2ZGZA

Parm with gmppnp
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
b'MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Plasmid segregation protein parM
publication title Molecular structure of the ParM polymer and the mechanism leading to its nucleotide-driven dynamic instability
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Structural protein
total genus 98
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA01
2QWRA 4BRFA 5FPMA 4H03B 2A41A 2P9NA 3BEXA 5EXWA 4ISEA 2YHYA 5F1XA 1TUYA 1MA9B 3CJ1A 2FLOA 3LM9A 3ID8A 4NO7A 1DKGD 5AQSA 2P9KB 2V7ZA 4MLHA 3H46O 3WXJA 5AFUH 2H3GX 5EY4A 4A61A 5KQDA 1KXPA 3UKRB 2CH6A 4EHTA 2P9NB 5AQJA 1QQNA 3AARA 4M7XA 2IVPA 1BU6O 4XH4A 1X9JA 4H5VA 4PL7A 4EIAA 4JAXA 1ZBSA 1QQMA 1H1VA 1HX1A 3LDLA 4QS7A 3TU5A 4IWVA 3VENA 1TYQB 1GLBG 2E2PA 3BF1A 2ZWHA 1G99A 3FLCO 5AQNA 3FR0A 4H0XB 3WXIA 2QXLA 4DHYA 2P9PA 3LDQA 4IO8A 4CZMA 3SJHA 3QBXA 3WXKA 4BR5A 1ZXOA 3UB5A 2YCHA 1Z6RA 2YHXA 3O8MA 3D7EO 2P9IA 3U9DA 3IDHA 1MWMA 4H0YB 5AQFA 4RTFD 2VYPA 2P9PB 1NGAA 4PKGA 4EHUA 1NGEA 3HM8A 5ELZA 1HKBA 2ITMA 2W40A 4CZHA 2GWJA 3ZX0A 5KQ8A 2QWNA 2NRHA 3DXMA 3HZ6A 3CJCA 3VF2A 2FF3B 5AQGA 3ZX3A 1LOTB 3A5OC 1LCUA 2VCPA 4FWLA 2P9LA 3HBTA 5AFUA 2YJEA 4DB3A 2QW9A 3VEVA 3CIPA 5AQLA 3A8YA 3EKSA 3KZBA 3DXMB 3I33A 2E1YA 4BC5A 2CGJA 3O5BA 3U8XA 1RFQA 3R8EA 1GLEG 3C0BA 2E88A 4FL9A 2P9LB 2FSKA 3AAPA 3CJ7A 3U4LA 5FPNA 2GTDA 1V4SA 4H0TB 4BRKA 3P4IA 2QWMA 3VETA 1U2VA 3QICA 1NGDA 2QWOA 3GOIA 4BR9A 4RCHA 5BPMA 4WQ4A 1HUXA 3BUZB 4H0VB 4WQ5C 3H45C 3HI0A 2BUPA 1SQKA 4BG8A 2Q2RA 4ISFA 3TPQA 3AY9A 4H0OA 4K25A 5AQHA 4BR2A 1K8KB 3UKUA 3LDNA 4CD3A 1U2VB 1Z05A 3D2EA 3D2FB 3VEWA 4RWTA 3GBTA 3FZKA 4PKIA 5LY3A 4H5RA 4PL8A 3O1WA 3WUHA 2PBDA 5JLHA 1BA1A 4CJ7A 1RGIA 3WT0A 2CGLA 3UKUB 5I9EB 2AP1A 4M7YA 4MLEA 3D2EB 4F9OA 2GEMA 3L4IA 1S3XA 4B1WB 1OKJA 3WEEA 3QFPA 4CBWA 4EFHA 4BRMA 2QWPA 1ESVA 1Q18A 3GDQA 4XEIA 5BPLA 2YHWA 1HKGA 2HOEA 4BQLA 1E4GT 1TYQA 2Q31A 3VEOA 4BREA 3ULEB 4BRAA 4FWPA 3VGLA 2FSNA 