2ZGZA

Parm with gmppnp
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Molecular structure of the ParM polymer and the mechanism leading to its nucleotide-driven dynamic instability
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Structural protein
molecule keywords Plasmid segregation protein parM
total genus 98
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA01
5AQKA 1GLDG 2CH5A 3G25A 3H1VX 4H0YB 2CGJA 4CBUA 4JHDB 2H3GX 2Q31A 1NGIA 4WQ4A 1RDWX 4CZJA 4E1JA 1CZAN 4FOIA 5AQMA 3BUZB 4IJAA 3U9ZA 1BU6O 1XQSC 3UKUB 3VEWA 5JICA 4YDUA 3MN9A 2E2QA 4FWMA 4PL8A 4O8KA 3R8EA 2DPNA 3QFUA 4Z94A 3SMSA 3H3OB 3DXKB 4L3QA 4H0VB 5JLFA 3AAQA 2ASMA 3WUHA 2V51B 2P9NA 4FPBA 3TU5A 1BO5O 3H3NO 3P4IA 3FLCO 1OKJA 4XH4A 4BRQA 4H0TB 3WXJA 2FSJA 1YUWA 2A3ZA 1RFQA 3CJBA 4CZEA 5ELZA 3AAPA 3LM9A 5FPNA 2I7NA 2A5XA 3FZKA 3C7NB 1QQNA 1TUYA 2V7YA 4H0XB 3FZMA 2IVOA 4HTLA 3GL1A 3WEEA 3CHWA 4BROA 2E20A 5AQSA 4BRNA 3VGKA 2KHOA 2YJEA 1QQOA 5EOYA 2ASPA 3TPQA 3WQTA 3LDNA 3C0BA 3FE1A 2P9IA 4WQ5C 2YHYA 4A2AA 1QZ5A 4B1ZA 4EHTA 1YVNA 3ZX3A 4QS9A 3SMPA 2FLOA 4BGBA 2CH6A 2GEMA 3IFRA 2ZGZA 4EHUA 4BC5A 4B1UB 4FPAA 4BQZA 2Q0UA 5EVZA 3CJ9A 4Y0WA 3M1FA 4PKIA 2V7ZA 2VYPA 1S3XA 3VPZA 5LJVA 4CD1A 3HBTA 1K8KB 1NGJA 3FR0A 3MN6A 1ZXOA 4K41A 1Y64A 2A6AA 4F9OA 4FL9A 2QWRA 2FF3B 2QWOA 2QWNA 3H46O 4RTFD 5F2RA 4DCHA 3IMXA 5AQUA 5AZIA 5AQPA 3CIPA 3VEOA 1DKGD 1TYQA 1HUXA 2YHWA 4WQ5A 3GDQA 2F9TA 3OHRA 3D2FB 1JCGA 1T6CA 1NGCA 1GLCG 3J8AA 4XH5A 4K43A 1GLAG 2IIRA 3MMVA 1HLUA 5AR0A 5BR9A 3HTVA 2GWKA 4BRGA 3VGLA 3A5LC 5BRHA 5AQVA 2P9PB 1C0FA 3BEXA 4XH1A 3ULEB 2P9PA 4DQ8A 4M7XA 4B1XB 4QS8A 5BRFA 4FOEA 1E4FT 3SK3A 3VESA 2A41A 4JAXA 3ZX0A 3DWLA 4MO5A 2P9UB 5AQYA 3O5BA 4H5WA 2D4WA 5ADXA 2CGLA 4K25A 3VOVA 5AQXA 3D2FA 3M3ZA 5KPRA 4M7YA 1S22A 3LDQA 3ZETB 1LCUA 3H45C 3MCPA 3A5OC 3U4LA 4IXCA 5BN8A 4CD3A 3ZEUB 3VEZA 4FWPA 5EX5A 4B1WB 3A8YA 3SLCA 5KPZA 1ATSA 5BPLA 4BG9A 2A42A 4QS7A 1YXQA 2J4RA 4BREA 2IVPA 5AQZA 1DEJA 5BPMA 4PL7A 3IDHA 