The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
66
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sequence length |
151
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structure length |
151
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural Characterization of the Fleeting Ferric Peroxo Species in Myoglobin: Experiment and Theory
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen binding
|
| molecule keywords |
Myoglobin
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| total genus |
66
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| structure length |
151
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| sequence length |
151
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-08-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YVT A; 2ZLX A; 2ZLV B; 4ESA B; 3AQ6 A; 7HBI A; 4FC3 B; 1LA6 B; 3FS4 B; 3ARL A; 3MJU A; 1QSH A; 2ZS0 A; 2Z85 A; 3GLN A; 4O2G A; 2QU0 B; 3E55 A; 3WTG B; 3D17 B; 1Y31 B; 1I3E A; 3ZJS A; 1YVQ B; 2BNL A; 1G0B B; 2AV3 A; 1DXT B; 1GLI B; 3CIU B; 3AG0 A; 1A00 B; 5HLX A; 1S5Y B; 3NFE B; 2HCO B; 1DM1 A; 1YEQ B; 4BJA A; 3WCV B; 3VRG B; 1YE2 B; 1CP5 A; 5KDQ B; 2D2N D; 5JOM A; 1DLW A; 1BUW A; 2QRW A; 1KD2 B; 2XKI A; 3HF4 B; 2LH3 A; 1IOP A; 3LQD A; 3WCU D; 2FAL A; 4F6J A; 1BIN A; 1YCB A; 3PI2 A; 1MNJ A; 3AQ9 A; 3LR9 A; 4YU4 A; 2HBG A; 4HSX A; 3UGY A; 1SHR B; 3HHB B; 1YH9 A; 1PMB A; 1HGC A; 3ZJJ A; 3WR1 B; 1YHU B; 4N8T A; 1S0H A; 1YHR B; 1MBD A; 4O35 A; 1V75 A; 1BZ6 A; 2B7H A; 1HLB A; 103M A; 1HBB B; 4IRO A; 4FWY A; 1KFR A; 2G0R A; 1HAC A; 4NXC A; 3IA3 B; 1BZ0 B; 4F68 A; 1CG5 B; 1Y22 B; 3FH9 B; 1YGD B; 1URY A; 2W31 A; 1Y4P B; 3AT5 B; 1Y85 B; 4IT8 A; 1DTM A; 3WCT A; 2ZSZ A; 1MBC A; 3GYS A; 1CG8 A; 3QJE A; 4DC7 A; 1JP8 A; 2ZSR A; 4MQG A; 3PIA A; 1XZ4 B; 2Z6S A; 3VRE B; 1UIW B; 2O5L X; 1Y8H A; 5KER B; 1Y0T A; 1OFJ A; 2DHB A; 1T1N A; 1O1M B; 1O1N B; 1MKO A; 4ROM A; 5JDO C; 2MYB A; 1UFP A; 1BZ1 A; 1HLM A; 1DUK A; 1DWR A; 2NSS A; 5C6E B; 1I3D A; 3QM5 A; 3KUN A; 2NX0 A; 1G0A B; 5CN9 A; 1XZ7 B; 2ZLW A; 1O1I A; 1DXU A; 1SI4 A; 3UBV A; 2HBS B; 1UVY A; 3LB3 A; 1R1Y A; 1NEJ B; 2AA1 B; 5CN6 A; 2G0S A; 5HU6 A; 1SPE A; 3MJP B; 1XYE B; 3ODQ A; 4MQK B; 1N9I A; 3MOU A; 4ROL B; 2MGJ A; 2ZLU A; 1MYT A; 1F5P A; 5HBI A; 2QFN A; 