The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
b'CQEANYGALLRELCLTQFQVDMEAVGETLWCDWGRTIRSYRELADCTWHMAEKLGCFWPNAEVDRFFLAVHGRYFRSCPIS'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Receptor activity-modifying protein 1
|
| publication title |
Crystal structure of the human receptor activity-modifying protein 1 extracellular domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Protein transport
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| total genus |
29
|
| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3AQF A; 3N7S C; 2YX8 A; 3N7R C; 3N7P D; 2XVT A; 3AQE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5CEH A; 3RAQ A; 4I2C A; 2GWS A; 3GIK A; 4CNQ A; 5DQI A; 4MEX A; 4ELT A; 4DEZ A; 1N61 A; 1VLB A; 1P7D A; 2LPE A; 4PH5 A; 4J9O A; 2PFO A; 4RQ3 A; 1YT3 A; 2A3V A; 4KX3 A; 3V7L A; 2KOB A; 3BZC A; 4RUA A; 1WUD A; 3N97 B; 1T94 A; 1XO1 A; 3RJI A; 1LV5 A; 1SV0 C; 4UB6 U; 2JRZ A; 4AP9 A; 3SAH A; 4O3P A; 5KFY A; 3OHA A; 1X9S A; 1QLN A; 3MR5 A; 1TAQ A; 4C0Z A; 1JXE A; 4JV2 A; 4UB2 A; 3IDW A; 3UXP A; 2XY7 A; 4UAS A; 2KFZ A; 8ICP A; 4DL7 A; 8ICR A; 1J2N A; 3PW5 A; 1T7P A; 2FPM A; 5J2G A; 1KL9 A; 4UAT A; 4P0Q A; 3BQ0 A; 4PJ0 U; 3RH4 A; 4BWM A; 4Q8F A; 3GIJ A; 1LKY B; 1BPB A; 3HRD D; 4RQ2 A; 3RBD A; 1SZP A; 4K4H A; 2MSN A; 3DDH A; 1JAL A; 5J8Y A; 1CRX A; 2IHN A; 2AQ0 A; 5A0L A; 5CJ7 A; 4KLD A; 9ICN A; 5ALI A; 5KG3 A; 4ELV A; 1MSW D; 2YB4 A; 2YB1 A; 3HX0 A; 2LM4 A; 2KHQ A; 4DQI A; 7ICO A; 5C0Y A; 4NJ8 A; 3T3F A; 1V9P A; 1ZQE A; 2FLN A; 5J2A A; 2KK0 A; 4ECY A; 3RRH A; 1S77 D; 2P6U A; 1NI3 A; 1XO0 A; 4KLE A; 1SV4 A; 5ALG A; 2DPI A; 1NNL A; 1S0O A; 1ZQG A; 2ZTE A; 2PFP A; 1UCV A; 2B21 A; 1X2I A; 3GQC A; 3TAR A; 2E8N A; 4YXJ A; 2ALZ A; 4I28 A; 3GU3 A; 5CR0 A; 1D8B A; 1HUZ A; 4HAI A; 3NS1 A; 4BGD A; 5AKL A; 7ICI A; 4DLE A; 2BDU A; 1ZD2 P; 3GV8 B; 4E0D A; 2JZB B; 1ZXI A; 2M0N A; 4ED6 A; 2BHN A; 2UVW A; 2KVC A; 2Y1I A; 4ED0 A; 9ICQ A; 2Q4T A; 2ZJA A; 3QUB A; 4J9S A; 3ZDD A; 