4Y A; 5ALW A; 3F2B A; 4PHE A; 3SV3 A; 3PMN A; 2FLN A; 5GTH U; 2XGP A; 3TFR A; 3N7R C; 4EX7 A; 5J0S A; 2OH2 A; 4O3P A; 7ICE A; 9ICL A; 3V7K A; 2PFP A; 1YZ6 A; 2K4P A; 3PX4 A; 4OJ5 A; 3NRW A; 1BGX T; 2LPE A; 4C8K A; 1F5S A; 2XID A; 1DGJ A; 1ZQH A; 3PW2 A; 4NL9 C; 1L7O A; 1TAQ A; 2FJ6 A; 2ZG6 A; 2IA6 A; 4FS2 A; 4ELT A; 3JPT A; 4DL3 A; 2QKQ A; 5ALJ A; 2W55 A; 3C2M A; 5DLF A; 3PW5 A; 5AM0 A; 4XRH A; 2KTQ A; 1ZQB A; 1ZQV A; 4TUQ A; 5IIN A; 3KHR A; 3THV A; 2PFO A; 4NXZ A; 1VLB A; 5J0U A; 3OHB A; 3AU2 A; 2W3R A; 4FO6 A; 1L6N A; 2WAQ C; 5KFA A; 5GTI U; 3V7L A; 2KE7 A; 2ZIX A; 2AH5 A; 5J0P A; 5KG6 A; 5AM5 A; 3BQT A; 8ICA A; 2BCV A; 2BGW A; 1N5W A; 4UAR A; 5KFX A; 3JPQ A; 1U47 A; 2YN4 A; 3CP8 A; 1Z19 A; 5AI0 A; 5KFS A; 3GIJ A; 3Q8L A; 1ZD4 A; 1QCK A; 1QTM A; 2F1I A; 1COK A; 3BQ7 A; 5ALO A; 3WU2 U; 3F2D A; 5JU5 A; 5ALE A; 3HX0 A; 3JPS A; 3PR5 B; 4DSJ A; 1V9P A; 1B0X A; 1JXL A; 2H3Z A; 3M6Z A; 1ZQF A; 5IIK A; 1S76 D; 3IM1 A; 1UT5 A; 4GLX A; 1L8L A; 2IOH A; 2KVS A; 1MSW D; 5DB7 A; 1SKR A; 1RPL A; 1MA7 A; 1XU4 A; 2YY6 A; 5KNI A; 5J0T A; 4NLN A; 3ZDD A; 2MU2 A; 4FZN A; 4B9V A; 2LYB A; 1ZQE A; 2DWQ A; 4C8N A; 3EWA A; 2HCF A; 4EX6 A; 7ICU A; 2A1J B; 3AMZ A; 1V97 A; 2NRV A; 1Q8K A; 4KLD A; 4J9S A; 1L3S A; 3PNC A; 4XUS A; 3QUQ A; 5AK5 A; 4C8O A; 4CF4 A; 3GII A; 3EW9 A; 3MR6 A; 4K4G A; 8ICR A; 1ZQN A; 3E2E A; 2JH1 A; 4CDG A; 1ZQZ A; 5AKY A; 2K60 A; 4ECX A; 1B4F A; 4UB8 U; 4RQ8 A; 4DFP A; 5DB6 A; 4Y2R A; 3C28 A; 2KJ5 A; 3T5H A; 4AYB C; 5L1K A; 1ZQR A; 4CGZ A; 5L1L A; 1SL0 A; 4FBU A; 4ELU A; 1SZH A; 1KBU A; 7ICG A; 3VC8 A; 2LKY A; 4TQS A; 3CYM A; 4US9 A; 3QU9 A; 4RNM A; 3TAD C; 4I2G A; 3A0H U; 3MR3 A; 5EOZ A; 3KKA C; 5DGB A; 5AI8 A; 2R18 A; 9ICN A; 3H40 A; 2AHO B; 3RJF A; 3MFI A; 2F1J A; 8ICS A; 9ICO A; 3PSF A; 3SYZ A; 5KFU A; 3IG5 A; 2BDP A; 3MBY A; 3WK7 A; 5CEH A; 1SXD A; 1IG6 A; 4Y2T A; 2Y9T A; 4PJ0 U; 1N48 A; 4F4K A; 4P2H A; 4BX9 C; 5KT3 A; 4Z6F A; 3PO4 A; 4GIB