The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
CQEANYGALLRELCLTQFQVDMEAVGETLWCDWGRTIRSYRELADCTWHMAEKLGCFWPNAEVDRFFLAVHGRYFRSCPIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein transport
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| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Crystal structure of the human receptor activity-modifying protein 1 extracellular domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Receptor activity-modifying protein 1
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| total genus |
29
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| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3N7S C; 3AQF A; 2YX8 A; 3N7R C; 3AQE A; 3N7P D; 2XVT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5L1J A; 1NK6 A; 3BDP A; 3QE9 Y; 4K4H A; 1D9F A; 4DL3 A; 2ISO A; 5FP0 A; 4B9N A; 4DL7 A; 4GXJ A; 8ICC A; 1ZQZ A; 4UBB A; 4QZ8 A; 1RYS A; 1WWU A; 2CPR A; 1ZQQ A; 3F2B A; 1TKD A; 1PK3 A; 3SMV A; 2EAO A; 4BX9 C; 4Y2Q A; 4UAZ A; 2W9C A; 1VDV A; 4PHA A; 4QZE A; 3GV8 B; 5KFI A; 1ZD4 A; 4IL6 U; 5HML A; 5DQH A; 1RQL A; 5KFG A; 4DOA A; 4QW9 A; 2XCA A; 5J2D A; 3TI0 A; 2G5I B; 3E58 A; 3PR4 A; 1PVP A; 3FYH A; 1KW4 A; 5AK6 A; 3PV8 A; 4DSL A; 4MEY A; 3D2Q A; 3V7L A; 8ICB A; 1X6J A; 3TAP A; 4B9S A; 1ZYQ A; 5HHH A; 4YFK A; 5AIB A; 2YMM A; 2C2E A; 4E0D A; 1Z4N A; 4HYK A; 5L1L A; 4DQS A; 3I1Y A; 1PK1 A; 2KK0 A; 5J2A A; 3C2M A; 4R64 A; 1SZH A; 4F2R A; 2RLT A; 3LWM A; 2ALZ A; 2E3T A; 3QUQ A; 5DDY A; 4FS1 A; 5HP4 A; 1H38 A; 1Z19 A; 4P0P B; 2ZIW B; 2R8J A; 2KZZ A; 2DKZ A; 4NV0 A; 1ZQN A; 4IRD A; 1DGJ A; 2ZIU A; 7ICL A; 1S8O A; 3D6J A; 3PSP A; 4PGX A; 1B4F A; 2ES6 A; 3ISC A; 4NLZ A; 3SEI A; 2AH5 A; 2HBK A; 2PI5 A; 4FZL A; 3QU4 A; 3M8R A; 2I6X A; 1ZET A; 4BGD A; 1K1S A; 1XU4 A; 2JEJ A; 4DFJ A; 2QB0 A; 4QZG A; 9ICQ A; 2BCR A; 4IQW A; 4MF2 A; 1TK5 A; 3IDW A; 1ZQB A; 1NNL A; 2C28 A; 1BPY A; 4DFP A; 1X9M A; 5ALK A; 5GTH U; 4I2J A; 2M0N A; 2VKQ A; 3QYP A; 9ICV A; 4C80 A; 4OJO A; 4F4W