2ZGZA

Parm with gmppnp
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
b'MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Plasmid segregation protein parM
publication title Molecular structure of the ParM polymer and the mechanism leading to its nucleotide-driven dynamic instability
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Structural protein
total genus 98
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA01
2FF3B 3HSCA 4ISEA 5AQHA 4AM7A 3EO3A 4BR7A 4L3QA 1U2VA 1GLEG 5AFUA 4BC3A 2GUPA 4BC2A 1E4FT 2CH6A 2P9UA 1P8ZA 4CJ7A 3ZX3A 3IUCA 3D2EB 1D4XA 2A5XA 2FLOA 2PAVA 2FSKA 3WT0A 3ZEUB 3MMVA 3A0IX 2GELA 3D2FA 4M7XA 3H46O 3CJAA 3KZBA 2GWKA 4H0XB 5BREA 3I8BA 3FLCO 1BOTO 2HMPA 3R8EA 1TYQB 2I7NA 3VF2A 5AZIA 3VETA 4BRPA 5JLHA 1NGJA 1IG8A 4J8FA 2AP1A 4IJAA 4BRNA 1DEJA 5AQGA 5F0XA 4O5FA 1HPMA 4BRQA 3ZX2A 3J8AA 4YDUA 3QBXA 5B8HA 2E1YA 5FPMA 1XC3A 3L6QA 4FWKA 2E1ZA 4KBOA 4CZKA 3KVGA 4FOIA 3WXLA 3OHRA 1ATRA 3HM8A 4FPAA 5KPZA 5ADXH 1R59O 1ATNA 2CGJA 5AQWA 1Z05A 1BA0A 3BF1A 3P4IA 5AQYA 3TPQA 3MCPA 3DJCA 3ATUA 2Q0RA 5KPRA 1C0GA 3AAQA 2A40A 2QWQA 1J6ZA 4Y0WA 5AQSA 4BRIA 2ZGYA 3UKUA 1ESVA 4BR5A 3VPZA 2W41A 2FSNA 5AFUH 3TU5A 4BR0A 1Z6RA 3DXMA 4FL9A 2V7YA 3A8YA 3R6MA 3CI5A 3O4WA 4PL8A 3O8MA 3VGMA 5AQNA 5I9EB 2E2NA 1GLFO 4K43A 5BR9A 4WQ4C 4CZIA 3CIPA 4QS9A 4HTLA 5LJWA 1EQYA 2FSJA 3GL1A 4H03B 3UB5A 3UE5A 3VOVA 5BRHA 2I7PA 2NLXA 2CGLA 2W40A 1QQNA 1SAZA 3GOIA 1U2VB 2A6AA 2NZTA 1MWKA 3BP8A 3LDPA 5E26A 4MLHA 4FPBA 5FPEA 3SLCA 1OKJA 1K8KA 1BDGA 3HBTA 3CERA 3U4LA 2HF4A 4RWTA 2QWOA 5KQ8A 3D2FB 4WYBA 4BRFA 1JCGA 1MDUB 1XQSC 4RCHA 1MWMA 3U9DA 1YVNA 1RDWX 4NB4A 4FWRA 4H0VB 2KHOA 1TUUA 5F2RA 4CZLA 1SZ2A 1GLDG 4XH1A 2H3GX 3H1VX 3M3ZA 5AZIB 5KQDA 2QWRA 2D1KA 3WXJA 3ID8A 3KHYA 4BRMA 3CQYA 5AQQA 3H3NO 4B1XB 3FR0A 1C0FA 2A3ZA 