2ZGZA

Parm with gmppnp
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
source organism Escherichia coli
publication title Molecular structure of the ParM polymer and the mechanism leading to its nucleotide-driven dynamic instability
pubmed doi rcsb
molecule keywords Plasmid segregation protein parM
total genus 98
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA01
3D2FA 4BR7A 4BR2A 3W3DA 1GLEG 5AQOA 4DHYA 1GLDG 3FGUA 5AQXA 1U2VA 5BPLA 5AQUA 4NO7A 3ZX2A 1C0FA 3D7EO 4FPAA 5AFUA 2FF3B 3VGLA 4BC3A 4BQZA 3QMLA 4CBXA 3BEXA 4BQLA 4K42A 3WT0A 3HM8A 4B1ZA 2HF4A 4A61A 3A5NC 1ZC6A 1K8KA 1GLJO 2ZGYA 5I9EB 4CZIA 1X3NA 5KPRA 3EO3A 3FZMA 4WQ4A 4K25A 3R8EA 3VPZA 5FPNA 4ISEA 1QZ6A 2IVPA 3WUHA 3BP8A 3LDPA 5AQHA 3FFKB 2Q31A 3WQUA 3QBWA 1NGJA 3U4LA 1NGEA 2YJFA 2CGJA 4BREA 3WQTA 3VEOA 2FSNA 4CI6A 2V7YA 3ATUA 1MWKA 2QWRA 5ADXH 4H5WA 1S22A 4BR5A 3A5OC 4PL8A 3UKRB 1HLUA 2HMPA 3DAWA 2P9LA 2J4RA 5AQPA 2PBDA 4I6MA 1P8ZA 2W41A 5LY3A 2FSJA 4BROA 4FWSA 1TYQB 3C7NB 2CGKA 3O4WA 3FZKA 1ESVA 3ZETA 2P9PA 2VWBA 4QS8A 2P9IA 3MN7A 3IFRA 2EWSA 2CH6A 1DKGD 2E2QA 3QFUA 2HOEA 3AY9A 3BUZB 2QWMA 4FSVA 4H0VB 1KAYA 2I7NA 3A5MC 1NGDA 3TU5A 5AQFA 2UYTA 4CD3A 4RWTA 4CZLA 1XC3A 1NGCA 3D2EA 5BPNA 3IUCA 5BPMA 3UKUB 1LOTB 1V4SA 1X3MA 1NM1A 4DQ8A 2FLOA 2Q0RA 3I33A 1OKJA 4BRIA 4A2AA 5KPTA 4CZJA 2WUSA 2Q97A 3ENOA 1T6DA 1NGAA 3UB5A 3AAPA 3SMSA 1YXQA 5TKYA 3GL1A 4H5TA 4E1JA 3FZHA 1QQOA 5F0XA 1JCEA 4KBOA 2E1YA 2V51B 1KAZA 4BVPA 3VGKA 2P9UB 4M63C 5ELZA 5BRHA 1SZ2A 4JD2B 5ADXA 5AQYA 4FO0A 4RCHA 3H3NO 3AAQA 5AQQA 1GLLO 4MO4A 4BR9A 4BR0A 5LJVA 2BUPA 5AQGA 4DCHA 1E4FT 3U8XA 3LM2A 3WEEB 2P9KA 2F9WA 3FE1A 5EXWA 4BRHA 4BG8A 3CJAA 3KZBA 4K41A 2YCHA 1TUUA 4BGAA 3L0QA 4B1XB 3DXMA 4K43A 1NGGA 4O8KA 1BO5O 3TPQA 4B1UB 1BA1A 2GEMA 5FPMA 4CBWA 5AQWA 1HPMA 2P9SA 