The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
CQEANYGALLRELCLTQFQVDMEAVGETLWCDWGRTIRSYRELADCTWHMAEKLGCFWPNAEVDRFFLAVHGRYFRSCPIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Receptor activity-modifying protein 1
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| publication title |
Crystal structure of the human receptor activity-modifying protein 1 extracellular domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Protein transport
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| total genus |
29
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| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2YX8 A; 3AQE A; 3N7P D; 2XVT A; 3N7R C; 3AQF A; 3N7S C; #chains in the Genus database with same CATH topology 4G9B A; 1FIQ A; 5KG2 A; 2XID A; 2E5S A; 1X2I A; 1TK0 A; 1Z19 A; 1N2X A; 4J9P A; 3RJF A; 5J0T A; 1SZP A; 1MSW D; 4IR9 A; 3MR5 A; 4Y2Y A; 2KVS A; 2KIC A; 4QNL A; 3H8S A; 5J2D A; 1JN3 A; 3ZDD A; 1RXV A; 5KFR A; 3OPX A; 3EWA A; 3QE9 Y; 5KT3 A; 1S76 D; 3M9N B; 2ZG6 A; 5AM5 A; 4I2F A; 3B9J A; 3Q8R B; 9ICV A; 4QWC A; 8ICM A; 4Z6F A; 1PK1 A; 2DFL A; 1OXJ A; 5EOZ A; 1RYU A; 3KHH A; 2B6G A; 4DCC A; 2IHM A; 4YMM A; 4UAW A; 3H0L B; 4F92 B; 2YY6 A; 4RPZ A; 3RH5 A; 1ZD2 P; 1U47 A; 5HR6 A; 1NI3 A; 1UHU A; 3RJE A; 4JK1 A; 1S0V A; 1S0M A; 3EW9 A; 4IS7 A; 2EAP A; 2KHV A; 1HUO A; 4C8M A; 5TIS U; 4RQ8 A; 4DLE A; 2JEF A; 4YFK A; 1N60 A; 1WCN A; 5J2K A; 2JEJ A; 5KFM A; 2BCS A; 2XY7 A; 4I2G A; 2XVT A; 1URJ A; 3C2K A; 2HMX A; 8ICJ A; 5DQH A; 3F2B A; 4XQ8 A; 4F4Z A; 3WU2 U; 3QU7 A; 3RJJ A; 5HML A; 2XGP A; 1HUZ A; 1ZQH A; 2HHW A; 1QSY A; 2KN7 A; 2HOF A; 2ZIU B; 3RBE A; 5JRT A; 5J2A A; 4DQQ A; 2W9A A; 4NLZ A; 2BR0 A; 3V6H A; 1KFD A; 2DKX A; 4C4T A; 1FFU A; 2I5H A; 1C20 A; 1GO3 F; 3V7K A; 5G5G A; 1S0N A; 4FFD A; 2LYA A; 2PFQ A; 3IG8 A; 1ZQD A; 5A0L A; 5L9X A; 5CA7 A; 2W03 A; 5CRX A; 4I2E A; 2FLL A; 4F71 A; 2I6X A; 4LJX A; 3GII A; 3K1R B; 5KFA A; 5EWE A; 7ICH A; 5KNI A; 4DSJ A; 1DGJ A; 3WKA A; 4DQP