2Z22A

Crystal structure of phosphate preplasmic binding protein psts from yersinia pestis
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
EASLTGAGATFPAPVYAKWADSYQKETGNKINYQGIGSSGGVKQIIANTVDFGASDAPLTDEKLATEGLFQFPTVIGGVVLAVNIPGIKSGELTLDGKTLGDIYLGTVKKWNDPAIVKLNPGVKLPDQNIAVVRRADGSGTSFVFTSYLAKVNAEWKEKVGAGSTVNWPTGLGGKGNDGIAAFVQRLPGSIGYVEYAYAKQNNLAYTKLISADGKPVSPTEHSFSSAAKGVDWSKSFAQDLTNQKGDDVWPITSTTFILVHKEQKNAANGTEVLKFFDWGYTHGAKQANELDYATLPAEVVEQVRAAWKTQIKDSSGKPIF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structures of OppA and PstS from Yersinia pestis indicate variability of interactions with transmembrane domains.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Periplasmic phosphate-binding protein
source organism Yersinia pestis
molecule tags Transport protein,immune system
total genus 108
structure length 321
sequence length 321
chains with identical sequence X
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2z22A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2z22A02
2QS1A 2DS9A 4BDOA 3E3KA 1RYOA 1R9LA 4PFYA 3U72A 1M5EA 3MVWA 2FA7A 1Y3NA 4MFIA 4X9TA 1MY1A 3IB0A 3V8XB 3N6UA 1BLFA 1ANFA 2H99A 2ZXTA 4ESXA 1OIBA 5AA2D 4H8JA 2ZYNA 1N0TA 4KR5A 3R7XA 3BBRA 4LQ5A 3CIJA 1I69A 1MY3A 5FTHA 3B7DA 1XVYA 1P1OA 3B6QA 1LFHA 4EDPA 2Z23A 3FZVA 1H45A 3IR1A 1LLSA 5EHMA 3GBAA 4NWDA 4F3GA 2I6EA 3T9UA 2HCAA 2Y7PA 3K2DA 2I3WA 1SI0A 3I5OA 4BDMA 1WDNA 4ONYA 4RPNA 4YKKA 1TXFA 4TLLB 3OENA 3QXMA 3OOAA 4QSCA 4ZDMA 3IO6A 4GOTA 1OMPA 3H7MA 2WKYA 3W15C 1IXHA 1HSEA 4LQ2A 5TP9A 1MXVA 4ZE9A 3R26A 2E0SA 4ELPA 4ZS9A 2NOOA 2F34A 4AB6A 3SERA 4YKPA 3TTMA 3EHUA 3GBBA 1B7UA 3TPAA 3TUSA 2XXPA 5ICTA 3N94A 1O7TA 1MXWA 2ALUA 4KHZE 1NKXA 4UACA 2OWTA 3CG1A 2ANJA 4ESWA 5DT6A 3S9NC 1HSJA 1TWYA 1LFGA 4ZECA 2F35A 5I57B 1H44A 3VE1B 1QKBA 5AA1A 3AXFA 2KLFA 