A; 3MGI A; 3ICX A; 2KHQ A; 2JZB A; 3RRG A; 4ICA A; 1XS9 D; 2YTU A; 4M9N A; 4UAZ A; 2ZIU B; 2EH9 A; 4US8 A; 3GU3 A; 1XNS A; 1LVH A; 3Q8M A; 1SL2 A; 1X40 A; 2HHW A; 1N61 A; 2AQ4 A; 4R8U A; 4QJF B; 4DS5 A; 1WYG A; 3KD3 A; 3C23 A; 2AQ0 A; 3SV4 A; 4DF8 A; 1H38 A; 4KLJ A; 2EZX A; 3AUO A; 5ALF A; 4UB2 A; 1XWL A; 4PHA A; 5EWE A; 4M0A A; 4NLK A; 5DG8 A; 4RU9 A; 1TVA A; 1SB3 C; 1MQ2 A; 5HMM A; 5AKH A; 2KNJ A; 4U6P A; 2JH7 A; 5KFO A; 1Z1B A; 3QU7 A; 2P35 A; 2RDI A; 2JGA A; 3L4P A; 1ZYQ A; 3SI8 A; 2RQ5 A; 2A3V A; 2QB0 A; 3RJI A; 2LYH A; 4C4S A; 5KFF A; 3QUC A; 1ZQT A; 5KG7 A; 3BQ0 A; 4E0D A; 4O5K A; 2FE9 A; 4OJO A; 2K4I A; 3V6J A; 4M04 A; 3M9N B; 5KG3 A; 5C5J A; 5KFG A; 3QX7 A; 1UHU A; 1ZQU A; 2KSO B; 5AHX A; 2MSN A; 4UB1 A; 3MR5 A; 1ZQ1 C; 1A77 A; 4DWI A; 3M8R A; 3I28 A; 2CN1 A; 2AXT U; 5AKG A; 2C2R A; 2VA8 A; 2K8C B; 4KLT A; 5DDM A; 5J2J A; 4JUZ A; 5ALP A; 4DL7 A; 5B66 U; 2JR5 A; 1NNL A; 2Y0S C; 1N5X A; 3NVV A; 4O0I A; 4JV1 A; 1J2N A; 2W8K A; 2JEJ A; 2UVR A; 4IS7 A; 2R8G A; 5TIS U; 1KFD A; 2BQR A; 1BNO A; 5ALN A; 3Q8R B; 4QZH A; 4F5R A; 1L7N A; 4DOB A; 2KFN A; 2OWO A; 4DSF A; 4PHP A; 5AM3 A; 4TUR A; 4YP3 A; 1LV5 A; 3ZD8 A; 4JK1 A; 1PUZ A; 4MFC A; 2XCP A; 1QQ7 A; 4M2Y A; 4FE3 A; 1NZB A; 5ALT A; 1ZQL A; 4IQV A; 2M0N A; 2Z7J A; 3F5E A; 1X42 A; 4LZD A; 7ICO A; 4OD0 A; 3HPO A; 7ICT A; 5KFN A; 4KMO B; 4KLG A; 1PK1 A; 1U45 A; 5AM2 A; 5J2D A; 5KFM A; 3TAN A; 5J2K A; 1X2I A; 7ICQ A; 3C5G A; 4J9P A; 2OEH A; 3ETL A; 5KAF U; 1N63 A; 3RFA A; 2XCA A; 2DPI A; 1NK7 A; 2KIW A; 2CXY A; 5CHG A; 5KFV A; 2C2E A; 2E8N A; 5F3X B; 3BZK A; 3MR2 A; 1ZJN A; 3C5F A; 3IG8 A; 4ED1 A; 2VKQ A; 3UQ0 A; 4NJ8 A; 5J2H A; 4O9M A; 5BOM A; 4DL4 A; 1T4G A; 1JRP A; 5JRT A; 2W9B B; 3NVZ A; 5KL1 B; 2XY6 A; 1D8L A; 4Z6D A; 3LVW A; 5KG5 A; 3OSN A; 4QZG A; 4QIW C; 4NWI A; 4RZR A; 1ZQP A; 1L3U A; 2WB1 F; 1P7D A; 4RT3 A; 7ICF A; 1S8O A; 4YMO A; 1D8B A; 1LKY A; 2JEG A; 1J97 A; 2DKX A; 4RQ3 A; 1NOM