3VERA 1T6DA 3D7EO 2GUPA 1X3MA 2P9KA 5AZJA 3H6EA 3C7NA 1QHAA 4GNIA 3KZBA 4IWVA 2OANA 3W3DA 2P9KB 4K42A 5AQGA 3CJCA 4MLEA 4H5NA 2QXLA 5BREA 5KQ8A 2P9IB 4XEIA 1C0GA 4ISGA 2NRHA 5LY3A 5AQRA 3LDOA 1D4XA 2UYTA 3GG4A 4FWOA 1HKGA 1NGDA 2W40A 1HKCA 3WQUA 4EAHD 3B8AX 3CJ1A 2Q2RA 4J8FA 5E26A 4FO0A 1SQKA 4IJNA 5FPEA 1BDGA 4H03B 5BPNA 4CJ7A 1DGKN 4FWKA 3DJCA 3W0LA 1ZBSA 4BR5A 3CQYA 2E1YA 5I9EB 4WQ4C 4AM7A 1NGAA 1LOTB 3O80A 3WXKA 3LDPA 2P9UA 1Z6RA 3CETA 4C23A 4RWTA 3I8BA 2E8AA 2VCPA 1WOQA 2ZGYA 1P8ZA 4A62A 5AQWA 3ULEA 2E1ZA 3U8XA 1HKBA 4BGAA 3D2EA 3QFPA 3VGMA 4BRPA 2D1KA 1BUPA 4JHDA 3D2EB 3JXUA 3QDKA 3FZLA 5FPMA 2QWQA 2QWPA 2BUPA 4CBXA 5AQFA 2A40A 3VF6A 1V4TA 2YI1A 5AQJA 1KXPA 1BOTO 5AZIB 1U6ZA 5JMVA 2YHXA 3A0IX 3LL3A 4H0PA 3ID8A 3MDQA 3WXLA 4CZGA 1XUPO 4M63C 2E88A 3H1QA 1X9JA 3CERA 1MDUB 5AQLA 1V4SA 5AFUH 4BVPA 2P9SA 4BR9A 4A2BA 4BG8A 4BRIA 4CZKA 2NZTA 2GELA 4FWSA 1SZ2A 4ISFA 4IZ9A 3I33A 3VF2A 1Z05A 1G99A 1HPMA 2HMPA 2ZWHA 4JD2A 3ZETA 5EXWA 3GE1A 4FWLA 3SJHA 5B8HA 4BC2A 4H5TA 1IG8A 2E2NA 1KAYA 4BR7A 3KHYA 3FGUA 3S41A 5KQDA 3FZFA 4NO7A 5AZJB 4CZHA 1GLJO 3ATUA 3R9PA 3DAWA 1NBWA 1GLLO 1J6ZA 1NLVA 1NGFA 4JNEA 4B1YB 4CZIA 4EIAA 4BRHA 1NM1A 2HF3A 4HWIA 4RCHA 4BQLA 2BTFA 4CBWA 3O8MA 1K8KA 3CI5A 5E84A 1WUAA 4A61A 3O1WA 2I7PA 3MN5A 1YAGA 2GWJA 3BP8A 3ZEUA 1TYQB 3JS6A 1QZ6A 3CJAA 4BR0A 3VEXA 3VEYA 3RSEA 2Q1NA 4CZFA 4H5VA 1NMDA 4I6MB 3EKSA 3ATVA 1BG3A 1MWMA 4FWQA 1RGIA 4BRAA 4MLHA 3UKUA 2HF4A 2HOEA 2YCHA 3O1BA 3VETA 3R6MA 2AA4A 1KAXA 2ASOA 2PAVA 3DXMA 4YDUC 4AM6A 1TUUA 3GOIA 5JLHA 3FZHA 5BRDA 4CZMA 4NB4A 1GLFO 1JCFA 1JCEA 4BR4A 2D0OA 3O4WA 5BN9A 1BA0A 2VWBA 1HX1A 4BRCA 2EWSA 4I6MA 1ATRA 4PKHA 3EL2A 3ENOA 3EKUA 2PBDA 5AQQA 4JD2B 2QWLA 3QMLA 5TKYA 3WEEB 2AP1A 3L4IA 3DXMB 5F1XA 2P9LB 2Q36A 2F9WA 2W41A 3MK6A 4MO4A 2E2PA 3CJ7A 1HJOA 2Q97A 2NLXA 3QBWA 3L6QA 3L0QA 4BRFA 1MWKA 2D0PA 4FSVA 3U9DA 4BC3A 2IVNA 4H5RA 3UB5A 1MA9B 2FSNA 1ATNA 2P9NB 3FFKB 4BVOA 1ZC6A 3O6WA 1NWKA 3DXKA 2CGKA 4IO8A 1NGEA 3CQXA 