2ZGZA

Parm with gmppnp
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular structure of the ParM polymer and the mechanism leading to its nucleotide-driven dynamic instability
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Plasmid segregation protein parM
total genus 98
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA01
1GLLO 2HF4A 2NRHA 5AQJA 4FWMA 4PKIA 3WT0A 4M7XA 4BREA 2QWOA 3ZX3A 2E8AA 5KPRA 4B1ZA 2A6AA 3WQTA 4ISGA 1S3XA 4FPAA 3UKRB 1IG8A 5CE3A 3FLCO 4YDUC 1ATSA 3FE1A 4FPBA 4M63C 3H46O 3A5MC 4O8KA 5AQHA 3WXIA 1Z05A 3RSEB 4FWNA 2YHWA 3O4WA 4FWLA 2W40A 2QWRA 4IWVA 4B1UB 3DWLA 5EXWA 2A41A 4H0TB 1SAZA 1MWMA 1V4SA 2PAVA 3CHWA 4K43A 4CD3A 4CZKA 5KQ8A 3VESA 4JD2B 1QQNA 1GLJO 3M6GA 5AZJB 3JS6A 4I6MB 2P9KB 1JCEA 2CH6A 3MN9A 2GTDA 2QWMA 3S41A 1WUAA 1ATNA 4BRNA 1T6DA 4J8FA 1YUWA 4GNIA 5ADXH 4M7YA 1BU6O 5AQZA 5AQXA 3CIPA 2ASOA 5BR9A 2ZGZA 3UKUB 2FSKA 1HKCA 2AA4A 4C23A 1KAZA 3ZETB 2EWSA 3OHRA 1NGGA 2ZGYA 2YJFA 3F9MA 2VWBA 3GL1A 4JAXA 3FR0A 5AFUH 3I33A 1BA1A 1WOQA 3LDPA 4BC5A 4H03B 3SMPA 3CQXA 4XH5A 3A0IX 3J8AA 1Q18A 1D4XA 1DGKN 4YDUA 3DXMA 3O8MA 3FZLA 2P9NB 1HX1A 2ASPA 2GWJA 3LM9A 5AZIB 1GLDG 5KPTA 3QBXA 2J4RA 2Q31A 4IXCA 2P9UB 3WQUA 3A5NC 4FOIA 4KBOA 2V7YA 3WEEA 4JHDA 2BUPA 1XQSC 2A5XA 3MK6A 1KXPA 3HBTA 3DJCA 3AARA 2H3GX 4FWSA 3FFKB 4BRAA 4CZMA 3SMSA 4BR7A 3CJAA 3UB5A 3VGMA 3ATVA 2FSNA 5EY4A 3D2FB 1SQKA 1TUUA 3ULEB 5JMVA 4CZEA 3VEVA 1H1VA 1C0GA 3VF2A 5BRDA 2V52B 4BRKA 5AR0A 4BRMA 3GG4A 3EL2A 3BP8A 3EZWA 4BR9A 3DXKA 3H3NO 1X3NA 2P9IA 5ADXA 1JCFA 4E1JA 3A8YA 4A2BA 1P8ZA 1ATRA 4FO0A 3AY9A 4BRCA 5BRHA 1Y64A 3MN5A 3CJ9A 5ELZA 2ZF5O 4Y0WA 3B8AX 1QHAA 3IMXA 3IFRA 1ESVA 2P9SA 4B1YB 2PBDA 4Z94A 3SK3A 5AFUA 1U2VA 3H1QA 5EOYA 4MLEA 4CJ7A 1T44A 5AQSA 4BC3A 3VF6A 5AQUA 4BRGA 3L6QA 3KVGA 4FL9A 