3LL3A 3O6WA 1Q18A 3H1QA 3F9MA 3ULEA 3VF6A 3EZWA 4L3QA 3D2FB 3A8YA 3VERA 3MN5A 3EKUA 1U2VB 1ZXOA 2A40A 3DJCA 3LDQA 2YI1A 5E84A 4H5RA 3LDNA 3LDOA 2QWNA 1NGHA 4BR4A 4H0TB 1HX1A 4XH5A 1QHAA 4IO8A 3A0IX 3CETA 4FL9A 1NGIA 4WQ5A 4BC5A 2Q1NA 3FLCO 3VEXA 5BN9A 1IJJA 4QS9A 1QZ5A 1K8KB 2GUPA 3VEYA 4PKIA 4H0OA 3RSEB 2QXLA 5AZJA 3CERA 5AQIA 3GE1A 2QWLA 5AQKA 3SJHA 4EFHA 4BRDA 2ZWHA 3P4IA 4F9OA 4EAHD 2V7ZA 2P9NA 1BWFO 4BRAA 3AARA 4WQ4C 3ATVA 5B8HA 4BRNA 4DB3A 5KQ8A 3QICA 3CJ1A 2BTFA 5F1XA 3QBXA 5JLHA 1BUPA 3JS6A 1G99A 2YHYA 4H5NA 5E26A 1KXPA 2P9LB 3GOIA 1DGKN 1GLBG 2GTDA 1BA0A 5KPZA 4I6MB 1KAXA 4M7YA 4XH1A 4JAXA 4Z94A 5JMVA 1WOQA 2F9TA 3FZFA 3VEZA 5BRFA 2NZTA 3GG4A 3ZETB 4ISFA 2P9PB 3EKSA 2E20A 2P9IB 2IIRA 3GBTA 3MMVA 4HTLA 1H1VA 4CZHA 3DXKA 2GWJA 3QB0A 4FPBA 3ZX0A 3SLCA 2NRHA 4FWMA 3LM9A 3CIPA 2A41A 3J8AA 4Y0WA 4FWPA 4IWVA 3EL2A 3H1VX 3O1BA 3D2EB 3MN6A 1T6CA 3CQXA 4BRQA 4HWIA 1S3XA 3ZX3A 2H3GX 3SMPA 5JICA 4IJNA 2D1KA 1XUPO 2DPNA 1HKBA 3HZ6A 4BRLA 1BDGA 3MK6A 2QW9A 3SK3A 3EN9A 4BRPA 1HKGA 5EVZA 2E2PA 4BRFA 4H5VA 5FPEA 1DEJA 5AQZA 3HSCA 3MDQA 3VOVA 4BVOA 4B1WB 4MLEA 3ZEUA 2HF3A 1ATNA 4YDUA 5AQMA 1TUYA 2GELA 5AZIA 1MDUB 2VYPA 1NMDA 3CJ7A 4FOEA 1HKCA 2PAVA 1MA9B 3KHYA 4IJAA 4A62A 4C23A 5AQVA 2E8AA 3VESA 4CZMA 5BR9A 3ID8A 1BOTO 3O8MA 1HUXA 4QS7A 3HBTA 1MWMA 2P9KB 4JD2A 1GLCG 2FSKA 1NLVA 2AA4A 3CJ9A 2ZF5O 1BU6O 2KHOA 3QFPA 5EX5A 2QWOA 4AM6A 5AQJA 1WUAA 4LC9B 5AQSA 4IXCA 3DXMB 4CZKA 1GLAG 1RFQA 3H3OB 4PL7A 1IG8A 3VEVA 4JHDA 1CZAN 1YVNA 3IMXA 1C0GA 3ENHA 3VGMA 2IVNA 2P9SB 4BG9A 5AQNA 3ULEB 4B9QA 3H46O 2AP1A 4BC2A 3CHWA 1NBWA 1SAZA 4H0XB 1YUWA 5AQRA 3R6MA 2CH5A 2D4WA 2Q0UA 3O08A 3L4IA 1RGIA 2E1ZA 1R59O 2A3ZA 2A6AA 3M3ZA 1J6ZA 4CZFA 5F2RA 5LJWA 4FWKA 4FWOA 2D0PA 2A42A 4ISGA 4XEIA 4XH4A 5AZJB 4WQ5C 1SQKA 1NGFA 2V52B 4JNEA 4PKHA 