1SD3A 3RY3A 2YJPA 5TPAB 3QYTA 4ELOA 2O51A 4WXJA 2AL5A 5JTYB 2DVZA 2Z8EA 5ISUA 1UTBB 4G8MA 2QMXA 3UIFA 1IUDA 3SDFA 3RT8A 4U1OA 4BDNA 5I58A 1Y1MA 5I59A 4G8NA 1MXUA 3DP4A 3IO4A 4LONB 2PX1A 1S7YA 4L17A 2BJJX 3KN3A 1Y1ZA 4E0XA 3TEPA 4U4SA 3SEWA 4YKJA 2Y7RA 2FYIA 3LUYA 4R9FA 1M5BA 2H25A 1LBBA 3HSTA 1UIUA 4YAHX 1I6AA 2F7AA 2Z8DA 5B7DA 2REJA 1F9BA 5HBCA 3TTNA 4ECFA 2G93A 2ZYMA 1AH5A 5AA4B 5H8QA 1J1NA 3PV0E 4GXAA 3PD9A 4F18A 4IY5A 4QFLA 4X1DA 3VLVA 2A5SA 3FIRA 2I48A 4NWCA 2DWJA 2O6AA 3PPRA 3N6TA 1QUKA 3TQLA 4WKMA 5KCJA 3T9HB 2ZNSA 4PFWA 4RXLA 3M3LA 3PPPA 4LATA 2ONKE 3FJGA 3H06B 3SESA 3TTLA 5KZTA 3H6VA 4M1VA 1CB6A 3KN7A 5I2NB 1IIWA 1FW0A 1O63A 1JVXA 2I4BA 2E1SA 1B1XA 4LZ7A 3VVEA 1JNFA 2F6GA 3OELA 3OSQA 4Q5TA 4QFOA 4OYVA 1NMUA 1B3GA 4NTLA 3O6IA 3I6VA 3UGWA 4HS7A 5I2KA 1SVXB 2PVUA 3MBPA 3OSRA 2NWJA 2OLBA 3VLWA 4OFOA 3H03A 2DP8A 2GRVA 5H8NA 3A09A 5HM4B 1WODA 2XXXA 5TU0A 2IEEA 2P1SA 4P0GA 2RF1A 1QJMA 4RK9A 3IOVA 4FECA 4RPOA 5M2VA 1B4HA 1B3HA 1NFTA 2VHAA 2UXAA 4BLAA 4XKPA 4THIA 4KPTA 1R1NA 2VP1A 3MW0A 4R73A 4LP2B 2DXRA 2V93A 3FGSA 5AA2B 3FVNA 3VXCA 1UTHB 3TMGA 2DE2A 3FXRA 2PT1A 2R9JA 4M4GA 3PUVE 1MDP1 5FHNA 1PBPA 3K1MA 1AOVA 1M5CA 1FTMA 3MVYA 1JVYA 4POWA 4U23A 4ZZAA 4HTGA 3V89B 2DQVA 2VGQA 1Y4CA 3P7IA 3K0VA 3ZS6A 3VV5A 1Y3QA 2I4CA 4DCXA 4ZEBA 4H1XA 1Y20A 1EU8A 1DSNA 4K3FA 4Q0CA 1ZU0A 1SYIA 2I3VA 2X7QA 3EQ1A 4F3BA 5DYHA 3MVXA 2X26A 2ZYKA 4NF4A 3K6XA 4GD5A 5L9SA 1ZBMA 2M8CA 3S9MC 1N84A 3TZAA 2ZNUA 3G3IA 2HAVA 3G3JA 4MLQA 1QULA 3KSXA 3U8QA 2THIA 4YZZA 1IQ7A 3O6HA 3V83A 3IB1A 1IXGA 1PC3A 4DXCA 1ELJA 3KG2A 5DVIA 1PBQA 1FQAA 1LAXA 2D5WA 3O28A 2F7CA 4DDDA 4U4XA 4QSEA 3TCHA 4BDLA 1A8FA 4H8IA 4TLMB 1AL3A 4HCWA 4IO7A 1VR5A 5ITOA 3IX1A 2Y84A 3ZKKA 5KDTB 4IGTA 2DWAA 4NF6A 3T9XB 5F7VA 4P0IA 1QUJA 2QSXA 3SEXA 4O3AA 5JEIA 2ONRA 2G29A 3C4MA 1PB8A 5DEXB 4OENA 3ZSFA 