2Z39A

Crystal structure of brassica juncea chitinase catalytic module glu234ala mutant (bjchi3-e234a)
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
246
structure length
246
Chain Sequence
FGDLSGIISRDQFYKMLKHMNDNDCHAVGFFTYDAFITAAKSFPSFGNTGDLAMRKKEIAAFFGQTSHETTGGWSGAPDGANTWGYCYKEAIDKSDPHCDSNNLEWPCAPGKFYYGRGPMMLSWNYNYGPCGRDLGLELLKNPDVASSDPVIAFKTAIWFWMTPQAPKPSCHDVITDQWEPSAADISAGRLPGYGVITNIINGGLECAGRDVAKVQDRISFYTRYCGMFGVDPGSNIDCDNQRPFN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Brassica juncea
publication title Crystal structures of a family 19 chitinase from Brassica juncea show flexibility of binding cleft loops
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase
total genus 90
structure length 246
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2007-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2z39A01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 2z39A02
4WM3A 1DXJA 4WLTA 3W6BA 4GLAA 1DI3A 1LSEA 2ZYCA 5LVJA 1JKCA 2W1YA 1IP1A 4GCCA 1GF8A 4NSGA 5IDDA 5L3IA 3N9CA 1AKIA 2YBLA 2XBRA 1REMA 3A3QA 2ZIKA 1HEPA 1HF4A 5IHGA 3WW5A 1GBZA 2B5ZA 4NG1A 1EL1A 1HEOA 5ILCA 1LOZA 1W6ZA 1J1XY 1AZFA 135LA 1G7IC 2EQLA 4ETAA 1YQVY 1D9UA 4TSCA 4XJHA 3AGGG 4LYCA 1C10A 1WQOA 3EXDA 1INUA 4WM6A 4B4EA 1GAYA 5KJ9A 4LZTA 1GF6A 1A2YC 2BQJA 1GF7A 3WUMA 1GBWA 1B9OA 1WQNA 4M6DA 3WUAA 2YSSC 3TXGA 1FBIX 1HSXA 2MECA 1CJ8A 1REXA 2W1MA 3D9AC 5LIOA 3W6DA 3B72A 2LYZA 2Q0MX 3GXRA 3WULA 1HSWA 5DN4A 2X0AA 1C7PA 4LYOA 5I4YA 5ILFA 1HNLA 1LJHA 1TAYA 2DQEY 5B1FA 1QSWA 3T6UA 1BB5A 1J1OY 3A34A 4GCFA 3WU9A 1IWUA 4H9HA 2Z12A 5LA5A 1IO5A 1LJFA 1DPXA 1IR7A 1LSFA 4HSFA 4PRQA 4BADA 3GXKA 4QGZA 4NY5A 4G4BA 4DC4A 4DD3A 1IOSA 1IWWA 4HTNA 1WTMA 4DD7A 3WUNA 1WQPA 2YVBA 2BQNA 1DI5A 4WO9A 5JENB 4NSJA 3QY4A 4FDYA 5APCA 1TBYA 4G4CA 1LZ8A 207LA 1IC4Y 4L41A 1HMLA 3WPJA 2YBNA 5FHWA 2HEFA 1GEZA 3CT1A 1GE3A 2D91A 3B0OA 4HJYA 4II8A 1HENA 3TXIA 2HU3A 1WQMA 2HU1A 4OW1A 1B7MA 