5EY4A 2YJEA 4BGBA 3RSEA 3VENA 3WXIA 4WYBA 2P9NB 5FPDA 3VF4A 2E2NA 2ZGZA 1QQNA 2Q36A 4H03B 4RTFD 2QM1A 3LDLA 3WXLA 3UKRA 2YHXA 2IVOA 1GLFO 5EOYA 3GDQA 4FOIA 3VETA 2I7PA 4A2BA 4EHTA 1U6ZA 2ITMA 3WXKA 4B1YB 3CJCA 3MN9A 2CGLA 1TYQA 3C7NA 2ASMA 1YAGA 4B1VA 2W40A 3DXKB 4EIAA 1LCUA 4BRMA 1BG3A 3U9DA 4GY2B 3OHRA 2GWKA 4BRGA 3QDKA 3FR0A 3IDHA 1ATSA 3BF3A 4MO5A 4NB4A 3C0BA 1ATRA 4CBUA 3O80A 1JCFA 1HJOA 2VCPA 3O5BA 4FWRA 4BC4A 5JLFA 4M7XA 4FWQA 3U9ZA 5CE3A 5AFUH 3DWLA 3H6EA 3M1FA 3CJBA 3VF2A 3UKUA 4MLHA 3R9PA 5KQDA 2ASPA 1Z6RA 2FF6A 4GNIA 4FWNA 3A5LC 3UE5A 4IZ9A 4CZGA 1QQMA 4H0YB 3B8AX 1E4GT 1RDWX 1NGBA 4BRCA 2D0OA 3M6GA 1ZBSA 3BF1A 2FXUA 3ZEUB 4CD1A 5AZIB 2A5XA 3I8BA 3KVGA 4BRKA 5BREA 2OANA 5BRDA 1NWKA 3S41A 2P9UA 2ASOA 5AQTA 4O5FA 3H45C 4JN4A 1JCGA 3JXUA 3FZLA 1D4XA 2E88A 2YHWA 3W0LA 4YDUC 4H0PA 4PKGA 1Y64A 4CJ7A 4J8FA 3WEEA 3L6QA 2Q2RA 3HTVA 1XQSC 2QWPA 2E2OA 4FWLA 4JHDB 4AM7A 3CQYA 3HI0A 3CI5A 3MCPA 1X9JA 5AQLA 2QWQA 1Z05A 3O1WA 2NLXA 3VEWA 5AR0A 4EHUA 1T44A 3WXJA 1EQYA 1V4TA 5BN8A 3G25A 4CZEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CHZA 4CJ4A 1VQ9N 1U2VA 3VA3A 3QEXA 1T8EA 3D7EO 5SZTA 2FF3B 2PZSA 3VGLA 4IDHA 4BQZA 4CBXA 3KD1E 1YTUA 3C95A 3LWLA 4JYAK 1NK4A 1RDBA 4Z4EA 3TARA 4NYFA 3THWA 1UOCA 3OYKA 3HXMA 3AVJA 1VQ7N 1X3NA 3E66A 3FZMA 4WQ4A 3OYCA 3R8EA 4J2EA 4ISEA 4JKBA 1QZ6A 2ATQA 3C6TA 3BP8A 4QAGA 4IEIA 2RF2A 1HPZA 3U4LA 2UU9K 3HPOA 2CGJA 1TVRA 3HRGA 3VEOA 3VQEA 2FSNA 4FK4A 1MWKA 4CIEA 4CHYA 5ADXH 1VAZA 4O8UA 4JK8A 3A5OC 4BR5A 3L2VA 3V1OA 2ZJRL 1HLUA 3QO9A 1BHLA 2HMPA 2P9LA 4E1NA 1P8ZA 4Z4FA 4FWSA 1TYQB 1F21A 3O4WA 3NAEA 3L2QA 3VN5A 3HL8A 2OTJN 3V9ZA 1FKOA 1LWEA 4C8OA 3G0ZA 2NRZA 3AY9A 4FSVA 4H0VB 3G6EN 1RBTA 5AQFA 3TU5A 3DI6A 4N47A 2YHAA 1N34K 4DTOA 4OLAA 1TAQA 4DTXA 1RT1A 4FJIA 5BPMA 1LOTB 4YHHK 