3W0LA 3EO3A 3VETA 3O1BA 4BG8A 1NGBA 1MWKA 3LDQA 4H5WA 3EN9A 4PKHA 2QXLA 3ZEUA 1RGIA 3IDHA 5AQVA 2ASMA 1NM1A 1EQYA 3U9DA 3P4IA 1GLFO 4XH4A 4H5TA 1BO5O 4ISEA 3R9PA 5FPDA 3C7NA 2P9PA 3EKSA 4CZHA 3DAWA 3VEZA 3BF1A 3VEOA 5BPMA 4B1WB 4FWRA 1NGEA 1BA0A 2FLOA 5LJWA 1NLVA 2FXUA 4BRPA 3QBWA 3FZFA 3H1VX 3QFPA 1BG3A 3HTVA 3ZX0A 2E2PA 5LJVA 1Z6RA 3TPQA 1SZ2A 2NZTA 4MLHA 1C0FA 4WYBA 3BEXA 3QB0A 2P9LA 4RTFD 2CGKA 3MMVA 2VYPA 4BROA 4PL7A 4H0OA 3QICA 4CBWA 2E1ZA 3D2EA 3EKUA 3O5BA 2GWKA 4DHYA 3LM2A 3WXLA 1GLBG 1HKBA 3VEYA 4BRLA 2FF3B 4BR2A 1X3MA 5F1XA 2Q2RA 1V4TA 5KPZA 2I7NA 5I9EB 4BRFA 3DXMB 4CZLA 1JCGA 4MO4A 2A3ZA 2HF3A 2VCPA 2YJEA 3CJCA 3WXKA 1NGHA 4PL8A 5AQWA 4DB3A 5AQTA 2NLXA 3FGUA 4CBXA 4H5NA 3L0QA 4FWOA 3D7EO 2QWQA 3WEEB 3QMLA 4BVPA 3HZ6A 3GBTA 5TKYA 4JHDB 1NGDA 4WQ5C 2E20A 1NGCA 5EX5A 2BTFA 2YHYA 4MO5A 2ITMA 3GDQA 2IVPA 5AQYA 1NBWA 2QWLA 4H5VA 3U9ZA 1KAXA 1NGIA 2Q0UA 4HWIA 4BC4A 4EAHD 1DKGD 1ZBSA 2WUSA 5AQKA 1XUPO 5E26A 2P9NA 5AQOA 3TU5A 3AAQA 3ATUA 5FPEA 2V51B 2DPNA 2YCHA 3GOIA 4FSVA 2CGJA 3U4LA 2E88A 1GLCG 1E4GT 1U6ZA 3A5LC 3VENA 5LY3A 3SJHA 1T6CA 5FPMA 1K8KA 4CD1A 3DXKB 5BPNA 4B9QA 2P9IB 5E84A 4BR4A 1BWFO 1HUXA 2Q36A 3R6MA 3KHYA 5KQDA 3H6EA 3O08A 3HI0A 4F9OA 4NO7A 4IZ9A 1GLEG 2KHOA 5AQQA 4BRQA 2E2NA 3CJ7A 2P9SB 4O5FA 3VEWA 1TYQA 1LCUA 5JICA 5FPNA 2D4WA 1U2VB 1E4FT 5EVZA 3ENOA 1HJOA 4B1XB 1KAYA 4BC2A 2D0PA 3H3OB 4IO8A 3MN6A 1HKGA 4BR0A 3HM8A 3LL3A 4NB4A 1J6ZA 4CI6A 3SLCA 4EHUA 1TUYA 4AM7A 1YVNA 1BOTO 5AQFA 4A2AA 4DQ8A 3VGLA 3ENHA 3ZEUB 3O1WA 3LDOA 4CZFA 1NWKA 3CI5A 2IVNA 3I8BA 3CJBA 3U8XA 4B1VA 4WQ5A 2GUPA 4QS7A 4H0XB 4ISFA 3C7NB 4A62A 4PKGA 2P9PB 3VEXA 4EFHA 4BRHA 4EIAA 4BQZA 3UKRA 3VERA 1G99A 4BG9A 3H45C 4LC9B 2Q0RA 2QWNA 3FZHA 1R59O 2E2QA 5BPLA 3AAPA 5AQLA 3GE1A 3G25A 3WUHA 5AQRA 4JNEA 3RSEA 3BF3A 5AQNA 