A; 4QZA A; 3KHH A; 1K1Q A; 3AQF A; 4R63 A; 4BXO B; 2L5Y A; 3RR8 A; 2IOF K; 1SKW A; 8ICX A; 4DCC A; 4BWM A; 2EAP A; 4NL9 A; 2R8K A; 5JUM A; 4GXI A; 3QEA Z; 5EE3 A; 4Y2Q A; 4HYK A; 8ICM A; 4YR0 A; 2DF4 B; 3PO5 A; 9ICQ A; 1V85 A; 5KFR A; 4NV0 A; 3OJU A; 3RBD A; 1KDH A; 5DLG A; 1NI3 A; 4UAY A; 2Y1J A; 4FZL A; 1BPE A; 3UXO A; 4UB4 A; 3SMV A; 3RH4 A; 4O5E A; 3PST A; 4IRK A; 2K8B B; 4LVS A; 1ZQY A; 5KT5 A; 2HI0 A; 2MUT A; 8ICN A; 2VIX A; 3BDP A; 3K1R B; 4MFA A; 1T8E A; 5KFB A; 2F3N A; 2KJ8 A; 5DQI A; 4F92 B; 4YFK A; 3BS5 A; 3CW2 C; 2GO7 A; 2EZY A; 1L8O A; 2F77 X; 2KFZ A; 5A0L A; 3H8M A; 3GIL A; 4F4W A; 3QU5 A; 2QAR B; 4PL2 A; 5K4L A; 3HKZ F; 4I2E A; 3OJS A; 9ICV A; 5D46 A; 4KLL A; 4QWC A; 4ED3 A; 2KKP A; 4KTQ A; 5DQH A; 2ZUC A; 5G5G A; 3NUQ A; 3JPN A; 5BPC A; 1UA0 A; 4RQ5 A; 1SXE A; 9ICW A; 4C4R A; 1EXN A; 5AKZ A; 4UW9 A; 2RRD A; 1PK3 A; 5III A; 2E8P A; 1WWU A; 1WWV A; 5AI6 A; 3T79 A; 2IMW P; 3RAQ A; 4GC6 A; 7ICV A; 5AIA A; 4EZ6 A; 4IR9 A; 8ICU A; 4BDP A; 4P0P A; 4QZC A; 4O3S A; 7ICI A; 2LM1 A; 3HIL A; 3MDC A; 5DG7 A; 1N60 A; 1IIP A; 4EEK A; 5J2G A; 4G9B A; 1ZQD A; 3KOO A; 3U26 A; 2PXI A; 2E1F A; 2ZJ8 A; 4YMM A; 5ALV A; 3GZF A; 4X5V A; 9ICF A; 1NJX A; 2DUY A; 5KG0 A; 2P66 A; 2H5X A; 2KVC A; 2LYA A; 3FDS A; 1QSS A; 1K5O A; 4IRD A; 1IV8 A; 4J9O A; 5AKJ A; 3T3F A; 2VAN A; 3O0F A; 5FP0 A; 1ZQS A; 2PMZ F; 2JEI A; 5KFI A; 7ICL A; 1UPH A; 5KFE A; 2OCE A; 4IQW A; 1NJY A; 3R9K A; 3VCB A; 5AIC A; 4GFJ A; 1TK8 A; 3AN1 A; 2ZIX B; 5EE0 A; 5HHH A; 2JRZ A; 1WCL A; 2ZJ5 A; 1MQ3 A; 4YG2 A; 2ESE A; 3L3F X; 5HHI A; 3PSI A; 1ZQA A; 1URJ A; 2OHF A; 4C0Z A; 2KIC A; 4I2H A; 1Z3E B; 5L1I A; 9ICE A; 4Z6E A; 5F9L A; 1VJ5 A; 4C8L A; 9ICU A; 2K89 A; 3ZDA A; 1KQQ A; 4FZM A; 2IOF A; 2JHD A; 4MEY A; 3KZX A; 5CA7 A; 4YMN A; 7ICS A; 5EWF A; 5D49 A; 2W54 A; 1OW5 A; 1VDV A; 1Z00 A; 2NO4 A; 2DBY A; 3ED5 A; 5G5H A; 4RPY A; 8ICQ A; 5IIM A; 2CRX A; 1ZET A; 7ICN A; 2F1H A; 1SV0 A; 4ECT A; 