2FXUA 4BRMA 1X3NA 4EFHA 4B9QA 2QW9A 4GY2B 3A5NC 4PKGA 3ENHA 5AQNA 5CE3A 3QICA 5KPTA 3WXIA 3HSCA 4BC4A 3ZX2A 3GBTA 3HM8A 5FPDA 5AQHA 5AQIA 5AFUA 1NGBA 3F9MA 2P9SB 3A5MC 4BRKA 1IJJA 4FWNA 4DB3A 3BF3A 1EQYA 3UE5A 3VEVA 1GLEG 3EO3A 4DHYA 5F0XA 1R59O 1NGHA 3BF1A 5ADXH 1QQMA 1GLBG 3EN9A 3RSEB 1NGGA 2V52B 3UKRA 3LDLA 1KAZA 2ITMA 2ZF5O 4H0OA 3VENA 4BR2A 4BRDA 1E4GT 1T44A 5AQOA 5AQTA 4KBOA 3WT0A 3AY9A 2P9LA 1Q18A 2QM1A 3AARA 3QB0A 2FF6A 3HZ6A 4WYBA 3MN7A 5EY4A 4BRLA 1SAZA 3M6GA 2E2OA 1BA1A 3EZWA 2GTDA 4JN4A 2YJFA 3O08A 2FSKA 4B1VA 4CI6A 4FWRA 3UKRB 4CZLA 5LJWA 2WUSA 3KVGA 1BWFO 1H1VA 1ESVA 3HI0A 1U2VB 4O5FA 3IUCA 3LM2A 4LC9B 1XC3A 2Q0RA 4ISEA 3VF4A 3QBXA 2QWMA 1U2VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EEQA 5AQKA 1HQEA 2HVHA 3G25A 1VQ8N 4Z4HA 3PX0A 2CGJA 2P1JA 2H3GX 3L4QA 1NJIO 4CZJA 3F2KA 4E1JA 4DLGA 1Q8IA 3U3YA 2WONA 4FYDA 3U9ZA 1BU6O 4CIEA 3IS9A 5JICA 1JLCA 3MN9A 2X74A 4O8KA 2ZJRL 1S1WA 1D9DA 2HMIA 3QFUA 4CW7B 3SMSA 3H3OB 4BE0A 5JLFA 2VGMA 3AAQA 3AO1A 2ASMA 4W5TA 1L3VA 3SPZA 4FPBA 3VQ5A 1RT5A 3H3NO 3O3FA 3FLCO 1OKJA 3WXJA 2ZJPL 3CJBA 1TKZA 3R1XA 3AAPA 1ZBFA 3PV8A 3FZKA 2BANA 2QA4N 3NF7A 1XNRK 4H0XB 3FZMA 4OKKA 4RW6A 5JS2A 5A2QO 4O0JA 5J2PA 2IVOA 3E66A 3ZSOA 3O4NA 4DQPA 1TAUA 5AQSA 3V9XA 4KKOA 2ASPA 3C0BA 1JL2A 3QEXA 4DTPA 1N33K 3ZT3A 4WQ5C 1VQPN 5J2NA 1QZ5A 3ZX3A 4EZ6A 4FW1A 4W5OA 4IO9L 4QAGA 3SUNA 2P5OA 3AVGA 4W5NA 3HPOA 4B1UB 2QK9A 1L3UA 5FDLA 5EVZA 3M1FA 3SCXA 4DR4K 3MCAB 3PIOL 1K8KB 1LV5A 1Q81O 3FR0A 4J2EA 1WAFA 4MQ3A 3QO9A 3MEDA 4DTUA 2QWRA 1RCHA 4RTFD 4FJ7A 1XI1A 4DR7K 1DKGD 2PFUA 1TYQA 1HUXA 1VQ6N 5J2MA 3K5MA 2NRXA 2P51A 1EX4A 4ID5A 1VQKN 4N76A 4XH5A 4K43A 4YOYA 1LWFA 2ZE2A 1SL0A 2GWKA 1N5YA 3VGLA 3A5LC 5BRHA 2HBLA 1L3TA 4XH1A 3OS0A 5EU7A 1NKCA 4DQ8A 4M7XA 4B1XB 4QS8A 1TKDA 3K5OA 4FK2A 2P9UB 2YNFA 4H4MA 2YV0X 3RRGA 2D4WA 5HBMA 3SZ2A 1NK9A 1Q9YA 1D9FA 4KPYA 4JV5K 5T7BA 4M3ZA 5KPRA 4M7YA 1W7AA 4JI1K 4YY3K 1RNHA 4A5BA 4DG1A 1WB9A 1BCMA 1S6QA 4FCYA 3P5JA 2FBVA 