3UK4A 3M3FA 1B7HA 3F11A 1LAHE 1YPNA 3VXBA 2RCBA 4QF9A 1GVCA 1FTKA 5IKBA 1MY0A 2Q8JA 3TCFA 1EZ9A 1YCJA 5AA3A 3C34A 3CRBA 4ZE8A 2GFEA 4DZ1A 2ZMBA 3LSLA 1MY4A 2D3IA 4YB5A 4F1VA 3VLUA 4DIGA 4H5FA 5H8SA 1LBCA 4GLIA 2XXHA 1AIVA 1A55A 4HW8A 3PUWE 3G3KA 1Y9UA 3RQTA 4N6PA 1N04A 1GGGA 1ZMGA 4KQPA 1LGBC 4JWYA 1POY1 1S50A 5CC2A 1USYH 2QJEA 1JQFA 1N7WA 3MVZA 5FTIA 4JSDA 3CFLA 1I6BA 3T22A 3LSWA 3O2AA 1MXYA 3TKDA 2OJTA 3CVGA 3HHFA 4R6YA 4EXKA 3DP8A 1B0LA 4JWOA 1CE2A 3MQ9A 1LCTA 1Q35A 2F7BA 1MPDA 2P2AA 3O9PA 3SEVA 1FQDA 5L8DA 3CFXA 1B5IA 1MS7A 2DWIA 5K2YA 3KN8A 3CFZA 4F22A 3IOTA 3H3GA 4GQOA 1MQGA 3G3GA 1LB9A 1PB9A 3O6GA 3FASA 3LR1A 4H5GA 1MH3A 5ITPA 4LVQA 1TT1A 2F5XA 2AL4A 3T66A 3MAMA 5I56A 2QL3A 1DTZA 3KGCA 3KOTA 1A40A 3JZJA 1BP5A 2RINA 4MLVA 3RTFB 3M3KA 2F78A 2O7UA 4QRZA 3KJ7A 4OFLA 2Z8FA 1MQDA 1MM6A 3A3CA 3O97A 4C1TA 3RTWB 3DP6A 1SW2A 2DE4A 3FV1A 4O3CA 5H8FA 5IAIA 3G3HA 3T9VA 1YTVA 2HEUA 4OWDA 1NL5A 2O1MA 4EQ9A 3PPQA 1URGA 4GXSB 3CG3A 3OEMA 2B3BA 1UTBA 4MBPA 4OTEA 1MY2A 3K6UA 3G3FA 5TP9B 1B5JA 1MDQA 3RPWA 1H76A 3I3VA 2DVCA 1B58A 5CRYA 4GF8A 1B46A 1MRPA 4DXUA 1B7ZA 4IGRA 4QFKA 1D4NA 1B51A 1OVBA 3G7WA 3PPOA 2YLNA 4GIZA 5L9OA 4OFJA 1R9QA 4RA1A 3MP8A 4YB7A 3E4RA 2NVUB 3PUZE 1LCFA 1EZOA 2O68A 3QUJA 5AE4A 2NUVA 3MUQA 1FQFA 4G68B 3IJOB 4F1UA 4H6DA 4IB2A 5A5XA 4QFPA 4E0WA 4MH5A 1BKAA 3S9EA 4YB6A 3MPLA 1URSA 4G8HA 4Z0IA 1FTLA 1MPBA 4RJZA 5I58B 3Q25A 4FEDA 2VOZA 1MG1A 3TTRA 5I59B 1AMFA 3KZGA 4LZ8A 5CI5A 3IK6B 1A54A 3DM0A 3T93B 1TFDA 3HHGA 4JDFA 3FUZA 2FNCA 1M5FA 3OXNA 4U22A 3VFJA 5CBRA 4PFTA 1JW4A 5CM6A 1IITA 4QHQA 1L5TA 3BFUA 3DELB 2O1LA 5H8QB 2I0CA 2XX8A 1H3DA 2ABHA 1USYE 3PMXA 4GWOA 3PMWA 4YMBA 4OMBA 1I6QA 2Y7WA 2X7PA 2ZYOA 5DVFA 3VDFA 1Y4TA 2Q2AA 3EF7A 4IO4A 4KCCA 3HN0A 3Q28A 1ZKBA 4F19A 1O64A 5H8HA 2H4IA 4U1ZA 3KFMA 1BTJA 2REGA 5AA2A 3PMVA 4ZEIA 