The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
CQEANYGALLRELCLTQFQVDMEAVGETLWCDWGRTIRSYRELADCTWHMAEKLGCFWPNAEVDRFFLAVHGRYFRSCPIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the human receptor activity-modifying protein 1 extracellular domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Receptor activity-modifying protein 1
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| molecule tags |
Protein transport
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
29
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| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3N7R C; 2YX8 A; 3N7S C; 2XVT A; 3AQF A; 3AQE A; 3N7P D; #chains in the Genus database with same CATH topology 4O3M A; 4XUS A; 3KKA C; 5AI6 A; 2ZIW B; 2WF6 A; 2W9C A; 1S77 D; 3BZC A; 3TAC B; 2PI4 A; 1X9S A; 5AIC A; 1SKR A; 2JZB A; 4QWB A; 4YMN A; 1L7P A; 2W3R A; 4J9L A; 1PK1 A; 1ZQU A; 4RQ5 A; 2EAO A; 5KFZ A; 4YR0 A; 3HT3 A; 1SV0 C; 3HKZ F; 3GIJ A; 1XSP A; 3H4D A; 1NJZ A; 3RH5 A; 4I27 A; 3MR2 A; 3C28 A; 3B0Y A; 2HHS A; 2FPK A; 2IOF K; 2BCR A; 2QB1 A; 4GFJ A; 4E0D A; 2YX8 A; 3RRH A; 7ICP A; 1JMS A; 4C8O A; 4KLE A; 9ICB A; 3MAB A; 1ZQM A; 4P0Q B; 4EEN A; 4RQ4 A; 4KMO B; 1DGJ A; 5KL8 B; 4PH5 A; 1XNS A; 4F4W A; 5AHX A; 7ICN A; 2PFP A; 3SZ2 A; 5KFG A; 5JU5 A; 3BZK A; 4UAZ A; 2MA1 A; 5GTI U; 4P0P A; 5HMM A; 4LZG A; 5DLF A; 3M6K A; 1PVQ A; 4JV0 A; 1RXV A; 3GV7 B; 5D46 A; 3RJG A; 1L8O A; 5J0Y A; 3T5J A; 5KFB A; 7ICF A; 5AKY A; 4PJ0 U; 4ECT A; 4NLZ A; 1WYG A; 1KFD A; 4KN4 A; 5AKX A; 4YVZ A; 5KFK A; 4EZ6 A; 5KFI A; 1RM6 C; 2R8G A; 5KNI A; 4DS4 A; 4FE3 A; 1CEZ A; 3DEE A; 4O5C A; 2AGP A; 3QU2 A; 5KG6 A; 5JTI A; 5ALG A; 5IIK A; 4EEY A; 4BJQ A; 1ZQR A; 4DSL A; 3KHR A; 1ZOL A; 4UAU A; 1VLB A; 2LKY A; 9ICM A; 3E0F A; 5KFW A; 4OJO A; 4UAS A; 1DK3 A; 4EX6 A; 3KOO A; 2BQU A; 1DXS A; 2XY7 A; 1Z1V A; 4F3O A; 2YMP A; 5KTQ A; 3THV A; 5BOL A; 4FS1 A; 2W7P A; 3PX0 A; 3JPN A; 4P4M A; 1ED1 A; 3K75 D; 5KG5 A; 3H8W A; 2KKP A; 4QWD A; 3PX6 