1MA9B 1IJJA 3A5OC 2W41A 4CBUA 1LOTB 5AQIA 2P9LB 1YXQA 4RWTA 4K25A 5AQGA 2YHXA 1RDWX 4H0YB 3BUZB 2ZWHA 4H5RA 1S22A 3D2EB 1QZ6A 4GY2B 4HTLA 4JD2A 3VGKA 2F9TA 5F2RA 3FZKA 4QS9A 5BN8A 2IVOA 5AZJA 1HLUA 1NGJA 4I6MA 2P9KA 2A42A 2QWPA 4CZIA 1BUPA 1QQMA 3QDKA 2Q97A 4AM6A 2FF6A 4BR5A 3IUCA 3M1FA 4WQ4C 3VOVA 5AQPA 2D0OA 3VPZA 4A61A 3CJ1A 3UKUA 3CERA 1YAGA 1X9JA 3ZETA 3HSCA 1CZAN 4FWKA 4H0PA 2GELA 3M3ZA 1ZC6A 2AP1A 2IIRA 3CQYA 2FSJA 2UYTA 4BGBA 2GEMA 3UE5A 1RFQA 1QZ5A 3W3DA 4BVOA 4EHTA 3VF4A 5JLHA 2QM1A 4BQLA 2YI1A 1ZXOA 1NGFA 3KZBA 5AZIA 3WXJA 4IJAA 1NMDA 4FOEA 1NGAA 4K42A 4QS8A 4FWQA 5AQMA 1K8KB 5JLFA 3LDNA 2E2OA 2P9UA 2HMPA 2V7ZA 1DEJA 2HOEA 4L3QA 5BRFA 3L4IA 1XC3A 2D1KA 3ID8A 1BDGA 3MN7A 1MDUB 4RCHA 3ZX2A 1QQOA 5F0XA 3QFUA 2CGLA 3FZMA 2I7PA 4XH1A 4H0VB 4DCHA 2Q1NA 2OANA 4K41A 4IJNA 1TYQB 3CETA 3LDLA 4BGAA 3R8EA 3MDQA 4BRDA 4JN4A 2CH5A 3D2FA 1GLAG 3O6WA 3JXUA 3O80A 2E1YA 2QW9A 3ULEA 2F9WA 4BRIA 4CZJA 5B8HA 4XEIA 5BN9A 3MCPA 4CZGA 4WQ4A 4FWPA 5BREA 1HPMA 3C0BA 2A40A 1OKJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DSFA 1GLLO 3G0ZA 2Z1GA 3WT0A 4M7XA 4JYAK 4ID5A 3AA2A 4KFBA 2XY8A 2A6AA 3WQTA 3HP9A 4ISGA 4B1ZA 3SQ0A 4V19S 1JLAA 4RW8A 3AVKA 2HHVA 2OTJN 3NAEA 5CE3A 4YDUC 4OO1J 3DRRA 3JSMA 1JLEA 4RW4A 3H46O 3N4QA 3RSEB 4Z4EA 3O4WA 2D0AA 4CFDA 2W40A 4IWVA 4CF0A 1BL3A 4B1UB 3CXCM 3DWLA 2Y1JA 3AVLA 3ZT0A 3HOSA 2A41A 3OS0A 1SAZA 4CZKA 1HYVA 4JKFA 4CD3A 4KHPK 3OA9A 3EZ5A 3U6FA 5AZJB 3WNGA 3JS6A 4CEBA 2HVIA 3NE6A 4JK8A 2CH6A 3CCMN 4N41A 1T6DA 1NKBA 4CHQA 4I9QA 2YX6A 1QVFM 5DM7L 4NCAA 3DLGA 4HCBA 5BR9A 1HKCA 2AA4A 4C23A 1VQ5N 4BDYA 3ZETB 4CHOA 2ZGYA 4CIFA 2Y1IA 2G8VA 2VWBA 4JAXA 4DR7K 4YOUA 4WFNL 4BC5A 4B9MA 4H03B 3AA4A 4KH5A 3A0IX 1D4XA 5HROA 2HBMA 3CMAN 4YDUA 1KRPA 5AZIB 3MWTA 3FZLA 3DMJA 3AA3A 1LW2A 1GLDG 