4ETBA 2XJWA 4DWXA 2DQGY 5KXPA 1QUTA 1W08A 1LJJA 4NWHA 1LCNA 4OWHA 4AXTA 2YBIA 1GB0A 1DQJC 4J1BA 4NFVA 4TTDA 3EBAB 4IATA 1YIKA 1GBOA 3MGWA 1IWZA 4B1AA 3W6FA 1B7SA 1RE2A 5KKIA 3P68A 4DD0A 1AT5A 1IOCA 1UC0A 5EBHA 1NQIA 2EKSC 4NG8A 4HJVA 5AMYA 5KXWA 1YL0X 5A3ZA 4HV2A 3TXJA 1NMMA 1XSFA 2HEBA 2HTXA 1YKYX 3OJPA 1V7SA 1OP9B 2YBMA 4Z98A 3G3AB 1NF5A 4BAPA 1QQYA 4WG7A 1VATA 1GFAA 4XYYA 1GE0A 1TCYA 4ETCA 1HEMA 1WVUA 3HBHA 4HP0A 1LMTA 3WVYA 2IFFY 1KXWA 1GB7A 4WLDA 5F9UA 3ULRA 3HFMY 1LYZA 2A7FA 1FLUA 1GF3A 1LYYA 2Z18A 3AJNA 3W6EA 4DDCA 4ET8A 1OUCA 4P2EA 4B49A 1XGQC 1LSZA 4M4OA 7LYZA 1B5YA 1E8LA 1JKDA 2ZNWY 1IVMA 1LAAA 4N0JA 1GB2A 4GN5C 3AZ5A 1D0KA 4KXIA 1HHLA 4OOTA 4N8ZA 2BPUA 1YL1X 1TEWA 1GF5A 1Z55A 4GCDA 4GLVA 4B0DA 3FE0A 2CJLA 5LVHA 4CHXA 1GWDA 1RJCB 4D9ZA 2FBDA 1OUIA 2Z37A 1IEEA 3A95A 3AB6A 5LVIA 4U3XB 2ZYPA 4Z3MA 2BQKA 1OUBA 1VEDA 1LHKA 2ZQ3A 4UWVA 1GHLA 1RCMA 2BQIA 4XJFA 1GF0A 2XTHA 3AGHA 3TMVA 4ZFPA 1B7RA 4B4JA 1OUEA 4ET9A 2F2NA 1JTOL 5II3A 3RT5X 1ZVYB 4WM2A 1LMAA 1GFJA 2LZTA 3AZ6A 5I5QA 132LA 5HNLA 1F6SA 5HQ1A 1YROA 1HFYA 4IJ4A 2F30A 4N1EI 193LA 1KIQC 4H8YA 4OWEA 1YAPA 4NGYA 5C6LA 4MCKA 1IR8A 4XJGA 5KXKA 208LA 4KPMA 2FYDA 3IWRA 2CDSA 1GB8A 9LYZA 2H5ZA 4I8SA 3LYMA 1XGRC 2MEBA 1XEKA 1IY3A 1QTEA 1D0LA 2BQOA 5KXXA 4NGIA 4Z41A 1RFPA 4RDSA 4HTKA 4E3UA 194LA 5APDA 2LYMA 4NGOA 5HNCA 2W1XA 3AGIA 4H1PA 4N1CC 1CKFA 1LHIA 2Z38A 4LYZA 4YEOA 4H9AA 2Y8PA 1IWXA 1LZRA 5KXOA 3M18B 2I6ZA 4PGJB 1B5VA 1OUFA 2ZWBA 3B6LA 4NWEA 1GXV2 3ATNA 3WU7A 4WLYA 4YENA 4O34A 3CSRA 4BAFA 1IP2A 4C5FA 4CFOA 3CSZA 4WL6A 4ETDA 153LA 5LXWA 1GFRA 1AM7A 2MEGA 1LZ5A 1QUSA 2CGIA 1C45A 4EOFA 1UIGA 3HBDA 2I25L 4RW1A 4ANRA 1BVKC 5A3EA 3E3DA 1GAZA 1JTPL 1IP3A 2H9KA 2HUBA 1YAMA 5T3FA 4NHIA 1KIRC 1GBYA 3WYHA 1OUDA 5FELA 1NKHA 1XEJA 4H9EA 2G4PA 5KXLA 1NBYC 2DKVA 4GN4A 4NGLA 4H92A 1LMNA 1HFXA 1GFGA 2N5ZA 3SP3A 1IWTA 1HEWA 2MEFA 4OWCA 5FSTA 5C6IA 1UCOA 1EQ4A 1B7LA 1IWVA 3WPLA 4QEQA 1I20A 3A94A 5I4WA 1FLWA 