A; 4F2R A; 1XC9 A; 3KHL A; 5T14 A; 1V85 A; 1C20 A; 3B0X A; 5DQI A; 2JH7 A; 3ISC A; 2WB1 C; 5IIJ A; 2XID A; 4B9N A; 5KFV A; 2ZIX A; 1ZQY A; 3IDW A; 5KFT A; 2AXT U; 2JR5 A; 2ZIV B; 3Q8R B; 2ASJ A; 1S0V A; 3M8R A; 5DQH A; 3KZI U; 3LVW A; 2KN7 A; 2C22 A; 3NS1 A; 2Z7J A; 5DG9 A; 2E8P A; 1L3U A; 3HPO A; 2QB0 B; 2H3F A; 4F5N A; 2BDP A; 4NLN A; 4C0Z A; 3CP8 A; 3QX7 A; 4LJX A; 1WCN A; 4BXO B; 1VJ5 A; 9ICE A; 2JHD A; 4C8L A; 4I2H A; 3C2L A; 4PHP A; 4CCH A; 7ICR A; 4F4Z A; 5AKZ A; 1RZT A; 1JRP A; 5ALZ A; 2V9W A; 2LYA A; 2G09 A; 4J9Q A; 2ZTE A; 2W9M A; 8ICG A; 1B43 A; 4M04 A; 4KLU A; 9ICQ A; 1KSP A; 1N56 A; 2OH2 A; 4I2A A; 4HYK A; 2W04 A; 2HOQ A; 1UT8 A; 2C28 A; 9ICP A; 1NK9 A; 5L1M A; 1L7O A; 5KT2 A; 1N5X A; 4RQ2 A; 8ICR A; 3RJI A; 5AM5 A; 4OCZ A; 4B9T A; 4EYH B; 4K4I A; 1X9W A; 4B9S A; 4O3R A; 3I28 A; 2KG5 A; 5KL1 B; 2GLE A; 3QUT A; 3SAH A; 2F44 A; 1U9L A; 2KVS A; 2WF5 A; 5EWG A; 2PMZ F; 7ICT A; 2QAR A; 1RXW A; 5AK3 A; 1SKS A; 4ECY A; 4DOA A; 2EQY A; 3UM9 A; 3H0L B; 1Y88 A; 1U45 A; 3HJE A; 1KDH A; 5KT4 A; 2FLL A; 1ZJN A; 4QW8 A; 4DQP A; 3NTU A; 3L4P A; 5DG7 A; 2HHT A; 3PX4 A; 2E3T A; 5J2J A; 2RQ5 A; 1L3T A; 5J8Y A; 1NK7 A; 2OWO A; 8ICH A; 4P2H A; 2JGA A; 2ZUC A; 4M9H A; 7ICK A; 3MGH A; 1MQ2 A; 4TQR A; 3GIL A; 3M6Z A; 3IN5 A; 3AU6 A; 4KMU A; 2KV2 A; 5J2E A; 2ZUD A; 3PST A; 5HR6 A; 5J29 A; 5CR0 A; 3FAH A; 2A3V A; 3PO5 A; 3L5K A; 3ICX A; 2J6U A; 3F2B A; 4Z6D A; 1NK5 A; 4B9L A; 2ODG A; 2HBK A; 1T3Q A; 2DKZ A; 4YD1 A; 1J2N A; 1COK A; 5ALI A; 4K4H A; 2HCF A; 3OTQ A; 2VKQ A; 5J0P A; 5AKJ A; 1V38 A; 9ICG A; 9ICV A; 3Q8K A; 3Q8L A; 2LYH A; 4IRC A; 5AKG A; 4F92 B; 4GXK A; 1VDV A; 2YTU A; 1DK2 A; 1ZQP A; 3BS5 B; 3KFU F; 3UXO A; 5ALD A; 4B6J A; 5AI9 A; 3WK5 A; 3UMC A; 5TZV A; 8ICP A; 5AM0 A; 4EBC A; 2AGO A; 1SL1 A; 5F9L A; 2UVU A; 2WAQ F; 2F8L A; 3OSN A; 2LYB A; 3RJF A; 5HP4 A; 4UB4 A; 1QH9 A; 4MF2 A; 1K1S A; 1D8Y A; 3M9N B; 3RTV A; 4PL2 A; 1C7Y A; 2F2A B; 4IQW A; 4F4K A; 1KN5 A; 4Q45 A; 5DB8 A; 4DFJ A; 3OJS A; 3QYP A; 