4FO0A 3WEEA 4JD2A 4MLEA 4BGBA 3H1QA 4FWSA 4EIAA 5BRDA 3H45C 2BUPA 3VEWA 4A61A 3LM9A 5BPLA 4H0YB 2VWBA 4CD1A 2YJFA 4DQ8A 4IWVA 4DHYA 2E2QA 2P9PA 4XH5A 2AA4A 2QWLA 1QQOA 5AQJA 3A5MC 3UKUB 4BRDA 4BROA 5AQTA 3CJBA 4PKGA 1H1VA 1X3NA 3VF4A 4JNEA 2A41A 3O5BA 4HWIA 4BRGA 1NLVA 1QHAA 3DXMB 3DXKA 3ENHA 1NGHA 4WQ5C 2IIRA 2Q1NA 2E20A 3FZMA 3VEZA 3SJHA 4B9QA 2CH5A 3MK6A 3R9PA 3CJ1A 3O1BA 2YHWA 3U8XA 2QXLA 5AQOA 2QWNA 3MN5A 4ISGA 3O6WA 4PKHA 5ELZA 2P9LA 3I33A 4BC4A 3FGUA 3JXUA 3VGKA 4IZ9A 4B1UB 3GG4A 4H5TA 4CZJA 4BREA 3ZX0A 3QBWA 4BVOA 4E1JA 1DGKN 3FZFA 4AM6A 3VEXA 1ZBSA 1K8KB 1LOTB 2YHYA 3WXKA 3LDLA 4GNIA 3FE1A 2Q97A 5F1XA 1YUWA 2E2OA 4CBUA 5AQMA 1T6CA 5BRFA 3VENA 4RTFD 3A5OC 4BR4A 4CI6A 2IVOA 2IVPA 4ISFA 4DB3A 1HX1A 3QB0A 4K42A 1WUAA 5EY4A 4BQZA 3CJ9A 3ZEUA 3ATVA 4BVPA 1HLUA 3ZETA 4M7YA 3HI0A 4O8KA 4WQ4A 2QWMA 2D0PA 3FZLA 4B1ZA 4DCHA 3UKRA 2E88A 1TYQA 3B8AX 1NM1A 4M63C 2DPNA 5JICA 4FWOA 1NMDA 2ZF5O 1HKCA 1QZ5A 3AARA 3GBTA 4JD2B 1G99A 3WEEB 4FWNA 1NBWA 2ASMA 2FF6A 4BC5A 2E2PA 1BUPA 2F9WA 3MN9A 2P9UB 4BR9A 1X3MA 4CD3A 4K41A 5KPTA 2Q31A 2Q36A 3JS6A 1JCFA 3QFPA 3MDQA 4H0OA 4FWQA 5AQRA 3CJ7A 4BRKA 4IJNA 4B1VA 2E8AA 2HF3A 3A5LC 1YXQA 5LY3A 1BG3A 5AQKA 3G25A 2P9SA 3O80A 3VEYA 1KAXA 4EHTA 1ATSA 3DXKB 4CBXA 3MN6A 3H6EA 3C7NA 3HZ6A 2P9IA 3EZWA 5BPNA 1T44A 3IFRA 3ULEA 3O1WA 3ENOA 3AAPA 3M1FA 2QM1A 4CBWA 2V52B 4CZMA 4JHDA 3IDHA 2P9LB 2QWPA 1GLCG 2BTFA 1XUPO 5AZJA 3EN9A 3DWLA 3AY9A 1BA1A 2P9NA 3VERA 5E84A 5EX5A 3A5NC 5AQUA 3RSEA 2YHXA 4NO7A 1RFQA 5AQPA 4BGAA 3LDOA 5EOYA 5AR0A 3EL2A 1QZ6A 3C0BA 4CZGA 2Q0UA 1LCUA 1SQKA 3VEVA 2GWJA 4EHUA 4H5RA 3WUHA 1GLBG 3FFKB 3D7EO 2WUSA 2VYPA 4WQ5A 3SMSA 4A2BA 3GE1A 1HJOA 1BO5O 1MA9B 3CETA 4H5WA 3FZHA 5BPMA 4IXCA 2YCHA 4CZFA 5EVZA 3ZETB 5LJVA 5AQLA 1V4TA 1NGDA 3GDQA 3WXIA 1KAZA 3QMLA 1KXPA 3CHWA 4MO5A 5FPNA 