1FLP A; 4OF9 A; 1EBC A; 1J7Y B; 1V9Q A; 2ZS0 C; 4TWU A; 2O5S X; 3LB1 A; 3ASE A; 2DN2 A; 1JP9 A; 2D5X B; 1YDZ A; 4WCH D; 4UIQ A; 1DUO A; 4ODC A; 1BVC A; 3GQP B; 1DO1 A; 1ECA A; 1UMO A; 1Y0A A; 3D1A B; 1YZI B; 1MNO A; 1Y7D B; 1IRC A; 3DHT B; 1CMY A; 1IRD A; 1D8U A; 1HDS B; 3AQ7 A; 4MBA A; 3TLD A; 3LR7 A; 2G0Z A; 3D1K A; 2H8F B; 2GTL C; 3WHM B; 5JDO E; 1XZU B; 2ZFO C; 1AJG A; 5CN5 A; 2BW9 M; 5F0B A; 1CQ2 A; 1V4X B; 1WLA A; 1XZ2 A; 1Y0W B; 5MBN A; 2G12 A; 2DXM B; 5HLQ A; 2DN1 A; 3GKV A; 1GBV A; 2GKM A; 1BZP A; 2GNV A; 5E6E B; 1X9F A; 1CH3 A; 5SW7 B; 3WCW B; 4AVD A; 1Y83 A; 5CNC A; 1BIJ B; 2LHB A; 2LH5 A; 3OZU A; 3A9M A; 2MGG A; 3A5B A; 5AZR A; 3ZJL A; 1YHU D; 1YFF B; 1IDR A; 1OUU A; 2ZLT B; 2MGL A; 3HXN B; 1NS6 B; 1COH A; 1QPW B; 2WY4 A; 1XZV A; 3QQQ A; 1YG5 B; 1Y09 A; 4G51 A; 3ZJM A; 3PT8 A; 2QMB A; 1VXE A; 3ZHW A; 1Y4V A; 3MKB B; 3UHV A; 3GDJ A; 2O5M X; 1FHJ A; 1Y7Z A; 1CBM A; 1HBR B; 3OO4 A; 3BOM B; 5HY8 B; 1VXF A; 3UHG A; 1DXV B; 3BCQ B; 2PGH A; 1HJT A; 1NS9 A; 1MLO A; 1TU9 A; 5ILM A; 3EU1 B; 2W72 C; 1LFY A; 1WVP A; 2RI4 B; 4B3W A; 1B86 A; 1J7S B; 1ECN A; 2EKU A; 1F63 A; 2V1E A; 3UH3 A; 2OH9 A; 1Y4G A; 2ZST A; 3BA2 A; 5CHR A; 4FWZ A; 3UHE A; 1LFZ A; 1OBM A; 1HBG A; 1Y46 B; 3UH6 A; 3CY5 B; 4YU3 B; 4H2L B; 2D2N A; 3AT6 A; 1MYJ A; 1R1X A; 1LH5 A; 2FRK X; 3A5G A; 2LH7 A; 1MLN A; 1NZ4 A; 1V4U A; 4ILZ A; 3QM6 A; 2AUR A; 3QJB A; 3UHD A; 3OGB A; 4U8U C; 5CNB A; 2OHB A; 4N7N A; 1UFJ A; 1Y5K B; 2G11 A; 1Y4F A; 1LFT B; 3R5I A; 1EBT A; 1LFV A; 3QZZ A; 1SDK B; 2MGI A; 1NIH B; 3UHI A; 2ZT4 A; 1WMU A; 1O1L B; 1MLF A; 1LJW A; 2ZT2 A; 3ONZ B; 2DN3 A; 4UZV A; 1JW8 A; 3SDH A; 2W6Y A; 3UHS A; 4F4O B; 3TM9 A; 1GCW B; 2MGM A; 3P5Q A; 3WCU B; 106M A; 1HBH B; 5F2A A; 3WFW A; 1J3Y B; 5EE4 C; 3NL7 A; 1Y35 A; 4MQH A; 4HRR B; 1IWH A; 2HBF A; 2D2M B; 1LTW A; 4PQC A; 1A3N A; 6HBI A; 1OR6 A; 1OUT B; 3OO5 B; 2Z8A A; 3SZK B; 4HHB B; 3K8B A; 1MBO A; 3ZJN A; 4F6G A; 1QSI B; 4L7Y B; 1J52 A; 6HBW B; 1XXT B; 2GDM A; 3G52 A; 2W6X A; 1BAB B; 2MGD A; 1VXB A; 4M4B B; 2ZS1 A; 1XY0 B; 4NK1 A; 4NI0 B; 1C7C B; 3GOU B; 1Y8K A; 1J3F A; 1GZX B; 2DC3 A; 3HRW A; 1HBA B; 1MYF A; 3WCW D; 3ZJP A; 1X46 A; 3VRF A; 5MBA A; 4X0L B; 2BWH A; 2HHD B; 1MYH A; 3B75 A; 1YGF B; 3IC0 A; 1H1X A; 2XYK A; 3HYU B; 1THB A; 3WCP B; 1A3O B; 2LH1 