2RC8A 2XXUA 4C1UA 2OBGA 3B6WA 3ILTB 2D21A 1EH3A 2OK2A 1FQBA 3THIA 1P1WA 3FV2A 3SEYA 4ZZEA 3UORA 1POTA 4PETA 2QS4A 4AQ4A 4OESA 1JW5A 3FJ7A 1A8EA 2R6GE 1VE4A 4ZEKA 3UP9A 4F31B 1IEJA 2CZLA 3FXUA 2VD3A 3K6VA 1HSLA 3OO7A 4KYDA 2OZZA 4LA9A 2R71A 3EN3A 2UVIA 1DPPA 2P0SA 3RGYA 3VVFA 1US5A 2V3QA 4NF8B 2A5TA 4PFUA 2UVGA 1P99A 2LAOA 1A99A 1SBPA 1N7XA 3ZKLA 4GVOA 4G4PA 3FATA 2O69A 4RK2A 1N3XA 3M8UA 3OEKA 3QUFA 1B5HA 3MJNA 4KI0E 1OQGA 1GV8A 2XX9A 5HPQA 4I9DA 4YU0A 4OEVA 4NF5A 4FATA 5BWJA 2Q89A 3S2VA 2UYFA 4F1YA 5DEXA 3CR9A 4IO2A 4F2OA 3LSXA 4ELRA 4EF2A 2F8DA 4NF4B 1FQEA 2XXRA 3C9HA 3C33A 3H6TA 2F97A 3K00A 4F3SA 2F36A 1FCKA 4F3PA 1DTGA 1P1UA 1UIVA 3PUYE 3UN6A 4FIMA 1P1NA 2HZLA 1SYHA 3MWBA 4GRKA 1RKMA 1DPEA 4G68C 2H98A 3K6WA 1R6ZA 4FAJA 2PYYA 1GTKA 5ELVA 3B6TA 4R6HA 2H9BA 2H5YA 2XXWA 4OZ9A 1VFDA 4Q30B 1B32A 2RC7A 1URDA 3TODA 2XX7A 1LAGE 1PB7A 2XXIA 4R72A 1SDXA 4Q8RA 4JBZA 2O84X 2XXYA 1WVJA 3PUXE 4RY1A 4R2FA 1A7LA 2QPQA 1US4A 1LSTA 2AIXA 1XOCA 1MQIA 4IY6A 5K2XA 3WAFA 3OO6A 3K01A 4O3BA 3VVDA 2Q9TA 3C35A 4EF1A 3PPNA 1B2HA 1JEVA 2ZNTA 2XXVA 3S4UA 3H6UA 3QIMA 3WAEA 2GHBA 2NXOA 3OMBA 1IXCA 3KSJA 3U92A 5J1DA 4LUBA 3MC2A 3HCQA 1Z7ME 2ESNA 3O29A 3JV9A 1B52A 3TAJA 1LFIA 1LB8A 1MQJA 4I62A 2ONSA 3KBRA 2V3UA 4GL8A 3MZ9A 2I0BA 1PEBA 4H65A 3PGFA 1M5DA 2B3FA 3SEUA 4OETA 1B0HA 2XHDA 1T0KA 4N13A 4EXLA 4JXIA 3K1PA 1VSOA 4C0RA 3TYHA 3MP1A 5FHMA 4R74A 3L6HA 3FVOA 4DXBA 5I57A 4MF3A 4NEDA 4IO3A 4TQUQ 4I8CA 1B05A 3A3UA 5TPAA 1PDAA 1II5A 1SW5A 1QW0A 5L9MA 4ND9A 1QKAA 3U1OA 3T96B 3IL1B 5JTYA 1SW1A 4FJPA 1XC1A 5I56B 1DOTA 4R2BA 4XKNA 4XIGQ 2CMOA 4YMAA 2QS3A 1ATGA 1QUIA 3TCGA 3IORA 4DLDA 3OO8A 2UVJA 1MM7A 3Q27A 1B1HA 3U94A 3E13X 1SQYA 3ONMA 4BDRA 3D4GA 4I1DA 2OWSA 5H8FB 3C36A 1MQHA 2DOJA 3JYRA 1D3KA 3IOUA 4G68A 2HFBA 2HAUA 2V25A 2DYXA 4R9GA 1IZ1A 5AA4A 1DMBA 1NNPA 3SETA 1NH7A 