1PVP A; 3UMB A; 2NYV A; 4M9L A; 1HUO A; 3C1Z A; 1RZT A; 1SV4 A; 4B9L A; 2QB1 A; 1L3T A; 2G07 A; 1DK2 A; 3BZC A; 4KLM A; 4F2R A; 4RQ0 A; 5AKL A; 4YN4 A; 2K4H A; 4ECS A; 4J9N A; 4ED0 A; 5KFY A; 1DRG A; 2JEF A; 4DSE A; 1U9L A; 2FDR A; 2I9G A; 4I2D A; 9ICR A; 4F91 B; 4Q8F A; 2NRW A; 5AK6 A; 4Y2J A; 1KTQ A; 2G0A A; 3AQE A; 4P4P A; 1BPZ A; 3QXG A; 3A0B U; 3GQC A; 2R8I A; 2VJ4 A; 1ED1 A; 3EPI A; 2O6K A; 5D4B A; 1DK3 A; 3KZI U; 1NKC A; 8ICV A; 3ISD A; 3K4G A; 3HJE A; 5KFT A; 2HDO A; 2DL0 A; 4QZE A; 1K1S A; 4I2I A; 1TKD A; 4ECZ A; 1B43 A; 9ICA A; 2GH1 A; 5ALY A; 5ALK A; 3PZP A; 2FLP A; 9ICX A; 1ZQM A; 1O03 A; 3F2C A; 1RQL A; 1BPB A; 3RJH A; 3PW0 A; 4GXJ A; 1BPD A; 2W9A A; 5J2E A; 2HBJ A; 2P6R A; 1DOQ A; 3UM9 A; 3NS1 A; 2ASJ A; 2KZM A; 5KT7 A; 4EEN A; 4M9G A; 4KLE A; 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4ECU A; 5IIO A; 2XY7 A; 5ALL A; 2KD1 A; 1WCN A; 4U7C A; 4RPZ A; 3T5J A; 2JMG A; 4F8R A; 8ICI A; 5CR0 A; 4JV2 A; 5AI4 A; 3ZD9 A; 1A6S A; 1UCV A; 2KEY A; 2PFQ A; 4J9L A; 2PI4 A; 4J03 A; 3GIM A; 2HBL A; 2HVH A; 1RQN A; 3MGV A; 3EZ5 A; 4KLH A; 4DEZ A; 3L5K A; 3AU6 A; 3UPQ A; 4PGQ A; 4YXJ A; 5ALD A; 2YB1 A; 4DSK A; 4F5N A; 4RQM A; 4GC7 A; 4DQP A; 5AKI A; 1SIJ A; 4LZG A; 3I1Y A; 1XO1 A; 4Y2V A; 5J8Y A; 1OXJ A; 2FPL A; 5KAI U; 4G3I A; 1S77 D; 2W04 A; 3H7I A; 3I76 A; 4IL6 U; 1X9S A; 2KK0 A; 2IBK A; 3M1Y A; 1C7Y A; 5KT4 A; 3NVW A; 1KW4 A; 4RPX A; 2NV3 A; 4QNL A; 3OGU A; 3SEI A; 4ECQ A; 3MFH A; 2ASL A; 4QZD A; 1JUD A; 5ALM A; 2KP7 A; 4UQG A; 1PVR A; 1S0N A; 1RXV A; 5KFK A; 2W8L A; 4LJX A; 1S10 A; 5ALU A; 3HRD D; 8ICY A; 1N56 A; 3RB3 A; 1KL9 A; 4OCZ A; 4F5O A; 1A76 A; 3D2N A; 1PK1 B; 2G5H B; 2XVT A; 2E3T A; 5J0X A; 3GDX A; 8ICG A; 2EAN A; 1TAU A; 3N7S C; 2AGQ A; 5ALG A; 1NK8 A; 1D8Y A; 1FFU A; 3RB0 A; 1PVQ A; 1UA1 A; 4M9H A; 4M47 A; 4I2A A; 3ZI4 A; 4KLS A; 2K8A A; 2ZTE A; 2EAM A; 4OJL A; 1B22 A; 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