2Z22A

Crystal structure of phosphate preplasmic binding protein psts from yersinia pestis
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
EASLTGAGATFPAPVYAKWADSYQKETGNKINYQGIGSSGGVKQIIANTVDFGASDAPLTDEKLATEGLFQFPTVIGGVVLAVNIPGIKSGELTLDGKTLGDIYLGTVKKWNDPAIVKLNPGVKLPDQNIAVVRRADGSGTSFVFTSYLAKVNAEWKEKVGAGSTVNWPTGLGGKGNDGIAAFVQRLPGSIGYVEYAYAKQNNLAYTKLISADGKPVSPTEHSFSSAAKGVDWSKSFAQDLTNQKGDDVWPITSTTFILVHKEQKNAANGTEVLKFFDWGYTHGAKQANELDYATLPAEVVEQVRAAWKTQIKDSSGKPIF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structures of OppA and PstS from Yersinia pestis indicate variability of interactions with transmembrane domains.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Periplasmic phosphate-binding protein
molecule tags Transport protein,immune system
source organism Yersinia pestis
total genus 108
structure length 321
sequence length 321
chains with identical sequence X
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2z22A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2z22A02
1FQAA 5A5XA 2VD2A 3C31A 3RLFE 2XXTA 3M3KA 1ZU0A 4OYVA 1LAHE 1P1OA 3V5AA 4NF6A 3B6TA 4KYDA 3B6WA 2BJJX 4ZEKA 1ZMGA 3FD3A 2DSFA 3BKIB 5L9OA 1MQJA 1JVXA 3VVEA 2ANJA 4I9DA 1IZ1A 5CRYA 1B6HA 4G77A 4UA8A 3QAXA 1L5TA 3TEPA 1PC3A 2V3QA 2V25A 1RYXA 3TQLA 5JTYA 2YLNA 3UK4A 4ZECA 2LAOA 2X7QA 3QYTA 1SW2A 4H8IA 4Q5TA 2I3VA 1MPDA 3OOAA 2XHDA 5FTHA 1NKXA 2D3IA 2FNCA 3MUQA 3D4GA 2I3WA 3K6XA 3T22A 1O63A 1B5IA 4EQBA 4NF4A 1Y20A 3DP4A 3S2VA 1B4HA 2Z22A 1NH7A 1R1NA 4H5FA 4KHZE 3CIJA 4ZEDA 2UVJA 3MPLA 2QSXA 3I3VA 4HCWA 2REJA 4G8HA 4R75A 3SEWA 3PPPA 1Z7NE 2UVHA 3T9XB 3UIFA 4YKIA 4ECFA 1LFGA 2XXVA 1SI0A 2ABHA 4KR5A 5ICTA 1GV8A 4XKNA 1M5DA 2VHAA 2OWTA 5AA2B 3GBAA 4LONB 3DELB 1NNTA 2DQVA 4NF5B 3O6HA 4YZZA 2ZNTA 4YAHX 1UTBA 1JW5A 5EHSA 4P0IA 1VSOA 1ZKBA 2DXRA 1RYOA 