2BCQ A; 5ALM A; 1UA1 A; 3A0H U; 3H40 A; 3OSN A; 3KBB A; 2A19 A; 4OJ5 A; 3EWA A; 2OH2 A; 1ZET A; 3MDA A; 4F4Y A; 1L8L A; 2PMZ C; 4ECZ A; 3UQ0 A; 2RQ5 A; 4C80 A; 4DO9 A; 4RQ6 A; 9ICH A; 2BQU A; 1DK3 A; 1ZQK A; 3AM9 A; 5J0P A; 3RB6 A; 1MC8 A; 1X6J A; 1BNP A; 2ASL A; 5AHX A; 1B4F A; 4IL6 U; 1SXD A; 1JRO A; 1HJP A; 3LVW A; 3QU5 A; 2W11 A; 1MA7 A; 2OWO A; 1ZQW A; 2D6F C; 1ZQX A; 2ZTC A; 3AU6 A; 1ZQN A; 3C5F A; 5J2C A; 2HI0 A; 3H0M B; 4BWJ A; 3KTQ A; 4KLQ A; 2Y9T A; 9ICC A; 4JB3 A; 3CW2 C; 2NRZ A; 1B0X A; 3RF9 A; 3BQT A; 4TUQ A; 3SQI A; 3I1Y A; 4I2J A; 5F9N A; 2BCV A; 2PFN A; 2E8P A; 4M9G A; 3MGV A; 4DS5 A; 2I1Q A; 3B0X A; 3IP4 B; 2AGQ A; 1Q8K A; 1UT5 A; 5D49 A; 2BGW A; 5J2E A; 7ICS A; 4MFA A; 2I5H A; 1NJX A; 1KFD A; 4ECW A; 4OJP A; 3AL0 B; 5BPC A; 1Z1V A; 4RPY A; 2EZY A; 5AI5 A; 4EZ6 A; 2KKV A; 4RQN A; 5G5G A; 3KOO A; 3TAD A; 1SZH A; 2BR0 A; 1O03 A; 1PK3 A; 2P35 A; 3C1Y A; 5L1I A; 2OM6 A; 1ZJN A; 2KJ8 A; 2C28 A; 4R65 A; 3ALR A; 3Q8L A; 2B6G A; 3H4B A; 4Q8E A; 3V6K A; 1LKY A; 3VC8 A; 9ICA A; 4IR1 A; 5F9L A; 3JPS A; 2KSO B; 4YN4 A; 2HHT A; 2LYA A; 3K1Z A; 2NRT A; 5DB6 A; 1N63 A; 2OYY A; 3ZDA A; 2AGO A; 3PX6 A; 3PNC A; 2FDR A; 1QQ6 A; 2F3N A; 4F5P A; 4Z6E A; 2KHV A; 4OO1 J; 1C7Y A; 3T5H A; 3PMN A; 2DUY A; 1TAM A; 2HHV A; 4DLG A; 1HUO A; 1KW4 A; 1S76 D; 1ZQM A; 5EWE A; 1Z4O A; 4DOA A; 1S9F A; 3KFU F; 1TK5 A; 4F4K A; 4PGQ A; 2F76 X; 4BXO B; 4JV0 A; 3GIM A; 3TAQ A; 2CRX A; 2E8O A; 2P6R A; 1ZQF A; 3NUQ A; 3NVZ A; 3PZP A; 2LYH A; 5J29 A; 1N48 A; 3QXG A; 1A6S A; 2JZB A; 3OJU A; 1RXV A; 3ZD9 A; 2FMQ A; 5J0Y A; 2WF9 A; 5ALY A; 1PVQ A; 3WKE A; 4ELU A; 2WAQ F; 1FO4 A; 3F5E A; 3NRW A; 1FFV A; 4UB5 A; 1T3N A; 2RLT A; 2DWQ A; 4O0I A; 3FC4 A; 5J2K A; 5HML A; 3IV6 A; 4NXZ A; 5JRT A; 2A1J B; 2HW3 A; 2QB1 A; 9ICP A; 1ZYQ A; 4NLN A; 3Q8Q B; 3M1Y A; 5KT6 A; 4IQV A; 4I27 A; 3V6J A; 4RT2 A; 2H3Z A; 5AIC A; 8ICW A; 8ICB A; 1SWV A; 1D9D A; 4Y2V A; 1KEJ A; 2VJ5 A; 3LDA A; 1D9F A; 2GOL A; 1XSP A; 1KFS A; 2DGZ A; 4KLU A; 