A; 3BJ3 A; 2FRJ X; 1MZ0 A; 2VYW A; 5B85 A; 2GL3 A; 2R4X A; 3GQR B; 1Y4B B; 3MN0 A; 5EOH A; 1C7B B; 4MBN A; 1M9P B; 1Y5J B; 3PI9 A; 1Y7G B; 3M38 A; 3MVC A; 1CH7 A; 3GQG A; 2MGC A; 2ZLV A; 1Y0C B; 4ESA A; 4FC3 A; 1LA6 A; 3FS4 A; 1G08 B; 1DWS A; 2QU0 A; 3LB4 A; 1XQ5 B; 3WTG A; 3D17 A; 1Y31 A; 1YVQ A; 1NAZ A; 1G0B A; 1MGN A; 1DXT A; 3UI0 A; 3G4U A; 1GLI A; 3CIU A; 1A00 A; 1Y8I B; 3AQ5 A; 2QSS B; 1HAB B; 1S5Y A; 3NFE A; 1S56 A; 2HCO A; 1IBE B; 2ZT1 A; 3HEN A; 3UHZ A; 3V2V A; 1YEQ A; 1YE0 B; 1UC3 A; 2MHB B; 4FH7 A; 3WCV A; 3VRG A; 1YE2 A; 5KDQ A; 2CMM A; 1YEU B; 1Q1F A; 3HEP A; 1LH1 A; 1YHE B; 1FCS A; 1KD2 A; 1ASH A; 3HF4 A; 2FRF A; 1ABY B; 3QQR A; 1A9W A; 4N7P B; 4F6D A; 1BBB B; 3PI4 A; 1HDA B; 1SHR A; 1GCV B; 3HHB A; 1VXG A; 1MLS A; 3WR1 A; 1W92 A; 1YHU A; 1QI8 B; 1YHR A; 2MYE A; 2V1G A; 1LH2 A; 3EDB A; 1HBB A; 4VHB A; 3BJ1 B; 109M A; 1G09 B; 1BVD A; 1JL7 A; 1GBU B; 1RVW B; 1S6A A; 2ZSN A; 5D5R A; 1BZ0 A; 1CG5 A; 4HSW A; 1Y22 A; 2VLY A; 1MOD A; 2ZSX A; 3FH9 A; 1YGD A; 1Y8W B; 2D2M D; 1MYZ A; 3KUO A; 4SDH A; 2MGA A; 1Y4P A; 3AT5 A; 1Y85 A; 1J41 B; 1RTX A; 104M A; 1LFL B; 2QFK A; 1N9H A; 1XZ4 A; 3VRE A; 1JL6 A; 1UIW A; 1NQP B; 2XKG A; 2ZS1 C; 5KER A; 1K0Y B; 5AZQ A; 3D4X B; 1O1M A; 1Y7C B; 1O1N A; 111M A; 4G1B A; 5D1V A; 3IXF A; 3ZOL A; 2GTL B; 2ZFO B; 5C6E A; 1CLS B; 1JZL A; 2G14 A; 2D5Z B; 1CIK A; 1G0A A; 1MDN A; 3A59 B; 3M39 A; 3S66 B; 1XZ7 A; 2V1H A; 2HBS A; 4MPM A; 2ZSS A; 3ECL A; 1O1P B; 1RTE A; 1ABW B; 1PBX B; 3GK9 A; 1NEJ A; 2AA1 A; 2Z6N B; 3DHR B; 5JGG B; 4H07 A; 1Y4R B; 3MJP A; 1XYE A; 5CN4 A; 2BMM A; 1NWN A; 3UHK A; 4MQK A; 4ROL A; 4N7O B; 1O16 A; 2VRY A; 1B0B A; 2HHB B; 4NZI A; 5EQM A; 1J7Y A; 5E29 B; 1LUE A; 2D60 B; 1DO4 A; 2BLH A; 1O1J B; 4QAU A; 2HBC B; 3UHC A; 1NZ3 A; 2D5X A; 1AJH A; 2AUP A; 1RSE A; 3AQ8 A; 2V1I A; 1DKE B; 1QXD B; 5CNE A; 5CHQ A; 2W6V B; 3GQP A; 1F65 A; 3EOK B; 1Y45 B; 2IG3 A; 3D1A A; 1YZI A; 102M A; 2HBE B; 4OOD A; 1Y7D A; 1URV A; 2ZSP A; 3DHT A; 2RAO B; 1DO7 A; 1HDS A; 3WFT A; 4NS2 A; 2H8F A; 3HEO A; 3WCV C; 3WHM A; 2GKN A; 1V4W B; 3OZW A; 1XZU A; 3VAU A; 4DWU A; 3UHB A; 3UHT A; 2MGB A; 2SPL A; 1V4X A; 3DUT B; 2W72 B; 1Y0W A; 3TM3 A; 1ABS A; 2DXM A; 3QMA A; 1YCA A; 1MBA A; 2R1H B; 2O5O X; 1HV4 B; 2VYY A; 1O1K B; 5HAV A; 3R0G A; 1V5H A; 1OJ6 A; 