3UKRB 4FWMA 3SMPA 2IVNA 4JAXA 3EKSA 4BR2A 4I6MA 1RGIA 4BRHA 2P9KA 5CE3A 5BN8A 1NGAA 1QQMA 4A62A 3M6GA 4MO4A 5AQZA 1TUYA 1JCEA 3HTVA 1S22A 5FPDA 4YDUC 2HOEA 4FOEA 5EXWA 4PKIA 5JLFA 3W3DA 3VESA 4A2AA 1NWKA 2ZWHA 4BRAA 2ASPA 3QFUA 1BWFO 2GTDA 3U9ZA 3VEOA 1T6DA 2Q2RA 4LC9B 2V51B 3BEXA 2CGKA 3D2EA 1CZAN 3IMXA 3SK3A 2P9SB 4JN4A 4FWLA 4BG8A 4F9OA 3LDNA 1X9JA 4CZHA 1GLLO 4FWPA 2D4WA 3LM2A 4H5VA 1NGGA 3C7NB 1U6ZA 2PBDA 3WQUA 2D0OA 2QW9A 4CZEA 2A42A 2P9IB 2EWSA 5BN9A 1NGIA 3ULEB 1GLJO 4EAHD 1KAYA 3W0LA 3S41A 4QS8A 4GY2B 2NRHA 4JHDB 1GLAG 4C23A 5AQFA 4IO8A 3EKUA 5AZJB 1YAGA 4B1YB 4QS7A 4B1WB 2P9NB 1ZC6A 2YI1A 4EFHA 1IJJA 4XEIA 3RSEB 3H3OB 1WOQA 2ZGZA 3MN7A 2P9PB 2V7ZA 3L0QA 3BUZB 2F9TA 1DKGD 1HKGA 5AQVA 1S3XA 4K25A 2OANA 1NGFA 2YJEA 5AQXA 4H0TB 1NGEA 2VCPA 3FZKA 4BQLA 3LDQA 4BRCA 3VF6A 1NGBA 5AQIA 5JMVA 4BG9A 4PL7A 2ASOA 3CQXA 1BU6O 1V4SA 3VGLA 2ITMA 3L4IA 1Y64A 1NGCA 2J4RA 4H0PA 3LL3A 5ADXA 4XH4A 5TKYA 1Q18A 3WQTA 3F9MA 2FXUA 2GEMA 4I6MB 4Z94A 4FSVA 3QICA 2P9KB 2UYTA 3DAWA 3BF3A 1HKBA 4H5NA 1E4GT 1HUXA 3CJCA 4BRLA 3O08A 1ZXOA 3QDKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QE1A 5AQHA 3E9OA 3DLLL 4L3QA 3AVMA 4DV3K 2GUPA 4BC2A 5I42A 2P9UA 1P8ZA 3TSUA 5J2PA 3D2EB 1RTHA 2FSKA 3WT0A 4H4MA 3MMVA 1FXXA 4M7XA 3KD1E 3QERA 1VSEA 2G8HA 1YJNN 3TANA 1OVYA 1IG8A 4ILHA 4BRNA 2DFEA 4O5FA 1Z25A 3ZX2A 4Z4GA 4GW6A 5FPMA 4DV1K 4AHVA 3VQ4A 4FOIA 3WXLA 1LV5A 1VHXA 4JI6K 3HM8A 4FPAA 3CCVN 2HVHA 2X6NA 1J9AA 4DQSA 4J2BA 1Z05A 4DS5A 3AO4A 1BA0A 3BF1A 3CC7N 4O0JA 1TK0A 3ATUA 3F9KA 3FFIA 3CM6A 2Q0RA 1RNHA 4N76A 3KLHA 1JLFA 3KK1A 1J6ZA 3SUQA 4BRIA 5HRSA 1E3MA 1ESVA 1I39A 4BR5A 4CJ4A 1SV5A 5C42A 2PY5A 4DSJA 2FSNA 4KPYA 4JI3K 1VQPN 3L2QA 4GV6A 3R6MA 1YTUA 4CIFA 5I9EB 4IKFA 4O4GA 1VQON 2UUCK 2KLAA 1KVAA 4DUZK 2KW4A 4CZIA 4BY9C 4QS9A 4FLYA 4AHCA 