2ZGZA

Parm with gmppnp
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Plasmid segregation protein parM
publication title Molecular structure of the ParM polymer and the mechanism leading to its nucleotide-driven dynamic instability
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Structural protein
total genus 98
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA01
2F9TA 4ISFA 4XH5A 5AZIA 3B8AX 5AZIB 3LDOA 4FSVA 4BGBA 3WEEA 3WEEB 4O8KA 3MK6A 2P9LB 1U2VB 3A5MC 1HX1A 4GNIA 3M3ZA 4CI6A 1ATSA 4PKIA 1J6ZA 3WQUA 3MDQA 4XEIA 3ZX0A 3D2FB 5AQKA 4CD3A 5JMVA 3L0QA 2YHYA 2A3ZA 2QWRA 3O1BA 4I6MA 4I6MB 3WXJA 4AM6A 2E2OA 1D4XA 3MN9A 4B1ZA 1NGAA 1S22A 4J8FA 2BTFA 2KHOA 4H0PA 4BRDA 2P9IA 1WUAA 2P9IB 3VEOA 4CZLA 5JLHA 3HZ6A 4CZIA 4XH4A 4CZMA 2J4RA 1HPMA 4CZHA 2HF3A 4FPAA 4IO8A 4O5FA 4EFHA 4BC3A 3CHWA 2P9NA 5FPMA 3BF3A 1WOQA 2A5XA 2FSNA 2PBDA 2IVPA 3AY9A 4BRPA 3GL1A 1GLCG 3I8BA 3SLCA 5KPTA 2P9SB 3FZFA 2CH5A 5AQSA 2A6AA 1RGIA 3OHRA 2Q0UA 3W3DA 4BRGA 3WXIA 3P4IA 1EQYA 3CJCA 4BRFA 2IVNA 2YHXA 3D2EB 3D2EA 5E26A 1NWKA 4IJNA 3MCPA 4B1WB 2FLOA 2W40A 4JN4A 3D7EO 4KBOA 4Y0WA 1CZAN 2GUPA 3ATUA 4B1YB 3HBTA 4MO5A 4B1XB 5BPMA 4EIAA 2IVOA 1Z6RA 2HF4A 3UKUB 3UKUA 3VPZA 3ATVA 1RDWX 4H0TB 3QDKA 5AQUA 3U8XA 3MMVA 1ATRA 2D0PA 1P8ZA 4BREA 1TUYA 2QWQA 2YI1A 1K8KA 3GE1A 4QS7A 3UKRB 3UKRA 1GLEG 5CE3A 2GWKA 4BVPA 4BR7A 1SAZA 1NGFA 2YCHA 3CJBA 5AQYA 2CGJA 2NZTA 3JS6A 2EWSA 4H03B 4JNEA 5AQMA 3LDNA 4DHYA 3A8YA 3A0IX 3IUCA 5B8HA 2Q0RA 2H3GX 1NGDA 3H3NO 5KPRA 1GLDG 4WQ5C 3SJHA 1KAYA 1Q18A 5AQPA 1NLVA 2D1KA 4H5WA 4JAXA 5AQIA 2E1YA 3BP8A 3AAPA 4PL7A 4NO7A 2D4WA 3CQYA 3VF4A 4H5TA 2Q2RA 4BC5A 4FPBA 1NGGA 3GOIA 1GLLO 5F2RA 5BPLA 2V52B 4YDUC 1HKGA 4K42A 3ZETB 3ID8A 4QS9A 2QWMA 4E1JA 4H0YB 3JXUA 2Q31A 3VEXA 5BREA 1BUPA 2WUSA 1NMDA 2CGLA 2HOEA 1ZXOA 5AQJA 5AQHA 2QXLA 3LM2A 1QQMA 4H5RA 1IJJA 1E4GT 1C0FA 1OKJA 4FWKA 2OANA 3LM9A 1QQNA 4FL9A 4DB3A 5BRFA 2ASPA 3QICA 3FZMA 1GLAG 3U9DA 1BWFO 5LY3A 1NGIA 1QQOA 1BOTO 