2Z37A

Crystal structure of brassica juncea chitinase catalytic module (bjchi3)
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
244
structure length
244
Chain Sequence
DLSGIISRDQFYKMLKHMNDNDCHAVGFFTYDAFITAAKSFPSFGNTGDLAMRKKEIAAFFGQTSHETTGGWSGAPDGANTWGYCYKEEIDKSDPHCDSNNLEWPCAPGKFYYGRGPMMLSWNYNYGPCGRDLGLELLKNPDVASSDPVIAFKTAIWFWMTPQAPKPSCHDVITDQWEPSAADISAGRLPGYGVITNIINGGLECAGRDVAKVQDRISFYTRYCGMFGVDPGSNIDCDNQRPFN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitinase
publication title Crystal structures of a family 19 chitinase from Brassica juncea show flexibility of binding cleft loops
pubmed doi rcsb
source organism Brassica juncea
total genus 89
structure length 244
sequence length 244
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2007-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2z37A01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 2z37A02
4EOFA 3HBEX 4HSFA 3TXJA 4ETCA 3IJVA 3WXUA 5B05A 1G7HC 5LVHA 4TUNA 4ZFPA 4H92A 4Z46A 1HFZA 1KIQC 1YQVY 1LYSA 4PJ2C 4R0FA 5LVJA 1B5ZA 3TXKA 1AKIA 1HELA 1IOQA 1SQ2L 3HBHA 1DI3A 4HJVA 3N9CA 1GXXA 4X3BA 5B1GA 2F2NA 1LZ9A 1WQOA 1LSCA 3OJPA 1TCYA 2MEGA 5LA8A 3W3EA 3LYOA 3LYTA 1IR7A 3LYMA 4H9HA 1I20A 2AUBA 3LZTA 1VDTA 5APDA 1IP2A 1QSWA 4B1AA 1LZ4A 2BAAA 2FBDA 2YVBA 4WLXA 5C6LA 4XN6A 1GDXA 3P4ZA 5B06A 1CKDA 4YF2A 2IHLA 3CSRA 1B9OA 1LJJA 1IWZA 1G7MC 2YBMA 2EPEA 1IOTA 1OUGA 1D0LA 4HV2A 5FDJA 4LYZA 4P2EA 1JSFA 1HEOA 153LA 1GFKA 1C46A 1LZBA 4HV1A 4A7DA 5LVGA 2YDGA 3QNGA 4KL7A 4NGZA 1IC4Y 1V7TA 1GPQC 2HEFA 4G4BA 5KXNA 4WG1A 1C08C 4NSIA 2BQKA 1LZGA 1UIFA 2CWIA 1KIRC 2G4QA 1HSWA 2Z38A 5KXYA 4LYCA 4NGKA 4DYGA 5KXWA 3P66A 3QY4A 3EBAB 4CHXA 3T6UA 2CJLA 4NSGA 4WMGA 4ET9A 4G4HA 1BQLY 1JITA 2PC2A 2XTHA 2FYCA 1B7NA 4WG7A 1RCMA 1GE0A 4XJBA 1JPOA 1UIEA 3AGGG 1LSYA 