The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
48
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHWSAEEKQLITGLWGKVNVAECGAEALARLLIVYPWTQRFFTSFGNLSSASAVLGNPNVRAHGKKVLTSFGEAVKNLDNIKNTFAQLSELHCDKLHVDPENFRLLGDILIIVLAGHFGKDFTPDCQAAWQKLVRAVAHALARKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Metal binding protein
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| publication title |
Crystal structure of parrot hemoglobin (Psittacula krameri) at pH 7.5
rcsb |
| total genus |
48
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-12-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HBB A; 5KER A; 2GNW A; 4WJG A; 5ILP A; 1MLO A; 3NG6 B; 1UVX A; 1YG5 A; 2ZS0 C; 4TWV A; 1JP6 A; 1MWB A; 2ZFO A; 1NS9 B; 4HSX A; 2HBF A; 4ZVA A; 2PGH B; 3IC2 B; 4N7P B; 1LFZ B; 4MAX A; 1S5X A; 1NPF A; 4H07 A; 2MYE A; 1JZL A; 3AQ6 A; 1BZR A; 1J41 A; 1MKO B; 1LH3 A; 1NZ3 A; 1Y5F B; 1LFV B; 2D2M D; 3DUT A; 2ZST A; 2O5M X; 3D17 B; 1CBL A; 1Y31 A; 3ZJL A; 2DN3 A; 5F0B A; 4YU4 B; 1AJH A; 1S0H B; 1A3O A; 3ZHW A; 3BCQ B; 3WFX A; 5E6E A; 1SHR B; 1NIH A; 1Y8I B; 1HLM A; 2MGM A; 1ITH A; 1YCA A; 3WR1 B; 3UHZ A; 3GK9 A; 1R1X B; 5JDO D; 1YEV B; 3ED9 A; 4DWU A; 1RPS A; 1NZ4 A; 1JL7 A; 2MGF A; 3AG0 A; 2LH5 A; 1Y01 B; 3EU1 A; 4F6G A; 1LHS A; 2V1H A; 4JAC A; 1F63 A; 2R80 A; 1MDN A; 3E5O A; 4U8U A; 1MYM A; 3WCT A; 1MCY A; 1A00 B; 1A0Z A; 4ESA B; 1JY7 B; 1BJE A; 2LH2 A; 3AT5 B; 1CG5 A; 2E2Y A; 3E5I A; 1XYE A; 1G08 A; 1HHO A; 1Y8W A; 2XYK A; 3WCV C; 1GLI A; 1J7Y A; 3HHB B; 2VM0 A; 1VRF A; 1HDS B; 2D2N A; 1XY0 B; 1CQX A; 1CP0 A; 4HRT A; 5D5R A; 1M9P B; 3LHB A; 2WTG A; 1LA6 A; 1M6M A; 1W92 A; 3WI8 A; 3G4Q A; 3PEL B; 3QJD A; 1Y0C B; 2H8D A; 2VRY A; 1BUW A; 2ZFO C; 4NK1 A; 2QU0 B; 3NMM A; 1MLF A; 1URY A; 5KKK A; 1NXF A; 1O1J B; 1BZZ A; 1MWD A; 1MLJ A; 1BIJ A; 1YHU A; 3H57 A; 1RQ3 A; 2ZSP A; 1MOH A; 1J7W A; 1MYZ A; 1F5P A; 3R5I A; 3QZX A; 1DXT B; 2ZT0 A; 3GLN A; 1YHE A; 1B0B A; 1YVT A; 2IG3 A; 2ZS0 B; 1Y0D B; 1Y45 A; 2O5O X; 2H8F B; 2MGC A; 1MOC A; 1Y4P B; 1LFQ B; 3HEO A; 1YE2 B; 4TYX A; 1FDH A; 1LJW A; 2QRW A; 2ZLV B; 4MQI B; 1EMY A; 3NG6 A; 1G9V B; 3PT7 B; 1FAW A; 2G12 A; 1Y4F B; 2LH6 A; 4N8T A; 4XDI A; 3K3U A; 4ROL B; 1C7B B; 4M4A B; 2PGH A; 1MYF A; 