4PKHA 3U4LA 3M1FA 4FWLA 5AQQA 3O08A 5KPZA 2YJFA 1Y64A 4M63C 5F1XA 1TYQA 4CJ7A 3BEXA 2CGKA 2Q97A 3KHYA 2QWOA 1DGKN 1GLJO 2P9NB 3CQXA 3O5BA 5BPNA 5AQZA 2GTDA 1MWKA 1SZ2A 4Z94A 1R59O 2BUPA 2AA4A 4CZJA 3H1VX 2VCPA 2IIRA 4WYBA 5FPNA 2V7ZA 3GBTA 1KAZA 4EAHD 1YAGA 4FWQA 4K25A 4BR0A 1KAXA 5ELZA 2E2NA 5I9EB 1XUPO 2FSKA 3EL2A 1MA9B 3VF2A 4FWNA 1KXPA 3CERA 3ZEUA 2ZGZA 5EOYA 5BR9A 4BC2A 1NBWA 3EKSA 1BG3A 3DXMA 4BG9A 2E20A 1BU6O 5AQTA 3O8MA 4BRAA 1NGBA 1YVNA 1V4TA 3H45C 2Q36A 2ASOA 3O1WA 4WQ5A 3GG4A 1X3MA 1K8KB 4A61A 3QFPA 5LJWA 3SMSA 3O4WA 3SK3A 3VEZA 2HMPA 3VEYA 3EO3A 5AQWA 3FZLA 1QZ5A 3R9PA 1QZ6A 3L6QA 4IJAA 4BRLA 4BVOA 4K41A 5JLFA 1XC3A 2PAVA 3H46O 4BQLA 3M6GA 1X3NA 4IWVA 2NLXA 1QHAA 5BN8A 4FWOA 3FE1A 3WQTA 4BRMA 2V51B 1SQKA 4ISGA 5AQXA 3EN9A 2E8AA 4YDUA 4A2BA 1E4FT 3RSEA 3KVGA 3IMXA 3C7NA 4ISEA 1HKBA 4CBXA 3VF6A 3A5OC 4H0OA 3CJ7A 3FFKB 3HSCA 1S3XA 2E2QA 2YJEA 4GY2B 4RWTA 4WQ4C 2P9UA 2P9UB 5AQLA 5AQRA 3QB0A 1BDGA 5FPEA 2I7PA 2QWPA 4FWMA 3CIPA 1BO5O 1HJOA 4CZFA 2QM1A 3WT0A 2ASMA 2ITMA 3VGKA 2UYTA 4H5NA 5JICA 3IDHA 4PL8A 1BA0A 4CZKA 3HTVA 4F9OA 1BA1A 5TKYA 5BN9A 4CZEA 1GLFO 1LCUA 3FZHA 5AQNA 5AFUA 1NGEA 3H3OB 2QWNA 1G99A 2VWBA 4BC4A 3VEWA 1ZBSA 1H1VA 3ZX3A 3W0LA 4QS8A 2FF3B 3J8AA 1ATNA 3CJ1A 2FXUA 2QW9A 3QFUA 2D0OA 4JHDA 3QMLA 4L3QA 5EX5A 1C0GA 1MWMA 1T6CA 2CH6A 1HKCA 4BRQA 5FPDA 3R8EA 3ENOA 4FOEA 3LDPA 1DKGD 2P9LA 1U2VA 4BR2A 3MN5A 4AM7A 4C23A 3VESA 4BR4A 3TPQA 3AARA 5LJVA 3CI5A 4M7XA 4FO0A 1U6ZA 1TYQB 3CETA 3D2FA 3G25A 4DCHA 1NGHA 5ADXH 4JD2A 3HI0A 4JD2B 3A5LC 4H0VB 1X9JA 2GELA 3DXKA 3DXKB 5AZJA 5AZJB 4MLHA 4K43A 3QBWA 4BR9A 1NGJA 3VOVA 1T6DA 3LDLA 3WXKA 3UE5A 4HTLA 4IZ9A 1RFQA 3FGUA 4H0XB 5AR0A 4B9QA 3BUZB 2GWJA 1T44A 4A62A 4EHTA 1TUUA 4PKGA 2P9PA 2P9PB 2Q1NA 2W41A 3O80A 3LDQA 3VERA 4BRCA 3F9MA 4CBWA 3CJ9A 4BGAA 3LL3A 3FR0A 3ZEUB 4BRNA 2P9SA 5BRDA 2E2PA 3FZKA 2FF6A 3DXMB 3C0BA 2QWLA 4H5VA 3MN6A 3HM8A 4FWRA 1ESVA 4BROA 1HLUA 3SMPA 3A5NC 4BQZA 1NGCA 1JCFA 2A41A 5KQDA 5BRHA 3BF1A 