3A6BY 5DM9A 5LAGA 2A7DA 4UWNA 1JHLA 3CT5A 3M3UA 4DD2A 5D5FA 1BWJA 2DQFC 1LSBA 1G7LC 5K7OA 2BQCA 4HPEA 1ALCA 1F10A 3J4GA 3AZ7A 1IR9A 2XBSA 3P66A 4WLXA 4DYGA 3EMSA 4R0FA 4GCBA 1GF4A 1IP4A 1KIPC 1LSAA 1V7TA 1BB4A 1LKSA 1XEIA 2YBJA 4WM5A 4WOAA 1IIZA 4LT1A 4WO6A 5B05A 4G4HA 1J1PY 3W6AA 3CT0A 1T3PA 5I53A 1A4VA 4GN3A 1F6RA 1T6VL 3LYOA 2NWDX 1JIYA 1VDSA 5I54A 1B7QA 2HEEA 1NBZC 3A8ZA 2W1LA 5LAFA 5KXTA 1BWHA 1IC7Y 2D4JA 2MEAA 2Z2FA 4H94A 3WW6A 3ZEKA 5KXYA 5APFA 1HERA 4FJRA 4H9IA 2BLXA 4H90A 5L9JA 1LZNA 3K3TA 1LZSA 2D4IA 1GFUA 2F4AA 3QE8A 1BB3A 4CFPA 2YDGA 2AUBA 1G7JC 4XJIA 5M1YA 1WQRA 1FKVA 1XGTC 2IHLA 1B5ZA 4EMNA 1DKKA 2MEHA 1KXYA 3CSQA 3LYTA 4NGWA 5DL9A 4B4IA 1UIBA 4LT2A 1GFVA 1JTTL 3ATOA 1GE4A 1GB5A 1OUGA 5KXNA 1JJ3A 1LZ9A 2BLYA 4NSIA 4DT3A 1I1ZA 1JISA 2YBHA 4J0LA 1GXXA 5F14A 1G7MC 1HMKA 1UUZC 1G7HC 1VDPA 2HEDA 4H8XA 1LSNA 2MEDA 4OOOA 1B5XA 3TXFA 1HFZA 5B1GA 1JUGA 4OWBA 1LJEA 1LZTA 1FLQA 1IP7A 4W96A 1UIHA 1F0WA 3AW6A 1IOQA 2HEAA 4NHQA 3TXEA 4NHTA 3W6CA 4MR1A 1LJ4A 3AZ4A 3WH1A 2VB1A 1IOTA 1QDTA 2ZNXY 1QSAA 1GDWA 3EO5A 4LYBA 4OWAA 4W94A 3WMKA 4PHIA 4MSTA 1ZVHL 3LZTA 3RW8A 4LYMA 3TXHA 3ZVQA 1LMQA 3IJUA 4H9BA 3A90A 4Z46A 1XFPL 5KXMA 5HLLA 2I26L 4BS7A 1UBZA 1AT6A 3AW7A 4XJBA 2GV0A 1VAUA 3WXTA 1LJNA 5F81A 2MEIA 1IP6A 6LYZA 3TXKA 1VDTA 1XGPC 1JWRA 2FYCA 4G49A 1FLYA 1CNSA 2Z39A 1CKCA 1D6QA 2Z2EA 1LZCA 3TMXA 5C6JA 1B7PA 4ETEA 3VWOA 2EPEA 4ML7A 4HTQA 4TX7A 3J6KA 3WXUA 1SLYA 1LYOA 5LYMA 1LPIA 5E4PA 5DN5A 2WARA 3WPKA 3TMUA 2BQAA 1GB3A 1REZA 1UIEA 1VDQA 4NHSA 2DQAA 1HC0A 1LMOA 134LA 1WQQA 1BGIA 1JKBA 4LGKA 1B0DA 2BAAA 3OK0A 4H8ZA 4HJZA 4RW2A 3IJVA 1NDMC 1DZBX 1UACY 1UICA 4N5RA 1BVXA 1D0MA 5F9XA 3B0IA 3G3BB 3ZVQB 2ZQ4A 4J7VA 133LA 2BQMA 1LZGA 4RLMA 1LYSA 1YKZX 1GD6A 1GFEA 2FBBA 2LHMA 4H93A 4LT3A 1GFTA 4KT3A 4NIJA 4XN6A 1C08C 3A91A 1FKQA 1TDYA 3W3EA 3BKVA 3T36A 1BB6A 1C46A 1LJIA 1LSMA 1LSGA 4AGAA 5J7CA 5KY1A 5DLAA 5D5CA 4CGEA 5B07A 5L3HA 1LMPA 4H91A 3FI7A 1GFKA 1EQEA 