4BE1A 2NLXA 2O8BA 4JK9A 1U2VB 2Y1JA 3OYFA 3J7ZO 3F2KA 1IG9A 4W5RA 1DLOA 3LDPA 5E26A 4DTJA 1OKJA 2QWOA 4DFKA 3HPHA 1D9FA 3OYIA 3D2FB 1KD1O 3NH1A 3U9DA 1YVNA 4N56A 1RBTA 1L5UA 4H0VB 1TKXA 2KHOA 3WNEA 4CZLA 4E7IA 5AZIB 3E66A 4DFJA 5HRNA 5FROA 4DLEA 1XWLA 3C6TA 3CG7A 3ID8A 2HBLA 2PYJA 4CK1A 3ZSXA 3VMFB 4B1XB 5J2NA 2A3ZA 3LP0A 4O0IA 4MLEA 3SAFA 4MDAA 4FWSA 4EIAA 3ZSVA 4JKGB 3RMDA 2BUPA 1KQSM 4A61A 5BPLA 2D0BA 4H0YB 4AHUA 1HPZA 3HVTA 4CD1A 4BDYA 3V81A 2HW3A 1NU0A 4XH5A 2AA4A 2FBVA 2QWLA 1U04A 2VG6A 3RMBA 4E7LA 5JS1A 4JI0K 2HHWA 3KWGA 2UXDK 3CCLN 3VQ8A 3I56N 3DXMB 3ENHA 4DV6K 1KVBA 2E20A 3VEZA 3SJHA 4CF8A 4B9QA 3AVAA 2IGIA 3CJ1A 4FK0A 2QXLA 3MN5A 4ISGA 4PKHA 5ELZA 3AVJA 4FLUA 4BDPA 1U4BA 4BC4A 3VGKA 4CF2A 3ID6A 2HMIA 1A5WA 4DF4A 2OZMA 3THYB 1U49A 3NF8A 4Z0UA 4E1JA 1SL0A 3FZFA 4AM6A 1GOBA 1ZBLA 4OKEA 3WXKA 1YUWA 1YF5L 3K5OA 4B9MA 4DTRA 3LWMA 3C6UA 4BR4A 1NK9A 1WB9A 2IVPA 1WUAA 2PZSA 5EY4A 3CC2N 3ATVA 4I9QA 3ZETA 2XY6A 3DLBA 1Q81O 2NUBA 4FJKA 2QWMA 1T05A 2D0PA 4KFBA 3FZLA 3UKRA 2E88A 1VQ5N 1Y97A 2P51A 3AARA 3LZIA 2KKZA 1G99A 4BC5A 2E2PA 3CF5L 1BUPA 1LW0A 1W2BM 3MN9A 4BR9A 2P1JA 2A1SA 3QFPA 4MDBA 1SL1A 3V9XA 3ASMA 4H0OA 2OPPA 2IOCA 2BDPA 3J81O 1OH8A 1UAXA 4IJNA 4B1VA 3MWPA 2HF3A 1Q86O 3E1YA 4M3TA 3O9SA 3A5LC 4K8XA 4IBNA 4FJ8A 2VG7A 4CJVA 4LFBK 2W6LA 5CR4A 1KAXA 1W7AA 2JGUA 3E9PA 3H6EA 3C7NA 1CXUA 5CYMA 3ZT1A 3HZ6A 1NK5A 4NCBA 1R0AA 1K73O 3VA0A 3ENOA 3AAPA 5C25A 3AO2A 4A57A 4CBWA 4CZMA 3IDHA 3T69A 3EY1A 3U3GA 4FM1A 4AQYK 2P9LB 4ELUA 3NGZA 2BTFA 4LF4K 1BIZA 1BA1A 3SBTA 5EX5A 1VSKA 1WSHA 3EEQA 4NO7A 4RG8A 4LSLA 5AQPA 4BGAA 4F3OA 3QIOA 1OH6A 1UOCA 4A59A 3EL2A 1QZ6A 4BWJA 3NF6A 4RW8A 4WFAL 4KH5A 4AF1A 4H5RA 2WTUA 1K8AO 4CK2A 4B9NA 2WUSA 5AJ3K 4IFEA 1N33K 1N5YA 5GAEP 1VQ4N 4A2BA 3DM2A 4B3RK 1Q8IA 4M41A 4KI4A 1BO5O 5HLFA 3FZHA 5GIPA 