4BR5A 5AFUH 1YUWA 2FSJA 3H1QA 3VETA 4B1VA 5ADXA 4FWPA 1GLBG 2YHWA 3TU5A 3MN7A 1JCEA 3O6WA 4IXCA 4WQ4A 3VEVA 2F9WA 3EKUA 3WXLA 1HUXA 3H6EA 5AQOA 4MLEA 4B1UB 4HWIA 3VENA 2E1ZA 2I7NA 1IG8A 4FWSA 3I33A 2A42A 5E84A 2ZWHA 1LOTB 3RSEB 3C7NB 2DPNA 5AQGA 2P9KA 2P9KB 1XQSC 1YXQA 3DWLA 1ZC6A 4XH1A 4RTFD 3FLCO 3ULEA 3ULEB 2ZF5O 5AQFA 3CJAA 2E88A 4BG8A 4CBUA 4A2AA 2GEMA 4NB4A 2ZGYA 3R6MA 2A40A 4LC9B 3WUHA 4BRIA 4M7YA 4BRKA 3GDQA 3DAWA 1V4SA 1DEJA 4DQ8A 3L4IA 2NRHA 3VGLA 3KZBA 3U9ZA 1MDUB 3UB5A 5KQ8A 2V7YA 2AP1A 4RCHA 5EXWA 3DJCA 4BRHA 1NM1A 3QBXA 4FOIA 5AQVA 1Z05A 2VYPA 4CZGA 3AAQA 3ENHA 3ZX2A 4CD1A 4MO4A 5F0XA 5EVZA 3IFRA 3ZETA 4EHUA 5EY4A 4JHDB 3S41A 3VGMA 1JCGA 3EZWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4XH5A 3NBPA 5AZIB 4OVLA 4O8KA 4X66K 3SQ2A 5JVGL 4GNIA 2OPPA 1WN7A 3WNHA 2UXCK 2IGIA 3O4QA 4PKIA 1HRHA 4JKDA 5KGWA 4M3TA 4I6MB 2E2OA 4IOXA 3G4SN 3OBYA 1J9AA 1S22A 4H0PA 4YOUA 4CIGA 4B3OA 5LL6Z 1YHQN 2J4RA 1RT7A 3A2FA 1KLMA 2HF3A 4FPAA 4EFHA 1KRPA 4RG8A 3NF9A 4CJTA 5FPMA 2FSNA 4ZTFA 1GLCG 3I8BA 1VRTA 1KTQA 4E3SA 2CH5A 5AQSA 2PYLA 2O8FA 2P5GA 3OHRA 4BRGA 3WXIA 3P4IA 4H4OA 1NWKA 3L2WA 1VQ7N 4IJNA 4FJHA 3HL8A 3OVNA 4C8LA 4B1WB 3CPWM 4Z4IA 1C0TA 4OO1J 1JLCA 4Y0WA 1CZAN 3K2PA 1LV5A 2GUPA 5C0YA 4RW9A 2NRVA 5BPMA 4DQPA 4EIAA 2IVOA 1BL3A 3ALYA 1SL2A 3SPZA 4PQUA 1P8ZA 1FKPA 3AO2A 5CE3A 3HXMA 1NK5A 2VG5A 3G10A 4G9ZA 1VSHA 4CF1A 2IS3A 1X9SA 2E4LA 4J2EA 3JAMO 2WTUA 2P51A 4WF9L 4AHTA 2EWSA 4AHUA 2NRRA 4A59A 5FRMA 3IUCA 3P31A 3EE8A 1NJWA 3AVCA 3THYA 1GLDG 4WQ5C 1VQ8N 1CXQA 2EX3A 5AQPA 4CGDA 2D1KA 3NGYA 4IEEA 3AAPA 4FJMA 4JRQA 3R1XA 4K0KK 1VK0A 4Y1CA 3CQYA 4H5TA 3MXJA 1NGGA 1SL0A 3GOIA 4KH4A 1RBVA 4CESA 3AVAA 4W5OA 4O4GA 5BREA 1C1CA 4NXMK 5C12A 2VGMA 3AVKA 3NH0A 3SI6A 3LDSA 3SZ2A 1BCOA 1G15A 1VSEA 2FBVA 1CZBA 1C1BA 4B9TA 3LM9A 3T19A 4DR2K 5BRFA 2HHXA 1HJRA 4PHTX 1JLEA 1VQNN 4JKFA 1J54A 4CJPA 2YKNA 4DV6K 1XWLA 4FWLA 3ZSYA 4FYDA 1QQCA 2ZQBA 3C6AA 5I42A 5AQQA 1WNSA 2YJFA 1A5XA 1Y64A 4M63C 