3PX0A 3NBPA 1S1UA 3SQ1A 4YOUA 4DQ8A 3J7YP 2KQ2A 4BRIA 3B6OA 5KPTA 4YNQA 4FJLA 4CZJA 2WUSA 3QIPA 3NH2A 3SMSA 1LW2A 3ITHA 3GL1A 4H8KA 2O8EB 1T7PA 4QCLA 4KBOA 4E19A 4DR6K 1KAZA 3VGKA 4OLBA 1NOZA 4DF4A 2Q3SA 5BRHA 4DSEA 3O9TA 4GV6A 5C25A 5ADXA 4OKEA 4DSJA 1RTHA 4BR9A 2D0CA 4BR0A 5LJVA 3U8XA 3LM2A 2EX3A 3WEEB 4K41A 4BGAA 3EEQA 1NK8A 1T05A 2X6NA 4K43A 4FZYA 1XMOK 4IO9L 5FPMA 1HPMA 3AA4A 2XY5A 3H1QA 3ULEA 3LP1A 4Z4GA 4IFEA 1W0HA 4G9ZA 4B3TK 4NLBA 4DTNA 3LDNA 3T1AA 1U04A 3HPGA 2HHVA 1K8AO 4C1NI 2JGUA 3AO5A 4WQ5A 4AILC 4EP5A 3O3FA 3FLCO 4LY7A 5BN9A 1IJJA 1DTTA 1QZ5A 2RHKA 3VEYA 4IEEA 3RSEB 1Q82O 4F2SA 2QWLA 3EE9A 1S1XA 2ZWHA 1CXQA 3V9UA 1BL3A 4BRAA 2P5GA 1SKSA 3HSTB 4LSNA 5KQ8A 3THYA 5F1XA 3E9LA 3QBXA 3SJJA 2DFEA 2VGMA 2GBZA 3CCMN 4FXDA 5E26A 1KXPA 1GLBG 3VQ5A 5T7BA 3IKMA 4JEPA 2F9TA 1CXUA 3VEZA 3NDKA 5J2QA 2P9PB 2IAJA 3TTFA 4UY8O 1L3VA 4DS5A 1VSHA 3RTVA 4HHTA 3DXKA 3QB0A 2I5JA 1N8RO 2Y1JA 3J7AP 2E4LA 3VQ8A 1UA0A 4FWPA 4OKJA 1MU2A 1UA1A 2EHGA 3F73A 4ZTJA 2BE2A 3O1BA 3TAQA 1YVUA 3MN6A 1VRUA 1RT6A 4HWIA 4DR2K 2F8SA 5CHIA 4FW1A 2H3GX 1R0AA 4CEBA 3SMPA 1RT4A 1KQSM 5K14A 3PIOL 1J9AA 1UWBA 1FJGK 5AJ3K 1TAUA 3VMFB 1HKGA 5EVZA 4BRFA 3O9SA 1VQON 1QSYA 2IOCA 4H5VA 3MDQA 4LD0A 3ZEUA 2GELA 2VYPA 3CJ7A 2HB5A 1TV6A 1JLQA 1ASUA 5D3GA 1MA9B 2DY4A 3AA5X 2DFFA 4A62A 4C23A 4FJJA 1KLMA 3ZSWA 4C8LA 3OVNA 4FCYA 2E8AA 1BGXT 3MEEA 3VESA 4MDBA 3O8MA 4QS7A 1NMNA 1MWMA 4JD2A 3LZJA 4IG3A 2FSKA 2ZF5O 2KHOA 3QFPA 4LC9B 3DXMB 2WOMA 4BE1A 1CZAN 4A5AA 4B9SA 2VGNA 5H1SQ 4IFYA 2GX9A 4GV3A 4CK2A 2YKNA 3P39A 4DR4K 1NNEA 1QTMA 2AP1A 1YITN 1VSLA 4F3OA 1B9FA 4WCEL 4DR5K 1YUWA 2OZMA 3TR8A 2Q0UA 4DV0K 3O08A 3U3YA 1RBVA 4JKDA 3HJFA 4C1NK 3THWB 4J2DA 1R59O 1TKZA 3F2KA 3WXMB 1QVGM 5F2RA 3RRHA 2VQFK 4FWKA 4FWOA 5DMRA 1IBLK 4X65K 5AZJB 5GAEP 2QEXN 3L2UA 1RBUA 