2ZGZA

Parm with gmppnp
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Molecular structure of the ParM polymer and the mechanism leading to its nucleotide-driven dynamic instability
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Structural protein
molecule keywords Plasmid segregation protein parM
total genus 98
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA01
3W3DA 3ATVA 3AAQA 4PKIA 4I6MB 1V4SA 3A8YA 3FR0A 4CZLA 3DXKB 2IVOA 1S3XA 1WUAA 4BG8A 2VCPA 4MO4A 2QM1A 2QWLA 5AQKA 2I7PA 3SLCA 1XC3A 4I6MA 1BWFO 3HBTA 3WEEA 4QS8A 2F9TA 4BGAA 3CJAA 3WUHA 4DQ8A 1GLCG 5KPZA 3CIPA 1NGGA 2CGKA 4BRNA 3J8AA 4B1ZA 1BDGA 3VF6A 5F2RA 5KPTA 1NGEA 3M3ZA 2P9IB 5AQXA 4WQ4C 4CZEA 1GLJO 4FO0A 4FWOA 3UKRA 4B1VA 4JHDB 5BRFA 4RWTA 3A0IX 3DJCA 1HLUA 5AQNA 1WOQA 3G25A 3O1WA 3H45C 3VOVA 1Q18A 5JLFA 3KZBA 3ZX0A 1NGJA 1ATSA 1HPMA 1J6ZA 1NM1A 2FXUA 4H5RA 3LDOA 2V52B 3FZFA 3LL3A 4BR9A 4M7YA 5EOYA 1RGIA 3GBTA 3KHYA 4MLHA 1NLVA 4BR5A 4DHYA 1NGHA 1R59O 1X9JA 2A42A 3P4IA 4MLEA 2CH6A 3U9ZA 3RSEA 2UYTA 2QW9A 1BO5O 3A5LC 3ENOA 2YCHA 4JAXA 3D2EA 1BG3A 1ESVA 4H5TA 2E1YA 1U2VB 2QWQA 3HM8A 4FOEA 3M1FA 4H5WA 1JCEA 1HKBA 4B9QA 4H5NA 4CZMA 3L6QA 2D0OA 1K8KA 3UKRB 4XEIA 4E1JA 4M63C 4LC9B 4PKGA 3MDQA 2P9IA 3FFKB 5EXWA 2FSKA 2IIRA 4QS7A 3I8BA 1RFQA 3LDPA 4C23A 1ZXOA 1S22A 2E2NA 4H0XB 1D4XA 3ID8A 5LY3A 1E4GT 3VETA 5FPEA 4XH5A 5AQWA 3WEEB 4CBUA 3FZHA 2E1ZA 3IDHA 5AQRA 4BRKA 1LCUA 4ISFA 2J4RA 5ADXA 2EWSA 4O5FA 3CJ1A 3IUCA 5FPNA 2E88A 3KVGA 5FPMA 4IWVA 3DXMB 3ULEB 2DPNA 5BN8A 4EFHA 2WUSA 1H1VA 1MA9B 3LDLA 2YJFA 3U8XA 2E2PA 5AQVA 4BGBA 3ZETB 1T6CA 4CZIA 4QS9A 2YI1A 4FPBA 4CD1A 2A40A 4BRDA 4H0YB 1C0GA 2ASMA 5AQQA 3OHRA 3SK3A 3IFRA 3JS6A 4EHTA 2GUPA 2NZTA 4BRCA 1QZ6A 4BVOA 5FPDA 2V7ZA 2NLXA 4AM7A 3ZX2A 2FF6A 5AZJB 2YHXA 1HUXA 5EX5A 4FWNA 1X3MA 