3R9PA 4IJAA 5BN9A 3VF6A 1CZAN 1QQOA 1XC3A 4AM7A 5AQQA 3WEEB 2NLXA 3LDOA 2ASOA 1E4FT 4BGBA 3M3ZA 2GWKA 5AQVA 1U6ZA 4FOIA 4BRQA 2Q1NA 3VESA 2BTFA 1C0GA 2Q36A 3O4WA 2E20A 5E84A 3CETA 4XH1A 4BQZA 3UE5A 4CZJA 4K41A 4FPAA 3VGKA 4BR0A 4DCHA 3AAQA 2ASMA 4BR7A 3R6MA 4B1XB 3GG4A 2P9UA 1KAXA 1YAGA 2D4WA 1ZC6A 1V4TA 5AQIA 4JNEA 5BPNA 3EKUA 3WQTA 1GLJO 2I7NA 1J6ZA 1NBWA 2A3ZA 3VPZA 4Z94A 3A0IX 1HJOA 4GY2B 3FE1A 2I7PA 3MN7A 3SK3A 3H6EA 4JHDA 2P9UB 1EQYA 3FZMA 3MMVA 5TKYA 5JICA 3JS6A 3CQXA 3CJ9A 3DJCA 4EAHD 4MO5A 1GLFO 4XH5A 2GUPA 1SZ2A 4QS9A 2W41A 5AQTA 3QFUA 1YVNA 4H5WA 1QHAA 5BN8A 3KVGA 3ATUA 3BF3A 3MDQA 4FWKA 2WUSA 2KHOA 1ATNA 4JHDB 4E1JA 3IMXA 3RSEB 4LC9B 2P9SA 1BDGA 5BRHA 3W0LA 4L3QA 1NM1A 2ZGYA 1X3NA 2A40A 3ENOA 5AQPA 3S41A 4MO4A 1K8KA 2ZGZA 3CJBA 1NGBA 4CBUA 4B1UB 1KAZA 4BRPA 4CZEA 2E2OA 4H0PA 3D2FA 3ATVA 1P8ZA 5AQMA 1NGFA 4CBXA 3FZHA 4BR4A 4FSVA 2DPNA 1DGKN 3A5MC 3EL2A 5JLFA 3O80A 3QBWA 1ATSA 2GELA 2P9SB 1C0FA 3MN9A 4J8FA 3H3NO 4BGAA 1JCGA 1S22A 3U9ZA 1WUAA 4IXCA 1GLDG 5AQZA 4CZKA 4M63C 5ADXH 4FWQA 5AQXA 3VGMA 3GE1A 5F2RA 1GLAG 1HPMA 3ZETA 4BRIA 3GL1A 4B1VA 3LM2A 2FXUA 2A6AA 1NGHA 3ZEUA 4B9QA 3VEYA 3H1VX 4YDUA 3ULEA 5FPDA 5EOYA 4HTLA 1XQSC 3DXKB 2D1KA 5LJVA 4BC3A 3M1FA 3L0QA 2CH5A 2E8AA 2E2QA 3ZETB 3FFKB 4BRCA 3EZWA 4WQ5A 1HLUA 3M6GA 1JCFA 3WXLA 5AQRA 3ZEUB 2ZF5O 4B1YB 4AM6A 4B1ZA 4PKHA 3CQYA 5EVZA 3EN9A 3A5LC 1IG8A 3G25A 1BOTO 4BRLA 4IZ9A 4NB4A 3CHWA 1QZ6A 5AZJA 4QS8A 3VF4A 3JXUA 3C7NA 1KAYA 5E26A 5F0XA 5BRDA 3SMSA 1IJJA 1RDWX 1GLLO 1NGIA 1BO5O 2E1ZA 4ISGA 5AZIA 2Q0RA 3O08A 3FGUA 4FWSA 4KBOA 4BVPA 1NMDA 3LL3A 3VEXA 5AR0A 4JD2A 4H5NA 2HF4A 4BROA 5KPZA 1T6DA 3F9MA 4BC2A 1NWKA 5AZJB 3A5NC 1T44A 5BREA 5ADXA 3C7NB 2QM1A 4GNIA 2D0PA 4CZFA 5AZIB 1GLCG 3CJAA 1WOQA 4O5FA 2FF6A 4DQ8A 5AQKA 5JMVA 4HWIA 4JD2B 4A2BA 4C23A 5LJWA 3FZFA 1QZ5A 5AQUA 3KHYA 3MCPA 3B8AX 2VWBA 4A2AA 3BP8A 3CI5A 1BUPA 3RSEA 1BA0A 1NGJA 3MN5A 1ATRA 3ZX2A 1D4XA 3CERA 2IVOA 3LDPA 5FPEA 2AA4A 3HTVA 3DWLA 4WQ4C 5KPRA 2HF3A 4FPBA 3WQUA 