2ZILA 4PRUA 1LSDA 1YAQA 2HECA 1ZV5L 4PPOA 5LVGA 1DPWA 1P2CC 1CKDA 1MELL 3TXDA 5B59A 4TWSA 1B7NA 1BWIA 1IORA 1VFBC 4HPIA 4TSBA 1B5UA 4ZIXA 1IC5Y 1UIFA 2C8PA 1DI4A 3N9EA 1IP5A 1LTMA 1H87A 3BKHA 1GEVA 1LJKA 2C8OA 2EIZC 1UIDA 1NHEA 4HV1A 2BQGA 2G4QA 1LZBA 4NHPA 4NGVA 1B5WA 1LKRA 3N9AA 1GE2A 2Z19A 3TMWA 1LMCA 1GF9A 1QIOA 5APEA 3RZ4A 3CQLA 1DKJA 1OUHA 1REYA 2LZ2A 3P64A 1NWGA 3A93A 1LHHA 1WTNA 5B06A 5LYZA 1QTKA 1GBSA 3WU8A 1B2KA 4CJ2A 5I4XA 3KAMA 1KXXA 1GFHA 1JSFA 4LT0A 1LZYA 4DDBA 5HMVA 3B0KA 4NSHA 4H9FA 4KL7A 4NGKA 5KXZA 4I0CA 1NDGC 2DBTA 5LINA 3CB7A 1JITA 1YKXX 1LZ1A 3A67Y 3A96A 1YAOA 4QDNA 1D6PA 4YF2A 5KKJA 4DDAA 2BQDA 1O23A 4PJ2C 1CJ6A 3RNXA 4YOPA 1H6MA 4G9SA 4WMGA 1ZMYL 3RU5A 5FCPA 2PC2A 1XGUC 4TUNA 1JKAA 1MLCE 1LHJA 1RI8B 2BQBA 4XENA 154LA 4LFPA 5HMJA 1B7OA 4YEMA 4N9RA 1N4FA 3HBEX 1GB6A 2DQJY 2DQHY 1CJ9A 5FDJA 3QNGA 3AYQA 4LYTA 1BHZA 1I56A 1UA6Y 1YANA 3D3DA 5LVKA 1LSCA 1CKHA 2DQIY 4NGZA 1OQMA 1QDRA 1IWYA 1GPQC 2CWIA 4UWUA 4XADA 1JEFA 1GDXA 1IY4A 4C3WA 1C43A 4WG1A 2D4KA 2H9JA 5LA8A 2DQDY 3P4ZA 1JSEA 4J1AA 4X3BA 1IX0A 5IELA 1HEQA 1OUAA 3LZ2A 4DD9A 4GCEA 5KXRA 4DD1A 1LHLA 3P65A 1JJ1A 4IASA 1GB9A 2BQEA 4NEBA 4NGJA 3F6ZA 1LZAA 3LN2A 4A7DA 1LSYA 5KXSA 1GBXA 4YM8A 1SQ2L 1LSPA 4R6CA 2BQLA 1BQLY 1LJ3A 5FEKA 1LZDA 4XJDA 6LYTA 2DQCY 1JJ0A 1FN5A 2MEEA 1PS5A 1LHMA 1LZ4A 1FDLY 4QY9A 1LJGA 1EQ5A 3TXBA 1WVVA 4WM1A 4LFXA 1GE1A 3WVXA 1PZYA 1CKGA 3A6CY 1CJ7A 3LHMA 2LYOA 2F4GA 2G4NA 1UIAA 2BQHA 2RSCA 5E9RA 4WL7A 4ZEEA 2ZIJA 3LYZA 5F16A 3A92A 1LZEA 1YILA 1JPOA 8LYZA 4WM4A 1HELA 2D6BA 4RLNA 3A3RX 1LZ6A 4H9CA 5LYTA 2BQFA 3WL2A 1OUJA 1BB7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XJTA 4WM3A 2XQOA 4WLTA 113LA 1DI3A 2W1YA 4NSGA 1GF8A 4I7QA 251LA 1REMA 3A3QA 3WW5A 4NG1A 3HT9A 135LA 1YQVY 1T6HA 2NTHA 1L51A 4LYCA 3EXDA 1CU6A 4LZTA 3WUMA 1A2YC 1JTNA 2MECA 1ZURA 3W6DA 1L66A 2Q0MX 3K2RA 3HH6A 3C8SA 4LYOA 1TAYA 2DQEY 1QSWA 234LA 5LA5A 4QGZA 1L52A 4DC4A 4HTNA 1CV4A 