A; 2ODG A; 1BVS A; 4RUA A; 2W8K A; 2I9G A; 3QUT A; 1PVQ A; 5KT5 A; 3ALR A; 1BPB A; 1T3Q A; 3AM9 A; 3C2K A; 4M04 A; 1S10 A; 1F44 A; 2F1I A; 2G06 A; 4Y2V A; 4M9N A; 2HBL A; 3V7J A; 4ECW A; 2J6S A; 5CEH A; 5KFO A; 1TAU A; 3HT3 A; 5J2G A; 1MSW D; 3WKC A; 3ICX A; 2AU0 A; 4NM1 A; 8ICW A; 4ELT A; 3NGD A; 1ZD2 P; 4FO6 A; 2W11 A; 4BJQ A; 4EZ6 A; 1KSP A; 3H4D A; 4TUQ A; 4KX3 A; 7ICG A; 5ALG A; 2G08 A; 3OHA A; 3MFI A; 1SKS A; 2K8C B; 2KIV A; 2E8M A; 3BQ7 A; 5ALW A; 3AN1 A; 4ECR A; 2J6U A; 2XGQ A; 2EAM A; 4Q43 A; 1Q3U A; 2ZUC A; 7ICT A; 4F50 A; 3RJF A; 5EE0 A; 2WAQ C; 5EE3 A; 2ZG6 A; 2FJ6 A; 1QQ6 A; 4KLS A; 5JTI A; 2BCV A; 5IIO A; 5J29 A; 5AM4 A; 3BJY A; 2HI0 A; 3N4M B; 3HIL A; 3SAG A; 9ICW A; 2GLE A; 3L3F X; 5AI9 A; 1ZQL A; 3KBB A; 3C1Y A; 1X9W A; 5KFN A; 5J2F A; 3MR5 A; 4XUS A; 4F72 A; 4DL6 A; 4RNM A; 5ALE A; 1V97 A; 3BS5 B; 1KFT A; 3OSP A; 4RZR A; 3C5G A; 9ICN A; 3SV3 A; 2ZIU B; 1XSN A; 1NKC A; 4ZOH C; 4I2G A; 4B9L A; 2V4R A; 2RRD A; 2M9N A; 1NK7 A; 5L1M A; 4BWJ A; 2VA8 A; 2LHT A; 1S77 D; 2HHV A; 8ICT A; 4J9N A; 2W9M A; 4US9 A; 2E8N A; 1FEZ A; 2BCU A; 2QB0 B; 1OW5 A; 1WYG A; 4F3O A; 5KG2 A; 4Y2J A; 3TAD A; 5DLF A; 2LM4 A; 4CNQ A; 4KLQ A; 3V7K A; 1N63 A; 5KAF U; 5IIJ A; 3MC1 A; 2YB1 A; 5AM1 A; 2LMR A; 2K4H A; 4UW9 A; 3Q8M A; 8ICI A; 3PSI A; 2KZM A; 2ASL A; 4B9U A; 1B0X A; 4NL9 C; 4F5N A; 1NJW A; 4RU9 A; 4F4Y A; 5AM3 A; 2GOL A; 3MBY A; 3BS7 A; 2H3Q A; 3I28 A; 4QZI A; 4F91 B; 2UVU A; 4ECT A; 4DS4 A; 5C0Y A; 3K75 D; 5J2E A; 2DF4 B; 5AKX A; 4U6P A; 1L7O A; 4Y2T A; 4M2Y A; 2YMP A; 4C8O A; 5KNI A; 3F5A A; 4MFA A; 1ZQI A; 1UPH A; 3KZX A; 2NRX A; 2P6R A; 5KFH A; 5KFK A; 4I2E A; 2FMP A; 2QLT A; 2JEI A; 2WF5 A; 3PO5 A; 1ZQK A; 4F5Q A; 4XQ8 A; 2OEH A; 1ZQ1 C; 3NRW A; 4M9H A; 1ZQO A; 5AI8 A; 1BPZ A; 2W3R A; 4O3O A; 2W7O A; 2WF8 A; 4YD1 A; 3Q8P B; 2V4Q A; 5CA7 A; 2F3N A; 1DK3 A; 2BCS A; 2NRW A; 2HCF A; 5TZV A; 1KRP A; 3RB3 A; 4KLD A; 4M9J A; 1FFV A; 2K4P A; 3UPQ A; 4QWB A; 3O0F A; 4RQN A; 5KT3 A; 2UVV A; 3ISD A; 1NK9 A; 2R18 A; 7ICJ A; 2KZ3 A; 4I28 A; 3M9O B; 2XY5 A; 1JX4 A; 3B0X A; 3UMG A; 4RUC A; 5KFW A; 1FFU A; 2YMQ A; 3GII A; 3KHL A; 4YVZ A; 1ZQJ A; 2W03 A; 8ICH A; 3TAQ A; 4B9V A; 3AL0 B; 1L3S A; 5D4B A; 5DGB A; 3UM9 A; 4GXK A; 2BDP A; 4QZH A; 1TV9 A; 5DDM A; 1C20 A; 4IRK A; 4EBE A; 2G09 A; 3EWA A; 4C4R A; 4DSJ A; 4YXM A; 3SI8 A; 2EH9 A; 2XO7 A; 3SR6 A; 3BZK A; 3WK9 A; 2HHQ A; 2E1F A; 3RFA A; 1QQ5 A; 4PPX A; 3H40 A; 3PVX A; 2KIW A; 5F9L A; 4KLM A; 1LKY B; 2HOQ A; 4IR9 A; 5E79 U; 2WB1 C; 1YZ6 A; 3RJI A; 2K4E A; 4KLH A; 4P0Q B; 3H8M A; 1NKE A; 4Y2X A; 1HIW A; 5AI6 A; 1LB2 B; 1N62 A; 1URJ A; 3BZC A; 2ZIX B; 2ASJ A; 3C1Z A; 4I29 A; 3RRH A; 3H7I A; 5IIK A; 1TVA A; 5KFT A; 1Y88 A; 4DS5 A; 1D8Y A; 3OJS A; 1KEJ A; 2HHW A; 3BQT A; 9ICH A; 4PHE A; 4M6W B; 3H0R B; 4BUG A; 4UB1 A; 2JV3 A; 8ICK A; 4UB5 A; 4K4I A; 5KFM A; 4CCH A; 2BGW A; 2D6F C; 7ICR A; 2NYV A; 4IC9 A; 2A1A A; 4YMM A; 4O3P A; 2JEG A; 2OWO A; 2XY7 A; 8ICL A; 1ECW A; 3WKE A; 8ICX A; 2HDO A; 4QZ9 A; 3A0B U; 2FMS A; 4TQR A; 2GO7 A; 4QZB A; 1CUK A; 1DOQ A; 1ZQX A; 1OUQ A; 3UMB A; 4F71 A; 5J0Q A; 3BQ1 A; 2EAP A; 4G3I A; 5AI0 A; 4QW8 A; 2AXT U; 5KAI U; 1SL1 A; 1KLN A; 4DSI A; 5GTI U; 4DL2 A; 3QEA Z; 5KFP A; 3JPP A; 5AHX A; 1UCV A; 9ICS A; 1RYU A; 2IOF K; 4KN4 A; 4O3R A; 4KLG A; 2ATL A; 4R66 A; 8ICG A; 5KFF A; 2ZJ8 A; 8ICF A; 3ETR A; 3PW0 A; 4OO1 J; 1U45 A; 4O5K A; 3HRD D; 4I2C A; 5CP2 A; 3LVW A; 4AYB F; 4EZ9 A; 1U49 A; 2R8I A; 4CF5 A; 1B43 A; 3LK9 A; 2O6K A; 1XC9 A; 2ISP A; 2HSZ A; 4RQM A; 4JV0 A; 5KG0 A; 1JI7 A; 3BQ0 A; 5K4L A; 1TAQ A; 5DKW A; 3KKA C; 1Z00 B; 1S0M A; 1T4G A; 3WK7 A; 5IIN A; 3D2S A; 2C22 A; 3V72 A; 2DWQ A; 1Z3E B; 2KEY A; 2CXY A; 2Y1J A; 2A1J A; 2W3S A; 5J8Y A; 2VAN A; 4DCC A; 2XC9 A; 2XIC A; 4UB8 U; 5J0X A; 1ZXI A; 5EOZ A; 2HHX A; 3IRU A; 4OCZ A; 1L7M A; 3Q8Q B; 4TUR A; 5AKY A; 3E0F A; 4RQ2 A; 4FBT A; 2KNJ A; 4Q8E A; 4YP3 A; 3FAH A; 5AIC A; 4DQQ A; 3RJH A; 3HKZ F; 4BXO B; 4UB4 A; 4O3M A; 4KLU A; 5J2K A; 4Q45 A; 9ICA A; 2GWS A; 5F3X B; 4IQT A; 5J0P A; 1UA0 A; 1N61 A; 2C2D