The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
CQEANYGALLRELCLTQFQVDMEAVGETLWCDWGRTIRSYRELADCTWHMAEKLGCFWPNAEVDRFFLAVHGRYFRSCPIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the human receptor activity-modifying protein 1 extracellular domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Protein transport
|
| molecule keywords |
Receptor activity-modifying protein 1
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| total genus |
29
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| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2XVT A; 2YX8 A; 3AQF A; 3N7P D; 3N7R C; 3AQE A; 3N7S C; #chains in the Genus database with same CATH topology 3UXN A; 5DKW A; 2G07 A; 3V72 A; 2M9N A; 3K75 D; 5H2F U; 4WJ3 B; 3N28 A; 4YQW A; 5KG3 A; 2XGQ A; 5KFU A; 9ICC A; 2AXT U; 4OJL A; 3UPQ A; 3RR7 A; 1KQQ A; 4DQS A; 2K8C B; 2AJQ A; 1D8L A; 5DQG A; 3IN5 A; 5DB9 A; 1PK3 A; 4F5R A; 3QUC A; 4YCX A; 1L3V A; 2LMR A; 1JRO A; 1TV9 A; 3Q8L A; 3SEI A; 4KLI A; 2IBK A; 3TFS A; 2OM6 A; 9ICG A; 5KT7 A; 4RQ7 A; 1SWW A; 4FE3 A; 2F8L A; 3TKA A; 2Z7J A; 2W3S A; 3H8M A; 1MSW D; 4FO6 A; 3ZDE A; 2FI1 A; 5J0Y A; 3V7K A; 8ICC A; 3TI0 A; 5ALU A; 1KN5 A; 2YMM A; 4F4Y A; 4MFC A; 4R8U B; 2WB1 F; 3SV4 A; 3N7P D; 3GII A; 4F71 A; 2RP5 A; 1XSL A; 3WU2 U; 4QWD A; 3MBY A; 2PI4 A; 1ZQA A; 4UAU A; 1B43 A; 2DKX A; 4RU9 A; 3QU2 A; 3JPS A; 2LYH A; 2ZIX A; 5AKL A; 5J2I A; 3WK7 A; 1URJ A; 2C28 A; 2DKZ A; 2KSO B; 5ALW A; 3PSP A; 5III A; 5DG9 A; 2HOF A; 3H7I A; 3J81 j; 4QW8 A; 4QJF B; 1JMS A; 2AGQ A; 5J2J A; 5CR0 A; 5KFJ A; 2K8B B; 4GC6 A; 3C5F A; 2YN4 A; 4PHD A; 3TAD C; 3MR3 A; 4NLC A; 1QSL A; 1MC8 A; 3PML A; 1TAQ A; 1NK9 A; 9ICM A; 3H4B A; 5DLF A; 4EBD A; 1NJW A; 4Z6D A; 3F2B A; 3LDA A; 5KFF A; 4DCC A; 2QAR B; 1ZJN A; 4UAW A; 5AKZ A; 1B4F A; 1Q3U A; 9ICN A; 5G5H A; 2AU0 A; 1BNP A; 3DV9 A; 5ALL A; 1J97 A; 1WYG A; 1TE2 A; 4RNO A; 5AIC A; 1OXJ A; 4BXO B; 5KT4 A; 3RBD A; 1ZQP A; 4FFD A; 2BDU A; 1VLB A; 9ICB A; 2ZIW B; 4DEZ A; 