4DD2A 1LAAA 1LHHA 1LTMA 4GCEA 4OWAA 1LJFA 2MEFA 1HNLA 2Z12A 1JKBA 4OWHA 1BGIA 4CFOA 2H9KA 1IY3A 1DI4A 3W6EA 2DQCY 4LFPA 7LYZA 4H94A 2MEBA 2BQJA 3OK0A 4C5FA 1GE1A 2LZTA 3SP3A 1GFRA 1TBYA 2MEAA 1LSMA 4NSHA 3AJNA 3AYQA 4IJ4A 1WQQA 1P2CC 5KXTA 4DT3A 2I25L 1WQPA 5I4WA 1HERA 1IOSA 4ETBA 4WL6A 1QUTA 1VATA 1DI5A 1GFHA 1LHLA 4J0LA 4QGZA 5B07A 1WTNA 2LYZA 1NBYC 1LHMA 3A3RX 2BQEA 4B0DA 4DWXA 3ATOA 3F6ZA 3AZ6A 4NG1A 1GB6A 1GAZA 1RI8B 4QEQA 3TXDA 4CGEA 4ETAA 2B5ZA 5IHGA 1NWGA 1LZ1A 2BQMA 2DQGY 1LMAA 4H9FA 4WO6A 1GFVA 4AGAA 4PPOA 1RE2A 4NGJA 4NWHA 1LZTA 4HPIA 4XJFA 1GB0A 5L9JA 1GEVA 1WVVA 4XYYA 3B0IA 1DPWA 4NHQA 4LYMA 4XJGA 1NDGC 3AGHA 4O34A 1LMNA 3D9AC 4KXIA 3WU8A 5FEKA 5LXWA 5HMVA 1ZV5L 1B0DA 1GBXA 1LMTA 4ET8A 2Q0MX 2D4IA 3HBDA 1GF4A 1YIKA 3WU9A 1BB3A 1WQNA 4H9EA 5IELA 2Y8PA 1LSZA 1YKZX 4R6CA 1GB3A 2ZQ3A 1JIYA 1GBWA 2G4PA 2ZIJA 2LZ2A 1LJ4A 2Z2FA 4TSCA 4BS7A 2C8OA 3P68A 3P65A 1JHLA 4GCFA 4XADA 3W6DA 1OUCA 3G3AB 5C6JA 4BAFA 1LMQA 1VDQA 5JENB 2XBRA 4H93A 5HMJA 3A93A 1ZVHL 1LJHA 2W1MA 5LAGA 5A3EA 1GF6A 1W08A 2BQDA 1XEKA 1HFXA 4OWEA 4ETEA 5KXOA 1LJ3A 1LSNA 3TMUA 4L41A 3WVXA 1FN5A 4OWBA 1NMMA 4MCKA 1XGTC 1D9UA 1B7SA 3ULRA 1H6MA 1IC7Y 1O23A 1A2YC 3WMKA 2W1LA 4GCBA 1ZVYB 5APEA 1GDWA 2YSSC 3WXTA 1C7PA 4WOAA 4CFPA 2A7DA 1I1ZA 3WVYA 1CNSA 1B5UA 1LSEA 1DKKA 4EMNA 3KAMA 5FCPA 1YL1X 1JSEA 2YBIA 4M4OA 1XGUC 1OUHA 1I56A 4WM1A 4IASA 1FLQA 1GFTA 1WTMA 4UWUA 4QY9A 1JWRA 4MSTA 4H8XA 3QE8A 1GBOA 1YAPA 1HMKA 3B0KA 4NHSA 1GE2A 1LJKA 5II3A 4H9AA 4NHTA 3A34A 3J4GA 4W94A 3TXIA 1UBZA 5LIOA 1DPXA 2H9JA 2XBSA 5ILFA 2ZQ4A 2A7FA 2HUBA 2BLXA 4I0CA 4G49A 4RLMA 1GFAA 1YKYX 3CQLA 3WYHA 1LHIA 1FLWA 1NBZC 2BQGA 3A6BY 5HNLA 4NFVA 1D0KA 3FI7A 1HENA 4N0JA 5KXMA 1IWXA 1LZNA 1NDMC 2BQIA 1G7LC 1B5VA 1GF7A 1YAOA 3TXHA 1ALCA 1IWWA 1D6QA 2D4KA 5HLLA 1A4VA 3TXBA 