2ZGZA

Parm with gmppnp
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular structure of the ParM polymer and the mechanism leading to its nucleotide-driven dynamic instability
pubmed doi rcsb
molecule keywords Plasmid segregation protein parM
source organism Escherichia coli
molecule tags Structural protein
total genus 98
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA01
3ULEB 5F1XA 4BGBA 3H3OB 4B9QA 3CJ7A 1TUYA 1BDGA 4EFHA 4H03B 4XH4A 3P4IA 5AQPA 4CI6A 1GLFO 4H0OA 3EZWA 3JXUA 3ULEA 4CZMA 4A2BA 1BWFO 3EL2A 4BRKA 1HKCA 3CJ9A 3QBXA 3VF4A 3F9MA 4CBWA 1NGFA 1NWKA 4CBUA 1G99A 2E1YA 4CZGA 3EN9A 4K42A 5JLFA 5BREA 3VOVA 4F9OA 4BR9A 4FOEA 3RSEA 3ZEUB 3BF1A 3FLCO 4EAHD 5EY4A 3GOIA 5FPDA 5I9EB 2YI1A 2HF3A 3VEZA 3DWLA 3ATVA 2Q36A 4H0VB 3WEEB 3KZBA 3G25A 1GLCG 3ZEUA 4H5RA 3M1FA 2NLXA 4PKHA 2GUPA 4PKIA 4ISEA 3MCPA 3WEEA 4H5NA 4BR5A 3CHWA 1LCUA 4FWRA 4QS7A 3R9PA 3O1WA 2P9UA 5AQHA 3VERA 2QM1A 4PL8A 2A6AA 1ATNA 3C0BA 2Q0UA 4YDUC 5EXWA 2E20A 3VEYA 5E84A 2KHOA 1YAGA 3HI0A 3IUCA 3BP8A 2D1KA 5KQDA 2A40A 1HX1A 2Q0RA 3WXJA 1J6ZA 1SZ2A 1ZXOA 3CIPA 3DJCA 3MN6A 4H0YB 3VPZA 3QMLA 4BRQA 4I6MB 4M63C 5ADXH 2P9LB 2PAVA 4BGAA 3CETA 3D7EO 2P9KB 2CGLA 3CJCA 5AQGA 2WUSA 5AQFA 3TU5A 4IWVA 2FF3B 3SLCA 2P9LA 4O8KA 1DGKN 2P9KA 2ZGZA 4WQ4A 3FE1A 1JCFA 4DCHA 3L0QA 5AR0A 1BA0A 5AQSA 2FF6A 4CBXA 2V51B 2QWNA 5EVZA 4B1XB 2E88A 5JLHA 3HBTA 3ID8A 2HOEA 4MO5A 4BC4A 5E26A 1E4GT 3EO3A 2NZTA 2V52B 5AFUH 1E4FT 4CZFA 2FSJA 4FOIA 4MO4A 3VF2A 3VGKA 3ENOA 2E2PA 3IDHA 3W0LA 4BRDA 3O1BA 3GE1A 2E8AA 1KAYA 3A5MC 2CGJA 3WXLA 1P8ZA 5KPRA 2HMPA 5KQ8A 3WXIA 1NGBA 2F9WA 4BVPA 3LM2A 3H45C 4HWIA 5JICA 1MWMA 1GLBG 4IZ9A 5AQUA 4MLEA 2FLOA 2VYPA 1IJJA 3MN7A 4B1YB 2W40A 2CH5A 5EOYA 1OKJA 3CJ1A 2QWRA 1S22A 3WUHA 4DQ8A 4H5VA 3TPQA 1XUPO 3GL1A 3R6MA 2QWQA 1KXPA 