A; 1NJZ A; 3RTV A; 1A77 A; 4QZD A; 4USA A; 4GC7 A; 3MDC A; 4DL5 A; 2YY6 A; 4YR0 A; 3RB4 A; 3G6V A; 1NK8 A; 4LJX A; 1ARO P; 4O0I A; 2BQR A; 2FPL A; 1KDH A; 4EBC A; 5BOL A; 7ICN A; 4PGQ A; 1NK5 A; 5HHI A; 5KFQ A; 4F4X A; 3UXO A; 1YZ7 A; 3KD3 A; 3TAC B; 3OHB A; 4RNN A; 5J2I A; 5KFV A; 5J2B A; 3ZD9 A; 4DLE A; 4B6J A; 4Q44 A; 1QLN A; 4MHV A; 1BPE A; 5AK4 A; 3IV6 A; 3G6Y A; 1L5U A; 7ICS A; 4KLT A; 2NRV A; 4IRC A; 7ICU A; 8ICY A; 5B5E U; 2V9W A; 3NVY A; 5ALN A; 4YMO A; 2W9B A; 3V6J A; 3ZDA A; 1S0N A; 2Y0S C; 1Q3V A; 3PST A; 2B0C A; 1T7P A; 2K60 A; 3BS5 A; 4J9M A; 2WAQ F; 3AUO A; 1ZQC A; 1J2N A; 4F4K A; 1O08 A; 3QUB A; 2KFN A; 2DUY A; 3Q8L A; 1QSY A; 3M9N B; 4Q8F A; 3AEV A; 4F8R A; 1X9X A; 4DQR A; 5KG5 A; 4CF3 A; 1RDF A; 4ED2 A; 2VA3 A; 3WKD A; 5L1I A; 1ZD5 A; 3WU2 U; 2MRL A; 1Q8K A; 2JH7 A; 4MEX A; 2E8O A; 4FS2 A; 5J0Y A; 3MGH A; 5AKI A; 2A1J B; 3DV9 A; 4O3N A; 7ICP A; 3ZI4 A; 3V6K A; 4ICA A; 4ECY A; 1SWV A; 5DB9 A; 9ICE A; 3WK6 A; 3TFS A; 4TUP A; 2FMQ A; 3HW8 A; 1L6N A; 1J2M A; 2QAR A; 1Z1B A; 9ICP A; 4C4T A; 5HR6 A; 1NZP A; 4DSK A; 2KP7 A; 1ZQM A; 4EX6 A; 3EZ5 A; 1T8E A; 2G5H B; 4B9T A; 4FBU A; 3EYZ A; 3PW4 A; 2HMX A; 3KHH A; 3LYS A; 4KLL A; 3PMN A; 3N28 A; 1V38 A; 2P6U A; 2LYB A; 3K1Z A; 3IG5 A; 2ZUD A; 1N48 A; 4ED3 A; 2YQE A; 3WK4 A; 2JGA A; 4BWM A; 1BPX A; 9ICF A; 4NLB A; 1KKX A; 2YB4 A; 4PZN A; 4EEN A; 2AJQ A; 2XID A; 1JMS A; 1RQN A; 3CP8 A; 4PL1 A; 4ED7 A; 4NJ8 A; 2EAN A; 4O3Q A; 5DBB A; 5KFY A; 7ICO A; 3CW2 C; 3L5K A; 2JMG A; 3MAB A; 1ZQP A; 1IXR A; 2E1E A; 2YN4 A; 3ONN A; 4RQ1 A; 4UB6 U; 1NK4 A; 4BDP A; 4Y2S A; 5AKZ A; 9ICR A; 4YD2 A; 3OGU A; 3HJE A; 1D9D A; 4Z6D A; 2PFP A; 4CF4 A; 1L7N A; 4DL4 A; 3S6J A; 3TQ1 A; 5IIM A; 2PFN A; 3GV5 B; 2W9B B; 3NVW A; 4EEL A; 3Q8R B; 4F5R A; 4Z6F A; 2DGZ A; 2DPJ A; 3TAN A; 5KFC A; 1COK A; 3RH6 A; 5AKL A; 4RPZ A; 3N97 B; 4O9M A; 4KMU A; 4CRX A; 4JV2 A; 2HBJ A; 2KKP A; 4P4P A; 4MFC A; 3IN5 A; 3SEN A; 2H3F A; 5CR0 A; 1PZN A; 4RNO A; 1K1Q A; 3RBE A; 2EQY A; 2F77 X; 1LV5 A; 