1XGQC 1LZYA 2GV0A 1MELL 3CT0A 5C6IA 3M18B 5KXXA 3WUMA 4NGIA 1LZRA 4HJZA 1IVMA 4WL7A 9LYZA 1QTEA 2Z39A 3WL2A 1BVXA 3T36A 3WPJA 4DD9A 5I4YA 1TEWA 5D5FA 1UA6Y 1VFBC 1OUDA 1JUGA 2Z2EA 1C45A 4HJYA 4LT0A 4NHIA 4LYOA 2C8PA 1FLUA 1JTOL 1NKHA 1LSPA 1OUIA 3HFMY 2HEDA 1BHZA 5FELA 1GXV2 3ZVQA 5I54A 5ILCA 1LSGA 3E3DA 1JKDA 2XJWA 4QDNA 5EBHA 4YEMA 3RNXA 1BB4A 1GFGA 1E8LA 5KKIA 1IR9A 3B72A 1CKFA 2D91A 4LYBA 1EQEA 1LYOA 4GCDA 6LYTA 5M1YA 1GE4A 1OUJA 2X0AA 4KPMA 4NGVA 1IO5A 3A3QA 4XJDA 1LZDA 2HEEA 1IEEA 2Z37A 4N1EI 3ZVQB 1AM7A 2EIZC 3AGIA 5KXRA 1YILA 1JTPL 1LSAA 2G4NA 3WW6A 1FBIX 1LOZA 1UIAA 2MEDA 1LZ6A 2MECA 2Z18A 1JJ0A 4H8YA 4H90A 4NSJA 4GLVA 1JISA 1FKQA 1BB7A 1GB8A 4AXTA 4II8A 4ZEEA 3CT5A 1G7JC 1QTKA 2F4GA 3G3BB 1BB6A 1IR8A 4B4JA 3CSZA 1HEWA 3WPKA 3D3DA 4DD7A 5F14A 2MEIA 5KXLA 4HTQA 5LINA 3B6LA 4H9IA 3TXEA 4OOTA 3RT5X 5I4XA 4BADA 4B4EA 1IX0A 4DD1A 5KXKA 3RU5A 1LJNA 5IDDA 1HMLA 1GAYA 1QSAA 1LJIA 1LCNA 2VB1A 4B49A 1INUA 1QDRA 2EKSC 4CJ2A 1YL0X 4GN4A 4TX7A 2DQIY 1DXJA 3LZ2A 1TDYA 207LA 3K3TA 4PRUA 1JEFA 3CSQA 4H9BA 1IP7A 1IP1A 1IWUA 4GLAA 4LT2A 2RSCA 2I26L 3TXFA 2H5ZA 1MLCE 1JKAA 1BVKC 1GBSA 1GD6A 4HTNA 4NIJA 4WLYA 4E3UA 1HC0A 1XEIA 5B59A 5KY1A 1DQJC 3TMVA 3EXDA 4OWCA 5KKJA 3A94A 1LZAA 1SLYA 1CKCA 2FYDA 3A92A 3J6KA 2ZWBA 1UIBA 2DQDY 2BQBA 1REMA 5L3HA 1RJCB 1OUEA 1LZSA 4HTKA 1IY4A 5APCA 5F9XA 2CDSA 1LZ8A 3AB6A 2DQJY 1DZBX 1B5YA 1LPIA 5HQ1A 1HEQA 2HU1A 5LYTA 132LA 2BPUA 1KXWA 194LA 1HHLA 3MGWA 1XSFA 1BWJA 3WPLA 4H8ZA 5FHWA 3ATNA 1JKCA 4FDYA 1IOCA 2NWDX 2BQCA 1IC5Y 5E9RA 1IP6A 1IORA 3AZ7A 1ZMYL 2BQNA 4OOOA 1LKSA 1QDTA 1GE3A 2DKVA 3IJUA 3AZ5A 1AT6A 193LA 1OUBA 1FDLY 2DQFC 1J1PY 1LJGA 3BKHA 3LYZA 4H91A 4WLTA 1PZYA 1CJ6A 1N4FA 2HEAA 4I8SA 4PRQA 1NQIA 3A6CY 3W6FA 1CJ8A 5T3FA 1LSBA 5HNCA 3TMXA 1AT5A 2D4JA 3AW7A 1B7OA 1CJ7A 1HSXA 4KT3A 