1RQL A; 3QU4 A; 1V97 A; 3OHB A; 1ZRM A; 5EE3 A; 4I28 A; 2OHF A; 9ICI A; 2FE9 A; 4R66 A; 4KX5 A; 4M0A A; 8ICL A; 1MC8 A; 2E5S A; 5GTH U; 2F1H A; 1COO A; 2RDJ A; 1ZD3 A; 2K89 A; 2XO7 A; 2BPG A; 5IIM A; 4IRK A; 4FBU A; 2WTF A; 4J9S A; 7ICU A; 5B5E U; 3V7J A; 1WUD A; 9ICA A; 1B0X A; 3JPO A; 1O08 A; 4OO1 J; 5J0O A; 3RBD A; 3Q8S B; 5CA7 A; 4EBD A; 2KD1 A; 1UHU A; 3T79 A; 4RQ8 A; 1SGG A; 3MFI A; 4F4X A; 1XSN A; 2DUY A; 3V7K A; 4DQR A; 5DB9 A; 5KT3 A; 3MGV A; 2A1J B; 3AM9 A; 3PW7 A; 2HOI A; 1UQV A; 3O0F A; 1SZP A; 3V6K A; 4KTQ A; 3T5K A; 2BQ3 A; 1ZQQ A; 4RQ6 A; 3VCB A; 2Q4T A; 5DG8 A; 3QXG A; 1ZET A; 1LVH A; 4M9G A; 1XO0 A; 3F5A A; 2DBY A; 3SAG A; 2F3N A; 2BPF A; 3HX0 A; 2WF9 A; 5EOZ A; 1QTM A; 3D2S A; 4O9M A; 3TQ1 A; 2YB4 A; 4F5R A; 7ICO A; 2ZIU B; 3BQ1 A; 5BPC A; 3RJH A; 3RJK A; 3C5F A; 3GIM A; 4PPX A; 5AM3 A; 1U48 A; 4MFF A; 2EDU A; 2L5Y A; 3TAN A; 4PGY A; 2BHN A; 4C4R A; 4OJ5 A; 4IS7 A; 2HI0 A; 4RPY A; 4YQW A; 4IL6 U; 3NRW A; 2EZZ A; 9ICU A; 4Y2Q A; 4EEK A; 1Q3U A; 3PVX A; 4Y2X A; 4QWE A; 2D6F C; 4Z6C A; 1A6S A; 1H38 A; 4ECR A; 4I29 A; 1TAU A; 4KLJ A; 2R8J A; 3ZDE A; 1IM4 A; 3QU5 A; 2M0N A; 4C8N A; 1NKC A; 2HHW A; 5J0X A; 1UA0 A; 5J0S A; 4UAY A; 4DSE A; 2KVC A; 4ECX A; 3AUO A; 4M9J A; 2K4H A; 4KX3 A; 1TAM A; 4RNO A; 3ZDC A; 5AKI A; 5DBA A; 3V72 A; 4YD2 A; 4DLE A; 1JN3 A; 4KLO A; 1L3V A; 5AKL A; 5CP2 A; 1X40 A; 3LWL A; 3DV9 A; 4DF8 A; 1Z3E B; 1F0M A; 4YN4 A; 3OSP A; 4QIW C; 3ZDD A; 2HHU A; 8ICK A; 2ASD A; 4QZ9 A; 3HRD D; 1ZXI A; 4I2E A; 3F53 A; 4BUG A; 4UB5 A; 3WKB A; 2OEH A; 1ZQD A; 2IA6 A; 4FZN A; 3AQF A; 4DL7 A; 1KTQ A; 5JRT A; 1SIJ A; 2W43 A; 2KK0 A; 3C21 A; 2V4Q A; 3RJE A; 2ZIW A; 1CRX A; 4F50 A; 2K8B B; 1BPX A; 3PY8 A; 4NV0 A; 3MDC A; 3QE9 Y; 2BDU A; 2NO5 A; 4O5E A; 4CF5 A; 1T94 A; 2XVT A; 5CEH A; 2FI1 A; 2Y9T A; 2W9B B; 4C80 A; 3NUQ A; 1BPD A; 3HW8 A; 3WK6 A; 5KT7 A; 5KFN A; 3MR5 A; 1Q8K A; 5KFL A; 2ZUB A; 5J0U A; 2G0A A; 1SB3 C; 2AQ0 A; 4P4O A; 2BCS A; 2KHV A; 5DBC A; 4B9U A; 5J0R A; 4DSF A; 4DEZ A; 1YZ7 A; 4M9N A; 4JB3 A; 1ZD5 A; 4YMM A; 2YML A; 2BZF A; 1XU4 A; 4NM2 A; 3N7P D; 4P0Q A; 2HHQ A; 3GII A; 1L8L A; 3ETL A; 2P35 A; 4UAV A; 3SMV A; 4RQ7 A; 3IM1 A; 3G6X A; 5EE1 A; 1TE2 A; 2XIC A; 1NJW A; 3NGD A; 1HJP A; 5K4L A; 1QQ5 A; 3KHG A; 2I9G A; 2JV3 A; 2W8K A; 3N7R C; 2N1R A; 2E8N A; 1ECW A; 3K1Z A; 3QNM A; 3C1Z A; 2IHN A; 2JEF A; 3RB0 A; 1TKD A; 4YXJ A; 4QZA A; 4NLG A; 1BNP A; 3BQT A; 2WFA A; 4PL1 A; 4Y2T A; 4QZ8 A; 2KSO B; 4R65 A; 5J2A A; 4QZI A; 1JAL A; 4QZE A; 5CRX A; 2YB1 A; 3KBB A; 5J2G A; 3EUB 2; 2K60 A; 4LZD A; 2NV3 A; 4DOB A; 2A19 A; 3PR4 A; 2P66 A; 1NJY A; 1ZQH A; 3PSP A; 4JMU A; 1S10 A; 3TAQ A; 1JIH A; 2Y0S F; 1KL9 A; 1ZQZ A; 2R18 A; 3SAF A; 1QSS A; 3PW4 A; 2HBL A; 5ALQ A; 3ZD8 A; 4G9B A; 1BPZ A; 5KAI U; 3Q8M A; 1LKY B; 3R9K A; 4OJP A; 2Y9U A; 3AN1 A; 4KLT A; 1RQN A; 2HHX A; 2KP7 A; 4MFA A; 4O3P A; 2ZTC A; 5ALO A; 1FFU A; 4ED3 A; 1IG6 A; 1F5S A; 2W9A A; 8ICY A; 1LB2 B; 5KG7 A; 3OJU A; 5ALK A; 4IC9 A; 4YFK A; 2K4P A; 4ACO A; 3RJJ A; 2ES6 A; 2ZIV A; 1L5U A; 3IG5 A; 3F2C A; 2OXO A; 3RFA A; 3IP4 B; 1ZRN A; 1X42 A; 2ISO A; 3KZX A; 4GXJ A; 2I6X A; 3JPP A; 2AJQ A; 3KHH A; 8ICI A; 5ALX A; 2IHM A; 3WKC A; 3CW2 C; 4NL9 C; 4DL6 A; 4DSK A; 4IR1 A; 4RZR A; 3T3F A; 1Z4O A; 2B0C A; 2DPI A; 2PI5 A; 1SXD A; 1JI7 A; 4NXZ A; 2J6S A; 2PFN A; 5KG3 A; 5B66 U; 1QSY A; 1U49 A; 4ECQ A; 1SL2 A; 3V6H A; 2JEJ A; 4YXM A; 4I2F A; 1RDF A; 3L3F X; 1PVP A; 3ALR A; 1NK0 A; 5CHG A; 1ZQB A; 2ZJ8 A; 2HVI A; 4ELT A; 3H8J A; 3ONN A; 1S76 D; 5HR7 A; 3GFK B; 3HWT A; 3BS7 A; 3BDP A; 2HW3 A; 4KLM A; 2AU0 A; 4YR2 A; 5DDY A; 1XSL A; 2MSN A; 4C8M A; 5ALU A; 1RYS A; 3F5E A; 2DKX A; 2VJ4 A; 4UAR A; 3WKA A; 2MU2 A; 9ICS A; 4KLI A; 2NO4 A; 5ALP A; 4J03 A; 1ZQW A; 2JH1 A; 3MDA A; 4BWM A; 4RNM A; 1S5L U; 3SQI A; 7ICI A; 2UVV A; 3U26 A; 2GWS A; 2JRZ A; 3NVY A; 4C4S A; 2FLN A; 1D9D A; 2LI6 A; 2UVR A; 4UBB A; 3EZ5 A; 2W03 A; 2IBK A; 5ALL A; 1ZQF A; 5KFH A; 1WWV A; 3G6Y A; 2I1Q A; 1QCK A; 2VA3 A; 8ICM A; 3LVV A; 2WB1 F; 3RBE A; 3M1Y A; 