A; 4P4P A; 3H40 A; 4MFF A; 4DSK A; 1LV5 A; 1JI7 A; 1KBU A; 5AKK A; 3K4G A; 1CRX A; 1DOQ A; 3NRW A; 3A0B U; 5B5E U; 1PVR A; 2CRX A; 5EE0 A; 1N62 A; 5DBB A; 2F76 X; 4AYB F; 2LMR A; 3K1Z A; 3JPR A; 1S77 D; 1SKR A; 3RR8 A; 3HKZ C; 3K75 D; 1MA7 A; 2ZTE A; 3BQ0 A; 3KHL A; 4IRK A; 4DO9 A; 4PHD A; 2OM6 A; 2FLP A; 2ZUD A; 3WK4 A; 4RNM A; 3M6K A; 2HHS A; 2D6F C; 2KD1 A; 5GTH U; 2YMQ A; 2W9B A; 4F2S A; 2HOQ A; 2E8M A; 2VA2 A; 1WWU A; 5ALM A; 5ALO A; 8ICI A; 1UCV A; 4F4Y A; 4YN4 A; 4OO1 J; 4Y2S A; 1IXR A; 3AN1 A; 2EZZ A; 2ZIX A; 2KE7 A; 4J9M A; 5ALN A; 4RQ6 A; 1XS9 D; 4M9J A; 2LHT A; 2W9M A; 3H4D A; 2A1J A; 2LI6 A; 5KFV A; 2YQE A; 9ICJ A; 5L1L A; 5KG3 A; 2KV2 A; 2DF4 B; 5AKJ A; 4ACO A; 5IIO A; 2JZB A; 1RZT A; 2QLT A; 1A77 A; 2HBJ A; 2HHV A; 3BZC A; 1OUQ A; 4J9K A; 1N5W A; 4J9N A; 4DOC A; 8ICE A; 3VC8 A; 1L7N A; 1Z4O A; 3H0M B; 5AKY A; 1BPX A; 2JEI A; 3RJG A; 1P7D A; 2NO4 A; 2QAR A; 1SV4 A; 5BOL A; 3MR2 A; 5KAF U; 2EH9 A; 5CB1 A; 2HI0 A; 2QB1 A; 4OJ6 A; 1ZQV A; 1A6S A; 1TE2 A; 1L8L A; 5DQI A; 2XGQ A; 2R8G A; 4J03 A; 5KG1 A; 1KLN A; 9ICW A; 4LZG A; 3Q8S B; 4E0D A; 3UMG A; 3I76 A; 2J6S A; 4KLG A; 3SEI A; 2BCR A; 1L7M A; 1SXD A; 5ALL A; 4O5K A; 1JAL A; 3EZ5 A; 7ICT A; 2MA1 A; 3MFI A; 2R8K A; 1KN5 A; 5KT2 A; 2AQ0 A; 3L5K A; 5CP2 A; 4Q43 A; 4YXM A; 3F2C A; 4U6P A; 1SL2 A; 2W43 A; 2MUT B; 4JB3 A; 4DEZ A; 2KSO A; 4B9M A; 3OSP A; 5KL1 B; 5J2E A; 4IR1 A; 4KLE A; 1BPZ A; 4I2J A; 5J0O A; 4GLX A; 1Q3V A; 1KW4 A; 2PKE A; 3GQC A; 3RB3 A; 4UAZ A; 4CF5 A; 2HSZ A; 4RQ0 A; 4CGZ A; 1ZQX A; 5L1K A; 2F2A B; 2FDR A; 5III A; 4F93 B; 2FMQ A; 1TAM A; 4CDG A; 1NKE A; 4F5O A; 2K8B B; 2A1A A; 2HCF A; 5DG8 A; 2PXI A; 2ZIV A; 7ICE A; 4DQR A; 3TAP A; 5ALE A; 3QEB Z; 4CF3 A; 2PMZ F; 3J81 j; 5KFP A; 3OJU A; 4RQ2 A; 3JPO A; 1KFS A; 4BWM A; 3UXN A; 4UW9 A; 2E8O A; 5KFH A; 4F4X A; 4F50 A; 2M0N A; 4EX7 A; 2HDO A; 2UVR A; 3GFK B; 9ICE A; 2JEG A; 4UB5 A; 2Y1J A; 3SI8 A; 1WCL A; 2OH2 A; 1MQ3 A; 4Z6E A; 4I29 A; 5C5J A; 2G09 A; 1ZQP A; 2JR5 A; 2BGW A; 1BPE A; 