2HZKA 2UYEA 2RKMA 2GHAA 4Z7EA 1EZPA 1OLCA 1Y3PA 3HO7A 4DE8A 1VFEA 4F39A 4IO6A 2HXWA 2F6PA 1JEUA 1FTOA 3GXAA 3RNNA 2QRYA 3HPIA 3V5AA 1LAFE 4RNSA 3BKIB 2AYSA 3BFTA 5DTBA 4PE5B 4G2ZA 4KYSA 4F2QA 4N07A 4YICA 5DVJA 4OHNA 5I2NA 4H0WA 5JK4A 1N76A 1D9YA 3FVKA 3Q26A 3MZBA 3N5LA 4ZEFA 2GH9A 3IOWA 3RT6B 5A5XB 5I84A 2HQ0A 5FHOA 4OEUA 5F1QA 4GL0A 4KCDA 4OERA 3U93A 3EPEA 5EYFA 1ZLQA 3UA8A 2Y7IA 4ISUA 1FTJA 2QMWA 1NNTA 1B3EA 4XXUA 1SI1A 1BIYA 5CMMA 4GFRA 4XKQA 4ZEDA 3EHSA 1OQHA 1UQWA 1ZJLA 4G77A 3TFLA 2DWHA 5KCJB 5CMKA 1H43A 4P11A 4FORA 4JWXA 2DXYA 2V3TA 2Y7KA 3R6UA 4PP0A 1XT8A 3QSLA 4UA8A 1UTHA 1S9TA 3USDA 3C31A 3W9WA 2XD3A 3QK6A 4RYAA 1XVXA 4QFNA 4TOZA 1QVSA 3GLBA 2VD2A 3QAXA 3LBSA 1B3LA 1TFAA 3CSGA 3H4ZA 2Q88A 1RYXA 4OQOA 2PMSA 3HV1A 4BDQA 2RCAA 1IXIA 5I2KB 3TELA 1B9JA 4X48A 1OLAA 5H8NB 1Z7NE 4NF8A 4ELQA 3KJTA 5H8HB 2V84A 1JW1A 1ZTYA 4POXA 1N3WA 2Q2CA 5B70A 4U21A 3MP6A 2DSFA 2DE3A 1KWHA 4X1BA 4IO5A 3DLNA 2UVHA 4JB7A 3EHTA 1GR2A 4YKIA 1NH8A 3CI8A 3C32A 3TDJA 3FXQA 1XHYA 3KOSA 4OXVA 3IB2A 3K4UA 1MPCA 3LSFB 4LZ5A 3O66A 1ZIUA 3TQWA 4HCYA 3E9XA 3K1NA 4U2RA 3OD7A 4F29A 3IJXB 4QSDA 4KD5A 5CBSA 4KFQA 5ICQA 3MPKA 3PU5A 4WEPA 1XS5A 5KDTA 3FJMA 2W7YA 3TTKA 1B3FA 2O7IA 4DCYA 3ECRA 2IA4A 1MXZA 1YAEA 2YPNA 2RC9A 1B6HA 4EUOA 3GZGA 3H6WA 2OCUA 5CMBA 4XKRA 2A5TB 4NMYA 3D4CA 3Q29A 2XXQA 3KEIA 3FVGA 4NE4A 1NNKA 3W9VA 1B4ZA 3PD8A 4R6KA 2I58A 4EQBA 3S9LC 1B40A 5CMCA 3SKPA 3LC8A 3RLFE 3ILUB 3ODBA 1Q1KA 4FEBA 3CSBA 4NF5B 2PT2A 4AB5A 3K02A 1D9VA 1OVTA 5BUUA 3L6GA 3IAZA 3RN8A 4H67A 4WEDA 1FQCA 1NNFA 2I49A 5EHSA 2B65A 1MXXA 1P1QA 5LOMA 4KYEA 4PQJA 2Z22A 1MH4A 4EQ7A 3FD3A 4FE8A 4NF6B 2XXTA 2QS2A 4XTCQ 2PBWA 1JETA 3MZ1A 3OO9A 2XD2A 4JSOA 1SW4A 4OVJA 3N26A 3RUMA 4R75A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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