4C7Y A; 3QU9 A; 1UHU A; 2F8L A; 1TE2 A; 3JPS A; 2PKE A; 1UT8 A; 5KT6 A; 1MA7 A; 4J9R A; 1Z1V A; 4R65 A; 5J0U A; 2FPM A; 3PW5 A; 4DWI A; 1ED1 A; 2XVT A; 1LKY A; 1S0O A; 3EUB 2; 4UAR A; 1K5O A; 4QWD A; 2QAR B; 4P0Q A; 4I2B A; 2BDU A; 4EEY A; 4KX5 A; 1AQ6 A; 1NZB A; 4XA5 A; 2Q0Z X; 1A0P A; 5J2H A; 4GXI A; 2G07 A; 2ZIX A; 2YX8 A; 2OH2 A; 2DL0 A; 2R8H A; 8ICO A; 3L4P A; 1IIP A; 3AQE A; 3QUC A; 3JPQ A; 2KVS A; 3RH5 A; 3MDA A; 1T94 A; 4DF8 A; 1XO0 A; 3LWL A; 4YXJ A; 4M6W A; 5ALZ A; 2WB1 F; 5L1K A; 4QJF B; 5DBC A; 1XNS A; 2IHN A; 2ZXH A; 2XY6 A; 1B22 A; 2KTQ A; 2WFA A; 3JPN A; 2J6T A; 5D49 A; 2VJ5 A; 9ICK A; 2R8G A; 4KLJ A; 8ICN A; 4ED8 A; 5DBA A; 5DQI A; 4X5V A; 2KJ8 A; 4TQS A; 1KL9 A; 4KLI A; 1FO4 A; 2CRX A; 4OJ6 A; 4U7C A; 3THV A; 3SQI A; 3T3F A; 2YML A; 5KFU A; 4ELV A; 3RJJ A; 1X42 A; 3MFH A; 1HUZ A; 1PUZ A; 4P2H A; 3KHG A; 4UQG A; 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1HJP A; 4MF8 A; 2DFL A; 1Q46 A; 3MGV A; 1ZQA A; 1NK0 A; 4ED1 A; 2KN7 A; 2BQU A; 1XO1 A; 1JXL A; 3DEE A; 4RQ0 A; 2IOF A; 5BPC A; 1XSL A; 2IOH A; 5ALV A; 3JPO A; 2Y9U A; 4C0Z A; 8ICM A; 5ALS A; 4NWI A; 5A0L A; 4G9B A; 2I1Q A; 9ICJ A; 3RB6 A; 3QZ8 A; 2BHN A; 3B0Y A; 3PX4 A; 2FI1 A; 1NKB A; 3QEB Z; 4NY8 A; 4UBC A; 9ICX A; 3QX7 A; 1RZT A; 3OJU A; 5KFZ A; 4OJL A; 2W55 A; 2P66 A; 5CJ7 A; 2KE7 A; 2EZX A; 3F2D A; 1U47 A; 3QU2 A; 3H8J A; 4GFJ A; 1UQV A; 2WF6 A; 1U4B A; 5EE9 A; 3T79 A; 5AKG A; 5CWR A; 3SYZ A; 5ALT A; 3LVV A; 2ZJ5 A; 1SZP A; 2AGP A; 1ZQF A; 3K4G A; 4PGY A; 2FLN A; 3ZDD A; 4JK1 A; 1ZJN A; 5DLG A; 3AQF A; 3F5E A; 3QXG A; 2H5X A; 3HWT A; 4B9M A; 3R9K A; 5J0T A; 4WJ3 B; 4M47 A; 3PZP A; 3GQC A; 7ICK A; 2HOI A; 1S5L U; 1MN8 A; 3AU2 A; 1U9L A; 4Z6E A; 1SWW A; 1P7D A; 5DG9 A; 1SB3 C; 2BQ3 A; 1IG6 A; 1JUD A; 1OXJ A; 1BNO A; 2C2R A; 3QU5 A; 2XGP A; 1MQ2 A; 2PXI A; 7ICE A; 2KOB A; 1VLB A; 3OPX A; 3C2L A; 3E2E A; 1ZQW A; 5HMM A; 4F4Z A; 4PHD A; 3F53 A; 3PW2 A; 1IM4 A; 4I2F A; 2KJ5 A; 4RQ3 A; 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