3S1I A; 4F6I A; 5E6E A; 1YMA A; 5SW7 A; 3WCW A; 1BIJ A; 1Y0D B; 1FAW B; 1YHU C; 2IN4 A; 3VHB A; 1G9V B; 1YIE B; 3NMM B; 1MLM A; 1YFF A; 2VLZ A; 2ZLT A; 3HXN A; 1NS6 A; 1QPW A; 5EET A; 1YG5 A; 3ZJI A; 4U8U B; 3G4Y A; 1FSX B; 1BZZ B; 3MKB A; 1HRM A; 4NXA A; 3PI8 B; 3PI1 A; 4AVE A; 1HSY A; 1C7D B; 3ECX A; 4FWX A; 1HBR A; 2ZS0 D; 3BOM A; 5HY8 A; 1DXV A; 1UX9 A; 1S69 A; 2EB8 A; 3BCQ A; 1JDO A; 1A01 B; 4XS0 B; 2HHE B; 1HGB B; 3V2Z A; 3EU1 A; 2H35 B; 4KMW A; 1OFK A; 2RI4 A; 1J7S A; 1LFQ B; 1JF3 A; 3WFX A; 1RQ4 B; 1RQ3 B; 3LB2 A; 3ZOM A; 3BJ2 B; 2G3H A; 2GTL D; 3RJN B; 3WCT C; 2ZFO D; 1Y46 A; 2H8D B; 4MQJ B; 1A4F B; 5CMV A; 4UUR A; 3CY5 A; 1YOG A; 4YU3 A; 4H2L A; 2EF2 A; 5E83 B; 1NZ5 A; 1BJE A; 2NRL A; 4M4A B; 1MYG A; 1CH1 A; 1CO9 A; 1VWT B; 1XZ5 B; 3LHB A; 4MAX A; 4FH6 A; 3KMF A; 1MNI A; 3OK5 A; 3IC2 B; 5IKS A; 1CP0 A; 1Y5K A; 1YIH B; 3S1J A; 1LFT A; 112M A; 1J40 B; 2ZT3 A; 1SDK A; 2GNW A; 1NIH A; 3A0G B; 1RQA B; 1J3Z B; 1O1L A; 2ZSQ A; 1RPS B; 2EVP A; 3QM9 A; 1DXD A; 3QJD B; 3ONZ A; 2ZFB B; 1S5X B; 3PI3 A; 4F4O A; 4HBI A; 1LHT A; 1GCW A; 1UX8 A; 3W4U B; 2O5B X; 1DWT A; 1YEV B; 3WCU A; 1HBH A; 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2SPM A; 1AJ9 B; 2QLS B; 1HCO B; 4KJT A; 1NWI A; 3UHU A; 4WJG A; 4N7P A; 1BBB A; 1N9X A; 1SDL B; 1HHO B; 1HDA A; 1FN3 B; 1K1K B; 2VLX A; 2R50 A; 1AZI A; 1GCV A; 2D2N C; 1JF4 A; 2G0V A; 4NI1 B; 1YOH A; 2XKH A; 3WCU C; 3ARJ A; 3BJ1 A; 1G09 A; 2PEG B; 1FDH G; 1GBU A; 1RVW A; 1MLQ A; 2M6Z B; 1SPG B; 105M A; 2BKM A; 5EU2 A; 1HGA B; 1Y8W A; 1UVX A; 1FSL A; 1CPW A; 1VXH A; 1H97 A; 3DR9 A; 2V1F A; 1J41 A; 1QXE B; 1HBS B; 1LFL A; 4NK2 A; 1MYI A; 3QJC B; 4KMV A; 1IT2 A; 1NQP A; 1K0Y A; 1NGK A; 3E4N A; 3D4X A; 4O1T A; 1Y2Z B; 1HDB B; 4DC8 A; 1Y7C A; 3QZX A; 1YVT B; 2ZLX B; 5CNG A; 2GTL A; 2OLP A; 2EKT A; 2ZFO A; 1CLS A; 3MJU B; 1QSH B; 1UT0 A; 1A6K A; 2ZS0 B; 2D5Z A; 2OH8 A; 1LH3 A; 5EYJ A; 3A59 A; 3S66 A; 1MLR A; 1L2K A; 1O1P A; 2SPN A; 1ABW A; 3K3U A; 1PBX A; 2Z6N A; 2MYA A; 3S48 C; 2LH6 A; 3DHR A; 5CNF A; 5JGG A; 1Y4R A; 4C0N A; 3M3B A; 3GKT A; 1DLY A; 3ZH0 A; 4N7O A; 1NPF A; 2MGK A; 1U7S A; 1MOB A; 2O5Q X; 2HHB A; 1CIO A; 1DTI A; 5E29 A; 2D60 A; 5JDO F; 1ECO A; 1O1J A; 2AV0 A; 4TWV A; 1BUW B; 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