5EVZA 4DU4A 4BE0A 4BRHA 2P9KA 4WFNL 3T1YK 5AQZA 1TUYA 1JCEA 2G8IA 4DTSA 4K8ZA 4YDUC 3LZJA 4CGGA 3S3MA 5EXWA 3VESA 4A2AA 3OTOK 2RE2A 3QIPA 3F5TA 3K58A 3SNNA 4GV3A 3U9ZA 4DR4K 3M5RA 4NXNK 4F4KA 3SK3A 1RT5A 3DRRA 3S3NA 3R1XA 4CEDA 2B4JA 4CZHA 5LL6Z 3OYLA 3TI0A 4FJIA 4IEEA 1U6ZA 2QW9A 2A42A 5BN9A 2IAJA 3WXMB 3ULEB 5C24A 4DQQA 3OYCA 3N4PA 3W0LA 3HPGA 4KI6A 4GY2B 4JHDB 3PSIA 1X9MA 5AQFA 4IO8A 5AZJB 2UXCK 1YJ9N 1BL3A 1YAGA 4B1YB 3HXMA 2P9NB 4XEIA 2BGGA 3TAQA 3LP1A 2ZJPL 2P9PB 2V7ZA 1DKGD 3U3YA 3QNNA 2O8CA 2NRRA 1BI4B 4PHTX 3MXIA 5AQXA 2VG5A 1C1BA 3DI6A 1NJIO 4JRQA 1CZ9A 4WFBL 1OH7A 3VF6A 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3VOVA 3TABA 4G1QA 3C94A 2W40A 3T1AA 1JLCA 5C10A 3BZKA 1MWKA 4MLHA 4M3RA 5FPEA 4OPAA 1EX4A 1BDGA 3HBTA 4Z4EA 4B08A 1I94K 4IDHA 1QHTA 4BRFA 1MDUB 3TSPA 5HRRA 4KB0A 5FRNA 1SKWA 4FWRA 1I3AA 3MEDA 1SZ2A 4JKEA 1GLDG 4XH1A 2H3GX 1JL1A 1RT2A 4CHZA 3KLEA 3KD5E 4Z4CA 2WC9A 4AH9A 3H3NO 1ILYA 4CJKA 4E0DA 4DQRA 5KGWA 4J2EA 3CFOA 3T1HK 2UXBK 1QQCA 4BDZA 4CJSA 4X64K 4B3MK 2VGMA 4DHYA 4W5TA 1X9WA 2E2QA 3O9UA 3K57A 2HHTA 3BDPA 3UIQA 4DR1K 4H8KA 5AQJA 4NCAA 3MEEA 2YX6A 4PKGA 1X3NA 1HYSA 4KKOA 1QS4A 4YHHK 5C0YA 2WOMA 1QHAA 4WQ5C 3HM9A 3HP9A 2IIRA 4O44A 3RMAA 4KTWA 3FZMA 4XIUA 4FYDA 3R9PA 3O1BA 3WNHA 4JKAA 3K9KA 3KWIA 1FKPA 2QWNA 1L3VA 3PUFA 3ZT3A 1KRPA 3I33A 3FGUA 2QEXN 4RW9A 4IZ9A 4AHRA 3PIOL 4FJGA 1ASUA 4B3TK 3TAFA 2O8BB 1S5JA 4KHPK 1NJYA 2OPRA 1WBBA 3KTQA 1BCOA 2KFZA 4BVOA 1NKBA 3SUNA 4CFDA 3VQBA 1ZBSA 2YHYA 5JVHL 3LDLA 5F1XA 2RPIA 2E2OA 1T7PA 4B9VA 1T6CA 5I3UA 3HOSA 3OY9A 4OLBA 1EWQA 4ILJA 1J5OA 2YNIA 3HYFA 2X78A 3CJ9A 2G8WA 4BVPA 1HLUA 4O8KA 3AVNA 3ISNC 4RW7A 2F8SA 3G4SN 3NH0A 2DPNA 5GADP 2ZF5O 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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