4F4Y A; 2P6R A; 1QQ7 A; 5KFC A; 3E58 A; 2WAQ C; 4IQT A; 3H8M A; 4YMO A; 4GC7 A; 7ICQ A; 1SWV A; 2CXY A; 9ICX A; 5ALT A; 4Y2Y A; 4I2D A; 4J9P A; 3K4G A; 4DFD A; 2DWQ A; 3QEB Z; 1N2X A; 4RPX A; 5EWF A; 1XO1 A; 4FZL A; 5AKK A; 8ICU A; 2H3Z A; 2XGP A; 1FFV A; 2Y1I A; 3ORY A; 4ELV A; 4KLL A; 4B9M A; 2YN4 A; 2NYV A; 2ASL A; 2XI9 A; 4RU9 A; 8ICZ A; 5J2I A; 4DQS A; 3CYM A; 4ZOH C; 3BQ7 A; 8ICW A; 5AI8 A; 4KLF A; 3QU9 A; 4IQU A; 1S9F A; 2BKE A; 4C7Y A; 3NAS A; 2AQ4 A; 4DO9 A; 2YY6 A; 4A8E A; 4GXI A; 5DB7 A; 3BS5 A; 4M6W B; 4ECU A; 3IV6 A; 4PHA A; 3EPG A; 4CGZ A; 1FEZ A; 3S6J A; 4F93 B; 1X2I A; 4ED7 A; 7ICJ A; 4FS2 A; 2IMW P; 3KTQ A; 1L7N A; 2FLP A; 2ESE A; 1PVR A; 9ICO A; 9ICW A; 1ZQS A; 2ATL A; 1A77 A; 3NRZ A; 4DL5 A; 4CDG A; 4GC6 A; 2JXJ A; 1J2M A; 1JUD A; 3QUC A; 4NY8 A; 4QJF B; 4OJL A; 2KHQ A; 2FPL A; 5KT5 A; 7ICS A; 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1D8B A; 5AI5 A; 2W3S A; 4K4G A; 1Q46 A; 5C5J A; 4RQ1 A; 3C23 A; 1L3S A; 2XC9 A; 3MBY A; 4QWA A; 4FZM A; 4DSJ A; 1S0O A; 1T4G A; 4I2G A; 2H3I A; 1N5W A; 3MR6 A; 2YMQ A; 4Y2U A; 4MEX A; 3RB4 A; 4I2C A; 1ZQE A; 4Q8E A; 2HMX A; 4QZG A; 3CNH A; 2HBM A; 4PHD A; 2GOL A; 2BPC A; 2ZXH A; 4LVS A; 1KKX A; 2FMP A; 3SEI A; 4NLK A; 4PHE A; 1ARO P; 4C4T A; 5AM2 A; 3GDX A; 1B4F A; 3SD7 A; 4CF4 A; 2G5H B; 3C29 A; 2G08 A; 3BJY A; 4NL9 A; 1S97 A; 1ZQJ A; 1KW4 A; 4QZF A; 5F9N A; 1T7P A; 2GH1 A; 2K4I A; 2EAN A; 1NNL A; 3SV4 A; 3H40 A; 4ELU A; 3HKZ C; 3JPS A; 3RR8 A; 1ZJM A; 1TK0 A; 1KQQ A; 2K4E A; 3K1R B; 1QLN A; 5HNK A; 4DL2 A; 5AIB A; 4TQS A; 3WKD A; 3OHA A; 1BPY A; 5J2K A; 1N48 A; 4QZD A; 4OJ6 A; 2OCE A; 2KMD A; 4EYI B; 3F2D A; 2W55 A; 5KFS A; 4M9L A; 1X6I A; 2MUT B; 4PGQ A; 1NI3 A; 3TFR A; 2K8C B; 5J0Q A; 5ALS A; 5HHI A; 2ISP A; 9ICR A; 1NZP A; 5AKH A; 3RF9 A; 4KLS A; 1NJX A; 1SWW A; 3MC1 A; 3V6J A; 5ALE A; 3UMG A; 3I76 A; 4RUC A; 2FJ6 A; 4ED1 A; 2BCQ A; 5KFP A; 7ICE A; 3HIL A; 2KZ3 A; 4ED0 A; 1ZQO A; 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