1H1VA 4JAXA 1V4TA 2HF4A 4B1UB 4O5FA 3LM9A 4BRLA 5LJWA 3OHRA 3RSEB 1HUXA 1HPMA 1NM1A 4M7YA 3VESA 1QZ6A 3J8AA 4DB3A 4H0XB 3O5BA 2H3GX 1Z6RA 4AM7A 3AY9A 2BTFA 3BF3A 2D0OA 4BQZA 3BUZB 1NGEA 5B8HA 4JNEA 5ELZA 3EKUA 4BR0A 3O4WA 4HTLA 1NMDA 1GLLO 4BREA 2D0PA 1YXQA 1EQYA 2P9UB 1C0GA 3FZMA 1KAXA 1NBWA 4H0PA 2P9SB 4WQ5A 1X3NA 3FFKB 2D4WA 4H0TB 4A62A 2E2OA 1YUWA 4GY2B 5FPMA 3DAWA 3M3ZA 3H1VX 4A2AA 3WT0A 4BR2A 3M6GA 5BN8A 4B1VA 1WUAA 2P9SA 2YHWA 3IFRA 5AZJB 5F0XA 3H46O 4C23A 1ATSA 1U2VB 2IVNA 3B8AX 3LDPA 4FWOA 2DPNA 2IIRA 4CZIA 5AZJA 1CZAN 1GLEG 4BRPA 3DXKB 4FPBA 2YJEA 4M7XA 3VF6A 3U9ZA 1U2VA 3ENHA 2E2QA 3S41A 4FWLA 4IO8A 4BRAA 2ASPA 2YHXA 3D2FB 4Y0WA 3UKRB 3VEXA 3DXKA 3A5NC 1QZ5A 4KBOA 3CQYA 3O6WA 1T44A 5KPTA 2QWOA 3HTVA 4CD3A 2FSNA 3D2FA 4WYBA 3UKRA 1XQSC 3VENA 3AAQA 3VGLA 4BC2A 4BRHA 2YCHA 3EKSA 3CQXA 1GLDG 4FWMA 1JCEA 1X9JA 4J8FA 3O08A 4CJ7A 3C7NB 4FWPA 1RDWX 1ATRA 2AP1A 3HM8A 3LDLA 3CI5A 3HSCA 2BUPA 4K41A 1WOQA 2A42A 1BUPA 5BRDA 1MWKA 1NGDA 3C7NA 1Y64A 3VGMA 3KVGA 5EX5A 4H5WA 3GG4A 2ASOA 2E1ZA 4BG8A 3SK3A 3UKUB 3IMXA 3MDQA 3VEOA 4B1ZA 3O80A 5AQVA 1HLUA 3L6QA 1HJOA 1SAZA 4NO7A 1ZBSA 4RTFD 5AQTA 5ADXA 2P9PB 1NLVA 3UKUA 5LY3A 1NGAA 3HZ6A 5AQXA 3UE5A 4FWKA 3VETA 2PBDA 3GBTA 1BA1A 3SMPA 4PKGA 3VEVA 4BR4A 4Z94A 1BO5O 2ZGYA 2FXUA 4MLHA 2P9PA 3FR0A 1K8KB 1V4SA 4JHDB 3AARA 4CZHA 3SMSA 5AZIB 3ATUA 2OANA 1GLAG 1K8KA 4BG9A 4ISGA 4IJNA 4JHDA 3W3DA 4BRIA 3D2EB 4WQ4C 1BG3A 3FGUA 5CE3A 3FZLA 5BR9A 5AZIA 4YDUA 4RCHA 2I7NA 1RFQA 5AFUA 2NRHA 1T6DA 4CZKA 3D2EA 1YVNA 3LL3A 1JCGA 3O8MA 5F2RA 4FSVA 2W41A 4JN4A 3QBWA 4EIAA 5AQOA 4K25A 3MK6A 1DKGD 1Z05A 2ZF5O 4L3QA 4PL7A 5BPMA 1BOTO 5JMVA 2FSKA 2Q1NA 3H6EA 1C0FA 1MA9B 5KPZA 3U8XA 4QS8A 4IJAA 2P9NB 3LDNA 1BU6O 1SQKA 3MMVA 1Q18A 3H3NO 3QB0A 1QHAA 3FZFA 5FPNA 3CJAA 3I8BA 4RWTA 2P9NA 4EHTA 