1SQKA 3S3OA 4JNEA 1X1PA 1A5VA 4BGBA 3Q7CA 3VENA 3WXIA 5HRPA 3KLFA 5FPDA 3VF4A 4CEDA 2KW4A 2DFHA 4RTFD 1G15A 3RR8A 1YJWN 4ZHRA 3HO1A 1JXBA 2I7PA 4A2BA 5J2MA 3SV3A 4M3WA 4JKGA 4OGEA 3AO4A 5CY4A 1TYQA 1YAGA 4EIAA 3T19A 1L3SA 4HTUA 2B5JA 1NKCA 4GY2B 1RDDA 4BRGA 3ZT3A 3QDKA 3CC2N 4IOAL 3CG7A 3BF3A 3MECA 1C0TA 1Q9XA 2HVHA 2D0AA 4DV7K 4JI6K 3DWLA 1XHZA 5JS1A 2WFBA 1KRPA 4BE0A 5TKWA 1YHQN 4JKAA 5KQDA 1HMVA 1Z6RA 4RW7A 1QQMA 4M3ZA 3AVAA 4J2AA 3MEGA 1QS4A 2O8EA 4B9MA 5GAHP 2D0OA 5CZ1A 5JS2A 2FXUA 4CD1A 3VTIA 3I8BA 3KVGA 4KTZA 5M1KA 1NWKA 4CEEA 3S41A 5AQTA 4DUZK 3E9OA 3ENBA 4O5FA 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4JLHA 4M3RA 1QQOA 5F0XA 5KRTA 4W5RA 1T3VA 3PV8A 3M5RA 2V51B 3OS0A 4BVPA 1I3AA 4M63C 5ELZA 1JLEA 4WF9L 4E7HA 4FJGA 4LH5A 4JD2B 4I2QA 5AQYA 4M41A 2IS3A 4RCHA 3H3NO 3AAQA 1GLLO 4FJMA 3J81O 5AQGA 2KKZA 1U49A 4KHNA 4KAZA 5EXWA 3HT3A 3L3VA 3OBYA 2YCHA 1TUUA 3CXCM 2OA8A 3BY5A 1QSSA 3DXMA 2UUAK 1BO5O 4NCGA 3KKRA 4CBWA 3V4IA 3B6PA 3EZWA 1RNHA 3WNFA 4NXNK 3D2FB 3WNGA 1NJIO 3A8YA 4OVLA 2YHBA 3LDQA 3C94A 4IOCL 4H5RA 1IG9A 3JSMA 4ILGB 4XH5A 4KHQA 4CGDA 1QE1A 1VSMA 3PIPL 3CETA 4M42A 4FL9A 5DM6L 1S6PA 4CGHA 2Q1NA 4PHTX 4NCBA 3VEXA 1O1WA 1K8KB 1A5WA 3KIOA 4X64K 4R79A 4H0OA 2F8TA 5AZJA 3RMDA 3C65A 1JL2A 5KGWA 4IBNA 5AQKA 4YOXA 4RW8A 4EFHA 4FJNA 3P4IA 3DLKA 4E7IA 1TKDA 2Y1IA 4WQ4C 5B8HA 4BRNA 1K73O 4B3MK 3CJ1A 4KH5A 3OYIA 1RT3A 3JS6A 4JKGB 3LAMA 1LWFA 4H5NA 3R3LA 4KO0A 4CJSA 4AHCA 5GAGP 5KPZA 4I6MB 4YORA 4U67L 4OPHA 3FZFA 4JK9A 2NZTA 3KTQA 3AA3A 4ISFA 2E20A 4DTMA 2P9IB 1VSEA 3LP0A 1K6YA 3QERA 2QA4N 4M3TA 1HNWK 5CYMA 4AHUA 5LMNK 3ZT4A 4E89A 2QKKA 1RTJA 3J8AA 3ZSXA 1TKTA 2B4JA 4IWVA 1XNQK 5JVHL 3EL2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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