2V7YA 3QMLA 1NGCA 3VERA 3MN6A 2CGKA 4FWMA 4FWRA 3QDKA 1MDUB 2P9IB 3O6WA 4BC4A 4Y0WA 5CE3A 3OHRA 1NLVA 2A42A 5AQWA 4FWNA 2QWLA 4A62A 1YXQA 3HSCA 3ENHA 3H1QA 2IIRA 1XUPO 4K42A 2J4RA 1MWKA 2E2NA 1TUUA 1NGGA 3DAWA 2UYTA 1BWFO 2A5XA 2IVNA 4BRNA 4BG9A 3I8BA 2EWSA 4K43A 3J8AA 2D0OA 4BRGA 2F9WA 3EO3A 1JCEA 1SAZA 5B8HA 2Q0UA 1BG3A 2NZTA 1YUWA 2YJFA 4O8KA 2V51B 1HKCA 5BR9A 2ASPA 4YDUC 4CZGA 4WYBA 5BRFA 2FSJA 4FO0A 3L6QA 1X3MA 3VOVA 3MK6A 3DXKA 3QB0A 5AQYA 3VEZA 5AQOA 2YI1A 4CI6A 2V52B 4I6MA 5EX5A 1DEJA 1Y64A 2HMPA 4H5TA 4BRDA 5KPTA 4IJNA 3O1BA 4BRHA 3IUCA 3W3DA 3SLCA 4CZLA 4FOEA 2OANA 4CD1A 1T6CA 2F9TA 4CZIA 2PAVA 4FWOA 2QWQA 4I6MB 3SMPA 2P9KA 3FZLA 3H3OB 1R59O 2Q97A 4BVOA 3IFRA 4JN4A 3UKRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ENBA 1SKRA 5FPMA 2B4JA 4H03B 3VQ6A 2P9NA 3ZCMA 1EP4A 5EXWA 2NRRA 3T1AA 4E7HA 3LM9A 1DKGD 2BANA 4DSIA 1IH7A 3C6TA 4A61A 1KXPA 4JI8K 3V9WA 3SBGA 2QI2A 3AARA 1VK0A 2ETJA 4JAXA 1QQMA 3DI6A 4DTMA 4AHCA 1H1VA 3S9HA 3LDLA 4JS4A 3U3GA 4IWVA 3D0PA 4MFBA 3HXMA 1TK0A 1FW6A 2AJQA 1U48A 1NKBA 1G99A 3RR8A 3IG1A 3WXIA 4DHYA 4FVMA 4GV3A 4DTPA 4CZMA 3SJHA 4F4KA 3F73A 3IRXA 1JLGA 1ZXOA 2YNFA 2JLEA 1VRUA 4H4OA 4OPAA 4JI0K 3IDHA 4FJHA 1MWMA 1ZBLA 1TKTA 1A5VA 4DSKA 5GAEP 1HNVA 2ZE2A 4PKGA 1NJWA 1Q9YA 3QLHA 2NRWA 3O4NA 5ELZA 2VWKA 3ZX0A 4DU1A 1L3UA 2FF3B 3HYFA 3ZX3A 3CMEN 4JK7A 1YVUA 1IKXA 3TTCA 4FWLA 3HBTA 2BDPA 4BE0A 4CF1A 4MQ3A 2NUBA 3CIPA 4BDYA 2E5LK 3ZSXA 3OYEA 1HYSA 3KZBA 2E1YA 4FLYA 4YY3K 2XRIA 3DLRA 3O5BA 5GAGP 1RFQA 1Q9XA 3WXMB 1GLEG 3C0BA 5HOOA 4FL9A 1VQLN 3P4IA 3TSPA 2QWMA 3SYZA 3TAPA 3QICA 3L2UA 1KVBA 4RCHA 1W7AA 4IEIA 3BUZB 4CF8A 1CLQA 1WN7A 2BUPA 4BG8A 5CYMA 2Y1IA 1CXUA 5AQHA 1K8KB 1B9FA 3TANA 5HBMA 1YHQN 1RILA 5HP1A 1N33K 4PKIA 5HLFA 4EZ9A 4WF9L 5IT9O 3CC2N 4H5RA 1L3TA 3WUHA 4KPYA 2PBDA 4U7BA 4KHPK 3P39A 3LPUA 2FBYA 3UKUB 5I9EB 1T05A 4YNQA 3D2EB 1VAZA 4JK8A 1S3XA 5E41A 4N5SA 1FKPA 1WBBA 1ESVA 3SQ4A 3HVTA 3V9UA 3WNGA 2HHVA 1A5XA 1Q18A 4XEIA 4BQLA 2Q31A 3LANA 1VQ4N 