4DSEA 3VQ4A 4UQGA 2EHGA 4WFAL 4KBOA 5C24A 3CCQN 4GKJK 3THYB 1XQSC 1N6QA 4ZHRA 3FFKB 4BRAA 1SKSA 4JKHA 5C42A 4BR7A 2HVHA 2OZMA 3CJAA 3TARA 3NCIA 3VGMA 3PX0A 5EY4A 3QEVA 1QVGM 1T05A 5BRDA 4ILJA 4BRMA 1NNEA 3CCEN 3EL2A 3DOLA 3HM9A 3ZLJA 4BR9A 5KRTA 4FJKA 1TL3A 3OYCA 3CCLN 2XHBA 1ATRA 3QO9A 3CG7A 1BHLA 3N4PA 5J2NA 3SAHA 1Y64A 1NK4A 5M1OA 3MN5A 3AO3A 1FKPA 3IMXA 3R1XA 2B6AA 1BISA 4W5RA 3OS2A 5AFUA 4CJFA 1S72N 4F3OA 1T44A 3VTHA 3VF6A 2O8CB 2F4VK 3AO2A 1IKWA 4F4KA 3LDQA 4F3TA 4JI4K 3C6TA 1RT3A 4IG0A 3TAFA 4JS5A 4R79A 4FJJA 4IBNA 4DSJA 3R9PA 3C7NA 2PZSA 4J2AA 3EKSA 1WB9A 3BF1A 1GOBA 4IOAL 4FWRA 1NGEA 1BA0A 3E9LA 2E6MA 3DLRA 3KK1A 2FXUA 3LPTA 4JI3K 3EEQA 5SZTA 3H1VX 4O8UA 4H4MA 5LJVA 5HL7L 2NZTA 2O8BB 3NF8A 1C0FA 5HBMA 4CJ3A 3QB0A 2VWJA 4BWJA 1YT3A 1VQ7N 4GW6A 4PL7A 5CHIA 2VGNA 3TSPA 2E1ZA 3D2EA 3EKUA 4RW6A 3S3NA 1YTAA 3WXLA 4DTNA 4JKDA 3VEYA 4N5SA 1X3MA 2Q2RA 3HVTA 1QSYA 2I7NA 5H1SQ 4DTOA 4BRFA 4MO4A 2HF3A 3S9HA 1X9MA 3HK2A 3CJCA 1SL0A 3I0RA 4B3OA 1NGHA 5JS2A 3OYAA 1HNIA 3E9OA 4DB3A 4MDBA 4DS5A 4CK3A 4F2SA 3OYHA 3L0QA 4FWOA 3D7EO 4G1QA 2KZMA 4CGIA 4HUEA 1TK0A 4JHDB 1NGDA 3DLHA 1S6PA 1NGCA 1J5OA 3MAQA 1RDBA 1K73O 5HLFA 4H5VA 1SS6A 4BC4A 5GAHP 1KFDA 1ZBSA 4DV2K 1JLGA 4GMJB 4FJIA 5E26A 5AQOA 3AAQA 3ATUA 1XHXA 2DPNA 3ZYYX 3I0SA 4DTUA 1ASWA 3A5LC 1RDUA 3SJHA 4DQRA 5BPNA 2P9IB 4FJMA 3THYA 4M3XA 1RCHA 3O3FA 1HUXA 3PSIA 5KQDA 2YHAA 3OYJA 3HI0A 1RBTA 4IZ9A 4EZ9A 4HTUA 4FM1A 4BRQA 4DKWA 1TYQA 4AHTA 5JICA 3MX5A 5FPNA 1S1XA 1E4FT 5EVZA 1N32K 3AVFA 2KZZA 1XNRK 3H3OB 4GV6A 1HKGA 4OKKA 4NB4A 2UUAK 4JI7K 2O8FA 1TUYA 3MXJA 1TGOA 5CZ2A 5AQFA 4CGGA 3QERA 3LP0A 1NWKA 3SCXA 1W97L 3KWIA 1CZBA 4J2EA 4FZZA 4CJWA 3KK2A 4B1VA 4H0XB 2HMIA 3NF9A 4A62A 4PKGA 4WCEL 3RVCA 4EFHA 5C15A 1L3UA 3UKRA 4DS4A 3DI6A 3DYAA 2OPRA 4BG9A 2XO7A 