4EEN A; 2NO5 A; 5J0W A; 2J6U A; 2N1R A; 5ALT A; 5AIB A; 2FMQ A; 2C22 A; 2HI0 A; 2EZY A; 3JPO A; 5J0T A; 2HHS A; 2EQY A; 1IV8 A; 2XC9 A; 3PO5 A; 3AU6 A; 1N61 A; 4BWJ A; 8ICX A; 3GFK B; 1UPH A; 5ALI A; 2EZX A; 2ZUD A; 4Y2X A; 2J6S A; 3SQI A; 2EZZ A; 1NJY A; 5L1M A; 7ICI A; 1ZQQ A; 3AQF A; 3ZI4 A; 2HHQ A; 3HP6 A; 1KRP A; 2G5I B; 4RNN A; 2KOB A; 4PJ0 U; 3KHH A; 3BQ1 A; 2W8K A; 4UW9 A; 3H0M B; 3RJF A; 5J2C A; 2LYB A; 2JEG A; 4UB6 U; 4RQ0 A; 5EWF A; 1BPZ A; 1XSP A; 3BZC A; 3EPI A; 3T5L A; 5IIL A; 5ALK A; 3V6J A; 5CB1 A; 5ALN A; 2YQE A; 4EEL A; 2KV2 A; 1DRG A; 4USA A; 3PW5 A; 4M6W B; 5K4L A; 3C29 A; 3BQ2 A; 1RZT A; 2FLL A; 2KJ5 A; 4UB8 U; 2Y1I A; 1YZ7 A; 2WAQ F; 3F2C A; 2PFN A; 7ICG A; 2PMZ C; 2DF4 B; 3IM1 A; 4BDP A; 3AQE A; 4NWI A; 1T8E A; 1KEJ A; 2HHX A; 4C7Y A; 4Q45 A; 3RAQ A; 4P0P A; 4UB3 A; 5KFD A; 4DF8 A; 1XO0 A; 3K1Z A; 1BPB A; 4O5K A; 2H5X A; 2KMD A; 4OJP A; 2YX8 A; 3RTV A; 3QYP A; 4KN7 A; 3ISC A; 2XCA A; 1SZP A; 4J9L A; 4DF4 A; 5KFI A; 1SL0 A; 2WF8 A; 1JN3 A; 4PGQ A; 2F1J A; 4DSF A; 1IIP A; 3WKD A; 1PUZ A; 2BPF A; 2NRT A; 2HBJ A; 3C5G A; 9ICV A; 2R8K A; 3KTQ A; 4OCZ A; 1CI4 A; 1O08 A; 5J0U A; 4GXK A; 1RXW A; 4KLL A; 5KFB A; 3RRH A; 3MR5 A; 3OJS A; 1JXL A; 2IOF A; 4M9H A; 1GO3 F; 3KOO A; 7ICQ A; 4PH5 A; 3PO4 A; 3Q8Q B; 4F93 B; 2PI5 A; 1S5L U; 2G06 A; 4NLB A; 1ZD5 A; 1A0P A; 4B6J A; 1NK5 A; 1N5X A; 5IIJ A; 5CA7 A; 5J0Q A; 5J0P A; 3OSP A; 2L5Y A; 5AKJ A; 4QW9 A; 2AGP A; 3NAS A; 7ICU A; 2Q4T A; 3HT3 A; 5IIN A; 4JV0 A; 4DFM A; 3KD3 A; 2YY6 A; 7ICV A; 5KL8 B; 1X6I A; 9ICR A; 4FZL A; 1Z00 A; 5J0O A; 3WKA A; 2O6K A; 3SMV A; 8ICM A; 5TZV A; 2W04 A; 2KP7 A; 3T79 A; 4JK1 A; 4BXO A; 4UAR A; 5KT3 A; 2BQ3 A; 2H3Z A; 1RQN A; 3WKE A; 9ICP A; 1N63 A; 1MQ3 A; 4Q44 A; 4R66 A; 2E3T A; 4DO9 A; 1S0N A; 5ALR A; 2OCE A; 4DSK A; 4LZG A; 1U47 A; 4RT2 A; 4J9S A; 5ALJ A; 4C8M A; 5J2H A; 3SV3 A; 5CEH A; 3AL0 B; 1F0M A; 1PVR A; 2PFQ A; 3H40 A; 2G0A A; 1NK6 A; 4EX7 A; 5ALV A; 4O0I A; 3SI8 A; 1X6J A; 1V97 A; 3L4P A; 2ZUC