4QFLA 3VV5A 4THIA 1MXWA 4U21A 3QUJA 3T96B 4JSDA 1I69A 1BTJA 5DEXA 4QFKA 1GVCA 1MXYA 2THIA 4FAJA 4R72A 1M5BA 3BFTA 4ZZEA 1UQWA 3I6VA 4Z7EA 4U1OA 4O3CA 3HPIA 4DCXA 3MZ9A 1A55A 2ZNSA 4GWOA 3K0VA 3MZ1A 2RC9A 2A5SA 3CFZA 2H99A 4OQOA 3IOTA 2XX8A 1MQHA 3EPEA 2DS9A 1IXCA 2I4BA 4RK9A 3PPRA 1SVXB 4POWA 1SI1A 2A5TA 2RKMA 1GTKA 4YB5A 1B9JA 4ZEFA 3PPOA 4F3SA 1LB9A 3IX1A 1QW0A 1FTOA 3Q29A 1B1XA 1H44A 2DVCA 4XKRA 2ZNUA 1SW4A 2H9BA 4IY5A 4LZ7A 4YB7A 2I6EA 4YKKA 3TZAA 2HZKA 1USYE 1XS5A 1JEUA 3UA8A 3OMBA 4K3FA 3RT6B 3TELA 3LSXA 3K00A 2XXYA 3I5OA 4NE4A 4L17A 5LOMA 3KGCA 1URGA 5KCJB 1MXZA 4QSEA 4IO5A 3KJ7A 4NWDA 1QUIA 4H0WA 3KN8A 2D21A 4FECA 4KI0E 3U8QA 2HEUA 3SEYA 2HCAA 1YPNA 3VLVA 2Q8JA 1SW1A 4BDQA 3IB0A 2QJEA 1CB6A 3RPWA 3M3LA 3PUVE 3A3CA 4PFUA 1WODA 5FHMA 2FYIA 1H45A 3PUXE 5H8HB 1ZIUA 3T9UA 4QSDA 3V83A 1XHYA 3CG3A 3U93A 3KN3A 2VOZA 1B40A 2O1LA 1F9BA 3O66A 3CSBA 4ZE9A 3TCGA 1YTVA 3C33A 2CMOA 3VFJA 2WKYA 3ZKKA 5AA4A 1AH5A 4G4PA 2ZYMA 4GRKA 4R73A 3W9WA 4X48A 4H5GA 2V3TA 2NWJA 2DXYA 4MLVA 3CI8A 1IEJA 3RUMA 5ICQA 4F18A 4OEUA 3A3UA 4ZZAA 2GHBA 3FVOA 3ZS6A 2ZXTA 2IEEA 5KZTA 4HCYA 2OJTA 4WEPA 1B0HA 1MS7A 3OO7A 5HPQA 3HSTA 3QSLA 3LUYA 1TT1A 2DVZA 4YKJA 2NVUB 2QRYA 2B3BA 2Q89A 1QJMA 3TCFA 2QS1A 4IO6A 3BFUA 5I2NB 3HN0A 2O1MA 3PMWA 3K6VA 2Q9TA 3IOUA 2Y7WA 3SKPA 3N6TA 4UACA 4R2BA 3KSJA 1A7LA 3VLUA 4I8CA 4NF4B 2ALUA 4I62A 1D4NA 4PFYA 4F22A 4FORA 4GL8A 1PBQA 2Y84A 3G3FA 3RN8A 1EZPA 1FCKA 4RK2A 1MQIA 3FZVA 4OHNA 4EQ9A 4R74A 4JWYA 1B7UA 4IGTA 4OZ9A 3K1PA 3PGFA 2PMSA 1FQCA 3K6WA 4GXSB 5DVJA 3KBRA 1US4A 4F19A 4U1ZA 2AL5A 3U92A 2Y7PA 1ZLQA 1IIWA 1I6BA 3S9MC 3R7XA 4ELOA 4YU0A 2GH9A 5ELVA 4U23A 5KDTB 3TKDA 1UIVA 1UTBB 4ND9A 4XKQA 3T93B 1D9YA 3QUFA 4EF2A 2X26A 2O7IA 1BLFA 4KFQA 1DPPA 3M3FA 4MFIA 4LA9A 1WDNA 1NMUA 4HTGA 5DEXB 3K02A 4R6KA 5H8FB 3CRBA 4RPOA 4QSCA 4DIGA 1PB8A 