5F1XA 1J5EK 1TYQA 3SUOA 2CGKA 2Q97A 2LSNA 4HCCA 1GLJO 2P9NB 1RILA 4AHVA 1MWKA 1K9MO 2NRXA 1R59O 1A5VA 3J80O 4PA1A 3H1VX 3O4NA 2IIRA 3ZSOA 2V7ZA 3GBTA 2ITGA 1OH5A 4B3TK 1D9FA 1VSJA 5MLCQ 1YAGA 4FWQA 4AHCA 4OJRA 4BR0A 1KAXA 5KTQA 1NU0A 5A2QO 1MA9B 4DQQA 4CJFA 5IT9O 2R7YA 1FJGK 3FFIA 1VQLN 1IKXA 1RDCA 3QINA 5M1PA 3OY9A 5EOYA 3HJFA 3DXMA 4F3OA 3VQ4A 4BG9A 3M8SA 5AQTA 3O8MA 4BRAA 1ASWA 4MDBA 1NGBA 1RCHA 3D0PA 1YVNA 1DLOA 2B6AA 4CGHA 2ASOA 3O1WA 3ZT2A 4M41A 4A61A 2VQFK 3IAYA 1QSSA 4ILHA 2OZSA 4NCBA 3VEZA 3EO3A 1XHZA 3FZLA 3R9PA 3C6UA 1DTTA 3ZT1A 4CEOA 1F21A 3SAHA 1N36K 3LPUA 2PAVA 3H46O 4CCHA 4AQYK 4F2SA 4IWVA 1HNZK 1BHLA 4B3MK 5HRNA 4BRMA 3FE1A 2V51B 4CJVA 1SQKA 4GVEA 3EN9A 1NJXA 4DUYK 2KZMA 3F5TA 5HL7L 4FJ9A 3LANA 4H0OA 1VQMN 3NAEA 3L2VA 3HSCA 3RWUA 5HOOA 4B9SA 2E2QA 4RWTA 4WQ4C 3AO3A 5AQLA 2X78A 3AVHA 5AQRA 3MX5A 4FJ5A 2QWPA 1BO5O 3NMUA 4AILC 1UOCA 3LALA 1BA0A 1KQSM 4CEEA 5TKYA 4CZEA 3O9QA 2KFNA 4IFVA 5AQNA 3TAEA 2Q3SA 4OPHA 1G99A 4MQ3A 3VEWA 3ULDA 1H1VA 1I94K 1FW6A 4HUFA 1S1VA 1S1TA 3QFUA 4JHDA 3QMLA 5JS1A 5EX5A 4J2BA 1T6CA 5M1FA 2HNDA 3DLRA 1NOYA 4L8RB 4DG1A 2P9LA 4Z0UA 1SUQA 3VESA 2O8CA 1XNRK 3TPQA 4KB1A 3VQAA 3E9LA 4IKFA 3P38A 3CI5A 1L3SA 3RMCA 1LWEA 1U6ZA 2F8SA 1WSIA 1NGHA 1MU2A 2OA8A 4BACA 4E7LA 4FJ8A 3PIOL 1BI4A 1IKWA 2GBZA 3WXKA 3VOVA 2DTUA 4V19S 4KTZA 2KZZA 3UE5A 1RDUA 4HTLA 4DTXA 4IZ9A 1RFQA 3FGUA 2HVHA 5DK5A 5AR0A 4R79A 3AVLA 4LF4K 4BE2A 2YNGA 1TUUA 1BGXT 3SBGA 2P9PA 2FC0A 1E3MA 3VERA 3TTDA 3LDQA 4CHNA 3S3NA 1N32K 4BRCA 3CJ9A 3RR7A 3SCXA 3OYAA 2QTDA 2ETJA 2FF6A 3HK2A 4LF5K 4CGFA 4H5VA 3V4IA 1U49A 1N33K 4FWRA 1HLUA 3A5NC 5KQDA 3V9ZA 1NOZA 4N47A 4BR5A 1KD1O 1RBTA 4B1VA 4NXNK 1SL1A 3HVTA 4LF7K 4IXCA 2YKMA 3CCMN 4DR6K 3EKUA 1HNVA 4B1UB 2I7NA 2HHSA 2A42A 5E84A 4IDKA 4CF0A 3VQBA 4CHPA 3WNFA 2OPRA 5AQGA 2P9KB 3RR8A 3QETA 1T8EA 1ZC6A 2DY4A 1HQUA 4XH1A 4CE9A 2Z1GA 3ULEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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