5KFS A; 3UMC A; 4FBT A; 4ED7 A; 3ORY A; 4C8L A; 2VA2 A; 1TAU A; 2HSZ A; 1KDH A; 5T14 A; 5HHH A; 2PI5 A; 3MR3 A; 5KFB A; 4ECU A; 4O3S A; 7ICU A; 3BDP A; 3N28 A; 4MF8 A; 5DLF A; 5DG7 A; 2ZG6 A; 5AI6 A; 4DWI A; 4YVZ A; 5TIS U; 1ZJM A; 4I29 A; 2ZJ5 A; 4BUG A; 4NLZ A; 5DKW A; 3TFS A; 3G6X A; 3WK5 A; 4NLG A; 3ED5 A; 2DKX A; 1IM4 A; 5AM1 A; 4IRC A; 3L4P A; 5G5H A; 5KFK A; 2V4R A; 9ICF A; 5ALJ A; 5KFG A; 4KIT B; 1U45 A; 1ED1 A; 2RDI A; 2P66 A; 2K4P A; 1ZQR A; 4ZOH C; 5CA7 A; 4YR2 A; 4P0Q B; 2KMD A; 4PL1 A; 1QQ7 A; 4M47 A; 4J03 A; 3BS7 A; 1COO A; 1B43 A; 3I76 A; 8ICL A; 3GIL A; 3C2M A; 2AJQ A; 4O3Q A; 5IIN A; 2NRV A; 1KFT A; 1YZ7 A; 2KSO A; 4G3I A; 2O6K A; 1ZQT A; 3J81 j; 1CEZ A; 2W04 A; 2CPR A; 3MBY A; 2W9M A; 2KJ9 A; 5ALE A; 3QZ8 A; 4O5C A; 4YR0 A; 2YMM A; 5AIA A; 3PST A; 4TUS A; 4C8O A; 1X9M A; 5TZV A; 2ASD A; 5KFV A; 4GXK A; 5AKG A; 1WWV A; 2LHT A; 3OSP A; 5KFD A; 1Q3V A; 3R9K A; 2W9A A; 1UPH A; 1D8L A; 4BJQ A; 2PI4 A; 2OXO A; 2AU0 A; 5IIL A; 4B9U A; 4BXO A; 4P2H A; 2LYB A; 4RPZ A; 3H8S A; 2W8L A; 1SL0 A; 4UB8 U; 3ISD A; 8ICG A; 4ICA A; 1XNS A; 7ICE A; 2ODG A; 5KT2 A; 4PZO A; 4RQ4 A; 4KLF A; 4M0A A; 3QUC A; 3SV3 A; 2IBK A; 3E2E A; 1DOQ A; 3BJY A; 4F91 B; 4X5V A; 3FAH A; 1Z19 A; 3QU7 A; 3KHR A; 2KNJ A; 1NZP A; 3OJS A; 1ZQV A; 2HVI A; 1U9L A; 3QE9 Y; 4RNO A; 1Z3E B; 4CCH A; 2F1I A; 4F72 A; 5KFO A; 5AKJ A; 2A1J A; 3EPI A; 1DRG A; 8ICZ A; 2HHS A; 3EZ5 A; 4KLG A; 3AN1 A; 3MAB A; 4I2F A; 4B9N A; 1N5X A; 4F5O A; 4JK1 A; 4EBD A; 8ICJ A; 4PPX A; 4QIW F; 1L3U A; 1BPY A; 9ICX A; 1LB2 B; 1TKD A; 3H4D A; 5HHI A; 3PR4 A; 3NRZ A; 4BDP A; 2GO7 A; 5AK5 A; 4DQQ A; 4KX5 A; 4J9N A; 5KFP A; 2ZXH A; 2AGP A; 4YG2 A; 1QSY A; 1NK0 A; 3TAD C; 5DBA A; 3Q8R B; 1ZD3 A; 3AQF A; 4P0P B; 4J9M A; 4C8N A; 1ZQZ A; 2BPG A; 2WFA A; 1S0M A; 4USA A; 2H3I A; 4FZM A; 2WTF A; 3L3F X; 4RNN A; 2BQ3 A; 2HOQ A; 4OD0 A; 2W9C A; 4GXJ A; 1QQ5 A; 5GTI U; 4IRK A; 5KG1 A; 7ICQ A; 1ZRM A; 1IV8 A; 4NWI A; 2E5S A; 1SXE A; 2FI1 A; 1S0N A; 3ZDC