3OYEA 4IBNA 5BPLA 2KQ2A 4CF9A 1I39A 1S1VA 1FK9A 1Y97A 2VG6A 3LP3A 2WFBA 3HVRA 3AVAA 1RT4A 2GUPA 2P9KA 5AZJA 1L5UA 3H6EA 4CGIA 1N6QA 1HPZA 1SKWA 5GAHP 1RDCA 4J2AA 3CJCA 4H5NA 4KHUA 4HUGA 3LDOA 1QHTA 1RDBA 3TAEA 2UYTA 1HKGA 1ILYA 3QIPA 4KB1A 4E7JA 3NBPA 3ZT2A 5FPEA 2D0CA 4G9ZA 1QVGM 3LP1A 4E7LA 4IEIA 3OY9A 3DJCA 4OGEA 2XY7A 2Y1IA 4UY8O 3CQYA 5I9EB 4IDHA 4ELVA 3LDPA 3CETA 3G71N 1KTQA 3HXMA 5CZ2A 4KH6A 2ZGYA 1P8ZA 2B4JA 1A5VA 3U8XA 1HKBA 2NRVA 3TR8A 1WAJA 3DRSA 3MEGA 1WBBA 5IWAK 3UIQA 4OKJA 3JXUA 5FPMA 1S5JA 1X9WA 4O55A 4C8KA 2WTUA 2BUPA 1VQON 4CBXA 3VF6A 1V4TA 1KXPA 5AZIB 2DFFA 1U6ZA 5GAEP 5JMVA 4BDZA 3A0IX 4CZGA 3QNOA 4LFBK 4M63C 4DTRA 3DLEA 3H1QA 3NCIA 1X9JA 5AQLA 4BR9A 3BZKA 4BRIA 4CZKA 3R3LA 1RBRA 3FFIA 2Q3SA 4ISFA 3WNEA 1U04A 5EXWA 4FWLA 4FLXA 1JLFA 4DFMA 4DTJA 4DV5K 4H5TA 1WSHA 1IG8A 3VMFB 5GINA 3CF5L 4F2RA 3FGUA 2P5GA 3ZSXA 4C8NA 1NK8A 3FZFA 3LWMA 2HW3A 4NXNK 5HP1A 4LF6K 4BE1A 5IT9O 4CZIA 3CCSN 3KTQA 4HWIA 4BQLA 4EP4A 1FXXA 4A61A 3PX4A 1YAGA 3D45A 1TYQB 3QLHA 4F3TA 3CJAA 3T1AA 3QESA 4I6MB 3VQDA 3C95A 4FWQA 4ELUA 5C2FA 3VETA 1I94K 3KD5E 2Y1JA 4AM6A 1QE1A 2OZMA 1S6PA 1YIJN 5BRDA 3THXA 4Q0BA 1LW0A 4DV2K 1GLFO 3THWA 4DQIA 3CCJN 4FZZA 3RR7A 1KLMA 1JCFA 2WBNA 3VQCA 1TL3A 5GADP 2D0OA 3KK2A 3S3MA 4WCEL 5JVHL 2PBDA 4JD2B 3QMLA 1Z26A 1HNWK 1ZBIA 1NJWA 4MDAA 3V4IA 4G1QA 5F1XA 2P9LB 3CMEN 2Q36A 4N5SA 1OH6A 3K5NA 3ZCMA 2E5LK 1JL1A 2E6LA 2E2PA 2Q97A 4AHRA 1LAVA 2IVNA 4QCLA 1ATNA 2IDOA 3FFKB 1BIUA 1NWKA 3KD1E 4B9QA 4GY2B 3ZLJA 2E4LA 5AQNA 1HNXK 2JWLA 5KPTA 4BC4A 4KTQA 3NF6A 5FPDA 3A2FA 3HM8A 4C8MA 1HJRA 4HUEA 4N41A 1NGBA 3DI6A 3T1YK 3F9MA 1OH5A 4BRKA 2KW4A 4FWNA 4DB3A 4CEBA 1K6YA 4CEQA 2BE2A 1RT2A 1GLEG 3T7ZA 3KLGA 1VQ7N 3OBYA 3JYTA 1J54A 4NLCA 5ADXH 4IOCL 3O4QA 3EN9A 2VWKA 3UKRA 2QKKA 2ITMA 4JEPA 2ZF5O 4PQUA 3QERA 3AVHA 5CYMA 5AQOA 5AJ3K 5AQTA 3AY9A 2P9LA 3HVTA 4WYBA 3SYZA 4JI0K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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