4O5BA 4LC9B 3KKRA 4N76A 3G25A 4C8OA 3VQPA 3VQCA 3A5OC 1YVUA 3MEEA 4FZYA 4LD0A 4BWMA 3CFOA 5AQIA 4LFAK 4KHUA 3VQ5A 1IKYA 5AQGA 2Z1HA 2YHXA 4H0YB 1C1BA 3BUZB 2ZWHA 4DMNA 4GY2B 3MECA 3VGKA 3THXA 5SWMA 4B8CA 5BN8A 1HLUA 2HNYA 4I6MA 1QQMA 3D45A 2BDPA 5C10A 1RTJA 5C12A 4FLWA 3RTVA 2OZSA 3IUCA 4DFMA 3HXMA 4NLBA 2JWLA 3F5TA 3VPZA 2O4IA 1RT4A 3UKUA 4CK2A 4OPKA 3KKSA 3K59A 4FWKA 3M3ZA 3DLLL 4F8RA 1BCOA 1DLOA 2DFEA 3ZT3A 2KKZA 1U45A 3CQYA 1VRUA 4B08A 4M41A 1RFQA 2KW4A 3NGIA 2G8FA 4BVOA 2ZE2A 5DMRA 3F73A 3VF4A 4CJPA 4YNQA 4Z4GA 4AHCA 2QEXN 4KREA 3WNFA 4MFBA 2UUBK 3KZBA 4IJAA 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1QHTA 2P9NB 2ASPA 2O4GA 1YITN 5KPTA 3QBXA 2G8WA 5TKWA 4LSNA 3ZSZA 4BY9C 5E41A 3ZCMA 3S3OA 4IXCA 2P9UB 4CE9A 1NJYA 2V7YA 4CEQA 1REVA 2BUPA 2A5XA 1S5JA 4FXDA 1RT7A 3K5OA 3DJCA 4DR2K 3SMSA 2WBNA 4FJLA 5GADP 2RPIA 3ATVA 2E6LA 2FSNA 4FK4A 5JMVA 4CEZA 3RMCA 1H1VA 3VF2A 3V9SA 2O8DA 3CPEA 1JLFA 3CD6N 1HQUA 3BP8A 3DXKA 3H3NO 4JI8K 3T1HK 1D9DA 1X3NA 4DR5K 4F2RA 2VQFK 4BRCA 1I3AA 1IBMK 2ETJA 4CGHA 1RT1A 4DLEA 4DSIA 4TSXA 3ULDA 3OBYA 3M8PA 2ZF5O 4AH9A 3B8AX 4B9UA 3AO1A 3IFRA 3CPWM 1XMQK 2P9SA 3LWMA 4Z94A 3SK3A 1U2VA 1VK0A 4CJ7A 3SI6A 3U3GA 4BC3A 3CCVN 4DLGA 2NNWA 5AQUA 1WSJA 4BRGA 2JLEA 4FLXA 4DV1K 4FL9A 3EO3A 4X66K 3ISNC 4AHUA 3AV9A 3O1BA 4ICLA 4ID1A 1TK8A 1NM1A 1S9EA 4HUFA 3U9DA 3HRGA 3CCUN 4LSLA 1DTQA 4H5TA 3QEIA 1Z26A 5GAEP 3L4QA 3EE8A 5FPDA 1EWQA 3CM5A 3OYKA 3VEOA 5BPMA 4KHSA 2OYQA 4PUOA 2HSTA 4B1WB 2FLOA 1WBBA 4BRPA 2D5RA 3J80O 3NGYA 2ZJQL 1QQCA 3TSUA 3QFPA 3Q7BA 4C8LA 1VQ4N 2P5OA 1LW0A 5JS1A 3LAKA 2ZQBA 3MMVA 2WFBA 1UA1A 4I2QA 3RWUA 4LF9K 3O5BA 3P39A 4NCBA 4ELVA 4I7FA 3PX6A 1V4TA 3TAMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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