A; 4I27 A; 5C0Y A; 4Y2S A; 1DGS A; 1ZQJ A; 7ICH A; 2BCR A; 3RH6 A; 4NM2 A; 4XUS A; 5TIS U; 4UAY A; 3F5E A; 3ZDC A; 4KIT B; 2W9B B; 1SKW A; 2UVU A; 4J9P A; 8ICZ A; 1HUO A; 5AIA A; 2VKQ A; 3D6J A; 1ZQD A; 3IV6 A; 4RQ5 A; 3WK6 A; 2YB1 A; 4MFF A; 2A3V A; 4IRD A; 5HNK A; 4J03 A; 4G3I A; 2E8P A; 4OJ5 A; 2C2R A; 1V85 A; 1L3S A; 1ZQT A; 4J9K A; 5DG7 A; 9ICQ A; 5KFW A; 1WWV A; 4TQS A; 4P0Q A; 4LJX A; 9ICS A; 5EE0 A; 3Q8S B; 1PK1 A; 5KG7 A; 1DK3 A; 3Q8K A; 1N56 A; 3IDW A; 4DS4 A; 4RNM A; 1ZD2 P; 2KZM A; 2HOI A; 3GV7 B; 2DGZ A; 2JEJ A; 4QZC A; 5DGB A; 4F5O A; 1XO1 A; 3K4G A; 1U9L A; 2WF7 A; 5L1I A; 8ICT A; 2ESE A; 2V4R A; 4DLE A; 7ICE A; 4KLG A; 3RB4 A; 4IQT A; 4KLO A; 3RB3 A; 1M6Y A; 3U26 A; 2HDO A; 1L7O A; 4P4P A; 2WFA A; 4R64 A; 1B22 A; 4I2E A; 1D9F A; 2IOF K; 1BNO A; 2ATL A; 4ELT A; 4I2B A; 4RQ3 A; 2KG5 A; 2AQ4 A; 2EH9 A; 4QZG A; 4I2A A; 2KKP A; 4PL1 A; 4M9L A; 2NRZ A; 2BGW A; 2KIC A; 3AMZ A; 1Y88 A; 3ISB A; 3PSF A; 8ICH A; 1UA0 A; 1HIW A; 1IG6 A; 1X66 A; 4IQU A; 1NI3 A; 2GOL A; 3CNH A; 2MAX A; 2JZB A; 2KE7 A; 2WB1 C; 2ZIV B; 5BOM A; 1L7M A; 3A0H U; 3QX7 A; 5KAF U; 2G08 A; 5ALD A; 4ELU A; 3ZD9 A; 1P7D A; 5C5J A; 3HX0 A; 3V6K A; 1HJP A; 5HHI A; 1RG6 A; 4PGY A; 2NYV A; 3ZDA A; 5L1L A; 2R8J A; 4QZ9 A; 5KFP A; 4QWA A; 2ASJ A; 1JAL A; 2G5H B; 8ICN A; 1L3T A; 4GXJ A; 8ICI A; 9ICW A; 3NVV A; 5ALO A; 3GV5 B; 5CJ7 A; 1MN8 A; 2KD1 A; 3E58 A; 4EEY A; 4ECQ A; 4Y2Y A; 1DGJ A; 3TAQ A; 2K60 A; 4KX3 A; 3M6K A; 4F4Z A; 4CCH A; 5KFE A; 5DB7 A; 1N62 A; 3RJI A; 4DOC A; 4K4H A; 4QZB A; 2Y9U A; 5DB8 A; 4K4I A; 3KKA A; 5AHX A; 4C8K A; 1LV5 A; 3QU5 A; 2HHU A; 2DFL A; 1XC9 A; 3BQ0 A; 2KVC A; 1ZQG A; 2HHT A; 1D8B A; 5EE9 A; 4NLN A; 4CF3 A; 4FBU A; 4ECU A; 4C4T A; 1ZQY A; 3PX0 A; 3BDP A; 2BCS A; 1K1S A; 2W3R A; 4C80 A; 2I6X A; 3HKZ C; 9ICL A; 2W9M A; 3O0F A; 5D49 A; 2YMP A; 3B0Y A; 4J9Q A; 2JEF A; 1QSY A; 5KTQ A; 1T7P A; 3VC8 A; 3WK5 A; 1T3Q A; 2IHN A; 5G5G A; 1QSS A; 3UMB A; 5A0L A; 2F2A B; 2XID A; 2E8M A; 3V6H A; 2Q0Z X; 5KT2 A; 1TAU A; 3KFU F; 4FZM A; 1S97 A; 5J2A A; 2KNJ A; 3ICX A; 5AKH A; 2ALZ A; 8ICY A; 3NS1 A; 1TK5 A; 4FS1 A; 1ZXI A; 3RB0 A; 3RBE A; 5AK3 A; 2JH7 A; 2ASD A; 4NY8 A; 5CP2 A; 2BKE A; 5EE1 A; 4YFK A; 2WAQ C; 4F3O A; 5KFX A; 1J2N A; 3HJE A; 7ICJ A; 1O03 A; 3PV8 A; 3T3F A; 3SYZ A; 1EXN A; 4JV2 A; 7ICN A; 1F5S A; 3EYZ A; 1NK0 A; 4LVS A; 4Y2V A; 4Y2T A; 5KG5 A; 1ZQL A; 7ICT A; 1OUQ A; 2D8C A; 2I9G A; 3EUB 2; 4UB1 A; 2MUT B; 5KFT A; 1SXE A; 4DSI A; 1ZRN A; 2P35 A; 2JGA A; 5ALE A; 4HAI A; 4EX6 A; 1BPY A; 1L7P A; 2VJ4 A; 4DL6 A; 4DFD A; 3GDX A; 3RRG A; 2ZIV A; 4YR0 A; 4JV1 A; 3HW8 A; 4EBC A; 2V4Q A; 2A19 A; 1QQ5 A; 1PK1 B; 3N4M B; 3FYH A; 4QWE A; 4PZN A; 1SV0 A; 1QLN A; 3A0B U; 4UQG A; 4F8R A; 1NK8 A; 4EEK A; 1Q8K A; 5AI9 A; 5AKI A; 4KLM A; 4QWB A; 1U4B A; 2K4I A; 3NTU A; 8ICQ A; 3R9K A; 2ISP A; 5J2E A; 3TFR A; 5AKE A; 1HEK A; 3LK9 A; 4UAS A; 4IRK A; 5BOL A; 4KLJ A; 8ICL A; 2HMX A; 2R8I A; 1VDV A; 2FPK A; 5DBC A; 1UHU A; 4RQ2 A; 4IRC A; 5F9L A; 1NK4 A; 1UCV A; 1ARO P; 1ZQC A; 2W11 A; 1S9F A; 3M8S A; 4QZA A; 5J2F A; 2BQR A; 4NM1 A; 5DLG A; 3MFI A; 1A77 A; 1K5O A; 5CWR A; 3WK4 A; 2K4E A; 1WCL A; 3H8J A; 4XQ8 A; 4F2S A; 4KLQ A; 4I2H A; 5KFN A; 4YD1 A; 4C8L A; 4RUC A; 1CUK A; 4O3R A; 3UXO A; 5AKG A; 4DL2 A; 3M7D A; 2AGO A; 5AM2 A; 4AYB F; 3JPQ A; 1BGX T; 4TUP A; 3C28 A; 3MC1 A; 9ICI A; 1XU4 A; 5KFG A; 8ICW A; 2ZJ8 A; 7ICK A; 1JIH A; 3PW4 A; 2W7P A; 3RAX A; 3PVX A; 3E2E A; 2NV3 A; 3QU9 A; 1D8Y A; 2FPM A; 3OJU A; 1FFV A; 4OJ6 A; 4JWN A; 5AKX A; 4YD2 A; 2WF9 A; 1Z1B A; 1X9W A; 5J0S A; 2E5S A; 1WCN A; 2FJ6 A; 1FIQ A; 3T5J A; 4J9M A; 1V38 A; 4UB2 A; 2IHM A; 4DQI A; 1ZD4 A; 1S0O A; 4BX9 C; 4YR3 A; 2ZIU A; 5AK6 A; 1BPE A; 3ZD8 A; 2BZF A; 5CHG A; 1X9X A; 4F72 A; 3PNC A; 2E8N A; 3PX6 A; 1S10 A; 9ICX A; 4BGD A; 4F5Q A; 3B9J A; 4FZN A; 5HHH A; 5KFK A; 2PFO A; 2KHQ A; 2G09 A; 1KBU A; 1RM6 C; 3PW2 A; 1ZQS A; 5DBA A; 1NNL A; 3PR5 B; 1X9S A; 3WK8 A; 4ECZ A; 2XVT A; 1MQ2 A; 1Z4N A; 5AKK A; 5KFA A; 5F3X B; 3M9N B; 2BHN