2Q97A 3GDQA 2AA4A 3BEXA 1XC3A 4FWSA 3A8YA 3QFPA 4JD2B 3ZX0A 3ZX2A 3WXKA 2VWBA 3KHYA 5AQJA 5LJVA 3A0IX 2V7YA 2I7PA 1ESVA 4BC3A 5AQMA 4FWNA 4A61A 4JD2A 2F9TA 1D4XA 4FL9A 4FO0A 1QQMA 2J4RA 2V7ZA 3UB5A 4BRGA 1KAZA 3CJBA 3MN5A 3ZETB 4XEIA 3L4IA 5AQNA 4EHUA 4CZEA 2A41A 4BQLA 2QW9A 4CZJA 4BRNA 4DHYA 1NGIA 1GLJO 1R59O 3R8EA 2IVPA 3JS6A 3ZETA 1ZC6A 2P9IB 1LOTB 2QWMA 4FWQA 3WQUA 4BC5A 3AAPA 2YHYA 4BR7A 3QDKA 4K43A 5BRFA 3H1QA 4H5TA 3ZX3A 3FZKA 5BPNA 1NGGA 2QWPA 1QQNA 3VEWA 5AQWA 4CZLA 2P9IA 3U4LA 4BROA 1S3XA 2YJFA 3LDOA 4I6MA 4ISFA 4WQ5C 4E1JA 2CH6A 2IVOA 3LDQA 5AQKA 2Q31A 3QICA 5TKYA 4GNIA 1HKBA 2ITMA 2ZWHA 4NB4A 2GEMA 2EWSA 2CGKA 2VCPA 3CERA 3DXMB 1DEJA 2A5XA 2QXLA 1IG8A 5AQIA 5AQRA 4BVOA 1NGJA 3I33A 5AQLA 3FZHA 1HKGA 4XH1A 2UYTA 2GWJA 1U6ZA 2E2NA 1MDUB 2A3ZA 3QFUA 1TUUA 5FPEA 3DXMA 3SJHA 4IXCA 3A5OC 1RGIA 4FPAA 2GELA 1T6CA 2Q2RA 4XH5A 3U9DA 5AQZA 1NGCA 1X3MA 1TYQB 4AM6A 5AQQA 1QQOA 3WQTA 2ASMA 2QWLA 3A5LC 4B1WB 3MN9A 4BRCA 5BN9A 4QS9A 4BRMA 5AQYA 2GTDA 5BRHA 4BRFA 2GWKA 4LC9B 1TYQA 4CD1A 1NGHA 5BPLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SKRA 4BGBA 3H3OB 3MXMA 2KFNA 4XH4A 2IDOA 1JL2A 3P4IA 3C95A 3AVJA 4OPKA 4IOCL 4Z4GA 5HRRA 3JXUA 4CZMA 2G8WA 2G8HA 1EWQA 1BHLA 3AVCA 1U49A 4CEOA 4QCLA 1HKCA 2PY5A 4FW1A 3AA3A 2QEXN 4CBWA 3D0PA 4HVJA 5CYQA 1NWKA 3OJUA 4O4GA 5JLFA 3SAFA 1YTAA 3BF1A 3FLCO 1YI2N 3KD5E 1EETA 3LP1A 1CLQA 1HQEA 2HF3A 3VEZA 3DWLA 3NF6A 3ATVA 4KREA 2Q36A 1DTTA 1GLCG 3ZEUA 3THXB 4H5RA 3M1FA 4W5OA 3WNHA 4KI6A 3RMAA 1NU0A 1Q82O 4K0KK 4BR5A 3DLHA 3M8QA 3O1WA 2P9UA 5AQHA 3SZ2A 2G8KA 4NYFA 2VQFK 1D8YA 3L3UA 2QA4N 4CJSA 2Q0UA 2HHQA 3VEYA 1N5YA 3HL8A 3LWLA 2D1KA 3I0SA 1NJWA 1O1WA 1HX1A 4JI7K 5IWAK 1WSGA 4UY8O 1ZXOA 3CIPA 3MN6A 3N4QA 4C8NA 5J2MA 4H0YB 3VPZA 4WCEL 4BRQA 1A5VA 4I6MB 5ADXH 4M3WA 4DV0K 4FJHA 