4N7P A; 3WCP B; 1ECD A; 1S56 A; 1T1N B; 4HRR A; 3HRW B; 2MGG A; 1FHJ A; 1J3Z A; 3WTG B; 3KUO A; 2R1H A; 1NWI A; 1QSI A; 3A0G B; 3UHX A; 1Y8K A; 2VHB A; 3G52 A; 3UHY A; 1MBC A; 112M A; 1NZ5 A; 1SHR A; 2D2N C; 3OGB A; 2C0K A; 2W6X A; 2HBS B; 2QMB B; 1YVQ B; 3EDB A; 2ZS1 D; 3S48 C; 2DHB B; 2GRF A; 2DN2 B; 2W72 A; 1Y7D A; 1Y4B B; 1KFR A; 1IWH A; 1THB B; 1SPE A; 4BJA A; 2OIF A; 4ROM A; 1Y83 B; 1AJ9 B; 3LB4 A; 1ABY A; 2MYA A; 3A59 B; 4WCH D; 1BBB B; 1MOB A; 2G10 A; 1FSX B; 3P5Q A; 1G0A B; 1YHU C; 1A4F B; 1FN3 A; 1YFF A; 2EB9 A; 3AT5 A; 3E4N A; 3WCU B; 1WVP A; 1NS6 A; 1EBC A; 1IRC A; 2O5Q X; 1MLU A; 3GQP A; 2ZFB A; 1B86 B; 1SI4 B; 1HBB B; 3S1I A; 1X46 A; 2ZWJ A; 1CO9 A; 1EW6 A; 4MXK A; 2OHB A; 4IRO A; 3HHB A; 5CNE A; 3HC9 A; 5CN4 A; 1YG5 B; 3WFW A; 2D2M A; 2ZFO B; 1XY0 A; 1VXH A; 2HBF B; 1I3D A; 3D4X B; 1M9P A; 1ABS A; 1YHR A; 3M38 A; 1S5X B; 3UHQ A; 2ZT1 A; 3BA2 A; 1J52 A; 1GJN A; 3PI8 A; 2AUR A; 3G4R A; 1CPW A; 3DUT B; 1MBS A; 1S69 A; 1HBA A; 1Y31 B; 1XQ5 A; 2ZLT A; 5AZQ A; 1V75 B; 4FWX A; 1HCO B; 2XKH A; 1C7D A; 2Z8A A; 2DN3 B; 3UHD A; 6HBW B; 105M A; 3VRE A; 1A3O B; 5E6E B; 1NIH B; 2DN1 A; 3UI0 A; 3NL7 B; 1DKE A; 2ZT2 A; 4C44 A; 3MVC A; 1MLK A; 1A3N B; 3MKB A; 1Y0W A; 2GTL D; 1RPS B; 2MGI A; 1R1Y A; 3D7O A; 1CH9 A; 2NRL A; 4F6I A; 2HHE B; 1MYH A; 1HBI A; 3EU1 B; 2H8F A; 3DHR A; 1YEU B; 1DM1 A; 4U8U B; 3GKT A; 1Y4P A; 2BLH A; 3HEN A; 3WCT B; 1QPW A; 2ZLV A; 3GQG B; 3QM8 A; 3BJ3 A; 2AUP A; 1BIN A; 1XZ4 A; 1XZV A; 3PT7 A; 1XYE B; 3HF4 B; 1G08 B; 3WCW D; 1HHO B; 3VRG B; 1Y8W B; 3PI1 A; 2FRF A; 4FWZ A; 4FH7 A; 2ZSR A; 3UHI A; 1C7B A; 1GLI B; 3QM6 A; 2SPO A; 1S6A A; 3WCP A; 1KD2 A; 3R0G A; 104M A; 2MGB A; 2OHA A; 5E83 A; 2QSS A; 4NS2 A; 5CHQ A; 2VYY A; 3ARJ A; 4MQH A; 1MZ0 A; 3O89 A; 2V1I A; 1V4X A; 2NRM A; 2H35 A; 2R4Z A; 2GKN A; 3QJD B; 2NSR A; 3UHU A; 2H8D B; 3ZOM A; 2GTL B; 1CH3 A; 5E29 A; 1BUW B; 3SDH A; 3NMM B; 2LH7 A; 2ZLU A; 1UMO A; 2QMB A; 1YVQ A; 5MBN A; 1BIJ B; 1YHU B; 1MNH A; 2DHB A; 1Y4B A; 1J7W B; 3R5I B; 2O5L X; 4ZVB A; 5EE4 D; 1JZM A; 5JDO C; 3UBV A; 3S65 B; 1YHE B; 1Z8U B; 1BZ6 A; 1UT0 A; 3GDJ B; 1BBB A; 1DO4 A; 1U7S A; 1Y5J A; 1YVT B; 1FSX A; 2DXM B; 2D5Z B; 1NGK A; 5EQM A; 1A4F A; 4ODC A; 3MJP A; 2FAL A; 1S5Y B; 3UHK A; 