1DKGD 2P9NB 4CZJA 2VWBA 3VENA 5ADXH 1MDUB 2GWJA 2IVNA 3W0LA 2ASPA 3C7NA 2W40A 2ASOA 4H0VB 4B1YB 4DB3A 1BOTO 1KXPA 3DAWA 4IZ9A 3VESA 1U2VA 4HWIA 2QWOA 4FOIA 3H46O 2P9SB 4BRLA 3L0QA 3D7EO 1IG8A 1G99A 2AP1A 1HKGA 2P9PA 1NBWA 3VGKA 3H1QA 3A5MC 3MN6A 2ZGZA 5EVZA 2A6AA 4F9OA 3FZKA 2V7YA 4ISEA 3WQTA 3QICA 1GLEG 2Q0RA 2QWMA 5AQGA 4H03B 4PL7A 4WQ5A 2A3ZA 3EO3A 4BVPA 4A62A 1QQOA 5F1XA 1TUYA 2HOEA 1V4TA 5BPLA 4BR7A 1GLFO 2NRHA 3GDQA 3GE1A 3BF1A 4BRQA 4BREA 1NGAA 5KQDA 3SMSA 4JHDA 4BRAA 4CZHA 5AQJA 3BF3A 4JNEA 3TPQA 4BRFA 4BRGA 4JD2A 5AZJA 3A5OC 4A61A 3GG4A 2P9KA 2Q36A 3ZEUB 3AY9A 2FSJA 4A2BA 3CQXA 5AQFA 1GLDG 4FPAA 5CE3A 5JMVA 3EL2A 4HTLA 3VGMA 4GY2B 2W41A 3VERA 5BPNA 3CJ9A 1DGKN 5BN9A 4K25A 1NWKA 2Q31A 1C0FA 4H0OA 5AR0A 1XQSC 3JXUA 4FL9A 3WXKA 3O08A 1JCGA 5AQOA 3BEXA 4Z94A 1KAYA 3DXKA 3QFPA 4YDUA 3VEVA 5AFUA 3L4IA 4IJNA 5AFUH 3IMXA 2V51B 3HSCA 2OANA 4RTFD 4CD3A 1NGDA 2F9WA 3FZLA 3AARA 4BC2A 1HKCA 1BUPA 5B8HA 2CH5A 1NGFA 4PL8A 5BR9A 1GLBG 2E8AA 3ATUA 2P9LA 3SJHA 1HJOA 1KAZA 1CZAN 2BUPA 2FLOA 3WQUA 3ZEUA 3RSEB 4JD2B 4NB4A 1P8ZA 3LDQA 3H3OB 4FWSA 5JICA 5KQ8A 4A2AA 3BP8A 4XH4A 4CBWA 1MWMA 4XH1A 3MN9A 2ITMA 1Y64A 3FLCO 3VEWA 3QBWA 1QQNA 1NMDA 3O80A 2E20A 5BREA 5LJWA 3QBXA 4CZGA 3EKSA 3F9MA 2Q97A 1E4FT 1XUPO 1TUUA 3VEXA 2Q1NA 2HF3A 3QB0A 2A41A 4WQ5C 3O1BA 4CZFA 1YVNA 4FWPA 2YJEA 3QMLA 3CJBA 3EKUA 2YHYA 1QHAA 3MK6A 4M7XA 3WXIA 5AQYA 4K42A 3CHWA 3VEYA 2GELA 3ENHA 3CI5A 5E26A 5AQZA 2CGJA 4BQZA 1KAXA 1ZC6A 4CBXA 1EQYA 4H5VA 3UKUB 2FSNA 1TYQB 2QXLA 4L3QA 3CETA 1T6DA 3CQYA 2A5XA 3D2EB 4EAHD 3C7NB 1LOTB 3WT0A 3VEOA 1YXQA 4GNIA 4AM6A 5JLHA 3A5NC 3MCPA 3BUZB 3WXJA 3LM9A 1X3NA 1IJJA 4BROA 4RCHA 3VEZA 3UB5A 2ZF5O 4FWMA 2QWNA 2ZWHA 2Q2RA 3B8AX 3CJCA 3MMVA 1U6ZA 4BC3A 5TKYA 1NGBA 1RDWX 1SAZA 4J8FA 2CGLA 4FWRA 5BRHA 1GLAG 3MN7A 