1NKCA 2P9KB 4IKFA 2F8SA 3NFAA 3C94A 3AO2A 4FYDA 1UA0A 2P9LA 3VN5A 4ILHA 2Z1JA 5JS1A 4WQ4A 3AO5A 4MDAA 1JCFA 4LSLA 2VQEK 4J2BA 2FF6A 4CBXA 3QINA 2QWNA 2W6LA 3P39A 1WSEA 4JKCA 3ID8A 1RILA 5E26A 4O8UA 3EO3A 4N76A 4AF1A 3NHGA 5AFUH 1VQMN 3HSTB 3ZCMA 2XRIA 4FOIA 3CCVN 5C15A 2ZE2A 3TSUA 4A59A 3VGKA 4DSIA 2E2PA 1KVBA 2IOCA 2NRZA 2YNHA 1XHZA 1KC8O 2E8AA 1KAYA 3A5MC 1RDCA 2DFHA 5KPRA 3QNOA 4GKJK 4DSLA 4CHQA 5T7BA 4C1NI 3RTVA 3V6DA 3RWUA 4GKKK 3RRGA 4HUFA 3SQ1A 1L5UA 1GLBG 3CCQN 1WNSA 4DUZK 2FLOA 4DV2K 3MN7A 3CMEN 2W40A 3U3GA 4FXDA 4MDBA 1NNEA 3WUHA 4DQ8A 3J7ZO 1WBBA 1XUPO 2XO7A 4JAXA 1I3AA 4C8MA 1V4TA 3SUQA 4OKKA 4LSNA 3OHRA 4IDHA 2P51A 1HUXA 4CJRA 4IEEA 3J8AA 2H3GX 3E66A 4AM7A 3TAEA 2BTFA 4KTWA 3BUZB 1JXBA 1NGEA 3NVMA 4F8RA 1NMDA 3JAMO 3BDPA 1GLLO 1JLFA 4BREA 1HPZA 1YXQA 3LPTA 4ZTFA 2IGIA 4HTUA 4DQIA 2YV0X 1NBWA 2OPPA 4KRFA 1X9WA 1X3NA 2D4WA 4H0TB 4CW7B 3TR8A 2X74A 1BISA 4JI2K 3ZT4A 4RW8A 5SZTA 3I0RA 3M6GA 1NKEA 3SPYA 1RT6A 3V9WA 1K73O 4B3RK 4LF8K 3RMCA 4JS5A 3F5TA 3OYMA 3HM9A 1R0AA 2IIRA 2HHWA 3ALYA 3CFPA 4M7XA 4CE9A 3U9ZA 4DSKA 3R1XA 4CCHA 3O3GA 2NUBA 1ASUA 4I9QA 2YHXA 3DXKA 3OYNA 3J7YP 1T44A 5M1PA 4DU3A 1XNRK 3THWA 1LAVA 4X65K 3CC2N 3UKRA 1XQSC 1VSDA 3VENA 4BC2A 3VGLA 1FKOA 5MLCQ 1KSPA 1GLDG 4FWMA 3VQ4A 1X9JA 1C1BA 4CESA 1RDWX 2HHUA 4I2QA 3MEGA 2BUPA 4DQQA 3PIPL 4FLTA 1Y97A 1WOQA 1KCFA 1BUPA 1MWKA 3K2PA 5LMNK 3C7NA 1IBMK 3VGMA 4IFYA 3DI6A 4LH5A 3ZSWA 2E1ZA 3L2QA 3IMXA 3HOSA 2OPRA 4CEBA 4CK2A 4LF4K 3P38A 1HJOA 1SAZA 2NRTA 3E01A 4E7KA 3V81A 3OBYA 4RTFD 5AQTA 4DFMA 2P9PB 1NOYA 3ZSXA 3SPZA 5J2QA 4K8XA 4FWKA 2PBDA 3RR8A 2O4GA 2FXUA 3AVHA 3SV4A 3FR0A 3MCAB 4JHDB 4KHWA 4X66K 3WNFA 4JKHA 4FLWA 3CPWM 4OVLA 2OANA 1K8KA 4NCAA 4ISGA 2Z1IA 1BG3A 1L3SA 3CFRA 5BR9A 1SKSA 4RCHA 2I7NA 1T6DA 4CZKA 3D2EA 1S1VA 3ZLJA 5J2PA 