A; 1L7P A; 4DFD A; 3C2K A; 3ICX A; 3SZ2 A; 3CP8 A; 5ALP A; 5AKE A; 2F8L A; 1QTM A; 3O0F A; 4C4S A; 3QU2 A; 1FEZ A; 2Y1J A; 4EX7 A; 3BQ2 A; 4QZA A; 1ZD4 A; 1XSN A; 4OJ6 A; 3RTV A; 2KKP A; 5KFC A; 1RQN A; 1WG8 A; 2GH1 A; 5KFI A; 5E79 U; 2FPK A; 4DF4 A; 4R8U B; 4O5E A; 2KZ3 A; 2YY6 A; 2R8H A; 4Z6C A; 4EYH B; 2KTQ A; 1VJ5 A; 3PV8 A; 3LWL A; 3KHH A; 2FPL A; 3HT3 A; 3VCB A; 3EUB 2; 1S10 A; 1MQ2 A; 3DV9 A; 3NGD A; 1BPX A; 4DOC A; 2E3T A; 3RJH A; 2PXI A; 1RDF A; 3NTU A; 4CGZ A; 4NLC A; 3V7J A; 3MC1 A; 4UAY A; 4DL4 A; 1KTQ A; 4F2S A; 2R8I A; 2M9N A; 2G06 A; 4IQU A; 4Y2Q A; 4DL2 A; 3F2C A; 4I2H A; 1GO3 F; 3WK6 A; 2NV3 A; 5KG6 A; 3NVY A; 1JN3 A; 4KLM A; 2EH9 A; 3UXO A; 4O5K A; 3RJJ A; 4QIW C; 1X40 A; 2C2R A; 8ICO A; 5CP2 A; 4ECT A; 2J6T A; 4JV1 A; 7ICR A; 2KIV A; 5IIO A; 2W3S A; 5DLG A; 1XWL A; 3GFK B; 3LYS A; 3N7S C; 2ZTD A; 4DSK A; 5ALZ A; 1K1Q A; 2JHD A; 1LVH A; 2W03 A; 3RJF A; 5HR6 A; 5ALH A; 1ZQL A; 3GZF A; 2OCE A; 3LVV A; 3LK9 A; 4DQP A; 4YR3 A; 1NJZ A; 9ICO A; 4FS1 A; 2HBM A; 2W7P A; 4ECX A; 2Y0S F; 1TFR A; 2BPC A; 1L7O A; 3RFA A; 2G5I B; 8ICK A; 4CDG A; 1U49 A; 1ECW A; 8ICQ A; 4DL3 A; 2XC9 A; 5ALQ A; 3TAP A; 5EOZ A; 1Y88 A; 4QWD A; 5AM4 A; 2HCF A; 4UAZ A; 3C29 A; 4F5R A; 5AKY A; 4DCC A; 9ICV A; 4QZD A; 3QNM A; 5DDY A; 5ALN A; 4P0P A; 3ETL A; 4CF5 A; 5EE0 A; 1K1S A; 4QWE A; 3C2L A; 1H38 A; 4LZG A; 2ISO A; 1T8E A; 3RR8 A; 3MDC A; 3JPP A; 2W9B B; 1S8O A; 3U26 A; 2HHU A; 2AHO B; 3D6J A; 2DBY A; 4RQ5 A; 1Q3U A; 4P4O A; 4YMO A; 3M6K A; 4EBC A; 2K8B B; 3EW9 A; 5KT7 A; 1KRP A; 1FFU A; 1F5S A; 4Q44 A; 5L9X A; 3AU2 A; 3M6Z A; 2DF4 B; 2WF8 A; 1RG6 A; 1WYG A; 4NM1 A; 3KZX A; 1SKS A; 5AKK A; 3SYZ A; 5HMM A; 2ZIX B; 2ISP A; 2F8K A; 1URJ A; 3D2N A; 2F1H A; 4YP3 A; 1ZQH A; 1YZ6 A; 3B0Y A; 3IHQ B; 4HYK A; 3K75 D; 7ICV A; 4J9R A; 1ZQI A; 3I28 A; 2UVR A; 1U48 A; 1KQQ A; 3IN5 A; 3QUT A; 2H5X A; 4UBB A; 2K89 A; 3SR6 A; 3TI0 A; 4QZ8 A; 3WK4 A; 9ICM A; 4R8U A; 2W54 A; 1UA0 A; 7ICG A; 2OEH A; 4UAR A; 5KFX A; 2XY6 