4B1UB 5KPRA 5AQMA 3MN5A 3LM2A 1MWKA 3FE1A 2GTDA 4FWLA 5EY4A 3FGUA 3O5BA 2BTFA 3M6GA 1T44A 1BA0A 2P9NA 1HX1A 4BC4A 1BU6O 2QWRA 3ULEA 1DEJA 3DXMA 3LDNA 3R8EA 3HI0A 2QWPA 3QFUA 4CI6A 1ATRA 2E2QA 2GEMA 2HMPA 4WYBA 4EIAA 3U9DA 5AQSA 2PAVA 5AQHA 3D2FB 3HTVA 4H0TB 1SQKA 5AQIA 2P9UB 4BG9A 4B1WB 1SZ2A 1NGCA 4FWKA 4PKHA 4BC5A 3VF4A 2P9KB 5AZIA 1BA1A 4FWQA 3DWLA 2PBDA 4BRIA 3WXLA 1YUWA 3TU5A 5AQPA 4O8KA 3S41A 3FZMA 3O6WA 5BPMA 1NGIA 3SMPA 5AQTA 3VF2A 1K8KB 2I7NA 3EZWA 4CZKA 3EN9A 4BR2A 4BRMA 2D1KA 4YDUC 3HZ6A 3QDKA 5AQUA 1OKJA 2P9SA 5ELZA 1TYQA 1YAGA 3CERA 4CJ7A 1JCFA 4WQ4A 4B1XB 1Z05A 4ISGA 5BRDA 3U4LA 1ZBSA 2YHWA 3GOIA 4BRPA 5AQLA 3I33A 3AAPA 3H3NO 2P9PB 4KBOA 3UE5A 2Q0UA 4JN4A 4K43A 3VPZA 4FSVA 4IJAA 4K41A 5E84A 5AZIB 1QQMA 2D0PA 2H3GX 2KHOA 2IVPA 2P9LB 4H0PA 1GLLO 3VGLA 3ZX3A 3UKUA 4EHUA 2P9UA 4IXCA 4Y0WA 2VYPA 4NO7A 2FF3B 4BR0A 3R6MA 3R9PA 1ATNA 3O8MA 4BR4A 5F0XA 4IO8A 3ZETA 2D4WA 2HF4A 2E2OA 3H1VX 1QZ5A 5LJVA 2AA4A 3GL1A 3O4WA 5I9EB 1Z6RA 3H6EA 4DCHA 4BRHA 4BQLA 3C0BA 4MO5A 3D2FA 3CJ7A 2ZGYA 2GWKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PY5A 4PKIA 4KH5A 4DTRA 3OYFA 1ZBHA 4FLTA 1B92A 1Z26A 2XRIA 1Y97A 3LWMA 3AVKA 3WNGA 4DF4A 3AO3A 4KHQA 3DXKB 4OLBA 1CZ9A 4RW7A 4BG8A 3BGRA 2YKNA 3MEGA 2Z1JA 3HP9A 3NGIA 4FVUA 3WNFA 4BGAA 4HCBA 2OZMA 4KAZA 3DLLL 2VQFK 3AVBA 2O8EA 4LFCK 3NFAA 1IV0A 2F7TA 4CJ5A 5HBMA 4CZEA 3EE9A 1EWRA 1HRHA 3UKRA 2IC3A 1K8AO 3ZSZA 3DJCA 1HLUA 3G25A 1S1UA 3O1WA 3QIPA 3BZCA 3S9HA 4DTMA 4CEQA 3NAEA 2VGMA 4DV6K 3THWB 1FW6A 3ZX0A 3PSIA 1NGJA 4BDPA 1ATSA 2PYLA 4IOAL 4CVNE 1NM1A 3OYJA 2V52B 3LL3A 4BR9A 4FJ8A 3CCSN 4DR4K 1RGIA 5MLCQ 4DU1A 1J54A 3OA9A 3VQ5A 4MLEA 2CH6A 3RWUA 1CZBA 1O1WA 3V1QA 3G4SN 4DTSA 2G8UA 3EYZA 2YCHA 4NCGA 2WC9A 4KHPK 3ZT4A 4KREA 3RMAA 4EP4A 3CD6N 3AO2A 3M1FA 4A5BA 2KZMA 4H5NA 