A; 3CW2 C; 1U45 A; 2H3Q A; 5AI0 A; 3C1Z A; 2K8A A; 5KFZ A; 2QKQ A; 2QAR A; 2A1A A; 2P66 A; 3JPP A; 2ZTC A; 2IA6 A; 7ICR A; 5AKY A; 4B9V A; 8ICB A; 4KLU A; 4O3O A; 3TAD A; 1X2I A; 2B6G A; 5B5E U; 5DQH A; 2DWQ A; 3NUQ A; 3T5K A; 2PXI A; 2KK0 A; 2ZIW A; 5ALF A; 2W9C B; 1ED1 A; 2Y0S F; 4EYI B; 9ICO A; 3TAC B; 2BR0 A; 3JPN A; 2BCU A; 1RDF A; 1SL2 A; 5AI6 A; 2RDI A; 5EE3 A; 2I5H A; 2KN7 A; 8ICG A; 5JTI A; 4DFJ A; 1ZQV A; 2QLT A; 1SKS A; 4PPX A; 4YXM A; 1PVP A; 5JUM A; 3UMG A; 3E0F A; 8ICV A; 2ZTD A; 5ALS A; 3EWA A; 1JI7 A; 2KEY A; 4O3Q A; 2W54 A; 5KFO A; 2W7O A; 5J8Y A; 2XI9 A; 2XY5 A; 2GH1 A; 4UAT A; 4PHA A; 3MAB A; 3F2D A; 1COK A; 5KFH A; 3OPX A; 1NJZ A; 4DQP A; 2Y9T A; 4YMM A; 1C7Y A; 4CNQ A; 5HP4 A; 3KZX A; 5KFQ A; 3AU2 A; 3PST A; 2EAM A; 5HR6 A; 1BPX A; 8ICE A; 3MGV A; 3RR8 A; 1NJX A; 4M04 A; 4I2J A; 4MHV A; 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4DS5 A; 3QZ7 A; 2C2E A; 5ALH A; 5ALP A; 4ECR A; 3AM9 A; 7ICO A; 5E79 U; 2I1Q A; 4ECY A; 3UM9 A; 2ES6 A; 2LM1 A; 2HBM A; 2JR5 A; 3SR6 A; 1DOQ A; 2JH1 A; 7ICM A; 3DDH A; 2HVI A; 1LB2 B; 4QZD A; 1COO A; 1B0X A; 5KT6 A; 2UVW A; 8ICF A; 1NZP A; 3FM9 A; 5KFY A; 5KNI A; 1SV4 A; 3BS5 A; 4YMN A; 1UT8 A; 1TVA A; 4KLT A; 4TUR A; 3RF9 A; 5JRT A; 2E1F A; 1UA1 A; 2EAO A; 4B9M A; 4KN4 A; 9ICK A; 1BVS A; 3BZK A; 4I2C A; 8ICJ A; 3M8R A; 3M1Y A; 1NKB A; 1ZET A; 1Q46 A; 4YG2 A; 4TQR A; 1L5U A; 4DL4 A; 4YN4 A; 3PZP A; 3ORY A; 4JWM A; 3SAG A; 2HCF A; 2YMQ A; 2PMZ F; 3FC4 A; 1TK0 A; 3MDA A; 1ZD3 A; 1ZRM A; 4C4R A; 1L3U A; 2LBO A; 3BS7 A; 1L8O A; 4UAZ A; 1FEZ A; 4CRX A; 2P6R A; 4I28 A; 2HOQ A; 4F91 B; 3MFH A; 5L1K A; 2ISO A; 5J2D A; 2WTF A; 3I28 A; 3G6V A; 4UAV A; 2K4H A; 3WKC A; 4MF8 A; 1X42 A; 1HUZ A; 3DEE A; 4NXZ A; 2DL0 A; 1ZQM A; 7ICP A; 4EYH B; 4KLH A; 3IP4 B; 4RQ6 A; 5KG0 A; 3IG5 A; 4NV0 A; 4F5N A; 2ZIU B; 3L3F X; 3OGU A; 4U7C A; 4NL9 C; 3C2M A; 1ZQF A; 2LM4 A; 4QZ8 A; 1N2X A; 1ZQR A; 4PL2 A; 2RHF A; 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