5CBSA 4KD5A 4OWDA 1O64A 1RKMA 2ZYOA 4LZ5A 3DP8A 1ZTYA 3FVNA 5I2KB 2PBWA 4P11A 4AB5A 2G93A 1USYH 3VE1B 4RNSA 2W7YA 1ZBMA 1URDA 1LAXA 1POY1 1SD3A 4KPTA 4OFJA 2QS4A 2R71A 4O3BA 3FJMA 4TLMB 3GBBA 3FASA 4DZ1A 3SEUA 4Q30B 1N04A 2UXAA 2A5TB 4YB6A 3SEXA 1Y3QA 1HSJA 1Y9UA 2F7BA 5AE4A 3MP6A 2XX7A 3TODA 4U2RA 4OVJA 2ZMBA 1LBBA 3TYHA 3Q26A 1YCJA 3GZGA 5CI5A 3L6HA 1FTLA 3MP1A 1ELJA 3KJTA 1OLAA 2OZZA 1IITA 4HS7A 3G3JA 1AL3A 1B5JA 4GIZA 4I1DA 1FQDA 4RPNA 4F2OA 1WVJA 4ISUA 3VLWA 4WEDA 5H8SA 2VP1A 3D4CA 1NNKA 4RJZA 4JSOA 4DXUA 3CG1A 1B05A 3RY3A 3CFXA 2F97A 4C1TA 1IUDA 3FV1A 1OVBA 2XD3A 1D3KA 1LSTA 1N3WA 3FV2A 1BP5A 3WAEA 4F3PA 4F31B 3IJXB 3K2DA 3L6GA 2ZYKA 2E1SA 3O6GA 3G3KA 3OEMA 2AYSA 5L8DA 3SEVA 3SETA 1P1UA 1NFTA 2YPNA 4E0WA 2QMXA 3PUWE 4LQ2A 4R9FA 3TTMA 1MM7A 4EDPA 2I58A 3THIA 4JWXA 1MH3A 3TPAA 5DTBA 1FTKA 1M5EA 1QULA 3RNNA 4QF9A 1A54A 1OLCA 3OD7A 1OVTA 4KQPA 4ELQA 4GQOA 3IO6A 5AA4B 4OXVA 3FXUA 1FTJA 1AMFA 2XXPA 4EXLA 4JDFA 1ZJLA 2B65A 4PETA 4ZE8A 3TDJA 1MY0A 1B7HA 1HSEA 3O28A 3T66A 1LFIA 2QMWA 4H1XA 1N7WA 5HM4B 2O68A 2XD2A 2I49A 5FTIA 3OO9A 5F1QA 4BDOA 3LR1A 1KWHA 1MQGA 4GVOA 3R26A 3LSFB 5L9MA 1JW4A 2DWHA 4IO3A 4XIGQ 4N13A 3OXNA 4BDNA 5IAIA 1DOTA 2XX9A 2P2AA 3VVDA 5HBCA 1SYIA 4MLQA 4M1VA 4H6DA 1MXXA 4NMYA 4YICA 3TAJA 4XXUA 1POTA 5CMCA 2ONRA 3N6UA 3TTNA 4QHQA 3C4MA 2XXIA 5K2YA 5I84A 1IQ7A 2F34A 1MY2A 4G8NA 1B2HA 2OLBA 3A09A 2R9JA 1B0LA 4H65A 3USDA 4X9TA 3ZSFA 4NTLA 1B3EA 1P99A 1S7YA 2F6GA 2Z8DA 4IO2A 2DYXA 3N94A 1FQBA 3V89B 2VD3A 2GHAA 4C1UA 5H8NB 1ANFA 3O9PA 1T0KA 2DP8A 2DE3A 2P0SA 5J1DA 3FIRA 1YAEA 2REGA 3U94A 3PMVA 3VXBA 3ILTB 1SBPA 2H98A 5I57A 4F1VA 2Z8EA 1QUJA 4FEDA 5BUUA 2RCAA 2OWSA 3HHGA 5JK4A 1UTHA 1LBCA 2F35A 3MC2A 1MY4A 4R6HA 4OFLA 3S9NC 1J1NA 1FQEA 3S9EA 1XC1A 3PMXA 5A5XB 2OBGA 1B46A 3ZKLA 3AXFA 4FEBA 3ILUB 3KZGA 4NF6B 2RF1A 3FVKA 