1KDH A; 9ICT A; 3HRD D; 3MR6 A; 3WK7 A; 1ZQO A; 2E8N A; 4NLG A; 2KP7 A; 5E79 U; 2E8P A; 4O9M A; 3T3F A; 4EYI B; 2I9G A; 1F0M A; 3Q8P B; 1QSL A; 2XC9 A; 4K4G A; 4EYH B; 5KTQ A; 1SKS A; 4ECU A; 2CPR A; 1ZQ1 C; 3CNH A; 1JRO A; 4KX3 A; 4KLQ A; 5J2H A; 3AMZ A; 2KZM A; 8ICO A; 3BS5 B; 5AHX A; 3QEA Z; 4IRC A; 2ZTD A; 4KMO B; 8ICR A; 4DFK A; 1ARO P; 2P6U A; 1M6Y A; 2R8J A; 2WAQ F; 2HOI A; 4EEN A; 1JMS A; 1PZN A; 3GIK A; 2EAM A; 4NLB A; 5T14 A; 2IOF A; 9ICX A; 3ALR A; 2RHF A; 1X9S A; 1BPB A; 4R65 A; 3WKE A; 1COK A; 2OHF A; 3LVW A; 3C28 A; 5CJ7 A; 3RTV A; 3T5H A; 5IIL A; 2VA3 A; 2F1I A; 3H8J A; 5ALJ A; 3C29 A; 3UXO A; 3N97 B; 3FAH A; 2W54 A; 7ICK A; 1B4F A; 5CWR A; 3IRU A; 2ZXI A; 3WK5 A; 3F5E A; 2JRZ A; 2EZX A; 5AIC A; 1WG8 A; 4EEK A; 2D3D A; 2KJ9 A; 4F4K A; 4F5Q A; 2VJ4 A; 3DEE A; 4RT2 A; 1Q8K A; 2DQN B; 3QNM A; 1Z4N A; 3PNC A; 2UVU A; 1DRG A; 4F91 B; 5KL8 B; 5DDY A; 2WF5 A; 3F5A A; 1VLB A; 4ED7 A; 4C8N A; 1ZQM A; 4KTQ A; 1F44 A; 4RNO A; 3NVW A; 2DKZ A; 4OJ5 A; 1ZD3 A; 1RQN A; 3HIL A; 2G06 A; 4KLI A; 4I2A A; 1X9M A; 4IQW A; 2ZJA A; 1L8O A; 3M6Z A; 3PO4 A; 2OCE A; 3JPN A; 1KEJ A; 4YMO A; 4O3O A; 2NRZ A; 5KG4 A; 5KFK A; 5HHH A; 3TQ1 A; 4TUS A; 2Y9U A; 5KT4 A; 4DFJ A; 2WFA A; 9ICQ A; 4KX5 A; 3KKA C; 4AYB C; 3E0F A; 3RBD A; 4IL6 U; 2H3F A; 1H38 A; 2RP5 A; 5AKX A; 1T8E A; 5J2F A; 4TUP A; 5IIJ A; 1ZET A; 4M2Y A; 4JWN A; 3G6X A; 5KFX A; 1O03 A; 3MC1 A; 1NK9 A; 3KZI U; 2LYB A; 4DSF A; 2KVC A; 3HP6 A; 5AM2 A; 2ASJ A; 7ICU A; 2KG5 A; 1DGS A; 9ICM A; 4YR0 A; 1XO1 A; 2VIX A; 3ZI4 A; 3UMC A; 1IIP A; 4GC7 A; 2M9N A; 1XNS A; 1UPH A; 3QUC A; 2EAN A; 5AI4 A; 2HHQ A; 4CF4 A; 5J0U A; 3JPT A; 2W9C B; 2MSN A; 1U48 A; 3RRG A; 5AI5 A; 3AQE A; 3QZ7 A; 5AM1 A; 4EEL A; 4MFA A; 4YG2 A; 3IN5 A; 1UQV A; 4NV0 A; 2JXJ A; 4R66 A; 3DV9 A; 3BQ2 A; 4J9R A; 2W7P A; 9ICL A; 1ZQY A; 3ZDC A; 3PSI A; 3PZP A; 3ICX A; 2LPE A; 1ZRN A; 4DL7 A; 1NJW A; 2WTF A; 4EBE A; 2I1Q A; 4M0A A; 4FE3 A; 1SZH A; 2C2R A; 2BHN A; 3L4P A; 4C8K A; 1XWL A; 4GC6 A; 5AKL A; 3T5J