1WQPA 4WO9A 5APCA 201LA 1LZ8A 207LA 1QT4A 3WPJA 2YBNA 5FHWA 2OTYX 3B0OA 4II8A 4HJYA 3TXIA 1QUGA 151LA 4OW1A 170LA 2DQGY 1QUTA 4OWHA 1LCNA 2YBIA 4J1BA 1DQJC 3W6FA 1B7SA 1RE2A 1UC0A 4I7TA 1LYJA 4HV2A 3TXJA 1XSFA 1L87A 3OJPA 1LI6A 1L33A 4Z98A 1NF5A 4W51A 1C6BA 1GFAA 1GE0A 1TCYA 1DYCA 4HP0A 1LMTA 2IGCA 3WVYA 1GB7A 4WLDA 5F9UA 3HFMY 1LYZA 1GF3A 1L94A 2RH1A 2NTGA 222LA 144LA 1E8LA 1LYIA 1HHLA 1L15A 236LA 1L34A 1GF5A 4GCDA 4B0DA 3NYAA 5LVHA 1RJCB 2FBDA 1OUIA 2Z37A 4W58A 2A4TA 225LA 1VEDA 2BQKA 2ZQ3A 4Z3MA 4ZFPA 3AGHA 3TMVA 1OUEA 2F2NA 1L05A 3C7YA 1GFJA 132LA 5HQ1A 120LA 4OWEA 193LA 1L74A 150LA 4DQ7A 4ARPA 1GB8A 9LYZA 1CV0A 2H5ZA 3SB5A 3LYMA 2MEBA 3SB8A 2BQOA 1C6IA 4Z41A 2QARC 3CDTA 4E3UA 2W1XA 3AGIA 1LHIA 2Z38A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4WM3 A;  1DXJ A;  4WLT A;  3W6B A;  4GLA A;  1DI3 A;  1LSE A;  2ZYC A;  5LVJ A;  1JKC A;  2W1Y A;  1IP1 A;  4GCC A;  1GF8 A;  4NSG A;  5IDD A;  5L3I A;  3N9C A;  1AKI A;  2YBL A;  2XBR A;  1REM A;  3A3Q A;  2ZIK A;  1HEP A;  1HF4 A;  5IHG A;  3WW5 A;  1GBZ A;  2B5Z A;  4NG1 A;  1EL1 A;  1HEO A;  5ILC A;  1LOZ A;  1W6Z A;  1J1X Y;  1AZF A;  135L A;  1G7I C;  2EQL A;  4ETA A;  1YQV Y;  1D9U A;  4TSC A;  4XJH A;  3AGG G;  4LYC A;  1C10 A;  1WQO A;  3EXD A;  1INU A;  4WM6 A;  4B4E A;  1GAY A;  5KJ9 A;  4LZT A;  1GF6 A;  1A2Y C;  2BQJ A;  1GF7 A;  3WUM A;  1GBW A;  1B9O A;  1WQN A;  4M6D A;  3WUA A;  2YSS C;  3TXG A;  1FBI X;  1HSX A;  2MEC A;  1CJ8 A;  1REX A;  2W1M A;  3D9A C;  5LIO A;  3W6D A;  3B72 A;  2LYZ A;  2Q0M X;  3GXR A;  3WUL A;  1HSW A;  5DN4 A;  2X0A A;  1C7P A;  4LYO A;  5I4Y A;  5ILF A;  1HNL A;  1LJH A;  1TAY A;  2DQE Y;  5B1F A;  1QSW A;  3T6U A;  1BB5 A;  1J1O Y;  3A34 A;  4GCF A;  3WU9 A;  1IWU A;  4H9H A;  2Z12 A;  5LA5 A;  1IO5 A;  1LJF A;  1DPX A;  1IR7 A;  1LSF A;  4HSF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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