A; 5AIB A; 3ONN A; 1ZQP A; 2BKE A; 1KBU A; 2JH7 A; 5DGB A; 4YFK A; 1NK7 A; 5L1K A; 3CYM A; 2IA6 A; 3ISC A; 8ICV A; 9ICL A; 5J2F A; 2ZUC A; 5L1M A; 2RP5 A; 3ZDB A; 3JPQ A; 1ZQQ A; 3WK8 A; 4PL2 A; 1ZQO A; 2KE7 A; 5KG7 A; 4BX9 C; 2XCP A; 5L1L A; 4QJF B; 1L3T A; 2UVU A; 5ALV A; 5ALL A; 3NAS A; 1NKE A; 4LVS A; 9ICI A; 3E0F A; 4NLB A; 3UM9 A; 3PY8 A; 4C8K A; 3N4M B; 2K4H A; 3Q8P B; 2QKQ A; 3JPN A; 5EE1 A; 5AKH A; 4M6W B; 2IOF K; 8ICA A; 2JMG A; 4DSJ A; 5DB7 A; 2Y0S C; 4KLH A; 2MU2 A; 3SD7 A; 2KD1 A; 4PHE A; 8ICI A; 4QZI A; 4RQM A; 1SL1 A; 4KN4 A; 2NRX A; 3HJE A; 4OJO A; 1NJY A; 2DFL A; 8ICY A; 1HIW A; 1QCK A; 2BCR A; 5ALO A; 2GLE A; 3MFH A; 4ECR A; 5J2D A; 3PO5 A; 1MQ3 A; 2BQR A; 1IXR A; 4KN7 A; 2LM1 A; 3SEN A; 4KMU A; 4UB1 A; 3KKA A; 4B9V A; 3QYP A; 3OTQ A; 2UVV A; 5AI8 A; 2JEJ A; 2L5Y A; 3PO4 A; 2ZUD A; 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5KFU A; 2IOF A; 3FM9 A; 5FP0 A; 9ICR A; 4GFJ A; 2KP7 A; 1DGS A; 3Q8M A; 2IOH A; 1KKX A; 3N7P D; 3H0R B; 3PX0 A; 1A77 A; 5KAF U; 1SGG A; 5C5J A; 2XI9 A; 5AM3 A; 4DL6 A; 2MAX A; 2JEG A; 1N60 A; 4KLO A; 4UW9 A; 4B9L A; 4US8 A; 2WB1 F; 5KFW A; 4ECS A; 4KLT A; 4B9T A; 1F0M A; 3IM1 A; 3HPO A; 3WKA A; 3M9O B; 1L6N A; 5J2J A; 1KN5 A; 3C28 A; 4M6W A; 4Y2U A; 2PKE A; 5GTH U; 4QZ9 A; 1L7N A; 2F77 X; 4DFM A; 3F5A A; 2B0C A; 1X9W A; 4AYB C; 4NM2 A; 5D46 A; 3BS5 B; 4B9S A; 1SKW A; 2VJ4 A; 3N7R C; 4EEY A; 4DQS A; 1ZQC A; 2QB0 B; 3TKA A; 3SAG A; 4F5N A; 3UMG A; 3PVX A; 3GII A; 2XVT A; 2H3F A; 4RUC A; 4ACO A; 5AM5 A; 4EYI B; 4M9H A; 4UAU A; 2IMW P; 3SEI A; 2H3Q A; 4FO6 A; 2BCS A; 2HOF A; 4ECQ A; 2WF5 A; 3RR7 A; 3MGI A; 3LWM A; 4DF8 A; 5ALX A; 5J0R A; 3RH5 A; 5IIJ A; 4EEN A; 2AXT U; 3QEB Z; 4O3M A; 1PK1 B; 7ICF A; 5J0S A; 7ICH A; 1N5W A; 4PHD A; 1ZQA A; 2KV2 A; 2Y9U A; 8ICE A; 5B5E U; 3CNH A; 4KLS A; 3Q8S B; 1RYU A; 3WKD A; 5CWR A; 1DGJ A; 4QW8 A; 1WCN A; 4F2R A; 2FMP A; 4NL9 A; 2R18 A; 7ICJ A; 1PVP A; 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