4ZIXA 1WVUA 4M6DA 1LYZA 2W1YA 3A90A 1IP3A 4WM2A 1LZEA 3EO5A 1OP9B 2DQHY 4RDSA 1YKXX 3LHMA 5LAFA 1DKJA 1F10A 5KXSA 1J1XY 3WUNA 3ZEKA 1UUZC 1B7QA 5E4PA 1RFPA 3A67Y 3A95A 5K7OA 1GBZA 1IWYA 1YAMA 3FE0A 1D0MA 4HPEA 4RW1A 1UCOA 4NHPA 2ZNXY 4DDCA 5LYZA 1T6VL 4J1AA 1KXYA 1GB5A 1BWHA 4HP0A 2ZNWY 1CKHA 3WUAA 4NG8A 2DQEY 3AW6A 1BB5A 3B0OA 1GB2A 1YROA 1F6SA 4W96A 1LMOA 1D6PA 1JJ1A 3P64A 4H1PA 4NGYA 4WM3A 2MEEA 5DM9A 4OW1A 4XENA 5F81A 1UIHA 1GBYA 1XGRC 3A91A 8LYZA 1XFPL 1LHJA 4N8ZA 2BLYA 3AZ4A 2BQAA 2BQHA 5F9UA 1LYYA 5J7CA 4D9ZA 5D5CA 1F6RA 1OQMA 1VDPA 5APFA 5I53A 5F16A 3RW8A 3WULA 4DD0A 4PGJB 4TWSA 2LYMA 3BKVA 5DL9A 1PS5A 1UC0A 4N9RA 1KXXA 4U3XB 1B7RA 5FSTA 2BQOA 5KJ9A 1UIDA 4YENA 2LYOA 4DC4A 4ANRA 1IWTA 2ZILA 208LA 4NGWA 5L3IA 1B7PA 1UIGA 1XEJA 4NWEA 134LA 3TXGA 1GB9A 4G4CA 5DLAA 1Z55A 5LVIA 1B5WA 1G7IC 2BQLA 4NGLA 1IWVA 2IFFY 4WM6A 2HTXA 2DQAA 1LJEA 2ZYPA 4N5RA 5LA5A 1GF5A 4GN3A 1IP4A 1IP5A 2YBJA 3WH1A 1GHLA 2WARA 3A8ZA 2FBBA 1OUAA 4FJRA 4LZTA 1GF8A 4RLNA 3GXRA 3TMWA 1J1OY 1B2KA 4Z98A 2EQLA 4DDAA 2HU3A 4H9CA 3M3UA 1LMCA 4GN5C 1HF4A 1B5XA 4DD3A 4J7VA 1GB7A 1REXA 1IIZA 5LYMA 2LHMA 4LGKA 4NY5A 4WM4A 135LA 1YANA 2HEBA 4BAPA 1WQMA 2BQFA 4GCCA 3W6AA 1VAUA 1LMPA 1TAYA 5DN5A 1GEZA 1H87A 4ETDA 1AZFA 4YEOA 1W6ZA 3A96A 1T3PA 1UACY 1HEPA 5B1FA 4ML7A 4Z3MA 3GXKA 4NEBA 1NHEA 4J1BA 5KXZA 1BWIA 4YOPA 2I6ZA 1GFJA 1LZ5A 4TSBA 1GFUA 3CB7A 2W1XA 2D6BA 2ZYCA 4C3WA 1KIPC 1F0WA 4XJIA 1GFEA 1NF5A 4G9SA 2DBTA 5AMYA 2Z19A 1LZCA 4IATA 4NGOA 4LYTA 1YAQA 2F4AA 3VWOA 3WW5A 1LSFA 1JJ3A 3IWRA 3N9AA 3W6BA 4UWNA 5A3ZA 1GF9A 4WO9A 1EQ4A 1CJ9A 5KXPA 2MEHA 1XGPC 1GWDA 1HFYA 2YBNA 1LKRA 4LT1A 1EQ5A 1LHKA 4RW2A 1QIOA 3W6CA 3EMSA 1FLYA 1JTTL 2F30A 2HECA 1CKGA 1GF3A 3CT1A 3N9EA 4LT3A 1GF0A 1LSDA 1FKVA 4Z41A 1VEDA 1C43A 4XJHA 3RZ4A 4LFXA 1B7MA 1REYA 1C10A 