A; 5ALV A; 1DK2 A; 4HYK A; 1NKB A; 3IG5 A; 4C4S A; 3Q8M A; 5EE3 A; 4R8U B; 1L5U A; 3PO5 A; 8ICS A; 4EZ6 A; 3NAS A; 3V6K A; 4CNQ A; 2ZIU A; 1NZB A; 4I28 A; 1JUD A; 4FZN A; 5J2J A; 1C7Y A; 3D2S A; 4ZH4 A; 4NJ8 A; 4B9S A; 2PFN A; 1L3V A; 4Y2P A; 2E3T A; 3C23 A; 3AU2 A; 2AHO B; 2JH7 A; 2BPG A; 1J2M A; 5KG5 A; 3G6V A; 3THV A; 3OSN A; 1FO4 A; 5AK5 A; 4IQT A; 1D8L A; 2ZTC A; 2HVI A; 4RQ1 A; 4G3I A; 3V6J A; 2O6K A; 8ICB A; 1L3T A; 1NK0 A; 5AIB A; 3N7S C; 4Q44 A; 2G0A A; 2CXY A; 1N48 A; 2DBY A; 5KFY A; 1JXE A; 5AM4 A; 3SD7 A; 3QU9 A; 1NOM A; 5J2B A; 4NLK A; 3F53 A; 2KNJ A; 5EWF A; 4R64 A; 3UQ0 A; 1NJY A; 3F2D A; 2XO7 A; 2ZJ5 A; 1SL0 A; 4NY8 A; 5B66 U; 4MF8 A; 1NJX A; 5FP0 A; 1O08 A; 1B0X A; 1NK5 A; 4XUS A; 5D4B A; 5ALP A; 7ICQ A; 2PMZ C; 4EBD A; 8ICQ A; 5ALG A; 2OEH A; 3ISC A; 3PW5 A; 2HBK A; 3LVV A; 4KLD A; 5AKZ A; 1KSP A; 3GV5 B; 3D6J A; 1L6N A; 5BPC A; 2DL0 A; 4J9O A; 4P0P B; 4NLN A; 4Q8F A; 1ZQG A; 4BGD A; 4M9L A; 1COO A; 4QJF B; 2EZY A; 9ICA A; 2NRT A; 2VJ5 A; 4U7C A; 5DB8 A; 3IDW A; 5KFU A; 4O5E A; 3A0H U; 4F72 A; 2AQ4 A; 3GZF A; 2UVV A; 5AI8 A; 4UB8 U; 2KOB A; 4WJ3 B; 3V7J A; 5DG9 A; 4ED2 A; 9ICG A; 1V97 A; 4DF4 A; 2F1J A; 2F8K A; 4DF8 A; 4USA A; 1UA0 A; 1HEK A; 1RYR A; 1JRP A; 4QW8 A; 2GWS A; 7ICL A; 2QB0 A; 4O3R A; 3ZDB A; 2KIV A; 1JXL A; 2QKQ A; 1BPY A; 2WAQ C; 5D49 A; 4EX6 A; 2FI1 A; 3TAN A; 5EE1 A; 4RQ7 A; 1BPD A; 1N56 A; 2K4P A; 3RAX A; 1QLN A; 3QZ8 A; 4O3M A; 4KLM A; 2MRL A; 4QWE A; 1K1S A; 4QZ9 A; 3LWM A; 3SV4 A; 1PUZ A; 4JV0 A; 4EEY A; 5KG6 A; 4GXI A; 1PVQ A; 4B9U A; 5KFO A; 1KL9 A; 4YXJ A; 4K4I A; 5HNK A; 8ICH A; 4YCX A; 3TAC B; 3SMV A; 4A8E A; 7ICG A; 1XO0 A; 1S97 A; 3SZ2 A; 4FZL A; 2MUT A; 1ZQI A; 1TK5 A; 3OTQ A; 1F5S A; 1TVA A; 2RLT A; 8ICV A; 1YZ7 A; 2EQY A; 3ZD8 A; 4ECZ A; 1X40 A; 2LM1 A; 5AK6 A; 2QB0 B; 4PHE A; 2NYV A; 1AQ6 A; 7ICM A; 3MDA A; 4B9L A; 4KLF A; 4ECV A; 4QZH A; 5L1M A; 3HX0 A; 3QUT A; 1T4G A; 3OHA A; 5IIM A; 2ASD A; 5AM3 A; 2V9W A; 1J2N A; 5AIA A; 9ICK A; 2IBK A; 4PGX A; 3AUO A; 