2NRXA 1C6VA 3LP1A 2Z1JA 3R9PA 4JS5A 1HR0K 3ZT1A 3RRGA 3G10A 3LDOA 4CIEA 4E7KA 1E4FT 3M3ZA 5CHIA 4Q0BA 4LF5K 2Q1NA 4OVLA 2HHTA 3M8RA 2BTFA 5K14A 3QINA 1U49A 3O9UA 1ZBHA 1T8EA 4XH1A 3UE5A 1RBUA 4KTQA 1EO1A 1S9EA 3WNEA 1RTDA 1VSMA 3R6MA 3ZYYX 1L3SA 4J2AA 1QVGM 1Q81O 3M8SA 2PZSA 1ZC6A 2PY5A 5LL6Z 5AQIA 5BPNA 1ZBUA 3SUNA 2VG7A 3P31A 2I7NA 1J6ZA 5JS1A 4B9VA 4CF9A 1VQKN 4FM1A 3L8BA 4HCBA 1OVQA 3MN7A 1LW0A 4JHDA 4HTUA 1FXXA 4KH4A 5KGWA 3L2VA 4RG8A 1WSFA 3VN5A 2JGUA 1WLJA 3CJ9A 3DJCA 4N76A 1GLFO 5H1SQ 2HBKA 5AQTA 1RCHA 4X64K 3HL8A 2OYQA 5JS2A 4B9NA 2VQEK 3C6UA 2QTDA 4FWKA 4E1JA 2UU9K 2DY4A 1NJIO 3RSEB 4X65K 5BRHA 1CXQA 3W0LA 3KTQA 3ENOA 4YHHK 1K8KA 4LFCK 3CJBA 4JRQA 4DWIA 2O8EB 4H0PA 4CGDA 5AQMA 5J2NA 3C94A 3NF9A 4FSVA 2OTLN 3M8QA 3DYAA 3EL2A 5JLFA 1ATSA 2GELA 3MN9A 4G9ZA 4FZYA 3L3VA 4FCYA 3H3NO 1ZBIA 1LV5A 4MDBA 1VQ5N 4CZKA 2GBZA 3BZKA 1ZYQA 4FWQA 1M1KO 1WSEA 1L3VA 4TSXA 3QESA 4Z0UA 1GLAG 1HPMA 4OGEA 5C2FA 1JXEA 2A6AA 4B9QA 3VEYA 3H1VX 3RVCA 4CGIA 3MX2A 5FPDA 4PQUA 1RBTA 3MWPA 1XQSC 2D1KA 1RBVA 3L0QA 2CH5A 1IKWA 4AHVA 2E8AA 3CXCM 3TAGA 3ZETB 3O9RA 2F8SA 1B92A 4KHYA 3KD1E 2JWLA 4BRCA 5C24A 3EZWA 4WQ5A 2HHQA 3M6GA 3CF5L 1JCFA 3V4IA 3ZEUB 2ZF5O 1TAUA 2FC0A 4M3YA 4B1ZA 3CFPA 2HNYA 3NGZA 3H08A 3AO2A 1RT1A 2KTQA 1S9GA 1BOTO 4LF6K 1ZBFA 4O4GA 4OGCA 1QZ6A 5AZJA 4QS8A 3VF4A 3CCLN 4LSNA 3NF6A 5F0XA 5BRDA 4OJRA 4KTWA 1GLLO 3DRRA 1YITN 2Q0RA 3FGUA 4KKOA 4O5BA 4OKJA 4C8LA 4CW7B 4NXMK 4E1MA 1EXQA 4RW6A 1HJRA 1MU2A 3EEQA 4H5NA 2HF4A 1F21A 1T6DA 4FW2A 5FRNA 4FLXA 2KW4A 4GNIA 4CZFA 1IKYA 4CFDA 1RDBA 1GLCG 1WOQA 4O5FA 2FF6A 4R79A 1I3AA 5JMVA 1J53A 3NF8A 3RMDA 4HVJA 5LJWA 4DUZK 3B8AX 3CYMA 3SBTA 2VWBA 1ILYA 4ELTA 1BUPA 3RSEA 3SPYA 1N32K 1BQMA 4M42A 4Y1DA 1WSJA 4IKFA 3CERA 5I42A 1ASUA 3OS2A 5FPEA 2AA4A 3DWLA 4WQ4C 3BZCA 3LPTA 4IEEA 3BGRA 3WQUA 2QKBA 3MXJA 1NK7A 4CGJA 5C0YA 3RWUA 3QEWA 4FWMA 3DRSA 3C95A 3O6WA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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