1QQYA 4PHIA 4WM5A 133LA 1EL1A 5LVKA 1V7SA 4MR1A 1REZA 2YBHA 3WU7A 1B7LA 154LA 4DDBA 2YBLA 4TTDA 4YM8A 1OUFA 2N5ZA 4UWVA 1HEMA 5I5QA 1WQRA 4B4IA 4N1CC 1VDSA 2ZIKA 6LYZA 1UICA 1QUSA 2CGIA 3LN2A 4WLDA 5DN4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HBEX 4HSFA 1L15A 1PQKA 3OE0A 1C6PA 1PQOA 1HFZA 1KIQC 5LVJA 3GUOA 1B5ZA 1L03A 1L32A 118LA 1HELA 3C8QA 3HBHA 1DI3A 3N9CA 1GXXA 1WQOA 2RBPA 3LYOA 3QAKA 3LYTA 2AUBA 1VDTA 1QSWA 1LZ4A 2BAAA 1GDXA 5B06A 4YF2A 1L55A 1QSBA 2IHLA 1KY1A 2EPEA 3DN2A 3DN4A 240LA 4LDLA 153LA 4HV1A 4A7DA 1KNIA 4NGZA 2BQKA 2G4QA 2Z38A 3LZMA 4LYCA 1SX2A 3P66A 244LA 3T6UA 242LA 4WMGA 4G4HA 1OVHA 3C81A 2XTHA 4XJBA 2RH1A 4DD2A 1LSYA 1C61A 1D2WA 1LTMA 1OVKA 1LJFA 1DYBA 2H9KA 1DI4A 238LA 3V2YA 4LDOA 2MEBA 4C5FA 3AJNA 4IJ4A 5KXTA 4DT3A 3HH3A 1HERA 1QT4A 1QUTA 1DI5A 1GFHA 1WTNA 2BQEA 4B0DA 1D3JA 3ATOA 4NG1A 3TXDA 3UONA 1L84A 2DQGY 4H9FA 1QUGA 2RB2X 1GFVA 1RE2A 4NGJA 1L56A 1GB0A 1QT7A 3DN1A 5L9JA 1WVVA 4NHQA 1LMNA 3D9AC 3WU8A 5LXWA 1LGUA 1GBXA 2Z6BA 2Y8PA 1L65A 2G4PA 1LJ4A 2Z2FA 1JHLA 184LA 3G3AB 1L42A 1LMQA 1VDQA 3GUJA 4H93A 1ZVHL 1G07A 1L22A 1W08A 2BQDA 1HFXA 1CU2A 4OWEA 1CV4A 1LJ3A 3TMUA 1QS5A 4L41A 3HT8A 3ULRA 1B7SA 1IC7Y 2LCBA 2YSSC 1LYFA 1C7PA 4CFPA 5FCPA 1JSEA 4M4OA 4MSTA 126LA 3QE8A 4NHSA 1P37A 4ARMA 1C6BA 4NHTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4EOF A;  3HBE X;  4HSF A;  3TXJ A;  4ETC A;  3IJV A;  3WXU A;  5B05 A;  1G7H C;  5LVH A;  4TUN A;  4ZFP A;  4H92 A;  4Z46 A;  1HFZ A;  1KIQ C;  1YQV Y;  1LYS A;  4PJ2 C;  4R0F A;  5LVJ A;  1B5Z A;  3TXK A;  1AKI A;  1HEL A;  1IOQ A;  1SQ2 L;  3HBH A;  1DI3 A;  4HJV A;  3N9C A;  1GXX A;  4X3B A;  5B1G A;  2F2N A;  1LZ9 A;  1WQO A;  1LSC A;  3OJP A;  1TCY A;  2MEG A;  5LA8 A;  3W3E A;  3LYO A;  3LYT A;  1IR7 A;  3LYM A;  4H9H A;  1I20 