2O6AA 2NXOA 3IO4A 1EU8A 4FE8A 4GXAA 1M5FA 4OFOA 4U22A 4ESXA 2Q2AA 4AB6A 4AQ4A 2D5WA 3KG2A 1QVSA 1MM6A 4LUBA 2V3UA 1I6QA 3TCHA 4OEVA 2HXWA 1Y1ZA 4BDLA 5JTYB 2I0CA 3FATA 3H6UA 2O51A 3TQWA 1MY1A 1Q1KA 4KCCA 2XXXA 1O7TA 5ITOA 3U72A 3EHSA 5DVIA 3C34A 3T9VA 3TTLA 4OESA 4JWOA 3H6WA 4ELPA 1OMPA 4R9GA 4Q8RA 4OETA 4QFPA 4JXIA 1Y1MA 3BBRA 4TQUQ 2HFBA 2Z8FA 1NNPA 4IB2A 4RA1A 1DTZA 5TU0A 1MH4A 5B70A 3OEKA 3H4ZA 1II5A 2XXWA 3R6UA 3ODBA 2OCUA 3JV9A 1JEVA 4LQ5A 2ONKE 5L9SA 3PPQA 2I0BA 4F3BA 1A40A 3S4UA 3QIMA 1DTGA 3SERA 5CMKA 1JVYA 4NEDA 4C0RA 3K1NA 1EH3A 4IO7A 1JW1A 4LATA 2P1SA 3G3IA 1I6AA 3KSXA 1LCFA 1Y4CA 1XVYA 1B5HA 1TFAA 5DYHA 1N76A 2PYYA 1JNFA 1LFHA 1B32A 4GOTA 4G68A 5ISUA 3CSGA 1AIVA 3MZBA 2H25A 2V93A 2RINA 4G8MA 3T9HB 4DLDA 3H7MA 2OK2A 3HO7A 3E13X 2PT1A 5I59A 1D9VA 4MF3A 4EF1A 4GD5A 5CMMA 4YKPA 4DDDA 4YMBA 3CVGA 1B51A 3KN7A 4YMAA 3FGSA 3O6IA 1A99A 4NF8A 1N3XA 4KCDA 2I4CA 1IXIA 4BDMA 1UIUA 2M8CA 1QKAA 1PBPA 4G68C 4E0XA 3EQ1A 2F78A 5EYFA 4FJPA 3RTFB 4F1YA 3G3HA 2O84X 1A8EA 2QPQA 5BWJA 4PE5B 2Q88A 2UVGA 3TUSA 3KFMA 1SYHA 3HCQA 4TOZA 5CM6A 4GF8A 3IOVA 3JZJA 1Y3PA 3KOSA 3C9HA 1DSNA 3S9LC 5AA3A 2DOJA 5I2NA 1TWYA 4MBPA 5F7VA 2PX1A 5H8QA 2F7CA 1LCTA 3MJNA 2GFEA 1VR5A 4PP0A 1LGBC 4R2FA 1PEBA 1NNFA 1QKBA 3FXQA 4XKPA 4TLLB 1BIYA 1TXFA 3U1OA 5I58A 1MPBA 1MY3A 4PFTA 3MVXA 3K1MA 5AA1A 3FJGA 4QFNA 2Y7IA 2ESNA 4LP2B 3TTKA 4NWCA 4U4SA 4POXA 2R6GE 2IA4A 1LAFE 3IAZA 2RCBA 1A8FA 1FTMA 2UYEA 3MVWA 3G3GA 4JB7A 3E3KA 2YJPA 1LAGE 1R6ZA 3OO6A 2X7PA 4ELRA 2DE4A 2CZLA 4IO4A 2RC8A 2XXQA 3EHTA 2AL4A 3QXMA 5I57B 1R9LA 1VFEA 1PDAA 3N5LA 3O2AA 1B1HA 1B52A 5KDTA 4G2ZA 5TPAA 4OTEA 2ZYNA 5DVFA 1UTHB 3GLBA 2NOOA 4WKMA 5TP9A 3H3GA 1B3HA 2XXRA 4BDRA 3OSQA 1IXGA 1DPEA 4ONYA 1B4ZA 3FJ7A 4ZEBA 5IKBA 2HAUA 4GLIA 1S9TA 5I56A 1B3LA 3C36A 3B6QA 5CC2A 4JBZA 2F36A 1VE4A 4OMBA 5H8FA 2XXHA 