3C6AA 3QEXA 3L6QA 5J2PA 3SQ0A 2DFEA 4DV7K 4LC9B 3OW2M 2IIRA 3I8BA 1RFQA 3L3VA 5SZTA 2E2NA 3K5OA 2G8WA 1SKSA 1YJ9N 1RDBA 4YOVA 2F8TA 1S1VA 4H0XB 3OBWA 4CEFA 3PX0A 3VETA 1N6QA 4XH5A 2QKKA 4DFPA 3O3FA 3VN5A 4O44A 1SL0A 4O5FA 4AH9A 2HW3A 1IH7A 3DI6A 5FPMA 1UAXA 3DXMB 4N47A 4I9QA 4GVMA 5BN8A 4R5PA 2WUSA 1H1VA 3HVRA 1VQNN 3U8XA 3HOTA 3V9SA 4KTWA 4X62K 4CHPA 5AQVA 4CZIA 3DM2A 1X1PA 1J9AA 1SKRA 4KHUA 4CJKA 4LF4K 3TI0A 1GOCA 4LF6K 3K9KA 3CFOA 2VQEK 3LALA 3JS6A 4EHTA 2GUPA 1X9MA 1QZ6A 3HM9A 3U3YA 2QI2A 3AA4A 4BVOA 4JKCA 3OS1A 3OYAA 4YOXA 4K8ZA 5GADP 3ZX2A 2YNIA 5AZJB 3L3UA 1VQ9N 1HUXA 2WOMA 1T03A 2VWBA 1D9DA 5KI6A 3J7YP 5J2QA 1KC8O 3M8SA 3SBTA 2ASOA 1KXPA 4QOZB 3VESA 1KD1O 4HWIA 3G0ZA 3KD1E 4FOIA 1TL3A 2YNFA 4UQGA 4JLHA 3H46O 4QAGA 1GOBA 1WSGA 5J2NA 4GVEA 4ILJA 2AP1A 3SZ2A 1L3SA 3E1YA 3CCJN 4C8OA 4DFJA 3H1QA 3MN6A 3LP0A 3AVLA 5EVZA 3MXMA 4JKBA 3NF9A 4ISEA 4O5BA 2BGGA 3NGYA 4H03B 2A3ZA 4ID5A 3EO3A 4BVPA 1QQOA 3UIQA 1TUYA 3OYKA 4DTUA 3G10A 3SMSA 5GINA 1VQ7N 3AA2A 2IGIA 2O8CA 3LDSA 3O9SA 1VSFA 4JNEA 4BRFA 4CIEA 2NRVA 5AZJA 3A5OC 4YNQA 2ETJA 2FBTA 1NKBA 4FK2A 3L2VA 5AQFA 4FPAA 3HT3A 1VQ8N 1BQNA 5FROA 5HRRA 2HHTA 2B5JA 4K25A 5C15A 3ISNC 1JCGA 1YJWN 1KAYA 3QNNA 4JI8K 3DXKA 1VRTA 3CCUN 1NK9A 3QFPA 5AFUA 4F3TA 3B6OA 4FM1A 4DKWA 4RTFD 1Q7YO 4JYAK 3RRHA 3ULDA 4BC2A 4BE2A 2RPIA 1RTDA 2FBYA 4OKEA 4PL8A 3CPEA 5HRSA 3V9ZA 3ATUA 4BDYA 1U4BA 4WFNL 2QK9A 1CZAN 1S6PA 2RE2A 3HPGA 4JD2B 3LDQA 4A2AA 2G8IA 4CBWA 1RNHA 3CCLN 4GW6A 3FLCO 4DS4A 3SPYA 2D5RA 4EZ6A 3HP6A 1TK8A 4B3TK 1YT3A 1UA1A 4CHQA 2HF3A 4WFBL 3ZT1A 1YHQN 4CZFA 4X65K 2YJEA 4LH4A 3TWHA 1TAQA 1WSHA 3WXIA 1Q81O 4YORA 3AGKA 2ZJPL 4DTPA 3QEVA 3LPUA 3CI5A 1LWCA 1WLJA 4FLZA 4CBXA 3UKUB 2FSNA 4E89A 5JVGL 3DOKA 4YOTA 4GNIA 3VQ8A 4FVMA 3QLHA 4CJWA 4BROA 2ZWHA 4BWMA 1NK5A 2Q2RA 