1SI4 A; 1LJW B; 1QSH A; 4O1T A; 4DWT A; 2BLJ M; 2W31 A; 1Y0A A; 3PI4 A; 2BKM A; 5JDO E; 3OO4 A; 1YEQ B; 1VRE A; 3O7N A; 1FAW B; 1A01 B; 5CN7 A; 1M6C A; 2V1F A; 1DO3 A; 1MLG A; 4N8T B; 4MU5 A; 3D4X A; 3OZV A; 2GLN A; 3QJC A; 2MGH A; 2Z85 A; 3NML A; 2MBW A; 3ZJI A; 4HRR B; 3H58 A; 2DC3 A; 4YU3 A; 1GZX A; 1FHJ B; 1J3Z B; 1VXD A; 2VLZ A; 2R1H B; 5CN9 A; 2ZS1 A; 1YIH A; 1V75 A; 1QSI B; 1HCO A; 1IDR A; 1Y8K B; 1U7R A; 3ZJS A; 1Y4Q A; 6HBW A; 1GVH A; 3IC0 A; 3ARL A; 1O1L A; 1NQP A; 1A6K A; 3NL7 A; 2QLS B; 2AA1 A; 3KMF C; 4HSW A; 1A3N A; 1SDL B; 2R4W A; 5HBI A; 2HBG A; 4OOD A; 1MBI A; 4F6J A; 1LH1 A; 1XZ5 A; 4NXC A; 3TM9 A; 2W72 B; 1Y7D B; 2QSP A; 4MPM A; 1JPB A; 1IWH B; 2HHE A; 1MOD A; 4ILZ A; 1OFJ A; 5CHR A; 1MNJ A; 1V4W B; 4ROM B; 3LR9 A; 1YEU A; 4M4B B; 1ABY B; 1BZ1 B; 3ORD A; 1MYJ A; 4H2L A; 3QM9 A; 3A5B A; 3LQD A; 3P5Q B; 1FN3 B; 1V07 A; 1YFF B; 1TU9 A; 3ZJP A; 3QMA A; 3GQG A; 1MTJ A; 1SDK B; 1CH1 A; 1NS6 B; 1CH7 A; 1G0B B; 3GQP B; 2ZFB B; 5EYJ A; 3HF4 A; 2RI4 B; 3VRG A; 1FLP A; 1RVW B; 5M3S A; 4NXA A; 5JGG A; 3AQ7 A; 4IRO B; 2MGA A; 3U3E A; 1DLW A; 1V5H A; 1JP9 A; 1RTX A; 2D2M B; 1WLA A; 1YMB A; 5CN8 A; 5C6E B; 5CMV A; 3WCU C; 4G1V A; 4H0B A; 1PBX A; 1YHR B; 3TLD A; 1ASH A; 3PI8 B; 4FC3 B; 1IT3 A; 1MWC A; 3BJ1 A; 4OF9 A; 2GTL A; 1HBA B; 3G4V A; 1XQ5 B; 2ZLT B; 2XKI A; 1C7D B; 2OLP A; 3VRE B; 5CN5 A; 3AT6 A; 1Y09 B; 2DN1 B; 4F6F A; 1DKE B; 1XZ7 A; 3NFE B; 3MKB B; 1Y0W B; 1MNI A; 1GBU A; 2MGL A; 1R1Y B; 3D7O B; 3DHT A; 3GKV B; 5CND A; 1MLS A; 1HGC B; 3S65 A; 2NSS A; 3GDJ A; 3HYU B; 1N9F A; 2DXM A; 2D5Z A; 1Y7G B; 4PQB A; 1JW8 A; 2AV0 A; 3DHR B; 1GCV B; 4WJG 1; 1D8U A; 3WCW A; 1SWM A; 1S5Y A; 3CIU B; 3EDA A; 3LB3 A; 1MNO A; 2ZLW A; 1QPW B; 5HY8 B; 1HDB A; 3QQQ A; 1YH9 B; 1HV4 B; 2HZ1 A; 3MYN A; 1OBM A; 3OK5 A; 1O1N A; 3BJ3 B; 3CY5 A; 1XZ4 B; 1YEQ A; 2D5X A; 2G0R A; 1MTI A; 1MTK A; 1XZV B; 1YMA A; 3VRF B; 1GBV A; 1HDA A; 1A01 A; 4U8U C; 3OJ1 A; 2R4X A; 3UGY A; 1LH2 A; 3WCT C; 4B4Y A; 1EBT A; 1KD2 B; 3HEP A; 2G0S A; 3UHW A; 4F4O A; 4DC7 A; 1CG8 A; 5E83 B; 2QSS B; 1COH B; 4L7Y A; 3G46 A; 3ECL A; 3FS4 A; 3IXF A; 4MQH B; 2BMM A; 1OUU A; 2SPM A; 1V4X B; 2H35 B; 1JDO A; 2HHD A; 3E55 A; 1MGN A; 1FCS A; 3ARK A; 1LH7 A; 3SZK A; 1IRD A; 4MXL