1US5A 3H6VA 3RQTA 2GRVA 2FA7A 4U4XA 1H3DA 1P1NA 3VXCA 3GXAA 3MBPA 1AOVA 3PD8A 4Z0IA 5I2KA 3RTWB 3C35A 4P0GA 3H03A 5CMBA 1VFDA 2UVIA 3MVZA 2HQ0A 5DT6A 3PUYE 3W15C 1N84A 3DP6A 4DE8A 1QUKA 3H6TA 1MDP1 4F1UA 3H06B 2KLFA 2HZLA 3KOTA 1R9QA 4BLAA 4OENA 4F2QA 2B3FA 1URSA 3P7IA 3SESA 2DWIA 1MRPA 4RXLA 3V8XB 2Y7KA 3W9VA 3PV0E 4ZEIA 1XVXA 5JEIA 3HV1A 2QL3A 1FW0A 4O3AA 2F8DA 3MQ9A 1ATGA 3MW0A 1XT8A 3OENA 4GL0A 4KYSA 5FHNA 2DE2A 1B58A 3CFLA 1MG1A 1N0TA 3IR1A 4OERA 1LLSA 4EUOA 1N7XA 4EQ7A 3TTRA 4LVQA 4PQJA 3OO8A 2I48A 2F6PA 3TFLA 1JQFA 1FQFA 4DXBA 5EHMA 4F39A 1Q35A 4N6PA 1S50A 3Q27A 3IL1B 3FVGA 3LSWA 4G68B 2XXUA 1B7ZA 5AA2A 1H76A 1EZ9A 3O97A 3FXRA 4NF5A 4WXJA 1Y4TA 3UORA 3UP9A 5M2VA 4X1DA 1TFDA 3PD9A 4RYAA 5I59B 3K4UA 1HSLA 1PB7A 1IXHA 2H5YA 3MWBA 1OQHA 4QRZA 4DXCA 4DCYA 1MQDA 4NF8B 2DWAA 2PT2A 2E0SA 1SW5A 4R6YA 3DLNA 2DWJA 3ONMA 3IOWA 1MPCA 3EN3A 3KEIA 2ONSA 2VGQA 3HHFA 3O29A 2G29A 2PVUA 2F5XA 3PU5A 3TMGA 4M4GA 1NL5A 4IY6A 1B3GA 3IB2A 4FATA 3OSRA 4GFRA 3LC8A 4QFOA 3E9XA 3EHUA 3SDFA 2Y7RA 2HAVA 3VDFA 4PFWA 3LSLA 3MVYA 4H8JA 3N26A 3WAFA 1PB9A 3B7DA 5H8QB 2O69A 3M8UA 1LB8A 1EZOA 5I58B 3DM0A 3UGWA 3VVFA 4Q0CA 4F3GA 3QK6A 3Q28A 2H4IA 3G7WA 2V84A 3F11A 3OELA 1BKAA 2AIXA 1Y3NA 3K6UA 2Q2CA 1MXUA 2QS3A 1MDQA 1H43A 4KYEA 3IJOB 4RY1A 5B7DA 3MPKA 3Q25A 5FHOA 3MAMA 3PPNA 5CBRA 5KCJA 3ECRA 4MH5A 1JETA 1SDXA 3JYRA 1Z7ME 3PUZE 3C32A 4ZS9A 1GR2A 5K2XA 1CE2A 4ZDMA 3IK6B 1MXVA 5AA2D 1NH8A 3EF7A 5TPAB 4ESWA 5H8NA 2UYFA 4LZ8A 1GGGA 3UN6A 5TP9B 4FIMA 1OIBA 1B3FA 2Z23A 3CR9A 5H8HA 3E4RA 1P1QA 1SQYA 4IGRA 4X1BA 1P1WA 3LBSA 3IORA 4N07A 1DMBA 2RC7A 3IB1A 3K01A 4F29A 5I56B 5ITPA 3RT8A 3MP8A 4H67A 1OQGA 1M5CA 2O7UA 3FUZA 4EXKA 2NUVA 4HW8A 2QS2A 2F7AA 1XOCA 3RGYA 4XTCQ
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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