4C8NA 1QHTA 1FJGK 2O8FB 3MMVA 2KFZA 3QO9A 1U6ZA 5HLFA 4F8RA 4E7HA 5I42A 1RDWX 3KTQA 4J8FA 1GLAG 3ASMA 3CCMN 1QS4A 4G1QA 5AQMA 5GAGP 2GTDA 1TKZA 2O8FA 3O5BA 2BTFA 4TSXA 3CXCM 5M1QA 4LF5K 3SUQA 3TAQA 3K5LA 1JLEA 5GAEP 3HI0A 2Y1IA 3QFUA 2GEMA 4FJGA 4CESA 3VQPA 1U49A 5D3GA 5AQSA 5M1KA 4H0TB 4ILHA 3IRXA 1ZBFA 3ZLJA 2ZE2A 2QA4N 4FZZA 4EP5A 4B9UA 3NF6A 3DWLA 3WXLA 1BL3A 4X64K 3HXMA 1Q86O 4IBNA 1K8KB 2I7NA 4BRMA 2D1KA 2P9SA 4C8MA 4JRQA 4K8XA 2E6LA 1YAGA 3ID6A 2Q3SA 2NNWA 3DLEA 3TANA 4KHYA 1HYZA 4DV2K 4I7FA 2X74A 4BRPA 5DK5A 2P5OA 2HMIA 3I33A 4O4GA 1TKXA 3CC7N 2PFUA 4K43A 1NKCA 4E7IA 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4FOEA 3HK2A 1JCEA 1HKBA 3LAKA 3L2WA 4KPYA 1NK4A 4IOXA 5SWMA 1RBUA 4M63C 4B3RK 4QS7A 3J7ZO 2F96A 5JS1A 4JKFA 3OJUA 1JXEA 3OYCA 4DR3K 5AQWA 4CBUA 3FZHA 2E1ZA 3IDHA 3CC2N 5CYQA 3AVCA 2QTDA 4CJQA 3RR7A 5ADXA 3IUCA 3TABA 5LMNK 3ITHA 1K6YA 3PIPL 3VQAA 4FJJA 5HP1A 4BGBA 3ZETB 2RHKA 4CD1A 4FPBA 1U45A 3QETA 3P39A 4BRDA 4BE0A 3HVTA 4Y1CA 4C8LA 3BDPA 4DSEA 3IFRA 4BY9C 2NZTA 4CFDA 2O8BA 4KV8A 2YHXA 5EX5A 4KB1A 4CZJA 3VENA 5ADXH 4DSJA 1MDUB 1TKTA 3O9UA 4JI6K 2ASPA 3NVKA 4H0VB 4B1YB 2OCEA 1YITN 1BOTO 4CEDA 3DAWA 4KO0A 1LAWA 1XI1A 2HSTA 1WN7A 2WBNA 3THWA 2X6NA 2P9SB 5CR4A 1IG8A 3ENBA 2NRXA 3ZSVA 4FJMA 4AF1A 1HKGA 2P9PA 4AHTA 4U7BA 1NBWA 3VGKA 3F2KA 4HUEA 3NGZA 4Z4GA 3KD5E 1GLEG 2HB5A 1J5OA 4KH6A 1I39A 2XY5A 4PL7A 4WQ5A 2KZZA 2BDPA 4A62A 2ATQA 3P5JA 2D0CA 1V4TA 5BPLA 4BR7A 3GDQA 3GE1A 3I0RA 2UXDK 3BF1A 2QEXN 3MEDA 2DY4A 5KQDA 4FLXA 4CEEA 3TAMA 4CZHA 4KHNA 3G6EN 3BF3A 2ZQBA 1YTUA 3MWTA 3KKSA 3ZSQA 3EE8A 4JD2A 1ASWA 2E4LA 3RMCA 3GG4A 4B3OA 4PHTX 1C1AA 2FSJA 3TAPA 2EX3A 3VA0A 5JMVA 2EHGA 3E01A 4HTLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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