A; 5KDQ A; 5E29 B; 5SW7 A; 108M A; 1KR7 A; 2QLS A; 1DWT A; 1J7S B; 1SDL A; 2ZLU B; 1AZI A; 3MYM A; 3GYS A; 2MGD A; 1Y7Z B; 1MLQ A; 4MQJ B; 3D1A B; 1OR6 A; 109M A; 4MQK A; 1V4W A; 1UFP A; 2GTL C; 4M4B A; 3UHB A; 1BZ1 A; 1YEO B; 1DXD A; 1HBS B; 1S61 A; 3ZJH A; 1Y35 B; 1Y5J B; 1O1M A; 1HAC B; 1IOP A; 4ODC B; 3MJP B; 1SDK A; 2HBD B; 2ZLX B; 2BLI A; 5EV5 A; 1I3E A; 1G0B A; 5EOH A; 1QSH B; 2RI4 A; 5EYS A; 2ZT3 A; 1RVW A; 1VXA A; 1Y0A B; 3DR9 A; 4JYQ A; 3TM3 A; 4G51 B; 3OO4 B; 1LFY B; 3G4U A; 1O16 A; 3UHR A; 5EUI A; 3S1J A; 5C6E A; 3ODQ A; 1LFL B; 5JOM A; 4C0N A; 3UHH A; 2EVP A; 1ECN A; 1YZI A; 3M3B A; 3QJC B; 5EU2 A; 3A9M A; 1OR4 A; 4YU3 B; 5B85 A; 1XXT A; 1GZX B; 2GNV A; 2HCO A; 1A6G A; 4FC3 A; 3B75 A; 2ZS1 B; 1YIH B; 1LFT A; 1YE0 A; 3RGK A; 4DC8 A; 3OO5 A; 3OZU A; 1YGD A; 1Y4Q B; 3IC0 B; 1O1L B; 5ILE A; 3UH6 A; 1X3K A; 3PI9 A; 3MOU A; 1Y09 A; 1NQP B; 1JL6 A; 3K8B A; 1HBR B; 3QJB B; 1MNK A; 2EB8 A; 2AA1 B; 5CN6 A; 2ZSZ A; 3NFE A; 1N9I A; 1SPG B; 1CH5 A; 3V2Z A; 2MYD A; 3GKV A; 2QFK A; 1HGC A; 1MLR A; 1XZ5 B; 2QSP B; 5HLQ A; 1K0Y B; 3HYU A; 2ZT4 A; 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4N7N A; 1A9W A; 1X9F D; 2ZLW B; 4KN3 A; 1HDB B; 1A0U A; 3RJ6 A; 2WTH A; 3GOU A; 3PI2 A; 5HU6 B; 4G51 A; 1IT2 A; 1O1N B; 3CY5 B; 107M A; 1LFY A; 1Q1F A; 2D5X B; 4HBI A; 1LH6 A; 1GBV B; 1HDA B; 1LFL A; 1RQ4 B; 3V2V A; 4N7O A; 1GDJ A; 4MQG A; 2OH9 A; 4F4O B; 1CLS B; 4UZV A; 1CMY A; 3ZOL A; 1CG8 B; 2MYB A; 2V1K A; 2CMM A; 4L7Y B; 1OUT A; 3UHT A; 1JEB A; 3FS4 B; 1OUU B; 2HHD B; 1XZ2 A; 4NZI A; 3WFU A; 1VXE A; 2HHB A; 1WMU A; 1DXV A; 3SZK B; 1IRD B; 5KDQ B; 1N9X A; 5SW7 B; 4FWY A; 1HBR A; 3QJB A; 4NI0 A; 1MYG A; 103M A; 4GZG A; 1Y4R A; 1SPG A; 2BNL A; 3GYS B; 1MBN A; 4MBN A; 1K0Y A; 1V9Q A; 2ZSN A; 1HAB A; 4MQK B; 4MQC A; 3ZJN A; 4B3W A; 1X9F B; 1UIW A; 3EOK A; 5HLU A; 1Y5K A; 4KMV A; 4NI1 B; 1O1M B; 3S66 A; 1K1K B; 2G11 A; 4O4Z A; 1VXB A; 5AB8 A; 1MBA A; 3QJE A; 5ILR A; 3D1K A; 2HBC A; 4MBA A; 3QQR A; 3PT8 A; 2Z6T A; 3SDN A; 1HBH A; 1HGB A; 3A5G A; 1Y4V A; 4AVE A; 3UHG A; 2ZSQ A; 2GKM A; 1G09 B; 3UGZ A; 5EUI B; 2ZS0 D; 2FRK X; 1YIE B; 1YDZ A; 4UUR A; 2RAO A; 3ODQ B; 1HSY A; 7HBI A; 4HHB A; 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