3PX4 A; 2R18 A; 4KLL A; 3PW4 A; 2WF6 A; 2C2D A; 1WWV A; 5KFF A; 4BWJ A; 4KLS A; 3LYS A; 2RQ5 A; 2XCP A; 2FPK A; 1V38 A; 4OCZ A; 4CCH A; 5KFB A; 3H7I A; 5KFZ A; 4DQI A; 5L1J A; 4FS1 A; 4RU9 A; 2R8H A; 4RUC A; 9ICU A; 4XA5 A; 5AK3 A; 1S10 A; 4IRD A; 3KOO A; 1X9X A; 4TQR A; 4JV2 A; 4YD2 A; 5IIN A; 2C28 A; 4I27 A; 4UB2 A; 4YVZ A; 1VDV A; 4ECQ A; 3AEV A; 3ZD9 A; 2Z7J A; 2ATL A; 1SV0 A; 3NRZ A; 5KG7 A; 4C7Y A; 3TAQ A; 2CN1 A; 2KKP A; 4ELU A; 1Q46 A; 4P0Q B; 3MGH A; 4OD0 A; 2YN4 A; 2H3Q A; 8ICG A; 9ICB A; 4C7Z A; 2XI9 A; 2Y1I A; 4JUZ A; 2ZXH A; 4KLT A; 2W8L A; 3BS5 A; 4LVS A; 3KD3 A; 3ONN A; 3RB6 A; 2F44 A; 4F5R A; 3HT3 A; 2DUY A; 2AJQ A; 4NM1 A; 4ED3 A; 1TAQ A; 2BQR A; 3LDA A; 3ETL A; 1CEZ A; 4P4O A; 5KFE A; 2KIW A; 1ZQL A; 4TQS A; 3L3F X; 5G5H A; 4FO6 A; 5F3X B; 1KQQ A; 4YMN A; 9ICH A; 3RF9 A; 3TFR A; 2K8A A; 3PSF A; 3FC4 A; 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5AK4 A; 3QU5 A; 2W9C A; 3TAR A; 2BKE A; 5KFJ A; 4Y2R A; 3RRH A; 3AL0 B; 1L7O A; 2GO7 A; 5DQG A; 5J0S A; 4KLH A; 5KFN A; 1ZJM A; 2YB4 A; 3PX0 A; 4CRX A; 5ALQ A; 3CW2 C; 1KKX A; 3NS1 A; 8ICP A; 3TKA A; 2GH1 A; 3DDH A; 5AI9 A; 2HW3 A; 2B21 A; 2AGO A; 4PHP A; 2BPC A; 3PY8 A; 1LKY B; 2G5I B; 9ICO A; 3C5G A; 1ZQE A; 4I2I A; 1BNO A; 1TK8 A; 5DG7 A; 3PW2 A; 1Z00 B; 5HMM A; 3M7D A; 2KMD A; 4ELT A; 4R8U A; 2H3I A; 3SV3 A; 1NKC A; 1L7P A; 3CP8 A; 4QZD A; 5J2I A; 1QQ6 A; 4O3P A; 3C2L A; 5J0Y A; 1V9P A; 2KK0 A; 2WF9 A; 4FZM A; 2G07 A; 3IM1 A; 8ICZ A; 4M6W B; 4F8R A; 5AI0 A; 5KFG A; 3JPS A; 3UPQ A; 3Q8K A; 4R63 A; 1RYS A; 5J29 A; 2K4E A; 2XIC A; 1CUK A; 3AQF A; 2PI4 A; 4DSI A; 1NK7 A; 4PGQ A; 3PR4 A; 3VCB A; 4NWI A; 4NL9 C; 1ZQU A; 5ALU A; 4FBU A; 4DL4 A; 1NJZ A; 3MFH A; 4UAV A; 4UQG A; 1Z3E B; 2H5X A; 4PL2 A; 4F3O A; 4GXK A; 2YX8 A; 2RDJ A; 4ECY A; 4XRH A; 1ZD4 A; 3TAD A; 4F2R A; 3WKD A; 4PPX A; 5KAI U; 7ICR A; 5J0R A; 3BJY A; 4QZB A; 2BCU A; 8ICA A; 1ZQT A; 1HIW A; 2KKV A; 4Y2X A; 3JPQ A; 1SXE A; 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