A;  2AUB A;  3LZT A;  1VDT A;  5APD A;  1IP2 A;  1QSW A;  4B1A A;  1LZ4 A;  2BAA A;  2FBD A;  2YVB A;  4WLX A;  5C6L A;  4XN6 A;  1GDX A;  3P4Z A;  5B06 A;  1CKD A;  4YF2 A;  2IHL A;  3CSR A;  1B9O A;  1LJJ A;  1IWZ A;  1G7M C;  2YBM A;  2EPE A;  1IOT A;  1OUG A;  1D0L A;  4HV2 A;  5FDJ A;  4LYZ A;  4P2E A;  1JSF A;  1HEO A;  153L A;  1GFK A;  1C46 A;  1LZB A;  4HV1 A;  4A7D A;  5LVG A;  2YDG A;  3QNG A;  4KL7 A;  4NGZ A;  1IC4 Y;  1V7T A;  1GPQ C;  2HEF A;  4G4B A;  5KXN A;  4WG1 A;  1C08 C;  4NSI A;  2BQK A;  1LZG A;  1UIF A;  2CWI A;  1KIR C;  2G4Q A;  1HSW A; 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 4J7V A;  1GB7 A;  1REX A;  1IIZ A;  5LYM A;  2LHM A;  4LGK A;  4NY5 A;  4WM4 A;  135L A;  1YAN A;  2HEB A;  4BAP A;  1WQM A;  2BQF A;  4GCC A;  3W6A A;  1VAU A;  1LMP A;  1TAY A;  5DN5 A;  1GEZ A;  1H87 A;  4ETD A;  1AZF A;  4YEO A;  1W6Z A;  3A96 A;  1T3P A;  1UAC Y;  1HEP A;  5B1F A;  4ML7 A;  4Z3M A;  3GXK A;  4NEB A;  1NHE A;  4J1B A;  5KXZ A;  1BWI A;  4YOP A;  2I6Z A;  1GFJ A;  1LZ5 A;  4TSB A;  1GFU A;  3CB7 A;  2W1X A;  2D6B A;  2ZYC A;  4C3W A;  1KIP C;  1F0W A;  4XJI A;  1GFE A;  1NF5 A;  4G9S A;  2DBT A;  5AMY A;  2Z19 A;  1LZC A;  4IAT A;  4NGO A;  4LYT A;  1YAQ A;  2F4A A;  3VWO A;  3WW5 A;  1LSF A;  1JJ3 A;  3IWR A;  3N9A A;  3W6B A;  4UWN A;  5A3Z A;  1GF9 A;  4WO9 A;  1EQ4 A;  1CJ9 A;  5KXP A;  2MEH A;  1XGP C;  1GWD A;  1HFY A;  2YBN A;  1LKR A;  4LT1 A;  1EQ5 A;  1LHK A;  4RW2 A;  1QIO A;  3W6C A;  3EMS A;  1FLY A;  1JTT L;  2F30 A;  2HEC A;  1CKG A;  1GF3 A;  3CT1 A;  3N9E A;  4LT3 A;  1GF0 A;  1LSD A;  1FKV A;  4Z41 A;  1VED A;  1C43 A;  4XJH A;  3RZ4 A;  4LFX A;  1B7M A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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