3ZSYA 3ZSOA 1Q9XA 4OKJA 4EIAA 3MK6A 1DKGD 1HNIA 1Z05A 2RF2A 1OH8A 1S1XA 3CG7A 2WC9A 2E5LK 4JYAK 1BOTO 3OYKA 1NJIO 4FK4A 1W7AA 3LP3A 1P90A 4IG0A 4FK2A 5J2NA 3LDNA 1BU6O 5AJ3K 4DF4A 1T7PA 3OYFA 1Q18A 3BY5A 3H3NO 4WFBL 3HXMA 1QHAA 4PA1A 2Q97A 4B3OA 3QEVA 2DFFA 3L3VA 3DRRA 4M3RA 3NDKA 1BIZA 1OVQA 3V9ZA 3ZX0A 3THYA 2P5OA 1IH7A 2VWBA 4O55A 1FK9A 3RMBA 3QEPA 4DMNA 4BDPA 3KWIA 1ESVA 4YOXA 3LWMA 4JD2A 2F9TA 3S3MA 1VHXA 3HRGA 4OKEA 1QQMA 3UB5A 4BRGA 2IAJA 3ID6A 4OLAA 3DLBA 2Z1GA 1SL2A 3AVKA 3J80O 3HO1A 1QSLA 4DS5A 2VG6A 4HHTA 3KD1E 1VSLA 3K59A 4DFKA 1GLJO 3HPHA 3VMFB 2P9IB 4DR4K 3QO9A 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1EP4A 3C0BA 4YDUC 5EXWA 3AO4A 1XC9A 2KHOA 1YAGA 3IUCA 3ENBA 1SL0A 3BP8A 3OYJA 3LDSA 5KQDA 3OYAA 4IEIA 4ICLA 3P31A 5EU7A 3WXMB 2W42A 3ZT0A 2OPQA 2P9LB 3AV9A 3NE6A 3CETA 3CJCA 1X1PA 5AQFA 2KW4A 4F2SA 4C1NK 4DWIA 3SBGA 3SLCA 2HBLA 4O8KA 2D0BA 2YNIA 4CIEA 3PLAA 3G0ZA 2ZGZA 3FE1A 3L0QA 5AR0A 1BA0A 4CJQA 5AQSA 4NXMK 3AVNA 2B4JA 4KI4A 3AVGA 1LWEA 1VSIA 5C42A 1TL3A 1IBKK 3CC7N 3TTCA 1Z26A 5JVGL 4JS4A 4B1XB 2FBTA 1M1KO 2E88A 3DYAA 1IG9A 4B8CA 5C10A 1E4GT 2NZTA 4NLCA 2V52B 4KHQA 3PO4A 4YY3K 1XHXA 4E3SA 2UUBK 4FJ7A 3O4NA 3ENOA 4V19S 3W0LA 3O1BA 4CJUA 1IKXA 2HMPA 3R3LA 2OTLN 4FJIA 3EZ5A 3WXIA 3HK2A 3E9LA 3LM2A 3RR7A 4FJ9A 2KKZA 1VQ7N 1RDBA 4B1YB 5EOYA 2GBZA 1YJ9N 1RNHA 4DR5K 2FBYA 1TKXA 3GL1A 3R6MA 2YNFA 1H1VA 1WB9A 3RSEB 3EE8A 3VQ6A 3TWHA 1JL1A 3NF8A 4KHNA 1C1AA 3PY8A 1XNQK 3WNEA 4LF7K 1JLCA 4CEDA 3Q7CA 3BZCA 1LV5A 1YITN 3TABA 4E19A 1EQYA 3K0SA 1IKYA 1HYZA 3T7ZA 3KK1A 3VQPA 4FVUA 1WLJA 3FFKB 3O9SA 3C6TA 2E2OA 4GY2B 3M3ZA 2HNDA 4DLGA 5C0YA 5KGWA 4M3UA 2JLEA 3OYHA 1WUAA 3AVMA 4IFEA 3KLFA 5F0XA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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